Result of FASTA (ccds) for
pF1KB5045
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5045, 653 aa
1>>>pF1KB5045 653 - 653 aa - 653 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2153+/-0.00131; mu= 4.0931+/- 0.077
mean_var=177.1698+/-35.750, 0's: 0 Z-trim(105.1): 198 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.096356
statistics sampled from 8029 (8249) to 8029 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 ( 653) 4352 618.5 8.9e-177
CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11 ( 640) 2295 332.6 1e-90
CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 ( 713) 2005 292.3 1.6e-78
CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 614) 505 83.7 8.2e-16
CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 620) 505 83.7 8.2e-16
CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9 ( 606) 468 78.6 2.9e-14
CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3 (1093) 460 77.6 9.8e-14
CCDS30855.1 LINGO4 gene_id:339398|Hs108|chr1 ( 593) 451 76.2 1.4e-13
CCDS5754.1 LRRN3 gene_id:54674|Hs108|chr7 ( 708) 450 76.1 1.8e-13
CCDS30808.1 LRIG2 gene_id:9860|Hs108|chr1 (1065) 453 76.7 1.9e-13
CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19 ( 592) 444 75.2 2.8e-13
CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059) 432 73.7 1.4e-12
CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119) 432 73.8 1.5e-12
CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 ( 560) 420 71.9 2.7e-12
CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20 ( 649) 421 72.1 2.8e-12
CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 ( 359) 409 70.2 5.5e-12
CCDS47855.1 PXDNL gene_id:137902|Hs108|chr8 (1463) 416 71.6 8.6e-12
CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 ( 545) 399 69.0 2e-11
CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 395 68.6 4.6e-11
>>CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 (653 aa)
initn: 4352 init1: 4352 opt: 4352 Z-score: 3287.2 bits: 618.5 E(32554): 8.9e-177
Smith-Waterman score: 4352; 100.0% identity (100.0% similar) in 653 aa overlap (1-653:1-653)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLLWQVTVHHHTWNAILLPFVYLTAQVWILCAAIAAAASAGPQNCPSVCSCSNQFSKVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MKLLWQVTVHHHTWNAILLPFVYLTAQVWILCAAIAAAASAGPQNCPSVCSCSNQFSKVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CTRRGLSEVPQGIPSNTRYLNLMENNIQMIQADTFRHLHHLEVLQLGRNSIRQIEVGAFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CTRRGLSEVPQGIPSNTRYLNLMENNIQMIQADTFRHLHHLEVLQLGRNSIRQIEVGAFN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GLASLNTLELFDNWLTVIPSGAFEYLSKLRELWLRNNPIESIPSYAFNRVPSLMRLDLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 GLASLNTLELFDNWLTVIPSGAFEYLSKLRELWLRNNPIESIPSYAFNRVPSLMRLDLGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LKKLEYISEGAFEGLFNLKYLNLGMCNIKDMPNLTPLVGLEELEMSGNHFPEIRPGSFHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LKKLEYISEGAFEGLFNLKYLNLGMCNIKDMPNLTPLVGLEELEMSGNHFPEIRPGSFHG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LSSLKKLWVMNSQVSLIERNAFDGLASLVELNLAHNNLSSLPHDLFTPLRYLVELHLHHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LSSLKKLWVMNSQVSLIERNAFDGLASLVELNLAHNNLSSLPHDLFTPLRYLVELHLHHN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PWNCDCDILWLAWWLREYIPTNSTCCGRCHAPMHMRGRYLVEVDQASFQCSAPFIMDAPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PWNCDCDILWLAWWLREYIPTNSTCCGRCHAPMHMRGRYLVEVDQASFQCSAPFIMDAPR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 