Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4091
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4091, 480 aa
1>>>pF1KB4091 480 - 480 aa - 480 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1919+/-0.00138; mu= 14.7640+/- 0.082
mean_var=177.0357+/-34.595, 0's: 0 Z-trim(106.7): 154 B-trim: 11 in 1/50
Lambda= 0.096393
statistics sampled from 8969 (9139) to 8969 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4062.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 ( 480) 3439 491.4 9.2e-139
CCDS64195.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 ( 470) 2910 417.8 1.3e-116
CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 387) 1334 198.5 1.1e-50
CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 343) 1228 183.7 2.7e-46
CCDS45345.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 ( 335) 929 142.1 8.8e-34
CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1 (2224) 924 142.5 4.4e-33
CCDS35457.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX (2351) 884 137.0 2.2e-31
CCDS44026.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX ( 216) 625 99.6 3.6e-21
CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 609) 539 88.2 2.7e-17
CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 644) 539 88.2 2.8e-17
CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 906) 539 88.4 3.4e-17
CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 923) 539 88.4 3.4e-17
CCDS46878.1 DCBLD2 gene_id:131566|Hs108|chr3 ( 775) 478 79.9 1.1e-14
>>CCDS4062.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 (480 aa)
initn: 3439 init1: 3439 opt: 3439 Z-score: 2604.7 bits: 491.4 E(32554): 9.2e-139
Smith-Waterman score: 3439; 100.0% identity (100.0% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MKRSVAVWLLVGLSLGVPQFGKGDICDPNPCENGGICLPGLADGSFSCECPDGFTDPNCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MKRSVAVWLLVGLSLGVPQFGKGDICDPNPCENGGICLPGLADGSFSCECPDGFTDPNCS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SVVEVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCEISEAYRGDTFIGYVCKCPRGFNGIHCQHNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 SVVEVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCEISEAYRGDTFIGYVCKCPRGFNGIHCQHNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 NECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 RALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 EYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 CRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 CRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 QGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 QGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 VYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE
430 440 450 460 470 480
>>CCDS64195.1 EDIL3 gene_id:10085|Hs108|chr5 (470 aa)
initn: 2897 init1: 2897 opt: 2910 Z-score: 2207.2 bits: 417.8 E(32554): 1.3e-116
Smith-Waterman score: 3348; 97.9% identity (97.9% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-470)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MKRSVAVWLLVGLSLGVPQFGKGDICDPNPCENGGICLPGLADGSFSCECPDGFTDPNCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MKRSVAVWLLVGLSLGVPQFGKGDICDPNPCENGGICLPGLADGSFSCECPDGFTDPNCS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SVVEVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCEISEAYRGDTFIGYVCKCPRGFNGIHCQHNI
::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SVVEV----------GPCTPNPCHNGGTCEISEAYRGDTFIGYVCKCPRGFNGIHCQHNI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 CRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 QGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE
420 430 440 450 460 470
>>CCDS10347.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 (387 aa)
initn: 1343 init1: 851 opt: 1334 Z-score: 1023.7 bits: 198.5 E(32554): 1.1e-50
Smith-Waterman score: 1339; 49.4% identity (72.6% similar) in 401 aa overlap (78-476:27-387)
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 CECPDGFTDPNCSSVVEVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCE-ISEAYRGDTFIGYVCK
:. ::::::: :: ::. :::.: .:.:
CCDS10 MPRPRLLAALCGALLCAPSLLVALDICSKNPCHNGGLCEEISQEVRGDVFPSYTCT
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 CPRGFNGIHCQHNINECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEG
: .:. : ::. :: :::.:.
CCDS10 CLKGYAGNHCET--------------------------------------KCVEPLGLEN
60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 GIISNQQITASSTHRALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRV
: :.:.::.:::.. ...:::.: : ::::. :..:::: . :: ::::.:: :.: :
CCDS10 GNIANSQIAASSVRVTFLGLQHWVPELARLNRAGMVNAWTPSSNDDNPWIQVNLLRRMWV
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 TGVITQGAKRIGSPEYIKSYKIAYSNDGKTWA-MYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSF
:::.::::.:..: ::.:..:.::: .:. . .. :. ....: :: ..:. ..: :
CCDS10 TGVVTQGASRLASHEYLKAFKVAYSLNGHEFDFIHDVNKKHKEFV--GNWNKNAVHVNLF
140 150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 TPPIKAQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLN
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CCDS10 ETPVEAQYVRLYPTSCHTACTLRFELLGCELNGCANPLGLKNNSIPDKQITASSSYKTWG
200 210 220 230 240 250
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 MDMFTWEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFV
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CCDS10 LHLFSWNPSYARLDKQGNFNAWVAGSYGNDQWLQVDLGSSKEVTGIITQGARNFGSVQFV
260 270 280 290 300 310
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 GSYKLAYSNDGEHWTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYG
.:::.:::::. .:: ::: . ..:.: ::.:: .:.::... :: ::..:::: .:..
