Result of FASTA (omim) for
pF1KB6237
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6237, 751 aa
1>>>pF1KB6237 751 - 751 aa - 751 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5837+/-0.00084; mu= 17.3889+/- 0.053
mean_var=356.4887+/-73.073, 0's: 0 Z-trim(111.5): 2148 B-trim: 94 in 1/53
Lambda= 0.067928
statistics sampled from 17752 (20109) to 17752 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.543), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 11.120
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 5325 537.9 5.7e-152
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 5325 537.9 5.7e-152
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 5325 537.9 5.7e-152
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 4670 473.6 1.2e-132
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 4670 473.6 1.2e-132
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2490 260.1 2.5e-68
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2490 260.1 2.5e-68
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2490 260.1 2.5e-68
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2490 260.1 2.6e-68
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 2490 260.2 2.6e-68
XP_006722943 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2389 250.5 2.8e-65
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 2389 250.5 2.8e-65
XP_016882725 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1118) 2389 250.5 2.8e-65
XP_011526567 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2389 250.5 2.9e-65
XP_016882724 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1150) 2389 250.5 2.9e-65
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 2389 250.5 2.9e-65
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2389 250.5 2.9e-65
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2374 248.7 6.5e-65
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2374 248.7 6.5e-65
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2374 248.8 6.8e-65
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2374 248.8 6.8e-65
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2374 248.8 6.8e-65
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2341 245.8 7.5e-64
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2325 244.3 2.3e-63
>>NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 isofo (751 aa)
initn: 5325 init1: 5325 opt: 5325 Z-score: 2849.3 bits: 537.9 E(85289): 5.7e-152
Smith-Waterman score: 5325; 99.9% identity (100.0% similar) in 751 aa overlap (1-751:1-751)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQESVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEPDISEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEPDISEEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 LSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 NEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 TGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 PFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYEC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 NECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 KAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 KAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 RSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 RSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 LTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 LTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 QRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIH
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KB6 SGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 SGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
730 740 750
>>NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 is (751 aa)
initn: 5325 init1: 5325 opt: 5325 Z-score: 2849.3 bits: 537.9 E(85289): 5.7e-152
Smith-Waterman score: 5325; 99.9% identity (100.0% similar) in 751 aa overlap (1-751:1-751)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQESVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEPDISEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEPDISEEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPVN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 QRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIH
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310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYEC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECG
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490 500 510 520 530 540
pF1KB6 KAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFI
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pF1KB6 RSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIH
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pF1KB6 LTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQH
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pF1KB6 QRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIH
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730 740 750
pF1KB6 SGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
730 740 750
>>NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 is (751 aa)
initn: 5325 init1: 5325 opt: 5325 Z-score: 2849.3 bits: 537.9 E(85289): 5.7e-152
Smith-Waterman score: 5325; 99.9% identity (100.0% similar) in 751 aa overlap (1-751:1-751)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQESVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEPDISEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEPDISEEE
70 80 90 100 110 120
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pF1KB6 LSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPVN
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190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRH
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pF1KB6 QRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIH
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pF1KB6 TGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEK
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370 380 390 400 410 420
pF1KB6 PFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYEC
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pF1KB6 NECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFI
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XP_011 DCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
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NP_001 DCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
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.. . . :. .: . . :. : : . :..:.:. :
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. .. : .:. :.: : .:.. ... . ... :. ..
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.: . .: . :. ::.: .:.. . : ..:.:: : . .
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::.::::: .::: : .. :. :.:::::::::::.:::::: ...:. :: ::::::
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:. :::::: :.: .:.. : .:::::::.::.:: :.:. . :. :: :::::: :::
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:::::.: : . ::. .:::::::.:::::::::.::::. :: ::: ::. : ::.
NP_001 NECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECS
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: :. :.::.: .:::::::::::::::::: :::: :. ::. :::..: ::::.:.
NP_001 KVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFT
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pF1KB6 YLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSS
:.: .:. :. :: :.:.::::.: ..:.::.: :.:::::::.:..::..:: ::
NP_001 QKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSS
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pF1KB6 LIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQH
: :. :::::.::::.:::..: .: .:. :.::::: :::.: :::::: :.:. :
NP_001 LTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTH
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pF1KB6 QKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTH
. :: ::::.::.: :.:.:.:::..::: :::::::.:::: :::: . :: :: :
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::.:::.:::: :.:.:...: .:.:::.::::. :..:::.:: ::.:. :. .: :
NP_001 TGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEK
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NP_001 RYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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>>NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 is (782 aa)
initn: 9429 init1: 2482 opt: 2490 Z-score: 1347.6 bits: 260.1 E(85289): 2.5e-68
Smith-Waterman score: 2576; 49.7% identity (71.3% similar) in 748 aa overlap (58-750:2-749)
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pF1KB6 VTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLENYTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPW
:::: .:::.:: ..::.::.: :::
NP_001 MLENYWNLVSLGLCHFDMNIISMLEEGKEPW
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pF1KB6 IMEPSIPV-----------GTCADWETRLENSVSAPEPDISEEELSPEVIVEKHKRDDSW
.. . . :. .: . . :. : : . :..:.:. :
NP_001 TVKSCVKIARKPRTPECVKGVVTDIPPKCTIKDLLPKEKSSTEAVFHTVVLERHESPDIE
40 50 60 70 80 90
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pF1KB6 SSNLLE----------SWE-----YEGSL-----------ERQQANQQTLPKEIKVTEKT
. .. : .:. :.: : .:.. ... . ... :. ..
