Result of FASTA (omim) for
pF1KB4569
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4569, 548 aa
1>>>pF1KB4569 548 - 548 aa - 548 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5972+/-0.000463; mu= 22.4414+/- 0.028
mean_var=69.7079+/-14.999, 0's: 0 Z-trim(108.5): 215 B-trim: 954 in 1/49
Lambda= 0.153615
statistics sampled from 16346 (16581) to 16346 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.527), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 7.130
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_061181 (OMIM: 611699) synaptic vesicle 2-relate ( 548) 3649 818.7 0
XP_005250200 (OMIM: 611700) PREDICTED: putative tr ( 492) 1236 283.9 8.1e-76
NP_001132928 (OMIM: 611700) putative transporter S ( 492) 1236 283.9 8.1e-76
NP_001318121 (OMIM: 611700) putative transporter S ( 401) 1006 232.8 1.5e-60
XP_011514099 (OMIM: 611700) PREDICTED: putative tr ( 340) 806 188.4 3e-47
XP_016867236 (OMIM: 611700) PREDICTED: putative tr ( 340) 806 188.4 3e-47
XP_016867237 (OMIM: 611700) PREDICTED: putative tr ( 340) 806 188.4 3e-47
NP_777619 (OMIM: 611700) putative transporter SVOP ( 340) 806 188.4 3e-47
NP_001284645 (OMIM: 610291) synaptic vesicle glyco ( 676) 385 95.4 6e-19
NP_055794 (OMIM: 610291) synaptic vesicle glycopro ( 727) 385 95.4 6.3e-19
XP_011541584 (OMIM: 610291) PREDICTED: synaptic ve ( 727) 385 95.4 6.3e-19
XP_011541583 (OMIM: 610291) PREDICTED: synaptic ve ( 727) 385 95.4 6.3e-19
NP_003049 (OMIM: 602608) solute carrier family 22 ( 555) 366 91.1 9.7e-18
NP_001315603 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 742) 359 89.7 3.5e-17
NP_001315604 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glyco ( 742) 359 89.7 3.5e-17
NP_055664 (OMIM: 185860) synaptic vesicle glycopro ( 742) 359 89.7 3.5e-17
XP_006715615 (OMIM: 602607) PREDICTED: solute carr ( 483) 355 88.6 4.8e-17
NP_694857 (OMIM: 602607) solute carrier family 22 ( 506) 355 88.6 4.9e-17
XP_005267160 (OMIM: 602607) PREDICTED: solute carr ( 573) 355 88.7 5.4e-17
XP_005267159 (OMIM: 602607) PREDICTED: solute carr ( 610) 355 88.7 5.6e-17
NP_004247 (OMIM: 604047) solute carrier family 22 ( 551) 341 85.6 4.5e-16
NP_001309963 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 616) 334 84.1 1.4e-15
XP_005255055 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic ve ( 683) 334 84.1 1.5e-15
NP_001309960 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 334 84.1 1.5e-15
XP_016878250 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic ve ( 683) 334 84.1 1.5e-15
NP_001309967 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 334 84.1 1.5e-15
NP_055663 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glycopro ( 683) 334 84.1 1.5e-15
XP_016878251 (OMIM: 185861) PREDICTED: synaptic ve ( 683) 334 84.1 1.5e-15
NP_001309968 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 334 84.1 1.5e-15
NP_001309961 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 334 84.1 1.5e-15
NP_001309966 (OMIM: 185861) synaptic vesicle glyco ( 683) 334 84.1 1.5e-15
