Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4809
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4809, 734 aa
1>>>pF1KB4809 734 - 734 aa - 734 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4389+/-0.00105; mu= 19.7535+/- 0.063
mean_var=73.7684+/-14.573, 0's: 0 Z-trim(103.8): 31 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.149327
statistics sampled from 7550 (7566) to 7550 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 3.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22 ( 734) 4810 1046.2 0
CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8 ( 863) 1087 244.2 6.3e-64
CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 543) 981 221.2 3.2e-57
CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 ( 719) 981 221.3 4.1e-57
CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2 ( 821) 882 200.0 1.2e-50
CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 818) 856 194.4 5.8e-49
CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 ( 853) 856 194.4 6e-49
CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3 ( 904) 827 188.2 4.8e-47
CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 (1143) 762 174.3 9.5e-43
CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 840) 695 159.8 1.6e-38
CCDS13095.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 824) 582 135.4 3.4e-31
CCDS63227.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 880) 529 124.0 9.9e-28
CCDS63226.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 ( 793) 410 98.3 4.7e-20
CCDS5121.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 ( 391) 402 96.4 8.8e-20
>>CCDS13915.1 MCM5 gene_id:4174|Hs108|chr22 (734 aa)
initn: 4810 init1: 4810 opt: 4810 Z-score: 5596.9 bits: 1046.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4810; 100.0% identity (100.0% similar) in 734 aa overlap (1-734:1-734)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MSGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDELK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RHYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEVTRPRPSGEEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RHYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEVTRPRPSGEEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 NIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAVPHGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAVPHGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 MPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGLTTSRGRDRVGVGIRSSYIRVLGIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGLTTSRGRDRVGVGIRSSYIRVLGIQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SRKRLPDGLTRRGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRKRLPDGLTRRGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RCSVLAAANSVFGRWDETKGEDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RCSVLAAANSVFGRWDETKGEDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VSALTQTQAVEGEIDLAKLKKFIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VSALTQTQAVEGEIDLAKLKKFIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 DRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 EGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGE
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB4 IQHRMQRKVLYRLK
::::::::::::::
CCDS13 IQHRMQRKVLYRLK
730
>>CCDS6143.1 MCM4 gene_id:4173|Hs108|chr8 (863 aa)
initn: 951 init1: 520 opt: 1087 Z-score: 1261.2 bits: 244.2 E(32554): 6.3e-64
Smith-Waterman score: 1134; 34.7% identity (61.9% similar) in 680 aa overlap (26-679:161-808)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MSGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFL-----RQYRVGTDRTG
: : ..:: ...:. .. :: : :
CCDS61 SDGAAAEDIVASEQSLGQKLVIWGTDVNVAACKENFQRFLQRFIDPLAKEEENVGIDITE
140 150 160 170 180 190
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 FTFKYRDELKRHYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEV
. : : . .:: ...:. : . :::..: : . : : . .. : ..:.
CCDS61 PLYMQR--LGEINVIGEPFLNVNCEHIKSFDKNLYRQLISYPQEVIPTFDMA----VNEI
200 210 220 230 240
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 TRPRPSGEEVLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISI
: . ..::: . . ...:.:. . ...:. : :..: .: . . . .
CCDS61 FFDRYPDSILEHQIQVRPFNALKTKNMRNLNPEDIDQLITISGMVIRTSQLIPEMQEAFF
250 260 270 280 290 300
180 190 200 210 220
pF1KB4 QCRSCRNTLTNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKC-PLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKL
::. : .: : . : : : : : :: : . .. .. : : .::
CCDS61 QCQVCAHT-TRVEMDRGR--IAEPSVC-----GR--CHTTHSMALIHNRSLFSDKQMIKL
310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 QELPDAVPHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGL----TTSRGRDRV
:: :. .: :. :. . :. : ::: ::.::.. ::: . . .. .. ..
