Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5567
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5567, 672 aa
1>>>pF1KB5567 672 - 672 aa - 672 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0044+/-0.000947; mu= 17.2583+/- 0.057
mean_var=91.7267+/-17.973, 0's: 0 Z-trim(106.9): 30 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.133914
statistics sampled from 9246 (9275) to 9246 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 3.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6851.1 STRBP gene_id:55342|Hs108|chr9 ( 672) 4425 865.4 0
CCDS55337.1 STRBP gene_id:55342|Hs108|chr9 ( 658) 4331 847.3 0
CCDS45966.1 ILF3 gene_id:3609|Hs108|chr19 ( 690) 2408 475.8 9.1e-134
CCDS12247.1 ILF3 gene_id:3609|Hs108|chr19 ( 702) 2408 475.8 9.2e-134
CCDS12246.1 ILF3 gene_id:3609|Hs108|chr19 ( 894) 2408 475.8 1.1e-133
CCDS45967.1 ILF3 gene_id:3609|Hs108|chr19 ( 706) 1979 392.9 8.2e-109
CCDS45965.1 ILF3 gene_id:3609|Hs108|chr19 ( 898) 1979 393.0 1e-108
CCDS34139.1 ZFR gene_id:51663|Hs108|chr5 (1074) 1066 216.6 1.4e-55
CCDS45921.1 ZFR2 gene_id:23217|Hs108|chr19 ( 939) 945 193.2 1.4e-48
CCDS72919.1 ILF2 gene_id:3608|Hs108|chr1 ( 352) 330 74.1 3.8e-13
CCDS1050.1 ILF2 gene_id:3608|Hs108|chr1 ( 390) 330 74.1 4.1e-13
CCDS33590.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21 ( 701) 325 73.3 1.3e-12
CCDS42970.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21 ( 714) 325 73.3 1.3e-12
CCDS33589.1 ADARB1 gene_id:104|Hs108|chr21 ( 741) 325 73.4 1.3e-12
>>CCDS6851.1 STRBP gene_id:55342|Hs108|chr9 (672 aa)
initn: 4425 init1: 4425 opt: 4425 Z-score: 4621.2 bits: 865.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4425; 100.0% identity (100.0% similar) in 672 aa overlap (1-672:1-672)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRSIRSFANDDRHVMVKHSTIYPSPEELEAVQNMVSTVECALKHVSDWLDETNKGTKTEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MRSIRSFANDDRHVMVKHSTIYPSPEELEAVQNMVSTVECALKHVSDWLDETNKGTKTEG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ETEVKKDEAGENYSKDQGGRTLCGVMRIGLVAKGLLIKDDMDLELVLMCKDKPTETLLNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ETEVKKDEAGENYSKDQGGRTLCGVMRIGLVAKGLLIKDDMDLELVLMCKDKPTETLLNT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VKDNLPIQIQKLTEEKYQVEQCVNEASIIIRNTKEPTLTLKVILTSPLIRDELEKKDGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 VKDNLPIQIQKLTEEKYQVEQCVNEASIIIRNTKEPTLTLKVILTSPLIRDELEKKDGEN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VSMKDPPDLLDRQKCLNALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVLRILRDLCNRVPTWAPLKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 VSMKDPPDLLDRQKCLNALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVLRILRDLCNRVPTWAPLKG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 WPLELICEKSIGTCNRPLGAGEALRRVMECLASGILLPGGPGLHDPCERDPTDALSYMTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 WPLELICEKSIGTCNRPLGAGEALRRVMECLASGILLPGGPGLHDPCERDPTDALSYMTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QQKEDITHSAQHALRLSAFGQIYKVLEMDPLPSSKPFQKYSWSVTDKEGAGSSALKRPFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QQKEDITHSAQHALRLSAFGQIYKVLEMDPLPSSKPFQKYSWSVTDKEGAGSSALKRPFE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DGLGDDKDPNKKMKRNLRKILDSKAIDLMNALMRLNQIRPGLQYKLLSQSGPVHAPVFTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 DGLGDDKDPNKKMKRNLRKILDSKAIDLMNALMRLNQIRPGLQYKLLSQSGPVHAPVFTM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SVDVDGTTYEASGPSKKTAKLHVAVKVLQAMGYPTGFDADIECMSSDEKSDNESKNETVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SVDVDGTTYEASGPSKKTAKLHVAVKVLQAMGYPTGFDADIECMSSDEKSDNESKNETVS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SNSSNNTGNSTTETSSTLEVRTQGPILTASGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SNSSNNTGNSTTETSSTLEVRTQGPILTASGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 FVMEVEVDGQKFRGAGPNKKVAKASAALAALEKLFSGPNAANNKKKKIIPQAKGVVNTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 FVMEVEVDGQKFRGAGPNKKVAKASAALAALEKLFSGPNAANNKKKKIIPQAKGVVNTAV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 SAAVQAVRGRGRGTLTRGAFVGATAAPGYIAPGYGTPYGYSTAAPAYGLPKRMVLLPVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SAAVQAVRGRGRGTLTRGAFVGATAAPGYIAPGYGTPYGYSTAAPAYGLPKRMVLLPVMK
