Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5186
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5186, 281 aa
1>>>pF1KB5186 281 - 281 aa - 281 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6002+/-0.000837; mu= 14.9385+/- 0.051
mean_var=86.0789+/-17.241, 0's: 0 Z-trim(109.4): 166 B-trim: 371 in 1/50
Lambda= 0.138237
statistics sampled from 10702 (10877) to 10702 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 1.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11185.1 RASD1 gene_id:51655|Hs108|chr17 ( 281) 1867 381.8 3.1e-106
CCDS13916.1 RASD2 gene_id:23551|Hs108|chr22 ( 266) 1015 211.8 4.2e-55
CCDS58519.1 RASD1 gene_id:51655|Hs108|chr17 ( 122) 624 133.6 6.8e-32
CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19 ( 198) 366 82.3 3.1e-16
CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9 ( 199) 358 80.7 9.3e-16
CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 ( 204) 341 77.3 1e-14
CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13 ( 183) 334 75.9 2.4e-14
CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX ( 183) 332 75.5 3.2e-14
CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3 ( 183) 332 75.5 3.2e-14
CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 ( 184) 318 72.7 2.2e-13
CCDS7699.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11 ( 170) 317 72.5 2.4e-13
CCDS12774.1 RRAS gene_id:6237|Hs108|chr19 ( 218) 318 72.7 2.5e-13
CCDS8702.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 188) 317 72.5 2.6e-13
CCDS8703.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 189) 317 72.5 2.6e-13
CCDS7698.1 HRAS gene_id:3265|Hs108|chr11 ( 189) 317 72.5 2.6e-13
CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1 ( 184) 316 72.3 2.9e-13
CCDS877.1 NRAS gene_id:4893|Hs108|chr1 ( 189) 305 70.1 1.4e-12
CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 ( 217) 301 69.4 2.6e-12
CCDS1123.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 219) 300 69.2 3e-12
CCDS58037.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 236) 300 69.2 3.2e-12
CCDS62431.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 ( 153) 288 66.6 1.2e-11
CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2 ( 206) 284 65.9 2.7e-11
CCDS3100.1 MRAS gene_id:22808|Hs108|chr3 ( 208) 282 65.5 3.5e-11
>>CCDS11185.1 RASD1 gene_id:51655|Hs108|chr17 (281 aa)
initn: 1867 init1: 1867 opt: 1867 Z-score: 2020.7 bits: 381.8 E(32554): 3.1e-106
Smith-Waterman score: 1867; 100.0% identity (100.0% similar) in 281 aa overlap (1-281:1-281)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAKNCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAKNCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIEDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ILDTKSCLKNKTKENVDVPLVICGNKGDRDFYREVDQREIEQLVGDDPQRCAYFEISAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ILDTKSCLKNKTKENVDVPLVICGNKGDRDFYREVDQREIEQLVGDDPQRCAYFEISAKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NSSLDQMFRALFAMAKLPSEMSPDLHRKVSVQYCDVLHKKALRNKKLLRAGSGGGGGDPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSSLDQMFRALFAMAKLPSEMSPDLHRKVSVQYCDVLHKKALRNKKLLRAGSGGGGGDPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KB5 DAFGIVAPFARRPSVHSDLMYIREKASAGSQAKDKERCVIS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DAFGIVAPFARRPSVHSDLMYIREKASAGSQAKDKERCVIS
250 260 270 280
>>CCDS13916.1 RASD2 gene_id:23551|Hs108|chr22 (266 aa)
initn: 1129 init1: 980 opt: 1015 Z-score: 1102.7 bits: 211.8 E(32554): 4.2e-55
Smith-Waterman score: 1143; 62.0% identity (84.1% similar) in 276 aa overlap (6-280:1-265)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAKNCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIEDF
:.: . .. ::.:::: ::::.::.:.:::..::::::.::::: ::::::::
CCDS13 MMKTLSSGNCTLSVPAKNSYRMVVLGASRVGKSSIVSRFLNGRFEDQYTPTIEDF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQQ
::: :.:::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::.::..:
CCDS13 HRKVYNIRGDMYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRESFDEVKRLQKQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB5 ILDTKSCLKNKTKENVDVPLVICGNKGDR-DFYREVDQREIEQLVGDDPQRCAYFEISAK
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CCDS13 ILEVKSCLKNKTKEAAELPMVICGNKNDHGELCRQVPTTEAELLVSGD-ENCAYFEVSAK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KNSSLDQMFRALFAMAKLPSEMSPDLHRKVSVQYCDVLHKKALRNKKLLRAGSGGGGGDP
::...:.:: .::.::::: :::: ::::.:::: :..: . . ... .
