Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5754
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5754, 749 aa
1>>>pF1KB5754 749 - 749 aa - 749 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1424+/-0.00103; mu= 15.4339+/- 0.061
mean_var=78.7634+/-15.763, 0's: 0 Z-trim(104.4): 69 B-trim: 30 in 2/48
Lambda= 0.144515
statistics sampled from 7822 (7882) to 7822 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 3.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1372.1 PLA2G4A gene_id:5321|Hs108|chr1 ( 749) 5020 1056.9 0
CCDS55962.1 PLA2G4E gene_id:123745|Hs108|chr15 ( 868) 685 153.1 1.7e-36
CCDS32204.1 PLA2G4F gene_id:255189|Hs108|chr15 ( 849) 674 150.8 8.2e-36
CCDS32203.1 PLA2G4D gene_id:283748|Hs108|chr15 ( 818) 643 144.4 7e-34
CCDS45241.1 PLA2G4B gene_id:100137049|Hs108|chr15 ( 781) 636 142.9 1.8e-33
CCDS55961.1 PLA2G4B gene_id:8681|Hs108|chr15 ( 893) 636 142.9 2.1e-33
CCDS32202.1 PLA2G4B gene_id:8681|Hs108|chr15 (1012) 636 142.9 2.3e-33
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CCDS12710.1 PLA2G4C gene_id:8605|Hs108|chr19 ( 541) 325 78.0 4.4e-14
CCDS59403.1 PLA2G4C gene_id:8605|Hs108|chr19 ( 551) 324 77.8 5.2e-14
>>CCDS1372.1 PLA2G4A gene_id:5321|Hs108|chr1 (749 aa)
initn: 5020 init1: 5020 opt: 5020 Z-score: 5654.3 bits: 1056.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5020; 99.9% identity (100.0% similar) in 749 aa overlap (1-749:1-749)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSFIDPYQHIIVEHQYSHKFTVVVLRATKVTKGAFGDMLDTPDPYVELFISTTPDSRKRT
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CCDS13 MSFIDPYQHIIVEHQYSHKFTVVVLRATKVTKGAFGDMLDTPDPYVELFISTTPDSRKRT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 RHFNNDINPVWNETFEFILDPNQENVLEITLMDANYVMDETLGTATFTVSSMKVGEKKEV
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CCDS13 RHFNNDINPVWNETFEFILDPNQENVLEITLMDANYVMDETLGTATFTVSSMKVGEKKEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PFIFNQVTEMVLEMSLEVCSCPDLRFSMALCDQEKTFRQQRKEHIRESMKKLLGPKNSEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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CCDS13 LHSARDVPVVAILGSGGGFRAMVGFSGVMKALYESGILDCATYVAGLSGSTWYMSTLYSH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 PDFPEKGPEEINEELMKNVSHNPLLLLTPQKVKRYVESLWKKKSSGQPVTFTDIFGMLIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PDFPEKGPEEINEELMKNVSHNPLLLLTPQKVKRYVESLWKKKSSGQPVTFTDIFGMLIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ETLIHNRMNTTLSSLKEKVNTAQCPLPLFTCLHVKPDVSELMFADWVEFSPYEIGMAKYG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TFMAPDLFGSKFFMGTVVKKYEENPLHFLMGVWGSAFSILFNRVLGVSGSQSRGSTMEEE
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CCDS13 TFMAPDLFGSKFFMGTVVKKYEENPLHFLMGVWGSAFSILFNRVLGVSGSQSRGSTMEEE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LENITTKHIVSNDSSDSDDESHEPKGTENEDAGSDYQSDNQASWIHRMIMALVSDSALFN
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CCDS13 LENITTKHIVSNDSSDSDDESHEPKGTENEDAGSDYQSDNQASWIHRMIMALVSDSALFN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TREGRAGKVHNFMLGLNLNTSYPLSPLSDFATQDSFDDDELDAAVADPDEFERIYEPLDV
