Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4085
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4085, 973 aa
1>>>pF1KB4085 973 - 973 aa - 973 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2269+/-0.000963; mu= 13.3231+/- 0.058
mean_var=126.7361+/-24.391, 0's: 0 Z-trim(108.6): 195 B-trim: 5 in 1/51
Lambda= 0.113926
statistics sampled from 10137 (10336) to 10137 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.661), E-opt: 0.2 (0.318), width: 16
Scan time: 4.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47285.1 PCDHA12 gene_id:56137|Hs108|chr5 ( 941) 6146 1022.1 0
CCDS75327.1 PCDHA12 gene_id:56137|Hs108|chr5 ( 792) 5101 850.3 0
CCDS54921.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5 ( 948) 4989 832.0 0
CCDS54916.1 PCDHA4 gene_id:56144|Hs108|chr5 ( 947) 4925 821.4 0
CCDS54914.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5 ( 948) 4903 817.8 0
CCDS54918.1 PCDHA7 gene_id:56141|Hs108|chr5 ( 937) 4884 814.7 0
CCDS54917.1 PCDHA5 gene_id:56143|Hs108|chr5 ( 936) 4836 806.8 0
CCDS75325.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5 ( 844) 3977 665.6 1.1e-190
CCDS47284.1 PCDHA11 gene_id:56138|Hs108|chr5 ( 949) 3968 664.2 3.5e-190
CCDS54919.1 PCDHA8 gene_id:56140|Hs108|chr5 ( 950) 3960 662.8 8.8e-190
CCDS4240.1 PCDHA13 gene_id:56136|Hs108|chr5 ( 950) 3952 661.5 2.2e-189
CCDS75326.1 PCDHA11 gene_id:56138|Hs108|chr5 ( 810) 3939 659.3 8.4e-189
CCDS47281.1 PCDHA6 gene_id:56142|Hs108|chr5 ( 950) 3928 657.6 3.4e-188
CCDS64269.1 PCDHA2 gene_id:56146|Hs108|chr5 ( 808) 3883 650.1 5e-186
CCDS54915.1 PCDHA3 gene_id:56145|Hs108|chr5 ( 950) 3879 649.5 8.9e-186
CCDS54913.1 PCDHA1 gene_id:56147|Hs108|chr5 ( 950) 3867 647.6 3.5e-185
CCDS54920.1 PCDHA9 gene_id:9752|Hs108|chr5 ( 950) 3823 640.3 5.3e-183
CCDS34255.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5 ( 685) 2654 448.1 2.8e-125
CCDS47282.1 PCDHA6 gene_id:56142|Hs108|chr5 ( 686) 2539 429.2 1.4e-119
CCDS54912.1 PCDHA1 gene_id:56147|Hs108|chr5 ( 686) 2500 422.8 1.2e-117
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 1944 331.5 4.3e-90
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 1944 331.5 4.8e-90
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 1940 330.8 6.8e-90
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 1940 330.8 7.6e-90
CCDS75350.1 PCDHGC5 gene_id:56097|Hs108|chr5 ( 878) 1933 329.7 1.6e-89
CCDS4263.1 PCDHGC5 gene_id:56097|Hs108|chr5 ( 944) 1933 329.7 1.7e-89
CCDS4261.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5 ( 934) 1925 328.4 4.2e-89
CCDS75348.1 PCDHGC3 gene_id:5098|Hs108|chr5 ( 863) 1923 328.0 5e-89
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 1910 325.9 2.2e-88
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 1910 325.9 2.4e-88
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 1908 325.5 2.6e-88
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 1908 325.5 2.7e-88
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 1908 325.6 2.9e-88
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 1908 325.6 2.9e-88
CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 820) 1904 324.9 4.1e-88
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 1904 324.9 4.3e-88
CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 932) 1904 324.9 4.6e-88
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 1904 324.9 4.6e-88
CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 810) 1890 322.6 2e-87
CCDS54923.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 927) 1890 322.6 2.3e-87
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 829) 1881 321.1 5.7e-87
CCDS47290.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 932) 1881 321.1 6.3e-87
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 1875 320.1 1.3e-86
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 1871 319.5 1.8e-86
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 1871 319.5 2e-86
CCDS58980.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 929) 1861 317.8 6.1e-86
CCDS75349.1 PCDHGC4 gene_id:56098|Hs108|chr5 ( 871) 1860 317.7 6.5e-86
CCDS75334.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 814) 1859 317.5 6.9e-86
CCDS4262.1 PCDHGC4 gene_id:56098|Hs108|chr5 ( 938) 1860 317.7 6.9e-86
CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 1850 316.0 1.9e-85
>>CCDS47285.1 PCDHA12 gene_id:56137|Hs108|chr5 (941 aa)
initn: 6146 init1: 6146 opt: 6146 Z-score: 5462.5 bits: 1022.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6146; 100.0% identity (100.0% similar) in 941 aa overlap (33-973:1-941)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 LQKRVTAHKIPQASDPLKLIVPTQRPSFSAMVIIGPRGPGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MVIIGPRGPGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQ
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LHYSVYEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LHYSVYEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 DREKLCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DREKLCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HFPLEGASDADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPELVLRKLLDREQTPKLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HFPLEGASDADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPELVLRKLLDREQTPKLNL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LLMVIDGGKPELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLMVIDGGKPELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPD
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EGLNGEISYGIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EGLNGEISYGIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSM
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 AGHSMVLVEVLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AGHSMVLVEVLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLT
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PHVPFKLVSTYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PHVPFKLVSTYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVND
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 NAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVSV
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATPA
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GSAGGAVSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GSAGGAVSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGE
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 ISTTRILDEADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ISTTRILDEADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPE
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 AALVDINVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AALVDINVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSY
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 SQQRRQRVCSAESPPKTDLMAFSPSLQLSREDCLNPPSEPRQPNPDWRYSASLRAGMHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SQQRRQRVCSAESPPKTDLMAFSPSLQLSREDCLNPPSEPRQPNPDWRYSASLRAGMHSS
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 VHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQS
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 GPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKE
880 890 900 910 920 930
970
pF1KB4 KGNSTTDNSDQ
:::::::::::
CCDS47 KGNSTTDNSDQ
940
>>CCDS75327.1 PCDHA12 gene_id:56137|Hs108|chr5 (792 aa)
initn: 5101 init1: 5101 opt: 5101 Z-score: 4535.4 bits: 850.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5101; 100.0% identity (100.0% similar) in 789 aa overlap (33-821:1-789)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 LQKRVTAHKIPQASDPLKLIVPTQRPSFSAMVIIGPRGPGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MVIIGPRGPGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQ
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LHYSVYEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LHYSVYEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 DREKLCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DREKLCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HFPLEGASDADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPELVLRKLLDREQTPKLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HFPLEGASDADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPELVLRKLLDREQTPKLNL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LLMVIDGGKPELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLMVIDGGKPELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPD
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EGLNGEISYGIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EGLNGEISYGIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSM
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 AGHSMVLVEVLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AGHSMVLVEVLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLT
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PHVPFKLVSTYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PHVPFKLVSTYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVND
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 NAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVSV
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATPA
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GSAGGAVSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GSAGGAVSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGE
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 ISTTRILDEADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ISTTRILDEADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPE
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 AALVDINVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AALVDINVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSY
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 SQQRRQRVCSAESPPKTDLMAFSPSLQLSREDCLNPPSEPRQPNPDWRYSASLRAGMHSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SQQRRQRVCSAESPPKTDLMAFSPSLQLSREDCLNPPSEVSY
760 770 780 790
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 VHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQS
>>CCDS54921.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5 (948 aa)
initn: 4528 init1: 3496 opt: 4989 Z-score: 4434.7 bits: 832.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4989; 82.9% identity (91.2% similar) in 941 aa overlap (42-973:9-948)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 IPQASDPLKLIVPTQRPSFSAMVIIGPRGPGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQLHYSVYEEA
: : ::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MVSRCSCLGVQCLLLSLLLLAAWEVGSGQLHYSVYEEA
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 KHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREKLCGRS
.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS54 RHGTFVGRIAQDLGLELAELVQRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRS
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 AECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDSHFPLEGASD
.::::::::::::::::::::::::::::::: : :::. . :: :::.::::::::
CCDS54 VECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPRFSVTEQKLSIPESRLLDSRFPLEGASD
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 ADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPELVLRKLLDREQTPKLNLLLMVIDGGK
::.: :.:::: :: :: : : : .::::. .: ::::::::::..:.:.::: . ::::
CCDS54 ADVGENALLTYKLSPNEYFVLDIINKKDKDKFPVLVLRKLLDREENPQLKLLLTATDGGK
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 PELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPDEGLNGEISY
::.::::.. : :::.:::.: ::.: :.: . :: :.: ::.::::: :::.: :. :
