Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6241
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6241, 751 aa
1>>>pF1KB6241 751 - 751 aa - 751 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8191+/-0.00192; mu= 14.8243+/- 0.115
mean_var=294.4714+/-55.930, 0's: 0 Z-trim(105.7): 975 B-trim: 21 in 1/50
Lambda= 0.074740
statistics sampled from 7481 (8554) to 7481 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 3.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 5350 592.3 9.4e-169
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2390 273.1 1.1e-72
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2227 255.8 2.7e-67
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2168 249.3 2e-65
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2123 244.3 5e-64
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 2090 240.7 6e-63
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CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2063 238.1 5.5e-62
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 2030 234.5 6.4e-61
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 2020 233.2 1.1e-60
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2022 233.7 1.2e-60
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2022 233.8 1.3e-60
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 2016 232.9 1.6e-60
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 2008 231.9 2.7e-60
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2010 232.5 3.2e-60
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CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 1986 229.9 1.9e-59
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CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1981 228.9 2e-59
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1980 228.9 2.3e-59
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1975 228.3 3.3e-59
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 1975 228.3 3.3e-59
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 1975 228.3 3.3e-59
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1973 228.2 3.9e-59
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1973 228.2 4e-59
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1969 227.7 5.3e-59
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 1933 224.0 8.4e-58
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 1907 221.0 5.2e-57
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1903 220.7 7.6e-57
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1903 220.7 7.6e-57
CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 1889 219.0 1.9e-56
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1880 218.2 4.2e-56
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1880 218.2 4.2e-56
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1880 218.2 4.2e-56
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1877 217.7 4.7e-56
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1877 217.8 5.1e-56
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1875 217.6 6.1e-56
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1875 217.7 6.2e-56
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1872 217.3 7.5e-56
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1873 217.6 8.1e-56
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1859 215.6 1.6e-55
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1859 215.8 1.8e-55
CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 1860 216.1 1.9e-55
CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 1860 216.1 2e-55
CCDS46100.1 ZNF225 gene_id:7768|Hs108|chr19 ( 706) 1857 215.6 2.2e-55
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 1857 215.8 2.5e-55
CCDS82339.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 598) 1854 215.1 2.5e-55
CCDS82338.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 640) 1854 215.2 2.6e-55
>>CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 (751 aa)
initn: 5350 init1: 5350 opt: 5350 Z-score: 3143.2 bits: 592.3 E(32554): 9.4e-169