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CCDS13 TREGRAGKVHNFMLGLNLNTSYPLSPLSDFATQDSFDDDELDAAVADPDEFERIYEPLDV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 KSKKIHVVDSGLTFNLPYPLILRPQRGVDLIISFDFSARPSDSSPPFKELLLAEKWAKMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KSKKIHVVDSGLTFNLPYPLILRPQRGVDLIISFDFSARPSDSSPPFKELLLAEKWAKMN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KLPFPKIDPYVFDREGLKECYVFKPKNPDMEKDCPTIIHFVLANINFRKYKAPGVPRETE
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CCDS13 KLPFPKIDPYVFDREGLKECYVFKPKNPDMEKDCPTIIHFVLANINFRKYRAPGVPRETE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 EEKEIADFDIFDDPESPFSTFNFQYPNQAFKRLHDLMHFNTLNNIDVIKEAMVESIEYRR
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CCDS13 EEKEIADFDIFDDPESPFSTFNFQYPNQAFKRLHDLMHFNTLNNIDVIKEAMVESIEYRR
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB5 QNPSRCSVSLSNVEARRFFNKEFLSKPKA
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QNPSRCSVSLSNVEARRFFNKEFLSKPKA
730 740
>>CCDS55962.1 PLA2G4E gene_id:123745|Hs108|chr15 (868 aa)
initn: 995 init1: 614 opt: 685 Z-score: 768.7 bits: 153.1 E(32554): 1.7e-36
Smith-Waterman score: 1027; 32.4% identity (63.5% similar) in 598 aa overlap (133-726:317-866)
110 120 130 140 150
pF1KB5 GTATFTVSSMKVGEKKEVPFIFNQVTEMVLEMSLEVCSCP---DLRFSMALCDQEKTFRQ
:. .. :: :.:....:: : : :
CCDS55 CRSRKKGPISQPLDCLSDGQVMTLPVGESYELHMKSTPCPETLDVRLGFSLCPAELEFLQ
290 300 310 320 330 340
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 QRKEHIRESMKKLLGPKNSEGLHSARDVPVVAILGSGGGFRAMVGFSGVMKALYESGILD
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CCDS55 KRKVVVAKALKQVL--QLEEDLQED-EVPLIAIMATGGGTRSMTSMYGHLLGLQKLNLLD
350 360 370 380 390 400
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 CATYVAGLSGSTWYMSTLYSHPDFPEKGPEEINEELMKNVSHNPLLLLTPQKVKRYVESL
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CCDS55 CASYITGLSGATWTMATLYRDPDWSSKNLEPAIFEARRHVVKDKLPSLFPDQLRKFQEEL
410 420 430 440 450 460
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 WKKKSSGQPVTFTDIFGMLIGETLIHNRMNTTLSSLKEKVNTAQCPLPLFTCLHVKPDVS
.... : :::::..:.:: : .: . ::. . .. .: :::.. ..:: :::
CCDS55 RQRSQEGYRVTFTDFWGLLIETCLGDERNECKLSDQRAALSCGQNPLPIYLTINVKDDVS
470 480 490 500 510 520
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 ELMFADWVEFSPYEIGMAKYGTFMAPDLFGSKFFMGTVVKKYEENPLHFLMGVWGSAFSI
. : .: ::::::.:. :::.:. .::::.:::: .::. :. . ...:.:.: ::
CCDS55 NQDFREWFEFSPYEVGLQKYGAFIPSELFGSEFFMGRLVKRIPESRICYMLGLWSSIFS-
530 540 550 560 570 580
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 LFNRVLGVSGSQSRGSTMEEELENITTKHIVSNDSSDSDDESHEPKGTENEDAGSDYQSD
:.. . . . : :: .. : ... .: .:: :. . . .
CCDS55 -----LNLLDAWNLSHTSEEFFHRWTREKV-----QDIEDEPILPEIPKCDANILETTVV
590 600 610 620 630
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 NQASWIHRMIMALVSDSALFNTREGRAGKVHNFMLGLNLNTSYPLSPLSDFATQDSFDDD
.::. . .. :... ... :::. ::.:.:.: . ..:. . :
CCDS55 IPGSWLSNSFREIL-------THRSFVSEFHNFLSGLQLHTNYLQN--GQFSR---WKDT
640 650 660 670 680
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 ELDAAVADPDEFERIYEPLDVKSKKIHVVDSGLTFNLPYPLILRPQRGVDLIISFDFSAR
::. :.. : ..... ..:... : :: .:::.: .:::: ... :
CCDS55 VLDGF---PNQ-------LTESANHLCLLDTAFFVNSSYPPLLRPERKADLIIHLNYCA-
690 700 710 720
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 PSDSSPPFKELLLAEKWAKMNKLPFPKID-PYVFDREGLKECYVFKPKNPDMEKDCPTII
.... :.:. .. ....:::: . : . :.:::::.. .::. : : : .
