FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4431, 890 aa
1>>>pF1KB4431 890 - 890 aa - 890 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.9646+/-0.0011; mu= -11.7213+/- 0.064
mean_var=429.4109+/-96.936, 0's: 0 Z-trim(111.9): 358 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.061892
statistics sampled from 12359 (12766) to 12359 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16
Scan time: 4.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 890) 6031 554.1 4.1e-157
CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 845) 5735 527.6 3.6e-149
CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 885) 2244 215.9 2.5e-55
CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 626) 1822 178.1 4.3e-44
CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 894) 1822 178.3 5.6e-44
CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 ( 999) 1632 161.3 7.8e-39
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 787 86.2 7.6e-16
CCDS482.1 TIE1 gene_id:7075|Hs108|chr1 (1138) 773 84.7 1.1e-15
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 755 83.1 3.7e-15
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 755 83.1 3.7e-15
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 748 82.5 5.7e-15
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 748 82.5 5.8e-15
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 714 79.5 4.7e-14
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 714 79.5 4.8e-14
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 704 78.6 8.3e-14
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1351) 704 78.6 8.6e-14
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1400) 704 78.6 8.8e-14
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 698 78.0 1.2e-13
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 686 76.8 1.8e-13
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 686 76.8 1.9e-13
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 692 77.6 2.1e-13
CCDS78389.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 ( 976) 681 76.4 2.8e-13
CCDS77820.1 RYK gene_id:6259|Hs108|chr3 ( 607) 673 75.5 3.2e-13
CCDS75016.1 RYK gene_id:6259|Hs108|chr3 ( 610) 673 75.5 3.3e-13
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 675 75.9 4.4e-13
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 675 75.9 4.4e-13
CCDS75825.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1081) 672 75.6 5.3e-13
CCDS6519.1 TEK gene_id:7010|Hs108|chr9 (1124) 672 75.7 5.5e-13
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 651 73.7 1.6e-12
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 651 73.7 1.6e-12
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 647 73.3 1.9e-12
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 647 73.3 2e-12
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 638 72.4 3.1e-12
CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 869) 639 72.6 3.5e-12
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 638 72.5 3.5e-12
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 638 72.5 3.5e-12
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 636 72.3 3.7e-12
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 635 72.2 3.9e-12
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 635 72.2 3.9e-12
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 635 72.2 4.2e-12
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 635 72.2 4.3e-12
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 635 72.2 4.3e-12
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 635 72.2 4.3e-12
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 635 72.3 4.4e-12
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 630 71.7 4.6e-12
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 630 71.7 5.1e-12
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 630 71.7 5.2e-12
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 630 71.7 5.2e-12
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 630 71.8 5.3e-12
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 629 71.6 5.5e-12
>>CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 (890 aa)
initn: 6031 init1: 6031 opt: 6031 Z-score: 2934.1 bits: 554.1 E(32554): 4.1e-157
Smith-Waterman score: 6031; 99.9% identity (99.9% similar) in 890 aa overlap (1-890:1-890)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MALRRSMGRPGLPPLPLPPPPRLGLLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLTVSQGQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MALRRSMGRPGLPPLPLPPPPRLGLLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLTVSQGQPV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KLNCSVEGMEEPDIQWVKDGAVVQNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLNCSVEGMEEPDIQWVKDGAVVQNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 DGGETEISQPVWLTVEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DGGETEISQPVWLTVEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 GGPAPSPSVLNVTGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGPAPSPSVLNVTGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVNPEAPLEGPLGPYKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS10 ANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVIPEAPLEGPLGPYKL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SWVQDNGTQDELTVEGTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SWVQDNGTQDELTVEGTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 DGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 VILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 CMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 TMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 CLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINIERAEEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINIERAEEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB4 GGTPSDCRYILTPGGLAEQPGQAEHQPESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGTPSDCRYILTPGGLAEQPGQAEHQPESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
850 860 870 880 890
>>CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 (845 aa)
initn: 5735 init1: 5735 opt: 5735 Z-score: 2791.6 bits: 527.6 E(32554): 3.6e-149
Smith-Waterman score: 5735; 99.9% identity (99.9% similar) in 845 aa overlap (46-890:1-845)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 PLPPPPRLGLLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLTVSQGQPVKLNCSVEGMEEPDIQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MGAPVKLTVSQGQPVKLNCSVEGMEEPDIQ