DLNISEGRMAELKCRTPPMSSVKWLLPNGTVLSHASRHPRISVLNDGTLNFSHVLLSDTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DLNISEGRMAELKCRTPPMSSVKWLLPNGTVLSHASRHPRISVLNDGTLNFSHVLLSDTG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VYTCMVTNVAGNSNASAYLNVSTAELNTSNYSFFTTVTVETTEISPEDTTRKYKPVPTTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VYTCMVTNVAGNSNASAYLNVSTAELNTSNYSFFTTVTVETTEISPEDTTRKYKPVPTTS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 TGYQPAYTTSTTVLIQTTRVPKQVAVPATDTTDKMQTSLDEVMKTTKIIIGCFVAVTLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 TGYQPAYTTSTTVLIQTTRVPKQVAVPATDTTDKMQTSLDEVMKTTKIIIGCFVAVTLLA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 AAMLIVFYKLRKRHQQRSTVTAARTVEIIQVDEDIPAATSAAATAAPSGVSGEGAVVLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AAMLIVFYKLRKRHQQRSTVTAARTVEIIQVDEDIPAATSAAATAAPSGVSGEGAVVLPT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB5 IHDHINYNTYKPAHGAHWTENSLGNSLHPTVTTISEPYIIQTHTKDKVQETQI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 IHDHINYNTYKPAHGAHWTENSLGNSLHPTVTTISEPYIIQTHTKDKVQETQI
610 620 630 640 650
>>CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11 (640 aa)
initn: 2312 init1: 1702 opt: 2295 Z-score: 1741.9 bits: 332.6 E(32554): 1e-90
Smith-Waterman score: 2399; 55.3% identity (81.3% similar) in 653 aa overlap (6-653:11-640)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MKLLWQVTVHHHTWNAILLPFVYLTAQVWILCAAIAAAASAGPQNCPSVCSCSNQ
:. . . :.. :.. . . .: ..:. . : :.::::::::::
CCDS31 MLNKMTLHPQQIMIGPRFNRALFDPLLVVLLALQLL--VVAGLVRA--QTCPSVCSCSNQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FSKVVCTRRGLSEVPQGIPSNTRYLNLMENNIQMIQADTFRHLHHLEVLQLGRNSIRQIE
::::.:.:..: :::.:: .::: ::: ::.::.:....:.::.:::.:::.:: :: ::
CCDS31 FSKVICVRKNLREVPDGISTNTRLLNLHENQIQIIKVNSFKHLRHLEILQLSRNHIRTIE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 VGAFNGLASLNTLELFDNWLTVIPSGAFEYLSKLRELWLRNNPIESIPSYAFNRVPSLMR
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CCDS31 IGAFNGLANLNTLELFDNRLTTIPNGAFVYLSKLKELWLRNNPIESIPSYAFNRIPSLRR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 LDLGELKKLEYISEGAFEGLFNLKYLNLGMCNIKDMPNLTPLVGLEELEMSGNHFPEIRP
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CCDS31 LDLGELKRLSYISEGAFEGLSNLRYLNLAMCNLREIPNLTPLIKLDELDLSGNHLSAIRP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 GSFHGLSSLKKLWVMNSQVSLIERNAFDGLASLVELNLAHNNLSSLPHDLFTPLRYLVEL
:::.:: :.:::...::...:::::::.: ::::.:::::::. :::::::::..: ..
CCDS31 GSFQGLMHLQKLWMIQSQIQVIERNAFDNLQSLVEINLAHNNLTLLPHDLFTPLHHLERI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 HLHHNPWNCDCDILWLAWWLREYIPTNSTCCGRCHAPMHMRGRYLVEVDQASFQCSAPFI
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CCDS31 HLHHNPWNCNCDILWLSWWIKDMAPSNTACCARCNTPPNLKGRYIGELDQNYFTCYAPVI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 MDAPRDLNISEGRMAELKCR-TPPMSSVKWLLPNGTVLSHASRHPRISVLNDGTLNFSHV
.. : :::..:: :::::: . ..::.:. :::::..:.. . ::.::.::::::..:
CCDS31 VEPPADLNVTEGMAAELKCRASTSLTSVSWITPNGTVMTHGAYKVRIAVLSDGTLNFTNV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LLSDTGVYTCMVTNVAGNSNASAYLNVSTAELNTSNYSFFTTVTVETTEISPEDTTRKYK
..:::.:::::.: .::..::: :::..: .:. .:.:.:::::: : : ... .
