Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6195
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6195, 663 aa
1>>>pF1KB6195 663 - 663 aa - 663 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5093+/-0.000991; mu= 1.8967+/- 0.060
mean_var=220.8902+/-45.903, 0's: 0 Z-trim(112.5): 87 B-trim: 203 in 1/50
Lambda= 0.086295
statistics sampled from 13147 (13234) to 13147 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.407), width: 16
Scan time: 4.570
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14617.1 ELF4 gene_id:2000|Hs108|chrX ( 663) 4290 547.0 3e-155
CCDS9374.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 ( 619) 1117 152.0 2.3e-36
CCDS82954.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 593) 889 123.6 7.9e-28
CCDS45043.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 ( 595) 841 117.6 5e-26
CCDS3745.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 533) 824 115.5 2e-25
CCDS3744.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 581) 768 108.5 2.7e-23
CCDS64062.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 521) 766 108.3 2.9e-23
CCDS64063.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 504) 702 100.3 7.1e-21
>>CCDS14617.1 ELF4 gene_id:2000|Hs108|chrX (663 aa)
initn: 4290 init1: 4290 opt: 4290 Z-score: 2900.7 bits: 547.0 E(32554): 3e-155
Smith-Waterman score: 4290; 100.0% identity (100.0% similar) in 663 aa overlap (1-663:1-663)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAITLQPSDLIFEFASNGMDDDIHQLEDPSVFPAVIVEQVPYPDLLHLYSGLELDDVHNG
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CCDS14 MAITLQPSDLIFEFASNGMDDDIHQLEDPSVFPAVIVEQVPYPDLLHLYSGLELDDVHNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IITDGTLCMTQDQILEGSFLLTDDNEATSHTMSTAEVLLNMESPSDILDEKQIFSTSEML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IITDGTLCMTQDQILEGSFLLTDDNEATSHTMSTAEVLLNMESPSDILDEKQIFSTSEML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PDSDPAPAVTLPNYLFPASEPDALNRAGDTSDQEGHSLEEKASREESAKKTGKSKKRIRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PDSDPAPAVTLPNYLFPASEPDALNRAGDTSDQEGHSLEEKASREESAKKTGKSKKRIRK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 TKGNRSTSPVTDPSIPIRKKSKDGKGSTIYLWEFLLALLQDRNTCPKYIKWTQREKGIFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TKGNRSTSPVTDPSIPIRKKSKDGKGSTIYLWEFLLALLQDRNTCPKYIKWTQREKGIFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LVDSKAVSKLWGKQKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKEMPKDLVVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 EDEDESSEATAAPPQASTASVASASTTRRTSSRVSSRSAPQGKGSSSWEKPKIQHVGLQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EDEDESSEATAAPPQASTASVASASTTRRTSSRVSSRSAPQGKGSSSWEKPKIQHVGLQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SASLELGPSLDEEIPTTSTMLVSPAEGQVKLTKAVSASSVPSNIHLGVAPVGSGSALTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SASLELGPSLDEEIPTTSTMLVSPAEGQVKLTKAVSASSVPSNIHLGVAPVGSGSALTLQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 TIPLTTVLTNGPPASTTAPTQLVLQSVPAASTFKDTFTLQASFPLNASFQDSQVAAPGAP
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CCDS14 TIPLTTVLTNGPPASTTAPTQLVLQSVPAASTFKDTFTLQASFPLNASFQDSQVAAPGAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LILSGLPQLLAGANRPTNPAPPTVTGAGPAGPSSQPPGTVIAAFIRTSGTTAAPRVKEGP
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CCDS14 LILSGLPQLLAGANRPTNPAPPTVTGAGPAGPSSQPPGTVIAAFIRTSGTTAAPRVKEGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LRSSSYVQGMVTGAPMEGLLVPEETLRELLRDQAHLQPLPTQVVSRGSHNPSLLGNQTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LRSSSYVQGMVTGAPMEGLLVPEETLRELLRDQAHLQPLPTQVVSRGSHNPSLLGNQTLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 PPSRPTVGLTPVAELELSSGSGSLLMAEPSVTTSGSLLTRSPTPAPFSPFNPTSLIKMEP
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CCDS14 PPSRPTVGLTPVAELELSSGSGSLLMAEPSVTTSGSLLTRSPTPAPFSPFNPTSLIKMEP
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 HDI
:::
CCDS14 HDI
>>CCDS9374.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 (619 aa)
initn: 1021 init1: 856 opt: 1117 Z-score: 766.2 bits: 152.0 E(32554): 2.3e-36
Smith-Waterman score: 1239; 42.5% identity (67.5% similar) in 579 aa overlap (1-530:1-562)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAITLQPSDLIFEFASNGMDDDIHQLEDPSVFPAVIVEQVPYPDLLHLYSGLELDDVHNG
:: ..: .::.:::::: :.:. .:: ::..:::::::.:: :.:. :.:: . :
CCDS93 MAAVVQQNDLVFEFASNVMEDE-RQLGDPAIFPAVIVEHVPGADILNSYAGLACVEEPND
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 IITDGTLCMTQDQILEGS---FLLT-----DDNEATSHTMSTAEVLLNMESPSDILDEKQ
.::...: .....:.. . . :: :.. : .:. .::.::::.::. .::::.
