Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4380
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4380, 391 aa
1>>>pF1KB4380 391 - 391 aa - 391 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8554+/-0.000895; mu= 11.7012+/- 0.055
mean_var=149.6425+/-34.562, 0's: 0 Z-trim(111.8): 336 B-trim: 1389 in 2/50
Lambda= 0.104845
statistics sampled from 12154 (12671) to 12154 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.389), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 2580 401.7 5.9e-112
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 1463 232.7 4.3e-61
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 1143 184.3 1.5e-46
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 1087 175.8 5.4e-44
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 1049 170.2 3.2e-42
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 923 151.1 1.7e-36
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 923 151.2 2e-36
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 917 150.2 3.1e-36
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 917 150.2 3.1e-36
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CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 917 150.2 3.2e-36
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 917 150.2 3.2e-36
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 917 150.2 3.3e-36
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 917 150.2 3.3e-36
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 917 150.2 3.4e-36
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 890 146.1 5.1e-35
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 878 144.3 1.8e-34
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 841 138.6 8.7e-33
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 804 133.0 3.9e-31
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 781 129.5 4.2e-30
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 780 129.4 4.8e-30
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 760 126.3 3.6e-29
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 737 122.8 4e-28
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 666 112.2 8.8e-25
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 ( 340) 576 98.5 9.5e-21
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 573 98.1 1.4e-20
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 573 98.1 1.4e-20
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 573 98.1 1.4e-20
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 565 96.9 3.3e-20
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 554 95.2 1e-19
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 548 94.3 1.9e-19
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 547 94.1 2e-19
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 529 91.4 1.3e-18
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 529 91.4 1.4e-18
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 528 91.3 1.5e-18
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 515 89.3 6.1e-18
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 514 89.2 7e-18
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 512 88.9 8.2e-18
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 512 88.9 8.3e-18
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 503 87.5 2.1e-17
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 503 87.5 2.2e-17
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 502 87.4 2.4e-17
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 500 87.0 2.8e-17
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 499 86.9 3.1e-17
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 496 86.5 4.5e-17
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 493 86.0 5.8e-17
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 489 85.4 9e-17
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 482 84.3 1.9e-16
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 478 83.7 2.8e-16
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 478 83.7 2.9e-16
>>CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 2580 init1: 2580 opt: 2580 Z-score: 2123.4 bits: 401.7 E(32554): 5.9e-112
Smith-Waterman score: 2580; 100.0% identity (100.0% similar) in 391 aa overlap (1-391:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MFPNGTASSPSSSPSPSPGSCGEGGGSRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGSAIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 MFPNGTASSPSSSPSPSPGSCGEGGGSRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGSAIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRYAKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 ISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRYAKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIYCLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRPTVAKVVNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 RHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIYCLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRPTVAKVVNLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTVACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVGAIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 VWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTVACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVGAIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPFYVVQLVNVFAEQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 LCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPFYVVQLVNVFAEQD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 DATVSQLSVILGYANSCANPILYGFLSDNFKRSFQRILCLSWMDNAAEEPVDYYATALKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 DATVSQLSVILGYANSCANPILYGFLSDNFKRSFQRILCLSWMDNAAEEPVDYYATALKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB4 RAYSVEDFQPENLESGGVFRNGTCTSRITTL
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS96 RAYSVEDFQPENLESGGVFRNGTCTSRITTL
370 380 390
>>CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 (388 aa)
initn: 1408 init1: 709 opt: 1463 Z-score: 1210.3 bits: 232.7 E(32554): 4.3e-61
Smith-Waterman score: 1463; 62.9% identity (83.4% similar) in 356 aa overlap (12-361:2-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MFPNGTASSPSSSPSPSPGSCGEGGGSRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGSAIL
:.:: : . :: :. :.:. :.. ...: . ... : .
