Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5178
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5178, 485 aa
1>>>pF1KB5178 485 - 485 aa - 485 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7867+/-0.00109; mu= 15.4325+/- 0.065
mean_var=71.6493+/-14.881, 0's: 0 Z-trim(103.4): 47 B-trim: 238 in 2/48
Lambda= 0.151519
statistics sampled from 7350 (7394) to 7350 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1585.1 AGT gene_id:183|Hs108|chr1 ( 485) 3162 700.8 8.2e-202
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 329 81.5 1.9e-15
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 310 77.4 3.4e-14
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 304 76.0 8.5e-14
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 287 72.3 1.1e-12
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 286 72.1 1.4e-12
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 273 69.3 9.3e-12
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 271 68.8 1.2e-11
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 261 66.6 5.6e-11
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 261 66.6 5.7e-11
>>CCDS1585.1 AGT gene_id:183|Hs108|chr1 (485 aa)
initn: 3162 init1: 3162 opt: 3162 Z-score: 3736.6 bits: 700.8 E(32554): 8.2e-202
Smith-Waterman score: 3162; 99.8% identity (99.8% similar) in 485 aa overlap (1-485:1-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MRKRAPQSEMAPAGVSLRATILCLLAWAGLAAGDRVYIHPFHLVIHNESTCEQLAKANAG
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CCDS15 MRKRAPQSEMAPAGVSLRATILCLLAWAGLAAGDRVYIHPFHLVIHNESTCEQLAKANAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KPKDPTFIPAPIQAKTSPVDEKALQDQLVLVAAKLDTEDKLRAAMVGMLANFLGFRIYGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 KPKDPTFIPAPIQAKTSPVDEKALQDQLVLVAAKLDTEDKLRAAMVGMLANFLGFRIYGM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 HSELWGVVHGATVLSPTAVFGTLASLYLGALDHTADRLQAILGVPWKDKNCTSRLDAHKV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LSALQAVQGLLVAQGRADSQAQLLLSTVVGVFTAPGLHLKQPFVQGLALYTPVVLPRSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LSALQAVQGLLVAQGRADSQAQLLLSTVVGVFTAPGLHLKQPFVQGLALYTPVVLPRSLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FTELDVAAEKIDRFMQAVTGWKTGCSLTGASVDSTLAFNTYVHFQGKMKGFSLLAEPQEF
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 FTELDVAAEKIDRFMQAVTGWKTGCSLMGASVDSTLAFNTYVHFQGKMKGFSLLAEPQEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 WVDNSTSVSVPMLSGMGTFQHWSDIQDNFSVTQVPFTESACLLLIQPHYASDLDKVEGLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 WVDNSTSVSVPMLSGMGTFQHWSDIQDNFSVTQVPFTESACLLLIQPHYASDLDKVEGLT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 FQQNSLNWMKKLSPRTIHLTMPQLVLQGSYDLQDLLAQAELPAILHTELNLQKLSNDRIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 FQQNSLNWMKKLSPRTIHLTMPQLVLQGSYDLQDLLAQAELPAILHTELNLQKLSNDRIR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VGEVLNSIFFELEADEREPTESTQQLNKPEVLEVTLNRPFLFAVYDQSATALHFLGRVAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VGEVLNSIFFELEADEREPTESTQQLNKPEVLEVTLNRPFLFAVYDQSATALHFLGRVAN
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PLSTA
:::::
CCDS15 PLSTA
>>CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 (405 aa)
initn: 149 init1: 67 opt: 329 Z-score: 391.0 bits: 81.5 E(32554): 1.9e-15
Smith-Waterman score: 329; 23.5% identity (62.0% similar) in 358 aa overlap (134-482:65-405)
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 AMVGMLANFLGFRIYGMHSELWGVVHGATVLSPTAVFGTLASLYLGALDHTADRLQAILG
.::... .:: : ::. :: : : . :
CCDS99 HHRGLASANVDFAFSLYKHLVALSPKKNIFISPVSISMALAMLSLGTCGHT--RAQLLQG
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 VPWKDKNCTSRLDAHKVLSALQAVQGLLVAQGRADSQAQLLLSTVVGVFTAPGLHLKQPF
. . : : : .. .. ...: .. :.. ..:.. .. ..... : .:.: . :
CCDS99 LGF---NLTERSET-EIHQGFQHLHQLFA---KSDTSLEMTMGNAL--FLDGSLELLESF
100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 VQGLA-LYTPVVLPRSLDFTELDVAAEKIDRFMQAVTGWKTGCSLTGASVDSTLAFNTYV
. : :: ...: . .:...:. ... : : ..: . . :.. .:.
