Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6002
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6002, 1686 aa
1>>>pF1KB6002 1686 - 1686 aa - 1686 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7298+/-0.00134; mu= 12.4850+/- 0.080
mean_var=141.4828+/-28.369, 0's: 0 Z-trim(103.8): 95 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.107826
statistics sampled from 7505 (7592) to 7505 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.576), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 4.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7824.1 PIK3C2A gene_id:5286|Hs108|chr11 (1686) 11108 1741.5 0
CCDS1446.1 PIK3C2B gene_id:5287|Hs108|chr1 (1634) 3924 623.9 1.4e-177
CCDS44839.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12 (1445) 1987 322.6 6.3e-87
CCDS73452.1 PIK3C2G gene_id:5288|Hs108|chr12 (1486) 1987 322.6 6.5e-87
CCDS104.1 PIK3CD gene_id:5293|Hs108|chr1 (1044) 1167 194.9 1.2e-48
CCDS3104.1 PIK3CB gene_id:5291|Hs108|chr3 (1070) 1165 194.6 1.5e-48
CCDS43171.1 PIK3CA gene_id:5290|Hs108|chr3 (1068) 1013 171.0 2e-41
CCDS5739.1 PIK3CG gene_id:5294|Hs108|chr7 (1102) 923 157.0 3.4e-37
CCDS77180.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18 ( 824) 564 101.1 1.7e-20
CCDS11920.1 PIK3C3 gene_id:5289|Hs108|chr18 ( 887) 564 101.1 1.8e-20
CCDS33603.2 PI4KA gene_id:5297|Hs108|chr22 (2102) 435 81.2 4.1e-14
CCDS55637.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 484) 388 73.6 1.9e-12
CCDS55638.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 801) 388 73.7 2.9e-12
CCDS81376.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 816) 388 73.7 3e-12
CCDS993.1 PI4KB gene_id:5298|Hs108|chr1 ( 828) 388 73.7 3e-12
>>CCDS7824.1 PIK3C2A gene_id:5286|Hs108|chr11 (1686 aa)
initn: 11108 init1: 11108 opt: 11108 Z-score: 9341.2 bits: 1741.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11108; 100.0% identity (100.0% similar) in 1686 aa overlap (1-1686:1-1686)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAQISSNSGFKECPSSHPEPTRAKDVDKEEALQMEAEALAKLQKDRQVTDNQRGFELSSS
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CCDS78 MAQISSNSGFKECPSSHPEPTRAKDVDKEEALQMEAEALAKLQKDRQVTDNQRGFELSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 TRKKAQVYNKQDYDLMVFPESDSQKRALDIDVEKLTQAELEKLLLDDSFETKKTPVLPVT
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CCDS78 TRKKAQVYNKQDYDLMVFPESDSQKRALDIDVEKLTQAELEKLLLDDSFETKKTPVLPVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 PILSPSFSAQLYFRPTIQRGQWPPGLPGPSTYALPSIYPSTYSKQAAFQNGFNPRMPTFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PILSPSFSAQLYFRPTIQRGQWPPGLPGPSTYALPSIYPSTYSKQAAFQNGFNPRMPTFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 STEPIYLSLPGQSPYFSYPLTPATPFHPQGSLPIYRPVVSTDMAKLFDKIASTSEFLKNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 STEPIYLSLPGQSPYFSYPLTPATPFHPQGSLPIYRPVVSTDMAKLFDKIASTSEFLKNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KARTDLEITDSKVSNLQVSPKSEDISKFDWLDLDPLSKPKVDNVEVLDHEEEKNVSSLLA
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CCDS78 KARTDLEITDSKVSNLQVSPKSEDISKFDWLDLDPLSKPKVDNVEVLDHEEEKNVSSLLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KDPWDAVLLEERSTANCHLERKVNGKSLSVATVTRSQSLNIRTTQLAKAQGHISQKDPNG