CCDS54 PEFTGSVSLLILVLDANDNAPIFDRPVYEVKMYENQVNQTLVIRLNASDSDEGINKEMMY
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 GIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSMAGHSMVLVE
... ..: . . : :: ::::.. .:::..:.:::.:.. ::: : :.:: ::::
CCDS54 SFSSLVPPTIRRKFWINERTGEIKVNDAIDFEDSNTYEIHVDVTDKGNPPMVGHCTVLVE
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 VLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLTPHVPFKLVS
.:: ::: :::.::::::::.::::::::::::::::.:::::::: :::::::::::::
CCDS54 LLDENDNSPEVIVTSLSLPVKEDAQVGTVIALISVSDHDSGANGQVTCSLTPHVPFKLVS
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 TYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDNAPAFAQPE
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CCDS54 TYKNYYSLVLDSALDRERVSAYELVVTARDGGSPPLWATASVSVEVADVNDNAPAFAQSE
400 410 420 430 440 450
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pF1KB4 YTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVSVHAESGKVYA
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CCDS54 YTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQENALVSYSLVERRLGERSLSSYVSVHAESGKVYA
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560 570 580 590 600 610
pF1KB4 LQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATPAGSAGGAVSE
::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS54 LQPLDHEELELLQFQVSARDGGVPPLGSNLTLQVFVLDENDNAPALLASPAGSAGGAVSE
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pF1KB4 LVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGEISTTRILDE
:: ::: :::::::::::::::::::::::::: :::::.:::.:::::::::::: :::
CCDS54 LVLRSVVAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQSAAVGARIPFRVGLYTGEISTTRALDE
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pF1KB4 ADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPEAALVDINVY
.:.::.::::::::::::.::.::::::::::..::::.::::::: : ::.::::.:::
CCDS54 TDSPRQRLLVLVKDHGEPSLTATATVLVSLVEGSQAPKASSRASVG-VAPEVALVDVNVY
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pF1KB4 LIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVC
:::::::::::::::::::::::::: :: . :.: ::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAAPTEGACGPVKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVC
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pF1KB4 SAESPPKTDLMAFSPSL------QLSREDCL---NPPSEPRQPNPDWRYSASLRAGMHSS
:.:. ::.::::::::: ... :: . .:::::::::::::::::::::
CCDS54 SGEGLPKADLMAFSPSLPPCPMVDVDGEDQSIGGDHSRKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSS
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pF1KB4 VHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQS
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pF1KB4 GPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKE
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970
pF1KB4 KGNSTTDNSDQ
:::::::::::
CCDS54 KGNSTTDNSDQ
940
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Smith-Waterman score: 4925; 82.1% identity (90.2% similar) in 941 aa overlap (40-973:8-947)
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pF1KB4 HKIPQASDPLKLIVPTQRPSFSAMVIIGPRGPGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQLHYSVYE
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CCDS54 MEFSWGSGQESRRLLLLLLLLAAWEAGNGQLHYSVSE
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pF1KB4 EAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREKLCG
:::::::::::::::::::::::::::::::: .: ::::::::::::::::::::.::
CCDS54 EAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKGRGGLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCR
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pF1KB4 RSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDSHFPLEGA
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CCDS54 RSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVRDINDNPPVFPATQKNLSIAESRPLDSRFPLEGA
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CCDS54 SDADIGENALLTYRLSPNEYFSLE-KPPDDELVKGLGLILRKSLDREEAPEIFLVLTATD
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pF1KB4 GGKPELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPDEGLNGE
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CCDS54 GGKPELTGTVQLLITVLDANDNAPAFDRTIYKVRLLENVPNGTLVIKLNASDLDEGLNGD
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 ISYGIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSMAGHSMV
: :... . . : : :.: ::.: . : .::::...::: :..:::: ..:: :
CCDS54 IVYSFSNDISPNVKSKFHIDPITGQIIVKGYIDFEESKSYEIIVEGIDKGQLPLSGHCRV
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 LVEVLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLTPHVPFK
.::: : :::::.. :::::..::: .:::::::::::.: :.:: : :::: :::::
CCDS54 IVEVEDNNDNVPDLEFKSLSLPIREDAPLGTVIALISVSDKDMGVNGLVTCSLTSHVPFK
340 350 360 370 380 390
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::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS54 LVSTFKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATASVSVEVADVNDNAPAFA
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CCDS54 QPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQENALVSYSLVERRVGERALSSYVSVHAESGK
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:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::..:::
CCDS54 VYALQPLDHEELELLQFQVTARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLAPRAGGTGGA
520 530 540 550 560 570
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pF1KB4 VSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGEISTTRI
:::::: :::.::::::::::::::::::::::::::.. ::.:::.::::::::::::
CCDS54 VSELVPWSVGVGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPGTGGARIPFRVGLYTGEISTTRA
580 590 600 610 620 630
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pF1KB4 LDEADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPEAALVDI
:::.::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::.:::: :::: :.:::::.