CCDS99 SADIKHYYESEVL--AMNFQDWATASRQINSYVKNKTQGKIVDLFSGLDSPAILVLVNYI
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 HFQGKM-KGFSLLAEPQE-FWVDNSTSVSVPMLSGMGTFQHWSDIQDNFSVTQVPFTESA
:.: . :.: . .: :.::..: :.:::. .:... : . ...:. .. ..
CCDS99 FFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTISYLHDSELPCQLVQMNYVGNG
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390
pF1KB5 CLLLIQPHYASDLDKVEGLTFQQNSLN-WMKKLSPRTIHLTMPQLVLQGSYDLQDLLAQA
...: : .. . .:. ....: : :. . : .:.....: ::: :.: .
CCDS99 TVFFILPDKGKMNTVIAALS--RDTINRWSAGLTSSQVDLYIPKVTISGVYDLGDVLEEM
270 280 290 300 310
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 ELPAILHTELNLQKLSND-RIRVGEVLNSIFFELEADEREPTESTQ-QLN---KPEVLEV
. .. .. :......: ... ..:... ..:. . . . :: :: :: .:.
CCDS99 GIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDTAGSTGVTLNLTSKPIILR-
320 330 340 350 360 370
460 470 480
pF1KB5 TLNRPFLFAVYDQSATALHFLGRVANPLSTA
.:.::.. ..:. . . ::.:: ::.
CCDS99 -FNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
380 390 400
>>CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 (414 aa)
initn: 173 init1: 95 opt: 310 Z-score: 368.4 bits: 77.4 E(32554): 3.4e-14
Smith-Waterman score: 326; 23.8% identity (57.9% similar) in 361 aa overlap (134-482:74-412)
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 AMVGMLANFLGFRIYGMHSELWGVVHGATVLSPTAVFGTLASLYLGALDHTADRLQAILG
::: .. ... : ::: : : :... ..
CCDS99 AAKELARQNMDLGFKLLKKLAFYNPGRNIFLSPLSISTAFSMLCLGAQDSTLDEIKQGFN
50 60 70 80 90 100
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 ---VPWKDKNCTSRLDAHKVLSALQAVQGLLVAQGRADSQAQLLLSTVVGVFTAPGLHLK
.: :: . . :.. : .: : .. : . .: :. .
CCDS99 FRKMPEKDLHEGFHYIIHELT---QKTQDLKLSIGNT-------------LFIDQRLQPQ
110 120 130 140
230 240 250 260 270
pF1KB5 QPFVQGLA-LYTPVVLPRSLDFTELDVAAEKIDRFMQAVTGWKTGCSLTGASVDSTLAFN
. :.. .:. .. .: .:..: ..:. :.. : : . . . . ... .
CCDS99 RKFLEDAKNFYSAETI--LTNFQNLEMAQKQINDFISQKTHGKINNLIENIDPGTVMLLA
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 TYVHFQGKMKG-FSL-LAEPQEFWVDNSTSVSVPMLSGMGTFQHWSDIQDNFSVTQVPFT
.:. :... : :. ... ..:......::.:::. : .: : . . .. ..:.