CCDS31 TVQDTGMYTCMVSNSVGNTTASATLNVTAA--TTTPFSYFSTVTVETMEPSQDEARTTDN
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 PV-PTTSTGYQPAYTTSTTVLIQTTR-VPKQVAVPATDTTDKMQTSLDEVMKTTKIIIGC
: :: . .. . .: :.. :.:: . : ..:.:: .. . ..:::::::::::::
CCDS31 NVGPTPVVDWETTNVT-TSLTPQSTRSTEKTFTIPVTDINSGIP-GIDEVMKTTKIIIGC
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 FVAVTLLAAAMLIVFYKLRKRHQQRSTVTAARTVEIIQVDEDIPAATSAAATAAPSGVSG
:::.::.::.::..:::.::.:.... . .::::::.::..: . :
CCDS31 FVAITLMAAVMLVIFYKMRKQHHRQNHHAPTRTVEIINVDDEITGDTPM-----------
540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 EGAVVLPTI-HDHIN-YNTYKPAHGAHWTENSLGNSLHPTVTTISEPYIIQTHTKDKVQE
:. . .:.: :.:.: ::.:: . : :.. ::.: ... :: .:. ..::.:::
CCDS31 ESHLPMPAIEHEHLNHYNSYKSPFNHTTTVNTI-NSIH---SSVHEPLLIRMNSKDNVQE
590 600 610 620 630
pF1KB5 TQI
:::
CCDS31 TQI
640
>>CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 (713 aa)
initn: 2358 init1: 1721 opt: 2005 Z-score: 1523.4 bits: 292.3 E(32554): 1.6e-78
Smith-Waterman score: 2386; 58.4% identity (79.7% similar) in 639 aa overlap (34-624:42-680)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 LWQVTVHHHTWNAILLPFVYLTAQVWILCAAIAAAASAG-PQ--NCPSVCSCSNQFSKVV
:...::..: : .:: .:::::: :.:.
CCDS42 LPPGRMSWPHGALLFLWLFSPPLGAGGGGVAVTSAAGGGSPPATSCPVACSCSNQASRVI
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CTRRGLSEVPQGIPSNTRYLNLMENNIQMIQADTFRHLHHLEVLQLGRNSIRQIEVGAFN
:::: :.::: .:: :::::::.::.::.:..:::.::.:::.:::..: .:.:::::::
CCDS42 CTRRDLAEVPASIPVNTRYLNLQENGIQVIRTDTFKHLRHLEILQLSKNLVRKIEVGAFN
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GLASLNTLELFDNWLTVIPSGAFEYLSKLRELWLRNNPIESIPSYAFNRVPSLMRLDLGE
:: :::::::::: ::..:. :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS42 GLPSLNTLELFDNRLTTVPTQAFEYLSKLRELWLRNNPIESIPSYAFNRVPSLRRLDLGE
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 LKKLEYISEGAFEGLFNLKYLNLGMCNIKDMPNLTPLVGLEELEMSGNHFPEIRPGSFHG
::.::::::.::::: ::.::::::::.::.:::: :: :::::.:::.. ::::::.:
CCDS42 LKRLEYISEAAFEGLVNLRYLNLGMCNLKDIPNLTALVRLEELELSGNRLDLIRPGSFQG
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 LSSLKKLWVMNSQVSLIERNAFDGLASLVELNLAHNNLSSLPHDLFTPLRYLVELHLHHN
:.::.:::.:..::. ::::::: : :: ::::.:::: ::::::::::. : ..::.::
CCDS42 LTSLRKLWLMHAQVATIERNAFDDLKSLEELNLSHNNLMSLPHDLFTPLHRLERVHLNHN
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PWNCDCDILWLAWWLREYIPTNSTCCGRCHAPMHMRGRYLVEVDQASFQCSAPFIMDAPR
::.:.::.:::.:::.: .:.:.:::.::::: ..:::. :.::. : : :: :.. :
CCDS42 PWHCNCDVLWLSWWLKETVPSNTTCCARCHAPAGLKGRYIGELDQSHFTCYAPVIVEPPT
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410
pF1KB5 DLNISEGRMAELKCRT-PPMSSVKWLLPNGTVLSHASRHPRISVLNDGTLNFSHVLLSDT
:::..:: ::::::: :.::.:: ::::...:.: . :::::.::::::..: ..::
CCDS42 DLNVTEGMAAELKCRTGTSMTSVNWLTPNGTLMTHGSYRVRISVLHDGTLNFTNVTVQDT
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450
pF1KB5 GVYTCMVTNVAGNSNASAYLNVSTAEL---------------------NTSNYSFFTTVT
: ::::::: :::..::: ::::... ....:..:::::
CCDS42 GQYTCMVTNSAGNTTASATLNVSAVDPVAAGGTGSGGGGPGGSGGVGGGSGGYTYFTTVT
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500
pF1KB5 VETTEISPEDT------TRKYKPVPTTST---GYQPA-----YTTSTTVLIQTTRVP--K
::: : .: . :.: : :::. : .:. ..:::. . : :
CCDS42 VETLETQPGEEALQPRGTEKEPPGPTTDGVWGGGRPGDAAGPASSSTTAPAPRSSRPTEK
500 510 520 530 540 550
510 520 530 540 550 560
pF1KB5 QVAVPATDTTDKMQTSLDEVMKTTKIIIGCFVAVTLLAAAMLIVFYKLRKRHQQRSTVTA
.:: ::.:.. .::.::::::::::::::.:..::.::..::::::.:: ..
