FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6116, 582 aa
1>>>pF1KB6116 582 - 582 aa - 582 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3956+/-0.00084; mu= 18.4533+/- 0.051
mean_var=75.1022+/-14.956, 0's: 0 Z-trim(107.7): 52 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.147995
statistics sampled from 9661 (9713) to 9661 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.298), width: 16
Scan time: 3.580
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS2280.1 FKBP7 gene_id:51661|Hs108|chr2 ( 222) 312 76.0 5.5e-14
CCDS5423.1 FKBP14 gene_id:55033|Hs108|chr7 ( 211) 308 75.1 9.6e-14
CCDS44871.1 FKBP11 gene_id:51303|Hs108|chr12 ( 146) 297 72.7 3.6e-13
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CCDS8512.1 FKBP4 gene_id:2288|Hs108|chr12 ( 459) 268 66.8 6.7e-11
CCDS13014.1 FKBP1A gene_id:2280|Hs108|chr20 ( 108) 260 64.7 6.8e-11
>>CCDS11409.1 FKBP10 gene_id:60681|Hs108|chr17 (582 aa)
initn: 3999 init1: 3999 opt: 3999 Z-score: 4613.0 bits: 863.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3999; 100.0% identity (100.0% similar) in 582 aa overlap (1-582:1-582)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MFPAGPPSHSLLRLPLLQLLLLVVQAVGRGLGRASPAGGPLEDVVIERYHIPRACPREVQ
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CCDS11 MFPAGPPSHSLLRLPLLQLLLLVVQAVGRGLGRASPAGGPLEDVVIERYHIPRACPREVQ
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGDFVRYHYNGTFEDGKKFDSSYDRNTLVAIVVGVGRLITGMDRGLMGMCVNERRRLIVP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PHLGYGSIGLAGLIPPDATLYFDVVLLDVWNKEDTVQVSTLLRPPHCPRMVQDGDFVRYH
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YNGTLLDGTSFDTSYSKGGTYDTYVGSGWLIKGMDQGLLGMCPGERRKIIIPPFLAYGEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GYGTVIPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPPGCVRRAGAGDFMRYHYNGSLMDG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TLFDSSYSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQGACMGERRRITIPPHLAYGENGTGDKIPG
310 320 330 340 350 360
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pF1KB6 SAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYNCSLLDGTQLFTSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYNCSLLDGTQLFTSH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 DYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERRQLIVPPHLAHGESGARGVPGSAVLLFEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERRQLIVPPHLAHGESGARGVPGSAVLLFEV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 ELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRLMPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRLMPG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB6 QDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKLKSDEDEERVHEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKLKSDEDEERVHEEL
550 560 570 580
>>CCDS5439.1 FKBP9 gene_id:11328|Hs108|chr7 (570 aa)
initn: 2390 init1: 1502 opt: 2331 Z-score: 2688.4 bits: 507.4 E(32554): 2e-143
Smith-Waterman score: 2331; 58.0% identity (80.0% similar) in 571 aa overlap (15-582:12-570)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MFPAGPPSHSLLRLPLLQLLLLVVQAVGRGLGRASPAGGPLED--VVIERYHIPRACPRE
::: ::: :. :.:.:..: : . ::: .: :::
CCDS54 MAFRGWRPPPPPLLLLLLWVT-------GQAAPVAGLGSDAELQIERRFVPDECPRT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 VQMGDFVRYHYNGTFEDGKKFDSSYDRNTLVAIVVGVGRLITGMDRGLMGMCVNERRRLI
:. :::::::: ::: ::.::::::::.. . :: :.::::::..:.:::::::: .
CCDS54 VRSGDFVRYHYVGTFPDGQKFDSSYDRDSTFNVFVGKGQLITGMDQALVGMCVNERRFVK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VPPHLGYGSIGLAGLIPPDATLYFDVVLLDVWNKEDTVQVSTLLRPPHCPRMVQDGDFVR
.::.:.::. :..:.:::...:.:::.:.:.::.:: ::. : ..:: ::: .: .::::
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120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 YHYNGTLLDGTSFDTSYSKGGTYDTYVGSGWLIKGMDQGLLGMCPGERRKIIIPPFLAYG
::::::.:::: ::.:... ::::::: :::: :::.:::::: ::.: : ::::::::
CCDS54 YHYNGTFLDGTLFDSSHNRMKTYDTYVGIGWLIPGMDKGLLGMCVGEKRIITIPPFLAYG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 EKGYGTVIPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPPGCVRRAGAGDFMRYHYNGSLM
: : : :: :::::: : :.:.:::::....:. .: .: : . .:::.::::::.:.
