Result of FASTA (omim) for
pF1KB5584
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5584, 641 aa
1>>>pF1KB5584 641 - 641 aa - 641 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2956+/-0.000385; mu= 15.2446+/- 0.024
mean_var=110.8341+/-22.203, 0's: 0 Z-trim(115.4): 38 B-trim: 137 in 1/52
Lambda= 0.121825
statistics sampled from 25783 (25816) to 25783 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 8.490
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006690 (OMIM: 604345) mannosyl-oligosaccharide ( 641) 4370 779.4 0
XP_006710365 (OMIM: 604345) PREDICTED: mannosyl-ol ( 637) 4328 772.0 0
XP_011538838 (OMIM: 604345) PREDICTED: mannosyl-ol ( 598) 4068 726.3 7.4e-209
NP_005898 (OMIM: 604344) mannosyl-oligosaccharide ( 653) 2487 448.5 3.5e-125
XP_005267043 (OMIM: 604344) PREDICTED: mannosyl-ol ( 736) 2487 448.5 3.8e-125
XP_011534135 (OMIM: 604344) PREDICTED: mannosyl-ol ( 464) 2272 410.6 6.4e-114
XP_016855604 (OMIM: 604345) PREDICTED: mannosyl-ol ( 329) 2128 385.2 2e-106
NP_065112 (OMIM: 616772) mannosyl-oligosaccharide ( 630) 2123 384.5 6.2e-106
NP_001275939 (OMIM: 616772) mannosyl-oligosacchari ( 590) 1954 354.8 5.1e-97
XP_016857349 (OMIM: 616772) PREDICTED: mannosyl-ol ( 387) 1731 315.4 2.3e-85
NP_057303 (OMIM: 604346,614202) endoplasmic reticu ( 699) 1125 209.1 4.2e-53
XP_016869728 (OMIM: 604346,614202) PREDICTED: endo ( 632) 926 174.1 1.3e-42
XP_006717008 (OMIM: 604346,614202) PREDICTED: endo ( 731) 926 174.2 1.5e-42
XP_011534136 (OMIM: 604344) PREDICTED: mannosyl-ol ( 427) 843 159.4 2.4e-38
NP_060687 (OMIM: 610302) ER degradation-enhancing ( 578) 383 78.7 6.6e-14
XP_011508316 (OMIM: 610214) PREDICTED: ER degradat ( 854) 345 72.1 9.2e-12
XP_011508315 (OMIM: 610214) PREDICTED: ER degradat ( 855) 345 72.1 9.2e-12
NP_079467 (OMIM: 610214) ER degradation-enhancing ( 932) 345 72.1 9.8e-12
XP_005245556 (OMIM: 610214) PREDICTED: ER degradat ( 933) 345 72.1 9.8e-12
NP_001306889 (OMIM: 610214) ER degradation-enhanci ( 948) 345 72.1 9.9e-12
XP_016857350 (OMIM: 616772) PREDICTED: mannosyl-ol ( 325) 293 62.6 2.5e-09
XP_016857887 (OMIM: 610214) PREDICTED: ER degradat ( 777) 294 63.1 4.3e-09
XP_016857886 (OMIM: 610214) PREDICTED: ER degradat ( 855) 294 63.1 4.6e-09
XP_011508314 (OMIM: 610214) PREDICTED: ER degradat ( 856) 294 63.1 4.6e-09
NP_001138497 (OMIM: 610302) ER degradation-enhanci ( 541) 279 60.4 2e-08
XP_011532573 (OMIM: 607673) PREDICTED: ER degradat ( 497) 263 57.5 1.3e-07
XP_011532574 (OMIM: 607673) PREDICTED: ER degradat ( 497) 263 57.5 1.3e-07
NP_055489 (OMIM: 607673) ER degradation-enhancing ( 657) 263 57.6 1.6e-07
>>NP_006690 (OMIM: 604345) mannosyl-oligosaccharide 1,2- (641 aa)
initn: 4370 init1: 4370 opt: 4370 Z-score: 4157.1 bits: 779.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4370; 100.0% identity (100.0% similar) in 641 aa overlap (1-641:1-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKALE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 REKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 REKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 AFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 HIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRADKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRADKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 GHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 LWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB5 YLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGNPAVR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGNPAVR
610 620 630 640
>>XP_006710365 (OMIM: 604345) PREDICTED: mannosyl-oligos (637 aa)