CCDS99 NYIFFRARWKHEFDPNVTKEEDFFLEKNSSVKVPMMFRSGIYQVGYDDKLSCTILEIPYQ
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 ESACLLLIQPHYASDLDKVE-GLTFQQNSLNWMKKLSPRTIHLTMPQLVLQGSYDLQDLL
.. ..: : . : ..: :: . : : :: :.. ...:.: . :..::. :
CCDS99 KNITAIFILPD-EGKLKHLEKGLQVDTFS-RWKTLLSRRVVDVSVPRLHMTGTFDLKKTL
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 AQAELPAILHTELNLQKLSNDR-IRVGEVLNSIFFELEADER--EPTEST--QQLNKPEV
. . :.. . .: :.. : ..:::.... ::. ::: : . .: : :
CCDS99 SYIGVSKIFEEHGDLTKIAPHRSLKVGEAVHKA--ELKMDERGTEGAAGTGAQTLPMETP
330 340 350 360 370 380
460 470 480
pF1KB5 LEVTLNRPFLFAVYDQSATALHFLGRVANPLSTA
: : ...:.:. .:... .. :::...::.
CCDS99 LVVKIDKPYLLLIYSEKIPSVLFLGKIVNPIGK
390 400 410
>>CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 (418 aa)
initn: 168 init1: 93 opt: 304 Z-score: 361.2 bits: 76.0 E(32554): 8.5e-14
Smith-Waterman score: 304; 22.9% identity (59.1% similar) in 401 aa overlap (92-481:32-415)
70 80 90 100 110
pF1KB5 PKDPTFIPAPIQAKTSPVDEKALQDQLVLVAAKLDT--EDKLRAAMVGMLANFLGFRIYG
: : :: .:. . .. . :. : ..
CCDS99 PSSVSWGILLLAGLCCLVPVSLAEDPQGDAAQKTDTSHHDQDHPTFNKITPNLAEF-AFS
10 20 30 40 50 60
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 MHSELWGVVHGATVL-SPTAVFGTLASLYLGALDHTADRLQAILGVPWKDKNCTSRLDAH
.. .: ...... ::... ..: : ::. : :.. . :. . : : .:.
CCDS99 LYRQLAHQSNSTNIFFSPVSIATAFAMLSLGTKADTHDEI--LEGLNF---NLTEIPEAQ
70 80 90 100 110
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 KVLSALQAVQGLLVAQGRADSQAQLLLSTVVGVFTAPGLHLKQPFVQGLA-LYTPVVLPR
.. : :: . .. ::: :: .: :.: . ::.: . :.. . :: ..
CCDS99 ----IHEGFQELLRTLNQPDSQLQL--TTGNGLFLSEGLKLVDKFLEDVKKLYHSEAF--
120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SLDFTELDVAAEKIDRFMQAVTGWKTGCSLTGASVDSTLAFNTYVHFQGKM-KGFSLL-A
...: . . : ..:. ... : : . . :...:. .:. :.:: . : . .
CCDS99 TVNFGDTEEAKKQINDYVEKGTQGKIVDLVKELDRDTVFALVNYIFFKGKWERPFEVKDT
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EPQEFWVDNSTSVSVPMLSGMGTF--QHWSDIQDNFSVTQVPFTESACLLLIQPHYASDL
: ..: ::. :.:.:::.. .: : :: . ... : . . .: ... : . :
CCDS99 EEEDFHVDQVTTVKVPMMKRLGMFNIQHCKKLSSW--VLLMKYLGNATAIFFLPD-EGKL
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DKVEGLTFQQNSLNWMKKLSPRTIHLTMPQLVLQGSYDLQDLLAQAELPAILHTELNLQK
...:. .. ..... . :. : .:.: . :.:::...:.: . .. . .:.
CCDS99 QHLENELTHDIITKFLENEDRRSASLHLPKLSITGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSG
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LSNDR-IRVGEVLNSIFFELEADEREPTESTQQLNKPEVL--EVTLNRPFLFAVYDQSAT
.... ......... . .. : . . : . :: .:.::.: . .:..