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 WVKDGAVVQNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVEDGGETEISQPVWLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 WVKDGAVVQNLDQLYIPVSEQHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVEDGGETEISQPVWLTV
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 EGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKIGGPAPSPSVLNVTGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKIGGPAPSPSVLNVTGV
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 TQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGRALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGRALL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 QSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRCANALGPSPYADWVPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QSCTVQVTQAPGGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRCANALGPSPYADWVPF
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 QTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVNPEAPLEGPLGPYKLSWVQDNGTQDELTVE
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QTKGLAPASAPQNLHAIRTDSGLILEWEEVIPEAPLEGPLGPYKLSWVQDNGTQDELTVE
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 GTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQGPPHSRTSWVPVVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQGPPHSRTSWVPVVLG
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 VLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VLTALVTAAALALILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATL
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 DSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKAD
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 IIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFL
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KB4 LASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LASRIGENPFNLPLQTLIRFMVDIACGMEYLSSRNFIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFG
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KB4 LSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAG
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KB4 IENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFTCLRMELENILGQLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFTCLRMELENILGQLSV
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830 840 850
pF1KB4 LSASQDPLYINIERAEEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAVGGTPSDCRYILTPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LSASQDPLYINIERAEEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAVGGTPSDCRYILTPGG
760 770 780 790 800 810
860 870 880 890
pF1KB4 LAEQPGQAEHQPESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LAEQPGQAEHQPESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
820 830 840
>>CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 (885 aa)
initn: 1847 init1: 1194 opt: 2244 Z-score: 1106.7 bits: 215.9 E(32554): 2.5e-55
Smith-Waterman score: 2335; 43.2% identity (69.2% similar) in 892 aa overlap (21-873:6-882)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MALRRSMGRPGLPPLPLPPPPRLG-------LLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLT
::.: : : . : . . : ..: : ..:
CCDS12 MAWRCPRMGRVPLAWCLALCGWACMAPRGTQAEESPFVGNPGNIT
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB4 VSQGQPVKLNCS--VEGMEEPDIQWVKDGAVVQNLD--QLYIPVSEQH---WI--GFLSL
..: : :. :.: : :...:..:: ... : : .:..:.. :: . : .
CCDS12 GARGLTGTLRCQLQVQG-EPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRI
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 KSVERSDAGRYWCQVEDGGETEISQPVWLTVEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVG
:.. ::.:.: : : : .: .::: .. .::.:.: ::.: .: :.::.:::.: :
CCDS12 TSLQLSDTGQYQCLVFLGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQG
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 PPEPVTIVWWRGTTKIG-GPAPSPS-VLNVTGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQ
::::: ..: . .. .. .:. .:. :.: :..... ::::::: ::...:::::.
CCDS12 PPEPVDLLWLQDAVPLATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATI--T
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KB4 ALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGW-----------EV
.:: : :. ... . .. ::: :: .: : ::.:.. . : :
CCDS12 VLPQQPRNLHLVSRQPTELEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEP
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 LAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRCANALGPSPYADWVPFQTKGLAPASAPQNLHA
:. . ::: : .: : : : .:: :... ::: .. :.: .: .: . :.:. :
CCDS12 LTSQASVPPHQLRLGSLHPHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISA
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380
pF1KB4 IRTDSGLILEWEEVNPEAPLEGPLGPYKLSWVQDNGTQDELTVEGTRANLT----GWDPQ
:. : ...:.: :.:::.: : :.:.. : . : . : : : ..: :
CCDS12 TRNGSQAFVHWQE--PRAPLQGTLLGYRLAY-QGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSV
350 360 370 380 390
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pF1KB4 KDLIVRVCVSNAVGCGPWSQPLVVSSHDRAGQQGPPHSRTSWVPVVLGVLTALVTAAALA
..: : : . .:.: :::: :. . . . . . : : :.::...: . . ::
CCDS12 SNLTVCVAAYTAAGDGPWSLPVPLEAWRPVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAVVAAACVLILA
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 LILLRKRRKETRFGQAFDSVMARGEPAVHFRAARSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEK
:.:...:.::::.:..:. .. ::: .:..:. .:..:. : :::.:::::.:::::
CCDS12 LFLVHRRKKETRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTE---ATLNSLGISEELKEK
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510 520 530 540 550 560
pF1KB4 LEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQLKQEDGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLR
:.::.. ... .::. ::.::::.: :.::.:.: :..::::: .: : . :..:.::
CCDS12 LRDVMVDRHKVALGKTLGEGEFGAVMEGQLNQDD-SILKVAVKTMKIAICTRSELEDFLS
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pF1KB4 EAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKGRLPIPMVILPFMKHGDLHAFLLASRIGENPFNL
::.::::::::.: .:.:: ... . .: :.::::::::::::.::: ::.:..: :
CCDS12 EAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLYSRLGDQPVYL
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: : :..::.::: ::::::.. ::::::::::::: :.:.:::::::::.:::.:::::
CCDS12 PTQMLVKFMADIASGMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLSKKIYNGDYYR
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pF1KB4 QGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIG
:: .:.::::.:.::::: .:: .::::.:::::::: ::::::: :.::.:::.::
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pF1KB4 GNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFTCLRMELENILGQLSVLSASQDPLYINI
::::::: .:.. .: :: .:: .:..::::: :: .::: : : . .. ::.:.
CCDS12 GNRLKQPADCLDGLYALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNM
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... : : :.:. . : . .: .. : . :. :. ::.: :. . .:.:
CCDS12 DEGGGYPEPPGAAGGADPPTQPDPKDSC---SCLTAAEVHPAG-RYVLCPS-TTPSPAQP
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. : .: .:
CCDS12 ADRGSPAAPGQEDGA
880
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.:. . : :. . ::: : .:
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: : : .:: :... ::: .. :.: .: .: . :.:. : :. : ...:.: :.:
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: :. . . : :: : :. .. : :.::...: . . :::.:...:.
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::::.:..:. .. ::: .:..:. .:..:. : :::.:::::.::::::.::.. .
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.. .::. ::.::::.: :.::.:.: :..::::: .: : . :..:.:: ::.:::::
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:::.: .:.:: ... . .: :.::::::::::::.::: ::.:..: :: : :..:
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:.::: ::::::.. ::::::::::::: :.:.:::::::::.:::.::::::: .:.:
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:::.:.::::: .:: .::::.:::::::: ::::::: :.::.:::.:: :::::::
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.:.. .: :: .:: .:..::::: :: .::: : : . .. ::.:.... :
CCDS62 DCLDGLYALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQEPDEILYVNMDEGGGYPE
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: :.:. . : . .: .. : . :. :. ::.: :. . .:.: . : .
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pF1KB4 PLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
: .:
CCDS62 PGQEDGA
620
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CCDS12 GARGLTGTLRCQLQVQG-EPPEVHWLRDGQILELADSTQTQVPLGEDEQDDWIVVSQLRI
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:.. ::.:.: : : : .: .::: .. .::.:.: ::.: .: :.::.:::.: :
CCDS12 TSLQLSDTGQYQCLVFLGHQTFVSQPGYVGLEGLPYFLEEPEDRTVAANTPFNLSCQAQG
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::::: ..: . .. .. .:. .:. :.: :..... ::::::: ::...:::::.
CCDS12 PPEPVDLLWLQDAVPLATAPGHGPQRSLHVPGLNKTSSFSCEAHNAKGVTTSRTATI--T
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pF1KB4 ALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGRALLQSCTVQVTQAPGGW-----------EV
.:: : :. ... . .. ::: :: .: : ::.:.. . : :
CCDS12 VLPQQPRNLHLVSRQPTELEVAWTPGLSGIYPLTHCTLQAVLSDDGMGIQAGEPDPPEEP
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:. . ::: : .: : : : .:: :... ::: .. :.: .: .: . :.:. :
CCDS12 LTSQASVPPHQLRLGSLHPHTPYHIRVACTSSQGPSSWTHWLPVETPEGVPLGPPENISA
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CCDS12 TRNGSQAFVHWQE--PRAPLQGTLLGYRLAY-QGQDTPEVLMDIGLRQEVTLELQGDGSV
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..: : : . .:.: :::: :. . . : :: : :. .. : :.::..
CCDS12 SNLTVCVAAYTAAGDGPWSLPVPLEAW-RPGQAQPVHQLVKEPSTPAFSWPWWYVLLGAV
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.: . . :::.:...:.::::.:..:. .. ::: .:..:. .:..:. : :::.:
CCDS12 VAAACVLILALFLVHRRKKETRYGEVFEPTVERGELVVRYRVRKSYSRRTTE---ATLNS
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. :..:.:: ::.::::::::.: .:.:: ... . .: :.::::::::::::.:::
CCDS12 TRSELEDFLSEAVCMKEFDHPNVMRLIGVCFQGSERESFPAPVVILPFMKHGDLHSFLLY
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::.:..: :: : :..::.::: ::::::.. ::::::::::::: :.:.:::::::::
CCDS12 SRLGDQPVYLPTQMLVKFMADIASGMEYLSTKRFIHRDLAARNCMLNENMSVCVADFGLS
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pF1KB4 RKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYTVQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAGIE
.:::.::::::: .:.::::.:.::::: .:: .::::.:::::::: ::::::: :.:
CCDS12 KKIYNGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVWSFGVTMWEIATRGQTPYPGVE
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pF1KB4 NAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWSADPKQRPSFTCLRMELENILGQLSVLS
:.:::.:: ::::::: .:.. .: :: .:: .:..::::: :: .::: : : .