CCDS55 -GSQTKPLKQTC---EYCTVQNIPFPKYELPD--ENENLKECYLM--ENPQ-EPDAPIVT
730 740 750 760 770 780
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 HFVLANINFRKYKAPGVPRETEEEKEIADFDIFDDPESPFSTFNFQYPNQAFKRLHDLMH
: : : .::::::::: : . :: : .. ::. :..:..: .. : . .: .: : .
CCDS55 FFPLINDTFRKYKAPGVER-SPEELEQGQVDIYG-PKTPYATKELTYTEATFDKLVKLSE
790 800 810 820 830
700 710 720 730 740
pF1KB5 FNTLNNIDVIKEAMVESIEYRRQNPSRCSVSLSNVEARRFFNKEFLSKPKA
.: ::: :.. .:. ..: ... ..:
CCDS55 YNILNNKDTLLQALRLAVEKKKRLKGQCPS
840 850 860
>>CCDS32204.1 PLA2G4F gene_id:255189|Hs108|chr15 (849 aa)
initn: 1066 init1: 555 opt: 674 Z-score: 756.4 bits: 150.8 E(32554): 8.2e-36
Smith-Waterman score: 1058; 32.1% identity (61.2% similar) in 672 aa overlap (69-725:227-846)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 LDTPDPYVELFISTTPDSRKRTRHFNNDINPVWNETFEFILDPNQENVLEITLMD-----
: :: : ..: . :.. ::.
CCDS32 REEYGSRQLQLAVPGAYEKPQLLPLQPPTEPGLPPTFTFHVNPVLSSRLHVELMELLAAV
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140
pF1KB5 ----ANYVMDET--LGTATFTVSSMKVGEKKEVPFIFNQVTEMVLEMSLEVCSCP-DLRF
. . .: :: . . .::. .:.... ... :..: :..:. : :::.
CCDS32 QSGPSAELEAQTSKLGEGGILLSSLPLGQEEQCSVALGEGQEVALSMKVEMSSGDLDLRL
260 270 280 290 300 310
150 160 170 180 190 200
pF1KB5 SMALCDQEKTFRQQRKEHIRESMKKLLGPKNSEGLHSARDVPVVAILGSGGGFRAMVGFS
.. : : :. : ..::. . ......:: ::.: :.. :::::.:::::: ::: ..
CCDS32 GFDLSDGEQEFLDRRKQVVSKALQQVLGL--SEALDSGQ-VPVVAVLGSGGGTRAMSSLY
320 330 340 350 360 370
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 GVMKALYESGILDCATYVAGLSGSTWYMSTLYSHPDFPEKGPEEINEELMKNVSHNPLLL
: . .: : :.:: .::..:.::::: .:::: : . . . . :. . .: . .
CCDS32 GSLAGLQELGLLDTVTYLSGVSGSTWCISTLYRDPAWSQVALQGPIERAQVHVCSSKMGA
380 390 400 410 420 430
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 LTPQKVKRYVESLWKKKSSGQPVTFTDIFGMLIGETLIHNRMNTTLSSLKEKVNTAQCPL
:. .... :.. : .. ::. :.. :..:.:. : ... . ::. .: : .: :
CCDS32 LSTERLQYYTQELGVRERSGHSVSLIDLWGLLVEYLLYQEENPAKLSDQQEAVRQGQNPY
440 450 460 470 480 490
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 PLFTCLHVKPDVSELMFADWVEFSPYEIGMAKYGTFMAPDLFGSKFFMGTVVKKYEENPL
:..: ..:. ..: ::.: ::.:::.:. :::... .::::..::: ... : .
CCDS32 PIYTSVNVRTNLSGEDFAEWCEFTPYEVGFPKYGAYVPTELFGSELFMGRLLQLQPEPRI
500 510 520 530 540 550
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 HFLMGVWGSAFSILFNRV-LGVSGSQSRGSTMEEELENITTKHIVSNDSSDSDDESHEPK
.:.:.:::::. .... : ..:: : .. : .. : . :. ..:.
