Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4848
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4848, 419 aa
1>>>pF1KB4848 419 - 419 aa - 419 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2714+/-0.00092; mu= 17.2214+/- 0.055
mean_var=64.7020+/-13.015, 0's: 0 Z-trim(105.4): 31 B-trim: 266 in 1/46
Lambda= 0.159447
statistics sampled from 8358 (8381) to 8358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.257), width: 16
Scan time: 2.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 ( 419) 2819 657.4 7.3e-189
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 ( 423) 1975 463.2 2e-130
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 ( 393) 1727 406.2 2.9e-113
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 501) 1501 354.2 1.6e-97
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 ( 433) 1317 311.9 7.6e-85
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 ( 433) 1300 308.0 1.1e-83
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 ( 427) 1297 307.3 1.8e-83
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 ( 436) 1193 283.4 3e-76
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 1138 270.7 1.9e-72
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 390) 1127 268.2 1e-71
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 ( 445) 1091 259.9 3.5e-69
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 372) 1071 255.3 7.3e-68
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 391) 1071 255.3 7.6e-68
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 418) 951 227.7 1.6e-59
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 951 227.7 1.8e-59
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 235) 929 222.5 3.4e-58
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 900 215.9 5.1e-56
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 303) 897 215.2 6.9e-56
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 ( 375) 879 211.1 1.4e-54
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 639 155.9 5.8e-38
>>CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 2819 init1: 2819 opt: 2819 Z-score: 3504.2 bits: 657.4 E(32554): 7.3e-189
Smith-Waterman score: 2819; 99.8% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAGDSRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MAGDSRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 NVHHGNVQETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NVHHGNVQETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 FMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQEEFE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS84 SRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINQKSPFWEMSQAQLHQEEFE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB4 SCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
370 380 390 400 410
>>CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 (423 aa)
initn: 1943 init1: 1876 opt: 1975 Z-score: 2454.9 bits: 463.2 E(32554): 2e-130
Smith-Waterman score: 1975; 72.4% identity (86.7% similar) in 421 aa overlap (1-419:12-414)
10 20 30 40
pF1KB4 MAGDSRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVP--IATDRTRLLAEGK
. ::: :.::.: :. .:: .:::::: .: :. ::: :
CCDS42 MAKLTESMTNVLEGDS---MDQDVESPVAIHQPK-LPKQARDDLPRHISRDRT------K
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 KPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFI
. :::..:.::::::::::.::::::.:.::::::::::::::.:.:::::::::::.:
CCDS42 RKIQRYVRKDGKCNVHHGNVRETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMI
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 WWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIIL
::::::::::.::. : : ::: ::.:::::::::::::::::::.::::.::::::::
CCDS42 WWLIAYIRGDMDHIEDPSWTPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIIL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 LLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNS
::.:..:::::::::::::::::::::::::::.::..::::::: ::::::::::::::
CCDS42 LLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 HIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFW
::::::::::::::.::.:::::::::::::::. :::::::::::::::::::..::::
CCDS42 HIVEASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFW
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 EMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVD
:.:.::: .::.:.:::::::::::::::::::::. .:.:::.::::::::: ::::::
CCDS42 EISKAQLPKEELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 YNTFHDTYETNTPSCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPK
::.::.::::.::: ::::::. ... :: :. . . :. .:: . :.: :
CCDS42 YNSFHETYETSTPSLSAKELAELASRAE----LP----LSWSVSSKLNQHAELETEEEEK
360 370 380 390 400
410
pF1KB4 GLGGSREARGSV
.: . : :.:
CCDS42 NLEEQTERNGDVANLENESKV
410 420
>>CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 1719 init1: 1719 opt: 1727 Z-score: 2147.0 bits: 406.2 E(32554): 2.9e-113
Smith-Waterman score: 1727; 70.0% identity (86.6% similar) in 367 aa overlap (47-411:18-372)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 VTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQETYRYLSD
.. ::::.::.:.:::..:::.::::::.:
CCDS11 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVRETYRYLTD
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 LFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSGF
::::::::.::..:: :...:..:::::: ::::::: ::::.:. : : :::.::.::
CCDS11 LFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLNGF
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 VSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKR
:.::::::::::::::: ::::..:::::.:::.::::::.::::::::::::::::.::
CCDS11 VAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPNKR
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 AETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTD
: ::.::..::.:.:: .:::::::::::.:::::::::::::.:::: :::::::.:::
CCDS11 AATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQTD
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 INVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTC
..::::::::::::::::.:::::. ::::: :. :....::.:::::::::::::::
CCDS11 LSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGMTC
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 QARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTPSCCAKELAEM--KREG
::::::. ::::::::: ::::: ::::::: .::.:.:. :::: :.:::: . ..
