Result of FASTA (omim) for
pF1KB6175
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6175, 653 aa
1>>>pF1KB6175 653 - 653 aa - 653 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0572+/-0.000351; mu= 0.4962+/- 0.022
mean_var=282.0636+/-59.152, 0's: 0 Z-trim(124.9): 50 B-trim: 3208 in 2/58
Lambda= 0.076366
statistics sampled from 47298 (47399) to 47298 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.821), E-opt: 0.2 (0.556), width: 16
Scan time: 12.200
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005178 (OMIM: 603870) protein CBFA2T3 isoform 1 ( 653) 4514 510.5 7.9e-144
XP_011521721 (OMIM: 603870) PREDICTED: protein CBF ( 558) 3766 428.0 4.5e-119
XP_005256380 (OMIM: 603870) PREDICTED: protein CBF ( 628) 3643 414.5 5.9e-115
NP_787127 (OMIM: 603870) protein CBFA2T3 isoform 2 ( 567) 3635 413.6 1e-114
XP_016879300 (OMIM: 603870) PREDICTED: protein CBF ( 493) 3223 368.1 4.1e-101
XP_016883611 (OMIM: 603672) PREDICTED: protein CBF ( 594) 1586 187.8 9.4e-47
XP_011527404 (OMIM: 603672) PREDICTED: protein CBF ( 574) 1573 186.4 2.5e-46
XP_016869430 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 361) 1557 184.5 5.9e-46
XP_016869428 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 382) 1557 184.5 6.1e-46
XP_016869429 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 382) 1557 184.5 6.1e-46
NP_001185563 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 615) 1341 160.9 1.3e-38
NP_001185557 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 604) 1320 158.5 6.3e-38
NP_001185555 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 604) 1320 158.5 6.3e-38
XP_011515653 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 604) 1320 158.5 6.3e-38
NP_001185558 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 604) 1320 158.5 6.3e-38
NP_001185560 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 604) 1320 158.5 6.3e-38
NP_001185556 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 604) 1320 158.5 6.3e-38
XP_016869420 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 604) 1320 158.5 6.3e-38
NP_783552 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isoform B ( 604) 1320 158.5 6.3e-38
NP_001185559 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 604) 1320 158.5 6.3e-38
NP_001185562 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 584) 1318 158.3 7.1e-38
XP_016869422 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 577) 1316 158.1 8.3e-38
XP_016869421 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 577) 1316 158.1 8.3e-38
XP_011515654 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 577) 1316 158.1 8.3e-38
NP_001185554 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 577) 1316 158.1 8.3e-38
NP_001185561 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 577) 1316 158.1 8.3e-38
NP_004340 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isoform A ( 577) 1316 158.1 8.3e-38
XP_016869419 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 632) 1314 157.9 1e-37
NP_001185608 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isofor ( 663) 1314 157.9 1.1e-37
XP_011515655 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 567) 1312 157.6 1.1e-37
XP_016869425 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 567) 1312 157.6 1.1e-37
XP_006716739 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 567) 1312 157.6 1.1e-37
NP_783553 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isoform C ( 567) 1312 157.6 1.1e-37
NP_783554 (OMIM: 133435) protein CBFA2T1 isoform C ( 567) 1312 157.6 1.1e-37
XP_016869423 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 567) 1312 157.6 1.1e-37
XP_016869426 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 567) 1312 157.6 1.1e-37
XP_016869424 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 567) 1312 157.6 1.1e-37
XP_016883614 (OMIM: 603672) PREDICTED: protein CBF ( 377) 1264 152.2 3.2e-36
XP_016869427 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBF ( 486) 1258 151.6 6.1e-36
XP_011527409 (OMIM: 603672) PREDICTED: protein CBF ( 378) 1188 143.8 1e-33
XP_016883613 (OMIM: 603672) PREDICTED: protein CBF ( 378) 1188 143.8 1e-33
XP_011527403 (OMIM: 603672) PREDICTED: protein CBF ( 614) 1056 129.5 3.6e-29
NP_005084 (OMIM: 603672) protein CBFA2T2 isoform M ( 604) 1053 129.1 4.5e-29
NP_001028171 (OMIM: 603672) protein CBFA2T2 isofor ( 595) 1051 128.9 5.2e-29
XP_011527405 (OMIM: 603672) PREDICTED: protein CBF ( 575) 1038 127.5 1.4e-28
XP_016883610 (OMIM: 603672) PREDICTED: protein CBF ( 575) 1038 127.5 1.4e-28
NP_001034798 (OMIM: 603672) protein CBFA2T2 isofor ( 575) 1038 127.5 1.4e-28
XP_016883612 (OMIM: 603672) PREDICTED: protein CBF ( 462) 1025 126.0 3.1e-28
>>NP_005178 (OMIM: 603870) protein CBFA2T3 isoform 1 [Ho (653 aa)
initn: 4514 init1: 4514 opt: 4514 Z-score: 2703.2 bits: 510.5 E(85289): 7.9e-144
Smith-Waterman score: 4514; 100.0% identity (100.0% similar) in 653 aa overlap (1-653:1-653)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPASRLRDRAASSASGSTCGSMSQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MPASRLRDRAASSASGSTCGSMSQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 WSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 WSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSNGPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSNGPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 DPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 RRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 YVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 DALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB6 AVVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AVVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
