Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4417
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4417, 490 aa
1>>>pF1KB4417 490 - 490 aa - 490 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3653+/-0.000807; mu= 18.3079+/- 0.049
mean_var=72.2857+/-14.532, 0's: 0 Z-trim(108.1): 23 B-trim: 53 in 1/50
Lambda= 0.150851
statistics sampled from 9994 (10006) to 9994 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.307), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33027.1 PLD3 gene_id:23646|Hs108|chr19 ( 490) 3335 735.0 4.3e-212
CCDS9995.2 PLD4 gene_id:122618|Hs108|chr14 ( 506) 1372 307.8 1.8e-83
CCDS76725.1 PLD4 gene_id:122618|Hs108|chr14 ( 513) 1372 307.8 1.8e-83
CCDS55692.1 PLD5 gene_id:200150|Hs108|chr1 ( 474) 858 195.9 8e-50
CCDS1621.2 PLD5 gene_id:200150|Hs108|chr1 ( 536) 858 195.9 8.9e-50
>>CCDS33027.1 PLD3 gene_id:23646|Hs108|chr19 (490 aa)
initn: 3335 init1: 3335 opt: 3335 Z-score: 3921.1 bits: 735.0 E(32554): 4.3e-212
Smith-Waterman score: 3335; 100.0% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MKPKLMYQELKVPAEEPANELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLW
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CCDS33 MKPKLMYQELKVPAEEPANELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLDFPNASTGNPSTSQAWLGLLAGAHSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EYGDLHLFGPNQRPAPCYDPCEAVLVESIPEGLDFPNASTGNPSTSQAWLGLLAGAHSSL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 DIASFYWTLTNNDTHTQEPSAQQGEEVLRQLQTLAPKGVNVRIAVSKPSGPQPQADLQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DIASFYWTLTNNDTHTQEPSAQQGEEVLRQLQTLAPKGVNVRIAVSKPSGPQPQADLQAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCL
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CCDS33 LQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRFYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLC
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CCDS33 ARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTWPRFYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PSGRTPDLKALLNVVDNARSFIYVAVMNYLPTLEFSHPHRFWPAIDDGLRRATYERGVKV
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CCDS33 PSGRTPDLKALLNVVDNARSFIYVAVMNYLPTLEFSHPHRFWPAIDDGLRRATYERGVKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 RLLISCWGHSEPSMRAFLLSLAALRDNHTHSDIQVKLFVVPADEAQARIPYARVNHNKYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RLLISCWGHSEPSMRAFLLSLAALRDNHTHSDIQVKLFVVPADEAQARIPYARVNHNKYM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VTERATYIGTSNWSGNYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAIFLRDWDSPYSHDLDTSA
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CCDS33 VTERATYIGTSNWSGNYFTETAGTSLLVTQNGRGGLRSQLEAIFLRDWDSPYSHDLDTSA
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB4 DSVGNACRLL
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CCDS33 DSVGNACRLL
490
>>CCDS9995.2 PLD4 gene_id:122618|Hs108|chr14 (506 aa)
initn: 1352 init1: 1102 opt: 1372 Z-score: 1612.1 bits: 307.8 E(32554): 1.8e-83
Smith-Waterman score: 1372; 47.4% identity (77.1% similar) in 437 aa overlap (60-487:72-502)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 KAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPA-PCYDPCEAVLVES
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CCDS99 LGSVALICLLWQVPRPPTWGQVQPKDVPRSWEHGSSPAWEPLEAEARQQRDSCQLVLVES
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 IPEGLDFPNASTGNPSTS---QAWLGLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTHTQEPSAQQGE
