Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5081
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5081, 541 aa
1>>>pF1KB5081 541 - 541 aa - 541 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8077+/-0.000843; mu= 15.7961+/- 0.051
mean_var=66.9373+/-13.908, 0's: 0 Z-trim(106.8): 26 B-trim: 282 in 1/50
Lambda= 0.156762
statistics sampled from 9196 (9222) to 9196 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 3.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12692.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 541) 3437 786.3 0
CCDS46125.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 339) 2166 498.8 4.3e-141
CCDS46126.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 313) 2008 463.0 2.3e-130
CCDS1879.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 532) 1891 436.6 3.4e-122
CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 496) 1019 239.4 7.4e-63
CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 542) 1019 239.4 8e-63
CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 ( 524) 972 228.8 1.2e-59
CCDS12321.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 564) 944 222.5 1.1e-57
CCDS574.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 560) 909 214.6 2.5e-55
CCDS72796.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 472) 904 213.4 4.8e-55
CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 565) 905 213.7 4.8e-55
CCDS31459.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 574) 905 213.7 4.9e-55
CCDS78003.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 430) 840 198.9 1e-50
CCDS54844.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 497) 757 180.2 5.1e-45
CCDS54362.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 234) 708 169.0 5.6e-42
CCDS72797.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 619) 537 130.4 5.9e-30
CCDS62578.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 312) 430 106.2 6.1e-23
CCDS72798.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 158) 293 75.1 7e-14
>>CCDS12692.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 (541 aa)
initn: 3437 init1: 3437 opt: 3437 Z-score: 4196.8 bits: 786.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3437; 99.6% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MVADPPRDSKGLAAAEPTANGGLALASIEDQGAAAGGYCGSRDQVRRCLRANLLVLLTVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MVADPPRDSKGLAAAEPTANGGLALASIEDQGAAAGGYCGSRDQVRRCLRANLLVLLTVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 AVVAGVALGLGVSGAGGALALGPERLSAFVFPGELLLRLLRMIILPLVVCSLIGGAASLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AVVAGVALGLGVSGAGGALALGPERLSAFVFPGELLLRLLRMIILPLVVCSLIGGAASLD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PGALGRLGAWALLFFLVTTLLASALGVGLALALQPGAASAAINASVGAAGSAENAPSKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGALGRLGAWALLFFLVTTLLASALGVGLALALQPGAASAAINASVGAAGSAENAPSKEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LDSFLDLARNIFPSNLVSAAFRSYSTTYEERNITGTRVKVPVGQEVEGMNILGLVVFAIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDSFLDLARNIFPSNLVSAAFRSYSTTYEERNITGTRVKVPVGQEVEGMNILGLVVFAIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 FGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIVEMEDVGLLFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIVEMEDVGLLFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGTSSSSATLPLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGTSSSSATLPLM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 MKCVEENNGVVKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQSLDFVKIITILVT
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MKCVEENNGVAKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQSLDFVKIITILVT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVLNVEGDALGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVLNVEGDALGAG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDPLPLPTEEGNPLLKHYRGPAGDATVASEKESV
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDPLPVPTEEGNPLLKHYRGPAGDATVASEKESV
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 M
:
CCDS12 M
>>CCDS46125.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 (339 aa)
initn: 2166 init1: 2166 opt: 2166 Z-score: 2646.6 bits: 498.8 E(32554): 4.3e-141
Smith-Waterman score: 2166; 99.4% identity (100.0% similar) in 338 aa overlap (204-541:2-339)
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NAPSKEVLDSFLDLARNIFPSNLVSAAFRSYSTTYEERNITGTRVKVPVGQEVEGMNILG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MYSTTYEERNITGTRVKVPVGQEVEGMNILG
10 20 30