610 620 630 640 650
>>XP_011521721 (OMIM: 603870) PREDICTED: protein CBFA2T3 (558 aa)
initn: 3766 init1: 3766 opt: 3766 Z-score: 2258.8 bits: 428.0 E(85289): 4.5e-119
Smith-Waterman score: 3766; 100.0% identity (100.0% similar) in 554 aa overlap (1-554:1-554)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPASRLRDRAASSASGSTCGSMSQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPASRLRDRAASSASGSTCGSMSQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 WSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSNGPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSNGPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 DPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 RRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 YVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 DALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPT
::::::::::::::
XP_011 DALTVINQQEDSSELGRS
550
>>XP_005256380 (OMIM: 603870) PREDICTED: protein CBFA2T3 (628 aa)
initn: 4301 init1: 3617 opt: 3643 Z-score: 2184.8 bits: 414.5 E(85289): 5.9e-115
Smith-Waterman score: 4255; 96.2% identity (96.2% similar) in 653 aa overlap (1-653:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MPASRLRDRAASSASGSTCGSMSQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MPASRLRDRAASSASGSTCGSMSQTHPVLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHT-------------------
70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 WSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ------LMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNGPATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRF
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTLTIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTK
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSNGPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSNGPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHP
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 DPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVL
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 RRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 YVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASE
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 DALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPT
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650
pF1KB6 AVVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
580 590 600 610 620
>>NP_787127 (OMIM: 603870) protein CBFA2T3 isoform 2 [Ho (567 aa)
initn: 3896 init1: 3617 opt: 3635 Z-score: 2180.7 bits: 413.6 E(85289): 1e-114
Smith-Waterman score: 3850; 95.8% identity (95.8% similar) in 592 aa overlap (62-653:1-567)
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 GLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGA
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 MPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGA
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 TRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLKWSMVCLLMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNG
:::::::::: :::::::::::::::::::::::::
NP_787 TRPPSFTPHT-------------------------LMNGSSHSPTAINGAPCTPNGFSNG
40 50 60
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 PATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 PATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 TIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 ASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPSN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 GPPQPTPPPHYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVVPGSRQEEVIDHKLTERE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 WAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWARRYSDAEDTKKGPAPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 AARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEAVNEVKRQAMSELQKAVSD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 AERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSSESCWNCGRKASETCSGCN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_787 AARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEAAHSLGPSLPVGAASPSEA
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::::::::::::::::::::::
NP_787 GSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGATRPPSFTPHTHREDGPATLPHGRFHGCLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB6 VLESGLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAA
.. ::: ::.::: : ::.::.::: ::
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. :. :: :::: . : :: .::: ..:::: :.
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::::::.:....:..:.:: .::::::::::::::::::::.::::::::.::::::.::
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:::.:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::.
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:::..: .:: ::::::.::. :::: .:.: .::. ::: . :: .:: ::..:: :.
