Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6124
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6124, 626 aa
1>>>pF1KB6124 626 - 626 aa - 626 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5165+/-0.000957; mu= 10.2276+/- 0.058
mean_var=144.9042+/-28.806, 0's: 0 Z-trim(110.4): 70 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.106545
statistics sampled from 11531 (11599) to 11531 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.356), width: 16
Scan time: 3.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73259.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 626) 4235 662.9 3.7e-190
CCDS31430.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 625) 4218 660.2 2.2e-189
CCDS76387.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 583) 3926 615.3 6.9e-176
CCDS44543.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 582) 3909 612.7 4.2e-175
CCDS58219.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 622) 1715 275.5 1.5e-73
CCDS8712.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 636) 1697 272.7 1e-72
CCDS58222.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 540) 1657 266.5 6.3e-71
CCDS58220.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 588) 1657 266.6 6.8e-71
CCDS58221.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 599) 1657 266.6 6.9e-71
CCDS971.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 774) 1134 186.3 1.3e-46
CCDS65642.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 787) 1130 185.7 2.1e-46
CCDS970.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 789) 1130 185.7 2.1e-46
CCDS65641.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 775) 1118 183.8 7.4e-46
CCDS32307.1 ARNT2 gene_id:9915|Hs108|chr15 ( 717) 1099 180.9 5.3e-45
>>CCDS73259.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 (626 aa)
initn: 4235 init1: 4235 opt: 4235 Z-score: 3527.5 bits: 662.9 E(32554): 3.7e-190
Smith-Waterman score: 4235; 100.0% identity (100.0% similar) in 626 aa overlap (1-626:1-626)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQESMDTDKDDPHGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQESMDTDKDDPHGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 HMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 HMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 DNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 FSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 VPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKKI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LNGGTPDIPSSGLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LNGGTPDIPSSGLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAM
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB6 AVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
610 620
>>CCDS31430.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 (625 aa)
initn: 2427 init1: 2427 opt: 4218 Z-score: 3513.4 bits: 660.2 E(32554): 2.2e-189
Smith-Waterman score: 4218; 99.8% identity (99.8% similar) in 626 aa overlap (1-626:1-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQESMDTDKDDPHGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQESMDTDKDDPHGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 LEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 HMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 SGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKK-DRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDE
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 DNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRW
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 FSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPT
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 VPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKKI
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 LNGGTPDIPSSGLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNGGTPDIPSSGLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAM
540 550 560 570 580 590
610 620
pF1KB6 AVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
600 610 620
>>CCDS76387.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 (583 aa)
initn: 3926 init1: 3926 opt: 3926 Z-score: 3271.2 bits: 615.3 E(32554): 6.9e-176
Smith-Waterman score: 3926; 100.0% identity (100.0% similar) in 579 aa overlap (48-626:5-583)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 PGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MINIESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAH
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 SQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANY
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 KPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLH
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 PKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPS
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 VKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAI
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 GRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYF
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 HQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVST
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 NTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGR
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 MIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSSGLLSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSSGLLSGQ
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 AQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPV
520 530 540 550 560 570
620
pF1KB6 DFSDLPWPL
:::::::::
CCDS76 DFSDLPWPL
580
>>CCDS44543.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 (582 aa)
initn: 2427 init1: 2427 opt: 3909 Z-score: 3257.1 bits: 612.7 E(32554): 4.2e-175
Smith-Waterman score: 3909; 99.8% identity (99.8% similar) in 579 aa overlap (48-626:5-582)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 PGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MINIESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAH
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 SQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANY
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 KPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLH
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 PKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPS
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 VKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAI
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VKVEDKDFPSTCSKKK-DRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAI
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 GRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYF
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 HQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVST
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 NTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGR
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 MIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSSGLLSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITSTPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSSGLLSGQ
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 AQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPV
520 530 540 550 560 570
620
pF1KB6 DFSDLPWPL
:::::::::
CCDS44 DFSDLPWPL
580
>>CCDS58219.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 (622 aa)
initn: 1723 init1: 899 opt: 1715 Z-score: 1434.1 bits: 275.5 E(32554): 1.5e-73
Smith-Waterman score: 1915; 50.2% identity (74.6% similar) in 633 aa overlap (8-626:21-622)
10 20 30 40
pF1KB6 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQ
:. ..:. .::: .:... .. ::::::..: .