CCDS10 ASYKVAYSNDSANWTEYQDPRTGSSKIFPGNWDNHSHKKNLFETPILARYVRILPVAWHN
320 330 340 350 360 370
470 480
pF1KB4 RITLRSELLGCTEEE
::.:: :::::
CCDS10 RIALRLELLGC
380
>>CCDS81918.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 (343 aa)
initn: 1224 init1: 851 opt: 1228 Z-score: 944.6 bits: 183.7 E(32554): 2.7e-46
Smith-Waterman score: 1228; 54.2% identity (80.7% similar) in 321 aa overlap (157-476:25-343)
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTHRALFGL
.: :::.:.: :.:.::.:::.. ...::
CCDS81 MPRPRLLAALCGALLCAPSLLVALECVEPLGLENGNIANSQIAASSVRVTFLGL
10 20 30 40 50
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRVTGVITQGAKRIGSPEYIKSY
:.: : ::::. :..:::: . :: ::::.:: :.: ::::.::::.:..: ::.:..
CCDS81 QHWVPELARLNRAGMVNAWTPSSNDDNPWIQVNLLRRMWVTGVVTQGASRLASHEYLKAF
60 70 80 90 100 110
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KIAYSNDGKTWA-MYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPIKAQYVRLYPQVCRRHC
:.::: .:. . .. :. ... : :: ..:. ..: : :..:::::::: :. :
CCDS81 KVAYSLNGHEFDFIHDVNKKHKE--FVGNWNKNAVHVNLFETPVEAQYVRLYPTSCHTAC
120 130 140 150 160 170
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMFTWEPRKARLDKQGKVN
:::.:::::::.::..:::.:.. : : :::::: ..: .. .:.:.: :::::::. :
CCDS81 TLRFELLGCELNGCANPLGLKNNSIPDKQITASSSYKTWGLHLFSWNPSYARLDKQGNFN
180 190 200 210 220 230
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 AWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYKLAYSNDGEHWTVYQDE
::..: ..::::::: .:::::::::..:: ::::.:::.:::::. .:: :::
CCDS81 AWVAGSYGNDQWLQVDLGSSKEVTGIITQGARNFGSVQFVASYKVAYSNDSANWTEYQDP
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 KQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITLRSELLGCTEEE
. ..:.: ::.:: .:.::... :: ::..:::: .:..::.:: :::::
CCDS81 RTGSSKIFPGNWDNHSHKKNLFETPILARYVRILPVAWHNRIALRLELLGC
300 310 320 330 340
>>CCDS45345.1 MFGE8 gene_id:4240|Hs108|chr15 (335 aa)
initn: 933 init1: 441 opt: 929 Z-score: 720.0 bits: 142.1 E(32554): 8.8e-34
Smith-Waterman score: 1019; 41.4% identity (62.1% similar) in 401 aa overlap (78-476:27-335)
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 CECPDGFTDPNCSSVVEVASDEEEPTSAGPCTPNPCHNGGTCE-ISEAYRGDTFIGYVCK
:. ::::::: :: ::. :::.: .:.:
CCDS45 MPRPRLLAALCGALLCAPSLLVALDICSKNPCHNGGLCEEISQEVRGDVFPSYTCT
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 CPRGFNGIHCQHNINECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEG
: .:. : ::. :: :::.:.
CCDS45 CLKGYAGNHCET--------------------------------------KCVEPLGLEN
60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 GIISNQQITASSTHRALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWTAAENDRWPWIQINLQRKMRV
: :.:.::.:::.. ...:::.: : ::::. :..:::: . :: ::::.:: :.: :
CCDS45 GNIANSQIAASSVRVTFLGLQHWVPELARLNRAGMVNAWTPSSNDDNPWIQVNLLRRMWV
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 TGVITQGAKRIGSPEYIKSYKIAYSNDGKTWA-MYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSF
:::.::::.:..: ::.:..:.::: .:. . .. :. ....: :: ..:. ..: :
CCDS45 TGVVTQGASRLASHEYLKAFKVAYSLNGHEFDFIHDVNKKHKEFV--GNWNKNAVHVNLF
140 150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 TPPIKAQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLN
:..:::::::: :. ::::.:::::::.::..:::.:.. : : :::::: ..: .
