Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4899
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4899, 469 aa
1>>>pF1KB4899 469 - 469 aa - 469 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2844+/-0.000925; mu= 13.1525+/- 0.055
mean_var=86.5893+/-17.523, 0's: 0 Z-trim(107.4): 76 B-trim: 364 in 1/48
Lambda= 0.137829
statistics sampled from 9489 (9571) to 9489 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 2.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13659.1 ETS2 gene_id:2114|Hs108|chr21 ( 469) 3220 650.3 1.2e-186
CCDS44767.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 485) 1513 310.9 1.9e-84
CCDS8475.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 441) 1467 301.7 9.9e-82
CCDS53724.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 225) 986 206.0 3.4e-53
CCDS81648.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 ( 354) 745 158.1 1.4e-38
CCDS59230.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 ( 259) 461 101.6 1e-21
CCDS59231.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 ( 386) 461 101.7 1.5e-21
CCDS53725.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 ( 419) 461 101.7 1.6e-21
CCDS44768.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 ( 452) 461 101.7 1.7e-21
CCDS13575.1 GABPA gene_id:2551|Hs108|chr21 ( 454) 457 100.9 2.9e-21
CCDS13658.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 479) 453 100.1 5.3e-21
CCDS46648.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 486) 453 100.1 5.4e-21
CCDS58789.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 363) 451 99.7 5.5e-21
CCDS82674.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 455) 451 99.7 6.7e-21
CCDS13657.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 462) 451 99.7 6.8e-21
CCDS2428.1 FEV gene_id:54738|Hs108|chr2 ( 238) 437 96.8 2.6e-20
CCDS46649.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21 ( 387) 435 96.5 5.3e-20
CCDS55087.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 454) 429 95.3 1.4e-19
CCDS55084.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 374) 423 94.1 2.7e-19
CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 419) 423 94.1 2.9e-19
CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 437) 423 94.1 3.1e-19
CCDS55086.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 459) 423 94.2 3.2e-19
CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7 ( 477) 423 94.2 3.3e-19
CCDS33906.1 ETV5 gene_id:2119|Hs108|chr3 ( 510) 422 94.0 4e-19
CCDS59292.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 207) 405 90.4 1.9e-18
CCDS58553.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 445) 405 90.6 3.7e-18
CCDS11465.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17 ( 484) 405 90.6 4e-18
CCDS77281.1 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19 ( 155) 394 88.2 6.8e-18
CCDS74341.1 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19 ( 249) 394 88.3 1e-17
CCDS32995.2 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19 ( 342) 394 88.3 1.3e-17
CCDS12600.1 ERF gene_id:2077|Hs108|chr19 ( 548) 374 84.4 3.2e-16
CCDS59165.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX ( 95) 359 81.1 5.5e-16
CCDS1164.1 ETV3 gene_id:2117|Hs108|chr1 ( 143) 356 80.6 1.2e-15
CCDS14283.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX ( 428) 359 81.4 2e-15
CCDS30893.1 ETV3L gene_id:440695|Hs108|chr1 ( 361) 356 80.8 2.6e-15
CCDS44250.1 ETV3 gene_id:2117|Hs108|chr1 ( 512) 356 80.9 3.6e-15
CCDS9060.1 ELK3 gene_id:2004|Hs108|chr12 ( 407) 341 77.8 2.3e-14
CCDS1457.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1 ( 405) 337 77.0 4e-14
CCDS1456.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1 ( 431) 337 77.0 4.2e-14
CCDS64062.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 521) 299 69.5 9.4e-12
CCDS9374.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 ( 619) 300 69.8 9.5e-12
CCDS3744.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 581) 299 69.5 1e-11
CCDS3745.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 533) 298 69.3 1.1e-11
CCDS82954.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 593) 298 69.3 1.2e-11
CCDS45043.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13 ( 595) 296 68.9 1.6e-11
CCDS14617.1 ELF4 gene_id:2000|Hs108|chrX ( 663) 292 68.2 3e-11
CCDS64063.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4 ( 504) 289 67.5 3.6e-11
>>CCDS13659.1 ETS2 gene_id:2114|Hs108|chr21 (469 aa)
initn: 3220 init1: 3220 opt: 3220 Z-score: 3464.3 bits: 650.3 E(32554): 1.2e-186
Smith-Waterman score: 3220; 100.0% identity (100.0% similar) in 469 aa overlap (1-469:1-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MNDFGIKNMDQVAPVANSYRGTLKRQPAFDTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQEVPTGLDSIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MNDFGIKNMDQVAPVANSYRGTLKRQPAFDTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQEVPTGLDSIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 HDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NSHLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NSHLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SLLDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLLDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB4 LRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
430 440 450 460
>>CCDS44767.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 (485 aa)
initn: 1464 init1: 877 opt: 1513 Z-score: 1629.6 bits: 310.9 E(32554): 1.9e-84
Smith-Waterman score: 1519; 54.7% identity (76.5% similar) in 439 aa overlap (45-469:55-485)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 VANSYRGTLKRQPAFDTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQEVPTGLDSISHDSANCELPLLTPC
.:.. :::::::. : ..:::::
CCDS44 QGPSNTYEDPRMNCGFQSNYHQQRPCYPFWDEMATQEVPTGLEHCVSDMECADVPLLTPS
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 SKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFSLVNVNLQRFGM
:: .:::::::::::: :::.::::::.: :.: .: .:..::.::::: .:..:.: :
CCDS44 SKEMMSQALKATFSGFTKEQQRLGIPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCM
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 NGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENSHLTSVPH--WIN
:: :: :::. :::::::::::::::::: . ::. . :. :. . :. . .
