Result of FASTA (omim) for
pF1KB6115
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6115, 620 aa
1>>>pF1KB6115 620 - 620 aa - 620 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3421+/-0.000451; mu= 24.6505+/- 0.028
mean_var=64.3901+/-12.778, 0's: 0 Z-trim(109.7): 101 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.159832
statistics sampled from 17794 (17895) to 17794 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 9.160
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001035 (OMIM: 126455,188890,613135) sodium-depe ( 620) 4179 973.1 0
NP_001165972 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependen ( 617) 2850 666.7 6.6e-191
NP_001034 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependent n ( 617) 2850 666.7 6.6e-191
NP_001165975 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependen ( 628) 2817 659.1 1.3e-188
XP_011521597 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 628) 2817 659.1 1.3e-188
XP_006721326 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 628) 2817 659.1 1.3e-188
NP_001165973 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependen ( 512) 2264 531.5 2.8e-150
NP_001036 (OMIM: 164230,182138,607834) sodium-depe ( 630) 2065 485.7 2.1e-136
XP_011521601 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 376) 1798 423.9 4.9e-118
XP_011521602 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 376) 1798 423.9 4.9e-118
XP_011519312 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 614) 1769 417.4 7.1e-116
NP_001193860 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 1769 417.4 7.1e-116
NP_001116319 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 1769 417.4 7.1e-116
NP_003035 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-depe ( 614) 1769 417.4 7.1e-116
NP_001116320 (OMIM: 603080) sodium- and chloride-d ( 614) 1769 417.4 7.1e-116
XP_005253805 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 571) 1756 414.4 5.4e-115
XP_005253804 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 610) 1754 414.0 7.8e-115
XP_011521600 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 395) 1750 412.8 1.1e-114
XP_006719068 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 570) 1749 412.8 1.7e-114
NP_057699 (OMIM: 615097) sodium- and chloride-depe ( 602) 1739 410.5 8.5e-114
XP_006713370 (OMIM: 186854) PREDICTED: sodium- and ( 649) 1724 407.1 9.9e-113
NP_003034 (OMIM: 186854) sodium- and chloride-depe ( 620) 1722 406.6 1.3e-112
XP_011532332 (OMIM: 186854) PREDICTED: sodium- and ( 620) 1722 406.6 1.3e-112
NP_001127839 (OMIM: 186854) sodium- and chloride-d ( 721) 1722 406.7 1.5e-112
NP_005620 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chlori ( 635) 1720 406.1 1.8e-112
NP_055043 (OMIM: 606205) sodium-dependent proline ( 636) 1713 404.5 5.6e-112
NP_055044 (OMIM: 607952) sodium- and chloride-depe ( 632) 1686 398.3 4.2e-110
NP_001136277 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chl ( 625) 1654 390.9 7e-108
XP_016865259 (OMIM: 606205) PREDICTED: sodium-depe ( 555) 1491 353.3 1.3e-96
XP_011521599 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 572) 1479 350.5 9.2e-96
XP_011521598 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodi ( 583) 1446 342.9 1.8e-93
NP_001136278 (OMIM: 300036,300352) sodium- and chl ( 520) 1383 328.3 4e-89
XP_011519314 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 483) 1367 324.6 4.9e-88
XP_016875333 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 394) 1307 310.7 6.2e-84
XP_011532327 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1296 308.3 4.8e-83
XP_006713369 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1296 308.3 4.8e-83
XP_016862560 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1296 308.3 4.8e-83
XP_005265467 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1296 308.3 4.8e-83
XP_011532329 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1296 308.3 4.8e-83
XP_005265468 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1296 308.3 4.8e-83
NP_003033 (OMIM: 137165,616421) sodium- and chlori ( 599) 1296 308.3 4.8e-83
XP_016862561 (OMIM: 137165,616421) PREDICTED: sodi ( 599) 1296 308.3 4.8e-83
XP_016874033 (OMIM: 604159,614618) PREDICTED: sodi ( 505) 1243 296.0 2e-79
NP_001305298 (OMIM: 604159,614618) sodium- and chl ( 563) 1238 294.9 4.9e-79
NP_004202 (OMIM: 604159,614618) sodium- and chlori ( 797) 1238 295.1 6.2e-79
XP_016874034 (OMIM: 604159,614618) PREDICTED: sodi ( 450) 1222 291.2 5.4e-78
NP_001177926 (OMIM: 615097) sodium- and chloride-d ( 510) 1215 289.6 1.8e-77
XP_011519315 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 440) 1212 288.8 2.6e-77
XP_011519316 (OMIM: 615097) PREDICTED: sodium- and ( 440) 1212 288.8 2.6e-77
XP_016875330 (OMIM: 603080) PREDICTED: sodium- and ( 426) 1171 279.4 1.8e-74
>>NP_001035 (OMIM: 126455,188890,613135) sodium-dependen (620 aa)
initn: 4179 init1: 4179 opt: 4179 Z-score: 5204.6 bits: 973.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4179; 100.0% identity (100.0% similar) in 620 aa overlap (1-620:1-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGPKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGPKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 ETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 NNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NNSWNSPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 TACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 DFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 DSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 GTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 VTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKD
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB6 RELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::::::::::::::::::::
NP_001 RELVDRGEVRQFTLRHWLKV
610 620
>>NP_001165972 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependent no (617 aa)
initn: 2847 init1: 1978 opt: 2850 Z-score: 3548.4 bits: 666.7 E(85289): 6.6e-191
Smith-Waterman score: 2850; 67.0% identity (85.6% similar) in 619 aa overlap (11-620:6-617)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGP-------KEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQS
:. : : .. .:: : .::..:::.:::: : ::..
NP_001 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQ----CLLAPRDG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPL
.:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:: ::..::::::
NP_001 --DAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPL
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTT
:::::::::.:::::: ::::::..::::..::::.:::::.:::::::.:.:::::::
NP_001 FYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGID
.::: :...::::::.: . :. :. . . . :::::..::::::::.: ::
NP_001 NLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAI
:.: :.::: ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::..:::::::
NP_001 DIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGAS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTS
.:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::::::..:.:
NP_001 NGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 INSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVF
:: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.:: :. :::::
NP_001 INCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 FIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYV
:.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.:::.:.:::::
NP_001 FVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCF
.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.::::::::.::: :
NP_001 LTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 LLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKL
:::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: : ::. :.:
NP_001 LLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERL
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KB6 AYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::.:.::....:: . ..::: :.::: .
NP_001 AYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
590 600 610
>>NP_001034 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependent norad (617 aa)
initn: 2847 init1: 1978 opt: 2850 Z-score: 3548.4 bits: 666.7 E(85289): 6.6e-191
Smith-Waterman score: 2850; 67.0% identity (85.6% similar) in 619 aa overlap (11-620:6-617)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGP-------KEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQS
:. : : .. .:: : .::..:::.:::: : ::..
NP_001 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQ----CLLAPRDG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPL
.:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:: ::..::::::
NP_001 --DAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPL
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTT
:::::::::.:::::: ::::::..::::..::::.:::::.:::::::.:.:::::::
NP_001 FYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGID
.::: :...::::::.: . :. :. . . . :::::..::::::::.: ::
NP_001 NLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAI
:.: :.::: ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::..:::::::
NP_001 DIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGAS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTS
.:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::::::..:.:
NP_001 NGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 INSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVF
:: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.:: :. :::::
NP_001 INCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 FIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYV
:.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.:::.:.:::::
NP_001 FVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCF
.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.::::::::.::: :
NP_001 LTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 LLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKL
:::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: : ::. :.:
NP_001 LLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERL
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KB6 AYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::.:.::....:: . ..::: :.::: .
NP_001 AYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
590 600 610
>>NP_001165975 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependent no (628 aa)
initn: 2814 init1: 1945 opt: 2817 Z-score: 3507.2 bits: 659.1 E(85289): 1.3e-188
Smith-Waterman score: 2817; 66.9% identity (85.7% similar) in 614 aa overlap (11-615:6-612)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGP-------KEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQS
:. : : .. .:: : .::..:::.:::: : ::..