NP_001171662 (OMIM: 607581) solute carrier family ( 451) 324 81.7 5.3e-15
NP_001171661 (OMIM: 607581) solute carrier family ( 542) 324 81.8 6e-15
NP_004245 (OMIM: 607581) solute carrier family 22 ( 542) 324 81.8 6e-15
XP_011543666 (OMIM: 607581) PREDICTED: solute carr ( 419) 322 81.2 6.9e-15
NP_001171665 (OMIM: 607581) solute carrier family ( 419) 322 81.2 6.9e-15
NP_003051 (OMIM: 212140,603377) solute carrier fam ( 557) 315 79.8 2.5e-14
XP_005265642 (OMIM: 604048) PREDICTED: solute carr ( 594) 281 72.3 4.8e-12
NP_004794 (OMIM: 604048) solute carrier family 22 ( 594) 281 72.3 4.8e-12
NP_001306962 (OMIM: 604048) solute carrier family ( 594) 281 72.3 4.8e-12
XP_011532547 (OMIM: 604048) PREDICTED: solute carr ( 594) 281 72.3 4.8e-12
XP_006713479 (OMIM: 604048) PREDICTED: solute carr ( 675) 281 72.4 5.2e-12
NP_001294914 (OMIM: 607097) solute carrier family ( 442) 275 70.8 9.7e-12
NP_060954 (OMIM: 607097) solute carrier family 22 ( 550) 275 70.9 1.1e-11
NP_003048 (OMIM: 602607) solute carrier family 22 ( 554) 273 70.5 1.6e-11
XP_005267162 (OMIM: 602607) PREDICTED: solute carr ( 418) 269 69.5 2.3e-11
XP_005267161 (OMIM: 602607) PREDICTED: solute carr ( 418) 269 69.5 2.3e-11
XP_011534376 (OMIM: 602607) PREDICTED: solute carr ( 418) 269 69.5 2.3e-11
NP_695009 (OMIM: 607582) solute carrier family 22 ( 506) 258 67.1 1.5e-10
NP_695010 (OMIM: 607582) solute carrier family 22 ( 519) 258 67.1 1.5e-10
>>NP_061181 (OMIM: 611699) synaptic vesicle 2-related pr (548 aa)
initn: 3649 init1: 3649 opt: 3649 Z-score: 4371.7 bits: 818.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3649; 100.0% identity (100.0% similar) in 548 aa overlap (1-548:1-548)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEEDLFQLRQLPVVKFRRTGESARSEDDTASGEHEVQIEGVHVGLEAVELDDGAAVPKEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MEEDLFQLRQLPVVKFRRTGESARSEDDTASGEHEVQIEGVHVGLEAVELDDGAAVPKEF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ANPTDDTFMVEDAVEAIGFGKFQWKLSVLTGLAWMADAMEMMILSILAPQLHCEWRLPSW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ANPTDDTFMVEDAVEAIGFGKFQWKLSVLTGLAWMADAMEMMILSILAPQLHCEWRLPSW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QVALLTSVVFVGMMSSSTLWGNISDQYGRKTGLKISVLWTLYYGILSAFAPVYSWILVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 QVALLTSVVFVGMMSSSTLWGNISDQYGRKTGLKISVLWTLYYGILSAFAPVYSWILVLR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 GLVGFGIGGVPQSVTLYAEFLPMKARAKCILLIEVFWAIGTVFEVVLAVFVMPSLGWRWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 GLVGFGIGGVPQSVTLYAEFLPMKARAKCILLIEVFWAIGTVFEVVLAVFVMPSLGWRWL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LILSAVPLLLFAVLCFWLPESARYDVLSGNQEKAIATLKRIATENGAPMPLGKLIISRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LILSAVPLLLFAVLCFWLPESARYDVLSGNQEKAIATLKRIATENGAPMPLGKLIISRQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 DRGKMRDLFTPHFRWTTLLLWFIWFSNAFSYYGLVLLTTELFQAGDVCGISSRKKAVEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DRGKMRDLFTPHFRWTTLLLWFIWFSNAFSYYGLVLLTTELFQAGDVCGISSRKKAVEAK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 