Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4782
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4782, 347 aa
1>>>pF1KB4782 347 - 347 aa - 347 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5289+/- 0.001; mu= 10.9213+/- 0.058
mean_var=191.9957+/-45.605, 0's: 0 Z-trim(110.2): 743 B-trim: 265 in 1/49
Lambda= 0.092561
statistics sampled from 10592 (11458) to 10592 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.352), width: 16
Scan time: 2.640
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS48015.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 347) 2417 335.4 4.2e-92
CCDS55339.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 338) 2243 312.2 4.1e-85
CCDS55338.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 331) 2236 311.2 7.7e-85
CCDS6854.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 313) 2172 302.6 2.8e-82
CCDS1394.1 NEK7 gene_id:140609|Hs108|chr1 ( 302) 1624 229.4 2.9e-60
CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13 ( 708) 627 96.8 5.8e-20
CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189) 628 97.2 7.3e-20
CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1214) 628 97.2 7.4e-20
CCDS56350.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1242) 628 97.2 7.5e-20
CCDS47162.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1258) 628 97.3 7.5e-20
CCDS56351.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1286) 628 97.3 7.6e-20
CCDS73576.1 NEK3 gene_id:4752|Hs108|chr13 ( 506) 609 94.2 2.5e-19
CCDS2863.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3 ( 841) 610 94.6 3.1e-19
CCDS32597.1 NEK8 gene_id:284086|Hs108|chr17 ( 692) 592 92.1 1.5e-18
CCDS55682.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 384) 579 90.0 3.4e-18
CCDS73024.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 388) 579 90.0 3.4e-18
CCDS1500.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 445) 579 90.1 3.7e-18
CCDS46915.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 470) 575 89.6 5.6e-18
CCDS82836.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 482) 575 89.6 5.7e-18
CCDS54639.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 599) 575 89.8 6.5e-18
CCDS3069.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 645) 575 89.8 6.8e-18
CCDS9839.1 NEK9 gene_id:91754|Hs108|chr14 ( 979) 566 88.8 2e-17
CCDS58750.1 STK36 gene_id:27148|Hs108|chr2 (1294) 514 82.0 2.9e-15
CCDS2421.1 STK36 gene_id:27148|Hs108|chr2 (1315) 514 82.1 3e-15
CCDS33293.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 ( 510) 505 80.3 3.8e-15
CCDS63020.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 (1215) 505 80.8 6.5e-15
CCDS2176.2 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 (1328) 505 80.9 6.8e-15
CCDS63021.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 ( 460) 489 78.1 1.6e-14
CCDS63022.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 ( 462) 480 76.9 3.7e-14
CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049) 462 75.0 3.2e-13
CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1122) 462 75.0 3.3e-13
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 456 73.7 3.5e-13
CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1235) 462 75.1 3.5e-13
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 455 73.5 3.5e-13
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 451 73.1 5.5e-13
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 449 72.7 6.2e-13
CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 ( 898) 453 73.7 6.6e-13
CCDS82837.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 540) 449 72.9 7.1e-13
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 448 72.7 7.6e-13
CCDS34566.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1558) 455 74.3 7.7e-13
CCDS75544.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1604) 455 74.3 7.8e-13
CCDS34565.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1608) 455 74.3 7.8e-13
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 443 71.7 8.6e-13
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 445 72.2 9.1e-13
CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 ( 853) 441 72.1 2e-12
CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001) 441 72.2 2.2e-12
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 435 71.4 4e-12
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 435 71.4 4.1e-12
CCDS35212.2 MAP3K15 gene_id:389840|Hs108|chrX (1313) 434 71.4 4.8e-12
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 431 70.8 5.3e-12
>>CCDS48015.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 (347 aa)
initn: 2417 init1: 2417 opt: 2417 Z-score: 1767.0 bits: 335.4 E(32554): 4.2e-92
Smith-Waterman score: 2417; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MPRREVCWEAAHFRQEEQSLPRPRVRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MPRREVCWEAAHFRQEEQSLPRPRVRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 PDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB4 PPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
310 320 330 340
>>CCDS55339.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 (338 aa)
initn: 2243 init1: 2243 opt: 2243 Z-score: 1641.6 bits: 312.2 E(32554): 4.1e-85
Smith-Waterman score: 2243; 99.1% identity (99.4% similar) in 327 aa overlap (21-347:12-338)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MPRREVCWEAAHFRQEEQSLPRPRVRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHP
: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MEATGWDSRCSPGTQVRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 PDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPE
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KB4 PPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
300 310 320 330
>>CCDS55338.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 (331 aa)