CCDS54 LDETDAPRHRLLVLVKDHGEPALTATATVLVSLVESGQAPKASSRALVGAVGPDAALVDV
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pF1KB4 NVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQ
::::::::::::::::::::::::::::: :: . ::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSALPTEGACAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRP
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pF1KB4 RVCSAESPPKTDLMAFSPSLQLSR--EDCLNPPSE----PRQPNPDWRYSASLRAGMHSS
::::.:.::::::::::::: :: :: :. : :::::::::::::::::::::
CCDS54 RVCSGEGPPKTDLMAFSPSLPDSRDREDQLQTTEESFAKPRQPNPDWRYSASLRAGMHSS
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pF1KB4 VHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQS
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pF1KB4 GPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKE
880 890 900 910 920 930
970
pF1KB4 KGNSTTDNSDQ
:::::::::::
CCDS54 KGNSTTDNSDQ
940
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pF1KB4 AHKIPQASDPLKLIVPTQRPSFSAMVIIGPRGPGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQLHYSVY
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CCDS54 MASSIRRGRGAWTRLLSLLLLAAWEVGSGQLRYSVP
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pF1KB4 EEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREKLC
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS54 EEAKHGTFVGRIAQDLGLELEELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELC
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pF1KB4 GRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDSHFPLEG
:::::::::.:::::::::::::.:::::::::::.: . . :: :::.:::::
CCDS54 GRSAECSIHVEVIVDRPLQVFHVEVEVKDINDNPPIFPMTVKTIRFPESRLLDSRFPLEG
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pF1KB4 ASDADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPELVLRKLLDREQTPKLNLLLMVID
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CCDS54 ASDADIGVNALLSYKLSSSEFFFLDIQANDELSESLSLVLGKSLDREETAEVNLLLVATD
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pF1KB4 GGKPELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPDEGLNGE
::::::::.::: : ::::::: :.: . ::: : ::. : : :..::::: ::: :.:
CCDS54 GGKPELTGTVQILIKVLDVNDNEPTFAQSVYKVKLLENTANGTLVVKLNASDADEGPNSE
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 ISYGIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSMAGHSMV
: :.. . . . :.:.: .:::: :.::.:: ..:::::.: ::: :::.:: .
CCDS54 IVYSLGSDVSSTIQTKFTIDPISGEIRTKGKLDYEEAKSYEIQVTATDKGTPSMSGHCKI
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 LVEVLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLTPHVPFK
....:.:::.::: .::::::..:.:..:::::::.:::::::.::.: ::::::::::
CCDS54 SLKLVDINDNTPEVSITSLSLPISENASLGTVIALITVSDRDSGTNGHVTCSLTPHVPFK
340 350 360 370 380 390
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pF1KB4 LVSTYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDNAPAFA
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::.:::::::::::::
CCDS54 LVSTFKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATTSVSIEVADVNDNAPAFA
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pF1KB4 QPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVSVHAESGK
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS54 QPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQENALVSYSLVERRVGERALSSYVSVHAESGK
460 470 480 490 500 510
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pF1KB4 VYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATPAGSAGGA
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:.::
CCDS54 VYALQPLDHEEVELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLAPRAGTAAGA
520 530 540 550 560 570
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pF1KB4 VSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGEISTTRI
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::: .. .:.:::.::::::::::::
CCDS54 VSELVPWSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQLGTGSARIPFRVGLYTGEISTTRA
580 590 600 610 620 630
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pF1KB4 LDEADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPEAALVDI
:::::.::::::::::::::::::.::::::::::.:::::.:::: :::. ::.:::.
CCDS54 LDEADSPRHRLLVLVKDHGEPALTATATVLVSLVESGQAPKASSRAWVGAAGSEATLVDV
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 NVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQ
::::::::::::::::::.:::::::::.::: . ::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVYLIIAICAVSSLLVLTVLLYTALRCSVPPTEGARAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQ
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 RVCSAESPPKTDLMAFSPSLQL---SREDCLNPPSE----PRQPNPDWRYSASLRAGMHS
::::.:.:::::::::::::. : :. :: ::::::::::::::::::::
CCDS54 RVCSGEDPPKTDLMAFSPSLSQGPDSAEEKQLSESEYVGKPRQPNPDWRYSASLRAGMHS
760 770 780 790 800 810
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pF1KB4 SVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQ
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 SGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKK
880 890 900 910 920 930
970
pF1KB4 EKGNSTTDNSDQ
::::::::::::
CCDS54 EKGNSTTDNSDQ
940
>>CCDS54918.1 PCDHA7 gene_id:56141|Hs108|chr5 (937 aa)
initn: 3862 init1: 3862 opt: 4884 Z-score: 4341.5 bits: 814.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4884; 80.7% identity (90.6% similar) in 942 aa overlap (35-973:1-937)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 KRVTAHKIPQASDPLKLIVPTQRPSFSAMVIIGPRG--PGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQ
.. : : ::...::: ...:::::.: ::
CCDS54 MVCPNGYDPGGRHLLLFIIILAAWEAGRGQ
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LHYSVYEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRI
::::: ::::::.::::::::::::::::::::::.. : .:::::::::::::::::::
CCDS54 LHYSVPEEAKHGNFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRAVCKFRGDLLEVNLQNGILFVNSRI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 DREKLCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDS
:::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: .... ..:: ::::
CCDS54 DREELCGRSAECSIHLEVIVERPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFPATQRNLFIAESRPLDS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HFPLEGASDADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPE-LVLRKLLDREQTPKLN
.:::::::::::: :.:::: :: :: : : . :. .... : ::::::::::.::.:.