CSLACEYLSEEDYMDLLWTTLSEFPGVLVTLWIIDRLGRKKTMALCFVIFSFCSLLLFIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 CSLACEYLSEEDYMDLLWTTLSEFPGVLVTLWIIDRLGRKKTMALCFVIFSFCSLLLFIC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VGRNVLTLLLFIARAFISGGFQAAYVYTPEVYPTATRALGLGTCSGMARVGALITPFIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 VGRNVLTLLLFIARAFISGGFQAAYVYTPEVYPTATRALGLGTCSGMARVGALITPFIAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 VMLESSVYLTLAVYSGCCLLAALASCFLPIETKGRGLQESSHREWGQEMVGRGMHGAGVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 VMLESSVYLTLAVYSGCCLLAALASCFLPIETKGRGLQESSHREWGQEMVGRGMHGAGVT
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RSNSGSQE
::::::::
NP_061 RSNSGSQE
>>XP_005250200 (OMIM: 611700) PREDICTED: putative transp (492 aa)
initn: 1225 init1: 867 opt: 1236 Z-score: 1482.2 bits: 283.9 E(85289): 8.1e-76
Smith-Waterman score: 1236; 39.1% identity (72.2% similar) in 478 aa overlap (49-519:16-490)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 TGESARSEDDTASGEHEVQIEGVHVGLEAVELDDGAAVPKEFANPTDDTFMVEDAVEAIG
.:. :.: :. .: :: ::::::.::
XP_005 MATKPTEPVTILSLRKLSLGTAEPQ-VKEP--KTFTVEDAVETIG
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 FGKFQWKLSVLTGLAWMADAMEMMILSILAPQLHCEWRLPSWQVALLTSVVFVGMMSSST
::.:. : .. : . ...:::.:......: ..:::.: .:::::.:..:: :.: :
XP_005 FGRFHIALFLIMGSTGVVEAMEIMLIAVVSPVIRCEWQLENWQVALVTTMVFFGYMVFSI
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 LWGNISDQYGRKTGLKISVLWTLYYGILSAFAPVYSWILVLRGLVGFGIGGVPQSVTLYA
:.: ..:.::: : :: :: :...:..::: : :.. :: .:: :..: :.. . .
XP_005 LFGLLADRYGRWKILLISFLWGAYFSLLTSFAPSYIWFVFLRTMVGCGVSGHSQGLIIKT
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 EFLPMKARAKCILLIEVFWAIGTVFEVVLAVFVMPSLGWRWLLILSAVPLLLFAVLCFWL
:::: : :. . : .::: :... . :: ..:..:::::. ....: ... : ..
XP_005 EFLPTKYRGYMLPLSQVFWLAGSLLIIGLASVIIPTIGWRWLIRVASIPGIILIVAFKFI
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 PESARYDVLSGNQEKAIATLKRIATENGAPMPLGKLIISRQEDRGKMRDLFTPHFRWTTL
:::::..: .:: . :.:::.:.: : . :: :::. : ::.. ::. .. :::
XP_005 PESARFNVSTGNTRAALATLERVAKMNRSVMPEGKLVEPVLEKRGRFADLLDAKYLRTTL
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 LLWFIWFSNAFSYYGLVLLTTELFQAGDVCGISSRKKAV-------EAKCSLACEYLSEE
.: ::.. .:.:::..: ..::.. ::: .: . .: :.. :....
XP_005 QIWVIWLGISFAYYGVILASAELLERDLVCGSKSDSAVVVTGGDSGESQSPCYCHMFAPS
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 DYMDLLWTTLSEFPGVLVTLWIIDRLGRKKTMALCFVIFSFCSLLLFICVGRNVLTLLLF
:: .. .:..:. ... :. :::. .... . .. ::: ::.. : .::
XP_005 DYRTMIISTIGEIALNPLNILGINFLGRRLSLSITMGCTALFFLLLNICTSSAGLIGFLF
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 IARAFISGGFQAAYVYTPEVYPTATRALGLGTCSGMARVGALITPFIAQVMLESSVYLTL
. ::.....:...:.:: :::::. ::::.:: ... :.::...:::.::.. .:. .:
XP_005 MLRALVAANFNTVYIYTAEVYPTTMRALGMGTSGSLCRIGAMVAPFISQVLMSASILGAL
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540
pF1KB4 AVYSGCCLLAALASCFLPIETKGRGLQESSHREWGQEMVGRGMHGAGVTRSNSGSQE
..:. :.. :... ::::::::.::.
