Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5949
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5949, 509 aa
1>>>pF1KB5949 509 - 509 aa - 509 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4189+/-0.00107; mu= 17.6180+/- 0.064
mean_var=62.2489+/-12.119, 0's: 0 Z-trim(102.4): 28 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.162558
statistics sampled from 6929 (6949) to 6929 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 3.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7103.1 HSPA14 gene_id:51182|Hs108|chr10 ( 509) 3259 773.3 0
CCDS9766.1 HSPA2 gene_id:3306|Hs108|chr14 ( 639) 1094 265.6 1.2e-70
CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs108|chr6 ( 641) 1086 263.7 4.3e-70
CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs108|chr6 ( 641) 1086 263.7 4.3e-70
CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs108|chr1 ( 643) 1084 263.3 6e-70
CCDS34413.1 HSPA1L gene_id:3305|Hs108|chr6 ( 641) 1078 261.8 1.6e-69
CCDS8440.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 646) 1072 260.4 4.3e-69
CCDS6863.1 HSPA5 gene_id:3309|Hs108|chr9 ( 654) 1062 258.1 2.2e-68
CCDS44754.1 HSPA8 gene_id:3312|Hs108|chr11 ( 493) 1018 247.7 2.2e-65
CCDS4208.1 HSPA9 gene_id:3313|Hs108|chr5 ( 679) 856 209.8 7.9e-54
CCDS66525.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 814) 670 166.2 1.3e-40
CCDS9340.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 858) 670 166.2 1.3e-40
CCDS4166.1 HSPA4 gene_id:3308|Hs108|chr5 ( 840) 655 162.7 1.5e-39
CCDS3734.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 839) 642 159.6 1.2e-38
CCDS66526.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 860) 584 146.0 1.6e-34
CCDS82953.1 HSPA4L gene_id:22824|Hs108|chr4 ( 813) 551 138.3 3.2e-32
CCDS60487.1 HSPA14 gene_id:51182|Hs108|chr10 ( 143) 481 121.6 6e-28
CCDS13567.1 HSPA13 gene_id:6782|Hs108|chr21 ( 471) 455 115.7 1.2e-25
CCDS73559.1 HSPH1 gene_id:10808|Hs108|chr13 ( 782) 301 79.7 1.4e-14
CCDS8408.1 HYOU1 gene_id:10525|Hs108|chr11 ( 999) 272 72.9 1.9e-12
>>CCDS7103.1 HSPA14 gene_id:51182|Hs108|chr10 (509 aa)
initn: 3259 init1: 3259 opt: 3259 Z-score: 4127.6 bits: 773.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3259; 100.0% identity (100.0% similar) in 509 aa overlap (1-509:1-509)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSRIRNI
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CCDS71 MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSRIRNI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDVARLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDVARLI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 FSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAALLAY
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CCDS71 FSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAALLAY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 GIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQYLA
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CCDS71 GIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQYLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSRARF
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CCDS71 SEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSRARF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVELLNS
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CCDS71 ELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVELLNS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 IPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVLFPSGT
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CCDS71 IPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVLFPSGT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PLPARRQHTLQAPGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRDILAVL
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CCDS71 PLPARRQHTLQAPGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRDILAVL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB5 TMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS
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CCDS71 TMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS
490 500
>>CCDS9766.1 HSPA2 gene_id:3306|Hs108|chr14 (639 aa)
initn: 982 init1: 492 opt: 1094 Z-score: 1381.9 bits: 265.6 E(32554): 1.2e-70
Smith-Waterman score: 1094; 35.6% identity (71.3% similar) in 505 aa overlap (3-505:7-506)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSR
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CCDS97 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 IRNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDV
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CCDS97 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ARLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAA
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CCDS97 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LLAYGIGQDS-PTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETL
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CCDS97 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 AQYLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNV
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CCDS97 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SRARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAV
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CCDS97 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 ELLNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVL
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CCDS97 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTP---LSLGIETAGGV-MTPL
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 FPSGTPLPARRQHTLQA-PGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLR
. .: .:... .:. . . ::: ...::.. . .:... ... : . :.
CCDS97 IKRNTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGE-RAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVP
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KB5 DILAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS
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CCDS97 QIEVTFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEAN
480 490 500 510 520 530
CCDS97 RDRVAAKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEY
540 550 560 570 580 590
>>CCDS34415.1 HSPA1B gene_id:3304|Hs108|chr6 (641 aa)
initn: 994 init1: 489 opt: 1086 Z-score: 1371.8 bits: 263.7 E(32554): 4.3e-70
Smith-Waterman score: 1086; 35.2% identity (71.5% similar) in 505 aa overlap (2-505:5-503)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSRI
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CCDS34 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 RNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDVA
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CCDS34 LNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEIS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAAL
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CCDS34 SMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LAYGIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQ
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CCDS34 IAYGLDR-TGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVN
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 YLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSR
... ::.:. :.:. : ::. .: .. : ::..::. .:. .:::.:: :: ...:
CCDS34 HFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVEL
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CCDS34 ARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 LNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVLFP
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CCDS34 NKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAP---LSLGLETAGGV-MTALIK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 SGTPLPARRQHTLQA-PGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRDI
.. .:... . . . . .: ...::.. . .:... ... :. . :. .:
CCDS34 RNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGE-RAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQI
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KB5 LAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS
... . .: :.:: ::. ::: . :.:
CCDS34 EVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRE
480 490 500 510 520 530
>>CCDS34414.1 HSPA1A gene_id:3303|Hs108|chr6 (641 aa)
initn: 994 init1: 489 opt: 1086 Z-score: 1371.8 bits: 263.7 E(32554): 4.3e-70
Smith-Waterman score: 1086; 35.2% identity (71.5% similar) in 505 aa overlap (2-505:5-503)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQSRI
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CCDS34 MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 RNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPEDVA
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CCDS34 LNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEIS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 RLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSAAL
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CCDS34 SMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LAYGIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETLAQ
.:::. . . :. :.:.: ::: ....:.. ...::..: .: : ..:: : . :..