CCDS58 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSDPS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 ES-MDTDK------DDP-----HGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDEL
.: . :.: ..: :.: . .: .:::::: :::::::::..:.::
CCDS58 QSGIMTEKVVEKLSQNPLTYLLSTRIEISASSG----SREAHSQTEKRRRDKMNNLIEEL
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 ASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAA
....: :: :.:::::::::::::::...:.: :: :. .::.:.::.:.::.::::..:
CCDS58 SAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 DGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAP
.::::::::.::::::::.:: :::::.: .: ::::::.:::::.::::::::: : .:
CCDS58 EGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 RERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKAD
::.:::::::: :.... : .:. ::.:::::::.: . ::: : .:. ::::
CCDS58 REKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPN--SKKKEH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 RKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRV
:: : ::: ::::.::::. .:..:. . ... :..::::::::. ..::: .::: :
CCDS58 RK-FYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQN-SGEINV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 KSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQT
: :...: :..::::.:::::::::.::::::::::::::::::: ..:.. :. :::.
CCDS58 KPTEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 REKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQ
.::: :. :::. :::::.::.:.:::: ::::::.:::::.::.::.. : :. .:
CCDS58 KEKILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHS-EPGEASF--
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 LTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPS
: : .: .: . ... .:::. :: :::.:: ::.::....:...::
CCDS58 LPCSSQS-------SEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYL
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 SCGSSPLNITS-TPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSS-GLLSGQAQENPGYPYSDSSSIL
. ::: .. . : . : ..:... : :: : : . :.. . .:
CCDS58 D-DSSPTGLMKDTHTVNCRSMSNKELF----PPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHEPLL
530 540 550 560 570
580 590 600 610 620
pF1KB6 GENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
... .. .: . . ::..:::..:. :::..::: : ::::. : :
CCDS58 SDGAQLDFDALCD--------NDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
580 590 600 610 620
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10 20 30 40
pF1KB6 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQ
:. ..:. .::: .:... .. ::::::..: .
CCDS87 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSDPS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KB6 ES-MDTDK------DDP---------------HGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRR
.: . :.: ..: .:.: ::: ..: :::::: :::::
CCDS87 QSGIMTEKVVEKLSQNPLTYLLSTRIEISASSGSRVEDGEHQVKMKAFREAHSQTEKRRR
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 DKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDD
::::..:.::....: :: :.:::::::::::::::...:.: :: :. .::.:.::.:.
CCDS87 DKMNNLIEELSAMIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDN
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 ELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVK
::.::::..:.::::::::.::::::::.:: :::::.: .: ::::::.:::::.::::
CCDS87 ELRHLILKTAEGFLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVK
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 EQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDF
::::: : .:::.:::::::: :.... : .:. ::.:::::::.: . ::: : .
CCDS87 EQLSSFDISPREKLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCL
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270 280 290 300 310 320
pF1KB6 PSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVV
:. :::: :: : ::: ::::.::::. .:..:. . ... :..::::::::. ..:
CCDS87 PN--SKKKEHRK-FYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIV
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 PQPVNGEIRVKSMEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHL
:: .::: :: :...: :..::::.:::::::::.::::::::::::::::::: ..:
CCDS87 PQN-SGEINVKPTEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 AECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANV
.. :. :::..::: :. :::. :::::.::.:.:::: ::::::.:::::.::.::..
CCDS87 TDKHKAVLQSKEKILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHS
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 LEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIME
: :. .: : : .: .: . ... .:::. :: :::.:: ::.::..
CCDS87 -EPGEASF--LPCSSQS-------SEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILD
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510 520 530 540 550 560
pF1KB6 IHRIRGSSPSSCGSSPLNITS-TPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSS-GLLSGQAQENPG
..:...:: . ::: .. . : . : ..:... : :: : : . :..
