Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5752
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5752, 747 aa
1>>>pF1KB5752 747 - 747 aa - 747 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1100+/-0.000843; mu= 8.9431+/- 0.051
mean_var=189.3340+/-38.469, 0's: 0 Z-trim(114.1): 20 B-trim: 141 in 1/51
Lambda= 0.093209
statistics sampled from 14708 (14726) to 14708 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.452), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7273.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 747) 5071 694.6 1.5e-199
CCDS44412.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 452) 3070 425.3 1e-118
CCDS81469.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 444) 2931 406.6 4.3e-113
CCDS12523.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 389) 722 109.5 1e-23
CCDS46069.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 352) 721 109.3 1e-23
CCDS7691.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 ( 399) 681 104.0 4.8e-22
CCDS74361.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 234) 650 99.6 5.7e-21
CCDS53590.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 ( 257) 642 98.6 1.3e-20
>>CCDS7273.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (747 aa)
initn: 5071 init1: 5071 opt: 5071 Z-score: 3696.0 bits: 694.6 E(32554): 1.5e-199
Smith-Waterman score: 5071; 100.0% identity (100.0% similar) in 747 aa overlap (1-747:1-747)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MADEAALALQPGGSPSAAGADREAASSPAGEPLRKRPRRDGPGLERSPGEPGGAAPEREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MADEAALALQPGGSPSAAGADREAASSPAGEPLRKRPRRDGPGLERSPGEPGGAAPEREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PAAARGCPGAAAAALWREAEAEAAAAGGEQEAQATAAAGEGDNGPGLQGPSREPPLADNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PAAARGCPGAAAAALWREAEAEAAAAGGEQEAQATAAAGEGDNGPGLQGPSREPPLADNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 YDEDDDDEGEEEEEAAAAAIGYRDNLLFGDEIITNGFHSCESDEEDRASHASSSDWTPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 YDEDDDDEGEEEEEAAAAAIGYRDNLLFGDEIITNGFHSCESDEEDRASHASSSDWTPRP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 RIGPYTFVQQHLMIGTDPRTILKDLLPETIPPPELDDMTLWQIVINILSEPPKRKKRKDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RIGPYTFVQQHLMIGTDPRTILKDLLPETIPPPELDDMTLWQIVINILSEPPKRKKRKDI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 NTIEDAVKLLQECKKIIVLTGAGVSVSCGIPDFRSRDGIYARLAVDFPDLPDPQAMFDIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NTIEDAVKLLQECKKIIVLTGAGVSVSCGIPDFRSRDGIYARLAVDFPDLPDPQAMFDIE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 YFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGIQRII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 YFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGIQRII
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILINREPLPHLHFDVELLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILINREPLPHLHFDVELLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 DCDVIINELCHRLGGEYAKLCCNPVKLSEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DCDVIINELCHRLGGEYAKLCCNPVKLSEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 PERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEKPQEVQTSRNVESIAEQMENPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEKPQEVQTSRNVESIAEQMENPDL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 KNVGSSTGEKNERTSVAGTVRKCWPNRVAKEQISRRLDGNQYLFLPPNRYIFHGAEVYSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KNVGSSTGEKNERTSVAGTVRKCWPNRVAKEQISRRLDGNQYLFLPPNRYIFHGAEVYSD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 SEDDVLSSSSCGSNSDSGTCQSPSLEEPMEDESEIEEFYNGLEDEPDVPERAGGAGFGTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SEDDVLSSSSCGSNSDSGTCQSPSLEEPMEDESEIEEFYNGLEDEPDVPERAGGAGFGTD
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB5 GDDQEAINEAISVKQEVTDMNYPSNKS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GDDQEAINEAISVKQEVTDMNYPSNKS
730 740
>>CCDS44412.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (452 aa)
initn: 3070 init1: 3070 opt: 3070 Z-score: 2244.8 bits: 425.3 E(32554): 1e-118
Smith-Waterman score: 3070; 100.0% identity (100.0% similar) in 452 aa overlap (296-747:1-452)
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 VSCGIPDFRSRDGIYARLAVDFPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSL
10 20 30
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 CHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGIQRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGIQRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRG
40 50 60 70 80 90
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 DIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKV
100 110 120 130 140 150
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 RPVALIPSSIPHEVPQILINREPLPHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLGGEYAKLCCNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RPVALIPSSIPHEVPQILINREPLPHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLGGEYAKLCCNPV
160 170 180 190 200 210
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 KLSEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KLSEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDD
220 230 240 250 260 270
570 580 590 600 610 620
pF1KB5 LDVSESKGCMEEKPQEVQTSRNVESIAEQMENPDLKNVGSSTGEKNERTSVAGTVRKCWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LDVSESKGCMEEKPQEVQTSRNVESIAEQMENPDLKNVGSSTGEKNERTSVAGTVRKCWP
280 290 300 310 320 330
630 640 650 660 670 680
pF1KB5 NRVAKEQISRRLDGNQYLFLPPNRYIFHGAEVYSDSEDDVLSSSSCGSNSDSGTCQSPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NRVAKEQISRRLDGNQYLFLPPNRYIFHGAEVYSDSEDDVLSSSSCGSNSDSGTCQSPSL
340 350 360 370 380 390
690 700 710 720 730 740
pF1KB5 EEPMEDESEIEEFYNGLEDEPDVPERAGGAGFGTDGDDQEAINEAISVKQEVTDMNYPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EEPMEDESEIEEFYNGLEDEPDVPERAGGAGFGTDGDDQEAINEAISVKQEVTDMNYPSN
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 KS
::
CCDS44 KS
>>CCDS81469.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (444 aa)
initn: 2931 init1: 2931 opt: 2931 Z-score: 2143.9 bits: 406.6 E(32554): 4.3e-113
Smith-Waterman score: 2931; 100.0% identity (100.0% similar) in 433 aa overlap (315-747:12-444)
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 VDFPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MCLCSGRKTILEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYT
10 20 30 40
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 QNIDTLEQVAGIQRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QNIDTLEQVAGIQRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPL
50 60 70 80 90 100
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 AIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILI
110 120 130 140 150 160
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 NREPLPHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLGGEYAKLCCNPVKLSEITEKPPRTQKELAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NREPLPHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLGGEYAKLCCNPVKLSEITEKPPRTQKELAYL
170 180 190 200 210 220
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 SELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEKPQEVQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEKPQEVQT
230 240 250 260 270 280
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 SRNVESIAEQMENPDLKNVGSSTGEKNERTSVAGTVRKCWPNRVAKEQISRRLDGNQYLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SRNVESIAEQMENPDLKNVGSSTGEKNERTSVAGTVRKCWPNRVAKEQISRRLDGNQYLF
290 300 310 320 330 340
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 LPPNRYIFHGAEVYSDSEDDVLSSSSCGSNSDSGTCQSPSLEEPMEDESEIEEFYNGLED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LPPNRYIFHGAEVYSDSEDDVLSSSSCGSNSDSGTCQSPSLEEPMEDESEIEEFYNGLED
350 360 370 380 390 400
710 720 730 740
pF1KB5 EPDVPERAGGAGFGTDGDDQEAINEAISVKQEVTDMNYPSNKS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EPDVPERAGGAGFGTDGDDQEAINEAISVKQEVTDMNYPSNKS
410 420 430 440
>>CCDS12523.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (389 aa)
initn: 709 init1: 310 opt: 722 Z-score: 539.3 bits: 109.5 E(32554): 1e-23
Smith-Waterman score: 722; 37.0% identity (64.2% similar) in 346 aa overlap (217-547:37-375)
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FVQQHLMIGTDPRTILKDLLPETIPPPELDDMT-LWQIVINILSEPPKRKKRKDINTIED
:: : .. . :: .... : :.:
CCDS12 SHPLETQAGKVQEAQDSDSDSEGGAAGGEADMDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEG
10 20 30 40 50 60
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AVKLLQ--ECKKIIVLTGAGVSVSCGIPDFRS-RDGIYARLAVDFPDLPDPQAMFDIEYF
... .: .:...: :.:::.:.: ::::::: :.: : . :: :.:.:.: ::
CCDS12 VARYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNL--EKYHLPYPEAIFEISYF
70 80 90 100 110 120
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGIQR--II
.: :.::: .:::.:::::.:..:: :. : .: ::: :::::::::..::... ..
CCDS12 KKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLV
130 140 150 160 170 180
370 380 390 400 410
pF1KB5 QCHGSFATASCLI--CKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENL
. ::.: :. :. :... .. ::..:.:.: : . ..::.::::::.:
CCDS12 EAHGTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQS-----LVKPDIVFFGESL
190 200 210 220 230
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 PEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILINREPL----PHLHF
: .: :. : .::::.:.:.::.:.: : . :. : .:..:::.: : : .