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CCDS78 KDPWDAVLLEERSTANCHLERKVNGKSLSVATVTRSQSLNIRTTQLAKAQGHISQKDPNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 TSSLPTGSSLLQEVEVQNEEMAAFCRSITKLKTKFPYTNHRTNPGYLLSPVTAQRNICGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TSSLPTGSSLLQEVEVQNEEMAAFCRSITKLKTKFPYTNHRTNPGYLLSPVTAQRNICGE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 NASVKVSIDIEGFQLPVTFTCDVSSTVEIIIMQALCWVHDDLNQVDVGSYVLKVCGQEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NASVKVSIDIEGFQLPVTFTCDVSSTVEIIIMQALCWVHDDLNQVDVGSYVLKVCGQEEV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LQNNHCLGSHEHIQNCRKWDTEIRLQLLTFSAMCQNLARTAEDDETPVDLNKHLYQIEKP
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CCDS78 LQNNHCLGSHEHIQNCRKWDTEIRLQLLTFSAMCQNLARTAEDDETPVDLNKHLYQIEKP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 CKEAMTRHPVEELLDSYHNQVELALQIENQHRAVDQVIKAVRKICSALDGVETLAITESV
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CCDS78 CKEAMTRHPVEELLDSYHNQVELALQIENQHRAVDQVIKAVRKICSALDGVETLAITESV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 KKLKRAVNLPRSKTADVTSLFGGEDTSRSSTRGSLNPENPVQVSINQLTAAIYDLLRLHA
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CCDS78 KKLKRAVNLPRSKTADVTSLFGGEDTSRSSTRGSLNPENPVQVSINQLTAAIYDLLRLHA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 NSGRSPTDCAQSSKSVKEAWTTTEQLQFTIFAAHGISSNWVSNYEKYYLICSLSHNGKDL
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CCDS78 NSGRSPTDCAQSSKSVKEAWTTTEQLQFTIFAAHGISSNWVSNYEKYYLICSLSHNGKDL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB6 FKPIQSKKVGTYKNFFYLIKWDELIIFPIQISQLPLESVLHLTLFGILNQSSGSSPDSNK
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CCDS78 FKPIQSKKVGTYKNFFYLIKWDELIIFPIQISQLPLESVLHLTLFGILNQSSGSSPDSNK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB6 QRKGPEALGKVSLPLFDFKRFLTCGTKLLYLWTSSHTNSVPGTVTKKGYVMERIVLQVDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QRKGPEALGKVSLPLFDFKRFLTCGTKLLYLWTSSHTNSVPGTVTKKGYVMERIVLQVDF
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB6 PSPAFDIIYTTPQVDRSIIQQHNLETLENDIKGKLLDILHKDSSLGLSKEDKAFLWEKRY
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CCDS78 PSPAFDIIYTTPQVDRSIIQQHNLETLENDIKGKLLDILHKDSSLGLSKEDKAFLWEKRY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB6 YCFKHPNCLPKILASAPNWKWVNLAKTYSLLHQWPALYPLIALELLDSKFADQEVRSLAV
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CCDS78 YCFKHPNCLPKILASAPNWKWVNLAKTYSLLHQWPALYPLIALELLDSKFADQEVRSLAV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB6 TWIEAISDDELTDLLPQFVQALKYEIYLNSSLVQFLLSRALGNIQIAHNLYWLLKDALHD
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CCDS78 TWIEAISDDELTDLLPQFVQALKYEIYLNSSLVQFLLSRALGNIQIAHNLYWLLKDALHD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB6 VQFSTRYEHVLGALLSVGGKRLREELLKQTKLVQLLGGVAEKVRQASGSARQVVLQRSME
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CCDS78 VQFSTRYEHVLGALLSVGGKRLREELLKQTKLVQLLGGVAEKVRQASGSARQVVLQRSME
1030 1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KB6 RVQSFFQKNKCRLPLKPSLVAKELNIKSCSFFSSNAVPLKVTMVNADPMGEEINVMFKVG
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CCDS78 RVQSFFQKNKCRLPLKPSLVAKELNIKSCSFFSSNAVPLKVTMVNADPMGEEINVMFKVG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB6 EDLRQDMLALQMIKIMDKIWLKEGLDLRMVIFKCLSTGRDRGMVELVPASDTLRKIQVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EDLRQDMLALQMIKIMDKIWLKEGLDLRMVIFKCLSTGRDRGMVELVPASDTLRKIQVEY
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB6 GVTGSFKDKPLAEWLRKYNPSEEEYEKASENFIYSCAGCCVATYVLGICDRHNDNIMLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GVTGSFKDKPLAEWLRKYNPSEEEYEKASENFIYSCAGCCVATYVLGICDRHNDNIMLRS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB6 TGHMFHIDFGKFLGHAQMFGSFKRDRAPFVLTSDMAYVINGGEKPTIRFQLFVDLCCQAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TGHMFHIDFGKFLGHAQMFGSFKRDRAPFVLTSDMAYVINGGEKPTIRFQLFVDLCCQAY