CCDS54 RFPLEGASDADIGENALLTYRLSPNEYFFLDVPTS-NQQVKPLGLVLRKLLDREETPELH
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LLLMVIDGGKPELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDP
::: . :::::::::.::. ::::: :::.:.::. : : : :::. : ::. ::::
CCDS54 LLLTATDGGKPELTGTVQLLITVLDNNDNAPVFDRTLYTVKLPENVSIGTLVIHPNASDL
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 DEGLNGEISYGIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPS
::::::.: :... . . : : ..: .: : . :..::::. :..: :.:.:::.:
CCDS54 DEGLNGDIIYSFSSDVSPDIKSKFHMDPLSGAITVIGHMDFEESRAHKIPVEAVDKGFPP
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 MAGHSMVLVEVLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSL
.::: :::::.:::::.:.. .::::::. :::: ::::.:::: ::: :.:::: :::
CCDS54 LAGHCTVLVEVVDVNDNAPQLTLTSLSLPIPEDAQPGTVITLISVFDRDFGVNGQVTCSL
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 TPHVPFKLVSTYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVN
::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS54 TPRVPFKLVSTFKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATASVSVEVADVN
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 DNAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVS
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::: ::::.:::::::
CCDS54 DNAPAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAGDADAQKNALVSYSLVELRVGERALSSYVS
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VHAESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLAPR
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 AGSAGGAVSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTG
.:..:::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::.::::::
CCDS54 VGGTGGAVRELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPVAAGASIPFRVGLYTG
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 EISTTRILDEADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDP
:::::: :::.:::::::::::::::::.::.::::::::::.:::::.:::::.: . :
CCDS54 EISTTRALDETDAPRHRLLVLVKDHGEPSLTATATVLVSLVESGQAPKASSRASLGIAGP
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 EAALVDINVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWS
:. :::.:::::::::::::::::::::::::::::: . . :. ::::::::::::::
CCDS54 ETELVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPSSEGACSLVKPTLVCSSAVGSWS
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 YSQQRRQRVCSAESPPKTDLMAFSPSLQLSREDCLNPPSEPRQPNPDWRYSASLRAGMHS
.::::::::::.:.::::::::::::: . . : ::::::::::::::::::::
CCDS54 FSQQRRQRVCSGEGPPKTDLMAFSPSLPQGPSSTDN----PRQPNPDWRYSASLRAGMHS
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 SVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQ
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 SGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKK
870 880 890 900 910 920
970
pF1KB4 EKGNSTTDNSDQ
::::::::::::
CCDS54 EKGNSTTDNSDQ
930
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Smith-Waterman score: 4836; 79.9% identity (90.3% similar) in 940 aa overlap (34-973:1-936)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 QKRVTAHKIPQASDPLKLIVPTQRPSFSAMVIIGPRGPGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQL
.. . :: ..:::: :::: :..:::::
CCDS54 MVYSRRGSLGSRLLLLWLLLAYWKAGSGQL
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 HYSVYEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRID
:::. ::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::
CCDS54 HYSIPEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKGRGDLLEVNLQNGILFVNSRID
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 REKLCGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDSH
::.:: : ::::::::::::::::::::.: ::::::::: : ..::.. . :: ::.
CCDS54 REELCRRRAECSIHLEVIVDRPLQVFHVEVAVKDINDNPPRFSRQEQRLFILESRMPDSR
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FPLEGASDADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPELVLRKLLDREQTPKLNLL
:::::::: :::.:. : : :. :: :.: .::..... . :::::: ::::.: . ::
CCDS54 FPLEGASDLDIGANAQLRYRLNPNEYFDLDVKTNEEETNFLELVLRKSLDREETQEHRLL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LMVIDGGKPELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPDE
... :::::::::.::. :.:::.:::.: ::: :.: : ::. . : ::.::::: ::
CCDS54 VIATDGGKPELTGTVQLLINVLDANDNAPEFDKSIYNVRLLENAPSGTLVIKLNASDADE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 GLNGEISYGIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSMA
:.: :: : .. .. . : : :: .::::.. ::::.:. :.:::...:.::. ..