CCDS87 LQRLQSSSYLD-DSSPTGLMKDTHTVNCRSMSNKELF----PPSPSEMGELEATRQNQST
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KB6 YPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLP
. .:... .. .: . . ::..:::..:. :::..::: : ::::.
CCDS87 VAVHSHEPLLSDGAQLDFDALCD--------NDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQ
590 600 610 620 630
pF1KB6 WPL
: :
CCDS87 WTL
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10 20 30
pF1KB6 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNR
:. ..:. .::: .:... .. :
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10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 KRKGSSTDYQESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELAS
:::::..: : ..::::: :::::::::..:.::..
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100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADG
..: :: :.:::::::::::::::...:.: :: :. .::.:.::.:.::.::::..:.:
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100 110 120 130 140 150
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pF1KB6 FLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRE
:::::::.::::::::.:: :::::.: .: ::::::.:::::.::::::::: : .:::
CCDS58 FLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPRE
160 170 180 190 200 210
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pF1KB6 RLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKADRK
.:::::::: :.... : .:. ::.:::::::.: . ::: : .:. :::: ::
CCDS58 KLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPN--SKKKEHRK
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 SFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKS
: ::: ::::.::::. .:..:. . ... :..::::::::. ..::: .::: ::
CCDS58 -FYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQN-SGEINVKP
280 290 300 310 320 330
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pF1KB6 MEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTRE
:...: :..::::.:::::::::.::::::::::::::::::: ..:.. :. :::..:
CCDS58 TEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQSKE
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 KITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLT
:: :. :::. :::::.::.:.:::: ::::::.:::::.::.::.. : :. .: :
CCDS58 KILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHS-EPGEASF--LP
400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 ASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSC
: .: .: . ... .:::. :: :::.:: ::.::....:...:: .
CCDS58 CSSQS-------SEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYLD-
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 GSSPLNITSTPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSSGLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENP
::: ..
CCDS58 DSSPTGLMKDTHTVNCRSVMVHSWISMPYVTMMTQPWLHL
510 520 530 540
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10 20 30 40
pF1KB6 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQ
:. ..:. .::: .:... .. ::::::..:
CCDS58 MAAEEEAAAGGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPRKRKGSDSD--
10 20 30 40 50
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pF1KB6 ESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSR
: ..::::: :::::::::..:.::....: :: :.:
CCDS58 ---------P---------------SQEAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSAMIPQCNPMAR
60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 KLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRG
::::::::::::::...:.: :: :. .::.:.::.:.::.::::..:.::::::::.::
CCDS58 KLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEGFLFVVGCERG
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLP
::::::.:: :::::.: .: ::::::.:::::.::::::::: : .:::.::::::::
CCDS58 KILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPREKLIDAKTGLQ
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 VKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGY
:.... : .:. ::.:::::::.: . ::: : .:. :::: :: : ::: :::
CCDS58 VHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPN--SKKKEHRK-FYTIHCTGY
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 LKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSMEYVSRHAID
:.::::. .:..:. . ... :..::::::::. ..::: .::: :: :...: :..
CCDS58 LRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQN-SGEINVKPTEFITRFAVN
280 290 300 310 320 330
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pF1KB6 GKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFK
::::.:::::::::.::::::::::::::::::: ..:.. :. :::..::: :. :::.
CCDS58 GKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQSKEKILTDSYKFR
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 IKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSML
:::::.::.:.:::: ::::::.:::::.::.::.. : :. .: : : .:
CCDS58 AKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHS-EPGEASF--LPCSSQS-----
400 410 420 430 440
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pF1KB6 PSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCGSSPLNITS-
.: . ... .:::. :: :::.:: ::.::....:...:: . ::: .. .
CCDS58 --SEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYLD-DSSPTGLMKD
450 460 470 480 490
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pF1KB6 TPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSS-GLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMID
: . : ..:... : :: : : . :.. . .:... .. .: .
