Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6113
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6113, 620 aa
1>>>pF1KB6113 620 - 620 aa - 620 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0996+/-0.00156; mu= 0.6540+/- 0.089
mean_var=363.1273+/-81.669, 0's: 0 Z-trim(106.9): 649 B-trim: 24 in 1/47
Lambda= 0.067305
statistics sampled from 8614 (9362) to 8614 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 1.680
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs109|chr5 ( 620) 4236 426.8 4.3e-119
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs109|chr4 ( 631) 2551 263.2 7.7e-70
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs109|chr4 ( 527) 1897 199.6 9.1e-51
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs109|chrX ( 659) 1790 189.3 1.4e-47
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs109|chrX ( 693) 1790 189.3 1.4e-47
CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs109|chrX ( 675) 1493 160.5 6.8e-39
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs109|chr8 ( 512) 1103 122.5 1.4e-27
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs109|chr1 ( 509) 1101 122.3 1.6e-27
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 504) 1085 120.7 4.8e-27
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 525) 1085 120.7 4.9e-27
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 505) 1083 120.5 5.5e-27
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs109|chr20 ( 526) 1083 120.5 5.6e-27
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs109|chr6 ( 537) 1081 120.4 6.5e-27
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs109|chr18 ( 543) 1077 120.0 8.6e-27
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs109|chr8 ( 491) 1072 119.4 1.1e-26
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs109|chr6 ( 534) 1061 118.4 2.5e-26
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs109|chr20 ( 536) 1052 117.5 4.6e-26
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs109|chr1 ( 529) 1046 117.0 6.8e-26
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs109|chr6 ( 505) 1036 116.0 1.3e-25
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs109|chr9 (1130) 989 111.8 5e-24
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs109|chr9 (1149) 989 111.9 5.1e-24
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 ( 542) 970 109.6 1.2e-23
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1043) 970 110.0 1.7e-23
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1058) 970 110.0 1.7e-23
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1064) 970 110.0 1.7e-23
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1079) 970 110.0 1.8e-23
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1161) 970 110.0 1.8e-23
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1167) 970 110.0 1.8e-23
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs109|chr1 (1182) 970 110.0 1.9e-23
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs109|chr8 ( 434) 947 107.2 4.7e-23
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs109|chr8 ( 505) 947 107.3 5.2e-23
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs109|chr20 ( 488) 771 90.2 7.1e-18
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 ( 453) 770 90.1 7.2e-18
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 694) 770 90.3 9.4e-18
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 752) 770 90.4 9.9e-18
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 764) 770 90.4 1e-17
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs109|chr5 ( 822) 770 90.4 1e-17
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs109|chr15 ( 822) 770 90.4 1e-17
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs109|chr15 ( 450) 764 89.5 1.1e-17
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs109|chr20 ( 451) 749 88.0 3e-17
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs109|chr6 ( 482) 725 85.7 1.6e-16
CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19 ( 466) 700 83.3 8.2e-16
CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19 ( 507) 700 83.3 8.6e-16
CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs109|chr19 ( 508) 700 83.3 8.6e-16