CCDS42 AFTVPITDVTENALKDLDDVMKTTKIIIGCFVAITFMAAVMLVAFYKLRKQHQLHKHHGP
560 570 580 590 600 610
570 580 590 600 610
pF1KB5 ARTVEIIQVDEDIPAATS-----AAATAAPSGVSGEGAVVLPTIH-DHINYNTY-KPAHG
.::::::.:....:::.. :::.:. .::.:.. ..::... ::.:.. : :
CCDS42 TRTVEIINVEDELPAASAVSVAAAAAVASGGGVGGDSHLALPALERDHLNHHHYVAAAFK
620 630 640 650 660 670
620 630 640 650
pF1KB5 AHWTENSLGNSLHPTVTTISEPYIIQTHTKDKVQETQI
::.. : :
CCDS42 AHYSSNPSGGGCGGKGPPGLNSIHEPLLFKSGSKENVQETQI
680 690 700 710
>>CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 (614 aa)
initn: 622 init1: 338 opt: 505 Z-score: 397.4 bits: 83.7 E(32554): 8.2e-16
Smith-Waterman score: 606; 27.6% identity (53.3% similar) in 544 aa overlap (19-477:9-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MKLLWQVTVHHHTWNAILLPFVYLTAQVWILCAAIAAAASAGPQNCPSVCSCSNQFSKVV
.: :. :: ..... :.. .:: : :: : :.
CCDS73 MLAGGVRSMPSPLLACWQPILLLVLGSVLSGSATGCPPRCECSAQDRAVL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 CTRRGLSEVPQGIPSNTRYLNLMENNIQMIQADTFRHLHHLEVLQLGRNSIRQIEVGAFN
: :. . ::.:::..:: :.: .: :. .. : : . ::: :.:..: . .: ::::
CCDS73 CHRKRFVAVPEGIPTETRLLDLGKNRIKTLNQDEFASFPHLEELELNENIVSAVEPGAFN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GLASLNTLELFDNWLTVIPSGAFEYLSKLRELWLRNNPIESIPSYAFNRVPSLMRLDLGE
.: .: :: : .: : .:: :.: ::.: .: . .: : . .: :. . .: :..:.
CCDS73 NLFNLRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGD
120 130 140 150 160 170
190 200 210
pF1KB5 LKKLEYISEGAFEGLFNLKYLNLGMCNIKDMPN---------------------------
. : :::. :: :: .:. :.: ::. ..:.
CCDS73 -NDLVYISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSF
180 190 200 210 220
220
pF1KB5 -------------------LTP----------------------------LVGLEELEMS
.:: :: :. :..:
CCDS73 KRLYRLKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLS
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 GNHFPEIRPGSFHGLSSLKKLWVMNSQVSLIERNAFDGLASLVELNLAHNNLSSLPHDLF
: . :. . .: : :... ....:....: :: :: : ::.. :.:..: ...:
CCDS73 YNPISTIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVF
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TPLRYLVELHLHHNPWNCDCDILWL--AWWLREYIPTNSTCCGRCHAPMHMRGRYLVEVD
. : : : :: ::: .::. : .. . :: .: ..:. . .