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CCDS99 IPQ--DLPSAA-GSPSAQPLGQAWLQLLDTAQESVHVASYYWSLTGPDIGVNDSSSQLGE
110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 EVLRQLQTLAPKGVNVRIAVSKPSGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFW
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CCDS99 ALLQKLQQLLGRNISLAVATSSPTLARTSTDLQVLAARGAHVRQVPMGRLTRGVLHSKFW
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 VVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTW
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CCDS99 VVDGRHIYMGSANMDWRSLTQVKELGAVIYNCSHLAQDLEKTFQTYWVLGVPKAVLPKTW
220 230 240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 PRFYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLNVVDNARSFIYVA
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CCDS99 PQNFSSHFNRFQPFHGLFDGVPTTAYFSASPPALCPQGRTRDLEALLAVMGSAQEFIYAS
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 VMNYLPTLEFSHPHRFWPAIDDGLRRATYERGVKVRLLISCWGHSEPSMRAFLLSLAALR
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CCDS99 VMEYFPTTRFSHPPRYWPVLDNALRAAAFGKGVRVRLLVGCGLNTDPTMFPYLRSLQALS
340 350 360 370 380 390
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 DNHTHSDIQVKLFVVPADEAQARIPYARVNHNKYMVTERATYIGTSNWSGNYFTETAGTS
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CCDS99 NPAANVSVDVKVFIVPVGN-HSNIPFSRVNHSKFMVTEKAAYIGTSNWSEDYFSSTAGVG
400 410 420 430 440 450
450 460 470 480 490
pF1KB4 LLVTQN-----GRGGLRSQLEAIFLRDWDSPYSHDLDTSADSVGNACRLL
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CCDS99 LVVTQSPGAQPAGATVQEQLRQLFERDWSSRYAVGLDGQAP--GQDCVWQG
460 470 480 490 500
>>CCDS76725.1 PLD4 gene_id:122618|Hs108|chr14 (513 aa)
initn: 1352 init1: 1102 opt: 1372 Z-score: 1612.0 bits: 307.8 E(32554): 1.8e-83
Smith-Waterman score: 1372; 47.4% identity (77.1% similar) in 437 aa overlap (60-487:79-509)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 KAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPNQRPA-PCYDPCEAVLVES
::.:. . : . : : :. :::::
CCDS76 LGSVALICLLWQVPRPPTWGQVQPKDVPRSWEHGSSPAWEPLEAEARQQRDSCQLVLVES
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 IPEGLDFPNASTGNPSTS---QAWLGLLAGAHSSLDIASFYWTLTNNDTHTQEPSAQQGE
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CCDS76 IPQ--DLPSAA-GSPSAQPLGQAWLQLLDTAQESVHVASYYWSLTGPDIGVNDSSSQLGE
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 EVLRQLQTLAPKGVNVRIAVSKPSGPQPQADLQALLQSGAQVRMVDMQKLTHGVLHTKFW
.:..:: : ..... .:.:.:. . ..:::.: ::.::.: : .::.::::.:::
CCDS76 ALLQKLQQLLGRNISLAVATSSPTLARTSTDLQVLAARGAHVRQVPMGRLTRGVLHSKFW
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 VVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIFEAYWFLGQAGSSIPSTW
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CCDS76 VVDGRHIYMGSANMDWRSLTQVKELGAVIYNCSHLAQDLEKTFQTYWVLGVPKAVLPKTW
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 PRFYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDLKALLNVVDNARSFIYVA
:. .....:. :.. ..:.:. ::....:: :::.::: ::.::: :. .:. :::..
CCDS76 PQNFSSHFNRFQPFHGLFDGVPTTAYFSASPPALCPQGRTRDLEALLAVMGSAQEFIYAS
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 VMNYLPTLEFSHPHRFWPAIDDGLRRATYERGVKVRLLISCWGHSEPSMRAFLLSLAALR
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CCDS76 VMEYFPTTRFSHPPRYWPVLDNALRAAAFGKGVRVRLLVGCGLNTDPTMFPYLRSLQALS
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 DNHTHSDIQVKLFVVPADEAQARIPYARVNHNKYMVTERATYIGTSNWSGNYFTETAGTS
. .. ...::.:.::. . .. ::..::::.:.::::.:.:::::::: .::. :::..