CCDS54 EDGDGKDIPGQASLVFDVALLDLHNPKDSISIENKVVPENCERISQSGDFLRYHYNGTLL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DGTLFDSSYSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQGACMGERRRITIPPHLAYGENGTGDKI
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CCDS54 DGTLFDSSYSRNRTFDTYIGQGYVIPGMDEGLLGVCIGEKRRIVVPPHLGYGEEGRGN-I
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 PGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYNCSLLDGTQLFT
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CCDS54 PGSAVLVFDIHVIDFHNPSDSISITSHYKPPD-CSVLSKKGDYLKYHYNASLLDGTLLDS
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 SHDYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERRQLIVPPHLAHGESGARG-VPGSAVLL
. . : . .::...:. :.: ::. :::::.: .:.::::..::.:. : :::::::.
CCDS54 TWNLGKTYNIVLGSGQVVLGMDMGLREMCVGEKRTVIIPPHLGYGEAGVDGEVPGSAVLV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FEVELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRL
:..::. ::: ::.:.:. . ::::..: . .::: :::: .:.:::. :::.:
CCDS54 FDIELLELVAGLPEGYMFIWNGEVSPNLFEEIDKDGNGEVLLEEFSEYIHAQVASGKGKL
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KB6 MPGQDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKLKSDEDEERVHEEL
:: : : . .:: ::::: :::.:..:.::: :.: :.::
CCDS54 APGFDAELIVKNMFTNQDRNGDGKVTAEEFKLK---DQEAKHDEL
530 540 550 560 570
>>CCDS64622.1 FKBP9 gene_id:11328|Hs108|chr7 (623 aa)
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Smith-Waterman score: 2203; 53.4% identity (74.0% similar) in 607 aa overlap (32-582:22-623)
10 20 30 40 50
pF1KB6 FPAGPPSHSLLRLPLLQLLLLVVQAVGRGLGRASPAGGPLED--VVIERYHIPRACPREV
:.:.:..: : . ::: .: ::: :
CCDS64 MAFRGWRPPPPPLLLLLLWVTGQAAPVAGLGSDAELQIERRFVPDECPRTV
10 20 30 40 50
60 70 80
pF1KB6 QMGDFVRYHYNGTFEDGKKFDS--------------------------------------
. :::::::: ::: ::.::::
CCDS64 RSGDFVRYHYVGTFPDGQKFDSRYWDTAEDKADKSPCPQVRVGVNTSPSCRLKQKGVGIY
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120
pF1KB6 ---------------SYDRNTLVAIVVGVGRLITGMDRGLMGMCVNERRRLIVPPHLGYG
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CCDS64 WKDLQFLVRVQNHGLSYDRDSTFNVFVGKGQLITGMDQALVGMCVNERRFVKIPPKLAYG
120 130 140 150 160 170
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SIGLAGLIPPDATLYFDVVLLDVWNKEDTVQVSTLLRPPHCPRMVQDGDFVRYHYNGTLL
. :..:.:::...:.:::.:.:.::.:: ::. : ..:: ::: .: .::::::::::.:
CCDS64 NEGVSGVIPPNSVLHFDVLLMDIWNSEDQVQIHTYFKPPSCPRTIQVSDFVRYHYNGTFL
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DGTSFDTSYSKGGTYDTYVGSGWLIKGMDQGLLGMCPGERRKIIIPPFLAYGEKGYGTVI
::: ::.:... ::::::: :::: :::.:::::: ::.: : ::::::::: : : :
CCDS64 DGTLFDSSHNRMKTYDTYVGIGWLIPGMDKGLLGMCVGEKRIITIPPFLAYGEDGDGKDI
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPPGCVRRAGAGDFMRYHYNGSLMDGTLFDSS
: :::::: : :.:.:::::....:. .: .: : . .:::.::::::.:.::::::::
CCDS64 PGQASLVFDVALLDLHNPKDSISIENKVVPENCERISQSGDFLRYHYNGTLLDGTLFDSS
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 YSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQGACMGERRRITIPPHLAYGENGTGDKIPGSAVLIF
::::.:..:::::::.:::::.:: :.:.::.:::..::::.:::.: :. :::::::.:
CCDS64 YSRNRTFDTYIGQGYVIPGMDEGLLGVCIGEKRRIVVPPHLGYGEEGRGN-IPGSAVLVF
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 NVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYNCSLLDGTQLFTSHDYGAPQ
..::::::::.: . : . .: . :. .: ::...:::: :::::: : .. . :
CCDS64 DIHVIDFHNPSDSISITSHYKPPD-CSVLSKKGDYLKYHYNASLLDGTLLDSTWNLGKTY
420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 EATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERRQLIVPPHLAHGESGARG-VPGSAVLLFEVELVSR
. .::...:. :.: ::. :::::.: .:.::::..::.:. : :::::::.:..::.