initn: 2231 init1: 2231 opt: 2236 Z-score: 1636.6 bits: 311.2 E(32554): 7.7e-85
Smith-Waterman score: 2236; 99.1% identity (99.1% similar) in 327 aa overlap (21-347:6-331)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MPRREVCWEAAHFRQEEQSLPRPRVRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHP
: : :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MGRRRPAP-FRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHP
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 PDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPE
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHS
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDY
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340
pF1KB4 PPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
290 300 310 320 330
>>CCDS6854.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 (313 aa)
initn: 2172 init1: 2172 opt: 2172 Z-score: 1590.7 bits: 302.6 E(32554): 2.8e-82
Smith-Waterman score: 2172; 100.0% identity (100.0% similar) in 313 aa overlap (35-347:1-313)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 EVCWEAAHFRQEEQSLPRPRVRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHPPDPQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHPPDPQ
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKARQDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 RHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKARQDC
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPERTVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 VKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPERTVW
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHSLVGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHSLVGT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDYPPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDYPPLP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340
pF1KB4 GEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
280 290 300 310
>>CCDS1394.1 NEK7 gene_id:140609|Hs108|chr1 (302 aa)
initn: 1614 init1: 1614 opt: 1624 Z-score: 1195.4 bits: 229.4 E(32554): 2.9e-60
Smith-Waterman score: 1624; 80.0% identity (91.3% similar) in 300 aa overlap (53-347:4-302)
30 40 50 60 70
pF1KB4 PRVRALVRLACRMAGQPGHMPHGGSSNNLCHTLGPVHPPDPQRHPNTLSFR-----CSLA
.. : :: :: .:. ..: .::
CCDS13 MDEQSQGMQGPPVPQFQPQK-ALRPDMGYNTLA
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 DFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQIFEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHP
.:.::::::::::::::.:.:::: :::::::::..:::::: ::.::: ::::::::
CCDS13 NFRIEKKIGRGQFSEVYRAACLLDGVPVALKKVQIFDLMDAKARADCIKEIDLLKQLNHP
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 NIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSAVEHM
:.::: :::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::::::.:::
CCDS13 NVIKYYASFIEDNELNIVLELADAGDLSRMIKHFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSALEHM
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 HSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS13 HSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFFSSKTTAAHSLVGTPYYMSPERIHENG
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 YNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSLCQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVS
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::..::::.::.::.
CCDS13 YNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLYSLCKKIEQCDYPPLPSDHYSEELRQLVN
220 230 240 250 260 270
320 330 340
pF1KB4 MCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSST
::: :::..:::. ::..:::.:: .:.
CCDS13 MCINPDPEKRPDVTYVYDVAKRMHACTASS
280 290 300
>>CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13 (708 aa)
initn: 500 init1: 244 opt: 627 Z-score: 471.8 bits: 96.8 E(32554): 5.8e-20
Smith-Waterman score: 627; 38.5% identity (72.0% similar) in 257 aa overlap (79-333:4-253)
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 NNLCHTLGPVHPPDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALK
... : ::.: :...: : : : ..:
CCDS31 MDKYDVIKAIGQGAFGKAYLAKGKSDSKHCVIK
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 KVQIFEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMI
... :: : . .. ::. ::....::::. ...:: :...: ::.: :.::: . :
CCDS31 EIN-FEKMPIQEKEASKKEVILLEKMKHPNIVAFFNSFQENGRLFIVMEYCDGGDLMKRI
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 KYFKKQKRLIPERTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVV-KLGDLGL
. ... :. : . .:::. ...:.:.:...::::: :.:.. .:.: ::::.:.
CCDS31 N--RQRGVLFSEDQILGWFVQISLGLKHIHDRKILHRDIKAQNIFLSKNGMVAKLGDFGI
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 GRFFSSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMN
.: ... :.. .:::::.::: ... :: :.:::::::.:::. .:. :: :. :
CCDS31 ARVLNNSMELARTCIGTPYYLSPEICQNKPYNNKTDIWSLGCVLYELCTLKHPFEGN--N
160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 LFSLCQKIEQCDYPPL-PGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQVAKQMHIWMSS
: .: :: : . :. :: .:..:. :.:. . .:..::.:. .
CCDS31 LQQLVLKICQAHFAPISPG--FSRELHSLISQLFQVSPRDRPSINSILKRPFLENLIPKY
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 T
CCDS31 LTPEVIQEEFSHMLICRAGAPASRHAGKVVQKCKIQKVRFQGKCPPRSRISVPIKRNAIL
270 280 290 300 310 320
>>CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189 aa)
initn: 528 init1: 381 opt: 628 Z-score: 470.1 bits: 97.2 E(32554): 7.3e-20
Smith-Waterman score: 628; 37.5% identity (73.0% similar) in 267 aa overlap (83-345:8-267)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 HTLGPVHPPDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQI
.:::.:.:... . : . ..:...:
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINI
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 FEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFK
.: ..: :.. .:...: ...::::..: .:: :.. : ::.. ..::: .: ..
