Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5807
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5807, 472 aa
1>>>pF1KB5807 472 - 472 aa - 472 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6912+/-0.00144; mu= -0.9897+/- 0.086
mean_var=326.0443+/-65.813, 0's: 0 Z-trim(109.7): 120 B-trim: 82 in 1/51
Lambda= 0.071029
statistics sampled from 10949 (11059) to 10949 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.34), width: 16
Scan time: 3.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 3010 322.6 5.7e-88
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 2553 275.8 7.1e-74
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1949 213.8 2.8e-55
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1867 205.4 1e-52
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1788 197.4 2.7e-50
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1761 194.5 1.8e-49
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 1639 182.2 1.3e-45
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 1584 176.4 4.9e-44
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1551 173.1 5.9e-43
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 1451 163.0 8.4e-40
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1438 161.5 1.9e-39
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 1413 158.9 1e-38
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 1384 156.0 8e-38
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 1341 151.5 1.7e-36
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1337 151.1 2.3e-36
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1308 148.2 1.8e-35
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 1291 146.4 5.6e-35
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 1289 146.2 6.9e-35
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 1238 140.9 2.4e-33
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 1230 140.1 4.1e-33
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 1227 139.9 5.5e-33
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 1222 139.3 7.3e-33
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 1201 137.2 3.4e-32
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 1158 132.8 7.1e-31
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 1105 127.3 3.1e-29
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 1054 122.1 1.2e-27
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 1053 122.1 1.4e-27
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 1034 120.1 4.9e-27
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 1026 119.2 8.3e-27
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 748 90.6 2.4e-18
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 692 85.0 1.7e-16
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 686 84.4 2.6e-16
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 685 84.3 2.8e-16
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 672 83.0 7.5e-16
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 669 82.8 1e-15
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 656 81.7 3.7e-15
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 646 80.3 4.7e-15
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 641 79.9 7.4e-15
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 639 79.6 8.1e-15
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 626 78.3 2e-14
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 626 78.3 2.1e-14
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 616 77.4 4.9e-14
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 614 77.1 5.2e-14
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 613 77.0 5.6e-14
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 611 76.9 6.6e-14
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 608 76.5 8e-14
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 608 76.6 8.7e-14
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 604 76.1 1e-13
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 601 75.7 1.2e-13
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 601 75.9 1.4e-13
>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 3010 init1: 3010 opt: 3010 Z-score: 1692.9 bits: 322.6 E(32554): 5.7e-88
Smith-Waterman score: 3010; 99.8% identity (99.8% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB5 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
430 440 450 460 470
>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 (473 aa)
initn: 2065 init1: 2065 opt: 2553 Z-score: 1439.8 bits: 275.8 E(32554): 7.1e-74
Smith-Waterman score: 2553; 87.3% identity (95.2% similar) in 458 aa overlap (1-449:1-456)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSS-RFSSG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB5 GAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGG----FGGGFAGGDGLLVGSEK
:: ::::::::::::::: ::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::
CCDS11 GACGLGGGYGGGFSSSSS-FGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGGDGLLVGSEK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 VTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS11 VTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSEIKDYSPYFKTIEDLRNKI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLE
..::..::. .:::::::::::::::::: :: ::..::::.::::::::::::::.:::
CCDS11 IAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDELTLARTDLE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 MQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAE
::::.::::::::.::::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS11 MQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEQMAE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 KNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLE
:::.::: ::..::::::.:::.:::::::..::..::::..:.::::::::::::::::
CCDS11 KNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQLSMKASLE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 NSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYR
::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::
CCDS11 NSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRLEQEIATYR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 RLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDV-----TSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTK
::::::::::::.: :. : :::.: .::::: :
CCDS11 RLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQGQSS
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 N
>>CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 (432 aa)
initn: 2248 init1: 1867 opt: 1949 Z-score: 1105.8 bits: 213.8 E(32554): 2.8e-55
Smith-Waterman score: 2089; 74.5% identity (86.2% similar) in 470 aa overlap (1-470:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
::: ::::::::.::: .:.:::::: : :: .:::...: :..:.
CCDS11 MTTSIRQFTSSSSIKGS----SGLGGGSSRTS-------CR----LSGGLGAGSCRLGSA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQ
: :::. ::. :: ::::: ::.:..:.: ::::.:.::.:::
CCDS11 G--GLGSTLGGSSYSSCYSFGSG--------------GGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQ
50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 NLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNKILTAT
::::::::::::::::::::..:::::::::::: :. .::: :..:::.:.:::::::
CCDS11 NLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPGPARDYSQYYRTIEELQNKILTAT
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
:::::.:::::::::::::::::.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIE
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
.:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRK
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLE
:::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..:
CCDS11 DAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLA
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
::..:::.::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLE
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470
pF1KB5 GEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
:::::: .:... . ::. ::.:: : .:.::::.:..::: .:
CCDS11 GEDAHL--TQYKK-----EPVTT--RQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
390 400 410 420 430
>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 (456 aa)
initn: 1727 init1: 1335 opt: 1867 Z-score: 1060.1 bits: 205.4 E(32554): 1e-52
Smith-Waterman score: 1867; 65.9% identity (87.1% similar) in 449 aa overlap (25-466:14-454)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGG-----LSVSSS
::::.: .:.::::. . .. .:: .:.::.