CCDS64 NIVLGSGQVVLGMDMGLREMCVGEKRTVIIPPHLGYGEAGVDGEVPGSAVLVFDIELLEL
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 EDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRLMPGQDPEK
::: ::.:.:. . ::::..: . .::: :::: .:.:::. :::.: :: : :
CCDS64 VAGLPEGYMFIWNGEVSPNLFEEIDKDGNGEVLLEEFSEYIHAQVASGKGKLAPGFDAEL
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580
pF1KB6 TIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKLKSDEDEERVHEEL
. .:: ::::: :::.:..:.::: :.: :.::
CCDS64 IVKNMFTNQDRNGDGKVTAEEFKLK---DQEAKHDEL
590 600 610 620
>>CCDS64623.1 FKBP9 gene_id:11328|Hs108|chr7 (338 aa)
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Smith-Waterman score: 1357; 56.3% identity (80.4% similar) in 341 aa overlap (243-582:3-338)
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pF1KB6 GMDQGLLGMCPGERRKIIIPPFLAYGEKGYGTVIPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLET
: :: :::::: : :.:.:::::....:.
CCDS64 MAGKDIPGQASLVFDVALLDLHNPKDSISIEN
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LELPPGCVRRAGAGDFMRYHYNGSLMDGTLFDSSYSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQG
.: .: : . .:::.::::::.:.::::::::::::.:..:::::::.:::::.:: :
CCDS64 KVVPENCERISQSGDFLRYHYNGTLLDGTLFDSSYSRNRTFDTYIGQGYVIPGMDEGLLG
40 50 60 70 80 90
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pF1KB6 ACMGERRRITIPPHLAYGENGTGDKIPGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETC
.:.::.:::..::::.:::.: :. :::::::.:..::::::::.: . : . .: . :
CCDS64 VCIGEKRRIVVPPHLGYGEEGRGN-IPGSAVLVFDIHVIDFHNPSDSISITSHYKPPD-C
100 110 120 130 140 150
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pF1KB6 NETTKLGDFVRYHYNCSLLDGTQLFTSHDYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERR
. .: ::...:::: :::::: : .. . : . .::...:. :.: ::. :::::.:
CCDS64 SVLSKKGDYLKYHYNASLLDGTLLDSTWNLGKTYNIVLGSGQVVLGMDMGLREMCVGEKR
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 QLIVPPHLAHGESGARG-VPGSAVLLFEVELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDL
.:.::::..::.:. : :::::::.:..::. ::: ::.:.:. . ::::..:
CCDS64 TVIIPPHLGYGEAGVDGEVPGSAVLVFDIELLELVAGLPEGYMFIWNGEVSPNLFEEIDK
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 NKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRLMPGQDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKLKS
. .::: :::: .:.:::. :::.: :: : : . .:: ::::: :::.:..:.:::
CCDS64 DGNGEVLLEEFSEYIHAQVASGKGKLAPGFDAELIVKNMFTNQDRNGDGKVTAEEFKLK-
280 290 300 310 320
580
pF1KB6 DEDEERVHEEL
:.: :.::
CCDS64 --DQEAKHDEL
330
>>CCDS8063.1 FKBP2 gene_id:2286|Hs108|chr11 (142 aa)
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Smith-Waterman score: 335; 46.2% identity (69.8% similar) in 106 aa overlap (156-261:31-136)
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GSIGLAGLIPPDATLYFDVVLLDVWNKEDTVQVSTLLRPPHCPRMVQDGDFVRYHYNGTL
.:... : ::: . :: ...::.: :
CCDS80 MRLSWFRVLTVLSICLSAVATATGAEGKRKLQIGVKKRVDHCPIKSRKGDVLHMHYTGKL
10 20 30 40 50 60
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 LDGTSFDTSYSKGGTYDTYVGSGWLIKGMDQGLLGMCPGERRKIIIPPFLAYGEKGYGTV
::: ::.: .. . .:.: .::: :::::::: ::.::..:: :.:::.:
CCDS80 EDGTEFDSSLPQNQPFVFSLGTGQVIKGWDQGLLGMCEGEKRKLVIPSELGYGERGAPPK
70 80 90 100 110 120
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 IPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPPGCVRRAGAGDFMRYHYNGSLMDGTLFDS
:: :.:::.: :. .