CCDS93 MITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDETIETIEAAEALLNMDSPGPMLDEKR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB6 IFSTSEMLPDSDP--APAVTLPNYLFPASEPDALNRAGDTSD-QEGHSLEEKASREESAK
: .. :..: ::.. . : :.. .. .:.. :: .. :: :. :
CCDS93 INNNIFSSPEDDMVVAPVTHVSVTL------DGIPEVMETQQVQEKYADSPGASSPEQPK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KTGKSKKRIRKTKGNRSTSPVTDPSIPIRKKSKDGKGSTIYLWEFLLALLQDRNTCPKYI
. :. :::: : ::.: :.: ..::.:::::.::::::::::::::. ::::::
CCDS93 R-----KKGRKTKPPRPDSPATTPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYI
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 KWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKQKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQ
:::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 KWTQREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQ
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 FKEMPKDLVVIEDEDESSEATAAPPQASTASVASASTTRRTSSRVSSRSAPQG-------
::::::::. :.::: :: .. :. :...... . : : ::::: . .:
CCDS93 FKEMPKDLIYINDEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSR--SRVSSSPGVKGGATTVLK
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390
pF1KB6 KGSSSWEKPKIQHVGLQPSASLELGPSLDEEIPTT---STMLVSPA----EGQVKLTKAV
:.:. ::: ::: :. . :: .. .:.:. ::.. :...
CCDS93 PGNSKAAKPKDPVEVAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQAVPEGEAARTSTM
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440
pF1KB6 S----ASSV--------PSNIHLGVAPVGSG-SALTLQTIPLTTVLTNGPPASTTAPTQL
. ::: :... . :.: .. ..::::.:::::... :.. :. ..
CCDS93 QDETLNSSVQSIRTIQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPLTTVIASTDPSAGTGSQKF
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KB6 VLQSVPAA---STFKDTFTLQASFPLNASFQDSQVAAPGA--PLILSGLPQLLAG----A
.::..:.. ...:.. ::.. .:. : : .:. .. :.. . : :
CCDS93 ILQAIPSSQPMTVLKENVMLQSQ---KAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTICNGTVSVA
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 NRPTNPAPPTVTGAGPAGPS--SQPPGTVIAAFIRTSGTTAAPRVKEGPLRSSSYVQGMV
. :. : :. .: . . ..::::::.. :.:. :
CCDS93 SSPSFSATAPVVTFSPRSSQLVAHPPGTVITSVIKTQETKTLTQEVEKKESEDHLKENTE
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 TGAPMEGLLVPEETLRELLRDQAHLQPLPTQVVSRGSHNPSLLGNQTLSPPSRPTVGLTP
CCDS93 KTEQQPQPYVMVVSSSNGFTSQVAMKQNELLEPNSF
590 600 610
>>CCDS82954.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 (593 aa)
initn: 780 init1: 680 opt: 889 Z-score: 613.0 bits: 123.6 E(32554): 7.9e-28
Smith-Waterman score: 895; 36.8% identity (64.5% similar) in 538 aa overlap (11-512:12-533)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAITLQPSDLIFEFASNGMDDDIHQLEDPSVFPAVIVEQVPYPDLLHLYSG--LELDD-
:.:..:::.... .. : : .:::::: :: : . :.. : ::
CCDS82 MTSAVVDSGGTILELSSNGVENQ-EESEKVSEYPAVIVEPVPSARLEQGYAAQVLVYDDE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 --VHNGIITDGTLCMTQDQILEGSFLLTDDNEATSHTMSTAEVLLNMESPSDILDEKQIF
. . . . . . . .:.: . ... . :..:. .::.::.::::. . : .