NP_001 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQ----CLLAPRDG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPL
.:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:: ::..::::::
NP_001 --DAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPL
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTT
:::::::::.:::::: ::::::..::::..::::.:::::.:::::::.:.:::::::
NP_001 FYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGID
.::: :...::::::.: . :. :. . . . :::::..::::::::.: ::
NP_001 NLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAI
:.: :.::: ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::..:::::::
NP_001 DIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGAS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTS
.:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::::::..:.:
NP_001 NGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 INSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVF
:: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.:: :. :::::
NP_001 INCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 FIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYV
:.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.:::.:.:::::
NP_001 FVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCF
.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.::::::::.::: :
NP_001 LTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 LLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKL
:::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: : ::. :.:
NP_001 LLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERL
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KB6 AYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::.:.::....:: . ..::: ..
NP_001 AYGITPENEHHLVAQRDIRQFQMKTRQGRRRATNSCQISC
590 600 610 620
>>XP_011521597 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodium-d (628 aa)
initn: 2814 init1: 1945 opt: 2817 Z-score: 3507.2 bits: 659.1 E(85289): 1.3e-188
Smith-Waterman score: 2817; 66.9% identity (85.7% similar) in 614 aa overlap (11-615:6-612)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGP-------KEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQS
:. : : .. .:: : .::..:::.:::: : ::..
XP_011 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQ----CLLAPRDG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPL
.:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:: ::..::::::
XP_011 --DAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPL
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTT
:::::::::.:::::: ::::::..::::..::::.:::::.:::::::.:.:::::::
XP_011 FYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGID
.::: :...::::::.: . :. :. . . . :::::..::::::::.: ::
XP_011 NLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAI
:.: :.::: ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::..:::::::
XP_011 DIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGAS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTS
.:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::::::..:.:
XP_011 NGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 INSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVF
:: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.:: :. :::::
XP_011 INCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 FIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYV
:.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.:::.:.:::::
XP_011 FVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCF
.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.::::::::.::: :
XP_011 LTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 LLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKL
:::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: : ::. :.:
XP_011 LLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERL
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KB6 AYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::.:.::....:: . ..::: ..
XP_011 AYGITPENEHHLVAQRDIRQFQMKTRQGRRRATNSCQISC
590 600 610 620
>>XP_006721326 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodium-d (628 aa)
initn: 2814 init1: 1945 opt: 2817 Z-score: 3507.2 bits: 659.1 E(85289): 1.3e-188
Smith-Waterman score: 2817; 66.9% identity (85.7% similar) in 614 aa overlap (11-615:6-612)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSKSKCSVGLMSSVVAPAKEPNAVGP-------KEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQS
:. : : .. .:: : .::..:::.:::: : ::..
XP_006 MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQ----CLLAPRDG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PVEAQDRETWGKKIDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPL
.:: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:: ::..::::::
XP_006 --DAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTLFLIIAGMPL
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 FYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTT
:::::::::.:::::: ::::::..::::..::::.:::::.:::::::.:.:::::::
XP_006 FYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 ELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGID
.::: :...::::::.: . :. :. . . . :::::..::::::::.: ::
XP_006 NLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIH
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 DLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAI
:.: :.::: ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::..:::::::
XP_006 DIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGAS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 DGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTS
.:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::::::..:.:
XP_006 NGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 INSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVF
:: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.:: :. :::::
XP_006 INCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSGSTFWAVVF
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 FIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYV
:.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.:::.:.:::::
XP_006 FVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 FTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCF
.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.::::::::.::: :
XP_006 LTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 LLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKL
:::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: : ::. :.:
XP_006 LLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERL
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KB6 AYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::.:.::....:: . ..::: ..