CCDS11 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 RFSSGGAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGGDG-LLVGS
:: :.:. :::::::. . ::.: :. .:::.:.:.::::::::.:::: :: :.
CCDS11 RFVSSGS---GGGYGGGMRVCG--FGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGGDGGLLSGN
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIK-DYSPYFKTIEDLR
::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.: :. . ::: ::::::.::
CCDS11 EKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARA
.::...:.::. :.:.:::::::::::: :::.:: ::..:::::::::::::::::::.
CCDS11 DKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLART
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 DLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEK
:::::::.:.::::::::::::::. . .:..:.:::::::::::::.:.: :::.:::
CCDS11 DLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEA
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 MAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKA
::::::.:.: :::.::::::.:::.:.:..:..:.::..::::::.:::::::::::::
CCDS11 MAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIA
.::::: ::. :: :: ::: .::..: ::..:::::: ::::::.:::.:::::::::
CCDS11 GLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIA
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 TYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
::: ::::.::.... . .:... .:: ... .: . ::.:::.:..
CCDS11 TYRSLLEGQDAKMAGIAIREASSGG---GGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
410 420 430 440 450
>>CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (458 aa)
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10 20 30 40 50 60
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: . :::.:::: .. :: : :.:. :.:: ::
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10 20 30
70 80 90 100 110
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: : : ::: . ::.....: ::.:.::: ::: :.::::::::::::: ::
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40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
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:.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::. .: :: .:::::.:::
CCDS11 LTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTI
100 110 120 130 140 150
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:.::.::::::..: :.:.:::::::::::: :::.:: ::.:::::::::::::::::
CCDS11 EELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELT
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:...:::::::::.:::::.::::::::. . .:: :.:::::::.::.::.:.: :::.
CCDS11 LSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMRE
220 230 240 250 260 270
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::::.:::.. ::. :: .:: ::: .:.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::
CCDS11 SMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLE
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::::::: ::::.::.. . :.:: : :.. :.:: .. :
CCDS11 QEIATYRSLLEGQDAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
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470
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>>CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (420 aa)
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10 20 30 40 50 60
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: . :::.:::: .. :: : :.:. :.:: ::
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70 80 90 100 110
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: : : ::: . ::.....: ::.:.::: ::: :.::::::::::::: ::
CCDS11 GSAGGYGGGVSCGFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGL
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:.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::. .: :: .:::::.:::
CCDS11 LTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTI
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:.::.::::::..: :.:.:::::::::::: :::.:: ::.:::::::::::::::::
CCDS11 EELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELT
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230 240 250 260 270 280
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:...:::::::::.:::::.::::::::. . .:: :.:::::::.::.::.:.: :::.
CCDS11 LSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMRE
220 230 240 250 260 270
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::: :::.::.:::::: ::. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::
CCDS11 QYEAMAERNRRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQL
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 SMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLE
::::.:::.. ::. :: .:: ::: .:.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::
CCDS11 SMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLE
340 350 360 370 380 390
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::::::: ::::.::
CCDS11 QEIATYRSLLEGQDAKKRQPP
400 410 420
>>CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 (584 aa)
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10 20 30
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:: ::: : : ::..::: :: :: :
CCDS11 SSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRGSS---G
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40 50 60 70 80 90
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CCDS11 GGCFGGSSGGYGGLGGFGGGSFR-GSYGSSSFGGSYGGIFGGGS--FGGGSFGGGSFGGG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KB5 L--GAGLGGGFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRD
:.:.::::::::.: ::: :.::::::::::::::::::::::::.: .:: ::..
CCDS11 GFGGGGFGGGFGGGFGGDGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEGKIKE
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
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::... . .: .::: :.:::.::.:.::. :.::::.::::::::::::::: :::.
CCDS11 WYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRLKYEN
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
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:. ::.::::::::::::::::::..:::::::::: ::::::::::::::. ::. :
CCDS11 EVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRNVSTG
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 DVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQS
::::::.:::::::...::.::.:::..::.:::::: :: :..::. :. .: : ..:
CCDS11 DVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIEQISS
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 GKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQ
::::.::::..: :::::::::..: ::: :: ::.::::.::.::: .:...:::: :
CCDS11 YKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEEQLQQ
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 LRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSR
.: : : :: ::. :::.: :::.:: ::: :::::
CCDS11 IRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGGSSGG
430 440 450 460 470 480
450 460 470
pF1KB5 QIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
CCDS11 GSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSGGGGG
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10 20 30 40 50
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::. : :: ...::. ::.:::: :.. : . :::: .:: :.::::.