CCDS82 TYMMQDVAEEQEVETENVETVEAS-VHSSNAHCTDKTIEAAEALLHMESPTCLRDSR---
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 STSEMLPDSDPAPAVTLPNYLFPASEPDALNRAG-DTSDQEGHSLEEKA-SREESAKKTG
: :.. : : :. :... : .::..... ..: .:.. .. . ....
CCDS82 SPVEVFV---P-PCVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTSPIPTSPDSHEPM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 KSKKRIRKTKGNRSTSPVTD--PSIPIRKKSKDGKGSTIYLWEFLLALLQDRNTCPKYIK
:.:: :: : ..: :... : . :.:: ..:::.: ::::::: ::::.::::.:::
CCDS82 KKKKVGRKPKTQQS--PISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQDKNTCPRYIK
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 WTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKQKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQF
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 WTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 KEMPKDLVVIEDEDESSEATAAPPQASTASVASASTTRRTSSRVSSRSAPQGKGSSSWEK
:.:::..:::.:. . .. :. .: . .. ...: :. .::.:: .
CCDS82 KDMPKNIVVIDDDKSETCNEDLAGTTDEKSLERVSLSAESLLKAAS-SVRSGKNSSPINC
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB6 PKIQHVGLQPSASLELGPSLDE--EIPTTS---TMLVSPAEGQVKLTKAVSASSVPSNIH
. .. :. ... .:. : . :::. . ..: .: . : .:. ..:
CCDS82 SRAEK-GVARVVNIT-SPGHDASSRSPTTTASVSATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKIS
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB6 -LGVAPVGSGSALTLQTIPLTT-----VLTNGP---PASTTAPTQLVLQ-----SVPAAS
..: :..:. : .: : :. :. . : :::: ....: ..::..
CCDS82 TVAVQSVNAGAPLITSTSPTTATSPKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQ
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KB6 TFKDTFTLQASFPLNASFQDSQVAAPGA-----PL-ILSGLP--QLLAGANRPTNPAPPT
. ::.. :..: . . :..: : :. : : : .: ... .. .::
CCDS82 LAQ--CQLQTKSNLTGSGSINIVGTPLAVRALTPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQTPPR
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 VTGAGPAGPSSQPPGTVIAAFIRTSGTTAAPRVKEGPLRSSSYVQGMVTGAPMEGLLVPE
: .: ::
CCDS82 VISAVIKGPEVKSEAVAKKQEHDVKTLQLVEEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMK
530 540 550 560 570 580
>>CCDS45043.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 (595 aa)
initn: 1183 init1: 783 opt: 841 Z-score: 580.7 bits: 117.6 E(32554): 5e-26
Smith-Waterman score: 1194; 41.7% identity (65.3% similar) in 576 aa overlap (1-530:1-538)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAITLQPSDLIFEFASNGMDDDIHQLEDPSVFPAVIVEQVPYPDLLHLYSGLELDDVHNG
:: ..: .::.:::::: :.:. .:: ::..:::::::.:: :.:. :.:: . :
CCDS45 MAAVVQQNDLVFEFASNVMEDE-RQLGDPAIFPAVIVEHVPGADILNSYAGLACVEEPND
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 IITDGTLCMTQDQILEGS---FLLT-----DDNEATSHTMSTAEVLLNMESPSDILDEKQ
.::...: .....:.. . . :: :.. : .:. .::.::::.::. .::::.