CCDS13 KNTNVDEMFYVLFSMAKLPHEMSPALHRKISVQYGDAFHPRPFCMRRVKEM---------
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB5 GDAFGIVAPFARRPSVHSDLMYIREKASAGSQAKDKERCVIS
::.:.:.::::::::.::: ::. :. .::.....:.:
CCDS13 -DAYGMVSPFARRPSVNSDLKYIKAKVLREGQARERDKCTIQ
230 240 250 260
>>CCDS58519.1 RASD1 gene_id:51655|Hs108|chr17 (122 aa)
initn: 624 init1: 624 opt: 624 Z-score: 686.0 bits: 133.6 E(32554): 6.8e-32
Smith-Waterman score: 624; 100.0% identity (100.0% similar) in 95 aa overlap (1-95:1-95)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAKNCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIEDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAKNCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIEDF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTDPRHQVLPQEQNQGERGRAPGHLRQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ILDTKSCLKNKTKENVDVPLVICGNKGDRDFYREVDQREIEQLVGDDPQRCAYFEISAKK
CCDS58 QG
>>CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19 (198 aa)
initn: 381 init1: 301 opt: 366 Z-score: 405.0 bits: 82.3 E(32554): 3.1e-16
Smith-Waterman score: 423; 41.2% identity (70.6% similar) in 177 aa overlap (19-194:1-167)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAK-NCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIED
.: . : ::.:..:.. :::...: ::. : :.:.: :::::
CCDS12 MPEQSNDYRVVVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRDTYIPTIED
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FHRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQ
.:. : : :.: ::.:.: ::::.:::: : .::::::. ...:.::. . .
CCDS12 TYRQVISCDKSVCTLQITDTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVFSVTSKQSLEELGPIYK
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 QILDTKSCLKNKTKENVDVPLVICGNKGDRDFYREVDQREIEQLVGDDPQRCAYFEISAK
:.. :. .. :.:... ::: : . :::: :: : :... .::..: :::
CCDS12 LIVQIKGSVE-------DIPVMLVGNKCD-ETQREVDTREA-QAVAQE-WKCAFMETSAK
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KNSSLDQMFRALFAMAKLPSEMSPDLHRKVSVQYCDVLHKKALRNKKLLRAGSGGGGGDP
: .. ..:. :...
CCDS12 MNYNVKELFQELLTLETRRNMSLNIDGKRSGKQKRTDRVKGKCTLM
160 170 180 190
>>CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9 (199 aa)
initn: 424 init1: 309 opt: 358 Z-score: 396.4 bits: 80.7 E(32554): 9.3e-16
Smith-Waterman score: 422; 36.2% identity (65.7% similar) in 210 aa overlap (19-227:1-192)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAK-NCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIED
.: . : ::....:.. :::...: ::. : :...: ::.::
CCDS66 MPEQSNDYRVAVFGAGGVGKSSLVLRFVKGTFRESYIPTVED
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FHRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQ
.:. : . :.: ::.:.: ::::.:::: : .::::.:. .:.:.::.. . .
CCDS66 TYRQVISCDKSICTLQITDTTGSHQFPAMQRLSISKGHAFILVYSITSRQSLEELKPIYE
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 QILDTKSCLKNKTKENVDVPLVICGNKGDRDFYREVDQREIEQLVGDDPQRCAYFEISAK
:: . :. ... .:... ::: :.. :::.. : : :. .::..: :::
CCDS66 QICEIKGDVES-------IPIMLVGNKCDESPSREVQSSEAEALA--RTWKCAFMETSAK
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KNSSLDQMFRALFAMAKLPSEMSPDLHRKVSVQYCDVLHKKALRNKKLLRAGSGGGGGDP
: .. ..:. :. . : .: ::.: :. :..::
CCDS66 LNHNVKELFQELLNLEK---------RRTVSLQIDGKKSKQQKRKEKLKGKCVIM
160 170 180 190
240 250 260 270 280
pF1KB5 GDAFGIVAPFARRPSVHSDLMYIREKASAGSQAKDKERCVIS
>>CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 (204 aa)
initn: 374 init1: 278 opt: 341 Z-score: 377.9 bits: 77.3 E(32554): 1e-14
Smith-Waterman score: 379; 37.8% identity (65.4% similar) in 188 aa overlap (25-208:15-192)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAKNCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIEDF
::.:..:.. :::.:.. .:. . : : :::::
CCDS78 MAAAGWRDGSGQEKYRLVVVGGGGVGKSALTIQFIQSYFVTDYDPTIEDS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQQ
. : : .. .::::::.:.. : :::. . ::. :.::::. .: ::::. ....:
CCDS78 YTKQCVIDDRAARLDILDTAGQEEFGAMREQYMRTGEGFLLVFSVTDRGSFEEIYKFQRQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ILDTKSCLKNKTKENVDVPLVICGNKGDRDFYREVDQREIEQLVGDDPQRCAYFEISAKK
:: ..:. . :... :::.: : :.: :.: .::. . .:.: :::
CCDS78 IL--------RVKDRDEFPMILIGNKADLDHQRQVTQEEGQQLA--RQLKVTYMEASAKI
120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB5 NSSLDQMFRALFAMAKLPSEM----SPDLHRKVSVQYCDVLHKKALRNKKLLRAGSGGGG
..:: :. : . . .:. ::. ::
CCDS78 RMNVDQAFHELVRVIRKFQEQECPPSPEPTRKEKDKKGCHCVIF
170 180 190 200
240 250 260 270 280
pF1KB5 GDPGDAFGIVAPFARRPSVHSDLMYIREKASAGSQAKDKERCVIS
>>CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13 (183 aa)
initn: 326 init1: 277 opt: 334 Z-score: 371.0 bits: 75.9 E(32554): 2.4e-14
Smith-Waterman score: 377; 37.2% identity (67.8% similar) in 180 aa overlap (25-204:4-171)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAKNCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIEDF
:..:.:::. :::.:.. .:.:: : . : ::::::
CCDS94 MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIEKYDPTIEDF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQQ
.:: . . :.::::.:.. : .:: : : .:. ::::.:: :..::.... .:.:
CCDS94 YRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ILDTKSCLKNKTKENVDVPLVICGNKGDRDFYREVDQREIEQLVGDDPQRCAYFEISAKK
:. ..:. ::... ::: : . :::.. : . :. . : ..: :::.