XP_006 AYGITPENEHHLVAQRDIRQFQMKTRQGRRRATNSCQISC
590 600 610 620
>>NP_001165973 (OMIM: 163970,604715) sodium-dependent no (512 aa)
initn: 2260 init1: 1978 opt: 2264 Z-score: 2819.1 bits: 531.5 E(85289): 2.8e-150
Smith-Waterman score: 2264; 66.8% identity (86.7% similar) in 488 aa overlap (135-620:27-512)
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 FMVIAGMPLFYMELALGQFNREGAAGVWKICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWAL
:: :::..::::.:::::.:::::::.:
NP_001 MGVQWWSHTQGEVAVGLGLGDSYLTPCPC-PGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSL
10 20 30 40 50
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 HYLFSSFTTELPWIHCNNSWNSPNCSDAH--PGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVL
.::::::: .::: :...::::::.: . :. :. . . . :::::..:::::
NP_001 YYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHTKYSK-YKFTPAAEFYERGVL
60 70 80 90 100 110
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 HLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLL
:::.: :: :.: :.::: ::..:...:::::::::::::::::::::.:: :: .::.
NP_001 HLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLV
120 130 140 150 160 170
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 RGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNC
.::::::: .:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.::::: :::
NP_001 HGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNC
180 190 200 210 220 230
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 YRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIYPEAIATLP
::::..:.::: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:::::.::
NP_001 YRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLS
240 250 260 270 280 290
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 LSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLF
:. ::::::.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ....::::.::
NP_001 GSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALF
300 310 320 330 340 350
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 CVTNGGIYVFTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRL
:.:.:::::.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: : ::.:::::
NP_001 CITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGFRPGLYWRL
360 370 380 390 400 410
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 CWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCS
:::.::: ::::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..::::. ::: :
NP_001 CWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLS
420 430 440 450 460 470
590 600 610 620
pF1KB6 LPGSFREKLAYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
::. :.:::.:.::....:: . ..::: :.::: .
NP_001 TQGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
480 490 500 510
>>NP_001036 (OMIM: 164230,182138,607834) sodium-dependen (630 aa)
initn: 1902 init1: 750 opt: 2065 Z-score: 2570.0 bits: 485.7 E(85289): 2.1e-136
Smith-Waterman score: 2065; 49.9% identity (79.6% similar) in 579 aa overlap (37-610:60-626)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 SVGLMSSVVAPAKEPNAVGPKEVELILVKEQNGVQLTSSTLTNPRQSPVEAQDRETWGKK
.... :..::. . .. .:::::::
NP_001 VVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLV----AELHQGERETWGKK
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IDFLLSVIGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLVPYLLFMVIAGMPLFYMELALGQFNRE
.::::::::.::::.:::::::.::.:::::::.:: .. ...:.:::::::::::..:.
NP_001 VDFLLSVIGYAVDLGNVWRFPYICYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRN
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 GAAGVW-KICPILKGVGFTVILISLYVGFFYNVIIAWALHYLFSSFTTELPWIHCNNSWN
: ..: :::::.::.:... .:..:.. .::.:.::::.::.:::: .::: :.::::
NP_001 GCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSCKNSWN
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SPNCSDAHPGDSSGDSSGLNDTFGTTPAAEYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLV
. ::.. :. . .:.:: :.. : ::..:.:.:..::: :::. :..
NP_001 TGNCTNYFSEDNITWT-----LHSTSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIM
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPYVVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRL
:.....:::.::::::::::::.:::.::..:..::.::.::::: :. ::. .. .:
NP_001 LIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGATLPGAWRGVLFYLKPNWQKL
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 CEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSSYNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVF
:..::::::.:. :::: :::::.::.:::::.::::.::.::. .: .::: ::::.:
NP_001 LETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIF
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SFLGYMAQKHSVPIGDVAKD-GPGLIFIIYPEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAM
. :::::. .. ...:::: ::.:.:: : ::::..: :. .:..::.::.:::.::..
NP_001 TVLGYMAEMRNEDVSEVAKDAGPSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTF
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 GGMESVITGLIDEF-QLLHRHRELFTLFIVLATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAAGTS
.:.:.:::...::: .. ..:: :.: .:.. :. :: .: :: :: ::...:.: .