NP_001 DFSFKEPQKNVHDFECQWRDDTGNYKGVLMAQKEGKRDQRDRRDIENKLMNNQLGVSFHS
100 110 120 130 140 150
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pF1KB6 -IPSWE----KGPVN--NEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNS-------NPV
.: . .: . :. ::.: .:.. . : ..:.:: : . .
NP_001 HLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQR
160 170 180 190 200 210
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pF1KB6 KKEKSC----KCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIH
.: .:: :::::::::. : : :.: :.:::::::.:: :.:. :: :: ::
NP_001 RKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIH
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 TGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEK
::.::::: .::: : .. :. :.:::::::::::.:::::: ...:. :: ::::::
NP_001 TGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEK
280 290 300 310 320 330
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pF1KB6 PYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKC
:. :::::: :.: .:.. : .:::::::.::.:: :.:. . :. :: :::::: :::
NP_001 PFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKC
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 NECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECG
:::::.: : . ::. .:::::::.:::::::::.::::. :: ::: ::. : ::.
NP_001 NECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECS
400 410 420 430 440 450
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pF1KB6 KSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFS
: :. :.::.: .:::::::::::::::::: :::: :. ::. :::..: ::::.:.
NP_001 KVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFT
460 470 480 490 500 510
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pF1KB6 YLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSS
:.: .:. :. :: :.:.::::.: ..:.::.: :.:::::::.:..::..:: ::
NP_001 QKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSS
520 530 540 550 560 570
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: :. :::::.::::.:::..: .: .:. :.::::: :::.: :::::: :.:. :
NP_001 LTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTH
580 590 600 610 620 630
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. :: ::::.::.: :.:.:.:::..::: :::::::.:::: :::: . :: :: :
NP_001 KVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIH
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pF1KB6 TGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
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:::: .:::.:: ..::.::.: :::
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.. . . :. .: . . :. : : . :..:.:. :
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. .. : .:. :.: : .:.. ... . ... :. ..
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pF1KB6 YLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSS
:.: .:. :. :: :.:.::::.: ..:.::.: :.:::::::.:..::..:: ::
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: :. :::::.::::.:::..: .: .:. :.::::: :::.: :::::: :.:. :
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pF1KB6 QKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTH
. :: ::::.::.: :.:.:.:::..::: :::::::.:::: :::: . :: :: :
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pF1KB6 TGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
::.:::.:::: :.:.:...: .:.:::.::::. :..:::.:: ::.:. :. .: :
NP_001 TGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEK
700 710 720 730 740 750
NP_001 RYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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pF1KB6 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPV-----------GTCADWETRLENSV
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pF1KB6 SAPEPDISEEELSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLE----------SWE-----YEGSL----
:. : : . :..:.:. : . .. : .:. :.: :
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160 170 180 190
pF1KB6 -------ERQQANQQTLPKEIKVTEKT-IPSWE----KGPVN--NEFGKSVNVSSNLVTQ
.:.. ... . ... :. .. .: . .: . :. ::.: .:..
NP_001 EGKRDQRDRRDIENKLMNNQLGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPL
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200 210 220 230 240
pF1KB6 EPSPEETSTKRSIKQNS-------NPVKKEKSC----KCNECGKAFSYCSALIRHQRTHT
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250 260 270 280 290 300
pF1KB6 GEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKP
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NP_001 GEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKP
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310 320 330 340 350 360
pF1KB6 YKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKPFKCD
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NP_001 YKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCN
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370 380 390 400 410 420
pF1KB6 ECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYECNECGK
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NP_001 ECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGK
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:::.::::. :: ::: ::. : ::.: :. :.::.: .::::::::::::::::::
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:::: :. ::. :::..: ::::.:. :.: .:. :. :: :.:.::::.: ..:.:
NP_001 RSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQL
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NP_001 ARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHR
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pF1KB6 RIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHT
::::: :::.: :::::: :.:. :. :: ::::.::.: :.:.:.:::..::: ::
NP_001 RIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHT
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pF1KB6 GEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKP
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NP_001 GEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKP
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730 740 750
pF1KB6 FGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
. :..:::.:: ::.:. :. .: :
NP_001 YRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 -------ERQQANQQTLPKEIKVTEKT-IPSWE----KGPVN--NEFGKSVNVSSNLVTQ
.:.. ... . ... :. .. .: . .: . :. ::.: .:..
XP_016 EGKRDQRDRRDIENKLMNNQLGVSFHSHLPELQLFQGEGKMYECNQVEKSTNNGSSVSPL
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pF1KB6 EPSPEETSTKRSIKQNS-------NPVKKEKSC----KCNECGKAFSYCSALIRHQRTHT
. : ..:.:: : . . .: .:: :::::::::. : : :.: :.
XP_016 QQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHS
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250 260 270 280 290 300
pF1KB6 GEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKP
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pF1KB6 YKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKPFKCD
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pF1KB6 ECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYECNECGK
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pF1KB6 GEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKP
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XP_016 GEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKP
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pF1KB6 FGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
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XP_016 YRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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751 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Sat Nov 5 14:22:39 2016 done: Sat Nov 5 14:22:41 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]