Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5541
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5541, 977 aa
1>>>pF1KB5541 977 - 977 aa - 977 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8897+/-0.00114; mu= -0.2922+/- 0.066
mean_var=432.0590+/-99.242, 0's: 0 Z-trim(110.7): 255 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.061702
statistics sampled from 11577 (11841) to 11577 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.364), width: 16
Scan time: 4.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45762.1 ERN1 gene_id:2081|Hs108|chr17 ( 977) 6553 599.5 1.1e-170
CCDS76845.1 ERN2 gene_id:10595|Hs108|chr16 ( 874) 1823 178.3 5.7e-44
CCDS32407.2 ERN2 gene_id:10595|Hs108|chr16 ( 926) 1816 177.7 9.2e-44
>>CCDS45762.1 ERN1 gene_id:2081|Hs108|chr17 (977 aa)
initn: 6553 init1: 6553 opt: 6553 Z-score: 3177.9 bits: 599.5 E(32554): 1.1e-170
Smith-Waterman score: 6553; 100.0% identity (100.0% similar) in 977 aa overlap (1-977:1-977)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPARRLLLLLTLLLPGLGIFGSTSTVTLPETLLFVSTLDGSLHAVSKRTGSIKWTLKEDP
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CCDS45 MPARRLLLLLTLLLPGLGIFGSTSTVTLPETLLFVSTLDGSLHAVSKRTGSIKWTLKEDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VLQVPTHVEEPAFLPDPNDGSLYTLGSKNNEGLTKLPFTIPELVQASPCRSSDGILYMGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VLQVPTHVEEPAFLPDPNDGSLYTLGSKNNEGLTKLPFTIPELVQASPCRSSDGILYMGK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 KQDIWYVIDLLTGEKQQTLSSAFADSLCPSTSLLYLGRTEYTITMYDTKTRELRWNATYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KQDIWYVIDLLTGEKQQTLSSAFADSLCPSTSLLYLGRTEYTITMYDTKTRELRWNATYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DYAASLPEDDVDYKMSHFVSNGDGLVVTVDSESGDVLWIQNYASPVVAFYVWQREGLRKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DYAASLPEDDVDYKMSHFVSNGDGLVVTVDSESGDVLWIQNYASPVVAFYVWQREGLRKV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 MHINVAVETLRYLTFMSGEVGRITKWKYPFPKETEAKSKLTPTLYVGKYSTSLYASPSMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MHINVAVETLRYLTFMSGEVGRITKWKYPFPKETEAKSKLTPTLYVGKYSTSLYASPSMV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 HEGVAVVPRGSTLPLLEGPQTDGVTIGDKGECVITPSTDVKFDPGLKSKNKLNYLRNYWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 HEGVAVVPRGSTLPLLEGPQTDGVTIGDKGECVITPSTDVKFDPGLKSKNKLNYLRNYWL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LIGHHETPLSASTKMLERFPNNLPKHRENVIPADSEKKSFEEVINLVDQTSENAPTTVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LIGHHETPLSASTKMLERFPNNLPKHRENVIPADSEKKSFEEVINLVDQTSENAPTTVSR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 DVEEKPAHAPARPEAPVDSMLKDMATIILSTFLLIGWVAFIITYPLSMHQQQQLQHQQFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DVEEKPAHAPARPEAPVDSMLKDMATIILSTFLLIGWVAFIITYPLSMHQQQQLQHQQFQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 KELEKIQLLQQQQQQLPFHPPGDTAQDGELLDTSGPYSESSGTSSPSTSPRASNHSLCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KELEKIQLLQQQQQQLPFHPPGDTAQDGELLDTSGPYSESSGTSSPSTSPRASNHSLCSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 SSASKAGSSPSLEQDDGDEETSVVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIVYRGMFDNRDVAVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSASKAGSSPSLEQDDGDEETSVVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIVYRGMFDNRDVAVKR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 ILPECFSFADREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCAATLQEYVEQKDFAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ILPECFSFADREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCAATLQEYVEQKDFAH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LGLEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIKAMISDFGLCKKLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LGLEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIKAMISDFGLCKKLAV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 GRHSFSRRSGVPGTEGWIAPEMLSEDCKENPTYTVDIFSAGCVFYYVISEGSHPFGKSLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GRHSFSRRSGVPGTEGWIAPEMLSEDCKENPTYTVDIFSAGCVFYYVISEGSHPFGKSLQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB5 RQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHVLKHPFFWSLEKQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHVLKHPFFWSLEKQLQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB5 FFQDVSDRIEKESLDGPIVKQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDLRKFRTYKGGSVRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FFQDVSDRIEKESLDGPIVKQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDLRKFRTYKGGSVRDL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB5 LRAMRNKKHHYRELPAEVRETLGSLPDDFVCYFTSRFPHLLAHTYRAMELCSHERLFQPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRAMRNKKHHYRELPAEVRETLGSLPDDFVCYFTSRFPHLLAHTYRAMELCSHERLFQPY
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB5 YFHEPPEPQPPVTPDAL
:::::::::::::::::
CCDS45 YFHEPPEPQPPVTPDAL
970
>>CCDS76845.1 ERN2 gene_id:10595|Hs108|chr16 (874 aa)
initn: 2895 init1: 1791 opt: 1823 Z-score: 902.8 bits: 178.3 E(32554): 5.7e-44
Smith-Waterman score: 2771; 49.7% identity (68.5% similar) in 974 aa overlap (2-969:10-863)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPARRLLLLLTLLLPGLGIFGSTSTVTLPETLLFVSTLDGSLHAVSKRTGSI
: :: : : . :: .. . ::.::.::::::::::.::.::..