XP_005 CLFSSVCVVCAISAFTLPIETKGRALQQIK
470 480 490
>>NP_001132928 (OMIM: 611700) putative transporter SVOPL (492 aa)
initn: 1225 init1: 867 opt: 1236 Z-score: 1482.2 bits: 283.9 E(85289): 8.1e-76
Smith-Waterman score: 1236; 39.1% identity (72.2% similar) in 478 aa overlap (49-519:16-490)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 TGESARSEDDTASGEHEVQIEGVHVGLEAVELDDGAAVPKEFANPTDDTFMVEDAVEAIG
.:. :.: :. .: :: ::::::.::
NP_001 MATKPTEPVTILSLRKLSLGTAEPQ-VKEP--KTFTVEDAVETIG
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 FGKFQWKLSVLTGLAWMADAMEMMILSILAPQLHCEWRLPSWQVALLTSVVFVGMMSSST
::.:. : .. : . ...:::.:......: ..:::.: .:::::.:..:: :.: :
NP_001 FGRFHIALFLIMGSTGVVEAMEIMLIAVVSPVIRCEWQLENWQVALVTTMVFFGYMVFSI
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 LWGNISDQYGRKTGLKISVLWTLYYGILSAFAPVYSWILVLRGLVGFGIGGVPQSVTLYA
:.: ..:.::: : :: :: :...:..::: : :.. :: .:: :..: :.. . .
NP_001 LFGLLADRYGRWKILLISFLWGAYFSLLTSFAPSYIWFVFLRTMVGCGVSGHSQGLIIKT
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 EFLPMKARAKCILLIEVFWAIGTVFEVVLAVFVMPSLGWRWLLILSAVPLLLFAVLCFWL
:::: : :. . : .::: :... . :: ..:..:::::. ....: ... : ..
NP_001 EFLPTKYRGYMLPLSQVFWLAGSLLIIGLASVIIPTIGWRWLIRVASIPGIILIVAFKFI
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 PESARYDVLSGNQEKAIATLKRIATENGAPMPLGKLIISRQEDRGKMRDLFTPHFRWTTL
:::::..: .:: . :.:::.:.: : . :: :::. : ::.. ::. .. :::
NP_001 PESARFNVSTGNTRAALATLERVAKMNRSVMPEGKLVEPVLEKRGRFADLLDAKYLRTTL
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 LLWFIWFSNAFSYYGLVLLTTELFQAGDVCGISSRKKAV-------EAKCSLACEYLSEE
.: ::.. .:.:::..: ..::.. ::: .: . .: :.. :....
NP_001 QIWVIWLGISFAYYGVILASAELLERDLVCGSKSDSAVVVTGGDSGESQSPCYCHMFAPS
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 DYMDLLWTTLSEFPGVLVTLWIIDRLGRKKTMALCFVIFSFCSLLLFICVGRNVLTLLLF
:: .. .:..:. ... :. :::. .... . .. ::: ::.. : .::
NP_001 DYRTMIISTIGEIALNPLNILGINFLGRRLSLSITMGCTALFFLLLNICTSSAGLIGFLF
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 IARAFISGGFQAAYVYTPEVYPTATRALGLGTCSGMARVGALITPFIAQVMLESSVYLTL
. ::.....:...:.:: :::::. ::::.:: ... :.::...:::.::.. .:. .:
NP_001 MLRALVAANFNTVYIYTAEVYPTTMRALGMGTSGSLCRIGAMVAPFISQVLMSASILGAL
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540
pF1KB4 AVYSGCCLLAALASCFLPIETKGRGLQESSHREWGQEMVGRGMHGAGVTRSNSGSQE
..:. :.. :... ::::::::.::.