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs109|chr3 ( 984) 698 83.5 1.5e-15
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs109|chr1 ( 986) 696 83.3 1.7e-15
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs109|chr1 ( 987) 696 83.3 1.7e-15
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs109|chr1 (1055) 696 83.4 1.8e-15
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs109|chr1 ( 976) 693 83.0 2.1e-15
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs109|chr4 (1004) 686 82.4 3.4e-15
>>CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs109|chr5 (620 aa)
initn: 4236 init1: 4236 opt: 4236 Z-score: 2251.8 bits: 426.8 E(33420): 4.3e-119
Smith-Waterman score: 4236; 100.0% identity (100.0% similar) in 620 aa overlap (1-620:1-620)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNNFILLEEQLIKKSQQKRRTSPSNFKVRFFVLTKASLAYFEDRHGKKRTLKGSIELSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MNNFILLEEQLIKKSQQKRRTSPSNFKVRFFVLTKASLAYFEDRHGKKRTLKGSIELSRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 KCVEIVKSDISIPCHYKYPFQVVHDNYLLYVFAPDRESRQRWVLALKEETRNNNSLVPKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KCVEIVKSDISIPCHYKYPFQVVHDNYLLYVFAPDRESRQRWVLALKEETRNNNSLVPKY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 HPNFWMDGKWRCCSQLEKLATGCAQYDPTKNASKKPLPPTPEDNRRPLWEPEETVVIALY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HPNFWMDGKWRCCSQLEKLATGCAQYDPTKNASKKPLPPTPEDNRRPLWEPEETVVIALY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DYQTNDPQELALRRNEEYCLLDSSEIHWWRVQDRNGHEGYVPSSYLVEKSPNNLETYEWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DYQTNDPQELALRRNEEYCLLDSSEIHWWRVQDRNGHEGYVPSSYLVEKSPNNLETYEWY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 NKSISRDKAEKLLLDTGKEGAFMVRDSRTAGTYTVSVFTKAVVSENNPCIKHYHIKETND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NKSISRDKAEKLLLDTGKEGAFMVRDSRTAGTYTVSVFTKAVVSENNPCIKHYHIKETND
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NPKRYYVAEKYVFDSIPLLINYHQHNGGGLVTRLRYPVCFGRQKAPVTAGLRYGKWVIDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NPKRYYVAEKYVFDSIPLLINYHQHNGGGLVTRLRYPVCFGRQKAPVTAGLRYGKWVIDP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIREGAMSEEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIREGAMSEEDFIEEAEVMMKLSHPKLVQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMAYLEEACVIH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 RDLAARNCLVGENQVIKVSDFGMTRFVLDDQYTSSTGTKFPVKWASPEVFSFSRYSSKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RDLAARNCLVGENQVIKVSDFGMTRFVLDDQYTSSTGTKFPVKWASPEVFSFSRYSSKSD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 VWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIMNHCWKERPE
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB6 DRPAFSRLLRQLAEIAESGL
::::::::::::::::::::
CCDS43 DRPAFSRLLRQLAEIAESGL
610 620
>>CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs109|chr4 (631 aa)
initn: 2455 init1: 1521 opt: 2551 Z-score: 1367.5 bits: 263.2 E(33420): 7.7e-70
Smith-Waterman score: 2551; 58.5% identity (82.3% similar) in 626 aa overlap (1-617:1-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNNFILLEEQLIKKSQQKRRTSPSNFKVRFFVLTKASLAYFEDRHGKKRTLKGSIELSRI
:: .::: :::.::::..::: :.: :.:::::. :.:.: : ..:. :: :..:.:
CCDS34 MNFNTILEEILIKRSQQKKKTSPLNYKERLFVLTKSMLTYYEGR-AEKKYRKGFIDVSKI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 KCVEIVKSDIS-IPCHYKYPFQVVHDNYLLYVFAPDRESRQRWVLALKEETRNNNSLVPK
:::::::.: . :::. ::::::::: ::.:::. .::. :: :::: .:::... :
CCDS34 KCVEIVKNDDGVIPCQNKYPFQVVHDANTLYIFAPSPQSRDLWVKKLKEEIKNNNNIMIK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 YHPNFWMDGKWRCCSQLEKLATGCAQYDPTKNASKKPLPPTPEDNRR------PLWEPE-
:::.:: ::...:: : :::: :: .:. ... .: :::.:: ..: :: : .
CCDS34 YHPKFWTDGSYQCCRQTEKLAPGCEKYNLFESSIRKALPPAPETKKRRPPPPIPLEEEDN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 -ETVVIALYDYQTNDPQELALRRNEEYCLLDSSEIHWWRVQDRNGHEGYVPSSYLVEKSP
: .:.:.::.:. . ..: :.:..:: .:.....::::..:. :.:::.::.:.. :.
CCDS34 SEEIVVAMYDFQAAEGHDLRLERGQEYLILEKNDVHWWRARDKYGNEGYIPSNYVTGKKS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 NNLETYEWYNKSISRDKAEKLLLDTGKEGAFMVRDSRTAGTYTVSVFTKAVVSENNPCIK
:::. :::: ....:.:::.:: . :::.:::::: : ::::..:: .:.. ..