CCDS61 QESPEDMPAGQTPHTVILFAHNDLVDKVQPGDRVNVTGIYRAVPIRVNPRVSNVKSVYKT
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 GVGI----RSSYIRVLGIQVDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAP
. . ... :. :. : .. . : : .. : ...:. :..:: .....::
CCDS61 HIDVIHYRKTDAKRLHGL--DEEAEQKLF----SEKRVELLKELSRKPDIYERLASALAP
420 430 440 450 460
350 360 370 380 390
pF1KB4 SIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPD-GLTR-RGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSP
::. :.::.: ::::.:: . : . :..::.:. :::::.:::::..: . :
CCDS61 SIYEHEDIKKGILLQLFGGTRKDFSHTGRGKFRAEINILLCGDPGTSKSQLLQYVYNLVP
470 480 490 500 510 520
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 IGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIH
: :::::::::.:::: ::.:: .:..... ::.::.:.:. :::::::: :. : ..:
CCDS61 RGQYTSGKGSSAVGLTAYVMKDPETRQLVLQTGALVLSDNGICCIDEFDKMNESTRSVLH
530 540 550 560 570 580
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 EAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKGE-DNIDFMPTILSRFDMIF
:.:::::.::::::: ::.: ::::::: . ..:. : .::.. :.:::::.::
CCDS61 EVMEQQTLSIAKAGIICQLNARTSVLAAANPIESQWNPKKTTIENIQLPHTLLSRFDLIF
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 IVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLAKLKKFIAYCRVKCGPRLSAEA
.. : ..: : ::.:...:. . .. :: : .:.: :: .::: . :::: ::
CCDS61 LLLDPQDEAYDRRLAHHLVALYYQ--SEEQAEEELLDMAVLKDYIAYAHSTIMPRLSEEA
650 660 670 680 690 700
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 AEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVE
.. : . :. :: . .. :. . ::::...:.::: .:..:. . :::
CCDS61 SQALIEAYVDMR-------KIGSSRGMVSAYPRQLESLIRLAEAHAKVRLSNKVEAIDVE
710 720 730 740 750
640 650 660 670 680
pF1KB4 EALRLFQVSTLDAA---------LSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQV
:: :: . . ..: .: .:. . ::.. .: :.. :.:
CCDS61 EAKRLHREALKQSATDPRTGIVDISILTTGMSA-TSRKRKEELAEALKKLILSKGKTPAL
760 770 780 790 800 810
690 700 710 720 730
pF1KB4 SEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGEIQHRMQRKVLYRLK
CCDS61 KYQQLFEDIRGQSDIAITKDMFEEALRALADDDFLTVTGKTVRLL
820 830 840 850 860
>>CCDS5684.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 (543 aa)
initn: 863 init1: 602 opt: 981 Z-score: 1140.7 bits: 221.2 E(32554): 3.2e-57
Smith-Waterman score: 992; 37.0% identity (65.9% similar) in 481 aa overlap (172-647:8-464)
150 160 170 180 190
pF1KB4 SDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTLTNIAMRPGLEGYAL-P-RKCNT
: .: . . : . . : ..:.:
CCDS56 MVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQT
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 DQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAVPHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVP
...: ... . . :: .:.:: : :: :..:: . . . . :
CCDS56 NRSG------GRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQP
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 GNRVTIMGIY-SIKKFGLTTSRGRDRVGVGIRSSYIRVLGI-QVDTDGSGRSFAGAVSPQ
:..:.. ::. : . :. :. : . .:... : ... . . .: :: ..
CCDS56 GDHVSVTGIFLPILRTGF-----RQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELT--
100 110 120 130 140
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 EEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINL
.::.:..: . :: .. :::: :.: :.:::. :: :: . : :. ::.::.
CCDS56 -REELRQIAE-EDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQS-PRGMKIRGNINI
150 160 170 180 190 200
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 LMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLA
..::::.::::::..... .: . ::.:.:::..::::.:.:: : .. .::::.:::
CCDS56 CLMGDPGVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLA
210 220 230 240 250 260
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 DGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDE
: :: :::::::: : ::.::::.::::::::::::: ::::.:::.::::: ..::..
CCDS56 DQGVCCIDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNP
270 280 290 300 310 320
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 TKG-EDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDL
.. :.::.. ..:::::......:. ... :. ::.:. .: . . : .:.
CCDS56 RRSLEQNIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFE-PLDM
330 340 350 360 370 380
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 AKLKKFIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAI
....::.:: : : . :. . :. :: : .:. :. : : ::
CCDS56 KLMRRYIAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREA-WASKDATYTSA-----RTLLAI
390 400 410 420 430
620 630 640 650 660 670
pF1KB4 VRIAEALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIE
.:.. ::..... . . ::.::.::...:
CCDS56 LRLSTALARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELV
440 450 460 470 480 490
680 690 700 710 720 730
pF1KB4 KQLKRRFAIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGEIQHRMQRKVLYRLK
CCDS56 SGGRSVRFSEAEQRCVSRGFTPAQFQAALDEYEELNVWQVNASRTRITFV
500 510 520 530 540
>>CCDS5683.1 MCM7 gene_id:4176|Hs108|chr7 (719 aa)
initn: 863 init1: 602 opt: 981 Z-score: 1138.9 bits: 221.3 E(32554): 4.1e-57
Smith-Waterman score: 1091; 32.5% identity (62.0% similar) in 655 aa overlap (32-647:10-640)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 SGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDELKR
... :.::... . ::: ..: :
CCDS56 MALKDYALEKEKVKKFLQEFYQDDELGKKQFKYGNQLVR
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB4 HYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVAD-----EVT-----
. . . :...:.: : .:.: . .. .. .:. .:..:. ::.
