Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4274
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4274, 647 aa
1>>>pF1KB4274 647 - 647 aa - 647 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4813+/-0.00226; mu= 16.4999+/- 0.135
mean_var=307.0696+/-57.426, 0's: 0 Z-trim(103.0): 990 B-trim: 9 in 1/50
Lambda= 0.073191
statistics sampled from 6160 (7225) to 6160 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.524), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 3.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 4532 494.1 2.6e-139
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 4321 471.7 1.3e-132
CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 2034 230.3 6.5e-60
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1952 221.7 2.7e-57
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1935 219.9 9.3e-57
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1935 219.9 9.3e-57
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1919 218.1 2.9e-56
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1913 217.5 4.7e-56
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1907 216.9 7e-56
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 657) 1890 215.1 2.5e-55
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 1871 213.3 1.1e-54
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1863 212.2 1.7e-54
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1863 212.2 1.8e-54
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1853 211.3 3.9e-54
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1853 211.3 4e-54
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 1850 210.8 4.5e-54
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1838 209.7 1.2e-53
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 1833 209.3 1.8e-53
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1828 208.6 2.3e-53
CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 1827 208.5 2.6e-53
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1821 207.8 3.9e-53
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1818 207.4 4.7e-53
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1818 207.5 4.8e-53
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1813 207.0 7.1e-53
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1813 207.1 7.7e-53
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1813 207.1 7.7e-53
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1813 207.1 7.7e-53
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1813 207.1 7.7e-53
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 1806 206.2 1.2e-52
CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 697) 1806 206.3 1.2e-52
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1799 205.3 1.7e-52
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1802 206.1 1.8e-52
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1799 205.6 2e-52
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 1799 205.6 2e-52
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 1799 205.6 2e-52
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1795 205.0 2.6e-52
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1794 204.9 2.6e-52
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1798 205.8 2.8e-52
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1794 204.9 2.8e-52
CCDS35074.1 ZNF510 gene_id:22869|Hs108|chr9 ( 683) 1790 204.6 3.8e-52
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1783 203.8 6.3e-52
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1778 203.0 7.6e-52
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1779 203.4 8.4e-52
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1779 203.4 8.6e-52
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1777 203.3 1e-51
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1770 202.3 1.5e-51
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1769 202.4 1.8e-51
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1769 202.4 1.9e-51
CCDS43933.1 ZNF81 gene_id:347344|Hs108|chrX ( 661) 1765 201.9 2.3e-51
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1760 201.5 3.6e-51
>>CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 (647 aa)
initn: 4532 init1: 4532 opt: 4532 Z-score: 2614.6 bits: 494.1 E(32554): 2.6e-139
Smith-Waterman score: 4532; 100.0% identity (100.0% similar) in 647 aa overlap (1-647:1-647)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAQGSVSFNDVTVDFTQEEWQHLDHAQKTLYMDVMLENYCHLISVGCHMTKPDVILKLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MAQGSVSFNDVTVDFTQEEWQHLDHAQKTLYMDVMLENYCHLISVGCHMTKPDVILKLER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GEEPWTSFAGHTCLEENWKAEDFLVKFKEHQEKYSRSVVSINHKKLVKEKSKIYEKTFTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GEEPWTSFAGHTCLEENWKAEDFLVKFKEHQEKYSRSVVSINHKKLVKEKSKIYEKTFTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 GKNPVNSKNLPPEYDTHGRILKNVSELIISNLNPARKRLSEYNGYGKSLLSTKQETTHPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GKNPVNSKNLPPEYDTHGRILKNVSELIISNLNPARKRLSEYNGYGKSLLSTKQETTHPE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VKSHNQSARAFSHNEVLMQYQKTETPAQSFGYNDCEKSFLQRGGLITHSRPYKGENPSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VKSHNQSARAFSHNEVLMQYQKTETPAQSFGYNDCEKSFLQRGGLITHSRPYKGENPSVY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 