CCDS11 QARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAEAAARLDA
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410
pF1KB4 RLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
.: .:: :: ..: :: .: ::
CCDS11 HLYWSIPSR----------LDEKVE--EEGAGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
350 360 370 380 390
>>CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 (501 aa)
initn: 1399 init1: 1399 opt: 1501 Z-score: 1864.5 bits: 354.2 E(32554): 1.6e-97
Smith-Waterman score: 1508; 62.8% identity (83.0% similar) in 358 aa overlap (16-370:23-364)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAGDSRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRY
:. : : . :.: . :: :: :::.
CCDS22 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQ--QLVP------------KKKRQRF
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 MEKSGKCNVHHGNV-QETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIA
..:.:.:::.:::. .:: ::::::::::::::::.::..: ..:::.:::.. .::.::
CCDS22 VDKNGRCNVQHGNLGSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIA
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 YIRGDLD--HVGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLV
: ::::. :::. . ::: :. .: ::::: ::::.:::::.: ::.::::::::.:
CCDS22 YTRGDLNKAHVGN--YTPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 QAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIV
:.::::::.::..::::.:.:::::::::::::..::::::: :: ::::::.:::::.:
CCDS22 QSILGSIVDAFLIGCMFIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 EASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMS
:.:: ::.::::: ::::.::.: ...:::.:: :.::::::: : : :. ::::...:
CCDS22 SAQIRCKLLKSRQTPEGEFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 QAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNT
: ... :.::.::::::.::.::::::::.:: . :::::::: ::..::.::..:::.
CCDS22 QRSMQTEQFEIVVILEGIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 FHDTYETNTPSCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLG
:: :.:. :: .:: ::
CCDS22 FHATFEVPTPPYSVKEQEEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQ
350 360 370 380 390 400
>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 1243 init1: 1203 opt: 1317 Z-score: 1636.7 bits: 311.9 E(32554): 7.6e-85
Smith-Waterman score: 1317; 52.5% identity (80.7% similar) in 373 aa overlap (47-417:40-403)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 VTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQE-TYRYLS
.. :.:...:.:.::.. .:..: . :::.
CCDS11 YSIVSSEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIEFANMDEKSQRYLA
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 DLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSG
:.::: ::..::. ::.:.... ..::.::.:.:.:: .:::. . . ::: .. :
CCDS11 DMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDLEPAEGRGRTPCVMQVHG
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 FVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKK
:..::::::::.::::::.: .::.:: .......:.:.: :...::.: ...:...:::
CCDS11 FMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPKK
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 RAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQT
::.::.::.:::...:: :::::.:::.::.:::::: .::.::: : :.:::.:::.:
CCDS11 RAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQI
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 DINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMT
::.:::: : ::.:::::. : :::.: ::.. .:. .:. ..::.:::::::::::.::
CCDS11 DIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATAMT
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 CQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYET-NTPSCCAKELAEMKREG
::::::. .:.:::::: ::: ::. :..::. :: :::. .:: : ::.:.: :
CCDS11 TQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVENK---
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410
pF1KB4 RLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
.: ::: . : : : : ..:::: : .: :
CCDS11 -FL--LPSANSF--CYENEL-AFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGG
370 380 390 400 410 420
CCDS11 VLEQRPYRRESEI
430
>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 1228 init1: 1188 opt: 1300 Z-score: 1615.5 bits: 308.0 E(32554): 1.1e-83
Smith-Waterman score: 1300; 52.3% identity (79.9% similar) in 373 aa overlap (47-417:40-403)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 VTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQE-TYRYLS
.. :.:...:.:.::. .:..: . :::.