CCDS56 LAHREQVALYVDLDDVAEDDPELVDSICENARRYAKLFADAVQELLPQYKEREVVNKDVL
40 50 60 70 80 90
120 130 140
pF1KB4 ------------RPRPSG----------EEVLQDIQVMLKSDAS--PSSIRSLKSDMMSH
: : : :... ....... .: : :: ...: ...
CCDS56 DVYIEHRLMMEQRSRDPGMVRSPQNQYPAELMRRFELYFQGPSSNKPRVIREVRADSVGK
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 LVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTLTNIAMRPGLEGYAL-P-RKCNTDQAGRP
:: . ::. .: :. : . . : .: . . : . . : ..:.:...:
CCDS56 LVTVRGIVTRVSEVKPKMVVATYTCDQCGAETYQPIQSPTFMPLIMCPSQECQTNRSG--
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 KCPLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAVPHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTI
... . . :: .:.:: : :: :..:: . . . . ::..:..
CCDS56 ----GRLYLQTRGSRFIKFQEMKMQEHSDQVPVGNIPRSITVLVEGENTRIAQPGDHVSV
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 MGIY-SIKKFGLTTSRGRDRVGVGIRSSYIRVLGI-QVDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFR
::. : . :. :. : . .:... : ... . . .: :: .. .::.:
CCDS56 TGIFLPILRTGF-----RQVVQGLLSETYLEAHRIVKMNKSEDDESGAGELT---REELR
280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 RLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGDP
..: . :: .. :::: :.: :.:::. :: :: . : :. ::.::. ..:::
CCDS56 QIAE-EDFYEKLAASIAPEIYGHEDVKKALLLLLVGGVDQS-PRGMKIRGNINICLMGDP
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 GTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVC
:.::::::..... .: . ::.:.:::..::::.:.:: : .. .::::.:::: :: :
CCDS56 GVAKSQLLSYIDRLAPRSQYTTGRGSSGVGLTAAVLRDSVSGELTLEGGALVLADQGVCC
390 400 410 420 430 440
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 IDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKG-ED
::::::: : ::.::::.::::::::::::: ::::.:::.::::: ..::.. .. :.
CCDS56 IDEFDKMAEADRTAIHEVMEQQTISIAKAGILTTLNARCSILAAANPAYGRYNPRRSLEQ
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 NIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLAKLKKF
::.. ..:::::......:. ... :. ::.:. .: . . : .:. ....
CCDS56 NIQLPAALLSRFDLLWLIQDRPDRDNDLRLAQHITYVHQHSRQPPSQFE-PLDMKLMRRY
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KB4 IAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEA
::.:: : : . :. . :. :: : .:. :. : : ::.:.. :
CCDS56 IAMCREK-QPMVPESLADYITAAYVEMRREA-WASKDATYTSA-----RTLLAILRLSTA
570 580 590 600 610
630 640 650 660 670 680
pF1KB4 LSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRR
:..... . . ::.::.::...:
CCDS56 LARLRMVDVVEKEDVNEAIRLMEMSKDSLLGDKGQTARTQRPADVIFATVRELVSGGRSV
620 630 640 650 660 670
>>CCDS2179.1 MCM6 gene_id:4175|Hs108|chr2 (821 aa)
initn: 917 init1: 638 opt: 882 Z-score: 1022.8 bits: 200.0 E(32554): 1.2e-50
Smith-Waterman score: 1011; 31.5% identity (62.3% similar) in 658 aa overlap (32-649:27-657)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 SGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDELKR
:. : .::.... . . . .. .:: :
CCDS21 MDLAAAAEPGAGSQHLEVRDEVAEKCQKLFLDFLEEFQSSDGEIKY-LQLAEELIR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB4 -HYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKE-VADEVTRPRPSGEE
. : . : . :: .:...:. . .. . : .: : : :. :
CCDS21 PERNT----LVVSFVDLEQFNQQLSTTIQEEFYRVYPYLCRALKTFVKDRKEIP------
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 VLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTL
. .:. : ... . .:: : :. .. :..: : .. . :. . . .. : .:....
CCDS21 LAKDFYVAFQDLPTRHKIRELTSSRIGLLTRISGQVVRTHPVHPELVSGTFLCLDCQTVI
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 TNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMP-DKCKCVDFQTLKLQELPDAVPH
.. .. :. : : . : : :.. .: . :::: ...:: .:.
CCDS21 RDVEQQ---FKYTQPNICRN-----PVCANRRRFLLDTNKSRFVDFQKVRIQETQAELPR
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB4 GEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMG----IYSIKKFGL------TTSR-----GRD
: .:: ... ... :.. . : . ...:.. :.:: : .