CCDS44 NGAALCALGKDCFLELAPDFVGDILWEHLEILQKEDVK----PYQVNGVNPAYPESRYTS
150 160 170 180 190 200
200 210 220 230 240
pF1KB4 SNTLGFGTEQA----PYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKSRL----
. ...: :.: : .. .. . ... : :. .:: . : . .:. :
CCDS44 DYFISYGIEHAQCVPPSEFSEPSFITESY-QTLHPISSEELLSLKYE-NDYPSVILRDPL
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 --SSVSVTYCSVSQDF-PGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSS
.... : ...:. .:. . .. : .:: :. .:..: : : :::.::::
CCDS44 QTDTLQNDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSRGKLGGQDSFES-IESYDSCDRLTQSWSSQSS
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LLDVQRVPSFESFE-DDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGS
. ..:::::..::. .: .: .:: .::::...:.: ... :::::::.:::.:::
CCDS44 FNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRAD-LNKDKPVIPAAALAGYTGS
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRG
:::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRG
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460
pF1KB4 LRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
:::::::::::::.:::::::::::::.:::.:::::::.: :.::...
CCDS44 LRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVKPDADE
440 450 460 470 480
>>CCDS8475.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 (441 aa)
initn: 1413 init1: 877 opt: 1467 Z-score: 1580.8 bits: 301.7 E(32554): 9.9e-82
Smith-Waterman score: 1473; 54.7% identity (77.1% similar) in 424 aa overlap (60-469:26-441)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 DTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQEVPTGLDSISHDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSG
: : ..::::: :: .:::::::::::
CCDS84 MKAAVDLKPTLTIIKTEKVDLELFPSPDMECADVPLLTPSSKEMMSQALKATFSG
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 FKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLE
: :::.::::::.: :.: .: .:..::.::::: .:..:.: ::: :: :::. :::
CCDS84 FTKEQQRLGIPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLE
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 LAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENSHLTSVPH--WINSNTLGFGTEQAPYGM
::::::::::::::: . ::. . :. :. . :. . .. ...: :.: .
CCDS84 LAPDFVGDILWEHLEILQKEDVKP----YQVNGVNPAYPESRYTSDYFISYGIEHAQC-V
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250
pF1KB4 QTQNYPKGGLL----DSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKSRL------SSVSVTYCSVSQD
... . ... ... : :. .:: . : . .:. : .... : ...:.
CCDS84 PPSEFSEPSFITESYQTLHPISSEELLSLKYE-NDYPSVILRDPLQTDTLQNDYFAIKQE
180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 F-PGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSLLDVQRVPSFESFE-
.:. . .. : .:: :. .:..: : : :::.::::. ..:::::..::.
CCDS84 VVTPDNMCMGRTSRGKLGGQDSFES-IESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVPSYDSFDS
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 DDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGSGPIQLWQFLLELLSD
.: .: .:: .::::...:.: ... :::::::.:::.::::::::::::::::.:
CCDS84 EDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRAD-LNKDKPVIPAAALAGYTGSGPIQLWQFLLELLTD
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 KSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSG
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS84 KSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAG
350 360 370 380 390 400
440 450 460
pF1KB4 KRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
::::::::::::.:::.:::::::.: :.::...
