Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5419
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5419, 318 aa
1>>>pF1KB5419 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5464+/-0.00147; mu= 14.7346+/- 0.086
mean_var=112.6101+/-34.735, 0's: 0 Z-trim(100.0): 452 B-trim: 1008 in 3/43
Lambda= 0.120861
statistics sampled from 5379 (5962) to 5379 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.487), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16
Scan time: 2.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 ( 318) 2063 371.5 4.9e-103
CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1 ( 326) 859 161.6 7.8e-40
CCDS838.1 TMIGD3 gene_id:57413|Hs108|chr1 ( 347) 728 138.7 6.2e-33
CCDS81358.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 ( 123) 714 135.8 1.7e-32
CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 ( 412) 582 113.4 3.2e-25
CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17 ( 332) 462 92.3 5.5e-19
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 404 82.3 6.4e-16
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 404 82.3 6.8e-16
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 369 76.3 5.3e-14
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 348 72.5 5.5e-13
CCDS31072.1 OPN3 gene_id:23596|Hs108|chr1 ( 402) 345 72.0 8.6e-13
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 341 71.4 1.4e-12
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 332 69.7 3.7e-12
CCDS3687.1 RRH gene_id:10692|Hs108|chr4 ( 337) 328 69.0 6e-12
CCDS31237.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 489) 330 69.5 6e-12
CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 322 68.0 1.3e-11
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 318 67.2 2e-11
CCDS8290.1 MTNR1B gene_id:4544|Hs108|chr11 ( 362) 318 67.3 2.1e-11
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 316 67.0 2.9e-11
CCDS3848.1 MTNR1A gene_id:4543|Hs108|chr4 ( 350) 315 66.7 2.9e-11
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 313 66.4 3.9e-11
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 310 65.9 5.3e-11
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 311 66.2 5.7e-11
>>CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 (318 aa)
initn: 2063 init1: 2063 opt: 2063 Z-score: 1963.3 bits: 371.5 E(32554): 4.9e-103
Smith-Waterman score: 2063; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
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CCDS83 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTFLSCQFVSVMRMDYMVYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTFLSCQFVSVMRMDYMVYF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 SFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSNSKETGAFYGREFKTAKSLFLVLFLFA
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CCDS83 SFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSNSKETGAFYGREFKTAKSLFLVLFLFA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LSWLPLSIINCIIYFNGEVPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKKFKETYLLILKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 LSWLPLSIINCIIYFNGEVPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKKFKETYLLILKAC
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB5 VVCHPSDSLDTSIEKNSE
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CCDS83 VVCHPSDSLDTSIEKNSE
310
>>CCDS1434.1 ADORA1 gene_id:134|Hs108|chr1 (326 aa)
initn: 954 init1: 533 opt: 859 Z-score: 828.6 bits: 161.6 E(32554): 7.8e-40
Smith-Waterman score: 1010; 48.8% identity (78.9% similar) in 322 aa overlap (1-313:1-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
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CCDS14 MPPSISAFQAA---YIGIEVLIALVSVPGNVLVIWAVKVNQALRDATFCFIVSLAVADVA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
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CCDS14 VGALVIPLAILINIGPQTYFHTCLMVACPVLILTQSSILALLAIAVDRYLRVKIPLRYKM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSE--YHRNVTF----LSCQFVSVMRM
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CCDS14 VVTPRRAAVAIAGCWILSFVVGLTPMFGWNNLSAVERAWAANGSMGEPVIKCEFEKVISM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSNSK-ETGAFYGREFKTAKSLF
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CCDS14 EYMVYFNFFVWVLPPLLLMVLIYLEVFYLIRKQLNKKVSASSGDPQKYYGKELKIAKSLA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LVLFLFALSWLPLSIINCIIYF--NGEVPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKKFKE
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CCDS14 LILFLFALSWLPLHILNCITLFCPSCHKPSILTYIAIFLTHGNSAMNPIVYAFRIQKFRV
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB5 TYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE
:.: : . :.:. .: ..
CCDS14 TFLKIWNDHFRCQPAPPIDEDLPEERPDD
300 310 320
>>CCDS838.1 TMIGD3 gene_id:57413|Hs108|chr1 (347 aa)
initn: 728 init1: 728 opt: 728 Z-score: 704.8 bits: 138.7 E(32554): 6.2e-33
Smith-Waterman score: 728; 98.3% identity (100.0% similar) in 119 aa overlap (1-119:1-119)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..