CCDS73 HSVGNLETLILDSNPLACDCRLLWVFRRRWRLNFNRQQPTCA----TPEFVQGKEFKDFP
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390
pF1KB5 QA----SFQCSAPFIMD-APRDLNISEGRMAELKCRTP--PMSSVKWLLPNGTVLSHASR
.. : : : : ... ..::. ... ::. : .. :: : ..: :.
CCDS73 DVLLPNYFTCRRARIRDRKAQQVFVDEGHTVQFVCRADGDPPPAILWLSPRKHLVS-AKS
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 HPRISVLNDGTLNFSHVLLSDTGVYTCMVTNVAGNSNASAYLNVSTAELNTSNY--SFFT
. :..:. ::::. .. ..:.:.: :...:..::.. :.:.: . . . . :.
CCDS73 NGRLTVFPDGTLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFA
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 TVTVETTEISPEDTTRKYKPVPTTSTGYQPAYTTSTTVLIQTTRVPKQVAVPATDTTDKM
.. . : . ..:: : :
CCDS73 FISNQPGE-GEANSTRATVPFPFDIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNT
530 540 550 560 570 580
>>CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 (620 aa)
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10 20 30 40 50 60
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.: :. :: ..... :.. .:: : :: : :.
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10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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: :. . ::.:::..:: :.: .: :. .. : : . ::: :.:..: . .: ::::
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.: .: :: : .: : .:: :.: ::.: .: . .: : . .: :. . .: :..:.
CCDS45 NLFNLRTLGLRSNRLKLIPLGVFTGLSNLTKLDISENKIVILLDYMFQDLYNLKSLEVGD
120 130 140 150 160 170
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. : :::. :: :: .:. :.: ::. ..:.
CCDS45 -NDLVYISHRAFSGLNSLEQLTLEKCNLTSIPTEALSHLHGLIVLRLRHLNINAIRDYSF
180 190 200 210 220 230
220
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.:: :: :. :..:
CCDS45 KRLYRLKVLEISHWPYLDTMTPNCLYGLNLTSLSITHCNLTAVPYLAVRHLVYLRFLNLS
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230 240 250 260 270 280
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: . :. . .: : :... ....:....: :: :: : ::.. :.:..: ...:
CCDS45 YNPISTIEGSMLHELLRLQEIQLVGGQLAVVEPYAFRGLNYLRVLNVSGNQLTTLEESVF
300 310 320 330 340 350
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. : : : :: ::: .::. : .. . :: .: ..:. . .
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350 360 370 380 390
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.. : : : : ... ..::. ... ::. : .. :: : ..: :.
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. :..:. ::::. .. ..:.:.: :...:..::.. :.:.: . . . . :.
CCDS45 NGRLTVFPDGTLEVRYAQVQDNGTYLCIAANAGGNDSMPAHLHVRSYSPDWPHQPNKTFA
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460 470 480 490 500 510
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.. . : . ..:: : :
CCDS45 FISNQPGE-GEANSTRATVPFPFDIKTLIIATTMGFISFLGVVLFCLVLLFLWSRGKGNT
540 550 560 570 580
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.:. :.: .: .. .. . : :: ..:. : : ..: ::::.: .: .:.: : :
CCDS65 ETKILDLSKNRLKSVNPEEFISYPLLEEIDLSDNIIANVEPGAFNNLFNLRSLRLKGNRL
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..: :.: ::.: .: . .: : . .: :. . .: :..:. . : :::. :: ::
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..:. :.: :: :..::
CCDS65 LSLEQLTLEKCNLTAVPTEALSHLRSLISLHLKHLNINNMPVYAFKRLFHLKHLEIDYWP
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220 230 240
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::: : :: : .:..: : . :. : : :
CCDS65 LLDMMPANSLYGLNLTSLSVTNTNLSTVPFLAFKHLVYLTHLNLSYNPISTIEAGMFSDL
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250 260 270 280 290 300
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:..: ....:. :: ..:.:: : ::...: : .: ...:. : : : ...::
CCDS65 IRLQELHIVGAQLRTIEPHSFQGLRFLRVLNVSQNLLETLEENVFSSPRALEVLSINNNP
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350
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::: .::. :. . : .: .: : . . ... : :. : : .