CCDS76 MASAVRGSRPWPRLGLQLQFAALLLGTLSPQVHTLRPENLLLVSTLDGSLHALSKQTGDL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KWTLKEDPVLQVPTHVEEPAFLPDPNDGSLYTLGSKNNEGLTKLPFTIPELVQASPCRSS
::::..:::.. : .: : ::: :: ::::: ::.....:: ::::::::::.:::::::
CCDS76 KWTLRDDPVIEGPMYVTEMAFLSDPADGSLYILGTQKQQGLMKLPFTIPELVHASPCRSS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 DGILYMGKKQDIWYVIDLLTGEKQQTLSSAFADSLCPSTSLLYLGRTEYTITMYDTKTRE
::..: :.::: :.:.: .:: :.::.. ::: ::.:::.::.::.: ..
CCDS76 DGVFYTGRKQDAWFVVDPESGETQMTLTTE-----GPSTPRLYIGRTQYTVTMHDPRAPA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LRWNATYFDYAASLPEDDVDYK-MSHFVSNGDGLVVTVDSESGDVLWIQNYASPVVAFYV
::::.:: :.: : : : :::..: : ::..::: :: ::: :. . ::.. :.
CCDS76 LRWNTTYRRYSAP-PMDGSPGKYMSHLASCGMGLLLTVDPGSGTVLWTQDLGVPVMGVYT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 WQREGLRKVMHINVAVETLRYLTFMSGEVGRITKWKYPFPKETEA-----KSKLTPTLYV
:...:::.. :...: .::..:.. :.. . :..: . ..: ::::
CCDS76 WHQDGLRQLPHLTLARDTLHFLALRWGHI----RLPASGPRDTATLFSTLDTQLLMTLYV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 GKYSTSLYASPSMVHEGVAVVPRGSTLPLLEGPQTDGVTIGDKGECVITPSTDVKFDPGL
:: :..:.: ..:: :::.:::: :: .:: :: ::. .:: .::: :.. :
CCDS76 GKDETGFYVSKALVHTGVALVPRGLTLAPADGPTTDEVTLQVSGEREGSPSTAVRYPSGS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 KSKNKLNYLRNYWLLIGHHETPLSASTKMLERFPNNLPKHRENVIPADSEKKSFEEVINL
. : . :::::::: : : ::. :
CCDS76 VA------LPSQWLLIGHHELPPVLHTTMLRV-------H--------------------
360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 VDQTSENAPTTVSRDVEEKPAHAPARPEAPVDSMLKDMATIILSTFLLIGWVAFIITYPL
:: : .: .: : .:: ::.
CCDS76 --------PTLGSGTAETRP---PENTQAP----------------------AFF-----
380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 SMHQQQQLQHQQFQKELEKIQLLQQQQQQLPFHPPGDTAQDGELLDTSGPYSESSGTSSP
..:: :. .:: ::. :. :.: :. .. :.. : ::.:
CCDS76 -LEQQPQV--------VEK-------QQETPL-APADFAHISQ--DAQ---SLHSGAS--
400 410 420 430
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 STSPRASNHSLCSGSSASKAGSSPSLEQDDGDEETSVVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIV
: :.. : : :. .. ..: :: ...:::::: ::::::.:: ::.:
CCDS76 ----RRSQKRLQSPSKQAQPLDDPEAEQ--------LTVVGKISFNPKDVLGRGAGGTFV
440 450 460 470 480
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 YRGMFDNRDVAVKRILPECFSFADREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCA
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CCDS76 FRGQFEGRAVAVKRLLRECFGLVRREVQLLQESDRHPNVLRYFCTERGPQFHYIALELCR
490 500 510 520 530 540
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 ATLQEYVEQKDFAHLGLEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIK
:.::::::. :. . :::: ..::: :::::::::.:::::::: ::::. :...: .