CCDS45 MITESSLDVAEEEIIDDDDDDITLTVEASCHDGDETIETIEAAEALLNMDSPGPMLDEKR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 IFSTSEMLPDSDPAPAVTLPNYLFPASEPDALNRAGDTSDQEGHSLEEKASREESAKKTG
: . :.. .. :: .. :: :. :
CCDS45 INGIPEVMETQQV---------------------------QEKYADSPGASSPEQPK---
120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 KSKKRIRKTKGNRSTSPVTDPSIPIRKKSKDGKGSTIYLWEFLLALLQDRNTCPKYIKWT
.:. :::: : ::.: :.: ..::.:::::.::::::::::::::. :::::::::
CCDS45 --RKKGRKTKPPRPDSPATTPNISVKKKNKDGKGNTIYLWEFLLALLQDKATCPKYIKWT
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 QREKGIFKLVDSKAVSKLWGKQKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKE
::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QREKGIFKLVDSKAVSRLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFKE
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KB6 MPKDLVVIEDEDESSEATAAPPQASTASVASASTTRRTSSRVSSRSAPQG-------KGS
:::::. :.::: :: .. :. :...... . : : ::::: . .: :.
CCDS45 MPKDLIYINDEDPSSSIESSDPSLSSSATSNRNQTSR--SRVSSSPGVKGGATTVLKPGN
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390
pF1KB6 SSWEKPKIQHVGLQPSASLELGPSLDEEIPTT---STMLVSPA----EGQVKLTKAVS--
:. ::: ::: :. . :: .. .:.:. ::.. :....
CCDS45 SKAAKPKDPVEVAQPSEVLRTVQPTQSPYPTQLFRTVHVVQPVQAVPEGEAARTSTMQDE
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KB6 --ASSV--------PSNIHLGVAPVGSG-SALTLQTIPLTTVLTNGPPASTTAPTQLVLQ
::: :... . :.: .. ..::::.:::::... :.. :. ...::
CCDS45 TLNSSVQSIRTIQAPTQVPVVVSPRNQQLHTVTLQTVPLTTVIASTDPSAGTGSQKFILQ
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490
pF1KB6 SVPAA---STFKDTFTLQASFPLNASFQDSQVAAPGA--PLILSGLPQLLAG----ANRP
..:.. ...:.. ::.. .:. : : .:. .. :.. . : :. :
CCDS45 AIPSSQPMTVLKENVMLQSQ---KAGSPPSIVLGPAQVQQVLTSNVQTICNGTVSVASSP
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 TNPAPPTVTGAGPAGPS--SQPPGTVIAAFIRTSGTTAAPRVKEGPLRSSSYVQGMVTGA
. : :. .: . . ..::::::.. :.:. :
CCDS45 SFSATAPVVTFSPRSSQLVAHPPGTVITSVIKTQETKTLTQEVEKKESEDHLKENTEKTE
510 520 530 540 550 560
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 PMEGLLVPEETLRELLRDQAHLQPLPTQVVSRGSHNPSLLGNQTLSPPSRPTVGLTPVAE
CCDS45 QQPQPYVMVVSSSNGFTSQVAMKQNELLEPNSF
570 580 590
>>CCDS3745.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 (533 aa)
initn: 761 init1: 680 opt: 824 Z-score: 570.0 bits: 115.5 E(32554): 2e-25
Smith-Waterman score: 830; 38.1% identity (65.4% similar) in 462 aa overlap (82-512:26-473)
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LELDDVHNGIITDGTLCMTQDQILEGSFLLTDDNEATSHTMSTAEVLLNMESPSDILDEK
... . :..:. .::.::.::::. . : .
CCDS37 MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALLHMESPTCLRDSR
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160
pF1KB6 QIFSTSEMLPDSDPAPAVTLPNYLFPASEPDALNRAG-DTSDQEGHSLEEKA-SREESAK
: :.. : : :. :... : .::..... ..: .:.. .. . ...