CCDS34 IAYGLDR-TGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVN
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 YLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNVSR
... ::.:. :.:. : ::. .: .. : ::..::. .:. .:::.:: :: ...:
CCDS34 HFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAVEL
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CCDS34 ARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 LNSIPPDEVIPIGAAIEAGILIGKENLLVEDSLMIECSARDILVKGVDESGASRFTVLFP
.:: :::.. :::..:.::.: .. :.: :... . : :.. .:. .:.:.
CCDS34 NKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAP---LSLGLETAGGV-MTALIK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 SGTPLPARRQHTLQA-PGSISSVCLELYESDGKNSAKEETKFAQVVLQDLDKKENGLRDI
.. .:... . . . . .: ...::.. . .:... ... :. . :. .:
CCDS34 RNSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGE-RAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQI
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KB5 LAVLTMKRDGSLHVTCTDQETGKCEAISIEIAS
... . .: :.:: ::. ::: . :.:
CCDS34 EVTFDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRE
480 490 500 510 520 530
>>CCDS1231.1 HSPA6 gene_id:3310|Hs108|chr1 (643 aa)
initn: 991 init1: 494 opt: 1084 Z-score: 1369.2 bits: 263.3 E(32554): 6e-70
Smith-Waterman score: 1084; 35.7% identity (71.0% similar) in 504 aa overlap (3-505:8-505)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAAIGVHLGCTSACVAVYKDGRAGVVANDAGDRVTPAVVAYSENEEIVGLAAKQS
:.:. :: : .::.:...::. ..::: :.:.::. ::....:..:: :::..
CCDS12 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KB5 RIRNISNTVMKVKQILGRSSSDPQAQKYIAESKCLVIEKNGKLRYEIDTGEETKFVNPED
: :::. .:...::. .: .:. . . :. ..:: . .. : : ::.
CCDS12 AALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 VARLIFSKMKETAHSVLGSDANDVVITVPFDFGEKQKNALGEAARAAGFNVLRLIHEPSA
.. ...:::::::.. ::. .. .::::: :...:..: .:. ::.::::.:.::.:
CCDS12 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 ALLAYGIGQDSPTGKSNILVFKLGGTSLSLSVMEVNSGIYRVLSTNTDDNIGGAHFTETL
: .:::. . . .:. :.:.: ::: ....::. ...:...: .: : ..:: : . :
CCDS12 AAIAYGLDRRG-AGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNRL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 AQYLASEFQRSFKHDVRGNARAMMKLTNSAEVAKHSLSTLGSANCFLDSLYEGQDFDCNV
.... ::.:. .:. :: ::. .: .. : ::..::. .:. .:::.:: :: ..
CCDS12 VNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTSI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 SRARFELLCSPLFNKCIEAIRGLLDQNGFTADDINKVVLCGGSSRIPKLQQLIKDLFPAV
.::::: ::: :: . .: .. : . . .:. ::: :::.::::.:.:..:.: .
CCDS12 TRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
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CCDS12 RDRVAAKNSLEAHVFHVKGSLQEESLRDKIPEEDRRKMQDKCREVLAWLEHNQLAEKEEY
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CCDS84 IEVTFDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQR
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CCDS68 LDVCP----LTLGIETVGGV-MTKLIPRNTVVPTKKSQIFSTASDNQPTVTIKVYEGE-R
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CCDS44 GGAPPSGGASSGPTIEEVD
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CCDS42 ARTTPSVVAFTADGERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDIKNVPFK
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CCDS42 IVRASNGDAWVEA----HGKLYSPSQIGAFVLMKMKETAENYLGHTAKNAVITVPAYFND
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CCDS42 SQRQATKDAGQISGLNVLRVINEPTAAALAYGL--DKSEDKV-IAVYDLGGGTFDISILE
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CCDS42 IQKGVFEVKSTNGDTFLGGEDFDQALLRHIVKEFKRETGVDLTKDNMALQRVREAAEKAK
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CCDS42 KSDIGEVILVGGMTRMPKVQQTVQDLFGRAPS-KAVNPDEAVAIGAAIQGGVLAGD----
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CCDS42 VTDVLLLDVTP---LSLGIETLGGV-FTKLINRNTTIPTKKSQVFSTAADGQTQVEIKVC
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CCDS42 QGE-REMAGDNKLLGQFTLIGIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGIVHVSAKDKGTGREQQIV
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:.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]