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 LVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIVEME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIVEME
40 50 60 70 80 90
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGTSSS
100 110 120 130 140 150
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SATLPLMMKCVEENNGVVKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQSLDFVK
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SATLPLMMKCVEENNGVAKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQSLDFVK
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 IITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVLNVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVLNVE
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 GDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDPLPLPTEEGNPLLKHYRGPAGDATV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS46 GDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDPLPVPTEEGNPLLKHYRGPAGDATV
280 290 300 310 320 330
540
pF1KB5 ASEKESVM
::::::::
CCDS46 ASEKESVM
>>CCDS46126.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 (313 aa)
initn: 2008 init1: 2008 opt: 2008 Z-score: 2454.0 bits: 463.0 E(32554): 2.3e-130
Smith-Waterman score: 2008; 99.4% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (229-541:1-313)
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 AAFRSYSTTYEERNITGTRVKVPVGQEVEGMNILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MNILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRF
10 20 30
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 FNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIVEMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIVEMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGL
40 50 60 70 80 90
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 LVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGTSSSSATLPLMMKCVEENNGVVKHISRFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS46 LVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGTSSSSATLPLMMKCVEENNGVAKHISRFI
100 110 120 130 140 150
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 LPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQSLDFVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQSLDFVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLT
160 170 180 190 200 210
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 LAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVLNVEGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVLNVEGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPEL
220 230 240 250 260 270
500 510 520 530 540
pF1KB5 IQVKSELPLDPLPLPTEEGNPLLKHYRGPAGDATVASEKESVM
:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IQVKSELPLDPLPVPTEEGNPLLKHYRGPAGDATVASEKESVM
280 290 300 310
>>CCDS1879.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 (532 aa)
initn: 1798 init1: 1269 opt: 1891 Z-score: 2307.3 bits: 436.6 E(32554): 3.4e-122
Smith-Waterman score: 1891; 60.9% identity (81.9% similar) in 524 aa overlap (32-541:17-532)
10 20 30 40 50
pF1KB5 VADPPRDSKGLAAAEPTANGGLALASIEDQGAAAG-GYCGSR-DQVRRC---LRANLLVL
: ::: : :. ..::: :: . :::
CCDS18 MEKSNETNGYLDSAQAGPAAGPGAPGTAAGRARRCAGFLRRQALVL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LTVVAVVAGVALGLGVSGAGGALALGPERLSAFVFPGELLLRLLRMIILPLVVCSLIGGA
::: .:.::..:: .. : :.:. ... ..::::.:::.:::::::::::::..::
CCDS18 LTVSGVLAGAGLGAALRG----LSLSRTQVTYLAFPGEMLLRMLRMIILPLVVCSLVSGA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 ASLDPGALGRLGAWALLFFLVTTLLASALGVGLALALQPGAASAAINAS-VGAAGSAENA
:::: . :::::. :. .: .::: ::::.:.::. ..::... ....: .: :.
CCDS18 ASLDASCLGRLGGIAVAYFGLTTLSASALAVALAFIIKPGSGAQTLQSSDLGLEDSGPPP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 PSKEVLDSFLDLARNIFPSNLVSAAFRSYSTTYE---ERNITG--TRVKVPVGQEVEGMN
::..:::::::::.:::::: ::::.:.: :. . . .: :. :.:.: :.::::
CCDS18 VPKETVDSFLDLARNLFPSNLVVAAFRTYATDYKVVTQNSSSGNVTHEKIPIGTEIEGMN
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 ILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIV
:::::.::.:.::::.::: ::: :::::::.::::::::::::::.::::::::..:::
CCDS18 ILGLVLFALVLGVALKKLGSEGEDLIRFFNSLNEATMVLVSWIMWYVPVGIMFLVGSKIV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGT
::.:. .: . :::::. .:::.::: .:::::::.::::::.::: :...:.::::.:
CCDS18 EMKDIIVLVTSLGKYIFASILGHVIHGGIVLPLIYFVFTRKNPFRFLLGLLAPFATAFAT
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SSSSATLPLMMKCVEENNGVVKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQSLD
::::::: ::::.:::::: :.::::::::::::::::::.::::::::::::.. :.