CCDS21 GSIPRSLEVILRAEAVESAQAGDKCDFTGTLIVVPDVSKLSTPGARAETNSRVSGVDGYE
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320
pF1KB4 RVGV-GIRSSYIRVLGIQV--------------------DTDGSGRSFAGAVSPQEEEEF
:. :.:. .: :. .. : . ...:. . .. .: :.
CCDS21 TEGIRGLRALGVRDLSYRLVFLACCVAPTNPRFGGKELRDEEQTAESIKNQMTVKEWEKV
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 RRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGD
... :.:. . :. :.: :. ..:... .:::: : .: . :::::. ..::
CCDS21 FEMSQDKNLYHNLCTSLFPTIHGNDEVKRGVLLMLFGGVPKTTGEGTSLRGDINVCIVGD
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 PGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVV
:.:::::.:: ::. :: .::::::.::::::::.:.:: :..:..:.::..:::.::
CCDS21 PSTAKSQFLKHVEEFSPRAVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEESHEFVIEAGALMLADNGVC
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 CIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKG-E
:::::::: :.::::::::::::::.:::. .:::.: :.::::: . :..:..:. .
CCDS21 CIDEFDKMDVRDQVAIHEAMEQQTISITKAGVKATLNARTSILAAANPISGHYDRSKSLK
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 DNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVITLHVSALTQTQAVEGEIDLAKLKK
.::.. :.::::..::. :: :: : .:.... :: : . .. .. .: ...
CCDS21 QNINLSAPIMSRFDLFFILVDECNEVTDYAIARRIVDLH-SRIEES--IDRVYSLDDIRR
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KB4 FIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAE
.. . : . :..: :. . . ..: .: :.. .. .:: :::::::...:..:
CCDS21 YLLFAR-QFKPKISKESEDFIVEQYKHLR----QRDGSGVTKSSWRITVRQLESMIRLSE
580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KB4 ALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKR
:...:. . :.::.::.. : .
CCDS21 AMARMHCCDEVQPKHVKEAFRLLNKSIIRVETPDVNLDQEEEIQMEVDEGAGGINGHADS
630 640 650 660 670 680
>>CCDS75468.1 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 (818 aa)
initn: 868 init1: 625 opt: 856 Z-score: 992.5 bits: 194.4 E(32554): 5.8e-49
Smith-Waterman score: 966; 33.7% identity (59.5% similar) in 597 aa overlap (136-682:122-700)
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 VADEVTRPRPSGEEVLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKA
: :.: : ..: .: . ::. : :: :.
CCDS75 DFVASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLVRPKV
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 TRISIQCRSCRNTLTNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKCVDFQ
.: : . ..:. . :.: . . . ::. . . . : : :
CCDS75 VRSVHYCPATKKTIER-RYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGL-SVYK--DHQ
160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 TLKLQELPDAVPHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGLTTSRGRDRV
:. .::.:. .: :..:: ... : : ::. ::.:: ..: : : ..:
CCDS75 TITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRC----LPGKKG----
210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 GVGIRSSYIRVLGIQVDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAAL--PNVYEVISKSIAPSI
: :. .:.. : .. ... . : .. ...... .... ..::.::::
CCDS75 --GYTSGTFRTVLIACNVKQMSKDAQPSFSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSLAPSI
260 270 280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 FGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVY
: .:::: :::.:: .. : .: :::::.:..:::..::::::..: .: ..
CCDS75 HGHDYVKKAILCLLLGGVERDLENGSHIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAPRAIP
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 TSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAME
:.:.:::..::::.: : . . .:.::::::: ::::::::::: . ::.::::.::
CCDS75 TTGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIHEVME
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 QQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKGE-DNIDFMPTILSRFDMIFIVKD
: ..:::::: . ::.::::::::: :.::.:. : .:: .. ..:::::..::. :
CCDS75 QGRVTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLFIMLD
440 450 460 470 480 490
530 540 550
pF1KB4 EHNEERDVMLAKHVITLH------------------VSALT------------QTQAVEG
. . :.: .. ::. .: :. :. .:: :
CCDS75 QMDPEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQIYEK
500 510 520 530 540 550
560 570 580 590
pF1KB4 EIDL--------------AKLKKFIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHER
. .: : .::.: .. : :. :.: . ..: .:: :
CCDS75 HDNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKI-IKPVLTQESATYIAEEYSRLRS---QDSM
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 DSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAAL---SG
.:: . :.:.: ::...:.: : .: ... . :.:::..: : . . .: .
CCDS75 SSDTARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLEKEKK
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 TLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLM
. : . ::.: :. ... ::.