CCDS80 IPGGATLVFEVELLKIERRTEL
130 140
>>CCDS46462.1 FKBP7 gene_id:51661|Hs108|chr2 (221 aa)
initn: 332 init1: 207 opt: 320 Z-score: 373.8 bits: 77.7 E(32554): 1.7e-14
Smith-Waterman score: 338; 31.5% identity (65.5% similar) in 200 aa overlap (380-573:35-220)
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 GENGTGDKIPGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYNCS
:.:..: :: :.:..:.: ::.. ::.
CCDS46 MHFLFRFIVFFYLWGLFTAQRQKKEESTEEVKIEVLHRP-ENCSKTSKKGDLLNAHYDGY
10 20 30 40 50 60
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 LL-DGTQLFTS--HDYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERRQLIVPPHLAHGESG
: ::.... : .. : :. .::...::.::: .. :: ::.:....:: .:.:. :
CCDS46 LAKDGSKFYCSRTQNEGHPKWFVLGVGQVIKGLDIAMTDMCPGEKRKVVIPPSFAYGKEG
70 80 90 100 110 120
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 ARG-VPGSAVLLFEVELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFSTF
.: .: .:.:.::.:: . : : . . :...:...: .. :.. .
CCDS46 YEGKIPPDATLIFEIELYAVTKG-PRSI----------ETFKQIDMDNDRQLSKAEINLY
130 140 150 160 170
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 IKAQVSEG-KGRLMPGQDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKL-KSDEDEERVHEEL
.. . . : : :: .. :.:...:.. :: :. : .. . ::
CCDS46 LQREFEKDEKPRDKSYQDA--VLEDIFKKNDHDGDGFISPKEYNVYQHDEL
180 190 200 210 220
>>CCDS8773.1 FKBP11 gene_id:51303|Hs108|chr12 (201 aa)
initn: 321 init1: 189 opt: 312 Z-score: 365.1 bits: 76.0 E(32554): 5.1e-14
Smith-Waterman score: 312; 40.4% identity (72.8% similar) in 114 aa overlap (259-371:29-141)
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 IIIPPFLAYGEKGYGTVIPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPP-GCVRRAGAGD
.....: ..:.::: :: :.. :. ::
CCDS87 MTLRPSLLPLHLLLLLLLSAAVCRAEAGLETESPVRTLQVETLVEPPEPCAEPAAFGD
10 20 30 40 50
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 FMRYHYNGSLMDGTLFDSSYSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQGACMGERRRITIPPHL
.. ::.:::.:: ..:.: .:. .:: .:::..:.: :.::.:: :: ::
CCDS87 TLHIHYTGSLVDGRIIDTSLTRDPLV-IELGQKQVIPGLEQSLLDMCVGEKRRAIIPSHL
60 70 80 90 100 110
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 AYGENGTGDKIPGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYN
:::. : ..:..::. ..:..:
CCDS87 AYGKRGFPPSVPADAVVQYDVELIALIRANYWLKLVKGILPLVGMAMVPALLGLIGYHLY
120 130 140 150 160 170
>>CCDS2280.1 FKBP7 gene_id:51661|Hs108|chr2 (222 aa)
initn: 331 init1: 173 opt: 312 Z-score: 364.5 bits: 76.0 E(32554): 5.5e-14
Smith-Waterman score: 333; 31.8% identity (65.7% similar) in 201 aa overlap (380-573:35-221)
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 GENGTGDKIPGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYNCS
:.:..: :: :.:..:.: ::.. ::.
CCDS22 MHFLFRFIVFFYLWGLFTAQRQKKEESTEEVKIEVLHRP-ENCSKTSKKGDLLNAHYDGY
10 20 30 40 50 60
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 LL-DGTQLFTS--HDYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGMCVGERRQLIVPPHLAHGESG
: ::.... : .. : :. .::...::.::: .. :: ::.:....:: .:.:. :
CCDS22 LAKDGSKFYCSRTQNEGHPKWFVLGVGQVIKGLDIAMTDMCPGEKRKVVIPPSFAYGKEG
70 80 90 100 110 120
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 -ARG-VPGSAVLLFEVELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLFEDMDLNKDGEVPPEEFST
:.: .: .:.:.::.:: . : : . . :...:...: .. :..