CCDS18 CSSSATLPSMMKCIEENNGVDKRISRFILPIGATVNMDGAAIFQCVAAVFIAQLNNVELN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 FVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVL
.:.:::::::::::::::.:::::::.::::::..::. . :::::::.:::. ::.
CCDS18 AGQIFTILVTATASSVGAAGVPAGGVLTIAIILEAIGLPTHDLPLILAVDWIVDRTTTVV
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 NVEGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDPLPLPTEEGNPLLKHYRGPAGD
::::::::::.:. .... ... : :: .:: : : :: .::. : ..:::
CCDS18 NVEGDALGAGILH-HLNQKATKKGEQELAEVKVEAI--PNCKSEEETSPLVTH-QNPAGP
470 480 490 500 510
540
pF1KB5 ATVASE---KESVM
.. : : ::::.
CCDS18 VASAPELESKESVL
520 530
>>CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (496 aa)
initn: 1150 init1: 1004 opt: 1019 Z-score: 1242.0 bits: 239.4 E(32554): 7.4e-63
Smith-Waterman score: 1188; 45.5% identity (73.7% similar) in 426 aa overlap (99-498:45-463)
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GLGVSGAGGALALGPERLSAFVFPGELLLRLLRMIILPLVVCSLIGGAASLDPGALGRLG
:.: .. :.: ..: : :.:: : :..:
CCDS78 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGMAALDSKASGKMG
20 30 40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 AWALLFFLVTTLLASALGVGLALALQPGAASAAINASVGAAGSAENAPSKEVLDSFLDLA
:......::..: ..:. ... ..:: .. : . : :.::::
CCDS78 MRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAA------DAFLDLI
80 90 100 110 120
190 200 210 220
pF1KB5 RNIFPSNLVSAAFRSYSTTYEERNI-----------------------TGTRVK---VPV
::.:: ::: : :....:.::.:.. : ::. :::
CCDS78 RNMFPPNLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPV
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GQEVEGMNILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIM
:.:.: ::::::.. :: .. .. .:. : .::.:.::: : ::. :::::::::.
CCDS78 PGSVNGVNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGIL
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 FLVAGKIVEMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVT
::.:::::::::.:.. ..:. : . ..: ::...::::.::: :::::. :. :..
CCDS78 FLIAGKIVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQ
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 PLATAFGTSSSSATLPLMMKCVEENNGVVKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIA
: ::.::::::::::. .::.:::::: :...::.::.:::.::::.::.. .::.:::
CCDS78 ALITALGTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIA
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 QLSQQSLDFVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAVDWL
:... :.: .:::: .::::.:.:::::: .:..:..:.: .:.::.: :.::.::::.
CCDS78 QVNNFELNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWF
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 VDRSCTVLNVEGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDPLPLPTEEGNPLLK
.:: :. :: ::.::::... ...: : .. . :.
CCDS78 LDRLRTTTNVLGDSLGAGIVE-HLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETE
430 440 450 460 470 480
530 540
pF1KB5 HYRGPAGDATVASEKESVM
CCDS78 KPIDSETKM
490
>>CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (542 aa)
initn: 1369 init1: 1004 opt: 1019 Z-score: 1241.3 bits: 239.4 E(32554): 8e-63
Smith-Waterman score: 1340; 45.2% identity (72.8% similar) in 489 aa overlap (41-498:37-509)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 GLAAAEPTANGGLALASIEDQGAAAGGYCGSRDQVRRCLRANLLVLLTVVAVVAGVALGL
....:. : : .:::::.::..:. ::.
CCDS39 EEPKMGGRMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGF
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120
pF1KB5 GVSGAGGALALGPERLSA-----FVFPGELLLRLLRMIILPLVVCSLIGGAASLDPGALG
.: : :.: : ::::::.:.:.:..:::.. ::. : :.:: : :
CCDS39 ---------TLRPYRMSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASG
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RLGAWALLFFLVTTLLASALGVGLALALQPGAASAAINASVGAAGSAENAPSKEVLDSFL
..: :......::..: ..:. ... ..:: .. : . : :.::
CCDS39 KMGMRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKENMHREGKIVRVTAA------DAFL
120 130 140 150 160 170
190 200 210
pF1KB5 DLARNIFPSNLVSAAFRSYSTTYEERNI-----------------------TGTRVK---
:: ::.:: ::: : :....:.::.:.. : ::.