CCDS34 NNLDQYEWYCRNMNRSKAEQLLRSEDKEGGFMVRDSSQPGLYTVSLYTK-FGGEGSSGFR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 HYHIKETNDNPKRYYVAEKYVFDSIPLLINYHQHNGGGLVTRLRYPVCFGRQKAPVTAGL
:::::::. .::.::.:::..: ::: .:.::.::..:::::::::: ..::.:::.
CCDS34 HYHIKETTTSPKKYYLAEKHAFGSIPEIIEYHKHNAAGLVTRLRYPVSVKGKNAPTTAGF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 RYGKWVIDPSELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIREGAMSEEDFIEEAEVMM
: :: :.::::::..:.::: ::.:.:: : . :::::.:::::: ::::::::.:::
CCDS34 SYEKWEINPSELTFMRELGSGLFGVVRLGKWRAQYKVAIKAIREGAMCEEDFIEEAKVMM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 KLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLGMCLDVCEGMA
::.::::::::::: .: :: .: ::::.::: ..:: ..: :. ..::.:: ::::::
CCDS34 KLTHPKLVQLYGVCTQQKPIYIVTEFMERGCLLNFLRQRQGHFSRDVLLSMCQDVCEGME
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 YLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGMTRFVLDDQYTSSTGTKFPVKWASPEVFS
:::. ::::::::::::.: :.:::::::.:.:::::::::.:.:::::: ::::.
CCDS34 YLERNSFIHRDLAARNCLVSEAGVVKVSDFGMARYVLDDQYTSSSGAKFPVKWCPPEVFN
480 490 500 510 520 530
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pF1KB6 FSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPRLASTHVYQIM
.::.:::::::::::::::::.::..:.:. .: ::: .. : :::.:.:::..::..:
CCDS34 YSRFSSKSDVWSFGVLMWEVFTEGRMPFEKYTNYEVVTMVTRGHRLYQPKLASNYVYEVM
540 550 560 570 580 590
600 610 620
pF1KB6 NHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAESGL
.::.:.:: ::.: ::: . :..:
CCDS34 LRCWQEKPEGRPSFEDLLRTIDELVECEETFGR
600 610 620 630
>>CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs109|chr4 (527 aa)
initn: 1894 init1: 1439 opt: 1897 Z-score: 1025.1 bits: 199.6 E(33420): 9.1e-51
Smith-Waterman score: 1906; 58.3% identity (81.3% similar) in 487 aa overlap (134-618:51-526)
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 LALKEETRNNNSLVPKYHPNFWMDGKWRCCSQL-EKLATGCAQYDPTKNASKKPLPPTPE
::: .: .. .. .:.: .::::: :
CCDS34 VQKRQMRTQISLSTDEELPEKYTQRRRPWLSQLSNKKQSNTGRVQPSK---RKPLPPLP-
30 40 50 60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 DNRRPLWEPEETV-VIALYDYQTNDPQELALRRNEEYCLLDSSEIHWWRVQDRNGHEGYV
: :: . : ::::. .: .::::: ::: .:.. . :::...:: :.:: .
CCDS34 ----PSEVAEEKIQVKALYDFLPREPCNLALRRAEEYLILEKYNPHWWKARDRLGNEGLI
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 PSSYLVEKSPNNLETYEWYNKSISRDKAEKLLLDTGKEGAFMVRDSRTAGTYTVSVFTKA
::.:..:.. .::: ::::...:.:..::.:: . .:::::.::::: :.::.::: :
CCDS34 PSNYVTENKITNLEIYEWYHRNITRNQAEHLLRQESKEGAFIVRDSRHLGSYTISVFMGA
140 150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 VVSENNPCIKHYHIKETNDNPKRYYVAEKYVFDSIPLLINYHQHNGGGLVTRLRYPVCFG
: .. ::::.::. ::. . .::::...:.::: :: :::::..::.::::::: .