NP_001 CLFSSVCVVCAISAFTLPIETKGRALQQIK
470 480 490
>>NP_001318121 (OMIM: 611700) putative transporter SVOPL (401 aa)
initn: 1000 init1: 642 opt: 1006 Z-score: 1207.8 bits: 232.8 E(85289): 1.5e-60
Smith-Waterman score: 1006; 38.1% identity (70.9% similar) in 399 aa overlap (128-519:1-399)
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 AMEMMILSILAPQLHCEWRLPSWQVALLTSVVFVGMMSSSTLWGNISDQYGRKTGLKISV
.:: :.: : :.: ..:.::: : ::
NP_001 MVFFGYMVFSILFGLLADRYGRWKILLISF
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 LWTLYYGILSAFAPVYSWILVLRGLVGFGIGGVPQSVTLYAEFLPMKARAKCILLIEVFW
:: :...:..::: : :.. :: .:: :..: :.. . .:::: : :. . : .:::
NP_001 LWGAYFSLLTSFAPSYIWFVFLRTMVGCGVSGHSQGLIIKTEFLPTKYRGYMLPLSQVFW
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 AIGTVFEVVLAVFVMPSLGWRWLLILSAVPLLLFAVLCFWLPESARYDVLSGNQEKAIAT
:... . :: ..:..:::::. ....: ... : ..:::::..: .:: . :.::
NP_001 LAGSLLIIGLASVIIPTIGWRWLIRVASIPGIILIVAFKFIPESARFNVSTGNTRAALAT
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 LKRIATENGAPMPLGKLIISRQEDRGKMRDLFTPHFRWTTLLLWFIWFSNAFSYYGLVLL
:.:.: : . :: :::. : ::.. ::. .. ::: .: ::.. .:.:::..:
NP_001 LERVAKMNRSVMPEGKLVEPVLEKRGRFADLLDAKYLRTTLQIWVIWLGISFAYYGVILA
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 TTELFQAGDVCGISSRKKAV-------EAKCSLACEYLSEEDYMDLLWTTLSEFPGVLVT
..::.. ::: .: . .: :.. :.... :: .. .:..:. ..
NP_001 SAELLERDLVCGSKSDSAVVVTGGDSGESQSPCYCHMFAPSDYRTMIISTIGEIALNPLN
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 LWIIDRLGRKKTMALCFVIFSFCSLLLFICVGRNVLTLLLFIARAFISGGFQAAYVYTPE
. :. :::. .... . .. ::: ::.. : .::. ::.....:...:.:: :
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pF1KB4 VYPTATRALGLGTCSGMARVGALITPFIAQVMLESSVYLTLAVYSGCCLLAALASCFLPI
::::. ::::.:: ... :.::...:::.::.. .:. .: ..:. :.. :... :::
NP_001 VYPTTMRALGMGTSGSLCRIGAMVAPFISQVLMSASILGALCLFSSVCVVCAISAFTLPI
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520 530 540
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:::::.::.
NP_001 ETKGRALQQIK
400
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pF1KB4 TMALCFVIFSFCSLLLFICVGRNVLTLLLFIARAFISGGFQAAYVYTPEVYPTATRALGL
.... . .. ::: ::.. : .::. ::.....:...:.:: :::::. ::::.