initn: 4328 init1: 4328 opt: 4328 Z-score: 4117.3 bits: 772.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4328; 100.0% identity (100.0% similar) in 635 aa overlap (1-635:1-635)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKALE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 REKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 REKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 AFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 HIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRADKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRADKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 GHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 LWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB5 YLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGNPAVR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSES
610 620 630
>>XP_011538838 (OMIM: 604345) PREDICTED: mannosyl-oligos (598 aa)
initn: 4068 init1: 4068 opt: 4068 Z-score: 3870.7 bits: 726.3 E(85289): 7.4e-209
Smith-Waterman score: 4068; 100.0% identity (100.0% similar) in 597 aa overlap (1-597:1-597)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKALE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 REKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 AFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 HIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 KMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRADKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACFAGGMFALGADGSRADKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 GHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 LWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPTHDDVQQSFFLAETLN
550 560 570 580 590
610 620 630 640
pF1KB5 YLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGNPAVR
>>NP_005898 (OMIM: 604344) mannosyl-oligosaccharide 1,2- (653 aa)
initn: 2656 init1: 2108 opt: 2487 Z-score: 2368.4 bits: 448.5 E(85289): 3.5e-125
Smith-Waterman score: 2647; 63.8% identity (84.4% similar) in 614 aa overlap (29-627:34-641)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLP
:.:::.:::.:::..::::::::::.::::
NP_005 GGLLPLFSSPAGGVLGGGLGGGGGRKGSGPAALRLTEKFVLLLVFSAFITLCFGAIFFLP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB5 DSSKHKRFDL-GLEDVLIPHVD--AGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREE------EERLRN
:::: : .: : .: : ::. . . . :.::: : :..
NP_005 DSSKLLSGVLFHSSPALQPAADHKPGPGARAEDA----AEGRARRREEGAPGDPEAALED
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 ---KIRADHEKALEEAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKP---LPPVPIPN
.:: .::.::.:::: :.: :::. .: ::.::.:. ..... : :::: .
NP_005 NLARIRENHERALREAKETLQKLPEEIQRDILLEKKKVAQD-QLRDKAPFRGLPPVDFVP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LVGIRGGDPEDNDIREKREKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQM
.:... .: : ::::: ::::::::::.::. :.:: :::.::.. ::: ..::. .
NP_005 PIGVESREPADAAIREKRAKIKEMMKHAWNNYKGYAWGLNELKPISKGGHSSSLFGNIK-
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GATIVDALDTLYIMGLHDEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSG
:::::::::::.:: .. :: ... :.:.::::.::.:.:::::::::.::::.::::::
NP_005 GATIVDALDTLFIMEMKHEFEEAKSWVEENLDFNVNAEISVFEVNIRFVGGLLSAYYLSG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 EEIFKIKAVQLAEKLLPAFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEF
::::. :::.:. ::::::.::.:::::..:.:::.:::: :::.::::::::::::.::
NP_005 EEIFRKKAVELGVKLLPAFHTPSGIPWALLNMKSGIGRNWPWASGGSSILAEFGTLHLEF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 IHLSYLTGDLTYYKKVMHIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYE
.:::.:.:. . .:::.:: .:.:...:.::::::::: .:.:::.:.:::::::::::
NP_005 MHLSHLSGNPIFAEKVMNIRTVLNKLEKPQGLYPNYLNPSSGQWGQHHVSVGGLGDSFYE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 YLLKAWLMSDKTDHEARKMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACF
::::::::::::: ::.::: ::..::: :::.:: .:::.:.:::.: ::.:::::.::
NP_005 YLLKAWLMSDKTDLEAKKMYFDAVQAIETHLIRKSSSGLTYIAEWKGGLLEHKMGHLTCF
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 AGGMFALGADGSRADKAGHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQ
::::::::::.. : :::::::::::::::::.:: .:::::.:.:::.:::.:.::
NP_005 AGGMFALGADAAPEGMAQHYLELGAEIARTCHESYNRTFMKLGPEAFRFDGGVEAIATRQ
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 AEKYYILRPEVIETYWYLWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPT
::::::::::.::: :.::.::::.::.:.:::. :.:..::::::.::..::: .