CCDS76 ASLQEYVENPDLDRGGLEPEVVLQQLMSGLAHLHSLHIVHRDLKPGNILITGPDSQGLGR
550 560 570 580 590 600
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 AMISDFGLCKKLAVGRHSFSRRSGVPGTEGWIAPEMLSEDCKENPTYTVDIFSAGCVFYY
...::::::::: .:: ::: .::.::::::.:::.:. ..:: .::::::::::::
CCDS76 VVLSDFGLCKKLPAGRCSFSLHSGIPGTEGWMAPELLQLLPPDSPTSAVDIFSAGCVFYY
610 620 630 640 650 660
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 VISEGSHPFGKSLQRQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHV
:.: :::::: :: :::::: :: : :. : :. :.::.:. :.. :: :::: .:
CCDS76 VLSGGSHPFGDSLYRQANILTGAPCLAHLEEEVHDKVVARDLVGAMLSPLPQPRPSAPQV
670 680 690 700 710 720
830 840 850 860 870 880
pF1KB5 LKHPFFWSLEKQLQFFQDVSDRIEKESLDGPIVKQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDL
: :::::: ::::::::::: .:::: . :.:. :: :: :::. .:.:.:..::::::
CCDS76 LAHPFFWSRAKQLQFFQDVSDWLEKESEQEPLVRALEAGGCAVVRDNWHEHISMPLQTDL
730 740 750 760 770 780
890 900 910 920 930 940
pF1KB5 RKFRTYKGGSVRDLLRAMRNKKHHYRELPAEVRETLGSLPDDFVCYFTSRFPHLLAHTYR
::::.::: ::::::::.:::::::::::.:::..::..:: :: :::.:::.:: ::.:
CCDS76 RKFRSYKGTSVRDLLRAVRNKKHHYRELPVEVRQALGQVPDGFVQYFTNRFPRLLLHTHR
790 800 810 820 830 840
950 960 970
pF1KB5 AMELCSHERLFQPYYFHEPPEPQPPVTPDAL
::. :. : :: ::: ::. .
CCDS76 AMRSCASESLFLPYY---PPDSEARRPCPGATGR
850 860 870
>>CCDS32407.2 ERN2 gene_id:10595|Hs108|chr16 (926 aa)
initn: 2895 init1: 1791 opt: 1816 Z-score: 899.2 bits: 177.7 E(32554): 9.2e-44
Smith-Waterman score: 2907; 50.3% identity (71.3% similar) in 974 aa overlap (2-969:10-915)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPARRLLLLLTLLLPGLGIFGSTSTVTLPETLLFVSTLDGSLHAVSKRTGSI
: :: : : . :: .. . ::.::.::::::::::.::.::..
CCDS32 MASAVRGSRPWPRLGLQLQFAALLLGTLSPQVHTLRPENLLLVSTLDGSLHALSKQTGDL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 KWTLKEDPVLQVPTHVEEPAFLPDPNDGSLYTLGSKNNEGLTKLPFTIPELVQASPCRSS
::::..:::.. : .: : ::: :: ::::: ::.....:: ::::::::::.:::::::
CCDS32 KWTLRDDPVIEGPMYVTEMAFLSDPADGSLYILGTQKQQGLMKLPFTIPELVHASPCRSS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 DGILYMGKKQDIWYVIDLLTGEKQQTLSSAFADSLCPSTSLLYLGRTEYTITMYDTKTRE
::..: :.::: :.:.: .:: :.::.. ::: ::.:::.::.::.: ..
CCDS32 DGVFYTGRKQDAWFVVDPESGETQMTLTTE-----GPSTPRLYIGRTQYTVTMHDPRAPA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LRWNATYFDYAASLPEDDVDYK-MSHFVSNGDGLVVTVDSESGDVLWIQNYASPVVAFYV
::::.:: :.: : : : :::..: : ::..::: :: ::: :. . ::.. :.