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::. .: .::::: :: ::::: .: .:. . . ::.:.::. : . :.
XP_016 SPALTVPLMNPGGQFHPTPPPLQHYTLEDIATSHLYREPNKMLEHREVRDRHHSLGLNGG
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pF1KB6 RQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWARR
:.:..::.:::::::.:::::.. :::::.::::::::..:::::::.::::::.: ::
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:.. . .: . ..: .: ... .. . : ::: : ::::: ..:.:.: :::.:
XP_016 YNENTELRKTGTELVSRQHSPGSA-DSLSNDSQREFNSRPGTGYVPVEFWKKTE-AVNKV
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: :::::.::::..::.:: :.:.::::.::...:..::::.:::. :::.::.:.:.::
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:::::::::::::: ::::::::::.:::.::..:::.:.: . .. : : . :
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. : .. ::. . :: :: ..:. .::
XP_016 ARSADCSVPSPALDKTSATTSRSSTPASVTAIDTNGL
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pF1KB6 GLLASAGCSAPRGPRKGGPAPVDRKAKASAMPDSPAEVKTQPRSTPPSMPPPPPAASQGA
:: ::.::: : ::.::.::: :: . :.
XP_011 MPGSPVEVKIQSRSSPPTMPPLPPI-NPGG
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:: :::: . : :: .::: ..:::: :. ::::
XP_011 PRPVSFTPTA-------------------------LSNGINHSPPTLNGAPSPPQRFSNG
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pF1KB6 PATSSTASLSTQHLPPACGARQLSKLKRFLTTLQQFGSDISPEIGERVRTLVLGLVNSTL
::.:....:..:.:: .::::::::::::::::::::.::::::::.::::::.:::::.
XP_011 PASSTSSALTNQQLPATCGARQLSKLKRFLTTLQQFGNDISPEIGEKVRTLVLALVNSTV
70 80 90 100 110 120
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pF1KB6 TIEEFHSKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARLAKQTPAQYLAQHEQLLLD
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::.:::.
XP_011 TIEEFHCKLQEATNFPLRPFVIPFLKANLPLLQRELLHCARAAKQTPSQYLAQHEHLLLN
130 140 150 160 170 180
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pF1KB6 ASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRYSPS-
.: .:: ::::::.::. :::: .:.: .::. ::: . :: .:: ::..:: :.::.
XP_011 TSIASPADSSELLMEVHGNGKRPSPERREENSFDRDTIAPEPPAKRVCTISPAPRHSPAL
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pF1KB6 -------NGPPQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVVPGSRQEE
.: .::::: :: ::::: .: .:. . . ::.:.::. : . :. :.:
XP_011 TVPLMNPGGQFHPTPPPLQHYTLEDIATSHLYREPNKMLEHREVRDRHHSLGLNGGYQDE
250 260 270 280 290 300
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pF1KB6 VIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWARRYSDA
..::.:::::::.:::::.. :::::.::::::::..:::::::.::::::.: :::..
XP_011 LVDHRLTEREWADEWKHLDHALNCIMEMVEKTRRSMAVLRRCQESDREELNYWKRRYNEN
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pF1KB6 EDTKKGPAPAAARPRSSSAGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEAVNEVKRQA
. .: . ..: .: ... .. . : ::: : ::::: ..:.:.: :::.:: ::
XP_011 TELRKTGTELVSRQHSPGSA-DSLSNDSQREFNSRPGTGYVPVEFWKKTE-AVNKVKIQA
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pF1KB6 MSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSSESCWNCGR
:::.::::..::.:: :.:.::::.::...:..::::.:::. :::.::.:.:.::::::
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pF1KB6 KASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEAAHSLGPSL
:::::::::: ::::::::::.:::.::..:::.:.: . .. : : . : . :
XP_011 KASETCSGCNIARYCGSFCQHKDWERHHRLCGQNLHGQSPH-GQGRPLLPVGRGSSARSA
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pF1KB6 PVGAASPS-EAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
.. ::. . :: :: ..:. .::
XP_011 DCSVPSPALDKTSATTSRSSTPASVTAIDTNGL
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pF1KB6 EQLLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQ
: :::::: ::.::: :: ::::::..:.:
XP_016 MPVRTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQ
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::::.:: : :.::::: ::::.:.:.:::.::.::::. :.::.:.::. . :
XP_016 RYSPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHG
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pF1KB6 SRQEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWAR
.::::.:::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.: :
XP_016 TRQEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIR
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pF1KB6 RYSDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEAVN
::::::: ::: . .... :..: ..:. ::. :::: : .:::::.::.:::::::
XP_016 RYSDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVN
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pF1KB6 EVKRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSSES
:::::::.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.:::::::::::
XP_016 EVKRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSES
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pF1KB6 CWNCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEAAH
::::::::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.:: :. : ..