CCDS45 ETPVEAQYVRLYPTSCHTACTLRFELLGCELNGCANPLGLKNNSIPDKQITASSSYKTWG
200 210 220 230 240 250
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 MDMFTWEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFV
. .:.:.: :::::::. :::..: ..::::.
CCDS45 LHLFSWNPSYARLDKQGNFNAWVAGSYGNDQWLQI-------------------------
260 270 280 290
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 GSYKLAYSNDGEHWTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYG
: ::.:: .:.::... :: ::..:::: .:..
CCDS45 ---------------------------FPGNWDNHSHKKNLFETPILARYVRILPVAWHN
300 310 320
470 480
pF1KB4 RITLRSELLGCTEEE
::.:: :::::
CCDS45 RIALRLELLGC
330
>>CCDS1281.1 F5 gene_id:2153|Hs108|chr1 (2224 aa)
initn: 934 init1: 420 opt: 924 Z-score: 707.4 bits: 142.5 E(32554): 4.4e-33
Smith-Waterman score: 924; 43.0% identity (68.2% similar) in 337 aa overlap (144-476:1897-2221)
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 IHCQHNINECEVEPCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQ
. : .: :.:.. :.:. ::::..:
CCDS12 GSFKTLEMKASKPGWWLLNTEVGENQRAGMQTPFLIMDRDCRM----PMGLSTGIISDSQ
1870 1880 1890 1900 1910 1920
180 190 200 210 220
pF1KB4 ITASSTHRALFGLQKWYPYYARLNKKGLINAWT----AAENDRWPWIQINLQRKMRVTGV
: :: : : : : ::::. : :::. ::: ::::...:... .::.
CCDS12 IKASE-----F-LGYWEPRLARLNNGGSYNAWSVEKLAAEFASKPWIQVDMQKEVIITGI
1930 1940 1950 1960 1970
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 ITQGAKRIGSPEYIKSYKIAYSNDGKTWAMYKVKGTNEDMVFRGNIDNNTPYANSFTPPI
:::::. . : . .:::.. .: ..: ..: . : : :: : .: :.: :::
CCDS12 QTQGAKHYLKSCYTTEFYVAYSSNQINWQIFKGNSTRNVMYFNGNSDASTIKENQFDPPI
1980 1990 2000 2010 2020 2030
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 KAQYVRLYPQVCRRHCTLRMELLGCELSGCSEPLGMKSGHIQDYQITASSIFRTLNMDMF
:.:.:. : . :::.:: :::..::: ::::..:.:.. ::::::. .. :.
CCDS12 VARYIRISPTRAYNRPTLRLELQGCEVNGCSTPLGMENGKIENKQITASSFKKSWWGDY-
2040 2050 2060 2070 2080 2090
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 TWEPRKARLDKQGKVNAWTSGHNDQSQWLQVDLLVPTKVTGIITQGAKDFGHVQFVGSYK
::: .:::. ::.:::: . :...:::..::: :.:.::::: :... ..: ::
CCDS12 -WEPFRARLNAQGRVNAWQAKANNNKQWLEIDLLKIKKITAIITQGCKSLSSEMYVKSYT
2100 2110 2120 2130 2140 2150
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 LAYSNDGEHWTVYQDEKQRKDKVFQGNFDNDTHRKNVIDPPIYARHIRILPWSWYGRITL
. ::..: .: :. ... ::.:.:: .. : :: ..::: .: ::..: .: :.:
CCDS12 IHYSEQGVEWKPYRLKSSMVDKIFEGNTNTKGHVKNFFNPPIISRFIRVIPKTWNQSIAL
2160 2170 2180 2190 2200 2210
470 480
pF1KB4 RSELLGCTEEE
: ::.::
CCDS12 RLELFGCDIY
2220
>>CCDS35457.1 F8 gene_id:2157|Hs108|chrX (2351 aa)
initn: 769 init1: 399 opt: 884 Z-score: 677.1 bits: 137.0 E(32554): 2.2e-31
Smith-Waterman score: 884; 44.9% identity (67.4% similar) in 325 aa overlap (157-480:2039-2349)
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PCKNGGICTDLVANYSCECPGEFMGRNCQYKCSGPLGIEGGIISNQQITASSTHRALFGL
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CCDS35 PSKAGIWRVECLIGEHLHAGMSTLFLVYSNKCQTPLGMASGHIRDFQITASGQ----YG-
2010 2020 2030 2040 2050 2060
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10 20 30 40
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]