NKKRRATNIEKKHTCNECGKSFCRKSVLILHQGIHSEEKPYQCHQCGNAFRRKSYLIDHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NKKRRATNIEKKHTCNECGKSFCRKSVLILHQGIHSEEKPYQCHQCGNAFRRKSYLIDHQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 RTHTGEKPFVCNECGKSFRLKTALTDHQRTHTGEKSYECLQCRNAFRLKSHLIRHQRTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RTHTGEKPFVCNECGKSFRLKTALTDHQRTHTGEKSYECLQCRNAFRLKSHLIRHQRTHT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GEKPYECNDCGKSFRQKTTLSLHQRIHTGEKPYICKECGKSFHQKANLTVHQRTHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GEKPYECNDCGKSFRQKTTLSLHQRIHTGEKPYICKECGKSFHQKANLTVHQRTHTGEKP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YICNECGKSFSQKTTLALHEKTHNEEKPYICSECGKSFRQKTTLVAHQRTHTGEKSYECP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YICNECGKSFSQKTTLALHEKTHNEEKPYICSECGKSFRQKTTLVAHQRTHTGEKSYECP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 HCGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHTGEKPYVCNECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HCGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHTGEKPYVCNECGK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 SFRQKATLTVHQKIHTGQKSYECPQCGKAFSRKSYLIHHQRTHTGEKPYKCSECGKCFRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SFRQKATLTVHQKIHTGQKSYECPQCGKAFSRKSYLIHHQRTHTGEKPYKCSECGKCFRQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB4 KTNLIVHQRTHTGEKPYVCNECGKSFSYKRNLIVHQRTHKGENIEMQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KTNLIVHQRTHTGEKPYVCNECGKSFSYKRNLIVHQRTHKGENIEMQ
610 620 630 640
>>CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 4321 init1: 4321 opt: 4321 Z-score: 2494.4 bits: 471.7 E(32554): 1.3e-132
Smith-Waterman score: 4321; 100.0% identity (100.0% similar) in 616 aa overlap (32-647:1-616)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 AQGSVSFNDVTVDFTQEEWQHLDHAQKTLYMDVMLENYCHLISVGCHMTKPDVILKLERG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MDVMLENYCHLISVGCHMTKPDVILKLERG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EEPWTSFAGHTCLEENWKAEDFLVKFKEHQEKYSRSVVSINHKKLVKEKSKIYEKTFTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EEPWTSFAGHTCLEENWKAEDFLVKFKEHQEKYSRSVVSINHKKLVKEKSKIYEKTFTLG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KNPVNSKNLPPEYDTHGRILKNVSELIISNLNPARKRLSEYNGYGKSLLSTKQETTHPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KNPVNSKNLPPEYDTHGRILKNVSELIISNLNPARKRLSEYNGYGKSLLSTKQETTHPEV
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KSHNQSARAFSHNEVLMQYQKTETPAQSFGYNDCEKSFLQRGGLITHSRPYKGENPSVYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KSHNQSARAFSHNEVLMQYQKTETPAQSFGYNDCEKSFLQRGGLITHSRPYKGENPSVYN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KKRRATNIEKKHTCNECGKSFCRKSVLILHQGIHSEEKPYQCHQCGNAFRRKSYLIDHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KKRRATNIEKKHTCNECGKSFCRKSVLILHQGIHSEEKPYQCHQCGNAFRRKSYLIDHQR
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 THTGEKPFVCNECGKSFRLKTALTDHQRTHTGEKSYECLQCRNAFRLKSHLIRHQRTHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 THTGEKPFVCNECGKSFRLKTALTDHQRTHTGEKSYECLQCRNAFRLKSHLIRHQRTHTG
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 EKPYECNDCGKSFRQKTTLSLHQRIHTGEKPYICKECGKSFHQKANLTVHQRTHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKPYECNDCGKSFRQKTTLSLHQRIHTGEKPYICKECGKSFHQKANLTVHQRTHTGEKPY
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ICNECGKSFSQKTTLALHEKTHNEEKPYICSECGKSFRQKTTLVAHQRTHTGEKSYECPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ICNECGKSFSQKTTLALHEKTHNEEKPYICSECGKSFRQKTTLVAHQRTHTGEKSYECPH
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 CGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHTGEKPYVCNECGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLNLHQRIHTGEKPYVCNECGKS
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550 560 570 580 590 600
pF1KB4 FRQKATLTVHQKIHTGQKSYECPQCGKAFSRKSYLIHHQRTHTGEKPYKCSECGKCFRQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FRQKATLTVHQKIHTGQKSYECPQCGKAFSRKSYLIHHQRTHTGEKPYKCSECGKCFRQK
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640
pF1KB4 TNLIVHQRTHTGEKPYVCNECGKSFSYKRNLIVHQRTHKGENIEMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TNLIVHQRTHTGEKPYVCNECGKSFSYKRNLIVHQRTHKGENIEMQ
580 590 600 610
>>CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 (652 aa)
initn: 3446 init1: 1788 opt: 2034 Z-score: 1189.1 bits: 230.3 E(32554): 6.5e-60
Smith-Waterman score: 2121; 48.9% identity (72.5% similar) in 657 aa overlap (2-641:4-649)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAQGSVSFNDVTVDFTQEEWQHLDHAQKTLYMDVMLENYCHLISVGCHMTKPDVILKL
:: ....::::.:: :::: : :: :: ::::: : .:.:.: ...:::.. ::
CCDS12 MINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVMLEIYSNLLSMGYQVSKPDALSKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 ERGEEPWTSF-AGHT--CLEENWKAEDFLVKFKEHQEKYSRSVVSIN-HKKLVKEKSKIY
:::::::: :. : :.: ...: : :.: .. .:: . . :. . . :.
