Result of FASTA (omim) for
pF1KB4098
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4098, 411 aa
1>>>pF1KB4098 411 - 411 aa - 411 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1831+/-0.000405; mu= 17.8416+/- 0.025
mean_var=66.0882+/-13.463, 0's: 0 Z-trim(109.8): 30 B-trim: 71 in 1/51
Lambda= 0.157766
statistics sampled from 17981 (18010) to 17981 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 6.920
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002603 (OMIM: 602527) pyruvate dehydrogenase ki ( 411) 2722 628.8 7.3e-180
NP_002601 (OMIM: 602524) [Pyruvate dehydrogenase ( ( 436) 1863 433.3 5.5e-121
NP_002602 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase ki ( 407) 1850 430.4 4e-120
NP_005382 (OMIM: 300906) pyruvate dehydrogenase ki ( 406) 1759 409.6 6.9e-114
NP_001135858 (OMIM: 300906) pyruvate dehydrogenase ( 415) 1759 409.6 7e-114
XP_011509647 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 360) 1681 391.9 1.4e-108
NP_001186827 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase ( 343) 1561 364.5 2.2e-100
NP_001186828 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase ( 343) 1561 364.5 2.2e-100
XP_011509645 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 380) 1417 331.8 1.8e-90
XP_011509649 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 380) 1417 331.8 1.8e-90
XP_011509646 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 380) 1417 331.8 1.8e-90
NP_001265478 (OMIM: 602524) [Pyruvate dehydrogenas ( 456) 1417 331.8 2.1e-90
XP_006712658 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 244) 1095 258.4 1.4e-68
NP_001186829 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase ( 199) 791 189.1 8.1e-48
XP_006712657 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate de ( 281) 440 109.3 1.2e-23
NP_001116429 (OMIM: 614901,614923) [3-methyl-2-oxo ( 365) 281 73.2 1.2e-12
XP_016878348 (OMIM: 614901,614923) PREDICTED: 3-me ( 410) 281 73.2 1.3e-12
NP_005872 (OMIM: 614901,614923) [3-methyl-2-oxobut ( 412) 279 72.8 1.8e-12
>>NP_002603 (OMIM: 602527) pyruvate dehydrogenase kinase (411 aa)
initn: 2722 init1: 2722 opt: 2722 Z-score: 3350.1 bits: 628.8 E(85289): 7.3e-180
Smith-Waterman score: 2722; 100.0% identity (100.0% similar) in 411 aa overlap (1-411:1-411)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MKAARFVLRSAGSLNGAGLVPREVEHFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFAFLRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MKAARFVLRSAGSLNGAGLVPREVEHFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFAFLRQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSVQLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPDDQKALSDFVDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSVQLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPDDQKALSDFVDTL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 IKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SDSQTGNPSHIGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SDSQTGNPSHIGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPIH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 IVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTPIEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTPIEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGVPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 RIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTDA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB4 IIYLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCIPSREPKNLAKEVAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IIYLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCIPSREPKNLAKEVAM
370 380 390 400 410
>>NP_002601 (OMIM: 602524) [Pyruvate dehydrogenase (acet (436 aa)
initn: 1872 init1: 1076 opt: 1863 Z-score: 2293.1 bits: 433.3 E(85289): 5.5e-121
Smith-Waterman score: 1863; 65.4% identity (87.4% similar) in 413 aa overlap (1-405:19-430)
10 20 30
pF1KB4 MKAARFVLRSAGSLNGAGL-----VPREVEHFSRYSPSPLSM
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NP_002 MRLARLLRGAALAGPGPGLRAAGFS-RSFSSDSGSSPASERGVPGQVDFYARFSPSPLSM
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 KQLLDFGSENACERTSFAFLRQELPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSVQLVKSWYIQSLM
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NP_002 KQFLDFGSVNACEKTSFMFLRQELPVRLANIMKEISLLPDNLLRTPSVQLVQSWYIQSLQ
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 DLVEFHEKSPDDQKALSDFVDTLIKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQY
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NP_002 ELLDFKDKSAEDAKAIYDFTDTVIRIRNRHNDVIPTMAQGVIEYKESFGVDPVTSQNVQY
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 FLDRFYMNRISTRMLMNQHILIFSDSQTGNPSH---IGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRML
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NP_002 FLDRFYMSRISIRMLLNQHSLLFGGKGKGSPSHRKHIGSINPNCNVLEVIKDGYENARRL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 CDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPIHIVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLT
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NP_002 CDLYYINSPELELEELNAKSPGQPIQVVYVPSHLYHMVFELFKNAMRATMEHHANRGVYP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 PIEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGVPLRIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGL
::.: :.::.::::.:.:::::::::: :::::.: ::::: : ...:: .:::::::::
NP_002 PIQVHVTLGNEDLTVKMSDRGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPRVETSRAVPLAGFGYGL
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 PISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTDAIIYLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADD
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NP_002 PISRLYAQYFQGDLKLYSLEGYGTDAVIYIKALSTDSIERLPVYNKAAWKHYNTNHEADD
360 370 380 390 400 410
400 410
pF1KB4 WCIPSREPKNLAKEVAM
::.::::::..