CCDS76 NPAANVSVDVKVFIVPVGN-HSNIPFSRVNHSKFMVTEKAAYIGTSNWSEDYFSSTAGVG
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490
pF1KB4 LLVTQN-----GRGGLRSQLEAIFLRDWDSPYSHDLDTSADSVGNACRLL
:.:::. . . .. ::. .: :::.: :. :: .: :. :
CCDS76 LVVTQSPGAQPAGATVQEQLRQLFERDWSSRYAVGLDGQAP--GQDCVWQG
470 480 490 500 510
>>CCDS55692.1 PLD5 gene_id:200150|Hs108|chr1 (474 aa)
initn: 988 init1: 327 opt: 858 Z-score: 1007.9 bits: 195.9 E(32554): 8e-50
Smith-Waterman score: 996; 36.4% identity (69.1% similar) in 450 aa overlap (42-479:7-443)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 VPAEEPANELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPN
..:.:.: :... :. .. . ..: .
CCDS55 MSQQKCIVIFALVCCFAILVALI---FSAVDIMGED
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KB4 Q---RPAPCYDPCEAVLVESIPEGLDFPNASTGNPSTSQAWLGLLAGAHSSLDIASFYWT
. : . :. .:::.:::::.. . . . : :.:..:: :..:.::.: .:
CCDS55 EDGLSEKNCQNKCRIALVENIPEGLNYSENAPFHLSLFQGWMNLLNMAKKSVDIVSSHWD
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LTNNDTHTQEPSAQQGEEVLRQLQTLAPKGVNVRIAVSKPSGPQPQADLQALLQSGAQVR
: : :: ::: ::......: :. ....... :: .. . :.:: .::.:
CCDS55 L--NHTH---PSACQGQRLFEKLLQLTSQNIEIKL-VSDVTADSKV--LEALKLKGAEVT
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 MVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIF
...: ..: :...::.::. : :.:::..::.:: :.:::::..::::::. :: .::
CCDS55 YMNMTAYNKGRLQSSFWIVDKQHVYIGSAGLDWQSLGQMKELGVIFYNCSCLVLDLQRIF
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EAYWFLGQAGSSIPSTWPRFYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDL
: : . : .:.:: . :..: ... :: : . :.....: .::..:. :.
CCDS55 ALYSSL-KFKSRVPQTWSKRLYGVYDNEKKLQLQLNETKSQAFVSNSPKLFCPKNRSFDI
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 KALLNVVDNARSFIYVAVMNYLPTLEFSHPHRFWPAIDDGLRRATYERGVKVRLLISCWG
:. .:.:.:....:.:::.::: : . .:: .: .:.: :.:.::::.: :
CCDS55 DAIYSVIDDAKQYVYIAVMDYLPISSTSTKRTYWPDLDAKIREALVLRSVRVRLLLSFWK
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 HSEPSMRAFLLSLAALRDNHTHSDIQVKLFVVPADEA-----QARIPYARVNHNKYMVTE
...: :. :: :. . .. ...::.: . ..: : . :.:.::::::.
CCDS55 ETDPLTFNFISSLKAICTEIANCSLKVKFFDLERENACATKEQKNHTFPRLNRNKYMVTD
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470
pF1KB4 RATYIGTSNWSGNYFTETAGTSLLVTQ----NGRGGLRSQLEAIFLRDWDSPYSHDLDTS
:.:::. .: :: ::..:::.:...: :.:. .. ::. .: ::: :::.. :. .