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB5 FPTYPVPHYSFF
::::::::::::
CCDS68 FPTYPVPHYSFF
670
>>CCDS55337.1 STRBP gene_id:55342|Hs108|chr9 (658 aa)
initn: 4331 init1: 4331 opt: 4331 Z-score: 4523.2 bits: 847.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4331; 100.0% identity (100.0% similar) in 658 aa overlap (15-672:1-658)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRSIRSFANDDRHVMVKHSTIYPSPEELEAVQNMVSTVECALKHVSDWLDETNKGTKTEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MVKHSTIYPSPEELEAVQNMVSTVECALKHVSDWLDETNKGTKTEG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 ETEVKKDEAGENYSKDQGGRTLCGVMRIGLVAKGLLIKDDMDLELVLMCKDKPTETLLNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ETEVKKDEAGENYSKDQGGRTLCGVMRIGLVAKGLLIKDDMDLELVLMCKDKPTETLLNT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VKDNLPIQIQKLTEEKYQVEQCVNEASIIIRNTKEPTLTLKVILTSPLIRDELEKKDGEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VKDNLPIQIQKLTEEKYQVEQCVNEASIIIRNTKEPTLTLKVILTSPLIRDELEKKDGEN
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VSMKDPPDLLDRQKCLNALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVLRILRDLCNRVPTWAPLKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VSMKDPPDLLDRQKCLNALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVLRILRDLCNRVPTWAPLKG
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 WPLELICEKSIGTCNRPLGAGEALRRVMECLASGILLPGGPGLHDPCERDPTDALSYMTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 WPLELICEKSIGTCNRPLGAGEALRRVMECLASGILLPGGPGLHDPCERDPTDALSYMTI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 QQKEDITHSAQHALRLSAFGQIYKVLEMDPLPSSKPFQKYSWSVTDKEGAGSSALKRPFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QQKEDITHSAQHALRLSAFGQIYKVLEMDPLPSSKPFQKYSWSVTDKEGAGSSALKRPFE
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DGLGDDKDPNKKMKRNLRKILDSKAIDLMNALMRLNQIRPGLQYKLLSQSGPVHAPVFTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DGLGDDKDPNKKMKRNLRKILDSKAIDLMNALMRLNQIRPGLQYKLLSQSGPVHAPVFTM
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 SVDVDGTTYEASGPSKKTAKLHVAVKVLQAMGYPTGFDADIECMSSDEKSDNESKNETVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SVDVDGTTYEASGPSKKTAKLHVAVKVLQAMGYPTGFDADIECMSSDEKSDNESKNETVS
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 SNSSNNTGNSTTETSSTLEVRTQGPILTASGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SNSSNNTGNSTTETSSTLEVRTQGPILTASGKNPVMELNEKRRGLKYELISETGGSHDKR
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 FVMEVEVDGQKFRGAGPNKKVAKASAALAALEKLFSGPNAANNKKKKIIPQAKGVVNTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FVMEVEVDGQKFRGAGPNKKVAKASAALAALEKLFSGPNAANNKKKKIIPQAKGVVNTAV
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 SAAVQAVRGRGRGTLTRGAFVGATAAPGYIAPGYGTPYGYSTAAPAYGLPKRMVLLPVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SAAVQAVRGRGRGTLTRGAFVGATAAPGYIAPGYGTPYGYSTAAPAYGLPKRMVLLPVMK
590 600 610 620 630 640
670
pF1KB5 FPTYPVPHYSFF
::::::::::::
CCDS55 FPTYPVPHYSFF
650
>>CCDS45966.1 ILF3 gene_id:3609|Hs108|chr19 (690 aa)
initn: 2444 init1: 892 opt: 2408 Z-score: 2515.0 bits: 475.8 E(32554): 9.1e-134
Smith-Waterman score: 2448; 57.7% identity (76.8% similar) in 690 aa overlap (1-648:1-685)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRSIRSFANDDRHVMVKHSTIYPSPEELEAVQNMVSTVECALKHVSDWLDETNKGTKTEG
:: .: :.:::::::.:::..::. ::::::::::: .: ::: ::::.:: .::.. ..