CCDS37 ---SPVEVFV---P-PCVSTPEFIHAAMRPDVITETVVEVSTEESEPMDTSPIPTSPDSH
60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KTGKSKKRIRKTKGNRSTSPVTD--PSIPIRKKSKDGKGSTIYLWEFLLALLQDRNTCPK
. :.:: :: : ..: :... : . :.:: ..:::.: ::::::: ::::.::::.
CCDS37 EPMKKKKVGRKPKTQQS--PISNGSPELGIKKKPREGKGNTTYLWEFLLDLLQDKNTCPR
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 YIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKQKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLV
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLV
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 YQFKEMPKDLVVIEDEDESSEATAAPPQASTASVASASTTRRTSSRVSSRSAPQGKGSSS
::::.:::..:::.:. . .. :. .: . .. ...: :. .::.::
CCDS37 YQFKDMPKNIVVIDDDKSETCNEDLAGTTDEKSLERVSLSAESLLKAAS-SVRSGKNSSP
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 WEKPKIQHVGLQPSASLELGPSLDE--EIPTTS---TMLVSPAEGQVKLTKAVSASSVPS
. . .. :. ... .:. : . :::. . ..: .: . : .:. .
CCDS37 INCSRAEK-GVARVVNIT-SPGHDASSRSPTTTASVSATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQ
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.: ..: :..:. : .: : :. :. . : :::: ....: ..:
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:.. . ::.. :..: . . :..: : :. : : : .: ... .. .
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. . . . . . . .:.: . ... . :..:. .::.::.::::. . : ..
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CCDS37 WTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQF
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. .. :. ... .:. : . :::. . ..: .: . : .:. ..:
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CCDS37 TVAVQSVNAGAPLITSTSPTTATSPKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQ
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. ::.. :..: . . :..: : :. : : : .: ... .. .::
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: .: ::
CCDS37 VISAVIKGPEVKSEAVAKKQEHDVKTLQLVEEKPADGNKTVTHVVVVSAPSAIALPVTMK
520 530 540 550 560 570
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CCDS64 YIKWTQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLV
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pF1KB6 WEKPKIQHVGLQPSASLELGPSLDE--EIPTTS---TMLVSPAEGQVKLTKAVSASSVPS
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340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 AASTFKDTFTLQASFPLNASFQDSQVAAPGA-----PL-ILSGLP--QLLAGANRPTNPA
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CCDS64 ATQLAQ--CQLQTKSNLTGSGSINIVGTPLAVRALTPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQT
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CCDS64 MATSLHEGPTNQLDLLIRAVEASVHSSNAHCTDKTIEAAEALLHMESPTCLRDSR
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CCDS64 ---SPVEVFV---P-PCVSTPEFIHAAMRPDVITE----------TVVEVSTEESEPMDT
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CCDS64 SPIP-----------TSP--DSHEPMKKK----KGNTTYLWEFLLDLLQDKNTCPRYIKW
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CCDS64 TQREKGIFKLVDSKAVSKLWGKHKNKPDMNYETMGRALRYYYQRGILAKVEGQRLVYQFK
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pF1KB6 EMPKDLVVIEDEDESSEATAAPPQASTASVASASTTRRTSSRVSSRSAPQGKGSSSWEKP
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CCDS64 DMPKNIVVIDDDKSETCNEDLAGTTDEKSLERVSLSAESLLKAAS-SVRSGKNSSPINCS
210 220 230 240 250 260
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pF1KB6 KIQHVGLQPSASLELGPSLDE--EIPTTS---TMLVSPAEGQVKLTKAVSASSVPSNIH-
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CCDS64 RAEK-GVARVVNIT-SPGHDASSRSPTTTASVSATAAPRTVRVAMQVPVVMTSLGQKIST
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pF1KB6 LGVAPVGSGSALTLQTIPLTT-----VLTNGP---PASTTAPTQLVLQ-----SVPAAST
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CCDS64 VAVQSVNAGAPLITSTSPTTATSPKVVIQTIPTVMPASTENGDKITMQPAKIITIPATQL
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CCDS64 AQ--CQLQTKSNLTGSGSINIVGTPLAVRALTPVSIAHGTPVMRLSMPTQQASGQTPPRV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]