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pF1KB6 SLGPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
:. :. ::.:: .. :. : .:. :. ..:.::
XP_016 SVTPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
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Smith-Waterman score: 1703; 67.2% identity (85.2% similar) in 366 aa overlap (298-653:25-382)
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 LLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRY
.::::: ::.::: :: ::::::..:.:::
XP_016 MRKRPWENRCYHLSKDKSAGLVSKKTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRY
10 20 30 40 50
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pF1KB6 SPSNG----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVVPGSR
::.:: : :.::::: ::::.:.:.:::.::.::::. :.::.:.::. . :.:
XP_016 SPNNGLSYQPNGLPHPTPPPPQHYRLDDMAIAHHYRDSYRHPSHRDLRDRNRPMGLHGTR
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 QEEVIDHKLTEREWAEEWKHLNNLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNHWARRY
:::.:::.::.::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.: :::
XP_016 QEEMIDHRLTDREWAEEWKHLDHLLNCIMDMVEKTRRSLTVLRRCQEADREELNYWIRRY
120 130 140 150 160 170
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pF1KB6 SDAEDTKKGPAPAAARPRSSS-AGPEGPQLDVPREFLPRTLTGYVPEDIWRKAEEAVNEV
::::: ::: . .... :..: ..:. ::. :::: : .:::::.::.:::::::::
XP_016 SDAEDLKKGGGSSSSHSRQQSPVNPDPVALDAHREFLHRPASGYVPEEIWKKAEEAVNEV
180 190 200 210 220 230
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pF1KB6 KRQAMSELQKAVSDAERKAHELITTERAKMERALAEAKRQASEDALTVINQQEDSSESCW
:::::.:::::::.::::::..::::::::::..:::::::.::::.:::::::::::::
XP_016 KRQAMTELQKAVSEAERKAHDMITTERAKMERTVAEAKRQAAEDALAVINQQEDSSESCW
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pF1KB6 NCGRKASETCSGCNAARYCGSFCQHRDWEKHHHVCGQSLQGPTAVVADPVPGPPEAAHSL
::::::::::::::.::::::::::.:::::::.:::.:: :. : .. :.
XP_016 NCGRKASETCSGCNTARYCGSFCQHKDWEKHHHICGQTLQ------AQQQGDTPAVSSSV
300 310 320 330 340
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pF1KB6 GPSLPVGAASPSEAGSAGPSRPGSPSPPGPLDTVPR
:. ::.:: .. :. : .:. :. ..:.::
XP_016 TPN--SGAGSPMDTPPAATPRSTTPGTPSTIETTPR
350 360 370 380
>>XP_016869429 (OMIM: 133435) PREDICTED: protein CBFA2T1 (382 aa)
initn: 1640 init1: 799 opt: 1557 Z-score: 945.8 bits: 184.5 E(85289): 6.1e-46
Smith-Waterman score: 1703; 67.2% identity (85.2% similar) in 366 aa overlap (298-653:25-382)
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 LLLDASASSPIDSSELLLEVNENGKRRTPDRTKENGSDRDPLHPEHLSKRPCTLNPAQRY
.::::: ::.::: :: ::::::..:.:::
XP_016 MRKRPWENRCYHLSKDKSAGLVSKKTKENGFDREPLHSEHPSKRPCTISPGQRY
10 20 30 40 50
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pF1KB6 SPSNG----P---PQPTPPP--HYRLEDIAMAHHFRDAYRHPDPRELRERHRPLVVPGSR
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