CCDS32 LRWNTTYRRYSAP-PMDGSPGKYMSHLASCGMGLLLTVDPGSGTVLWTQDLGVPVMGVYT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 WQREGLRKVMHINVAVETLRYLTFMSGEVGRITKWKYPFPKETEA-----KSKLTPTLYV
:...:::.. :...: .::..:.. :.. . :..: . ..: ::::
CCDS32 WHQDGLRQLPHLTLARDTLHFLALRWGHI----RLPASGPRDTATLFSTLDTQLLMTLYV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 GKYSTSLYASPSMVHEGVAVVPRGSTLPLLEGPQTDGVTIGDKGECVITPSTDVKFDPGL
:: :..:.: ..:: :::.:::: :: .:: :: ::. .:: .::: :.. :
CCDS32 GKDETGFYVSKALVHTGVALVPRGLTLAPADGPTTDEVTLQVSGEREGSPSTAVRYPSGS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 KSKNKLNYLRNYWLLIGHHETPLSASTKMLERFPNNLPKHRENVIPADSEKKSFEEVINL
. : . :::::::: : : ::. :. :. : ... .: ..:
CCDS32 VA------LPSQWLLIGHHELPPVLHTTMLRVHPTLGSGTAETRPPENTQAPAF--FLEL
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 VDQTSENAPTTVSRDVEEKPAHAPARPEAPVDSMLKDMATIILSTFLLIGWVAFIITYPL
.. . :. : : .: . :.. . .:. . :.. :: ::. :.
CCDS32 LSLSREKL-----WDSELHPEEKT--PDSYLGLGPQDLLAASLTAVLLGGWILFV-----
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 SMHQQQQLQHQQFQKELEKIQLLQQQQQQLPFHPPGDTAQDGELLDTSGPYSESSGTSSP
:.::: :....::. :. :.: :. .. :.. : ::.:
CCDS32 -MRQQQP-------------QVVEKQQET-PL-APADFAHISQ--DAQ---SLHSGAS--
460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 STSPRASNHSLCSGSSASKAGSSPSLEQDDGDEETSVVIVGKISFCPKDVLGHGAEGTIV
: :.. : : :. .. ..: :: ...:::::: ::::::.:: ::.:
CCDS32 ----RRSQKRLQSPSKQAQPLDDPEAEQ--------LTVVGKISFNPKDVLGRGAGGTFV
490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 YRGMFDNRDVAVKRILPECFSFADREVQLLRESDEHPNVIRYFCTEKDRQFQYIAIELCA
.::.:..: :::::.: :::... ::::::.:::.::::.::::::. ::.:::.:::
CCDS32 FRGQFEGRAVAVKRLLRECFGLVRREVQLLQESDRHPNVLRYFCTERGPQFHYIALELCR
540 550 560 570 580 590
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 ATLQEYVEQKDFAHLGLEPITLLQQTTSGLAHLHSLNIVHRDLKPHNILISMPNAHGKIK
:.::::::. :. . :::: ..::: :::::::::.:::::::: ::::. :...: .
CCDS32 ASLQEYVENPDLDRGGLEPEVVLQQLMSGLAHLHSLHIVHRDLKPGNILITGPDSQGLGR
600 610 620 630 640 650
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 AMISDFGLCKKLAVGRHSFSRRSGVPGTEGWIAPEMLSEDCKENPTYTVDIFSAGCVFYY
...::::::::: .:: ::: .::.::::::.:::.:. ..:: .::::::::::::
CCDS32 VVLSDFGLCKKLPAGRCSFSLHSGIPGTEGWMAPELLQLLPPDSPTSAVDIFSAGCVFYY
660 670 680 690 700 710
770 780 790 800 810 820
pF1KB5 VISEGSHPFGKSLQRQANILLGACSLDCLHPEKHEDVIARELIEKMIAMDPQKRPSAKHV
:.: :::::: :: :::::: :: : :. : :. :.::.:. :.. :: :::: .:
CCDS32 VLSGGSHPFGDSLYRQANILTGAPCLAHLEEEVHDKVVARDLVGAMLSPLPQPRPSAPQV
720 730 740 750 760 770
830 840 850 860 870 880
pF1KB5 LKHPFFWSLEKQLQFFQDVSDRIEKESLDGPIVKQLERGGRAVVKMDWRENITVPLQTDL
: :::::: ::::::::::: .:::: . :.:. :: :: :::. .:.:.:..::::::
CCDS32 LAHPFFWSRAKQLQFFQDVSDWLEKESEQEPLVRALEAGGCAVVRDNWHEHISMPLQTDL
780 790 800 810 820 830
890 900 910 920 930 940
pF1KB5 RKFRTYKGGSVRDLLRAMRNKKHHYRELPAEVRETLGSLPDDFVCYFTSRFPHLLAHTYR
::::.::: ::::::::.:::::::::::.:::..::..:: :: :::.:::.:: ::.:
CCDS32 RKFRSYKGTSVRDLLRAVRNKKHHYRELPVEVRQALGQVPDGFVQYFTNRFPRLLLHTHR
840 850 860 870 880 890
950 960 970
pF1KB5 AMELCSHERLFQPYYFHEPPEPQPPVTPDAL
::. :. : :: ::: ::. .
CCDS32 AMRSCASESLFLPYY---PPDSEARRPCPGATGR
900 910 920
977 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 17:32:59 2016 done: Thu Nov 3 17:32:59 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]