FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4124, 993 aa
1>>>pF1KB4124 993 - 993 aa - 993 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0582+/-0.0014; mu= -7.9557+/- 0.082
mean_var=347.0512+/-74.403, 0's: 0 Z-trim(106.7): 672 B-trim: 103 in 1/52
Lambda= 0.068846
statistics sampled from 8382 (9162) to 8382 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 4.570
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 2599 273.9 1.1e-72
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 539) 2250 239.1 1.9e-62
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CCDS75672.1 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7 ( 729) 964 111.4 6.8e-24
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CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 761 91.1 6e-18
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CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 748 90.1 2.6e-17
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 738 88.9 3.1e-17
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CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 742 89.6 4.7e-17
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 742 89.6 4.8e-17
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 727 87.7 5.7e-17
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 723 87.4 8e-17
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CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 722 87.3 8.8e-17
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CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 719 87.1 1.5e-16
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 719 87.1 1.6e-16
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 713 86.4 1.6e-16
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 710 86.1 2.4e-16
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 704 85.5 3.1e-16
>>CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 (998 aa)
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Smith-Waterman score: 6712; 99.5% identity (99.5% similar) in 998 aa overlap (1-993:1-998)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGEAQAAKEVLLLDSKAQQTELEWISSPPNGWEEISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGEAQAAKEVLLLDSKAQQTELEWISSPPNGWEEISG
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 LDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 LDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNAQRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 ETFNLYYYETDYDTGRNIRENLYVKIDTIAADESFTQGDLGERKMKLNTEVREIGPLSKK
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 GFYLAFQDVGACIALVSVKVYYKKCWSIIENLAIFPDTVTGSEFSSLVEVRGTCVSSAEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EAENAPRMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQQKGDTCEPCGRGFYKSSSQDLQCSRCPTHS
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 FSDKEGSSRCECEDGYYRAPSDPPYVACTRPPSAPQNLIFNINQTTVSLEWSPPADNGGR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 NDVTYRILCKRCSWEQGECVPCGSNIGYMPQQTGLEDNYVTVMDLLAHANYTFEVEAVNG
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pF1KB4 VSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVITEYEIKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 VSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVLQRSVELSWQEPEHPNGVITEYEIKY
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pF1KB4 YEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVATLEEAT-
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 YEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQIRAFTAAGYGNYSPRLDVATLEEATG
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pF1KB4 ----ATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEELYFHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KMFEATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGRRHCGYSKADQEGDEELYFHF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KFPGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRDV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 AVAIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFMENGALD
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pF1KB4 AFLRKHDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 AFLRKHDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLS
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780 790 800 810 820 830
pF1KB4 RVIEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 RVIEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDM
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pF1KB4 SNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIRNPNSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 SNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIRNPNSL
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pF1KB4 KTPLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESVARMTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KTPLGTCSRPISPLLDQNTPDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESVARMTI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 EDVMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV
970 980 990
>>CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016 aa)
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10 20 30
pF1KB4 MVFQTRYPSWIILCYIWLLRFAHTGEAQAAKEVLL
: : : : :: : :. ..:: :
CCDS75 RGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALR---TLLASPSNEVNL
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40 50 60 70 80 90
pF1KB4 LDSKAQQTELEWISSPPNGWEEISGLDENYTPIRTYQVCQVMEPNQNNWLRTNWISKGNA
:::.. . .: ::. : ::::::. .::::.::.:::::.::: :::::: :.:::. .:
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pF1KB4 QRIFVELKFTLRDCNSLPGVLGTCKETFNLYYYETDYDTGRNIRENLYVKIDTIAADESF
.:::.:::::::::::::: :::::::::.::.:.: ..::::.:: :.:::::::::::
CCDS75 SRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESF
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pF1KB4 TQGDLGERKMKLNTEVREIGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVKVYYKKCWSIIENLAIF
:. :::.: ::::::::..::::::::::::::::::::::::.:::::: :....::.:
CCDS75 TELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVF
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220 230 240 250 260 270
pF1KB4 PDTVTGSEFSSLVEVRGTCVSSAEEEAENAPRMHCSAEGEWLVPIGKCICKAGYQQKGDT
:::.::.. :.:.:: :.::. . ... :.::::::::::::::::.:::::..:. :
CCDS75 PDTITGADSSQLLEVSGSCVNHS--VTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGT
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pF1KB4 CEPCGRGFYKSSSQDLQCSRCPTHSFSDKEGSSRCECEDGYYRAPSDPPYVACTRPPSAP
:. : ::.:.: . .:..:: ::.. .:.:. : :: :.: :::: .:::::::::
CCDS75 CQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAP
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pF1KB4 QNLIFNINQTTVSLEWSPPADNGGRNDVTYRILCKRCSWEQGECVPCGSNIGYMPQQTGL
.: : :.:.:.: ::: ::::.:::.::.: : ::.:. . : : ::... :.:.:.::
CCDS75 RNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 EDNYVTVMDLLAHANYTFEVEAVNGVSDLSRSQRLFAAVSITTGQAAPSQVSGVMKERVL
... : ..:::::.:::::.:::::::::: . : ...:..::.::::: :..: : ..