CCDS94 II--------RVKRYEKVPVILVGNKVDLESEREVSSSEGRALA--EEWGCPFMETSAKS
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NSSLDQMFRALFAMAKLPSEMSPDLHRKVSVQYCDVLHKKALRNKKLLRAGSGGGGGDPG
.. .:..: . . .. .::
CCDS94 KTMVDELFAEI--VRQMNYAAQPDKDDPCCSACNIQ
150 160 170 180
>>CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX (183 aa)
initn: 324 init1: 276 opt: 332 Z-score: 368.8 bits: 75.5 E(32554): 3.2e-14
Smith-Waterman score: 376; 41.5% identity (68.9% similar) in 164 aa overlap (25-188:4-157)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAKNCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIEDF
:..:.:::. :::.:.. .:.:: : . : ::::::
CCDS14 MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIEKYDPTIEDF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQQ
.:: . . :.::::.:.. : .:: : : .:. ::::.:: :..::.... .:.:
CCDS14 YRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ILDTKSCLKNKTKENVDVPLVICGNKGDRDFYREVDQREIEQLVGDDPQRCAYFEISAKK
:. .: : :::.. ::: : . ::: . : . :. . : ..: :::.
CCDS14 IVRVKRYEK--------VPLILVGNKVDLEPEREVMSSEGRALAQE--WGCPFMETSAKS
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NSSLDQMFRALFAMAKLPSEMSPDLHRKVSVQYCDVLHKKALRNKKLLRAGSGGGGGDPG
.: .:..:
CCDS14 KSMVDELFAEIVRQMNYSSLPEKQDQCCTTCVVQ
150 160 170 180
>>CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3 (183 aa)
initn: 325 init1: 277 opt: 332 Z-score: 368.8 bits: 75.5 E(32554): 3.2e-14
Smith-Waterman score: 382; 40.2% identity (70.1% similar) in 164 aa overlap (25-188:4-157)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAKNCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIEDF
:..:.:::. :::.:.. .:.:: : . : ::::::
CCDS31 MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGSFIEKYDPTIEDF
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQQ
.:: . . :.::::.:.. : .:: : : .:. ::::.:: :..::.... .:.:
CCDS31 YRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMRDLYIKNGQGFILVYSLVNQQSFQDIKPMRDQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 ILDTKSCLKNKTKENVDVPLVICGNKGDRDFYREVDQREIEQLVGDDPQRCAYFEISAKK
:. ..:. ::... ::: : . :::. : . :. . : ..: :::.
CCDS31 II--------RVKRYERVPMILVGNKVDLEGEREVSYGEGKALA--EEWSCPFMETSAKN
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 NSSLDQMFRALFAMAKLPSEMSPDLHRKVSVQYCDVLHKKALRNKKLLRAGSGGGGGDPG
..:.:..:
CCDS31 KASVDELFAEIVRQMNYAAQPNGDEGCCSACVIL
150 160 170 180
>>CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 (184 aa)
initn: 340 init1: 254 opt: 318 Z-score: 353.7 bits: 72.7 E(32554): 2.2e-13
Smith-Waterman score: 362; 35.1% identity (66.5% similar) in 188 aa overlap (25-212:4-182)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLAAMIKKMCPSDSELSIPAKNCYRMVILGSSKVGKTAIVSRFLTGRFEDAYTPTIEDF
:..:.:::. :::.:.. .:. : : . : :::::
CCDS89 MREYKLVVLGSGGVGKSALTVQFVQGIFVEKYDPTIEDS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 HRKFYSIRGEVYQLDILDTSGNHPFPAMRRLSILTGDVFILVFSLDNRDSFEEVQRLRQQ
.:: . .. .:.::::.:.. : ::: : . .:. : ::.:. ...:...: ::.:
CCDS89 YRKQVEVDAQQCMLEILDTAGTEQFTAMRDLYMKNGQGFALVYSITAQSTFNDLQDLREQ
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