CCDS11 MTSYSYRQSSATSSF-------GGLGGGSVRFG---PGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSA
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:: ::::: :.:::: .:: ....::::.:.:
CCDS11 RF---------------VSSSSS-------GAYGGG--------YGGVLTASDGLLAGNE
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pF1KB5 KVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIEDLRNK
:.:::::::::::::::::::: ::..::::::::::.: :. .::: :. ::.:::.:
CCDS11 KLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGPSRDYSHYYTTIQDLRDK
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:: ::..:. ..::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::.::
CCDS11 ILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDL
150 160 170 180 190 200
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:::::.:::::::::::::::...:::::::.:.::.:.:::.::..::..::.::: ::
CCDS11 EMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMA
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:.:::::: :: ..::::::::: ..: .: ..::...::::.:.:::::::::::::.:
CCDS11 EQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAAL
270 280 290 300 310 320
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CCDS11 EDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATY
330 340 350 360 370 380
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CCDS11 RSLLEGQEDHYNNLSASKVL
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::...:.: . .: . ..:.: :: :. :.::
CCDS11 MDLSNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGG-----SAFGFGASC--
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:::.: ..: : :.. :.::: :...... ....: ..::: :::: :.::. :
CCDS11 ----GGGFS-AASMF--GSSSGFGGGSGSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGLGMGFGGSPG
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:: ..:.:: :: :::: :::::::::::::::::::::::..:: :::.::. .
CCDS11 GGSLGILSGNDGGLLSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGT
110 120 130 140 150 160
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: .::: :. ::::::::..:.. ::..:::::::::::.::: :::.:: ::.
CCDS11 GTADASQSDYSKYYPLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQ
170 180 190 200 210 220
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.:::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::.:::::.:....: :.:.:::
CCDS11 GVEADINGLRRVLDELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEM
230 240 250 260 270 280
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CCDS11 DAAPGVDLTRLLNDMRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVT
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pF1KB5 ELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEME
.:::..:::::::::::.:: :::.:: :..: :: ::.:.:..:...: :: :.: . :
CCDS11 DLRRAFQNLEIELQSQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAE
350 360 370 380 390 400
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.:: ... ::.::.::: :: ::::::.:: : : : . :.:. . :.::
CCDS11 RQNVDHQRLLNVKARLELEIETYRRLLDGEAQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTDSSKDPTK
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pF1KB5 -RQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRTKN
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CCDS11 TRKIKTVVQEMVNGEVVSSQVQEIEELM
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>>CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 (623 aa)
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10 20 30
pF1KB5 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGG------GIGGGSSRI
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CCDS32 MSCRQFSSSYLSRSGGGGGGGLGSGGSIRSSYSRFSSSGGGGGGGRFSSSSGYGGGSSRV
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pF1KB5 SSVLAGGSC--RAPSTYGGGLSVSS--SRFSSGGAYGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGG
. .::: . :::.:.:: . :. ::. :.::. :::.:::.. ::.:::::
CCDS32 CGRGGGGSFGYSYGGGSGGGFSASSLGGGFG-GGSRGFGGASGGGYSSSGG-FGGGFGGG
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pF1KB5 YGGGLGAGLG------GGFGGGFAGGDG-LLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEAN
:::.:.: : :::::: .:::: .:...:: :::.::.:::::::::.::::::
CCDS32 SGGGFGGGYGSGFGGFGGFGGGAGGGDGGILTANEKSTMQELNSRLASYLDKVQALEEAN
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pF1KB5 ADLEVKIRDWYQRQRPAEI-KDYSPYFKTIEDLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADD
::: ::.:::... :: : :.::::..::.::...:. :: : ..::.:::.:.. ::
CCDS32 NDLENKIQDWYDKKGPAAIQKNYSPYYNTIDDLKDQIVDLTVGNNKTLLDIDNTRMTLDD
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 FRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNA
:: :.: : :::..:.:::::::.:::.::. ..::::: :.:.::: :::::.:::.
CCDS32 FRIKFEMEQNLRQGVDADINGLRQVLDNLTMEKSDLEMQYETLQEELMALKKNHKEEMSQ
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pF1KB5 LRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVAT
: :: .::::::...::: ::.. ::.::..::.. ::::: :. . :. ....::..
CCDS32 LTGQNSGDVNVEINVAPGKDLTKTLNDMRQEYEQLIAKNRKDIENQYETQITQIEHEVSS
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 NSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGS
... :::. .:...::. .:.:::::::::: ::.::.:::.::.::: :: .:::.:..
CCDS32 SGQEVQSSAKEVTQLRHGVQELEIELQSQLSKKAALEKSLEDTKNRYCGQLQMIQEQISN
360 370 380 390 400 410
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.: :....: :.: :::::..::..: :::.:: ::. :::: . . ::
CCDS32 LEAQITDVRQEIECQNQEYSLLLSIKMRLEKEIETYHNLLEGGQEDFESSGAGKIGLGGR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]