CCDS22 YAEGKIPPDATLIFEIELYAVTKG-PRSI----------ETFKQIDMDNDRQLSKAEINL
130 140 150 160 170
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 FIKAQVSEG-KGRLMPGQDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDELKL-KSDEDEERVHEEL
... . . : : :: .. :.:...:.. :: :. : .. . ::
CCDS22 YLQREFEKDEKPRDKSYQDA--VLEDIFKKNDHDGDGFISPKEYNVYQHDEL
180 190 200 210 220
>>CCDS5423.1 FKBP14 gene_id:55033|Hs108|chr7 (211 aa)
initn: 381 init1: 171 opt: 308 Z-score: 360.2 bits: 75.1 E(32554): 9.6e-14
Smith-Waterman score: 380; 33.2% identity (63.6% similar) in 217 aa overlap (361-573:7-210)
340 350 360 370 380
pF1KB6 QGACMGERRRITIPPHLAYGENGTGDKIPGSAVL-IFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPS
.::: .: . .: : :.:..:..:
CCDS54 MRLFLWNAVLTLFVTSLIGALIPEPEVKIEVLQKPF
10 20 30
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 ETCNETTKLGDFVRYHYNCSLLDGTQLFTS---HDYGAPQEATLGANKVIEGLDTGLQGM
:.. :: ::.. ::. : .:: : :. : : ::: ....: : ::.::
CCDS54 -ICHRKTKGGDLMLVHYEGYLEKDGSLFHSTHKHNNGQPIWFTLGILEALKGWDQGLKGM
40 50 60 70 80 90
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 CVGERRQLIVPPHLAHGESGARGVPGSAVLLFEVELVSREDGLPTGYLFVWHKDPPANLF
::::.:.::.:: :..:. : .: ..:.:...:. ..: : . :.. :
CCDS54 CVGEKRKLIIPPALGYGKEGKGKIPPESTLIFNIDLLEIRNG-PRS-----HES-----F
100 110 120 130 140
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 EDMDLNKDGEVPPEEFSTFIKAQVSEGKGRLMPGQDPEKTIGDMFQNQDRNQDGKITVDE
..:::: : .. .: ....: . : .: .. . . . :.:...:...:: :.. :
CCDS54 QEMDLNDDWKLSKDEVKAYLKKEF-EKHGAVVNESHHDALVEDIFDKEDEDKDGFISARE
150 160 170 180 190 200
570 580
pF1KB6 LKLKSDEDEERVHEEL
. : ::
CCDS54 FTYKHDEL
210
>>CCDS44871.1 FKBP11 gene_id:51303|Hs108|chr12 (146 aa)
initn: 424 init1: 174 opt: 297 Z-score: 349.8 bits: 72.7 E(32554): 3.6e-13
Smith-Waterman score: 297; 41.3% identity (71.2% similar) in 104 aa overlap (259-361:29-131)
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 IIIPPFLAYGEKGYGTVIPPQASLVFHVLLIDVHNPKDAVQLETLELPP-GCVRRAGAGD
.....: ..:.::: :: :.. :. ::
CCDS44 MTLRPSLLPLHLLLLLLLSAAVCRAEAGLETESPVRTLQVETLVEPPEPCAEPAAFGD
10 20 30 40 50
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 FMRYHYNGSLMDGTLFDSSYSRNHTYNTYIGQGYIIPGMDQGLQGACMGERRRITIPPHL
.. ::.:::.:: ..:.: .:. .:: .:::..:.: :.::.:: :: ::
CCDS44 TLHIHYTGSLVDGRIIDTSLTRDPLV-IELGQKQVIPGLEQSLLDMCVGEKRRAIIPSHL
60 70 80 90 100 110
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 AYGENGTGDKIPGSAVLIFNVHVIDFHNPADVVEIRTLSRPSETCNETTKLGDFVRYHYN
:::. : ..::.
CCDS44 AYGKRGFPPSVPGTKDNLMRPPGMTSSSQ
120 130 140
582 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 21:47:01 2016 done: Fri Nov 4 21:47:02 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]