CCDS39 DLIRNMFPPNLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEEL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 VPVGQEVEGMNILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPV
::: :.:.: ::::::.. :: .. .. .:. : .::.:.::: : ::. :::::::
CCDS39 VPVPGSVNGVNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 GIMFLVAGKIVEMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWG
::.::.:::::::::.:.. ..:. : . ..: ::...::::.::: :::::. :. :
CCDS39 GILFLIAGKIVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 IVTPLATAFGTSSSSATLPLMMKCVEENNGVVKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAV
.. : ::.::::::::::. .::.:::::: :...::.::.:::.::::.::.. .::.
CCDS39 LLQALITALGTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAI
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 FIAQLSQQSLDFVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAV
::::... :.: .:::: .::::.:.:::::: .:..:..:.: .:.::.: :.::.::
CCDS39 FIAQVNNFELNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAV
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 DWLVDRSCTVLNVEGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDPLPLPTEEGNP
::..:: :. :: ::.::::... ...: : .. . :.
CCDS39 DWFLDRLRTTTNVLGDSLGAGIVE-HLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDN
480 490 500 510 520 530
520 530 540
pF1KB5 LLKHYRGPAGDATVASEKESVM
CCDS39 ETEKPIDSETKM
540
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20 30 40 50 60 70
pF1KB5 EPTANGGLALASIEDQGAAAGGYCGSRDQVRRCLRANLLVLLTVVAVVAGVALGLGVSGA
.: :. : ..: ::.::: :.. :. :
CCDS64 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREH
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 GGALALGPERLSAFVFPGELLLRLLRMIILPLVVCSLIGGAASLDPGALGRLGAWALLFF
.. .: :.. :.::::.:.:.:..:::::.. :.: :.:.:: .. :..: :....
CCDS64 SNLSTL--EKFY-FAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYY
50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 LVTTLLASALGVGLALALQPGAASAAINASVGAAGSAENAPSKEVLDSFLDLARNIFPSN
. :::.: ::. :.....:: .. .:: . . ..: ..:..::: ::.:: :
CCDS64 FCTTLIAVILGIVLVVSIKPG-----VTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPEN
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230
pF1KB5 LVSAAFRSYSTTYEE--------RNIT---------------GTRVKVPVGQEVEGMNIL
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CCDS64 LVQACFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIVEM
::.:: .:::... :.: .:..:. :::....::: .:. :: : :.::.::.::::.:.
CCDS64 GLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGTSS
:: . : .:: :. : : :::....::::::. .::::.:: :.. : ::. ::
CCDS64 EDWEI-FRKLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISS
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SSATLPLMMKCVEENNGVVKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFIAQLSQQSLDFV
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CCDS64 SSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIG
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 KIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVLNV
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CCDS64 QIITISITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNV
400 410 420 430 440 450
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pF1KB5 EGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPL-DPLPLPTEEGNPLLKHYRGPAGDA
:::.:.:.... . : : ..:.::. . .:. : .
CCDS64 LGDAFGTGIVEKLSKK------ELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNG
460 470 480 490 500
540
pF1KB5 TVASEKESVM
CCDS64 GFAVDKSDTISFTQTSQF
510 520
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20 30 40 50 60 70
pF1KB5 AAAEPTANGGLALASIEDQGAAAGGYCGSRDQVRRCLRANLLVLLTVVAVVAGVALGLGV
..: : :: : ..:::: ::: ::.:....