CCDS65 LACDCRLLWILQ--RQPTLQFGGQQPMCAGPDTIRERSFKDFHSTALSFYFTCKKPKIRE
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360 370 380 390 400 410
pF1KB5 AP-RDLNISEGRMAELKCRTP--PMSSVKWLLPNGTVLSHASRHPRISVLNDGTLNFSHV
. : ..::. ..:.: . :. ..:. : .. : . : .::.::::.. .
CCDS65 KKLQHLLVDEGQTVQLECSADGDPQPVISWVTPRRRFITTKS-NGRATVLGDGTLEIRFA
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LLSDTGVYTCMVTNVAGNSNASAYLNVSTAELNTSNYSFFTTVTVETTEISPEDTTRKYK
.:.:.:.:...:.:::.. .: :.:
CCDS65 QDQDSGMYVCIASNAAGNDTFTASLTVKGFASDRFLYANRTPMYMTDSNDTISNGTNANT
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::.: ::.: .. ::: ::.....:.: : :. . ::.. :. :..: : :: : :
CCDS33 VLKLQRNNISKLTDGAFWGLSKMHVLHLEYNSLVEVNSGSLYGLTALHQLHLSNNSIARI
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... .: .: :. ...: ..: .. : .:. : :. .:. . . . : .:
CCDS33 HRKGWSFCQKLHELVLS-FNNLTRLDEESLAELSSLSVLRLSHNSISHIAEGAFKGLRSL
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. :... :.. : :.: ::.::.:: ....... . . ::.:: .: .:::. :
CCDS33 RVLDLDHNEISGTIEDTSGAFSGLDSLSKLTLFGNKIKSVAKRAFSGLEGLEHLNLGGNA
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. :. : :. .. : :::. . . :::.. :: :: . .. . : : ..:
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. . : :: :. : :. :. :. .. : . :: : :
CCDS33 QSIFSVPPESFVCDDFLKPQIITQPETTMAMVGKDIRFTCSAASSSSSPMTFAWKKDN-E
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::..:. . . : .:: :.. .: .. : : :..:: :.. . .: :.:
CCDS33 VLTNADMENFVHVHAQDGEVMEYTTILHLRQVTFGHEGRYQCVITNHFGSTYSHKARLTV
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.. :: : .:..:: .. . . .: :
CCDS33 NVLP------SFTKTPHDITIRTTTMARLECAATGHPNPQIAWQKDGGTDFPAARERRMH
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CCDS33 VMPDDDVFFITDVKIDDAGVYSCTAQNSAGSISANATLTVLETPSLVVPLEDRVVSVGET
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CCDS30 MDAATAPKQAWPPWPPLLFLLLLPGGSGG--SCPAVCDCTSQ
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. :.: .: : :: :.: .:. :.: : . .: . .: :. :.:. :.. .:
CCDS30 PQAVLCGHRQLEAVPGGLPLDTELLDLSGNRLWGLQQGMLSRLSLLQELDLSYNQLSTLE
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CCDS30 PGAFHGLQSLLTLRLQGNRLRIMGPGVFSGLSALTLLDLRLNQIVLFLDGAFGELGSLQK
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CCDS30 LEVGD-NHLVFVAPGAFAGLAKLSTLTLERCNLSTVPGLALARLPALVALRLRELDIGRL
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240
pF1KB5 P-------------EIR---------PGSFHGL--SSL----------------------
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CCDS30 PAGALRGLGQLKELEIHLWPSLEALDPGSLVGLNLSSLAITRCNLSSVPFQALYHLSFLR
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250 260 270 280
pF1KB5 -----------------------KKLWVMNSQVSLIERNAFDGLASLVELNLAHNNLSSL
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CCDS30 VLDLSQNPISAIPARRLSPLVRLQELRLSGACLTSIAAHAFHGLTAFHLLDVADNALQTL
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290 300 310 320 330 340
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. : :: :.: :: .::: .::: ::... . . : .: :..:. :
CCDS30 EETAFPSPDKLVTLRLSGNPLTCDCRLLWLLR-LRRHLDFGMSP-PACAGPHHVQGKSLK
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390
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: .. . : :. .: . :: . :: : ..: : .:.:. :.:. :..