CCDS99 VTEEAPLKLSKAVHKAVLTIDEKGTEAAGAMFLEAIPMSIPPEVKFNKPFVFLMIEQNTK
350 360 370 380 390 400
480
pF1KB5 ALHFLGRVANPLSTA
. :.:.:.::
CCDS99 SPLFMGKVVNPTQK
410
>>CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 (422 aa)
initn: 202 init1: 91 opt: 287 Z-score: 341.1 bits: 72.3 E(32554): 1.1e-12
Smith-Waterman score: 353; 26.1% identity (57.6% similar) in 387 aa overlap (109-483:54-421)
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 VDEKALQDQLVLVAAKLDTEDKLRAAMVGMLANFLGFRIYGMHSELWGVVHGATVLSPTA
..:: ..:.: .:: . . : .::..
CCDS32 AHGDKSLQGPQPPRHQLSEPAPAYHRITPTITNF-ALRLY---KELAADAPGNIFFSPVS
30 40 50 60 70
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 VFGTLASLYLGALDHTADRLQAILGVPWKDKNCTSRLDAHKVLSALQAVQGLLVAQGRAD
. ::: : ::: .:. . :: . : . : : :. ..:: . :
CCDS32 ISTTLALLSLGAQANTSALILEGLGFNLTE---TPEADIH------QGFRSLL--HTLAL
80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 SQAQLLLSTVVGVFTAPGLHLKQPFVQGLA-LYTPVVLPRSLDFTELDVAAEKIDRFMQA
. .: :.. ..: :. .: ..... :: .. : .::. .....:. ...
CCDS32 PSPKLELKVGNSLFLDKRLKPRQHYLDSIKELYGAFAF--SANFTDSVTTGRQINDYLRR
130 140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 VT-GWKTGCSLTGASVDSTLAFNTYVHFQGKMKG-FS-LLAEPQE-FWVDNSTSVSVPML
: : . : : : :. ... .:. :..: : :: .. :: :.::. ::..:::.
CCDS32 QTYGQVVDC-LPEFSQDTFMVLANYIFFKAKWKHPFSRYQTQKQESFFVDERTSLQVPMM
190 200 210 220 230 240
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pF1KB5 SGMGTFQHWSDIQDNFSVTQVPFTESACLLLIQPHYASDLDKVEGLTFQQNSLNWMKKLS
. : . .: :. . .: ::. : . . .::. :. .: . :
CCDS32 HQKEMHRFLYDQDLACTVLQIEYRGNALALLVLPD-PGKMKQVEAALQPQTLRKWGQLLL
250 260 270 280 290 300
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pF1KB5 PRTIHLTMPQLVLQGSYDLQDLLAQAELPAILHTELNLQKLSNDRIR-VGEVLNSIFFEL
: . : .:.. ..:.:.:.:.: : : ::. : ... .... . ...: .. . ..
CCDS32 PSLLDLHLPRFSISGTYNLEDILPQIGLTNILNLEADFSGVTGQLNKTISKVSHKAMVDM
310 320 330 340 350 360
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pF1KB5 EADEREPTESTQQLNKPEVLEVT------LNRPFLFAVYDQSATALHFLGRVANPLSTA
: .. :..: :.. .:::::. ... .. .: :::.:.::..
CCDS32 SEKGTEAGAASGLLSQPPSLNTMSDPHAHFNRPFLLLLWEVTTQSLLFLGKVVNPVAG
370 380 390 400 410 420
>>CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 (444 aa)
initn: 155 init1: 103 opt: 286 Z-score: 339.5 bits: 72.1 E(32554): 1.4e-12
Smith-Waterman score: 296; 25.0% identity (53.8% similar) in 452 aa overlap (59-481:23-441)
30 40 50 60 70 80
pF1KB5 GLAAGDRVYIHPFHLVIHNESTCEQLAKANAGKPKDPTFIPAPIQAKTSPV---DEKALQ
: .:..: ::: : .:: : .. .