CCDS42 MSAPSTLPPGGEEGLGTAWPSAANASSAPAEAEEAVAGPGDARAAG-MVA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRYAKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTLL
:. ::..:::::: ::..::.:::::::::::::::.::::.::::.::::::...:. :
CCDS42 IQCIYALVCLVGLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLNLAVADELFMLSVPFVASSAAL
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIYCLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRPTVAKVVNLG
::::::..::: :::::..:::::..::::::::::::::::..:: ::::.:::..:::
CCDS42 RHWPFGSVLCRAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPSVAKLINLG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB4 VWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDG-TVACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVGAI
::. :::: :::..:. : : .::::. :.:: : . ::.::::.:::::: ::
CCDS42 VWLASLLVTLPIAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHPA--WSAVFVVYTFLLGFLLPVLAI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 CLCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPFYVVQLVNVFAEQ
:::.::..::: :::.::::::.:::.::: .:.:::.:::.::::::::::.:.:. .
CCDS42 GLCYLLIVGKMRAVALRAGWQQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLNLFVTS
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 DDATVSQLSVILGYANSCANPILYGFLSDNFKRSFQRILCLS-----WMDNAAEEPVDYY
::::...:.::.::::::::::::::::::.: :::.::: .: :::.:::
CCDS42 LDATVNHVSLILSYANSCANPILYGFLSDNFRRFFQRVLCLRCCLLEGAGGAEEEPLDYY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB4 ATALKSRAYSVEDFQPENLESGGVFRNGTCTSRITTL
::::::.
CCDS42 ATALKSKGGAGCMCPPLPCQQEALQPEPGRKRIPLTRTTTF
350 360 370 380
>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa)
initn: 1158 init1: 986 opt: 1143 Z-score: 949.0 bits: 184.3 E(32554): 1.5e-46
Smith-Waterman score: 1143; 55.6% identity (83.3% similar) in 288 aa overlap (57-340:42-329)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 SRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGSAILISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRY
: ...::: :::..:::::..::::::::
CCDS11 HTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCIIGLCGNTLVIYVILRY
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 AKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTLLRHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIY
::::: ::::::::::::::.::..:::. .. : ::::: .::.:..::..:.::::.
CCDS11 AKMKTITNIYILNLAIADELFMLGLPFLAMQVALVHWPFGKAICRVVMTVDGINQFTSIF
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 CLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRPTVAKVVNLGVWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTV
::::.:.:::.:::::::.:..::: .::.....:: .::::::::.... .:. :
CCDS11 CLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMIYAGLRSNQWGRS
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 ACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVGAICLCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSE
.:.. : . : .::..:::..:::.:. :::::..:: :.. ....: ..::.::
CCDS11 SCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKSSGIRVGSSKRKKSE
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 RKITLMVMMVVMVFVICWMPFYV--VQLVNVFAEQDDATVSQLS--VILGYANSCANPIL
.:.: :: .:: ::..::.:::. :. :.. : .... :.: ::::::::::
CCDS11 KKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALKGMFDFVVVLTYANSCANPIL
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 YGFLSDNFKRSFQRILCLSWMDNAAEEPVDYYATALKSRAYSVEDFQPENLESGGVFRNG
:.:::::::.::: .:::
CCDS11 YAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRLNETTETQRTLLNGDLQTSI
320 330 340 350 360
>>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa)
initn: 1145 init1: 594 opt: 1087 Z-score: 903.3 bits: 175.8 E(32554): 5.4e-44
Smith-Waterman score: 1091; 49.9% identity (75.6% similar) in 349 aa overlap (10-350:6-335)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MFPNGTASSPSSSPSPSPGSCGEGGGSRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGSAIL
:.:.:: . .: ::: :. : : : . : . . :.:
CCDS10 MEPLFPASTPSWNASS---------PGA-ASGG----GDNRTLVGPAPSAGARAVL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRYAKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTLL
. .: .:: .:: ::..::::.::.:::::.:::::::::.:: : ::..:::.:..
CCDS10 VPVLYLLVCAAGLGGNTLVIYVVLRFAKMKTVTNIYILNLAVADVLYMLGLPFLATQNAA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIYCLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRPTVAKVVNLG
:::: .:::::...:.::.:::..::::.:::::.:::::...::.::: :::... .
