Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5990, 609 aa
1>>>pF1KB5990 609 - 609 aa - 609 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6469+/-0.000922; mu= 17.4068+/- 0.055
mean_var=72.6941+/-14.850, 0's: 0 Z-trim(105.7): 176 B-trim: 330 in 1/52
Lambda= 0.150427
statistics sampled from 8386 (8575) to 8386 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 3.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 4126 905.0 0
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 1828 406.3 6.1e-113
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 1729 384.8 1.6e-106
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 1729 384.9 1.9e-106
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 1729 384.9 2e-106
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 1681 374.5 2.8e-103
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 1670 372.0 1.1e-102
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 1623 361.9 1.6e-99
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 1610 359.0 9.9e-99
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 1610 359.0 9.9e-99
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 1606 358.1 1.8e-98
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 1600 356.8 4.3e-98
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 1598 356.4 5.7e-98
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 1592 355.1 1.7e-97
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 1592 355.2 1.7e-97
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 1570 350.4 4.8e-96
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 1567 349.7 6.6e-96
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 1538 343.4 4.9e-94
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 1531 341.9 1.4e-93
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 1421 318.0 1.9e-86
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 1415 316.7 4.7e-86
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 1345 301.5 2.1e-81
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 1323 296.7 4.8e-80
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 544) 1279 287.2 3.9e-77
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 1112 250.9 2.6e-66
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 1097 247.7 3.3e-65
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 1046 236.6 6.9e-62
CCDS75163.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 437) 1004 227.4 3e-59
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 988 224.0 4.4e-58
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 985 223.4 6.7e-58
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 977 221.6 2.1e-57
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 957 217.3 4.5e-56
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 948 215.4 2.4e-55
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 866 197.6 4.2e-50
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 860 196.3 1e-49
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 848 193.7 6e-49
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 836 191.0 3.2e-48
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 810 185.4 1.8e-46
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 810 185.4 1.8e-46
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 808 185.0 2.4e-46
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 758 174.1 4.4e-43
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 735 169.1 1.4e-41
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 728 167.6 4.1e-41
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 691 159.6 1.1e-38
CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1 ( 642) 662 153.3 9e-37
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 ( 601) 655 151.8 2.5e-36
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 651 150.9 4.6e-36
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 639 148.3 2.7e-35
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 603 140.5 5.7e-33
CCDS11411.1 KLHL11 gene_id:55175|Hs108|chr17 ( 708) 585 136.6 1.1e-31
>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 (609 aa)
initn: 4126 init1: 4126 opt: 4126 Z-score: 4836.8 bits: 905.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4126; 100.0% identity (100.0% similar) in 609 aa overlap (1-609:1-609)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MEGKPMRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEGKPMRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRKHRELCDVVLVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAME
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SCRELLRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 YSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PLMQGPRTRPRKPIRCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 SVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QDGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERY
430 440 450 460 470 480
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pF1KB5 NPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 TSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIK
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 MTHCESHIW
:::::::::
CCDS13 MTHCESHIW
>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 (642 aa)
initn: 2575 init1: 1203 opt: 1828 Z-score: 2141.2 bits: 406.3 E(32554): 6.1e-113
Smith-Waterman score: 1828; 49.9% identity (77.3% similar) in 555 aa overlap (47-601:71-624)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 TGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGA
: .: .... ... .:.. :::.:: :.:
CCDS30 RTRPRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAA
50 60 70 80 90 100
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 KKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEG
:.: ::.:.:..:::::.::::.:..:::::.:...::: .:.. :..::::..:.: ::
CCDS30 KEIRAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEG
110 120 130 140 150 160
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 NVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHN
::::::::: :::: ...:::.:: :::::::::::.:::.::: .::. : ... ..
CCDS30 NVQTLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQH
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 FQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQH
: .: ..::::::: .:.....::: ::: :::.:. ::..:::.... :: ..:....
CCDS30 FVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKC
230 240 250 260 270 280
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 VRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRC
::::::: ::.: : .. :.. .:.::. :: .. :::..: .. :::::.
CCDS30 VRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGA
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 GEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGS
: ::::::: .. : :: .:..:..::::: :: :::... . ::::::.::.