CCDS83 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRFRI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTFLSCQFVSVMRMDYMVYF
CCDS83 PGLPGCILSFQLKVCFLPVMWLFILLSLALISDAMVMDEKVKRSFVLDTASAICNYNAHY
130 140 150 160 170 180
>>CCDS81358.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 (123 aa)
initn: 714 init1: 714 opt: 714 Z-score: 697.0 bits: 135.8 E(32554): 1.7e-32
Smith-Waterman score: 714; 100.0% identity (100.0% similar) in 116 aa overlap (1-116:1-116)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVSSIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTFLSCQFVSVMRMDYMVYF
CCDS81 PTL
>>CCDS13826.1 ADORA2A gene_id:135|Hs108|chr22 (412 aa)
initn: 770 init1: 474 opt: 582 Z-score: 566.3 bits: 113.4 E(32554): 3.2e-25
Smith-Waterman score: 811; 41.6% identity (75.4% similar) in 305 aa overlap (10-302:4-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
... .:::.:. :.. ::.::::: .: :: .::..: ::.:::: ::::
CCDS13 MPIMGSSVYITVELAIAVLAILGNVLVCWAVWLNSNLQNVTNYFVVSLAAADIA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
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CCDS13 VGVLAIPFAITISTGFCAACHGCLFIACFVLVLTQSSIFSLLAIAIDRYIAIRIPLRYNG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYHRNVTF------LSCQFVSVMRM
..: : ...::..:: .:::::.::: . .: . ..: : .:. :
CCDS13 LVTGTRAKGIIAICWVLSFAIGLTPMLGWNNCGQPKEGKNHSQGCGEGQVACLFEDVVPM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLNLSN---SKETGAFYGREFKTAKS
.:::::.:.. ...::..: ..:: :: : .:. :. .... . .: ..:::
CCDS13 NYMVYFNFFACVLVPLLLMLGVYLRIFLAARRQLKQMESQPLPGERARSTLQKEVHAAKS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 LFLVLFLFALSWLPLSIINCIIYFNGE---VPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAYKIKK
: ... :::: :::: ::::. .: . .: ..:..:.:::.::..::..:::.:..
CCDS13 LAIIVGLFALCWLPLHIINCFTFFCPDCSHAPLWLMYLAIVLSHTNSVVNPFIYAYRIRE
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KB5 FKETYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE
:..:. :... :.
CCDS13 FRQTFRKIIRSHVLRQQEPFKAAGTSARVLAAHGSDGEQVSLRLNGHPPGVWANGSAPHP
300 310 320 330 340 350
>>CCDS11173.1 ADORA2B gene_id:136|Hs108|chr17 (332 aa)
initn: 740 init1: 452 opt: 462 Z-score: 454.4 bits: 92.3 E(32554): 5.5e-19
Smith-Waterman score: 766; 39.3% identity (71.9% similar) in 313 aa overlap (8-304:3-312)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFIVSLALADIA
: .. :...:. :. ...::::: .: .::: : ::.:::: ::.:
CCDS11 MLLETQDALYVALELVIAALSVAGNVLVCAAVGTANTLQTPTNYFLVSLAAADVA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 VGVLVMPLAIVVSLGITIHFYSCLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRYLRVKLTVRYKR
::....:.::..:::. ::.:::..:..:..:..::.::::.:::::: . . .:::
CCDS11 VGLFAIPFAITISLGFCTDFYGCLFLACFVLVLTQSSIFSLLAVAVDRYLAICVPLRYKS
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pF1KB5 VTTHRRIWLALGLCWLVSFLVGLTPMFGWNMKLTSEYH----------RNVTFLSCQFVS
..: : .... :...: .::::..::: : .. . .. ...: : .
CCDS11 LVTGTRARGVIAVLWVLAFGIGLTPFLGWNSKDSATNNCTEPWDGTTNESCCLVKCLFEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB5 VMRMDYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLSLN--LSNSKETGAFYGREFKT
:. :.:::::.:. .. ::..: .::. :: . .:. . ...:. : ::...