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB6 NLIRKQTNLFLNLLSLMIPSGLPELTSIQDLKYVRDALQPQTTDAEATIFFTRLIESSLG
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CCDS78 NLIRKQTNLFLNLLSLMIPSGLPELTSIQDLKYVRDALQPQTTDAEATIFFTRLIESSLG
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB6 SIATKFNFFIHNLAQLRFSGLPSNDEPILSFSPKTYSFRQDGRIKEVSVFTYHKKYNPDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SIATKFNFFIHNLAQLRFSGLPSNDEPILSFSPKTYSFRQDGRIKEVSVFTYHKKYNPDK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB6 HYIYVVRILREGQIEPSFVFRTFDEFQELHNKLSIIFPLWKLPGFPNRMVLGRTHIKDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HYIYVVRILREGQIEPSFVFRTFDEFQELHNKLSIIFPLWKLPGFPNRMVLGRTHIKDVA
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB6 AKRKIELNSYLQSLMNASTDVAECDLVCTFFHPLLRDEKAEGIARSADAGSFSPTPGQIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AKRKIELNSYLQSLMNASTDVAECDLVCTFFHPLLRDEKAEGIARSADAGSFSPTPGQIG
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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pF1KB6 GAVKLSISYRNGTLFIMVMHIKDLVTEDGADPNPYVKTYLLPDNHKTSKRKTKISRKTRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GAVKLSISYRNGTLFIMVMHIKDLVTEDGADPNPYVKTYLLPDNHKTSKRKTKISRKTRN
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB6 PTFNEMLVYSGYSKETLRQRELQLSVLSAESLRENFFLGGVTLPLKDFNLSKETVKWYQL
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CCDS78 PTFNEMLVYSGYSKETLRQRELQLSVLSAESLRENFFLGGVTLPLKDFNLSKETVKWYQL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB6 TAATYL
::::::
CCDS78 TAATYL
>>CCDS1446.1 PIK3C2B gene_id:5287|Hs108|chr1 (1634 aa)
initn: 3433 init1: 1981 opt: 3924 Z-score: 3301.7 bits: 623.9 E(32554): 1.4e-177
Smith-Waterman score: 4507; 47.2% identity (73.7% similar) in 1573 aa overlap (189-1685:84-1631)
160 170 180 190 200
pF1KB6 PSTYSKQAAFQNGFNPRMPTFPSTEPIYLSLPGQSPYFSY-PLTP--ATPFH-----PQ-
: :..: ..: :.: . : : ::
CCDS14 DPSLISWDEPGVDFYSKPAGRRTDLKLLRGLSGSDPTLNYNSLSPQEGPPNHSTSQGPQP
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 GSLPIYRPVVSTDMAKLFDKIASTSEFLKNGKARTDLEITDSKVSNLQVSPKSEDISKFD
:: : . .: :. .:: ... .... . :.: . .:.: . :.. : .:
CCDS14 GSDPWPKGSLSGDYLYIFD---GSDGGVSSSPGPGDIEGSCKKLSPPPLPPRA---SIWD
120 130 140 150 160
270 280 290 300
pF1KB6 WLDLDP---------LSKPKVDNV---------EVLDHE--EEKNV------SSLLAKDP
: : .:.:. :. ..:.:. ::..: . ::..
CCDS14 TPPLPPRKGSPSSSKISQPSDINTFSLVEQLPGKLLEHRILEEEEVLGGGGQGRLLGSVD
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340
pF1KB6 WDAV-----LLEERSTANCHLERKVN------------GKSLSVATVTRSQSL--NIRTT
.:.. :. .:: . .. : .. .:. : :.::... ..
CCDS14 YDGINDAITRLNLKSTYDAEMLRDATRGWKEGRGPLDFSKDTSGKPVARSKTMPPQVPPR
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390
pF1KB6 QLAKAQGHISQKDPNGT---SSLPTGSS---------LLQEVEVQNEEMAAFCRSITKLK
:. :. .. :. . :. :.:: :.. : ..::.::::. . :.
CCDS14 TYASRYGNRKNATPGKNRRISAAPVGSRPHTVANGHELFEVSEERDEEVAAFCHMLDILR
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 TKFPYTNHRTNPGYLLSPVTAQRNICGENASVKVSIDIEGFQLPVTFTCDVSSTVEIIIM
. .. . ::. : :: . . :.....::.. . .: .::::. ::::...:.
CCDS14 SGSDIQDYFLT-GYVWSAVTPSPEHLGDEVNLKVTVLCDRLQEALTFTCNCSSTVDLLIY
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KB6 QALCWVHDDLNQVDVGSYVLKVCGQEEVLQNNHCLGSHEHIQNCRKWDTEIRLQLLTFSA
:.::..:::: .::::..::: :: :: :::.: :::::.:: :::.: .:::::. ..
CCDS14 QTLCYTHDDLRNVDVGDFVLKPCGLEEFLQNKHALGSHEYIQYCRKFDIDIRLQLMEQKV
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KB6 MCQNLARTAEDDETPVDLNKHLYQIEKPCKEAMTRHPVEELLDSYHNQVELALQIENQHR
. ..::::..::..: :: .. :.: :....:. . :.:.:::.:. : ...