NP_002 WCVPSREPKDMTTFRSA
420 430
>>NP_002602 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase kinase (407 aa)
initn: 1109 init1: 1109 opt: 1850 Z-score: 2277.5 bits: 430.4 E(85289): 4e-120
Smith-Waterman score: 1850; 65.2% identity (89.1% similar) in 405 aa overlap (1-404:1-400)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MKAARFVLRSAGSLNGAGLVPREVEHFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFAFLRQE
:. . .:..: :: :: :. .::::..:::::::::.::::: ::::.:::.:::::
NP_002 MRWVWALLKNA-SLAGA---PKYIEHFSKFSPSPLSMKQFLDFGSSNACEKTSFTFLRQE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSVQLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPDDQKALSDFVDTL
::::::::.:::..:: ....: :::::.:::.:::.:..:: .:.:.:...::.:.:.:
NP_002 LPVRLANIMKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLDIMEFLDKDPEDHRTLSQFTDAL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 IKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIF
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NP_002 VTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYFLDRFYLSRISIRMLINQHTLIF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB4 SDSQT-GNPSHIGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPI
. : . ..:.:::::::::.: ::.::.. ...:::.::..::.:.. ..:. :::
NP_002 DGSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDKYYMASPDLEIQEINAANSKQPI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 HIVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTPIEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGVP
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NP_002 HMVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHESSLILPPIKVMVALGEEDLSIKMSDRGGGVP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LRIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTD
:: :.::::: ::::::: . .. ..:::::::::::::::::::::::.:.:. :.:::
NP_002 LRKIERLFSYMYSTAPTP-QPGTGGTPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLQLFSMEGFGTD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 AIIYLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCIPSREPKNLAKEVAM
:.:::::::..:.:.:::.::::..::: .:: :::.:: ::::
NP_002 AVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCVPSTEPKNTSTYRVS
360 370 380 390 400
>>NP_005382 (OMIM: 300906) pyruvate dehydrogenase kinase (406 aa)
initn: 1738 init1: 727 opt: 1759 Z-score: 2165.6 bits: 409.6 E(85289): 6.9e-114
Smith-Waterman score: 1759; 63.8% identity (87.2% similar) in 390 aa overlap (20-407:12-401)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MKAARFVLRSAGSLNGAGLVPREVEHFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFAFLRQE
::...:..::.::::::.::.:::: .::::.::. :::.:
NP_005 MRLFRWLLKQPVPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSVQLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPDDQKALSDFVDTL
::::::: ..:...:: .:.: :: ::.:::.::...:.:...:::.: ..:..:...:
NP_005 LPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 IKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIF
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NP_005 IKVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB4 S-DSQTGNPSHIGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPI
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NP_005 GGDTNPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 HIVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTP-IEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGV
..::::::: :::::::::.:::::: :.. : ....:.::::::.::::: ::::
NP_005 QVVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 PLRIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGT
::: :::::.: ::::: : .. .: :::::::::::::::::.::::::.:::. : ::
NP_005 PLRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 DAIIYLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCIPSREPKNLAKEVAM
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NP_005 DAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQ
360 370 380 390 400
>>NP_001135858 (OMIM: 300906) pyruvate dehydrogenase kin (415 aa)