Smith-Waterman score: 5350; 100.0% identity (100.0% similar) in 751 aa overlap (1-751:1-751)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGPQGARRQAFLAFGDVTVDFTQKEWRLLSPAQRALYREVTLENYSHLVSLGILHSKPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MGPQGARRQAFLAFGDVTVDFTQKEWRLLSPAQRALYREVTLENYSHLVSLGILHSKPEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IRRLEQGEVPWGEERRRRPGPCAGIYAEHVLRPKNLGLAHQRQQQLQFSDQSFQSDTAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IRRLEQGEVPWGEERRRRPGPCAGIYAEHVLRPKNLGLAHQRQQQLQFSDQSFQSDTAEG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QEKEKSTKPMAFSSPPLRHAVSSRRRNSVVEIESSQGQRENPTEIDKVLKGIENSRWGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QEKEKSTKPMAFSSPPLRHAVSSRRRNSVVEIESSQGQRENPTEIDKVLKGIENSRWGAF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 KCAERGQDFSRKMMVIIHKKAHSRQKLFTCRECHQGFRDESALLLHQNTHTGEKSYVCSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KCAERGQDFSRKMMVIIHKKAHSRQKLFTCRECHQGFRDESALLLHQNTHTGEKSYVCSV
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CGRGFSLKANLLRHQRTHSGEKPFLCKVCGRGYTSKSYLTVHERTHTGEKPYECQECGRR
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FNDKSSYNKHLKAHSGEKPFVCKECGRGYTNKSYFVVHKRIHSGEKPYRCQECGRGFSNK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SHLITHQRTHSGEKPFACRQCKQSFSVKGSLLRHQRTHSGEKPFVCKDCERSFSQKSTLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YHQRTHSGEKPFVCRECGQGFIQKSTLVKHQITHSEEKPFVCKDCGRGFIQKSTFTLHQR
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pF1KB6 THSEEKPYGCRECGRRFRDKSSYNKHLRAHLGEKRFFCRDCGRGFTLKPNLTIHQRTHSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 THSEEKPYGCRECGRRFRDKSSYNKHLRAHLGEKRFFCRDCGRGFTLKPNLTIHQRTHSG
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pF1KB6 EKPFMCKQCEKSFSLKANLLRHQWTHSGERPFNCKDCGRGFILKSTLLFHQKTHSGEKPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EKPFMCKQCEKSFSLKANLLRHQWTHSGERPFNCKDCGRGFILKSTLLFHQKTHSGEKPF
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pF1KB6 ICSECGQGFIWKSNLVKHQLAHSGKQPFVCKECGRGFNWKGNLLTHQRTHSGEKPFVCNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ICSECGQGFIWKSNLVKHQLAHSGKQPFVCKECGRGFNWKGNLLTHQRTHSGEKPFVCNV
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670 680 690 700 710 720
pF1KB6 CGQGFSWKRSLTRHHWRIHSKEKPFVCQECKRGYTSKSDLTVHERIHTGERPYECQECGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CGQGFSWKRSLTRHHWRIHSKEKPFVCQECKRGYTSKSDLTVHERIHTGERPYECQECGR
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730 740 750
pF1KB6 KFSNKSYYSKHLKRHLREKRFCTGSVGEASS
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KFSNKSYYSKHLKRHLREKRFCTGSVGEASS
730 740 750
>>CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 (738 aa)
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Smith-Waterman score: 2394; 43.6% identity (72.9% similar) in 746 aa overlap (9-739:5-737)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGPQGARRQAFLAFGDVTVDFTQKEWRLLSPAQRALYREVTLENYSHLVSLGILHSKPEL
: ..: :..::::::::.::.:.:. ::..: ::::: ::::: ::..
CCDS31 MTMLQESFSFDDLSVDFTQKEWQLLDPSQKNLYKDVMLENYSSLVSLGYEVMKPDV
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pF1KB6 IRRLEQGEVPW-GEERRRRPGPCAGIYAEHVLRPKNLGLAHQ-RQQQLQFSDQSFQSDTA
: .::::: :: :. : . . .: . . . :: :..:.. .. . : :
CCDS31 IFKLEQGEEPWVGD------GEIPSSDSPEVWKVDGNMMWHQDNQDKLKIIKRGHECD-A
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pF1KB6 EGQEKEKSTKPMAFSSPPLRHAVSSRRRNSVV----------EIESSQGQRENPTEIDKV
:.. . . : : :::.. : .... . . .... .. . .:.
CCDS31 FGKNFNLN---MNFV--PLRKSNSEGDLDGLILKHHLDLLIPKGDYGKAESDDFNVFDNF
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 L---KGIENSRWGAFKCAERGQDFSRKMMVIIHKKAHSRQKLFTCRECHQGFRDESALLL
. : ... : . .. .. .: ..::... . .::. : ::.. : . .:.
CCDS31 FLHSKPEDTDTWLKYYDCDKYKESYKKSQIIIYHRNRLGEKLYECSECRKRFSKKPSLIK
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 HQNTHTGEKSYVCSVCGRGFSLKANLLRHQRTHSGEKPFLCKVCGRGYTSKSYLTVHERT
::. : . .. :. ::. : :.... :.:::.::::. :. ::.....:: :: :.::
CCDS31 HQSRHIRDIAFGCGNCGKTFPQKSQFITHHRTHTGEKPYNCSQCGKAFSQKSQLTSHQRT
230 240 250 260 270 280
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pF1KB6 HTGEKPYECQECGRRFNDKSSYNKHLKAHSGEKPFVCKECGRGYTNKSYFVVHKRIHSGE
::::::::: :::. :. :: .: ..:.::::. :.::::....:: .. :.:::.::
CCDS31 HTGEKPYECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGEKPYGCNECGRAFSEKSNLINHQRIHTGE
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pF1KB6 KPYRCQECGRGFSNKSHLITHQRTHSGEKPFACRQCKQSFSVKGSLLRHQRTHSGEKPFV
::..:.:::..:: ::.:.::.:::.: :::.: .:...: :. :.::: :.::::.