NP_005 NEKYYILRPEVMETYMYMWRLTHDPKYRKWAWEAVEALENHCRVNGGYSGLRDVYLLHES
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 HDDVQQSFFLAETLKYLYLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGNPAVR
.::::::::::::::::::.:: ::::::.::.::.::: ::.:
NP_005 YDDVQQSFFLAETLKYLYLIFSDDDLLPLEHWIFNSEAHLLPILPKDKKEVEIREE
600 610 620 630 640 650
>>XP_005267043 (OMIM: 604344) PREDICTED: mannosyl-oligos (736 aa)
initn: 2656 init1: 2108 opt: 2487 Z-score: 2367.7 bits: 448.5 E(85289): 3.8e-125
Smith-Waterman score: 2647; 63.8% identity (84.4% similar) in 614 aa overlap (29-627:117-724)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLP
:.:::.:::.:::..::::::::::.::::
XP_005 GGLLPLFSSPAGGVLGGGLGGGGGRKGSGPAALRLTEKFVLLLVFSAFITLCFGAIFFLP
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100
pF1KB5 DSSKHKRFDL-GLEDVLIPHVD--AGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREE------EERLRN
:::: : .: : .: : ::. . . . :.::: : :..
XP_005 DSSKLLSGVLFHSSPALQPAADHKPGPGARAEDA----AEGRARRREEGAPGDPEAALED
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 ---KIRADHEKALEEAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKP---LPPVPIPN
.:: .::.::.:::: :.: :::. .: ::.::.:. ..... : :::: .
XP_005 NLARIRENHERALREAKETLQKLPEEIQRDILLEKKKVAQD-QLRDKAPFRGLPPVDFVP
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LVGIRGGDPEDNDIREKREKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQM
.:... .: : ::::: ::::::::::.::. :.:: :::.::.. ::: ..::. .
XP_005 PIGVESREPADAAIREKRAKIKEMMKHAWNNYKGYAWGLNELKPISKGGHSSSLFGNIK-
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GATIVDALDTLYIMGLHDEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSG
:::::::::::.:: .. :: ... :.:.::::.::.:.:::::::::.::::.::::::
XP_005 GATIVDALDTLFIMEMKHEFEEAKSWVEENLDFNVNAEISVFEVNIRFVGGLLSAYYLSG
330 340 350 360 370 380
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 EEIFKIKAVQLAEKLLPAFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEF
::::. :::.:. ::::::.::.:::::..:.:::.:::: :::.::::::::::::.::
XP_005 EEIFRKKAVELGVKLLPAFHTPSGIPWALLNMKSGIGRNWPWASGGSSILAEFGTLHLEF
390 400 410 420 430 440
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 IHLSYLTGDLTYYKKVMHIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGLGDSFYE
.:::.:.:. . .:::.:: .:.:...:.::::::::: .:.:::.:.:::::::::::
XP_005 MHLSHLSGNPIFAEKVMNIRTVLNKLEKPQGLYPNYLNPSSGQWGQHHVSVGGLGDSFYE
450 460 470 480 490 500
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 YLLKAWLMSDKTDHEARKMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKMGHLACF
::::::::::::: ::.::: ::..::: :::.:: .:::.:.:::.: ::.:::::.::
XP_005 YLLKAWLMSDKTDLEAKKMYFDAVQAIETHLIRKSSSGLTYIAEWKGGLLEHKMGHLTCF
510 520 530 540 550 560
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 AGGMFALGADGSRADKAGHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVEAVAVRQ
::::::::::.. : :::::::::::::::::.:: .:::::.:.:::.:::.:.::
XP_005 AGGMFALGADAAPEGMAQHYLELGAEIARTCHESYNRTFMKLGPEAFRFDGGVEAIATRQ
570 580 590 600 610 620
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 AEKYYILRPEVIETYWYLWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDVYSSTPT
::::::::::.::: :.::.::::.::.:.:::. :.:..::::::.::..::: .