CCDS56 SRM-SSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDL---FKRIN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 KQKR-LIPERTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFF
:: :. : . .:::.: :..:.:.:...::::: :.:.: :.:.:::.:..: .
CCDS56 AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVL
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 SSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSL
.: . :.. .:::::.::: ... :: :::::.:::.:::. .:. : . .:. .:
CCDS56 NSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMK--NL
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340
pF1KB4 CQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQ---VAKQMHIWMSST
:: . ..::. . ::: :: :::. . .:..::... . . .::... ..:
CCDS56 VLKIISGSFPPV-SLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQL
220 230 240 250 260 270
CCDS56 IAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLH
280 290 300 310 320 330
>>CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1214 aa)
initn: 528 init1: 381 opt: 628 Z-score: 470.0 bits: 97.2 E(32554): 7.4e-20
Smith-Waterman score: 628; 37.5% identity (73.0% similar) in 267 aa overlap (83-345:8-267)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 HTLGPVHPPDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQI
.:::.:.:... . : . ..:...:
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINI
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 FEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFK
.: ..: :.. .:...: ...::::..: .:: :.. : ::.. ..::: .: ..
CCDS56 SRM-SSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDL---FKRIN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 KQKR-LIPERTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFF
:: :. : . .:::.: :..:.:.:...::::: :.:.: :.:.:::.:..: .
CCDS56 AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVL
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 SSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSL
.: . :.. .:::::.::: ... :: :::::.:::.:::. .:. : . .:. .:
CCDS56 NSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMK--NL
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340
pF1KB4 CQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQ---VAKQMHIWMSST
:: . ..::. . ::: :: :::. . .:..::... . . .::... ..:
CCDS56 VLKIISGSFPPV-SLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQL
220 230 240 250 260 270
CCDS56 IAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLH
280 290 300 310 320 330
>>CCDS56350.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1242 aa)
initn: 528 init1: 381 opt: 628 Z-score: 469.9 bits: 97.2 E(32554): 7.5e-20
Smith-Waterman score: 628; 37.5% identity (73.0% similar) in 267 aa overlap (83-345:8-267)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 HTLGPVHPPDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQI
.:::.:.:... . : . ..:...:
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINI
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 FEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFK
.: ..: :.. .:...: ...::::..: .:: :.. : ::.. ..::: .: ..
CCDS56 SRM-SSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDL---FKRIN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 KQKR-LIPERTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFF
:: :. : . .:::.: :..:.:.:...::::: :.:.: :.:.:::.:..: .
CCDS56 AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVL
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 SSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSL
.: . :.. .:::::.::: ... :: :::::.:::.:::. .:. : . .:. .:
CCDS56 NSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMK--NL
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340
pF1KB4 CQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQ---VAKQMHIWMSST
:: . ..::. . ::: :: :::. . .:..::... . . .::... ..:
CCDS56 VLKIISGSFPPV-SLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQL
220 230 240 250 260 270
CCDS56 IAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLH
280 290 300 310 320 330
>>CCDS47162.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1258 aa)
initn: 528 init1: 381 opt: 628 Z-score: 469.9 bits: 97.3 E(32554): 7.5e-20
Smith-Waterman score: 628; 37.5% identity (73.0% similar) in 267 aa overlap (83-345:8-267)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 HTLGPVHPPDPQRHPNTLSFRCSLADFQIEKKIGRGQFSEVYKATCLLDRKTVALKKVQI
.:::.:.:... . : . ..:...:
CCDS47 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINI
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 FEMMDAKARQDCVKEIGLLKQLNHPNIIKYLDSFIEDNELNIVLELADAGDLSQMIKYFK
.: ..: :.. .:...: ...::::..: .:: :.. : ::.. ..::: .: ..
CCDS47 SRM-SSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDL---FKRIN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 KQKR-LIPERTVWKYFVQLCSAVEHMHSRRVMHRDIKPANVFITATGVVKLGDLGLGRFF
:: :. : . .:::.: :..:.:.:...::::: :.:.: :.:.:::.:..: .
CCDS47 AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVL
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 SSETTAAHSLVGTPYYMSPERIHENGYNFKSDIWSLGCLLYEMAALQSPFYGDKMNLFSL
.: . :.. .:::::.::: ... :: :::::.:::.:::. .:. : . .:. .:
CCDS47 NSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMK--NL
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340
pF1KB4 CQKIEQCDYPPLPGEHYSEKLRELVSMCICPDPHQRPDIGYVHQ---VAKQMHIWMSST
:: . ..::. . ::: :: :::. . .:..::... . . .::... ..:
CCDS47 VLKIISGSFPPV-SLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQL
220 230 240 250 260 270
CCDS47 IAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLH
280 290 300 310 320 330
347 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 15:30:26 2016 done: Thu Nov 3 15:30:27 2016
Total Scan time: 2.640 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]