CCDS45 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHTERALKAVSDWIDEQEKGSSEQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 ETEVKKDEAGENYSKDQGG--------RTLCGVMRIGLVAKGLLIKDDMDLELVLMCKDK
:.. . : :. ::. .: ::: ::::.::::::::.: :.::::::.::.:
CCDS45 ESD-NMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLVAKGLLLKGDLDLELVLLCKEK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PTETLLNTVKDNLPIQIQKLTEEKYQVEQCVNEASIIIRNTKEPTLTLKVILTSPLIRDE
:: .::. : ::: ::. .::.::.. : :..:.:.:.::::: :.: . ::::..:.:
CCDS45 PTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIKNTKEPPLSLTIHLTSPVVREE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LEKK-DGENVSMKDPPDLLDRQKCLNALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVLRILRDLCNR
.:: ::..:..::::.::::::: ::::::::::::::::::::::::.:.:::::.:
CCDS45 MEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVIRVLRDLCTR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VPTWAPLKGWPLELICEKSIGTCNRPLGAGEALRRVMECLASGILLPGGPGLHDPCERDP
::::.::.::::::.::::::: :::.:::::::::.:::::::..: : :..::::..
CCDS45 VPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLECLASGIVMPDGSGIYDPCEKEA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB5 TDALSYMTIQQKEDITHSAQHALRLSAFGQIYKVLEMDPLPSSKPFQK-------YSWSV
:::.... ::.::::.::::::::.::::..::: ::::::. : . :. ..
CCDS45 TDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDPLPSKMPKKPKNENPVDYTVQI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 TDKEGAGSSALKRPFEDGLGDDKDPNKKMKRNLRKILDSKAIDLMNALMRLNQIRPGLQY
. . . .:::.:. :..:.:.:: :. .: .. . :::::::::..:::::
CCDS45 PPSTTYAITPMKRPMEED-GEEKSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQY
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 KLLSQSGPVHAPVFTMSVDVDGTTYEASGPSKKTAKLHVAVKVLQAMGYPTGFDADIECM
::.::.::::::.:::::.:::...:::::::::::::::::::: :: ::: ..
CCDS45 KLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFEASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 SSDEKSDNESKNETVSSNSSNNTGNSTTETSSTLEVRTQGPILTASGKNPVMELNEKRRG
. : ..:.: .:. .. .. . . . . :::::: ::::::::::::::
CCDS45 GEDSAEETEAKPAVVAPAPVVEAVSTPSAAFPSDATAEQGPILTKHGKNPVMELNEKRRG
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 LKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFRGAGPNKKVAKASAALAALEKLFSG-PNA--A
::::::::::::::::::::::::::::.::: ::::::: :::::::::: : : :
CCDS45 LKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKLFPDTPLALDA
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620
pF1KB5 NNKKKKIIP-------QAK---------GVVNTAVSAAVQAVRGRGRGTLTRG-----AF
:.::. .: :: : ... : .:::::: :: .:
CCDS45 NKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGGPMHNEVPPP-PNLRGRGRGGSIRGRGRGRGF
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670
pF1KB5 VGATAAPGYI--APGYGTPYGYSTAAPAYGLPKRMVLLPVMKFPTYPVPHYSFF
::. . ::. . :::. :::. . . :
CCDS45 GGANHG-GYMNAGAGYGS-YGYGGNSATAGYTGFV
660 670 680 690
>>CCDS12247.1 ILF3 gene_id:3609|Hs108|chr19 (702 aa)
initn: 2444 init1: 892 opt: 2408 Z-score: 2514.9 bits: 475.8 E(32554): 9.2e-134
Smith-Waterman score: 2448; 57.7% identity (76.8% similar) in 690 aa overlap (1-648:1-685)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRSIRSFANDDRHVMVKHSTIYPSPEELEAVQNMVSTVECALKHVSDWLDETNKGTKTEG
:: .: :.:::::::.:::..::. ::::::::::: .: ::: ::::.:: .::.. ..