XP_005 NEKYYILRPEVMETYMYMWRLTHDPKYRKWAWEAVEALENHCRVNGGYSGLRDVYLLHES
630 640 650 660 670 680
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 HDDVQQSFFLAETLKYLYLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGNPAVR
.::::::::::::::::::.:: ::::::.::.::.::: ::.:
XP_005 YDDVQQSFFLAETLKYLYLIFSDDDLLPLEHWIFNSEAHLLPILPKDKKEVEIREE
690 700 710 720 730
>>XP_011534135 (OMIM: 604344) PREDICTED: mannosyl-oligos (464 aa)
initn: 2304 init1: 2108 opt: 2272 Z-score: 2166.2 bits: 410.6 E(85289): 6.4e-114
Smith-Waterman score: 2272; 70.8% identity (91.4% similar) in 442 aa overlap (186-627:12-452)
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 LPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREKREKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSP
.::::::.::. :.:: :::.::.. :::
XP_011 MYGEMEVCPFHQMMKHAWNNYKGYAWGLNELKPISKGGHSS
10 20 30 40
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 NIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLHDEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGL
..::. . :::::::::::.:: .. :: ... :.:.::::.::.:.:::::::::.:::
XP_011 SLFGNIK-GATIVDALDTLFIMEMKHEFEEAKSWVEENLDFNVNAEISVFEVNIRFVGGL
50 60 70 80 90 100
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 LAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLPAFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAE
:.::::::::::. :::.:. ::::::.::.:::::..:.:::.:::: :::.:::::::
XP_011 LSAYYLSGEEIFRKKAVELGVKLLPAFHTPSGIPWALLNMKSGIGRNWPWASGGSSILAE
110 120 130 140 150 160
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 FGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVMHIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVG
:::::.::.:::.:.:. . .:::.:: .:.:...:.::::::::: .:.:::.:.:::
XP_011 FGTLHLEFMHLSHLSGNPIFAEKVMNIRTVLNKLEKPQGLYPNYLNPSSGQWGQHHVSVG
170 180 190 200 210 220
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 GLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEARKMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEK
::::::::::::::::::::: ::.::: ::..::: :::.:: .:::.:.:::.: ::.
XP_011 GLGDSFYEYLLKAWLMSDKTDLEAKKMYFDAVQAIETHLIRKSSSGLTYIAEWKGGLLEH
230 240 250 260 270 280
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 KMGHLACFAGGMFALGADGSRADKAGHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGA
:::::.::::::::::::.. : :::::::::::::::::.:: .:::::.:.:::.
XP_011 KMGHLTCFAGGMFALGADAAPEGMAQHYLELGAEIARTCHESYNRTFMKLGPEAFRFDGG
290 300 310 320 330 340
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 VEAVAVRQAEKYYILRPEVIETYWYLWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVK
:::.:.:: ::::::::::.::: :.::.::::.::.:.:::. :.:..::::::.::..
XP_011 VEAIATRQNEKYYILRPEVMETYMYMWRLTHDPKYRKWAWEAVEALENHCRVNGGYSGLR
350 360 370 380 390 400
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 DVYSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYLYLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLS
::: ..::::::::::::::::::.:: ::::::.::.::.::: ::.:
XP_011 DVYLLHESYDDVQQSFFLAETLKYLYLIFSDDDLLPLEHWIFNSEAHLLPILPKDKKEVE
410 420 430 440 450 460
640
pF1KB5 GNPAVR
XP_011 IREE
>>XP_016855604 (OMIM: 604345) PREDICTED: mannosyl-oligos (329 aa)
initn: 2124 init1: 2124 opt: 2128 Z-score: 2031.5 bits: 385.2 E(85289): 2e-106
Smith-Waterman score: 2128; 98.1% identity (98.5% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSFPHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKALE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAKEKLRKSREEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPPVPIPNLVGIRGGDPEDNDIREK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 REKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 REKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIFGSSQMGATIVDALDTLYIMGLH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 DEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 AFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSSILAEFGTLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVM
:::::::::::::::: . :
XP_016 AFNTPTGIPWAMVNLKRSYICRWPGRQFL
310 320
>>NP_065112 (OMIM: 616772) mannosyl-oligosaccharide 1,2- (630 aa)
initn: 2165 init1: 1403 opt: 2123 Z-score: 2022.9 bits: 384.5 E(85289): 6.2e-106
Smith-Waterman score: 2127; 52.4% identity (77.9% similar) in 630 aa overlap (22-628:7-619)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSF-PHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPD
:.: : ::: .::..::.::...::::::.:.::
NP_065 MLMRKVPGFVPASPWGLRLPQKFLFLLFLSGLVTLCFGALFLLPH
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SSKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKAL
::. ::. : :.. ..::. .. : .:.: : : .