CCDS12 LGRVGWLQRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFAL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 SGAGGALALGPERLSAFVFPGELLLRLLRMIILPLVVCSLIGGAASLDPGALGRLGAWAL
: .... : ::::::.:.:.:..:::.: ::. : :::: : ::.: :
CCDS12 R----PYQLTYRQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAA
80 90 100 110 120 130
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pF1KB5 LFFLVTTLLASALGVGLALALQPGAASAAINASVGAAGSAENAPSKEVLDSFLDLARNIF
....:::..: .:. .. ..:: .: . .. : :. :. :.:.:: ::.:
CCDS12 VYYMVTTIIAVFIGILMVTIIHPGKGS---KEGLHREGRIETIPTA---DAFMDLIRNMF
140 150 160 170 180
200 210
pF1KB5 PSNLVSAAFRSYSTTYEERNITGTRVK---------------------------------
: ::: : :....: : : .: : :.
CCDS12 PPNLVEACFKQFKTQYSTRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB5 ----------VPVGQEVEGMNILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVL
::: ..:.: ::::::...::... . .:..: ::.:.::: : :
CCDS12 LQEMLSFEETVPVPGSANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRL
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 VSWIMWYAPVGIMFLVAGKIVEMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFT
:. :.:::::::.::.::::.::::...: ..:: : : ..: .:. .:::::::: :
CCDS12 VGIIIWYAPVGILFLIAGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVT
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 RKNPYRFLWGIVTPLATAFGTSSSSATLPLMMKCVEENNGVVKHISRFILPIGATVNMDG
..::. :. :.. : ::.::::::::::. ..:.::. :: ..:.::.::.::::::::
CCDS12 HRNPFPFIGGMLQALITAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDG
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 AALFQCVAAVFIAQLSQQSLDFVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLP
.::.. .::.::::... :.. .: :: .::::.:::::::: .:..:..:.: .:.::
CCDS12 TALYEALAAIFIAQVNNYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLP
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 VDHISLILAVDWLVDRSCTVLNVEGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDP
.. :.::.::::..:: :. :: ::..::..... .: : . : :: . :
CCDS12 TEDITLIIAVDWFLDRLRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQR-ELELQEAELTLPSLGKPYKS
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540
pF1KB5 LPLPTEEGNPLLKHYRGPAGDATVASEKESVM
: . :.: :: .:. .
CCDS12 L-MAQEKGAS-----RGRGGNESAM
550 560
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20 30 40 50 60 70
pF1KB5 TANGGLALASIEDQGAAAGGYCGSRDQVRRCLRANLLVLLTVVAVVAGVALGLGVSGAGG
: : .::.: .:..:..: ::. .
CCDS57 MVPHAILARGRDVCRRNGLLIL-SVLSVIVGCLLGFFLR----
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80 90 100 110 120 130
pF1KB5 ALALGPERLSAFVFPGELLLRLLRMIILPLVVCSLIGGAASLDPGALGRLGAWALLFFLV
. :.:...: : ::::::.:.:.:.:::::: ::..: :::: . .:::. .. ..:
CCDS57 TRRLSPQEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLW
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 TTLLASALGVGLALALQPGAASAAINASVGAAGSAENAPSKEVLDSFLDLARNIFPSNLV
::..: .:. .. ..:: ::: . .. .:. : :..::: ::.::.:::
CCDS57 TTFMAVIVGIFMVSIIHPG--SAAQKETTEQSGK----PIMSSADALLDLIRNMFPANLV
100 110 120 130 140 150
200 210 220
pF1KB5 SAAFRSYSTTY-----------EE---RNI--------TGTRVK------VPVGQEV---
:.:..: : :: : : .:..:. .: . :
CCDS57 EATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKS
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 -----EGMNILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIRFFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGI
.:::.::.: :. ..:. : ..: : :. : . .::..: .:. .:: : ::
CCDS57 EPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGI
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 MFLVAGKIVEMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHGLLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIV
.::.::::.::.: . .:: : . . : ..:::..:::.::..:.::: :. ::.