CCDS54 GINKEIVYFFSNLVLDDVKSKFIINSNTGEIKVNGELDYEDYNSYEINIDAMDKSTFPLS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GHSMVLVEVLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLTP
:: :.:..::::::.::. .:.: :::.::: ..::::::::::::::::::: ::: :
CCDS54 GHCKVVVKLLDVNDNTPEMAITTLFLPVKEDAPLSTVIALISVSDRDSGANGQVTCSLMP
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 HVPFKLVSTYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDN
:::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS54 HVPFKLVSTFKNYYSLVLDSALDRESVSVYELVVTARDGGSPSLWATASVSVEVADVNDN
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 APAFAQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVSVH
:::::::.:::::::::::::::::::: :::::.:::::::::::::::. ::::::::
CCDS54 APAFAQPQYTVFVKENNPPGCHIFTVSARDADAQENALVSYSLVERRVGERPLSSYVSVH
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 AESGKVYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATPAG
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .:
CCDS54 AESGKVYALQPLDHEEVELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLVPRVG
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SAGGAVSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGEI
..::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: .:.:::.::::::::
CCDS54 GTGGAVSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDPDSGYNAWLSYELQPAPGSARIPFRVGLYTGEI
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 STTRILDEADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPEA
:::: :::..:::::::::::::::: ::.::::::::::.:::::.:::::.::: :::
CCDS54 STTRSLDETEAPRHRLLVLVKDHGEPPLTATATVLVSLVESGQAPKASSRASAGAVGPEA
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 ALVDINVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSYS
::::.::::::::::::::::::::::::::::: :: . :. :::::.:::::::::::
CCDS54 ALVDVNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAQPTEAVCTRGKPTLLCSSAVGSWSYS
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 QQRRQRVCSAESPPKTDLMAFSPSLQLSREDCLNPPSEPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSV
:::::::::.:.::::::::::::: . . : ::::::::::::::::::::::
CCDS54 QQRRQRVCSGEAPPKTDLMAFSPSLPQGPTSTDN----PRQPNPDWRYSASLRAGMHSSV
760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 HLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNPKQSG
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 PGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQEKKEK
870 880 890 900 910 920
970
pF1KB4 GNSTTDNSDQ
::::::::::
CCDS54 GNSTTDNSDQ
930
>>CCDS75325.1 PCDHA10 gene_id:56139|Hs108|chr5 (844 aa)
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Smith-Waterman score: 3977; 81.6% identity (91.1% similar) in 767 aa overlap (42-808:9-774)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 IPQASDPLKLIVPTQRPSFSAMVIIGPRGPGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQLHYSVYEEA
: : ::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MVSRCSCLGVQCLLLSLLLLAAWEVGSGQLHYSVYEEA
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 KHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREKLCGRS
.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS75 RHGTFVGRIAQDLGLELAELVQRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELCGRS
40 50 60 70 80 90
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pF1KB4 AECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDSHFPLEGASD
.::::::::::::::::::::::::::::::: : :::. . :: :::.::::::::
CCDS75 VECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPRFSVTEQKLSIPESRLLDSRFPLEGASD
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 ADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPELVLRKLLDREQTPKLNLLLMVIDGGK
::.: :.:::: :: :: : : : .::::. .: ::::::::::..:.:.::: . ::::
CCDS75 ADVGENALLTYKLSPNEYFVLDIINKKDKDKFPVLVLRKLLDREENPQLKLLLTATDGGK
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 PELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPDEGLNGEISY
::.::::.. : :::.:::.: ::.: :.: . :: :.: ::.::::: :::.: :. :
CCDS75 PEFTGSVSLLILVLDANDNAPIFDRPVYEVKMYENQVNQTLVIRLNASDSDEGINKEMMY
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 GIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSMAGHSMVLVE
... ..: . . : :: ::::.. .:::..:.:::.:.. ::: : :.:: ::::
CCDS75 SFSSLVPPTIRRKFWINERTGEIKVNDAIDFEDSNTYEIHVDVTDKGNPPMVGHCTVLVE
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 VLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLTPHVPFKLVS
.:: ::: :::.::::::::.::::::::::::::::.:::::::: :::::::::::::
CCDS75 LLDENDNSPEVIVTSLSLPVKEDAQVGTVIALISVSDHDSGANGQVTCSLTPHVPFKLVS
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 TYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDNAPAFAQPE
::::::::::::::::: :::::::::::::::: ::::: ::::::::::::::::: :
CCDS75 TYKNYYSLVLDSALDRERVSAYELVVTARDGGSPPLWATASVSVEVADVNDNAPAFAQSE
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 YTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVSVHAESGKVYA
::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::..::::::::::::::::
CCDS75 YTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQENALVSYSLVERRLGERSLSSYVSVHAESGKVYA
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 LQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATPAGSAGGAVSE
::::::::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS75 LQPLDHEELELLQFQVSARDGGVPPLGSNLTLQVFVLDENDNAPALLASPAGSAGGAVSE
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KB4 LVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGEISTTRILDE
:: ::: :::::::::::::::::::::::::: :::::.:::.:::::::::::: :::
CCDS75 LVLRSVVAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQSAAVGARIPFRVGLYTGEISTTRALDE
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KB4 ADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPEAALVDINVY
.:.::.::::::::::::.::.::::::::::..::::.::::::: : ::.::::.:::
CCDS75 TDSPRQRLLVLVKDHGEPSLTATATVLVSLVEGSQAPKASSRASVG-VAPEVALVDVNVY
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KB4 LIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVC
:::::::::::::::::::::::::: :: . :.: ::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAAPTEGACGPVKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQRVC
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830 840 850
pF1KB4 SAESPPKTDLMAFSPSLQLSREDCLNPPSEPRQPNPDWRYSASLRAGMHSSVHLEEAGIL
:.:. ::.:::::::::
CCDS75 SGEGLPKADLMAFSPSLPPCPMVDVDGEDQSIGGDHSRKVGYYVFIFLLCFMNNIFSYRI
760 770 780 790 800 810
>>CCDS47284.1 PCDHA11 gene_id:56138|Hs108|chr5 (949 aa)
initn: 4982 init1: 2684 opt: 3968 Z-score: 3527.8 bits: 664.2 E(32554): 3.5e-190
Smith-Waterman score: 4968; 81.9% identity (90.3% similar) in 944 aa overlap (39-973:7-949)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 AHKIPQASDPLKLIVPTQRPSFSAMVIIGPRGPGSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQLHYSVY
:: :. :: : :::: ::::::::::::
CCDS47 MFGFQRRGLGTPRLQLWLLLLEFWEVGSGQLHYSVS
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREKLC
:::::::::::::::::::::::: :::::::: :::::::::::::::::::::::.::
CCDS47 EEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVQRLFRVASKTHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREELC
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 GRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDSHFPLEG
:.:::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::. ..:: ::.:::::
CCDS47 GQSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVNVEVKDINDNPPVFSLREQKLLIAESKQSDSRFPLEG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 ASDADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPELVLRKLLDREQTPKLNLLLMVID
:::::: :.:::: :: :: : : :. . :.:.: ::::.::.::::: . :
CCDS47 ASDADIEENALLTYRLSKNEYFSLDSPTNGKQIKRLSLILKKSLDREKTPELNLLLTATD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GGKPELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPDEGLNGE
::::::::.:.. . ::::::: : ::: ::: : ::. ..: :..:::.: :::.:::
CCDS47 GGKPELTGTVRLLVQVLDVNDNDPEFDKSEYKVSLMENAAKETLVLKLNATDRDEGVNGE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ISYGIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSMAGHSMV
..:.. : : . . .:... ..::.:. : ::.:::. :.:.:.: ::: : :::: :
CCDS47 VTYSLMSIKP-NGRHLFTLDQNNGEVRVNGTLDYEENKFYKIEVQATDKGTPPMAGHCTV
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LVEVLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLTPHVPFK
::.::.::: ::: ::::::::.:::: .::::::::::::::.:::: ::::::::::
CCDS47 WVEILDTNDNSPEVAVTSLSLPVREDAQPSTVIALISVSDRDSGVNGQVTCSLTPHVPFK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 LVSTYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDNAPAFA
::::.:::::::::::::::.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LVSTFKNYYSLVLDSALDRENVWAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDNAPAFA
400 410 420 430 440 450
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pF1KB4 QPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVSVHAESGK
::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::::::.:..::::::::::::::
CCDS47 QPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSARDADAQENALVSYSLVERRLGDRALSSYVSVHAESGK
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATPAGSAGGA
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS47 VYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLSSNVTLQVFVLDENDNAPALLATQAGSAGGA
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 VSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGEISTTRI
:..:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :..:::.::::::::::::
CCDS47 VNKLVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAGGSRIPFRVGLYTGEISTTRA
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 LDEADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPEAALVDI
:::::.::::::::::::::::::.::::::::::.:::::.:::. .::..:::::::.