NP_065 SSRLKRL------FLAPRT------QQPGLEVVAEIAGHAPAREQEPPPNPAPAAPAPGE
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KB5 EE----AKEKLRKSR-EEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPP-VPI------------
.. :. . ::. .. : :. ... .: ..: ::.
NP_065 DDPSSWASPRRRKGGLRRTRPTGPREEATAARGNSIPASRPGDEGVPFRFDFNAFRSRLR
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KB5 -PNLVGIRGGDPED--NDIREKREKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIF
: : : :. . .. ...: .::::::::. ::..:. :. :.:::::... :. :.:
NP_065 HPVL-GTRADESQEPQSQVRAQREKIKEMMQFAWQSYKRYAMGKNELRPLTKDGYEGNMF
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 GSSQMGATIVDALDTLYIMGLHDEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAA
:. . :::..:.:::::.: :..:: ... :. ... ..:..:.:.::::::.:::::.:
NP_065 GGLS-GATVIDSLDTLYLMELKEEFQEAKAWVGESFHLNVSGEASLFEVNIRYIGGLLSA
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 YYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLPAFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSS-ILAEFG
.::.:::.:.:::..:.:::::::::::::: ..:..::: :::::.:::: ::::::
NP_065 FYLTGEEVFRIKAIRLGEKLLPAFNTPTGIPKGVVSFKSG---NWGWATAGSSSILAEFG
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 TLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVMHIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGL
.::.::.::. :.:. .. .:: .:::.:.:...: :::::.:.: .: : :.:.:::::
NP_065 SLHLEFLHLTELSGNQVFAEKVRNIRKVLRKIEKPFGLYPNFLSPVSGNWVQHHVSVGGL
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 GDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEARKMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKM
::::::::.:.:::: ::: ::..:: .:.:::: .:.. : ::::.:.::..: :..::
NP_065 GDSFYEYLIKSWLMSGKTDMEAKNMYYEALEAIETYLLNVSPGGLTYIAEWRGGILDHKM
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 GHLACFAGGMFALGADGSRADKAGHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVE
::::::.:::.::::. .. .: .:: ::.:.:..:::::: :. :::::.: :... :
NP_065 GHLACFSGGMIALGAEDAKEEKRAHYRELAAQITKTCHESYARSDTKLGPEAFWFNSGRE
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 AVAVRQAEKYYILRPEVIETYWYLWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDV
:::.. .:.::::::::.:.: :::: ::.: ::.::::..::.:::::...::::..::
NP_065 AVATQLSESYYILRPEVVESYMYLWRQTHNPIYREWGWEVVLALEKYCRTEAGFSGIQDV
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 YSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYLYLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGN
:::::.::. :::::::::::::::::: :::: :. :::::::::::: :
NP_065 YSSTPNHDNKQQSFFLAETLKYLYLLFSEDDLLSLEDWVFNTEAHPLPVNHSDSSGRAWG
570 580 590 600 610 620
640
pF1KB5 PAVR
NP_065 RH
630
>>NP_001275939 (OMIM: 616772) mannosyl-oligosaccharide 1 (590 aa)
initn: 1936 init1: 1235 opt: 1954 Z-score: 1862.7 bits: 354.8 E(85289): 5.1e-97
Smith-Waterman score: 1958; 50.7% identity (77.7% similar) in 600 aa overlap (22-598:7-589)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MTTPALLPLSGRRIPPLNLGPPSF-PHHRATLRLSEKFILLLILSAFITLCFGAFFFLPD
:.: : ::: .::..::.::...::::::.:.::
NP_001 MLMRKVPGFVPASPWGLRLPQKFLFLLFLSGLVTLCFGALFLLPH
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 SSKHKRFDLGLEDVLIPHVDAGKGAKNPGVFLIHGPDEHRHREEEERLRNKIRADHEKAL
::. ::. : :.. ..::. .. : .:.: : : .