CCDS32 CYLQGMWGSAFATSLDEIFLKTAGS---GLSFLEWYRG----------SVNITDDCQKPQ
560 570 580 590 600
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 GTENEDAGSDYQSDNQASWIHRMIMALVSDSALFNTREGRAGKVHNFMLGLNLNTSYPLS
.: . :. . . .. : .:..: : . :: :: :. .: .
CCDS32 -LHNPSRLRTRLLTPQGPFSQAVL-----D--IFTSRFTSA-QSFNFTRGLCLHKDYVAG
610 620 630 640 650
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 PLSDF-ATQDSFDDDELDAAVADPDEFERIYEPLDVKSKKIHVVDSGLTFNLPYPLILRP
.: : .:. :: : :. ...::.:...: :.:: : :
CCDS32 --REFVAWKDTH-----------PDAFPNQLTPM---RDCLYLVDGGFAINSPFPLALLP
660 670 680 690
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 QRGVDLIISFDFSARPSDSSPPFKELLLAEKWAKMNKLPFPKIDPYVFDREGLKECYVF-
::.::::.:::.: . ::. : ..::. .:::.:. : : .:::.:
CCDS32 QRAVDLILSFDYSLEA-----PFEVLKMTEKYCLDRGIPFPSIEVGPEDMEEARECYLFA
700 710 720 730 740 750
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 KPKNPDMEKDCPTIIHFVLANINFRKYKAPGVPRETEEEKEIADFDIFDDPESPFSTFNF
: ..: : ..:: :.: .:: . :::: :.: ::: ..:: ... :..:.. .::
CCDS32 KAEDPR----SPIVLHFPLVNRTFRTHLAPGVERQTAEEKAFGDF-VINRPDTPYGMMNF
760 770 780 790 800
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pF1KB5 QYPNQAFKRLHDLMHFNTLNNIDVIKEAMVESIEYRRQNPSRCSVSLSNVEARRFFNKEF
: : : :: : ..:.:::....: :. ... :.: :
CCDS32 TYEPQDFYRLVALSRYNVLNNVETLKCALQLALD-RHQARERAGA
810 820 830 840
pF1KB5 LSKPKA
>>CCDS32203.1 PLA2G4D gene_id:283748|Hs108|chr15 (818 aa)
initn: 934 init1: 342 opt: 643 Z-score: 721.8 bits: 144.4 E(32554): 7e-34
Smith-Waterman score: 933; 30.3% identity (61.4% similar) in 627 aa overlap (99-719:234-807)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PVWNETFEFILDPNQENVLEITLMDANYVMDETLGTATFTVSSMKVGEKKEVPFIFNQVT
:.. : : . . .: ::: . .
CCDS32 ASAFRFHYMAALETELSGRLRSSRSNGWNGDNSAGYLTVPLRPLTIG--KEVTMDVPAPN
210 220 230 240 250 260
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EMVLEMSLEVCSCPD---LRFSMALCDQEKTFRQQRKEHIRESMKKLLGPKNSEGLHSAR
....:.. .::. ..... :: .:..: ..::. . ...:. : . .. :.
CCDS32 APGVRLQLKAEGCPEELAVHLGFNLCAEEQAFLSRRKQVVAKALKQAL--QLDRDLQED-
270 280 290 300 310
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DVPVVAILGSGGGFRAMVGFSGVMKALYESGILDCATYVAGLSGSTWYMSTLYSHPDFPE
.::::.:...::: :::... : . :: . :.:::.:: .:.::::: :. ::. :.. .
CCDS32 EVPVVGIMATGGGARAMTSLYGHLLALQKLGLLDCVTYFSGISGSTWTMAHLYGDPEWSQ
320 330 340 350 360 370
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KGPEEINEELMKNVSHNPLLLLTPQKVKRYVESLWKKKSSGQPVTFTDIFGMLIGETLIH
. : . ...... : ...:... : . : . .:.:.::.:...... :...:
CCDS32 RDLEGPIRYAREHLAKSKLEVFSPERLASYRRELELRAEQGHPTTFVDLWALVL-ESMLH
380 390 400 410 420 430
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 NR-MNTTLSSLKEKVNTAQCPLPLFTCLHVKPDVSELM-FADWVEFSPYEIGMAKYGTFM
.. :. ::. . .. .: ::::. :.:: . : . : .::::::::.:. :::.:.