CCDS55 GAAYIGNFDWVGNDFTQNAGTGLVINQADVRNNRSIIK-QLKDVFERDWYSPYAKTLQPT
390 400 410 420 430 440
480 490
pF1KB4 ADSVGNACRLL
CCDS55 KQPNCSSLFKLKPLSNKTATDDTGGKDPRNV
450 460 470
>>CCDS1621.2 PLD5 gene_id:200150|Hs108|chr1 (536 aa)
initn: 988 init1: 327 opt: 858 Z-score: 1007.2 bits: 195.9 E(32554): 8.9e-50
Smith-Waterman score: 996; 36.4% identity (69.1% similar) in 450 aa overlap (42-479:69-505)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 VPAEEPANELPMNEIEAWKAAEKKARWVLLVLILAVVGFGALMTQLFLWEYGDLHLFGPN
..:.:.: :... :. .. . ..: .
CCDS16 NFYSSVKQQDYSASVWLRRKDKLEHSQQKCIVIFALVCCFAILVALI---FSAVDIMGED
40 50 60 70 80 90
80 90 100 110 120
pF1KB4 Q---RPAPCYDPCEAVLVESIPEGLDFPNASTGNPSTSQAWLGLLAGAHSSLDIASFYWT
. : . :. .:::.:::::.. . . . : :.:..:: :..:.::.: .:
CCDS16 EDGLSEKNCQNKCRIALVENIPEGLNYSENAPFHLSLFQGWMNLLNMAKKSVDIVSSHWD
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LTNNDTHTQEPSAQQGEEVLRQLQTLAPKGVNVRIAVSKPSGPQPQADLQALLQSGAQVR
: : :: ::: ::......: :. ....... :: .. . :.:: .::.:
CCDS16 L--NHTH---PSACQGQRLFEKLLQLTSQNIEIKL-VSDVTADSKV--LEALKLKGAEVT
160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 MVDMQKLTHGVLHTKFWVVDQTHFYLGSANMDWRSLTQVKELGVVMYNCSCLARDLTKIF
...: ..: :...::.::. : :.:::..::.:: :.:::::..::::::. :: .::
CCDS16 YMNMTAYNKGRLQSSFWIVDKQHVYIGSAGLDWQSLGQMKELGVIFYNCSCLVLDLQRIF
210 220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EAYWFLGQAGSSIPSTWPRFYDTRYNQETPMEICLNGTPALAYLASAPPPLCPSGRTPDL
: : . : .:.:: . :..: ... :: : . :.....: .::..:. :.
CCDS16 ALYSSL-KFKSRVPQTWSKRLYGVYDNEKKLQLQLNETKSQAFVSNSPKLFCPKNRSFDI
270 280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 KALLNVVDNARSFIYVAVMNYLPTLEFSHPHRFWPAIDDGLRRATYERGVKVRLLISCWG
:. .:.:.:....:.:::.::: : . .:: .: .:.: :.:.::::.: :
CCDS16 DAIYSVIDDAKQYVYIAVMDYLPISSTSTKRTYWPDLDAKIREALVLRSVRVRLLLSFWK
330 340 350 360 370 380
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 HSEPSMRAFLLSLAALRDNHTHSDIQVKLFVVPADEA-----QARIPYARVNHNKYMVTE
...: :. :: :. . .. ...::.: . ..: : . :.:.::::::.
CCDS16 ETDPLTFNFISSLKAICTEIANCSLKVKFFDLERENACATKEQKNHTFPRLNRNKYMVTD
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470
pF1KB4 RATYIGTSNWSGNYFTETAGTSLLVTQ----NGRGGLRSQLEAIFLRDWDSPYSHDLDTS
:.:::. .: :: ::..:::.:...: :.:. .. ::. .: ::: :::.. :. .
CCDS16 GAAYIGNFDWVGNDFTQNAGTGLVINQADVRNNRSIIK-QLKDVFERDWYSPYAKTLQPT
450 460 470 480 490 500
480 490
pF1KB4 ADSVGNACRLL
CCDS16 KQPNCSSLFKLKPLSNKTATDDTGGKDPRNV
510 520 530
490 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 05:51:09 2016 done: Sat Nov 5 05:51:10 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]