CCDS75 KNTSVMMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIA
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pF1KB4 QRSVELSWQEPEHPNGVITEYEIKYYEKDQRERTYSTVKTKSTSASINNLKPGTVYVFQI
. :. ::::::..:::.: ::::::.:::: : .:. .:.: :. . ..:::..::::::
CCDS75 KNSISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQ-ETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQI
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pF1KB4 RAFTAAGYGNYSPRLDVATLEEATATAVSSEQNPVIIIAVVAVAGTIILVFMVFGFIIGR
:: :::::: .: :.. : ...:.::.:. . .::: ...: .::. .:.: ...
CCDS75 RARTAAGYGVFSRRFEFETTP--VSVAASSDQSQIPVIAVSVTVG-VILLAVVIGVLLSG
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pF1KB4 RHCGYSKADQEGDEE-LYFH---FKFPGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIE
:.:::::: :. .:: ..:: .:.::..:::::.::::::.:::.::::..:::: ::
CCDS75 RRCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIE
600 610 620 630 640 650
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pF1KB4 RVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRDVAVAIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVH
::::::::::::::::::::::.. ::::::::::::::::::: ::::::::::::..:
CCDS75 RVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIH
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::::::..:::::: :.::::.::.::.:.::::::::::::::::.:::.::.::::::
CCDS75 LEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVH
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pF1KB4 RDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVIEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSA
:::::::::.::::::::::::::::.::::::.::: :::::.:::::::: .::::::
CCDS75 RDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSA
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pF1KB4 SDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKE
:::::::::::::.::::::::.:.:::::::.:::::::.::::::.:.::::::::::
CCDS75 SDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKE
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pF1KB4 RAERPKFEQIVGILDKMIRNPNSLKTPLGTCSRPISPLLDQNTPDFT-TFCSVGEWLQAI
: ::::..::..:::.::::.:::: ... : .: :: ...: . .. ::::::.::
CCDS75 RNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCR-VSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAI
900 910 920 930 940 950
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pF1KB4 KMERYKDNFTAAGYNSLESVARMTIEDVMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTG
:: :: . : ::.:...::..:.::. ::.::::::::::.:.: :..:...
CCDS75 KMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLEDLRRLGVTLVGHQKKIMNSLQEMKVQLVNGMVPL
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB4 IQV
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>>CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 (986 aa)
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10 20 30 40 50
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CCDS24 IMDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTC
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CCDS24 KETFNLYYYESDNDKERFIRENQFVKIDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSK
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CCDS24 KGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNSE
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: ...:.:.:.:.::::::::.:.:.::..... :. : :.::. : : :..:: :
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CCDS24 RQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAV
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::::::: ::.: :.: . ...:..:.: : :::..:: ::::::..: :.:.: . .
CCDS24 KYYEKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTT-NTV
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CCDS24 PSRIIGDGANSTVLL--VSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADEEKHLN---
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CCDS24 LEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSN
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CCDS24 LARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
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>>CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 (983 aa)
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CCDS29 YEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYGTNSRKFEFETSPDSFS
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CCDS29 --ISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIY-VLIGR-FCGYKSKHGADEKRLHFGNGHLKL
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pF1KB4 PGTKTYIDPETYEDPNRAVHQFAKELDASCIKIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRDVAV
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CCDS29 PGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAKELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISV
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pF1KB4 AIKTLKVGYTEKQRRDFLCEASIMGQFDHPNVVHLEGVVTRGKPVMIVIEFMENGALDAF
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CCDS29 AIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSF
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pF1KB4 LRKHDGQFTVIQLVGMLRGIAAGMRYLADMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRV
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CCDS29 LRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRV
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pF1KB4 IEDDPEAVYTTTGGKIPVRWTAPEAIQYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSN
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CCDS29 LEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSN
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pF1KB4 QDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIRNPNSLKT
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CCDS29 QDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALYQLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKI
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CCDS29 ITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFRTTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDD
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pF1KB4 VMSLGITLVGHQKKIMSSIQTMRAQMLHLHGTGIQV
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CCDS29 MKKVGVTVVGPQKKIISSIKALETQSKNGPVPV
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>>CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (987 aa)
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CCDS23 MALRRLGAALLLLPLLAAVEETLMDSTTATAELGWMVHPPSGWEEVSG
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