XP_011 SLSITMGCTALFFLLLNICTSSAGLIGFLFMLRALVAANFNTVYIYTAEVYPTTMRALGM
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pF1KB4 GTCSGMARVGALITPFIAQVMLESSVYLTLAVYSGCCLLAALASCFLPIETKGRGLQESS
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XP_011 GTSGSLCRIGAMVAPFISQVLMSASILGALCLFSSVCVVCAISAFTLPIETKGRALQQIK
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530 540
pF1KB4 HREWGQEMVGRGMHGAGVTRSNSGSQE
>>XP_016867236 (OMIM: 611700) PREDICTED: putative transp (340 aa)
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Smith-Waterman score: 806; 37.2% identity (71.0% similar) in 328 aa overlap (199-519:11-338)
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 FAPVYSWILVLRGLVGFGIGGVPQSVTLYAEFLPMKARAKCILLIEVFWAIGTVFEVVLA
:::: : :. . : .::: :... . ::
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230 240 250 260 270 280
pF1KB4 VFVMPSLGWRWLLILSAVPLLLFAVLCFWLPESARYDVLSGNQEKAIATLKRIATENGAP
..:..:::::. ....: ... : ..:::::..: .:: . :.:::.:.: : .
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XP_016 GSKSDSAVVVTGGDSGESQSPCYCHMFAPSDYRTMIISTIGEIALNPLNILGINFLGRRL
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pF1KB4 TMALCFVIFSFCSLLLFICVGRNVLTLLLFIARAFISGGFQAAYVYTPEVYPTATRALGL
.... . .. ::: ::.. : .::. ::.....:...:.:: :::::. ::::.
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pF1KB4 GTCSGMARVGALITPFIAQVMLESSVYLTLAVYSGCCLLAALASCFLPIETKGRGLQESS
:: ... :.::...:::.::.. .:. .: ..:. :.. :... ::::::::.::.
XP_016 GTSGSLCRIGAMVAPFISQVLMSASILGALCLFSSVCVVCAISAFTLPIETKGRALQQIK
290 300 310 320 330 340
530 540
pF1KB4 HREWGQEMVGRGMHGAGVTRSNSGSQE
>>XP_016867237 (OMIM: 611700) PREDICTED: putative transp (340 aa)
initn: 800 init1: 442 opt: 806 Z-score: 969.2 bits: 188.4 E(85289): 3e-47
Smith-Waterman score: 806; 37.2% identity (71.0% similar) in 328 aa overlap (199-519:11-338)
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pF1KB4 FAPVYSWILVLRGLVGFGIGGVPQSVTLYAEFLPMKARAKCILLIEVFWAIGTVFEVVLA
:::: : :. . : .::: :... . ::
XP_016 MAAGRLIIKTEFLPTKYRGYMLPLSQVFWLAGSLLIIGLA
10 20 30 40
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pF1KB4 VFVMPSLGWRWLLILSAVPLLLFAVLCFWLPESARYDVLSGNQEKAIATLKRIATENGAP
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XP_016 SVIIPTIGWRWLIRVASIPGIILIVAFKFIPESARFNVSTGNTRAALATLERVAKMNRSV
50 60 70 80 90 100
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XP_016 MPEGKLVEPVLEKRGRFADLLDAKYLRTTLQIWVIWLGISFAYYGVILASAELLERDLVC
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pF1KB4 GISSRKKAV-------EAKCSLACEYLSEEDYMDLLWTTLSEFPGVLVTLWIIDRLGRKK
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XP_016 GSKSDSAVVVTGGDSGESQSPCYCHMFAPSDYRTMIISTIGEIALNPLNILGINFLGRRL
170 180 190 200 210 220
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 TMALCFVIFSFCSLLLFICVGRNVLTLLLFIARAFISGGFQAAYVYTPEVYPTATRALGL
.... . .. ::: ::.. : .::. ::.....:...:.:: :::::. ::::.
XP_016 SLSITMGCTALFFLLLNICTSSAGLIGFLFMLRALVAANFNTVYIYTAEVYPTTMRALGM
230 240 250 260 270 280
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 GTCSGMARVGALITPFIAQVMLESSVYLTLAVYSGCCLLAALASCFLPIETKGRGLQESS
:: ... :.::...:::.::.. .:. .: ..:. :.. :... ::::::::.::.