CCDS74 YSIVSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFANMDEKSQRYLA
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 DLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSG
:.::: ::..::. ::.:.... ..::.:: :.:.:: .:::. . . ::: .. :
CCDS74 DMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGDLEPAEGHGRTPCVMQVHG
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 FVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKK
:..::::::::.::::::.: .::.: .......:.:.: :...::.: ...:...:::
CCDS74 FMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPKK
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 RAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQT
::.::.::.:::...:: :::::.:::.::.:::::: .::.::: : :.:::.:::.:
CCDS74 RAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQI
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 DINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMT
::.:::: : ::.:::::. : :::.: ::.. .:. .:. ..::.:::::::::::.::
CCDS74 DIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATAMT
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
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::::::. .:.:::::: ::: ::. :..::. :: :::. .:: : ::.:.: :
CCDS74 TQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVENK---
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410
pF1KB4 RLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
.: ::: . : : : : ..:::: : .: :
CCDS74 -FL--LPSANSF--CYENEL-AFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGG
370 380 390 400 410 420
CCDS74 VLEQRPYRRGSEI
430
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20 30 40 50 60 70
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::.::.::::.::: :::::.:::.::.::.::: .::.:.::: :.:::.:::.: :::
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::::.: ::.:::::. : :::.: ::....:. .. . .::.:::::::::::.:: :
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::::. .:.:::::. ::: :: .:.:::. :: :::. ::: : :..::: :
CCDS11 RSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLAEKKYILSNA
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CCDS11 NSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPLRRESEI
380 390 400 410 420
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10 20 30 40
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10 20 30 40
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::. .:::: ..::: .. :: ....:..::::..::.:.:::: : .::.::
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CCDS12 AVAAVVLQCIAGCVLDAFVVGAVMAKMAKPKKRNETLVFSENAVVALRDHRLCLMWRVGN
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pF1KB4 LRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINEK
:: ::.::: .::.:.. : : :::.:::.. :..:::: : ::.:::::. : :::.
CCDS12 LRRSHLVEAHVRAQLLQPRVTPEGEYIPLDHQDVDVGFDGGTDRIFLVSPITIVHEIDSA
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CCDS12 SPLYELGRAELARADFELVVILEGMVEATAMTTQCRSSYLPGELLWGHRFEPVLFQRGSQ
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::::: :: :::. .:: : :::: : ... : . .:. : . : : .:.
CCDS12 YEVDYRHFHRTYEVPGTPVCSAKELDERAEQASHSLKSSFPGS-LTAFCYENELALSCCQ
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pF1KB4 EQNEEDEPKGLGGSREARGSV
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CCDS12 EEDEDDETEEGNGVETEDGAASPRVLTPTLALTLPP
410 420 430
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CCDS86 TTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAYMEKSGMEKSGLESTVCV
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pF1KB4 ENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKI
:. .:.::::::::...:::.: :..::.:: .: .:..: :.: :.:: :.::.:.:
CCDS86 TNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLILQNIVGLIINAVMLGCIFMKT
130 140 150 160 170 180
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CCDS86 AQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMIISASVRIQVVKKTTTPEGEVV
190 200 210 220 230 240
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CCDS86 PIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLANQDLEVIVILEGVVE
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pF1KB4 ATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTPSCCAKELAEM
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CCDS86 TTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSKFGNTVKVAAPRCSARELDE-
310 320 330 340 350 360
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CCDS86 -KPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPKVQFMTPEGNQ
370 380 390 400 410
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10 20 30 40 50 60
pF1KB4 SRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHH
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CCDS31 MLSRKGIIPEEYVLTRLAEDPAKPRYRARQRRARFVSKKGNCNVAH
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pF1KB4 GNVQETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDL-DHVGD
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CCDS31 KNIREQGRFLQDVFTTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGDLAPSEGT
50 60 70 80 90 100
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pF1KB4 QEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMV
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CCDS31 AE--PCVTSIHSFSSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIML
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 GCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQ
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CCDS31 GCIFMKTAQAHRRAETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTT
170 180 190 200 210 220
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CCDS31 SPEGEVVPLHQVDIPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEII
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CCDS31 VILEGVVETTGITTQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTVKVPTPLC
290 300 310 320 330 340
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]