CCDS11 VVPMSYMVYFNFFGCVLPPLLIMLVIYIKIFLVACRQLQRTELMDHSRTT---LQREIHA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 AKSLFLVLFLFALSWLPLSIINCIIYFN---GEV-PQLVLYMGILLSHANSMMNPIVYAY
:::: ... .::: :::. .::. :. :. :. .. :.::::::::..:::::::
CCDS11 AKSLAMIVGIFALCWLPVHAVNCVTLFQPAQGKNKPKWAMNMAILLSHANSVVNPIVYAY
240 250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KB5 KIKKFKETYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE
. . :. :. :.. ..:.
CCDS11 RNRDFRYTFHKIISRYLLCQADVKSGNGQAGVQPALGVGL
300 310 320 330
>>CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 (359 aa)
initn: 275 init1: 121 opt: 404 Z-score: 399.3 bits: 82.3 E(32554): 6.4e-16
Smith-Waterman score: 404; 29.7% identity (63.8% similar) in 323 aa overlap (4-317:13-321)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFI
.::: ... .: ... ..: : ...:::.: .: :: :.. : ::
CCDS43 MAPNGTASSFCLDSTACKIT-IT-VVLAVLI-LITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNLTNCFI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB5 VSLALADIAVGVLVMPLAIVVSLGITIHFYS--CLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRY
::::..:. .:.::.:.. . .:. : . : ..: : ... :::..:. :..:::
CCDS43 VSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 LRVKLTVRYKRVTTHRRIWLALGLCWLVSFLVG-LTPMFGWNMKLTSEYHR-NVTFLSCQ
: .:: ..: :. ..: : :..:. .. :. .::: . .: . : : .:.
CCDS43 CAVMDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSR--NETSKGNHTTSKCK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FVSVMRMDYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLS-LNLSNSKETGAFYGREF
:.: .. .: . :. ...::..:: : :: . :.. . .: .: ..... ::
CCDS43 -VQVNEVYGLV--DGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHISSWKAATI--REH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 KTAKSLFLVLFLFALSWLPLSIINCIIY--FNGE--VPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVY
:.. .: :. : . :.: .. ..: . :. . ... . . :..::: .:::.:
CCDS43 KATVTLAAVMGAFIICWFP--YFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILY
240 250 260 270 280
290 300 310
pF1KB5 AYKIKKFKETYLLILKACVVCHPSDSLDTSIEKNSE
: . :. : .. : .: ::...:.
CCDS43 AALNRDFRTGYQQLF--CCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWS
290 300 310 320 330 340
CCDS43 GTEVTAPQGATDR
350
>>CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 (397 aa)
initn: 275 init1: 121 opt: 404 Z-score: 398.8 bits: 82.3 E(32554): 6.8e-16
Smith-Waterman score: 404; 29.7% identity (63.8% similar) in 323 aa overlap (4-317:13-321)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MPNNSTALSLANVTYITMEIFIGLCAIVGNVLVICVVKLNPSLQTTTFYFI
.::: ... .: ... ..: : ...:::.: .: :: :.. : ::
CCDS47 MAPNGTASSFCLDSTACKIT-IT-VVLAVLI-LITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNLTNCFI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB5 VSLALADIAVGVLVMPLAIVVSLGITIHFYS--CLFMTCLLLIFTHASIMSLLAIAVDRY
::::..:. .:.::.:.. . .:. : . : ..: : ... :::..:. :..:::
CCDS47 VSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 LRVKLTVRYKRVTTHRRIWLALGLCWLVSFLVG-LTPMFGWNMKLTSEYHR-NVTFLSCQ
: .:: ..: :. ..: : :..:. .. :. .::: . .: . : : .:.
CCDS47 CAVMDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSR--NETSKGNHTTSKCK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 FVSVMRMDYMVYFSFLTWIFIPLVVMCAIYLDIFYIIRNKLS-LNLSNSKETGAFYGREF
:.: .. .: . :. ...::..:: : :: . :.. . .: .: ..... ::
CCDS47 -VQVNEVYGLV--DGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHISSWKAATI--REH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 KTAKSLFLVLFLFALSWLPLSIINCIIY--FNGE--VPQLVLYMGILLSHANSMMNPIVY
:.. .: :. : . :.: .. ..: . :. . ... . . :..::: .:::.:
CCDS47 KATVTLAAVMGAFIICWFP--YFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILY
240 250 260 270 280
290 300 310
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]