CCDS12 ERGEEPWTMEDERHSRICPENN-EVDDHLQDHLENQ-RMLKSVEQYHEHNAFGNTASQT-
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 EKTFTLGKNPVNSKNLPPEYDTHGRILKNVSELIISNLNPARKRLSEYNGYGKSLLSTKQ
:.. : .. .. .. . . ::. :. .: . . ....: :::.: .
CCDS12 -KSLCLFRENHDT------FELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTKFSGDGKSFLHGNY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 ETTHPEVKSHNQSARAFSHNEVLMQYQKTETPAQSFGYNDCEKSFLQRGGLITHSRPYKG
: . .: . :..: : . . ..:.:. .. ..: :.:.... : : : . :
CCDS12 EELYSAAK-FSVSTKANSTKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHERVHTG
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB4 ENP-------SVYNKKRRATNIEKKHT------CNECGKSFCRKSVLILHQGIHSEEKPY
:.: .:...: : .. .. : :.:::: : :: :: :: :. ::::
CCDS12 EKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPY
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 QCHQCGNAFRRKSYLIDHQRTHTGEKPFVCNECGKSFRLKTALTDHQRTHTGEKSYECLQ
:..::..: : :: :::.::::: ..:.::::.: :. : ::::::::: : : .
CCDS12 ICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSE
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 CRNAFRLKSHLIRHQRTHTGEKPYECNDCGKSFRQKTTLSLHQRIHTGEKPYICKECGKS
: ..: : ..: :::.::::::: ::.:::.: .:. . ::: :::::::::.::::.
CCDS12 CGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSECGKG
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 FHQKANLTVHQRTHTGEKPYICNECGKSFSQKTTLALHEKTHNEEKPYICSECGKSFRQK
: .:.:: ::::.:: :: :.:.::::.:. :. : .:..::. :::: ::::::.: :
CCDS12 FPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKGFPLK
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 TTLVAHQRTHTGEKSYECPHCGKAFRMKSYLIDHHRTHTGEKPYECNECGKSFSQKTNLN
. :..::::::::: :.: .:::.: ..: :. :.::::::::: ::::::.:. :.::
CCDS12 SRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFKSNLV
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 LHQRIHTGEKPYVCNECGKSFRQKATLTVHQKIHTGQKSYECPQCGKAFSRKSYLIHHQR
.::: ::::::..:.::::.: .: : :::.::: .:: : .::..:.... : :..
CCDS12 VHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELALHKQ
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pF1KB4 VKSHNQSARAFSHNEVLMQYQKTETPAQSFGYNDCEKSFLQRGGLITHSRPYKGENP---
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CCDS33 YECK-ECGKYFSRSANLIQHQSIHTGEKPFECKECGKAFRLHIQFTRHQKFHTGEKPFEC
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CCDS33 NECGKAFSLLTLLNRHKNIHTGEKLFECKECGKSFNRSSNLVQHQSIHSGVKPYECKECG
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CCDS33 KGFNRGAHLIQHQKIHSNEKPFVCKECGMAFRYHYQLIEHCQIHTGEKPFECKECGKAFT
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CCDS33 LLTKLVRHQKIHTGEKPFECRECGKAFSLLNQLNRHKNIHTGEKPFECKECGKSFNRSSN
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CCDS33 LVQHQSIHAGIKPYECKECGKGFNRGAHLIQHQKIHSNEKPFVCRECEMAFRYHCQLIEH
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CCDS33 SRIHTGDKPFECQDCGKAFNRGSSLVQHQSIHTGEKPYECKECGKAFRLYLQLSQHQKTH
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CCDS33 TGEKPFECKECGKFFRRGSNLNQHRSIHTGKKPFECKECGKAFRLHMHLIRHQKLHTGEK
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CCDS33 PFECKECGKAFRLHMQLIRHQKLHTGEKPFECKECGKVFSLPTQLNRHKNIHTGEKAS
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