initn: 1738 init1: 727 opt: 1759 Z-score: 2165.5 bits: 409.6 E(85289): 7e-114
Smith-Waterman score: 1759; 63.8% identity (87.2% similar) in 390 aa overlap (20-407:12-401)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MKAARFVLRSAGSLNGAGLVPREVEHFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFAFLRQE
::...:..::.::::::.::.:::: .::::.::. :::.:
NP_001 MRLFRWLLKQPVPKQIERYSRFSPSPLSIKQFLDFGRDNACEKTSYMFLRKE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSVQLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPDDQKALSDFVDTL
::::::: ..:...:: .:.: :: ::.:::.::...:.:...:::.: ..:..:...:
NP_001 LPVRLANTMREVNLLPDNLLNRPSVGLVQSWYMQSFLELLEYENKSPEDPQVLDNFLQVL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 IKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIF
:::::::..::::::::.::::. :: . :.:::::::: :::: :::.::: :.:
NP_001 IKVRNRHNDVVPTMAQGVIEYKEKFGFDPFISTNIQYFLDRFYTNRISFRMLINQHTLLF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB4 S-DSQTGNPSHIGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPI
. :.. .:.:::::::.:.:. ::.::.: ..:::.:::: .:::.. . :.: ::.::
NP_001 GGDTNPVHPKHIGSIDPTCNVADVVKDAYETAKMLCEQYYLVAPELEVEEFNAKAPDKPI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 HIVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTP-IEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGV
..::::::: :::::::::.:::::: :.. : ....:.::::::.::::: ::::
NP_001 QVVYVPSHLFHMLFELFKNSMRATVELYEDRKEGYPAVKTLVTLGKEDLSIKISDLGGGV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 PLRIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGT
::: :::::.: ::::: : .. .: :::::::::::::::::.::::::.:::. : ::
NP_001 PLRKIDRLFNYMYSTAPRPSLEPTRAAPLAGFGYGLPISRLYARYFQGDLKLYSMEGVGT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 DAIIYLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCIPSREPKNLAKEVAM
::.::::::::::.:.::::::::..::. . ::::: :: ::.. .:
NP_001 DAVIYLKALSSESFERLPVFNKSAWRHYKTTPEADDWSNPSSEPRDASKYKAKQDKIKTN
360 370 380 390 400 410
NP_001 RTF
>>XP_011509647 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate dehydr (360 aa)
initn: 1693 init1: 1076 opt: 1681 Z-score: 2070.4 bits: 391.9 E(85289): 1.4e-108
Smith-Waterman score: 1681; 67.4% identity (89.5% similar) in 353 aa overlap (56-405:2-354)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 HFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFAFLRQELPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSV
:::::::::::::.:::..:: .:. : ::
XP_011 MFLRQELPVRLANIMKEISLLPDNLLRTPSV
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 QLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPDDQKALSDFVDTLIKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDAC
:::.:::::::..:..:..:: .: ::. ::.::.:..::::..:.::::::.::::..
XP_011 QLVQSWYIQSLQELLDFKDKSAEDAKAIYDFTDTVIRIRNRHNDVIPTMAQGVIEYKESF
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 TVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIFSDSQTGNPSH---IGSIDPNCDVVA
:::::.::.:::::::::.::: :::.::: :.:. . :.::: ::::.:::.:.
XP_011 GVDPVTSQNVQYFLDRFYMSRISIRMLLNQHSLLFGGKGKGSPSHRKHIGSINPNCNVLE
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 VVQDAFECSRMLCDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPIHIVYVPSHLHHMLFELFKNAMRA
:..:..: .: ::: ::..::::.: ..:.: : :::..:::::::.::.::::::::::
XP_011 VIKDGYENARRLCDLYYINSPELELEELNAKSPGQPIQVVYVPSHLYHMVFELFKNAMRA
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 TVEHQENQPSLTPIEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGVPLRIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNS
:.::. :. ::.: :.::.::::.:.:::::::::: :::::.: ::::: : ...:
XP_011 TMEHHANRGVYPPIQVHVTLGNEDLTVKMSDRGGGVPLRKIDRLFNYMYSTAPRPRVETS
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 RNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTDAIIYLKALSSESIEKLPVFNKSA
: .::::::::::::::::.::::::.:::: ::::::.::.::::..:::.:::.::.:
XP_011 RAVPLAGFGYGLPISRLYAQYFQGDLKLYSLEGYGTDAVIYIKALSTDSIERLPVYNKAA
280 290 300 310 320 330
390 400 410
pF1KB4 FKHYQMSSEADDWCIPSREPKNLAKEVAM
.:::. . ::::::.::::::..