CCDS31 KPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFGCSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGEKPYE
350 360 370 380 390 400
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pF1KB6 CKDCERSFSQKSTLVYHQRTHSGEKPFVCRECGQGFIQKSTLVKHQITHSEEKPFVCKDC
:..:...: ..:.:. :::::.:::: : .::..: ::: :..::.::. ::::.:. :
CCDS31 CSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQCGKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFICSKC
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 GRGFIQKSTFTLHQRTHSEEKPYGCRECGRRFRDKSSYNKHLRAHLGEKRFFCRDCGRGF
:..: .:: .. :::::. :::: : :::. : .: : ..: : : ::: . : .::..:
CCDS31 GKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPYECSECGKAFSEKLSLTNHQRIHTGEKPYVCSECGKAF
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 TLKPNLTIHQRTHSGEKPFMCKQCEKSFSLKANLLRHQWTHSGERPFNCKDCGRGFILKS
: .: :::::.::::. :..: :.:. :..: :: ::.::.:..:.:: ..: ::
CCDS31 CQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKSSLATHQRTHTGEKPYECRDCEKAFSQKS
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB6 TLLFHQKTHSGEKPFICSECGQGFIWKSNLVKHQLAHSGKQPFVCKECGRGFNWKGNLLT
: ::. :.::::. :: : ..:. ::.:..: .:.:..:. :.:: ..: :..:..
CCDS31 QLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKAFFEKSELIRHLRTHTGEKPYECNECRKAFREKSSLIN
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB6 HQRTHSGEKPFVCNVCGQGFSWKRSLTRHHWRIHSKEKPFVCQECKRGYTSKSDLTVHER
::: :.::::: :. ::..:: : : :. : :. :::. :.::......::.:. :.:
CCDS31 HQRIHTGEKPFECSECGKAFSRKSHLIPHQ-RTHTGEKPYGCSECRKAFSQKSQLVNHQR
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750
pF1KB6 IHTGERPYECQECGRKFSNKSYYSKHLKRHLREKRFCTGSVGEASS
:::::.::.: :::. ::.:: .: . : .:
CCDS31 IHTGEKPYRCIECGKAFSQKSQLINHQRTHTVKKS
710 720 730
>>CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090 aa)
initn: 1840 init1: 1840 opt: 2227 Z-score: 1321.8 bits: 255.8 E(32554): 2.7e-67
Smith-Waterman score: 2254; 41.0% identity (70.3% similar) in 747 aa overlap (9-741:4-729)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGPQGARRQAFLAFGDVTVDFTQKEWRLLSPAQRALYREVTLENYSHLVSLGILHSKPEL
.... : :...::.:.::. :. ::. :::.: .:::: :::::. ::..
CCDS59 MNMEGLVMFQDLSIDFSQEEWECLDAAQKDLYRDVMMENYSSLVSLGLSIPKPDV
10 20 30 40 50
70 80 90 100
pF1KB6 IRRLEQGEVPWGEERRRRPGPCAGIYAEHVLRPKNLGLAHQ----------RQQQLQ-FS
: ::::. :: : : : .: . :. : .. :... . .
CCDS59 ISLLEQGKEPWMVSRDVLGGWCRD--SEFRCKTKDSCLPKEIYEVTSSQWVRMEKCHSLV
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 DQSFQSD-TAEGQEKEKSTKPMAFSSPPLRHAVSSRRRNSVVEIESSQG--QRENPTEID
.: ..: .:: .... . . :..:. . . . . ...: .: .: :
CCDS59 GSSVRDDWECKGQFQHQDINQERY----LEKAIMTYETTPTFCLQTSLTLHHRIHPGE--
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KVLKGIENSRWGAFKCAERGQDFSRKMMVIIHKKAHSRQKLFTCRECHQGFRDESALLLH
:. :. : ::: :...... ...:. .::. :.:: ..:. : :. :
CCDS59 KLYKSTECM---AFK---YGSELTQQ------QETHTGEKLYKCKECGKAFHHFSYLVKH
170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 QNTHTGEKSYVCSVCGRGFSLKANLLRHQRTHSGEKPFLCKVCGRGYTSKSYLTVHERTH
: ::::: .:. :..: ..:..::. .. :.: :. ... ...: : : :
CCDS59 QRIHTGEKPCACKEYGKAFISGSHLIQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIH
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 TGEKPYECQECGRRFNDKSSYNKHLKAHSGEKPFVCKECGRGYTNKSYFVVHKRIHSGEK
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:.: .::. .: :. :: :.::::. :.:::..: :::..:: :. :::. ::.::
CCDS59 KECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKPYDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECG
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..: . :.. ::: :. :::: :.:::. : .:. :.: : : ::: . :..::..:.
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: ::: :.::::. ::.: :::.....:. :: .:.::.:..::.::..: .:.
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>--
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CCDS12 AFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
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CCDS12 ALQGERPRQSCPG---------EKLWDHNQCRKILSY--------------KQVSSQPQK
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CCDS74 KHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQR
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CCDS74 THTGEKPYDCKECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGEKTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTG
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CCDS74 EKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQRIHDLT
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