CCDS30 EFSDILPPGHFTCKPALIRKSGPRWVIAEEGGHAVFSCSGDGDPAPTVSWMRPHGAWLGR
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400 410 420 430 440 450
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:.: . ::.::::.. : : : :.:.:.:.:::::.. ..:.: .:
CCDS30 AGR---VRVLEDGTLEIRSVQLRDRGAYVCVVSNVAGNDSLRTWLEVIQVEPPNGTLSDP
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460 470 480 490 500 510
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CCDS30 NITVPGIPGPFFLDSRGVAMVLAVGFLPFLTSVTLCFGLIALWSKGKGRVKHHMTFDFVA
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CCDS57 NNLSSVTNINVKKMPQLLSVYLEENKLTELPEKCLSELS---NLQELYINHNLLSTISPG
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CCDS57 AFIGLHNLLRLHLNSNRLQMINSKWFDALPNLEILMIGENPIIRIKDMNFKPLINLRSLV
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CCDS57 IAGINLTEIPDNALVGLENLESISFYDNRLIKVPHVALQKVVNLKFLDLNK-NPINRIRR
220 230 240 250 260 270
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CCDS57 GDFSNMLHLKELG-----INNMPE---LISIDSLAV--DNLPDLR----------KIEAT
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: ..: :. ::: : .: : : : ::.: : . : : :. .: :: ::: :
CCDS57 NNPRLSYIHPNAFFRLPKLESLMLNSNALSALYHGTIESLPNLKEISIHSNPIRCDCVIR
320 330 340 350 360 370
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pF1KB5 WLAWW---LREYIPTNSTCCGRCHAPMHMRGRYLVEVD-QASFQCSAPFIMDA--PRDLN
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CCDS57 WMNMNKTNIRFMEPDSLFCVD----PPEFQGQNVRQVHFRDMMEICLPLIAPESFPSNLN
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CCDS57 VEAGSYVSFHCRATAEPQPEIYWITPSGQKLLPNTLTDKFYVHSEGTLDINGVTPKEGGL
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pF1KB5 YTCMVTNVAGNSNASAYLNVSTAELNTSNYSF---FTTVTVETTEISPEDTTRKYKPVPT
:::..::..: . :....:. . . .: :. . . .... .: . ... :
CCDS57 YTCIATNLVGADLKSVMIKVDGSFPQDNNGSLNIKIRDIQANSVLVSWKASSKILK----
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480 490 500 510 520 530
pF1KB5 TSTGYQPAYTTSTTVLIQTTRVPKQVAVPATDTTDKMQTSLDEVMKTTKIIIGCFVAVTL
.:. . : .. :..:.:..: :
CCDS57 SSVKWTAFVKTENSHAAQSARIPSDVKVYNLTHLNPSTEYKICIDIPTIYQKNRKKCVNV
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CCDS30 TSSFPRMQLKYLNLSNNRITTLEAGCFDNLSSSLLVVKLNRNRMSMIPPKIFKLP-HLQF
170 180 190 200 210
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:.: .: :..... ::. : :. :.. ::.: ... ::: :: ... ::: : :: .
CCDS30 LELKRNRIKIVEGLTFQGLDSLRSLKMQRNGISKLKDGAFFGLNNMEELELEHNNLTRVN
220 230 240 250 260 270
140 150 160 170 180 190
pF1KB5 SGAFEYLSKLRELWLRNNPIESIPSYAFNRVPSLMRLDLGELKKLEYISEGAFEGLFNLK
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CCDS30 KGWLYGLRMLQQLYVSQNAIERISPDAWEFCQRLSELDLS-YNQLTRLDESAFVGLSLLE
280 290 300 310 320 330
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CCDS30 RLNLGDNRVTHIADGVFRFLSNLQTLDLRNNEISWAIEDASEAFAGLTSLTKLILQGNQI
340 350 360 370 380 390
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. : ..:: :: :: .:.: .: . :. .. :. .: :: :. . ::: . :: :
CCDS30 KSITKKAFIGLESLEHLDLNNNAIMSIQENAFSQT-HLKELILNTSSLLCDCHLKWLLQW
400 410 420 430 440 450
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