XP_011 WKHYNTNHEADDWCVPSREPKDMTTFRSA
340 350 360
>>NP_001186827 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase kin (343 aa)
initn: 830 init1: 830 opt: 1561 Z-score: 1923.1 bits: 364.5 E(85289): 2.2e-100
Smith-Waterman score: 1561; 64.7% identity (89.9% similar) in 337 aa overlap (69-404:1-336)
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 QLLDFGSENACERTSFAFLRQELPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSVQLVKSWYIQSLMD
.:::..:: ....: :::::.:::.:::.:
NP_001 MKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLD
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100 110 120 130 140 150
pF1KB4 LVEFHEKSPDDQKALSDFVDTLIKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYF
..:: .:.:.:...::.:.:.:. .::::..::::::::..::::. :::.:::.:::
NP_001 IMEFLDKDPEDHRTLSQFTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYF
40 50 60 70 80 90
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pF1KB4 LDRFYMNRISTRMLMNQHILIFSDSQT-GNPSHIGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQ
:::::..::: :::.::: :::. : . ..:.:::::::::.: ::.::.. ...:::.
NP_001 LDRFYLSRISIRMLINQHTLIFDGSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDK
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 YYLSSPELKLTQVNGKFPDQPIHIVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTPIE
::..::.:.. ..:. ::::.:::::::.:::::::::::::::: .:.. : ::.
NP_001 YYMASPDLEIQEINAANSKQPIHMVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHESSLILPPIK
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 VIVVLGKEDLTIKISDRGGGVPLRIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPIS
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NP_001 VMVALGEEDLSIKMSDRGGGVPLRKIERLFSYMYSTAPTP-QPGTGGTPLAGFGYGLPIS
220 230 240 250 260
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pF1KB4 RLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTDAIIYLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCI
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NP_001 RLYAKYFQGDLQLFSMEGFGTDAVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCV
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pF1KB4 PSREPKNLAKEVAM
:: ::::
NP_001 PSTEPKNTSTYRVS
330 340
>>NP_001186828 (OMIM: 602525) pyruvate dehydrogenase kin (343 aa)
initn: 830 init1: 830 opt: 1561 Z-score: 1923.1 bits: 364.5 E(85289): 2.2e-100
Smith-Waterman score: 1561; 64.7% identity (89.9% similar) in 337 aa overlap (69-404:1-336)
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 QLLDFGSENACERTSFAFLRQELPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSVQLVKSWYIQSLMD
.:::..:: ....: :::::.:::.:::.:
NP_001 MKEINLLPDRVLSTPSVQLVQSWYVQSLLD
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100 110 120 130 140 150
pF1KB4 LVEFHEKSPDDQKALSDFVDTLIKVRNRHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYF
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NP_001 IMEFLDKDPEDHRTLSQFTDALVTIRNRHNDVVPTMAQGVLEYKDTYGDDPVSNQNIQYF
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pF1KB4 LDRFYMNRISTRMLMNQHILIFSDSQT-GNPSHIGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQ
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NP_001 LDRFYLSRISIRMLINQHTLIFDGSTNPAHPKHIGSIDPNCNVSEVVKDAYDMAKLLCDK
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pF1KB4 YYLSSPELKLTQVNGKFPDQPIHIVYVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTPIE
::..::.:.. ..:. ::::.:::::::.:::::::::::::::: .:.. : ::.
NP_001 YYMASPDLEIQEINAANSKQPIHMVYVPSHLYHMLFELFKNAMRATVESHESSLILPPIK
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280 290 300 310 320 330
pF1KB4 VIVVLGKEDLTIKISDRGGGVPLRIIDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPIS
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NP_001 VMVALGEEDLSIKMSDRGGGVPLRKIERLFSYMYSTAPTP-QPGTGGTPLAGFGYGLPIS
220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 RLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTDAIIYLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCI
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NP_001 RLYAKYFQGDLQLFSMEGFGTDAVIYLKALSTDSVERLPVYNKSAWRHYQTIQEAGDWCV
270 280 290 300 310 320
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pF1KB4 PSREPKNLAKEVAM
:: ::::
NP_001 PSTEPKNTSTYRVS
330 340
>>XP_011509645 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate dehydr (380 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KB4 HFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFAFLRQELPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSV
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XP_011 MFLRQELPVRLANIMKEISLLPDNLLRTPSV
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90 100 110 120
pF1KB4 QLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPDDQKALSD--------------------FVDTLIKVRN
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XP_011 QLVQSWYIQSLQELLDFKDKSAEDAKAIYERPRRTWLQVSSLCCMACKMIFTDTVIRIRN
40 50 60 70 80 90
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pF1KB4 RHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIFSDSQT
::..:.::::::.::::.. :::::.::.:::::::::.::: :::.::: :.:. .