CCDS75 RKKRSEDESETEDEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQVHTP
680 690 700 710 720 730
>>CCDS4940.2 MCM3 gene_id:4172|Hs108|chr6 (853 aa)
initn: 868 init1: 625 opt: 856 Z-score: 992.3 bits: 194.4 E(32554): 6e-49
Smith-Waterman score: 1005; 31.2% identity (58.1% similar) in 721 aa overlap (15-682:36-735)
10 20 30 40
pF1KB4 MSGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQR-RFKEFLRQYR
::: .. :.: :. ...: :.:
CCDS49 PPLPRGNLWWREEFGSFRAGVESSWEPPRDFGGGSSLAAGMAGTVVLDDVELREAQRDYL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 VGTDRTGFTFKYRDELKRHYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAA
: :...... . ..: . :...:: .: :. : .. :.: ...:
CCDS49 DFLDDEEDQGIYQSKVRELISDNQYRLIVNVNDLRRKNEKRANRLLNNAFEELVAFQRAL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 KEVADEVTRPRPSGEEVLQDIQVMLKSDASPSSI--RSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAV
: : :. . . ... : :... . . . :.: : ..: .: . ::. : :
CCDS49 K---DFVASIDATYAKQYEEFYVGLEGSFGSKHVSPRTLTSCFLSCVVCVEGIVTKCSLV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 RAKATRISIQCRSCRNTLTNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKC
: :..: : . ..:. . :.: . . . ::. . .
CCDS49 RPKVVRSVHYCPATKKTIER-RYSDLTTLVAFPSSSVYPTKDEENNPLETEYGLSVYK--
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 VDFQTLKLQELPDAVPHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGLTTSRG
: ::. .::.:. .: :..:: ... : : ::. ::.:: ..: : : ..:
CCDS49 -DHQTITIQEMPEKAPAGQLPRSVDVILDDDLVDKAKPGDRVQVVGTYRC----LPGKKG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB4 RDRVGVGIRSSYIRVLGIQVDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAAL--PNVYEVISKSI
: :. .:.. : .. ... . : .. ...... .... ..::.
CCDS49 ------GYTSGTFRTVLIACNVKQMSKDAQPSFSAEDIAKIKKFSKTRSKDIFDQLAKSL
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 APSIFGGTDMKKAIACLLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSP
:::: : .:::: :::.:: .. : .: :::::.:..:::..::::::..: .:
CCDS49 APSIHGHDYVKKAILCLLLGGVERDLENGSHIRGDINILLIGDPSVAKSQLLRYVLCTAP
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 IGVYTSGKGSSAAGLTASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIH
.. :.:.:::..::::.: : . . .:.::::::: ::::::::::: . ::.:::
CCDS49 RAIPTTGRGSSGVGLTAAVTTDQETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMSDMDRTAIH
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 EAMEQQTISIAKAGITTTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKGE-DNIDFMPTILSRFDMIF
:.::: ..:::::: . ::.::::::::: :.::.:. : .:: .. ..:::::..:
CCDS49 EVMEQGRVTIAKAGIHARLNARCSVLAAANPVYGRYDQYKTPMENIGLQDSLLSRFDLLF
470 480 490 500 510 520
520 530 540
pF1KB4 IVKDEHNEERDVMLAKHVITLH------------------VSALT------------QTQ
:. :. . :.: .. ::. .: :. :. .::
CCDS49 IMLDQMDPEQDREISDHVLRMHRYRAPGEQDGDAMPLGSAVDILATDDPNFSQEDQQDTQ
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590
pF1KB4 AVEGEIDL--------------AKLKKFIAYCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGAR
: . .: : .::.: .. : :. :.: . ..: .::
CCDS49 IYEKHDNLLHGTKKKKEKMVSAAFMKKYIHVAKI-IKPVLTQESATYIAEEYSRLRS---
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 QHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAAL-
: .:: . :.:.: ::...:.: : .: ... . :.:::..: : . . .:
CCDS49 QDSMSSDTARTSPVTARTLETLIRLATAHAKARMSKTVDLQDAEEAVELVQYAYFKKVLE
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 --SGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKV
. . : . ::.: :. ... ::.
CCDS49 KEKKRKKRSEDESETEDEEEKSQEDQEQKRKRRKTRQPDAKDGDSYDPYDFSDTEEEMPQ
710 720 730 740 750 760
720 730
pF1KB4 LQLMLRRGEIQHRMQRKVLYRLK
CCDS49 VHTPKTADSQETKESQKVELSESRLKAFKVALLDVFREAHAQSIGMNRLTESINRDSEEP
770 780 790 800 810 820
>>CCDS3043.1 MCM2 gene_id:4171|Hs108|chr3 (904 aa)
initn: 1001 init1: 615 opt: 827 Z-score: 958.1 bits: 188.2 E(32554): 4.8e-47
Smith-Waterman score: 1122; 31.8% identity (60.7% similar) in 741 aa overlap (30-730:194-900)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MSGFDDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDEL
....:::.::: . . .. : . :
CCDS30 DEEMIESIENLEDLKGHSVREWVSMAGPRLEIHHRFKNFLRTHVDSHGHNVFKERISDMC
170 180 190 200 210 220
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 KRHYNLGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEVTRPRPSGEE
:.. : . :..::::. .. :: .: . ::: ::...::: :: : :. ..