CCDS12 MRPMRIFVNDDRHVMAKHSSVYPTQEELEAVQNMVSHTERALKAVSDWIDEQEKGSSEQA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB5 ETEVKKDEAGENYSKDQGG--------RTLCGVMRIGLVAKGLLIKDDMDLELVLMCKDK
:.. . : :. ::. .: ::: ::::.::::::::.: :.::::::.::.:
CCDS12 ESD-NMDVPPEDDSKEGAGEQKTEHMTRTLRGVMRVGLVAKGLLLKGDLDLELVLLCKEK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PTETLLNTVKDNLPIQIQKLTEEKYQVEQCVNEASIIIRNTKEPTLTLKVILTSPLIRDE
:: .::. : ::: ::. .::.::.. : :..:.:.:.::::: :.: . ::::..:.:
CCDS12 PTTALLDKVADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIKNTKEPPLSLTIHLTSPVVREE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LEKK-DGENVSMKDPPDLLDRQKCLNALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVLRILRDLCNR
.:: ::..:..::::.::::::: ::::::::::::::::::::::::.:.:::::.:
CCDS12 MEKVLAGETLSVNDPPDVLDRQKCLAALASLRHAKWFQARANGLKSCVIVIRVLRDLCTR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 VPTWAPLKGWPLELICEKSIGTCNRPLGAGEALRRVMECLASGILLPGGPGLHDPCERDP
::::.::.::::::.::::::: :::.:::::::::.:::::::..: : :..::::..
CCDS12 VPTWGPLRGWPLELLCEKSIGTANRPMGAGEALRRVLECLASGIVMPDGSGIYDPCEKEA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB5 TDALSYMTIQQKEDITHSAQHALRLSAFGQIYKVLEMDPLPSSKPFQK-------YSWSV
:::.... ::.::::.::::::::.::::..::: ::::::. : . :. ..
CCDS12 TDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDPLPSKMPKKPKNENPVDYTVQI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 TDKEGAGSSALKRPFEDGLGDDKDPNKKMKRNLRKILDSKAIDLMNALMRLNQIRPGLQY
. . . .:::.:. :..:.:.:: :. .: .. . :::::::::..:::::
CCDS12 PPSTTYAITPMKRPMEED-GEEKSPSKKKKKIQKKEEKAEPPQAMNALMRLNQLKPGLQY
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 KLLSQSGPVHAPVFTMSVDVDGTTYEASGPSKKTAKLHVAVKVLQAMGYPTGFDADIECM
::.::.::::::.:::::.:::...:::::::::::::::::::: :: ::: ..