CCDS10 SFWPFGPVLCRLVMTLDGVNQFTSVFCLTVMSVDRYLAVVHPLSSARWRRPRVAKLASAA
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTVACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVGAIC
.::::: . ::..::. . . :: :: :::. : . :..:: ..::. :. .::
CCDS10 AWVLSLCMSLPLLVFADV--QEGGT--CNASWPEPVGLWGAVFIIYTAVLGFFAPLLVIC
170 180 190 200 210
250 260 270 280 290
pF1KB4 LCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPFYVVQLVN--VFAE
:::.::..:.: .....: :.:::::.: ::..::.::. ::.::..:..:: :
CCDS10 LCYLLIVVKVRAAGVRVG-CVRRRSERKVTRMVLVVVLVFAGCWLPFFTVNIVNLAVALP
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 QDDATVSQ--LSVILGYANSCANPILYGFLSDNFKRSFQRILCL----SWMDNAAEEPVD
:. :... . :::.::::::::.:::::::::..:::..::: . : : ::
CCDS10 QEPASAGLYFFVVILSYANSCANPVLYGFLSDNFRQSFQKVLCLRKGSGAKDADATEPRP
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390
pF1KB4 YYATALKSRAYSVEDFQPENLESGGVFRNGTCTSRITTL
CCDS10 DRIRQQQEATPPAHRAAANGLMQTSKL
340 350 360
>>CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 (418 aa)
initn: 859 init1: 723 opt: 1049 Z-score: 871.5 bits: 170.2 E(32554): 3.2e-42
Smith-Waterman score: 1049; 49.5% identity (76.0% similar) in 329 aa overlap (57-377:43-365)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 SRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGSAILISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRY
:..:: ..: :::.::: :::.::::.::.
CCDS13 SEPENASSAWPPDATLGNVSAGPSPAGLAVSGVLIPLVYLVVCVVGLLGNSLVIYVVLRH
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 AKMKTATNIYILNLAIADELLMLSVPFLVTSTLLRHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIY
. ..::.::::::.::::.::..:::.... : .::::.:.::::..::..:.::::.
CCDS13 TASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYWPFGSLMCRLVMAVDGINQFTSIF
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 CLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRPTVAKVVNLGVWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTV
::::.:::::.::::: ..::.: ::..:. .::: : .:.::.:::: . :
CCDS13 CLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWVASAVVVLPVVVFSGV---PRGMS
140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 ACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLMGFLLPVGAICLCYVLIIAKMRMVALKAGW----QQR
.:.: :::: : .::..:: .::. :. .:::::.::..:.: .. .. : :.:
CCDS13 TCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYLLIVVKVRSAGRRV-WAPSCQRR
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310
pF1KB4 KRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPFYVVQLVNVFAE--QDDATVSQ--LSVILGYANSCA
.::::..: ::. :: .::.:::::::...::: .. : . : : : ::::::
CCDS13 RRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPEEPAFFGLYFLVVALPYANSCA
250 260 270 280 290 300
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CCDS55 HIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCF-REFCIPTS
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CCDS55 SNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQS
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CCDS47 MDSSAAPTNASNCTDALAYSSCSPAPSPGSWVNLSHLDGNLSDPCGP-NRTDLGGRDSLC
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50 60 70 80 90 100
pF1KB4 NGTLSEGQGSAILISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRYAKMKTATNIYILNLAIADELL
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110 120 130 140 150 160
pF1KB4 MLSVPFLVTSTLLRHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIYCLTVLSVDRYVAVVHPIKAAR
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CCDS47 TSTLPFQSVNYLMGTWPFGTILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKALD
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pF1KB4 YRRPTVAKVVNLGVWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTVACNMLMPEPAQRWLVGFVLYT
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CCDS47 FRTPRNAKIINVCNWILSSAIGLP-VMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICV
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pF1KB4 FLMGFLLPVGAICLCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPF
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CCDS47 FIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPI
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pF1KB4 YVVQLVNVFAEQDDATVSQLS----VILGYANSCANPILYGFLSDNFKRSFQRILCLSWM
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CCDS47 HIYVIIKALVTIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCF-REFCIPTS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KB4 DNAAEEPVDYYATALKSRAYSVEDFQPENLESGGVFRNGTCTSRITTL
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CCDS47 SNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQRERRQKSDW
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391 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]