XP_011 RHNDVIPTMAQGVIEYKESFGVDPVTSQNVQYFLDRFYMSRISIRMLLNQHSLLFGGKGK
100 110 120 130 140 150
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pF1KB4 GNPSH---IGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPIHIV
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XP_011 GSPSHRKHIGSINPNCNVLEVIKDGYENARRLCDLYYINSPELELEELNAKSPGQPIQVV
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pF1KB4 YVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTPIEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGVPLRI
::::::.::.:::::::::::.::. :. ::.: :.::.::::.:.::::::::::
XP_011 YVPSHLYHMVFELFKNAMRATMEHHANRGVYPPIQVHVTLGNEDLTVKMSDRGGGVPLRK
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 IDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTDAII
:::::.: ::::: : ...:: .::::::::::::::::.::::::.:::: ::::::.:
XP_011 IDRLFNYMYSTAPRPRVETSRAVPLAGFGYGLPISRLYAQYFQGDLKLYSLEGYGTDAVI
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 YLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCIPSREPKNLAKEVAM
:.::::..:::.:::.::.:.:::. . ::::::.::::::..
XP_011 YIKALSTDSIERLPVYNKAAWKHYNTNHEADDWCVPSREPKDMTTFRSA
340 350 360 370 380
>>XP_011509649 (OMIM: 602524) PREDICTED: pyruvate dehydr (380 aa)
initn: 1673 init1: 1076 opt: 1417 Z-score: 1745.3 bits: 331.8 E(85289): 1.8e-90
Smith-Waterman score: 1625; 63.5% identity (84.7% similar) in 373 aa overlap (56-405:2-374)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 HFSRYSPSPLSMKQLLDFGSENACERTSFAFLRQELPVRLANILKEIDILPTQLVNTSSV
:::::::::::::.:::..:: .:. : ::
XP_011 MFLRQELPVRLANIMKEISLLPDNLLRTPSV
10 20 30
90 100 110 120
pF1KB4 QLVKSWYIQSLMDLVEFHEKSPDDQKALSD--------------------FVDTLIKVRN
:::.:::::::..:..:..:: .: ::. . :.::.:..::
XP_011 QLVQSWYIQSLQELLDFKDKSAEDAKAIYERPRRTWLQVSSLCCMACKMIFTDTVIRIRN
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RHHNVVPTMAQGIIEYKDACTVDPVTNQNLQYFLDRFYMNRISTRMLMNQHILIFSDSQT
::..:.::::::.::::.. :::::.::.:::::::::.::: :::.::: :.:. .
XP_011 RHNDVIPTMAQGVIEYKESFGVDPVTSQNVQYFLDRFYMSRISIRMLLNQHSLLFGGKGK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 GNPSH---IGSIDPNCDVVAVVQDAFECSRMLCDQYYLSSPELKLTQVNGKFPDQPIHIV
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XP_011 GSPSHRKHIGSINPNCNVLEVIKDGYENARRLCDLYYINSPELELEELNAKSPGQPIQVV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 YVPSHLHHMLFELFKNAMRATVEHQENQPSLTPIEVIVVLGKEDLTIKISDRGGGVPLRI
::::::.::.:::::::::::.::. :. ::.: :.::.::::.:.::::::::::
XP_011 YVPSHLYHMVFELFKNAMRATMEHHANRGVYPPIQVHVTLGNEDLTVKMSDRGGGVPLRK
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IDRLFSYTYSTAPTPVMDNSRNAPLAGFGYGLPISRLYAKYFQGDLNLYSLSGYGTDAII
:::::.: ::::: : ...:: .::::::::::::::::.::::::.:::: ::::::.:
XP_011 IDRLFNYMYSTAPRPRVETSRAVPLAGFGYGLPISRLYAQYFQGDLKLYSLEGYGTDAVI
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KB4 YLKALSSESIEKLPVFNKSAFKHYQMSSEADDWCIPSREPKNLAKEVAM
:.::::..:::.:::.::.:.:::. . ::::::.::::::..
XP_011 YIKALSTDSIERLPVYNKAAWKHYNTNHEADDWCVPSREPKDMTTFRSA
340 350 360 370 380
411 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]