CCDS30 KENR---ESLV-VNYEDLAAREHVLAYFLPEAPAELLQIFDEAALEV---VLAMYPKYDR
230 240 250 260 270
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 VLQDIQVMLKSDASPSSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTL
. . :.: .. .:::.. ...:.. :.. . ..: . . .. .: .: .:
CCDS30 ITNHIHVRISHLPLVEELRSLRQLHLNQLIRTSGVVTSCTGVLPQLSMVKYNCNKCNFVL
280 290 300 310 320 330
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 TNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQAGRPKCP-LDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAVPH
. . . : . : .: :.: :. . .. ..: ...:: : :
CCDS30 GPFCQSQNQE--VKPGSC-------PECQSAGPFEVNMEETIYQNYQRIRIQESPGKVAA
340 350 360 370 380
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 GEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFG-LTTSRGRDRVGVGIRSSYIRVL
:..:: . : :. ::... . ::: . : :.:. : .. : ....
CCDS30 GRLPRSKDAILLADLVDSCKPGDEIELTGIYHNNYDGSLNTANGFPVFATVILANHV---
390 400 410 420 430 440
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 GIQVDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLL
. ... .: .. .. . . :. .. : : ::::::.: :.:...: :
CCDS30 -----AKKDNKVAVGELTDEDVKMITSLSKDQQIGEKIFASIAPSIYGHEDIKRGLALAL
450 460 470 480 490
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 FGGSRKRLPDGLTR-RGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTA
::: : : : . :::::.:. :::::::::.::..:: : ...:.:.:.::.::::
CCDS30 FGGEPKN-PGGKHKVRGDINVLLCGDPGTAKSQFLKYIEKVSSRAIFTTGQGASAVGLTA
500 510 520 530 540 550
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 SVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITT
:.: : ::.. .:.::.:::: :: ::::::: ..::..::::::::.:::.::::.:
CCDS30 YVQRHPVSREWTLEAGALVLADRGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVT
560 570 580 590 600 610
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 TLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKG-EDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKH
.:..::.:.:::: . ::.: . .:.:. :.::::.. .:.: . .: :::.
CCDS30 SLQARCTVIAAANPIGGRYDPSLTFSENVDLTEPIISRFDILCVVRDTVDPVQDEMLARF
620 630 640 650 660 670
540 550 560 570
pF1KB4 VITLHVS-------------------ALTQTQAVEGEIDLAKLKKFIAYCRVKCGPRLSA
:. :: :. .: .:: . :::.: : . . :.:.
CCDS30 VVGSHVRHHPSNKEEEGLANGSAAEPAMPNTYGVE-PLPQEVLKKYIIYAKERVHPKLNQ
680 690 700 710 720 730
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 EAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEAD
.:. . : .: ..: .:::::::..:...:.::: ....:. .. : :
CCDS30 MDQDKVAKMYSDLR-------KESMATGSIPITVRHIESMIRMAEAHARIHLRDYVIEDD
740 750 760 770 780 790
640 650 660 670 680
pF1KB4 VEEALRLFQVSTLDA-------ALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQL------KRRF
:. :.:.. : .:. .. :.. .: ....:.: : ::: .:
CCDS30 VNMAIRVMLESFIDTQKFSVMRSMRKTFARYLSFR-RDNNELLLFILKQLVAEQVTYQRN
800 810 820 830 840
690 700 710 720 730
pF1KB4 AIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQL----MLRRGEIQHRMQRKVLYRLK
.:.: . . . .: . ::.. . ..: ....: ..::..
CCDS30 RFGAQQDTIEVPEKDLVDKARQINIHNLSAFYDSELFRMNKFSHDLKRKMILQQF
850 860 870 880 890 900
>>CCDS56447.1 MCM9 gene_id:254394|Hs108|chr6 (1143 aa)
initn: 660 init1: 330 opt: 762 Z-score: 881.0 bits: 174.3 E(32554): 9.5e-43
Smith-Waterman score: 849; 28.0% identity (60.6% similar) in 668 aa overlap (35-691:13-647)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 DDPGIFYSDSFGGDAQADEGQARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDELKRHYN
:. .. .:. . . .: ::: ::
CCDS56 MNSDQVTLVGQVFESYVSEYH--KNDILLILKERDE-DAHYP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LGEYWIEVEMEDLASFDEDLADYLYKQPAEHLQLLEEAAKEVADEVTRP--RPSGEEVLQ
. :. : . ....:. :.: : ... : .. : . . .: . . :
CCDS56 -----VVVNAMTLFETNMEIGEYFNMFPSEVLTIFDSALRRSALTILQSLSQPEAVSMKQ
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB4 DIQVMLKS-DASPSSIRSL--KSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTL
.... ... . : .: :. ..:.... : .: .: :.. . . .: .:....