CCDS12 NSEIYDYLRQGNRLKQPADCLDGLYALMSRCWELNPQDRPSFTELREDLENTLKALPPAQ
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pF1KB4 ASQDPLYINIERA----EEPTAGGSLELPGRDQPYSGAGDGSGMGAVGGTPSDCRYILTP
.. ::.:.... : : :.:. . : . .: .. : . :. :. ::.: :
CCDS12 EPDEILYVNMDEGGGYPEPPGAAGGADPPTQPDPKDSC---SCLTAAEVHPAG-RYVLCP
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860 870 880 890
pF1KB4 GGLAEQPGQAEHQ--PESPLNETQRLLLLQQGLLPHSSC
. . .:.: . : .: .:
CCDS12 S-TTPSPAQPADRGSPAAPGQEDGA
880 890
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pF1KB4 RLGLLLAALASLLLPESAAAGLKLMGAPVKLTVSQGQPVKLNCSV---EGMEEPDIQWVK
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CCDS20 PHTGNVAIPQVTSVESKPLPPLAFKHTVGHIILSEHKGVKFNCSISVPNIYQDTTISWWK
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80 90 100 110 120 130
pF1KB4 DGAVV----QNLDQLYIPVSE-QHWIGFLSLKSVERSDAGRYWCQVEDGGETEISQPVWL
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CCDS20 DGKELLGAHHAITQFY-PDDEVTAIIASFSITSVQRSDNGSYICKMKINNEEIVSDPIYI
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140 150 160 170 180 190
pF1KB4 TVEGVPFFTVEPKDLAVPPNAPFQLSCEAVGPPEPVTIVWWRGTTKIG-GPAPSPSVLNV
:.:.: :: .:... : :. :.:.:.::::::::.: : ....... : :::::.:
CCDS20 EVQGLPHFTKQPESMNVTRNTAFNLTCQAVGPPEPVNIFWVQNSSRVNEQPEKSPSVLTV
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200 210 220 230 240 250
pF1KB4 TGVTQSTMFSCEAHNLKGLASSRTATVHLQALPAAPFNITVTKLSSSNASVAWMPGADGR
:.:. ..::::::: :::. :. . ....:.:. : .... . .. . ..:.:: ::
CCDS20 PGLTEMAVFSCEAHNDKGLTVSKGVQINIKAIPSPPTEVSIRNSTAHSILISWVPGFDGY
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260 270 280 290 300 310
pF1KB4 ALLQSCTVQVTQA-P-GGWEVLAVVVPVPPFTCLLRDLVPATNYSLRVRCANALGPSPYA
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CCDS20 SPFRNCSIQVKEADPLSNGSVMIFNTSALPHLYQIKQLQALANYSIGVSCMNEIGWSAVS
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pF1KB4 DWVPFQTKGLAPASAPQNLHAIRTDSG--LILEWEEVNPEAPLEGPLGPYKLSWV-QDNG
:. .: ::. :: :. .. ..:. . ..: . : .: : :..: : :. :
CCDS20 PWILASTTEGAPSVAPLNVTVFLNESSDNVDIRWMK-PPTKQQDGELVGYRISHVWQSAG
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pF1KB4 TQDELTVE----GTRANLTGWDPQKDLIVRVCVSNAVGCGPWSQP--LVVSSH---DRAG
. :: : :.:: .. . ::. . . : ::.:.: . . .: : :
CCDS20 ISKELLEEVGQNGSRARISVQVHNATCTVRIAAVTRGGVGPFSDPVKIFIPAHGWVDYAP
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CCDS20 SSTPAPGNADPVLIIFGCFCGFILIGLILYISLAIRKRVQETKFGNAFTE--EDSELVVN
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pF1KB4 FRAARSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQ
. : .:: :. :: :: :::.:.::..:::::.: .. . ::..::.:::::: :..
CCDS20 YIAKKSFCRR---AIELTLHSLGVSEELQNKLEDVVIDRNLLILGKILGEGEFGSVMEGN
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::::::. .::::: .: : .. .::::: ::::::.:.::.: .:.:: .. ..: .