CCDS12 PARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGM
240 250 260 270 280 290
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 DVELLGDCDVIINELCHRLG--GEYAKLCCNPVKL-SEITEKPPRTQKELAYLSELPPTP
. : : : .. . .. :: . : ..: . : ...: : .. .
CCDS12 IMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAG
300 310 320 330 340 350
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 LHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEKPQEVQTSRNVESI
. :.::... ::
CCDS12 VPNPSTSASPKKSPPPAKDEARTTEREKPQ
360 370 380
>>CCDS46069.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (352 aa)
initn: 675 init1: 310 opt: 721 Z-score: 539.1 bits: 109.3 E(32554): 1e-23
Smith-Waterman score: 721; 37.4% identity (64.7% similar) in 334 aa overlap (228-547:12-338)
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 PRTILKDLLPETIPPPELDDMTLWQIVINILSEPPKRKKRKDINTIEDAVKLLQ--ECKK
:: .... : :.: ... .: .:..
CCDS46 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSERCRR
10 20 30 40
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 IIVLTGAGVSVSCGIPDFRS-RDGIYARLAVDFPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAK
.: :.:::.:.: ::::::: :.: : . :: :.:.:.: ::.: :.::: .::
CCDS46 VICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNL--EKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAK
50 60 70 80 90
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 EIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGIQR--IIQCHGSFATASCL
:.:::::.:..:: :. : .: ::: :::::::::..::... ... ::.: :. :.
CCDS46 ELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCV
100 110 120 130 140 150
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 I--CKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDK
:... .. ::..:.:.: : . ..::.::::::.:: .: :. :
CCDS46 SASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQS-----LVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDF
160 170 180 190 200 210
440 450 460 470 480
pF1KB5 DEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILINREPL----PHLHFDVELLGDCDVII
.::::.:.:.::.:.: : . :. : .:..:::.: : : . . : : :
CCDS46 LKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDS
220 230 240 250 260 270
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 NELCHRLG--GEYAKLCCNPVKL-SEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPER
.. . .. :: . : ..: . : ...: : .. . . :.::..
CCDS46 KKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKK
280 290 300 310 320 330
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 TSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEKPQEVQTSRNVESIAEQMENPDLKNV
. ::
CCDS46 SPPPAKDEARTTEREKPQ
340 350
>>CCDS7691.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 (399 aa)
initn: 694 init1: 266 opt: 681 Z-score: 509.3 bits: 104.0 E(32554): 4.8e-22
Smith-Waterman score: 683; 34.7% identity (64.2% similar) in 366 aa overlap (140-494:40-378)
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 PSREPPLADNLYDEDDDDEGEEEEEAAAAAIGYRDNLLFGDEIITNGFHSCESDEEDRAS
.: ::.. : : :. ... : :
CCDS76 AALRLWGRVVERVEAGGGVGPFQACGCRLVLGGRDDVSAG----LRGSHGARGEPLDPAR
10 20 30 40 50 60
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 HASSSDWTPRPRIGPYTFVQQHLMIGTDPRTILKDLLPETIPPPELDDMTLWQIVINILS
. :::.. : .: .: ::. ... .: . .... . ....
CCDS76 PLQRP---PRPEV-PRAFRRQ-------PRAAAPSFFFSSIKGGR-RSISFSVGASSVVG
70 80 90 100 110
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 EPPKRKKRKDINTIEDAVKLLQE--CKKIIVLTGAGVSVSCGIPDFRSR-DGIYARLAVD
. : : ...:...:.. :....:..:::.:. ::::::: .:.:. : .
CCDS76 SGGSSDKGK--LSLQDVAELIRARACQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQ-Q
120 130 140 150 160 170
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 FPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQN
. ::: :.:.:.. .: ..:.::: .:::.:::...:.. : :. : .: ::: ::::
CCDS76 Y-DLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQN
180 190 200 210 220
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 IDTLEQVAGI--QRIIQCHGSFATASCLICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPL
:: ::.:.:: ..... ::.::.:.: .:. : .:.:.. . ::::: : .
CCDS76 IDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTVCQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTG----
230 240 250 260 270 280
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 AIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILI
..::.:::::: ::..: . : .:::...:.::.:.: : . .. ::..::
CCDS76 -VVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLI
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