CCDS14 VRSDLARTVNDDQSPSTLNYLVHLQERPVKQTISRQALSLLFDTYHNEVDAFLLADGDFP
470 480 490 500 510 520
580 590 600 610 620 630
pF1KB6 -AVDQVIKAVRKICSALDGVETLAITESVKKLKRAVNLPRSKTADVTSLFGGEDTSRSST
.:.:...:. ::.:: .::: :: ....: : . .: : ..
CCDS14 LKADRVVQSVKAICNALAAVETPEITSALNQLP---PCPSRMQPKIQ-----KDPSVLAV
530 540 550 560 570
640 650 660 670 680
pF1KB6 RGSLNPENPVQVSINQLTAAIYDLLRLHANSGRSPTDCA-QSSKS---VKEAWTTTEQLQ
: :: .: .. ::::: ::..:. :. . . : .:.. :.:: ...:
CCDS14 R-----ENREKV-VEALTAAILDLVELYCNTFNADFQTAVPGSRKHDLVQEACHFARSLA
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KB6 FTIFAAHGISSNWVSNYEKYYLICSLSHNGKDLFKPIQSKKVGTYKNFFYLIKWDELIIF
::..:.: : :...:: .:: :::::.::.: .:.:.... : .:.:: ::. : :
CCDS14 FTVYATHRIPIIWATSYEDFYLSCSLSHGGKELCSPLQTRRAHFSKYLFHLIVWDQQICF
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KB6 PIQISQLPLESVLHLTLFGILNQSSGSSPDSNKQRKGPEALGKVSLPLFDFKRFLTCGTK
:.:...:: :..: ::... ::: ..::::. ::::: :. :::.:.. :::: :
CCDS14 PVQVNRLPRETLLCATLYALPIPPPGSSSEANKQRRVPEALGWVTTPLFNFRQVLTCGRK
700 710 720 730 740 750
810 820 830 840 850 860
pF1KB6 LLYLWTSSHTNSVPGTVTKKGYVMERIVLQVDFPSPAFDIIYTTPQVDRSIIQQHNLETL
:: :: ... : . . . . ..::.:::. :::: .:.: :. . .... .:
CCDS14 LLGLWPATQENPSARWSAPNFHQPDSVILQIDFPTSAFDIKFTSPPGDK-FSPRYEFGSL
760 770 780 790 800 810
870 880 890 900 910 920
pF1KB6 ENDIKGKLLDILHKDSSLGLSKEDKAFLWEKRYYCFKHPNCLPKILASAPNWKWVNLAKT
... . :: ::..:.: :. :: :::::::: .. . :: .:::::.:.:. :
CCDS14 REEDQRKLKDIMQKESLYWLTDADKKRLWEKRYYCHSEVSSLPLVLASAPSWEWACLPDI
820 830 840 850 860 870
930 940 950 960 970 980
pF1KB6 YSLLHQWPALYPLIALELLDSKFADQEVRSLAVTWIEAISDDELTDLLPQFVQALKYEIY
: ::.:: . :: :: . : ::::: .:: :: ..:: :: : :::.::::::: :
CCDS14 YVLLKQWTHMNHQDALGLLHATFPDQEVRRMAVQWIGSLSDAELLDYLPQLVQALKYECY
880 890 900 910 920 930
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB6 LNSSLVQFLLSRALGNIQIAHNLYWLLKDALHDVQFSTRYEHVLGALLSVGGKRLREELL
:.: ::.:::.::.......: ..:::::.:.: ::: ::...:.::: :: ::::.
CCDS14 LDSPLVRFLLKRAVSDLRVTHYFFWLLKDGLKDSQFSIRYQYLLAALLCCCGKGLREEFN
940 950 960 970 980 990
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB6 KQTKLVQLLGGVAEKVRQASGSARQVVLQRSMERVQSFFQKN-KCRLPLKPSLVAKELNI
.: ::. :. .:..::.:. :::: .:. ..:.:..:: : .:::::.:::..: .
CCDS14 RQCWLVNALAKLAQQVREAAPSARQGILRTGLEEVKQFFALNGSCRLPLSPSLLVKGIVP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB6 KSCSFFSSNAVPLKVTMVNADPMGEEINVMFKVGEDLRQDMLALQMIKIMDKIWLKEGLD
..::.:.:::::::... :.::.::.: :.:: :.:::::::.::::.::.:::..::::
CCDS14 RDCSYFNSNAVPLKLSFQNVDPLGENIRVIFKCGDDLRQDMLTLQMIRIMSKIWVQEGLD
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KB6 LRMVIFKCLSTGRDRGMVELVPASDTLRKIQVEYGVTGSFKDKPLAEWLRKYNPSEEEYE
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CCDS11 AQYWRK
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