CCDS34 RRS-TEAAIKHYQIKK-NDSGQ-WYVAERHAFQSIPELIWYHQHNAAGLMTRLRYPVGLM
200 210 220 230 240
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 RQKAPVTAGLRYGKWVIDPSELTFVQEIGSGQFGLVHLGYWLNKDKVAIKTIREGAMSEE
. :.:::. : :: ::::::.:..::::::::.:::: : .. .::::.: ::.::::
CCDS34 GSCLPATAGFSYEKWEIDPSELAFIKEIGSGQFGVVHLGEWRSHIQVAIKAINEGSMSEE
250 260 270 280 290 300
410 420 430 440 450 460
pF1KB6 DFIEEAEVMMKLSHPKLVQLYGVCLEQAPICLVFEFMEHGCLSDYLRTQRGLFAAETLLG
::::::.::::::: :::::::::... :. .: ::::.::: .::: ..: . : ::.
CCDS34 DFIEEAKVMMKLSHSKLVQLYGVCIQRKPLYIVTEFMENGCLLNYLRENKGKLRKEMLLS
310 320 330 340 350 360
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 MCLDVCEGMAYLEEACVIHRDLAARNCLVGENQVIKVSDFGMTRFVLDDQYTSSTGTKFP
.: :.:::: :::. ::::::::::::. . ..:.:::::::.::::.:.:: :.:::
CCDS34 VCQDICEGMEYLERNGYIHRDLAARNCLVSSTCIVKISDFGMTRYVLDDEYVSSFGAKFP
370 380 390 400 410 420
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 VKWASPEVFSFSRYSSKSDVWSFGVLMWEVFSEGKIPYENRSNSEVVEDISTGFRLYKPR
.::. :::: :..::::::::::::::::::.:::.:.::.:: .::: :: :::::.:.
CCDS34 IKWSPPEVFLFNKYSSKSDVWSFGVLMWEVFTEGKMPFENKSNLQVVEAISEGFRLYRPH
430 440 450 460 470 480
590 600 610 620
pF1KB6 LASTHVYQIMNHCWKERPEDRPAFSRLLRQLAEIAESGL
:: .:..: ::.:.:: ::.:..::: ..::::.
CCDS34 LAPMSIYEVMYSCWHEKPEGRPTFAELLRAVTEIAETW
490 500 510 520
>>CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs109|chrX (659 aa)
initn: 2059 init1: 1331 opt: 1790 Z-score: 967.9 bits: 189.3 E(33420): 1.4e-47
Smith-Waterman score: 2172; 50.5% identity (75.6% similar) in 652 aa overlap (11-617:10-656)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MNNFILLEEQLIKKSQQKRRTSPSNFKVRFFVLTKASLAYFE-D-RHGKKRTLKGSIELS
..:.::::..::: ::: :.:.:: .:.:.: : ..:.. . ::::..
CCDS14 MAAVILESIFLKRSQQKKKTSPLNFKKRLFLLTVHKLSYYEYDFERGRRGSKKGSIDVE
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB6 RIKCVEIVKSD---------------------ISIPCHYKYPFQVVHDNYLLYVFAPDRE
.: ::: : . ::: .. ::::::.:. ::::.: .:
CCDS14 KITCVETVVPEKNPPPERQIPRRGEESSEMEQISIIERFPYPFQVVYDEGPLYVFSPTEE
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 SRQRWVLALKEETRNNNSLVPKYHPNFWMDGKWRCCSQLEKLATGCAQYDPTKNAS----
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620
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CCDS14 PTFQQLLSSIEPLREKDKH
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CCDS35 LHSYEPSHDGDLGFEKGEQLRILEQSG-EWWKAQSLTTGQEGFIPFNF-VAKA-NSLEPE
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CCDS35 RNLDNGG--FYISPRITFPGLHELVRHYTNASDGLCTRLSRPCQTQKPQKPWWED----E
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CCDS35 ERNYIHRDLRAANILVSDTLSCKIADFGLARLIEDNEYTAREGAKFPIKWTAPEAINYGT
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CCDS35 FTIKSDVWSFGILLTEIVTHGRIPYPGMTNPEVIQNLERGYRMVRPDNCPEELYQLMRLC
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CCDS35 WKERPEDRPTFDYLRSVLEDFFTATEGQYQPQP
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CCDS54 MGCMKSKFLQVGGNTFSKTETSASPHCPVYVPDPTSTIKPGPNSHN
10 20 30 40
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