CCDS12 KLVSQTGPVHAPIFTMSVEVDGNSFEASGPSKKTAKLHVAVKVLQDMGLPTGAEGRDSSK
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 SSDEKSDNESKNETVSSNSSNNTGNSTTETSSTLEVRTQGPILTASGKNPVMELNEKRRG
. : ..:.: .:. .. .. . . . . :::::: ::::::::::::::
CCDS12 GEDSAEETEAKPAVVAPAPVVEAVSTPSAAFPSDATAEQGPILTKHGKNPVMELNEKRRG
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 LKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFRGAGPNKKVAKASAALAALEKLFSG-PNA--A
::::::::::::::::::::::::::::.::: ::::::: :::::::::: : : :
CCDS12 LKYELISETGGSHDKRFVMEVEVDGQKFQGAGSNKKVAKAYAALAALEKLFPDTPLALDA
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620
pF1KB5 NNKKKKIIP-------QAK---------GVVNTAVSAAVQAVRGRGRGTLTRG-----AF
:.::. .: :: : ... : .:::::: :: .:
CCDS12 NKKKRAPVPVRGGPKFAAKPHNPGFGMGGPMHNEVPPP-PNLRGRGRGGSIRGRGRGRGF
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670
pF1KB5 VGATAAPGYI--APGYGTPYGYSTAAPAYGLPKRMVLLPVMKFPTYPVPHYSFF
::. . ::. . :::. :::. . . :
CCDS12 GGANHG-GYMNAGAGYGS-YGYGGNSATAGYSDFFTDCYGYHDFGSS
660 670 680 690 700
>>CCDS12246.1 ILF3 gene_id:3609|Hs108|chr19 (894 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRSIRSFANDDRHVMVKHSTIYPSPEELEAVQNMVSTVECALKHVSDWLDETNKGTKTEG
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CCDS45 TDAIGHLDRQQREDITQSAQHALRLAAFGQLHKVLGMDPLPSKMPKKPKNENPVDYTVQI
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10 20 30
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CCDS34 GYPHGPPGPLGLLGVRPGMPPQPQGPAPLRRPDSSDDRYVMTKHATIYPTEEELQAVQKI
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CCDS34 VSITERALKLVSDSLSEHEKNKNKEGDD---KKEGG----KD---RALKGVLRVGVLAKG
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CCDS34 LLLRGDRNVNLVLLCSEKPSKTLLSRIAENLPKQLAVISPEKYDIKCAVSEAAIILNSCV
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CCDS34 EPKMQVTITLTSPIIREE-NMREGDVTSGMVKDPPDVLDRQKCLDALAALRHAKWFQARA
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CCDS34 SGIILKGSPGLLDPCEKDPFDTLATMTDQQREDITSSAQFALRLLAFRQIHKVLGMDPLP
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CCDS34 QMS--QRFNIHNNRKRRRDSDGVDGFEAEGKKDKKDYDNF
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pF1KB5 MRLNQIRPGLQYKLLSQSGPVHAPVFTMSVDVDGTTYEASGPSKKTAKLHVAVKVLQAMG
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CCDS45 VPPHAPPDWAQPLLMGRPESPASAPLQPGRRPASSDDRHVMCKHATIYPTEQELLAVQRA
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pF1KB5 VSTVECALKHVSDWLDETNKGTKTEGETEVKKDEAGENYSK-DQGGRTLCGVMRIGLVAK
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CCDS45 VSHAERALKLVSDTLAEEDRG---------RREEEGDKRSSVAPQTRVLKGVMRVGILAK
620 630 640 650 660
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pF1KB5 GLLIKDDMDLELVLMCKDKPTETLLNTVKDNLPIQIQKLTEEKYQVEQCVNEASIIIRNT
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CCDS45 GLLLRGDRNVRLALLCSEKPTHSLLRRIAQQLPRQLQMVTEDEYEVSSD-PEANIVISSC
670 680 690 700 710 720
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pF1KB5 KEPTLTLKVILTSPLIRDELEKKDGENVSMKDPPDLLDRQKCLNALASLRHAKWFQARAN
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CCDS45 EEPRMQVTISVTSPLMREDPSTDPGVEEPQADAGDVLSPKKCLESLAALRHARWFQARAS
730 740 750 760 770 780
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pF1KB5 GLKSCVIVLRILRDLCNRVPTWAPLKGWPLELICEKSIGTCNRPLGAGEALRRVMECLAS
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CCDS45 GLQPCVIVIRVLRDLCRRVPTWGALPAWAMELLVEKAVSSAAGPLGPGDAVRRVLECVAT
790 800 810 820 830 840
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CCDS45 GTLLTDGPGLQDPCERDQTDALEPMTLQEREDVTASAQHALRMLAFRQTHKVLGMDLLPP
850 860 870 880 890 900
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. :.: . . . .:::: . :: . : :
CCDS45 RHRLGARFRKRQRGPGEGEEGAGEK--KRGRRGGEGLV
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