XP_016 GTSGSLCRIGAMVAPFISQVLMSASILGALCLFSSVCVVCAISAFTLPIETKGRALQQIK
290 300 310 320 330 340
530 540
pF1KB4 HREWGQEMVGRGMHGAGVTRSNSGSQE
>>NP_777619 (OMIM: 611700) putative transporter SVOPL is (340 aa)
initn: 800 init1: 442 opt: 806 Z-score: 969.2 bits: 188.4 E(85289): 3e-47
Smith-Waterman score: 806; 37.2% identity (71.0% similar) in 328 aa overlap (199-519:11-338)
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 FAPVYSWILVLRGLVGFGIGGVPQSVTLYAEFLPMKARAKCILLIEVFWAIGTVFEVVLA
:::: : :. . : .::: :... . ::
NP_777 MAAGRLIIKTEFLPTKYRGYMLPLSQVFWLAGSLLIIGLA
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230 240 250 260 270 280
pF1KB4 VFVMPSLGWRWLLILSAVPLLLFAVLCFWLPESARYDVLSGNQEKAIATLKRIATENGAP
..:..:::::. ....: ... : ..:::::..: .:: . :.:::.:.: : .
NP_777 SVIIPTIGWRWLIRVASIPGIILIVAFKFIPESARFNVSTGNTRAALATLERVAKMNRSV
50 60 70 80 90 100
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pF1KB4 MPLGKLIISRQEDRGKMRDLFTPHFRWTTLLLWFIWFSNAFSYYGLVLLTTELFQAGDVC
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NP_777 MPEGKLVEPVLEKRGRFADLLDAKYLRTTLQIWVIWLGISFAYYGVILASAELLERDLVC
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pF1KB4 GISSRKKAV-------EAKCSLACEYLSEEDYMDLLWTTLSEFPGVLVTLWIIDRLGRKK
: .: . .: :.. :.... :: .. .:..:. ... :. :::.
NP_777 GSKSDSAVVVTGGDSGESQSPCYCHMFAPSDYRTMIISTIGEIALNPLNILGINFLGRRL
170 180 190 200 210 220
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pF1KB4 TMALCFVIFSFCSLLLFICVGRNVLTLLLFIARAFISGGFQAAYVYTPEVYPTATRALGL
.... . .. ::: ::.. : .::. ::.....:...:.:: :::::. ::::.
NP_777 SLSITMGCTALFFLLLNICTSSAGLIGFLFMLRALVAANFNTVYIYTAEVYPTTMRALGM
230 240 250 260 270 280
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pF1KB4 GTCSGMARVGALITPFIAQVMLESSVYLTLAVYSGCCLLAALASCFLPIETKGRGLQESS
:: ... :.::...:::.::.. .:. .: ..:. :.. :... ::::::::.::.
NP_777 GTSGSLCRIGAMVAPFISQVLMSASILGALCLFSSVCVVCAISAFTLPIETKGRALQQIK
290 300 310 320 330 340
530 540
pF1KB4 HREWGQEMVGRGMHGAGVTRSNSGSQE
>>NP_001284645 (OMIM: 610291) synaptic vesicle glycoprot (676 aa)
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110 120 130 140 150 160
pF1KB4 MMILSILAPQLHCEWRLPSWQVALLTSVVFVGMMSSSTLWGNISDQYGRKTGLKISVLWT
....... :. . . .:. . : :.:..::: .. .::...:. ::: .: : . .
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170 180 190 200 210
pF1KB4 LYYGILSAFAPVYSWILVLRGLVGFGIGG-VPQSVTLYAEFLPMKARAKCILLIEVFWAI
....::.:. :...: : : :::::: .: . .:: : . :.. . . .:: :
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pF1KB4 GTVFEVVLAVFVMPSLGWR-----------W--LLILSAVPLLLFAVLCFWLPESARYDV
: .. ..: ..: :: : ..:. :.: . .: ..::: :. .