CCDS99 MKVVPSLLLSVLLAQVWLVPGLAPSPQSPE-TPAP-QNQTSRVVQAPKEEEE
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130
pF1KB5 DQLVLVAAKLDTEDKL-----RAAMVGMLANFLGFRIYGMHSELWGVVH-GATVLSPTAV
:. : . :.: : .. .:: :: . : . : : :.:: ..
CCDS99 DEQEASEEKASEEEKAWLMASRQQLAKETSNF-GFSLLRKIS----MRHDGNMVFSPFGM
60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 FGTLASLYLGALDHTADRLQAILGVPWKDKNCTSRLDAHKVLSALQAVQ-GLLVA--QG-
....:.::: : ... : : :.::. .. ::: . .:
CCDS99 SLAMTGLMLGATGPTETQIKRGL---------------H--LQALKPTKPGLLPSLFKGL
110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 RADSQAQLLLSTVVG--VFTAPGLHLKQPFVQGLALYTPV-VLPRSLDFTELDVAAEKID
: . .: :. . : .: . .:. : . : . .: ..: . . : . ..
CCDS99 RETLSRNLELGLTQGSFAFIHKDFDVKETFFNLSKRYFDTECVP--MNFRNASQAKRLMN
150 160 170 180 190 200
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pF1KB5 RFMQAVTGWKTGCSLTGASVDSTLAFNTYVHFQGK-MKGFS-LLAEPQEFWVDNSTSVSV
.... : : . . .. : . :. :.:: . :. ...: . : .:. ...:
CCDS99 HYINKETRGKIPKLFDEINPETKLILVDYILFKGKWLTPFDPVFTEVDTFHLDKYKTIKV
210 220 230 240 250 260
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pF1KB5 PMLSGMGTFQHWSDIQDNFS--VTQVPFTESACLLLIQPHYASDLDKVEGLTFQQNSLNW
::. : : : : .. :: : ..:. .: .:.. . .: .: . .:
CCDS99 PMMYGAGKFA--STFDKNFRCHVLKLPYQGNATMLVVLMEKMGDHLALEDYLTTDLVETW
270 280 290 300 310 320
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pF1KB5 MKKLSPRTIHLTMPQLVLQGSYDLQDLLAQAELPAILHTELNLQKLSND--RIRVGEVLN
..... :.... .:.. :. .:....:: : . :. .:..:: ..:..::.
CCDS99 LRNMKTRNMEVFFPKFKLDQKYEMHELLRQMGIRRIFSPFADLSELSATGRNLQVSRVLQ
330 340 350 360 370 380
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pF1KB5 SIFFELEADEREPTESTQQL-------NKPEVLEVTLNRPFLFAVYDQSATALHFLGRVA
.:.::: ::.. . . : :..: .::: : .:.... : :::::.
CCDS99 RTV--IEVDER-GTEAVAGILSEITAYSMPPVIKV--DRPFHFMIYEETSGMLLFLGRVV
390 400 410 420 430
480
pF1KB5 NPLSTA
::
CCDS99 NPTLL
440
>>CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 (418 aa)
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..: . : ..:... :.. : . .:..: :. . . . : ...
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. : : : .:.: :. : .....: .........:.... . :....::.. :..
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CCDS82 SLLFIGRLVRPKGDKMRDEL
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CCDS99 VFNRPFLMFIVDNN---ILFLGKVNRP
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CCDS32 AQSQFIANHPFLFIMKHNPTESILFMGRVTNPDTQEIKGRDLDSL
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CCDS75 SQASRCSAQKNTEFAVDLYQEVSLSHKDNIIFSPLGITLVLEMVQLGAKGKAQQQIRQTL
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CCDS75 YLHGNKEFFQSAI-KLVDFQDAKACAEMISTWVERKTDGKIKDMFSGEEFGPLTRLVLVN
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CCDS75 AIYFKGDWKQKFRKEDTQLINFTKKNGSTVKIPMMKALLRTKYGYFSESSLNYQVLELSY
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CCDS75 LYSLNITEIFSGGCDLSGITDSSEVYVSQVTQKVFFEINEDGSEAATSTG-IHIPVIMSL
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