NP_001 SSRLKRL------FLAPRT------QQPGLEVVAEIAGHAPAREQEPPPNPAPAAPAPGE
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KB5 EE----AKEKLRKSR-EEIRAEIQTEKNKVVQEMKIKENKPLPP-VPI------------
.. :. . ::. .. : :. ... .: ..: ::.
NP_001 DDPSSWASPRRRKGGLRRTRPTGPREEATAARGNSIPASRPGDEGVPFRFDFNAFRSRLR
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210
pF1KB5 -PNLVGIRGGDPED--NDIREKREKIKEMMKHAWDNYRTYGWGHNELRPIARKGHSPNIF
: ..: :. . .. ...: .::::::::. ::..:. :. :.:::::... :. :.:
NP_001 HP-VLGTRADESQEPQSQVRAQREKIKEMMQFAWQSYKRYAMGKNELRPLTKDGYEGNMF
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 GSSQMGATIVDALDTLYIMGLHDEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAA
:. . :::..:.:::::.: :..:: ... :. ... ..:..:.:.::::::.:::::.:
NP_001 GGLS-GATVIDSLDTLYLMELKEEFQEAKAWVGESFHLNVSGEASLFEVNIRYIGGLLSA
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 YYLSGEEIFKIKAVQLAEKLLPAFNTPTGIPWAMVNLKSGVGRNWGWASAGSS-ILAEFG
.::.:::.:.:::..:.:::::::::::::: ..:..::: :::::.:::: ::::::
NP_001 FYLTGEEVFRIKAIRLGEKLLPAFNTPTGIPKGVVSFKSG---NWGWATAGSSSILAEFG
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 TLHMEFIHLSYLTGDLTYYKKVMHIRKLLQKMDRPNGLYPNYLNPRTGRWGQYHTSVGGL
.::.::.::. :.:. .. .:: .:::.:.:...: :::::.:.: .: : :.:.:::::
NP_001 SLHLEFLHLTELSGNQVFAEKVRNIRKVLRKIEKPFGLYPNFLSPVSGNWVQHHVSVGGL
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 GDSFYEYLLKAWLMSDKTDHEARKMYDDAIEAIEKHLIKKSRGGLTFIGEWKNGHLEKKM
::::::::.:.:::: ::: ::..:: .:.:::: .:.. : ::::.:.::..: :..::
NP_001 GDSFYEYLIKSWLMSGKTDMEAKNMYYEALEAIETYLLNVSPGGLTYIAEWRGGILDHKM
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 GHLACFAGGMFALGADGSRADKAGHYLELGAEIARTCHESYDRTALKLGPESFKFDGAVE
::::::.:::.::::. .. .: .:: ::.:.:..:::::: :. :::::.: :... :
NP_001 GHLACFSGGMIALGAEDAKEEKRAHYRELAAQITKTCHESYARSDTKLGPEAFWFNSGRE
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 AVAVRQAEKYYILRPEVIETYWYLWRFTHDPRYRQWGWEAALAIEKYCRVNGGFSGVKDV
:::.. .:.::::::::.:.: :::: ::.: ::.::::..::.:::::...::::..::
NP_001 AVATQLSESYYILRPEVVESYMYLWRQTHNPIYREWGWEVVLALEKYCRTEAGFSGIQDV
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 YSSTPTHDDVQQSFFLAETLKYLYLLFSGDDLLPLDHWVFNTEAHPLPVLHLANTTLSGN
:::::.::. :::::::::::
NP_001 YSSTPNHDNKQQSFFLAETLKI
570 580 590
>>XP_016857349 (OMIM: 616772) PREDICTED: mannosyl-oligos (387 aa)
initn: 1741 init1: 1403 opt: 1731 Z-score: 1653.4 bits: 315.4 E(85289): 2.3e-85
Smith-Waterman score: 1731; 66.0% identity (89.8% similar) in 371 aa overlap (259-628:9-376)
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 DALDTLYIMGLHDEFLDGQRWIEDNLDFSVNSEVSVFEVNIRFIGGLLAAYYLSGEEIFK
..:.:.::::::.:::::.:.::.:::.:.
XP_016 MATRVTCSSGEASLFEVNIRYIGGLLSAFYLTGEEVFR
10 20 30
290 300 310 320 330 340
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