CCDS20 LKQEDGTSLKVAVKTMKLDNSSQREIEEFLSEAACMKDFSHPNVIRLLGVCIEMSSQG-I
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CCDS20 AARNCMLRDDMTVCVADFGLSKKIYSGDYYRQGRIAKMPVKWIAIESLADRVYTSKSDVW
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CCDS20 AFGVTMWEIATRGMTPYPGVQNHEMYDYLLHGHRLKQPEDCLDELYEIMYSCWRTDPLDR
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CCDS20 PTFSVLRLQLEKLLESLPDVRNQADVIYVNTQLLESSEGLAQGSTLAP-LDLNIDPDSII
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CCDS20 ASCTPRAAISVVTAEVHDSKPHEGRYILNGGSEEWEDLTSAPSAAVTAEKNSVLPGERLV
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pF1KB4 LLQQGL-LPHSSC
..:. :::
CCDS20 --RNGVSWSHSSMLPLGSSLPDELLFADDSSEGSEVLM
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>>CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347 aa)
initn: 584 init1: 430 opt: 787 Z-score: 397.9 bits: 86.2 E(32554): 7.6e-16
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: .::.. ...:.. ::.. :... :. ... .. .. . . .
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..:. : . . :: . .:..:.. .:....:: .::.: :: :
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...:: :::. .: :::.: .. .:. :.. :. . :.: : . . .
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:.: :.: .. . : :. . : :. :: . ::.:.. :.::. :..
CCDS51 SFE--GEDGDVICLNSDDIM-PVALMETKNREGLNYMVLATECGQGEEKSEGPLGSQESE
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CCDS51 SCGLRKEEKEPHADKDFCQEKQVAYCPSGKPEGLNYACLTHSGYGDGSD
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CCDS48 VQVAGGAGDPLWIDVDRPEETSTIIRGLNASTRYLFRMRASIQ-GLGDWSNTVEESTLGN
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CCDS48 TAEEA
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. : :: : .: :. :: :. . . :.:: . .: ...: : :
CCDS73 SSSLPLPDRHSGHKAENG-PG-------PGVLVLRASFDERQPYAHMNGGRKNERALPLP
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pF1KB4 QGLLPHSSC
:. :.:
CCDS73 QS----STC
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CCDS10 --NFVFARTMP--AEGADDIPGPVTWEP-RPENSIFLKWPE--PENP-NGLILMYEIKYG
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CCDS10 GYENFIHLIIA-LPVAVLLIVGGLV----IMLYVFHRKRNNSRLGNGV--LYASVNPE-Y
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pF1KB4 FRAARSFNRERPERIEATLDSLGISDELKEKLEDVLIPEQQFTLGRMLGKGEFGSVREAQ
: :: . . :: . . ....:..: ::.: :: : :.
CCDS10 FSAADVY----------------VPDEWE-------VAREKITMSRELGQGSFGMVYEGV
990 1000 1010
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pF1KB4 LKQ--EDGSFVKVAVKMLKADIIASSDIEEFLREAACMKEFDHPHVAKLVGVSLRSRAKG
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CCDS10 AKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIE-FLNEASVMKEFNCHHVVRLLGVV----SQG
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pF1KB4 RLPIPMVILPFMKHGDLHAFLLASR--IGENPFNLP--LQTLIRFMVDIACGMEYLSSRN
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CCDS10 Q-PT-LVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPPSLSKMIQMAGEIADGMAYLNANK
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KB4 FIHRDLAARNCMLAEDMTVCVADFGLSRKIYSGDYYRQGCASKLPVKWLALESLADNLYT
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CCDS10 FVHRDLAARNCMVAEDFTVKIGDFGMTRDIYETDYYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFT
1140 1150 1160 1170 1180 1190
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pF1KB4 VQSDVWAFGVTMWEIMTRGQTPYAGIENAEIYNYLIGGNRLKQPPECMEDVYDLMYQCWS
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CCDS10 TYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRFVMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQ
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CCDS10 YNPKMRPSFLEIISSIKEEMEPGFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEPENMESVPLDPSAS
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pF1KB4 QPYSGAGD-GSGMGAVGGTPSDCRYILTPGGLAEQPGQAEHQPESPLN---ETQRLLLLQ
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CCDS10 SSSLPLPDRHSGHKAENG-PG-------PGVLVLRASFDERQPYAHMNGGRKNERALPLP
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890 residues in 1 query sequences
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