CCDS30 GPVLFAVGGGSLFAIHGDCEAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGT
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380 390 400 410 420 430
pF1KB5 SYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPK
: : .:: ::: :: :. .:. .: :. .:::.: :.::..:: ::.:::: .:::::
CCDS30 SDLATVESYDPVTNTWQPEVS-MGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPL
410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 ENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTR
. :: ::.::::: : ::.: : :::::: :..: : :::.:.:: : : .: : .:
CCDS30 TGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQVNVWSPVASMLSR
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500 510 520 530 540 550
pF1KB5 RKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQL
:. : :: . .:..:: : :. :.:.:::.:... : :. :. ::: :....: :
CCDS30 RSSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWL
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600
pF1KB5 MAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
.:::: ::.. :..:: ..: .: : . : :: . ::.:...
CCDS30 YAVGGNDGSSSLNSIEKYNPRTNKWVAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSS
580 590 600 610 620 630
CCDS30 TSL
640
>>CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 (568 aa)
initn: 1902 init1: 741 opt: 1729 Z-score: 2025.9 bits: 384.8 E(32554): 1.6e-106
Smith-Waterman score: 1729; 45.7% identity (78.1% similar) in 558 aa overlap (50-601:15-568)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 DVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKI
: .::.. .. .:..::::.::.: ..:
CCDS54 MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRI
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 YAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQ
:::..::. : :: ::::... :.:: :. .. .. .. ::..:::... ..: :..
CCDS54 PAHRLVLSSVSDYFAAMFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIE
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 TLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQHNFQE
:: .::::::... ::::.:: .:: ::::::::.:::...: .: ..: ..:...:.:
CCDS54 CLLSTACLLQLSQVVEACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFME
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 VMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRL
:....::.::::... ...::..:. .:: ..::...::......:: .: ..: ..::
CCDS54 VIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETILNALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRL
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 PLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGPRTRPRKPIRCGEV
:::.:.::. . .. :...: ::. :. :: .: :::..::..:.:::.::: : .
CCDS54 PLLAPQFLAD-MENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKST-VG-T
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 LFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYL
:::::: : . .:.:.:: .:: : ::.:. :: ::.:::: ::.:::.:: . :
CCDS54 LFAVGGMDSTKGATSIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTL
290 300 310 320 330 340
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pF1KB5 NSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYDPKENK
:.:: :.:::. :: . : :: : ..::::: : .:::::.:: : :: :::.::. .
CCDS54 NTVECYNPKTKTWSV-MPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQARQ
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 WTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSPLNTVERYNPQENRWHTIAPMGTRRKH
:. ::.::: : :.::::.: :::::: ::.: :..:: ..:. :.: : :. ::
CCDS54 WNFVATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGRDGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGG
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540 550
pF1KB5 LGCAVYQDMIYAVGGRDD-----TTELSS-AERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVN
.: .... ..::.::.: :..::. .:::.:.:..:. :..:. :..::. ...
CCDS54 VGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLG
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600
pF1KB5 GQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGGMNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
.:.::::.:: .::.:.:..::..: : . . : :. : ..:.
CCDS54 DKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
530 540 550 560
>>CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 (709 aa)
initn: 1902 init1: 741 opt: 1729 Z-score: 2024.4 bits: 384.9 E(32554): 1.9e-106
Smith-Waterman score: 1729; 45.7% identity (78.1% similar) in 558 aa overlap (50-601:156-709)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 DVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVGAKKI
: .::.. .. .:..::::.::.: ..:
CCDS33 SCRTSNSSQTLSSCHTMEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRI
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CCDS14 DRIYVIGGYDGRSRLSSVECLDYTADEDGVWYS-VAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGF
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CCDS14 DGSRRHTSMERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSVEKYD
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CCDS14 PHTGHWTNVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMT
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CCDS14 TPRCYVGATVLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLRE
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CCDS14 K
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CCDS34 IRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIAKLLASDDMNIPNEETIL
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CCDS34 NALLTWVRHDLEQRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFLAD-MENNVLFRDDIECQKLIMEAMK
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CCDS34 LCLGRAGACVVTVKL
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CCDS34 PPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAE
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