NP_001 GGIYASAMAWAIIPHYGWSFSMGSAYQFHSWRVFVIVCALPCVSSVVALTFMPESPRFLL
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270 280 290 300
pF1KB4 LSGNQEKAIATLKRIATEN----GAP---MPLGKLIISRQED------------------
:....: :: : : : : . ..:. .: :
NP_001 EVGKHDEAWMILKLIHDTNMRARGQPEKVFTVNKIKTPKQIDELIEIESDTGTWYRRCFV
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310 320 330 340 350
pF1KB4 --RGKMRDL-------FTPHFRWTTLLLWFIWFSNAFSYYGLVLLTTELFQAGDVCGISS
: .. . :. : .:. : ..::. .:.::::
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pF1KB4 RKKAVEAKCSLACEYLSEEDYMDLLWTTLSEFPGVLVTLWIIDRLGRKKTMALCFVIFSF
NP_001 LTRNVERDKYANFTINFTMENQIHTGMEYDNGRFIGVKFKSVTFKDSVFKSCTFEDVTSV
470 480 490 500 510 520
>>NP_055794 (OMIM: 610291) synaptic vesicle glycoprotein (727 aa)
initn: 545 init1: 287 opt: 385 Z-score: 460.7 bits: 95.4 E(85289): 6.3e-19
Smith-Waterman score: 422; 27.9% identity (55.8% similar) in 312 aa overlap (71-334:139-450)
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 VHVGLEAVELDDGAAVPKEFANPTDDTFMVEDAVEAIGFGKFQWKLSVLTGLAWMADAME
: .. : :.::: : . :.: :::..:
NP_055 VGQPKGDEYKDRRELESERRADEEELAQQYELIIQECGHGRFQWALFFVLGMALMADGVE
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 MMILSILAPQLHCEWRLPSWQVALLTSVVFVGMMSSSTLWGNISDQYGRKTGLKISVLWT
....... :. . . .:. . : :.:..::: .. .::...:. ::: .: : . .
NP_055 VFVVGFVLPSAETDLCIPNSGSGWLGSIVYLGMMVGAFFWGGLADKVGRKQSLLICMSVN
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210
pF1KB4 LYYGILSAFAPVYSWILVLRGLVGFGIGG-VPQSVTLYAEFLPMKARAKCILLIEVFWAI
....::.:. :...: : : :::::: .: . .:: : . :.. . . .:: :
NP_055 GFFAFLSSFVQGYGFFLFCRLLSGFGIGGAIPTVFSYFAEVLAREKRGEHLSWLCMFWMI
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260
pF1KB4 GTVFEVVLAVFVMPSLGWR-----------W--LLILSAVPLLLFAVLCFWLPESARYDV
: .. ..: ..: :: : ..:. :.: . .: ..::: :. .
NP_055 GGIYASAMAWAIIPHYGWSFSMGSAYQFHSWRVFVIVCALPCVSSVVALTFMPESPRFLL
290 300 310 320 330 340
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pF1KB4 LSGNQEKAIATLKRIATEN----GAP---MPLGKLIISRQED------------------
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NP_055 EVGKHDEAWMILKLIHDTNMRARGQPEKVFTVNKIKTPKQIDELIEIESDTGTWYRRCFV
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pF1KB4 --RGKMRDL-------FTPHFRWTTLLLWFIWFSNAFSYYGLVLLTTELFQAGDVCGISS
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NP_055 RIRTELYGIWLTFMRCFNYPVRDNTIKLTIVWFTLSFGYYGLSVWFPDVIKPLQSDEYAL
410 420 430 440 450 460
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pF1KB4 RKKAVEAKCSLACEYLSEEDYMDLLWTTLSEFPGVLVTLWIIDRLGRKKTMALCFVIFSF
NP_055 LTRNVERDKYANFTINFTMENQIHTGMEYDNGRFIGVKFKSVTFKDSVFKSCTFEDVTSV
470 480 490 500 510 520
548 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 05:55:15 2016 done: Sat Nov 5 05:55:16 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]