CCDS57 VFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGIL
280 290 300 310 320 330
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pF1KB5 TPLATAFGTSSSSATLPLMMKCVEENNGVVKHISRFILPIGATVNMDGAALFQCVAAVFI
: :..:::::::::. .::. ::: . ..:.::.::.:::.::::.::.. :::.::
CCDS57 QALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFI
340 350 360 370 380 390
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pF1KB5 AQLSQQSLDFVKIITILVTATASSVGAAGIPAGGVLTLAIILEAVNLPVDHISLILAVDW
::... ::: .:::: .::::.:.:::::: .:..:..:.: .:.::.: :.::.::::
CCDS57 AQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDW
400 410 420 430 440 450
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pF1KB5 LVDRSCTVLNVEGDALGAGLLQNYVDRTESRSTEPELIQVKSELPLDPLPLPTEEGNPLL
.:: :..:: ::::.::.. . . .:.: : . :: . :. .:
CCDS57 ALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKL-----LPCETKPVSLQEIVAAQ
460 470 480 490 500
530 540
pF1KB5 KHYRGPAGDATVASEKESVM
CCDS57 QNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQVEQDEELPAASLNHCTIQISELETNV
510 520 530 540 550 560
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20 30 40 50 60 70
pF1KB5 TANGGLALASIEDQGAAAGGYCGSRDQVRRCLRANLLVLLTVVAVVAGVALGLGVSGAGG
: : .::.: .:..:..: ::. .
CCDS72 MVPHAILARGRDVCRRNGLLIL-SVLSVIVGCLLGFFLR----
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 ALALGPERLSAFVFPGELLLRLLRMIILPLVVCSLIGGAASLDPGALGRLGAWALLFFLV
. :.:...: : ::::::.:.:.:.:::::: . .. :. : . : .
CCDS72 TRRLSPQEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVV------SRNMFPANL--VEATFKQYRTK
40 50 60 70 80 90
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pF1KB5 TTLLASALGVGLALALQPGAASAAINASVGAAGSAENAPSKEVLDSFLDLARNIFPSNLV
:: .... : : : . : :. :. : . :::. : ..:
CCDS72 TTPVVKSPKV---------APEEAPPRRILIYGVQEENGSH-VQNFALDLTP---PPEVV
100 110 120 130
200 210 220 230 240 250
pF1KB5 SAAFRSYSTTYEERNITGTRVKVPVGQEVEGMNILGLVVFAIVFGVALRKLGPEGELLIR
..: :: .:::.::.: :. ..:. : ..: : :.
CCDS72 ---YKSEP---------GTS---------DGMNVLGIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVS
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pF1KB5 FFNSFNEATMVLVSWIMWYAPVGIMFLVAGKIVEMEDVGLLFARLGKYILCCLLGHAIHG
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CCDS72 FCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHG
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 LLVLPLIYFLFTRKNPYRFLWGIVTPLATAFGTSSSSATLPLMMKCVEENNGVVKHISRF
:..:::.::..:.::: :. ::. : :..:::::::::. .::. ::: . ..:.::
CCDS72 LFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLENNHIDRRIARF
240 250 260 270 280 290
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.::.:::.::::.::.. :::.::::... ::: .:::: .::::.:.:::::: .:..
CCDS72 VLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLV
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pF1KB5 TLAIILEAVNLPVDHISLILAVDWLVDRSCTVLNVEGDALGAGLLQNYVDRTESRST---
:..:.: .:.::.: :.::.:::: .:: :..:: ::::.::.. . . .:.:
CCDS72 TMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTE
360 370 380 390 400 410
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pF1KB5 ----EPELIQVK---SELPLD---PLPLPTEEGNPLLKHYRGPAGDATVASEKESVM
:: .. :: : : : :: . :. . ::
CCDS72 TCFPSPETAALRDQASEPPGDRGSPAEWLCEECSRGLRAHPGPHLPPPRPRSSGAG
420 430 440 450 460 470
541 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 12:21:46 2016 done: Sat Nov 5 12:21:46 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]