CCDS56 NLHARISGLPVCPELVREHIPKTKDVGHFLSVTGTVIRTSLVKVLEFERDYMCNKCKHVF
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 TNIAMRPGLEGYALPRKCNTDQA---GRPKCPLDPYFIMPDKCKCVDFQTLKLQELPDAV
. : . : .: . .. .. : :. : .:. :.: .:.:: . .
CCDS56 VIKADFEQYYTFCRPSSCPSLESCDSSKFTC-LSGLSSSPTRCR--DYQEIKIQEQVQRL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 PHGEMPRHMQLYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGLTTSRGRDRVGVGIRSSYIRV
: .:: :.. . : :. :. .::.:: .... . : .: . ....::.:
CCDS56 SVGSIPRSMKVILEDDLVDSCKSGDDLTIYGIV-MQRWKPFQQDVRCEVEIVLKANYIQV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LGIQVDTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAALPNV-YEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIAC
. : .:: . :. . :. .. . : . .:: :. :..:: .: :.:
CCDS56 NNEQ----SSGIIMDEEVQKEFEDFWEYYKSDPFAGRNVILASLCPQVFGMYLVKLAVAM
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 LLFGGSRKRLPDGLTRRGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLT
.: :: .. : ::. .::..:::::.:::.::.. : .: .: :.: ::..::::
CCDS56 VLAGGIQRTDATGTRVRGESHLLLVGDPGTGKSQFLKYAAKITPRSVLTTGIGSTSAGLT
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 ASVMRDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGIT
.....: . : .:.::.::::.:. :::::....: ::..:::::::::::.::::..
CCDS56 VTAVKDSGEWN--LEAGALVLADAGLCCIDEFNSLKEHDRTSIHEAMEQQTISVAKAGLV
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 TTLNSRCSVLAAANSVFGRWDETKGED-NIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAK
::.: ..:::.: :..: .. . :: . .:::::.:... : .::. : ....
CCDS56 CKLNTRTTILAATNPK-GQYDPQESVSVNIALGSPLLSRFDLILVLLDTKNEDWDRIISS
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 HVITLHVSALTQTQAVEGEIDLAKLKKFIAYCRVKC-GPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGA
.. . : .. :.: . .: .. : :: ...... ::
CCDS56 FIL----ENKGYPSKSEKLWSMEKMKTY--FCLIRNLQPTLS-DVGNQVLLRYY------
510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 RQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALSKMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAAL
: .:.:: :.. :.: ::...:.::: ... .. .: :. .. ... : .::
CCDS56 -QMQRQSDCRNAARTTIRLLESLIRLAEAHARLMFRDTVTLEDAITVVSVMESSMQGGAL
560 570 580 590 600
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 SGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFAIGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQ
: ..... .. :. .: . . ... . : .::
CCDS56 LGGVNALHTSFPENPGEQYQRQCELILEKLELQSLLSEELRRLERLQNQSVHQSQPRVLE
610 620 630 640 650 660
720 730
pF1KB4 LMLRRGEIQHRMQRKVLYRLK
CCDS56 VETTPGSLRNGPGEESNFRTSSQQEINYSTHIFSPGGSPEGSPVLDPPPHLEPNRSTSRK
670 680 690 700 710 720
>>CCDS13094.1 MCM8 gene_id:84515|Hs108|chr20 (840 aa)
initn: 746 init1: 341 opt: 695 Z-score: 804.9 bits: 159.8 E(32554): 1.6e-38
Smith-Waterman score: 862; 29.2% identity (60.7% similar) in 699 aa overlap (56-693:112-790)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 ARKSQLQRRFKEFLRQYRVGTDRTGFTFKYRDELKRHYNLGEYWIEV-EMEDLASFDEDL
.::..:. .. . :. : ..... :.
CCDS13 FSEVYSDSSPLIEKIQAFEKFFTRHIDLYDKDEIERKGSILVDFKELTEGGEVTNLIPDI
90 100 110 120 130 140
90 100 110 120 130
pF1KB4 ADYLYKQPAEHL--------QLLEEAAKEVADEVTRPRP---SGEEVLQDIQVMLKS-DA
: : : . : :.: . .. : :. . .:: ... .. . .