CCDS47 LDEADSPRHRLLVLVKDHGEPALTATATVLVSLVESGQAPKASSRTLAGAASPEAALVDV
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 NVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRRQ
:::::::::.::::::::::::::: :: :: . ::::::::::: :::::::::::::
CCDS47 NVYLIIAICVVSSLLVLTLLLYTALWWSATPTEGACAPGKPTLVCSRAVGSWSYSQQRRQ
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830
pF1KB4 RVCSAESPPKTDLMAFSPSLQLS---------REDCLNPPSEPRQPNPDWRYSASLRAGM
:::: :.::::::::::::: :. .: : :..::::::::::::::::::
CCDS47 RVCSEEGPPKTDLMAFSPSLPLGLNKEEEGERQEPGSNHPGQPRQPNPDWRYSASLRAGM
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 HSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGNP
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KB4 KQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQE
880 890 900 910 920 930
960 970
pF1KB4 KKEKGNSTTDNSDQ
::::::::::::::
CCDS47 KKEKGNSTTDNSDQ
940
>>CCDS54919.1 PCDHA8 gene_id:56140|Hs108|chr5 (950 aa)
initn: 4966 init1: 3934 opt: 3960 Z-score: 3520.7 bits: 662.8 E(32554): 8.8e-190
Smith-Waterman score: 4956; 81.5% identity (91.1% similar) in 945 aa overlap (39-973:6-950)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 AHKIPQASDPLKLIVPTQRPSFSAMVIIGPRGP-GSQRLLLSLLLLAAWEVGSGQLHYSV
:: :: :::: :::::::.::::::::::
CCDS54 MDYHWRGELGSWRLLLLLLLLAAWKVGSGQLHYSV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 YEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHGDLLEVNLQNGILFVNSRIDREKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::::::::::.:
CCDS54 PEEAKHGTFVGRIAQDLGLELAELVPRLFRVASKRHRDLLEVSLQNGILFVNSRIDREEL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDINDNPPVFREREQKVPVSESAPLDSHFPLE
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CCDS54 CGRSAECSIHLEVIVDRPLQVFHVDVEVKDVNDNPPVFRVKDQKLFVSESRMPDSRFPLE
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 GASDADIGVNSLLTYALSLNENFELKIKTKKDKSILPELVLRKLLDREQTPKLNLLLMVI
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CCDS54 GASDADVGANSVLTYRLSSHDYFMLDVNSKNDENKLVELVLRKSLDREDAPAHHLFLTAT
160 170 180 190 200 210
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pF1KB4 DGGKPELTGSVQIQITVLDVNDNGPAFDKPSYKVVLSENVQNDTRVIQLNASDPDEGLNG
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CCDS54 DGGKPELTGTVQLLVTVLDVNDNAPTFEQSEYEVRIFENADNGTTVIKLNASDPDEGANG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EISYGIKMILPVSEKCMFSINPDTGEIRIYGELDFEENNAYEIQVNAIDKGIPSMAGHSM
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CCDS54 AISYSFNSLVETMVIDHFSIDRNTGEIVIRGNLDFEQENLYKILIDATDKGHPPMAGHCT
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 VLVEVLDVNDNVPEVMVTSLSLPVQEDAQVGTVIALISVSDRDSGANGQVICSLTPHVPF
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CCDS54 VLVRILDKNDNVPEIALTSLSLPVREDAQFGTVIALISVNDLDSGANGQVTCSLMPHVPF
340 350 360 370 380 390
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pF1KB4 KLVSTYKNYYSLVLDSALDRESVSAYELVVTARDGGSPSLWATARVSVEVADVNDNAPAF
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CCDS54 KLVSTFKNYYSLVLDSALDRERVSAYELVVTARDGGSPSLWATASLSVEVADVNDNAPAF
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pF1KB4 AQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSAWDADAQKNALVSYSLVERRVGEHALSSYVSVHAESG
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CCDS54 AQPEYTVFVKENNPPGCHIFTVSARDADAQENALVSYSLVERRVGERSLSSYISVHTESG
460 470 480 490 500 510
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pF1KB4 KVYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLATPAGSAGG
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CCDS54 KVYALQPLDHEELELLQFQVSARDAGVPPLGSNVTLQVFVLDENDNAPALLEPRVGGTGG
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pF1KB4 AVSELVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAAVGAHIPFHVGLYTGEISTTR
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CCDS54 AASKLVPRSVGAGHVVAKVRAVDADSGYNAWLSYELQPAASSPRIPFRVGLYTGEISTTR
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pF1KB4 ILDEADAPRHRLLVLVKDHGEPALTSTATVLVSLVENGQAPKTSSRASVGAVDPEAALVD
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CCDS54 VLDEADSPRHRLLVLVKDHGEPALTATATVLVSLVESGQAPKASSRQSAGVLGPEAALVD
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pF1KB4 INVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSAPPTVSRCAPGKPTLVCSSAVGSWSYSQQRR
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CCDS54 VNVYLIIAICAVSSLLVLTLLLYTALRCSALPTEGGCRAGKPTLVCSSAVGSWSYSQQQP
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pF1KB4 QRVCSAESPPKTDLMAFSP-------SLQLSREDCLNPPS--EPRQPNPDWRYSASLRAG
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CCDS54 QRVCSGEGPPKTDLMAFSPCLPPDLGSVDVGEEQDLNVDHGLKPRQPNPDWRYSASLRAG
760 770 780 790 800 810
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pF1KB4 MHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGN
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CCDS54 MHSSVHLEEAGILRAGPGGPDQQWPTVSSATPEPEAGEVSPPVGAGVNSNSWTFKYGPGN
820 830 840 850 860 870
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pF1KB4 PKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQ
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CCDS54 PKQSGPGELPDKFIIPGSPAIISIRQEPTNSQIDKSDFITFGKKEETKKKKKKKKGNKTQ
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pF1KB4 EKKEKGNSTTDNSDQ
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CCDS54 EKKEKGNSTTDNSDQ
940 950
973 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 14:22:13 2016 done: Thu Nov 3 14:22:14 2016
Total Scan time: 4.560 Total Display time: 0.280
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]