CCDS32 GQVMDQKLSGQRAALERGQNPLPLYLSLNVKENNLETLDFKEWVEFSPYEVGFLKYGAFV
440 450 460 470 480 490
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 APDLFGSKFFMGTVVKKYEENPLHFLMGVWGSAFSILFNRVLGVSGSQSRGSTMEEELEN
:.::::.:::: .... : . :: ..:.. ::. : . . : : . ..
CCDS32 PPELFGSEFFMGRLMRRIPEPRICFLEAIWSNIFSL--NLLDAWYDLTSSGESWKQ----
500 510 520 530 540 550
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pF1KB5 ITTKHIVSNDSSDSDDESHEPKGTENEDAGSDYQSDNQASWIHRMIMALVSDSALFNTRE
:: .:.. : .. :: : : .: .:::.. ::.. : : .
CCDS32 ----HI--KDKTRSLEK--EPLTT------SGTSSRLEASWLQPGT-ALAQAFKGFLTGR
560 570 580 590
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 GRAGKVHNFMLGLNLNTSYPLSPLSDFATQDSFDDDELDAAVADPDEFERIYEPLDVKSK
. ::. ::.:. .: .::.: . : .::. :.. : :
CCDS32 PLHQRSPNFLQGLQLHQDY--CSHKDFST---WADYQLDSM---PSQ-------LTPKEP
600 610 620 630 640
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 KIHVVDSGLTFNLPYPLILRPQRGVDLIISFDFSARPSDSSPPFKELLLAEKWAKMNKLP
.. .::.. .: : ..:: : .:::.:::.: : ::. : .: . . ::
CCDS32 RLCLVDAAYFINTSSPSMFRPGRRLDLILSFDYSL-----SAPFEALQQTELYCRARGLP
650 660 670 680 690
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 FPKIDPYVFDREGLKECYVFK-PKNPDMEKDCPTIIHFVLANINFRKYKAPGVPRETEEE
::...: :.. .::..:. : :. : ..:: :.: .:. ..:::: : . :
CCDS32 FPRVEPSPQDQHQPRECHLFSDPACPEA----PILLHFPLVNASFKDHSAPGVQR-SPAE
700 710 720 730 740 750
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 KEIADFDIFDDPESPFSTFNFQYPNQAFKRLHDLMHFNTLNNIDVIKEAMVESIEYRRQN
. .. :. :.. :. : .. :.:: : .:. .. .: .:. ....:
CCDS32 LQGGQVDL-TGATCPYTLSNMTYKEEDFERLLRLSDYNVQTSQGAILQALRTALKHRTLE
760 770 780 790 800 810
730 740
pF1KB5 PSRCSVSLSNVEARRFFNKEFLSKPKA
CCDS32 ARPPRAQT
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CCDS12 -RIEADEAPVVAVLGSGGGLRAHIACLGVLSEMKEQGLLDAVTYLAGVSGSTWAISSLYT
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pF1KB5 HPDFPEKGPEEINEELMKNVSHNPLLLLTPQKVKRYVESLWK--KKSSGQPVTFTDIFGM
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CCDS12 ND-----GDMEALEADLK---HR----FTRQEWD-LAKSLQKTIQAARSENYSLTDFWAY
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CCDS12 MVISKQTRELPESHLSNMKKPVEEGTLPYPIFAAIDNDLQPSWQEARAPETWFEFTPHHA
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pF1KB5 GMAKYGTFMAPDLFGSKFFMGTVVKKYEENPLHFLMGVWGSAFS-------ILFN--RVL
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CCDS12 GFSALGAFVSITHFGSKFKKGRLVRTHPERDLTFLRGLWGSALGNTEVIREYIFDQLRNL
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CCDS12 THNFLYKHGGIRDKIMSSRKHLHLVDAGLAINTPFPLVLPPTREVHLILSFDFSA-----
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CCDS12 GDPFETIRATTDYCRRHKIPFPQVEEAELDLWSKAPASCYILKGETG------PVVMHFP
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