CCDS84 KRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVKPDADE
410 420 430 440
>>CCDS53724.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 (225 aa)
initn: 976 init1: 877 opt: 986 Z-score: 1068.4 bits: 206.0 E(32554): 3.4e-53
Smith-Waterman score: 986; 70.2% identity (87.8% similar) in 205 aa overlap (266-469:23-225)
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 FQMFPKSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQS
: . : .:: :. .:..: : : ::
CCDS53 MKAAVDLKPTLTIIKTEKVDLELFPSPGKLGGQDSFES-IESYDSCDRLTQS
10 20 30 40 50
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 WNSQSSLLDVQRVPSFESFE-DDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVL
:.::::. ..:::::..::. .: .: .:: .::::...:.: ... :::::::.:
CCDS53 WSSQSSFNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTFKDYVRDRAD-LNKDKPVIPAAAL
60 70 80 90 100 110
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 AGFTGSGPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNY
::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS53 AGYTGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNY
120 130 140 150 160 170
420 430 440 450 460
pF1KB4 EKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
:::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::.:::::::.: :.::...
CCDS53 EKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVKPDADE
180 190 200 210 220
>>CCDS81648.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11 (354 aa)
initn: 1207 init1: 728 opt: 745 Z-score: 806.4 bits: 158.1 E(32554): 1.4e-38
Smith-Waterman score: 1122; 49.0% identity (64.6% similar) in 412 aa overlap (60-469:26-354)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 DTFDGSLFAVFPSLNEEQTLQEVPTGLDSISHDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSG
: : ..::::: :: .:::::::::::
CCDS81 MKAAVDLKPTLTIIKTEKVDLELFPSPDMECADVPLLTPSSKEMMSQALKATFSG
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 FKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLE
: :::.::::::.: :.: .: .:..::.::::: .:..:.: ::: :: :::. :::
CCDS81 FTKEQQRLGIPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLE
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 LAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENSHLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQT
::::::::::::::: . ::. . :. .: :..
CCDS81 LAPDFVGDILWEHLEILQKEDVK---------------PYQVN-------------GVN-
120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 QNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNN
:: .:.:: .: :. : .. .
CCDS81 -------------PA--------------YPESRYTS----------DYFIS-YGIEHAQ
150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 SGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSLLDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTM
:.. . : ..:... . :. ::... .:.: :. : : .
CCDS81 CVPPSEFSEPSFITESYQTLHPI-----SSEELLSLK-------YEND-YPSVILRDPLQ
170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 SFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFT--GSGPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGD
. : .:. ..: . : : . : : :::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS81 T--DTLQNDYFAIKQ-EVVTPDNMCMGRTSRGSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGD
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 GWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQ
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS81 GWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQ
280 290 300 310 320 330
450 460
pF1KB4 NLLGFTPEELHAILGVQPDTED
.:::.:::::::.: :.::...
CCDS81 SLLGYTPEELHAMLDVKPDADE
340 350
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Smith-Waterman score: 461; 49.7% identity (73.5% similar) in 155 aa overlap (295-442:13-167)
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 LLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSLLDVQRVPSFESFEDDC---SQS
: ..::: :.:.. ::..: . ...
CCDS59 MDPGSLLAYNTTSHTDQSSRLSVKEDPSYDSVRRGAWGNNMN
10 20 30 40
330 340 350 360 370
pF1KB4 LCLNK-PTMSFKDYIQERSDPVEQGKP---VIPAAVLAGFTGSGPIQLWQFLLELLSDKS
::: : .. . :.. .. : : . :.. . ::: :::::::::::::..
CCDS59 SGLNKSPPLGGAQTISKNTEQRPQPDPYQILGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSA
50 60 70 80 90 100
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 CQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKR
: :.: : . :::..::::::::::.::.::.:::.::::.:::::::::. :. :::
CCDS59 NASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMTKVHGKR
110 120 130 140 150 160
440 450 460
pF1KB4 YVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
:.:.:
CCDS59 YAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNFVPPHPSSMPVTSSSF
170 180 190 200 210 220
>>CCDS59231.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 (386 aa)
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70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFS
.::. .: .: ::....: ::: :: .:.:
CCDS59 LVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYS
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LVNVNLQRF-GMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENS
:.... . : .:.:. ::...:: ::. . . ..: :: . .:.. :. .:
CCDS59 LMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYL----RESSLLAYNTTS
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKS
: :.:. : :: ... :
CCDS59 H----------------TDQS------------------------SRLSVKED----P--
150
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSL
.: :: . :.:.: :: :. : .::... : :..
CCDS59 -------SYDSVRRGAWGNNMN-----SGLNKS--PPLGGAQTI--------SKNTE---
160 170 180
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGSGP
:: : .: :: . :. .. ::. :::
CCDS59 ---QR-P----------------QP------------DPYQILGPT--SSRLAN-PGSGQ
190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 IQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLR
:::::::::::::.. : :.: : . :::..::::::::::.::.::.:::.::::.::
CCDS59 IQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALR
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460
pF1KB4 YYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
:::::::. :. ::::.:.:
CCDS59 YYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNF
280 290 300 310 320 330
>>CCDS53725.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 (419 aa)
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70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFS
.::. .: .: ::....: ::: :: .:.:
CCDS53 LVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LVNVNLQRF-GMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENS
:.... . : .:.:. ::...:: ::. . . ..: :: . .:.. :. .:
CCDS53 LMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYL----RESSLLAYNTTS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKS
: :.:. : :: ... :
CCDS53 H----------------TDQS------------------------SRLSVKED----P--
180
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSL
.: :: . :.:.: :: :. : .::... : :..