CCDS58 THTVNCRSMSNKELF----PPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHEPLLSDGAQLDFDALC
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620
pF1KB6 NDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
. ::..:::..:. :::..::: : ::::. : :
CCDS58 D--------NDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
560 570 580
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10 20 30
pF1KB6 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNR
:. ..:. .::: .:... .. :
CCDS58 AAEEEAAAGGEVAGGEATAPGKVLREENQCIAPVVSSRVSPGTRPTAMGSFSSHMTEFPR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 KRKGSSTDYQESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELAS
:::::..: : ..::::: :::::::::..:.::..
CCDS58 KRKGSDSD-----------P---------------SQEAHSQTEKRRRDKMNNLIEELSA
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100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADG
..: :: :.:::::::::::::::...:.: :: :. .::.:.::.:.::.::::..:.:
CCDS58 MIPQCNPMARKLDKLTVLRMAVQHLRSLKGLTNSYVGSNYRPSFLQDNELRHLILKTAEG
100 110 120 130 140 150
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pF1KB6 FLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRE
:::::::.::::::::.:: :::::.: .: ::::::.:::::.::::::::: : .:::
CCDS58 FLFVVGCERGKILFVSKSVSKILNYDQASLTGQSLFDFLHPKDVAKVKEQLSSFDISPRE
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 RLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKCNRPSVKVEDKDFPSTCSKKKADRK
.:::::::: :.... : .:. ::.:::::::.: . ::: : .:. :::: ::
CCDS58 KLIDAKTGLQVHSNLHAGRTRVYSGSRRSFFCRIKSCKISVKEEHGCLPN--SKKKEHRK
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 SFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKS
: ::: ::::.::::. .:..:. . ... :..::::::::. ..::: .::: ::
CCDS58 -FYTIHCTGYLRSWPPNIVGMEEERNSKKDNSNFTCLVAIGRLQPYIVPQN-SGEINVKP
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 MEYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTRE
:...: :..::::.:::::::::.::::::::::::::::::: ..:.. :. :::..:
CCDS58 TEFITRFAVNGKFVYVDQRATAILGYLPQELLGTSCYEYFHQDDHNNLTDKHKAVLQSKE
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 KITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLT
:: :. :::. :::::.::.:.:::: ::::::.:::::.::.::.. : :. .: :
CCDS58 KILTDSYKFRAKDGSFVTLKSQWFSFTNPWTKELEYIVSVNTLVLGHS-EPGEASF--LP
400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 ASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSC
: .: .: . ... .:::. :: :::.:: ::.::....:...:: .
CCDS58 CSSQS-------SEESSRQSCMSVPGMSTGTVLGAGSIGTDIANEILDLQRLQSSSYLD-
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 GSSPLNITS-TPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPSS-GLLSGQAQENPGYPYSDSSSILGE
::: .. . : . : ..:... : :: : : . :.. . .:..
CCDS58 DSSPTGLMKDTHTVNCRSMSNKELF----PPSPSEMGELEATRQNQSTVAVHSHEPLLSD
510 520 530 540 550
580 590 600 610 620
pF1KB6 NPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
. .. .: . . ::..:::..:. :::..::: : ::::. : :
CCDS58 GAQLDFDALCD--------NDDTAMAAFMNYLEAEGGLGDPGDFSDIQWTL
560 570 580 590
>>CCDS971.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 (774 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSGVDCNRKRKGSSTDYQESMDTDKDDPHGR
:: : ::. ..:. . :.. . . . ..: : :: .:
CCDS97 MAATTANPEMTSDVPSLGPA--IASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFD-DDGEGN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 LEYTE-HQGRIKN-----AREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTV
.. . . ...: ::: ::.::.:::.::...: ::...::::.:..:: ::::.
CCDS97 SKFLRCDDDQMSNDKERFARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKLTI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSE
:::::.:::.:::. : :...:::.::.:.:::::::.:::::::.:.:. :....::.
CCDS97 LRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYVSD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 SVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITP
:: .:: :.. .:..:.: .:: :. :..::::.:..: :..: ::: :: .
CCDS97 SVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGT-VKKEGQQ
180 190 200 210 220 230
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