CCDS13 ATELRDAPEKTLACMGLAIHQVLTKDLERHAAELQAQEGLSNDGETMVNVPHIHARVYNY
150 160 170 180 190 200
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 SP-SSIRSLKSDMMSHLVKIPGIIIAASAVRAKATRISIQCRSCRNTLTNIAMRPGLEG-
: ............. . . : .. .: .. :.... : .: .: : .:
CCDS13 EPLTQLKNVRANYYGKYIALRGTVVRVSNIKPLCTKMAFLCAAC----GEIQSFPLPDGK
210 220 230 240 250
200 210 220 230 240
pF1KB4 YALPRKCNTDQAGRPKCPLDPYFIMPDKCKCV--DFQTLKLQEL--PDAVPHGEMPRHMQ
:.:: :: . : : . . .. : :.:..:.::: : :..:: ..
CCDS13 YSLPTKCPV-----PVCRGRSFTALRSSPLTVTMDWQSIKIQELMSDDQREAGRIPRTIE
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LYCDRYLCDKVVPGNRVTIMGIYSIKKFGLTTSRGRDRVG--VGIRSSYI---RVLGIQV
. : :. :::. ::: :: .... . :. . :... : . .
CCDS13 CELVHDLVDSCVPGDTVTITGIVKVSNAEEGSRNKNDKCMFLLYIEANSISNSKGQKTKS
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 DTDGSGRSFAGAVSPQEEEEFRRLAALPNVYEVISKSIAPSIFGGTDMKKAIACLLFGGS
. :: ... : .. .... : :....: .:. : ::: .: ..: :::::
CCDS13 SEDGCKHGMLMEFSLKDLYAIQEIQAEENLFKLIVNSLCPVIFGHELVKAGLALALFGGS
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410
pF1KB4 RKRLPDG--LTRRGDINLLMLGDPGTAKSQLLKFVEKCSPIGVYTSGKGSSAAGLTASVM
.: : . ::: ..:..:::: .:::.:. . . .: :::. :. ....:::...
CCDS13 QKYADDKNRIPIRGDPHILVVGDPGLGKSQMLQAACNVAPRGVYVCGNTTTTSGLTVTLS
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 RDPSSRNFIMEGGAMVLADGGVVCIDEFDKMREDDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTTLN
.: :: .: .:.::.::.: :. ::::::: .. . :. ::::::.::.::::.. .:
CCDS13 KDSSSGDFALEAGALVLGDQGICGIDEFDKMGNQHQ-ALLEAMEQQSISLAKAGVVCSLP
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 SRCSVLAAANSVFGRWDETKG-EDNIDFMPTILSRFDMIFIVKDEHNEERDVMLAKHVIT
.: :..:::: : :.....: .:. . ..:::::..::. : ::..: .:..:::.
CCDS13 ARTSIIAAANPVGGHYNKAKTVSENLKMGSALLSRFDLVFILLDTPNEHHDHLLSEHVIA
560 570 580 590 600 610
540 550 560
pF1KB4 LH------VSALT------------------------QTQAVEGE-IDLAK---LKKFIA
.. .:. : . ..: :: :: :.:.:.
CCDS13 IRAGKQRTISSATVARMNSQDSNTSVLEVVSEKPLSERLKVVPGETIDPIPHQLLRKYIG
620 630 640 650 660 670
570 580 590 600 610 620
pF1KB4 YCRVKCGPRLSAEAAEKLKNRYIIMRSGARQHERDSDRRSSIPITVRQLEAIVRIAEALS
: : ::::.:::. :.. :. .: ..:.: .: :::.::::...:..:: .
CCDS13 YARQYVYPRLSTEAARVLQDFYLELR-------KQSQRLNSSPITTRQLESLIRLTEARA
680 690 700 710 720
630 640 650 660 670 680
pF1KB4 KMKLQPFATEADVEEALRLFQVSTLDAALSGTLSGVEGFTSQEDQEMLSRIEKQLKRRFA
...:. ::. :.:. ..... : : .. : ..... ::. . : .: . :: ..
CCDS13 RLELREEATKEDAEDIVEIMKYSML-GTYSDEFGNLDFERSQHGSGMSNR--STAKRFIS
730 740 750 760 770 780
690 700 710 720 730
pF1KB4 IGSQVSEHSIIKDFTKQKYPEHAIHKVLQLMLRRGEIQHRMQRKVLYRLK
..:.:..
CCDS13 ALNNVAERTYNNIFQFHQLRQIAKELNIQVADFENFIGSLNDQGYLLKKGPKVYQLQTM
790 800 810 820 830 840
734 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:14:48 2016 done: Fri Nov 4 03:14:49 2016
Total Scan time: 3.810 Total Display time: 0.200
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]