CCDS53 -------SYDSVRRGAWGNNMN-----SGLNKS--PPLGGAQTI--------SKNTE---
190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGSGP
:: : .: :: . :. .. ::. :::
CCDS53 ---QR-P----------------QP------------DPYQILGPT--SSRLAN-PGSGQ
230 240
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 IQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLR
:::::::::::::.. : :.: : . :::..::::::::::.::.::.:::.::::.::
CCDS53 IQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALR
250 260 270 280 290 300
430 440 450 460
pF1KB4 YYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
:::::::. :. ::::.:.:
CCDS53 YYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNF
310 320 330 340 350 360
>>CCDS44768.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11 (452 aa)
initn: 628 init1: 427 opt: 461 Z-score: 499.5 bits: 101.7 E(32554): 1.7e-21
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70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQWLLWATNEFS
.::. .: .: ::....: ::: :: .:.:
CCDS44 LVGGGESNPMNYNSYMDEKNGPPPPNMTTNERRVIVPADPTLWTQEHVRQWLEWAIKEYS
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LVNVNLQRF-GMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKTEDQYEENS
:.... . : .:.:. ::...:: ::. . . ..: :: . .:.. :. .:
CCDS44 LMEIDTSFFQNMDGKELCKMNKEDFLRATTLYNTEVLLSHLSYL----RESSLLAYNTTS
160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQEFQMFPKS
: :.:. : :: ... :
CCDS44 H----------------TDQS------------------------SRLSVKED----P--
210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQSWNSQSSL
.: :: . :.:.: :: :. : .::... : :..
CCDS44 -------SYDSVRRGAWGNNMN-----SGLNKS--PPLGGAQTI--------SKNTE---
230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVLAGFTGSGP
:: : .: :: . :. .. ::. :::
CCDS44 ---QR-P----------------QP------------DPYQILGPT--SSRLAN-PGSGQ
260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 IQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLR
:::::::::::::.. : :.: : . :::..::::::::::.::.::.:::.::::.::
CCDS44 IQLWQFLLELLSDSANASCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALR
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460
pF1KB4 YYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
:::::::. :. ::::.:.:
CCDS44 YYYDKNIMTKVHGKRYAYKFDFHGIAQALQPHPTESSMYKYPSDISYMPSYHAHQQKVNF
350 360 370 380 390 400
>>CCDS13575.1 GABPA gene_id:2551|Hs108|chr21 (454 aa)
initn: 730 init1: 448 opt: 457 Z-score: 495.2 bits: 100.9 E(32554): 2.9e-21
Smith-Waterman score: 552; 32.8% identity (54.0% similar) in 378 aa overlap (85-461:168-418)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 GLDSISHDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQW
:.. :..:::.::::: .: :: .:: .:
CCDS13 VEEAQVITLDGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERLGIPYDPIQWSTDQVLHW
140 150 160 170 180 190
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 LLWATNEFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKT
..:. .:::.....: ....:. ::.:..: :.. .: :.::: ::: . : .
CCDS13 VVWVMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLNQEDFFQRVPR--GEILWSHLELLRKYVLASQ
200 210 220 230 240 250
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 EDQYEENSHLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQ
:.:..: ... .:
CCDS13 EQQMNE------------------------------------------------IVTIDQ
260
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 EFQMFPKSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQ
:..: .::. :.:: . ..
CCDS13 PVQIIP----ASVQ---------------------SATP-----------------TTIK
270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 SWNSQSSLLDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVL
::... :::.: . : :: ::.: ..
CCDS13 VINSSAKAAKVQRAPRI-SGED---------------------RSSPGNR----------
290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 AGFTGS-GPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMN
::. : :::::::::::.::. .. :::.:: :::: .:. ::..::.::::: ::
CCDS13 ---TGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKWGQRKNKPTMN
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460
pF1KB4 YEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED
::::::.:::::: ..: :..:::.::.:::::..:.:.. ::. ..
CCDS13 YEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVTECEQKKLAKMQ
380 390 400 410 420 430
CCDS13 LHGIAQPVTAVALATASLQTEKDN
440 450
469 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 21:05:30 2016 done: Sat Nov 5 21:05:31 2016
Total Scan time: 2.200 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]