NP_001 AGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYATGPA
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 ILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQRPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTF
.: .::::..:.::::. :: :...: : :. .::.:: .:: ::::.. ...
NP_001 VLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMS-
510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 RPPHYG--AYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPIYAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKDR
::. : .: :. ::. :.:::. .: : ::.. ::.:.:.. .:.::
NP_001 -PPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIITPGTFKERIIKSITPETPT
560 570 580 590 600 610
610 620
pF1KB6 ELVDRGEVRQFTLRHWLKV
: . :..:
NP_001 E-IPCGDIRLNAV
620 630
>>XP_011521601 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodium-d (376 aa)
initn: 1820 init1: 1782 opt: 1798 Z-score: 2240.1 bits: 423.9 E(85289): 4.9e-118
Smith-Waterman score: 1798; 69.1% identity (89.1% similar) in 376 aa overlap (245-620:1-376)
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 EYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPY
..:...:::::::::::::::::::::.::
XP_011 MVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPY
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 VVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSS
:: .::..::::::: .:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.:
XP_011 FVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFAS
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 YNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIY
:::: :::::::..:.::: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:
XP_011 YNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILY
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 PEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVL
::::.:: :. ::::::.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ...
XP_011 PEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTF
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 ATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQ
.::::.:::.:.:::::.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: :
XP_011 STFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGF
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 RPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPI
::.::::::::.::: ::::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..:::
XP_011 RPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPI
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620
pF1KB6 YAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
:. ::: : ::. :.:::.:.::....:: . ..::: :.::: .
XP_011 YVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
340 350 360 370
>>XP_011521602 (OMIM: 163970,604715) PREDICTED: sodium-d (376 aa)
initn: 1820 init1: 1782 opt: 1798 Z-score: 2240.1 bits: 423.9 E(85289): 4.9e-118
Smith-Waterman score: 1798; 69.1% identity (89.1% similar) in 376 aa overlap (245-620:1-376)
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 EYFERGVLHLHQSHGIDDLGPPRWQLTACLVLVIVLLYFSLWKGVKTSGKVVWITATMPY
..:...:::::::::::::::::::::.::
XP_011 MVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPY
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 VVLTALLLRGVTLPGAIDGIRAYLSVDFYRLCEASVWIDAATQVCFSLGVGFGVLIAFSS
:: .::..::::::: .:: ::: .::::: ::.::::::::. ::::.::::::::.:
XP_011 FVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFYRLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFAS
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 YNKFTNNCYRDAIVTTSINSLTSFSSGFVVFSFLGYMAQKHSVPIGDVAKDGPGLIFIIY
:::: :::::::..:.::: .::: :::..::.:::::..:.: : ::: .: ::.::.:
XP_011 YNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILY
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 PEAIATLPLSSAWAVVFFIMLLTLGIDSAMGGMESVITGLIDEFQLLHRHRELFTLFIVL
::::.:: :. ::::::.:::.::.::.:::::.::::: :.::.:.:::.:::. ...
XP_011 PEAISTLSGSTFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTF
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 ATFLLSLFCVTNGGIYVFTLLDHFAAGTSILFGVLIEAIGVAWFYGVGQFSDDIQQMTGQ
.::::.:::.:.:::::.:::: :::::::::.::.:::::.::::: .::.::::: :
XP_011 STFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDRFSNDIQQMMGF
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 RPSLYWRLCWKLVSPCFLLFVVVVSIVTFRPPHYGAYIFPDWANALGWVIATSSMAMVPI
::.::::::::.::: ::::::::::..:.: : :::: ::: .:: :: :::..:::
XP_011 RPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPI
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620
pF1KB6 YAAYKFCSLPGSFREKLAYAIAPEKDRELVDRGEVRQFTLRHWLKV
:. ::: : ::. :.:::.:.::....:: . ..::: :.::: .
XP_011 YVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHLVAQRDIRQFQLQHWLAI
340 350 360 370
620 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 16:36:15 2016 done: Sat Nov 5 16:36:16 2016
Total Scan time: 9.160 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]