FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4076, 573 aa
1>>>pF1KB4076 573 - 573 aa - 573 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8241+/-0.000849; mu= 13.7198+/- 0.052
mean_var=315.5068+/-64.727, 0's: 0 Z-trim(111.1): 2098 B-trim: 99 in 1/52
Lambda= 0.072205
statistics sampled from 17259 (19599) to 17259 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 9.690
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056209 (OMIM: 194538) zinc finger protein 10 [H ( 573) 4039 436.1 1.5e-121
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1813 204.3 1e-51
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1808 203.8 1.5e-51
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1808 203.8 1.5e-51
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1701 192.6 3.2e-48
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 1630 185.5 6.7e-46
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 1630 185.5 6.7e-46
NP_008887 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 659) 1624 184.6 8.6e-46
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 1621 184.5 1.2e-45
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1591 181.1 9.1e-45
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1591 181.2 9.4e-45
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1591 181.2 9.4e-45
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1591 181.2 9.4e-45
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1591 181.2 9.5e-45
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 1580 180.0 2e-44
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1563 178.2 6.8e-44
NP_001284552 (OMIM: 608640) zinc finger protein 46 ( 540) 1544 176.1 2.5e-43
NP_001278562 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1538 175.7 4.3e-43
NP_001265438 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1538 175.7 4.3e-43
NP_001265437 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 667) 1538 175.7 4.3e-43
NP_001275688 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 691) 1538 175.7 4.4e-43
NP_037388 (OMIM: 606740) zinc finger protein 180 i ( 692) 1538 175.7 4.4e-43
XP_011525582 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 734) 1538 175.7 4.5e-43
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1534 175.1 5.2e-43
XP_016882744 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
NP_001275690 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882740 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882745 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882742 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
NP_001275689 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882739 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882741 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_016882743 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
NP_001275691 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 349) 1526 173.9 7.4e-43
XP_005259333 (OMIM: 613905) PREDICTED: zinc finger ( 792) 1517 173.6 2.1e-42
NP_079303 (OMIM: 613905) zinc finger protein 606 [ ( 792) 1517 173.6 2.1e-42
XP_006723247 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 566) 1502 171.8 5.3e-42
XP_016882229 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 585) 1502 171.8 5.4e-42
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1506 172.7 5.5e-42
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1506 172.7 5.5e-42
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1506 172.7 5.5e-42
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1506 172.7 5.5e-42
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1506 172.7 5.5e-42
XP_005258908 (OMIM: 606741) PREDICTED: zinc finger ( 567) 1490 170.5 1.3e-41
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1467 168.1 6.5e-41
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1467 168.1 6.5e-41
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1467 168.1 6.5e-41
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1467 168.1 6.5e-41
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1467 168.2 7.2e-41
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1467 168.3 7.4e-41
>>NP_056209 (OMIM: 194538) zinc finger protein 10 [Homo (573 aa)
initn: 4039 init1: 4039 opt: 4039 Z-score: 2303.2 bits: 436.1 E(85289): 1.5e-121
Smith-Waterman score: 4039; 100.0% identity (100.0% similar) in 573 aa overlap (1-573:1-573)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQSCDIKMEGMARND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQSCDIKMEGMARND
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVAFTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVAFTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQDSCASNSNECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQDSCASNSNECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PDNDNSLTHGSSLGISKGIHREKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PDNDNSLTHGSSLGISKGIHREKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHT
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB4 GEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
550 560 570
>>XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (670 aa)
initn: 6767 init1: 1415 opt: 1813 Z-score: 1049.4 bits: 204.3 E(85289): 1e-51
Smith-Waterman score: 1817; 48.8% identity (69.8% similar) in 582 aa overlap (8-573:20-590)
10 20 30 40
pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYK
: : :::.:: : :..::: : ::. .::.:::....
XP_005 MELGSRRRSVGCRCRGLCLAVRREQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFR
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 NLVSLGYQLTKPDVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQS
:::.:. : ::.:: ::. : : :: .. : ..:: :: ..: :: ...: .. ..
XP_005 LLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 CDIKMEGMARNDLWYLSLEEV-----WKCRDQLDKYQENPERHLRQVAFTQKKVLTQERV
: .: . . ::: :.. :.: :. : :::: :. . :.
XP_005 SVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSC--------ESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQW
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB4 SESGKYGGNCLLPAQLVLREYFHKRDS-HT-----KSLKHDLVLNGHQDSCASNS----N
...: .: : : .: . . .:.: :: : : :: : : .:.... .
XP_005 QRNG-FGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL--NVLQKTCVKEKPYKCQ
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 ECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYECKECGK
:::..: .. ::. :::::.. :.: . ... ..:.: . :: ::::.: .::.
XP_005 ECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGR
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 FFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSW
:. . : .:: :::::::::.::::::: : . :..:::::.::::.::::.:
XP_005 TFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQ
290 300 310 320 330 340
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pF1KB4 FSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHL
::. : : :::.: : :..:::.: ::: : .::: ::::::::: ::::.: : : :
XP_005 SIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPL
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 ILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQ
: :::::. .::::.::::..:: . :. :.::::: ::. :..::: ::.:: : .:.
XP_005 IQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHE
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 RTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHV
::::::::::: .:::.: ::. : ::::::::::::: .::::: ....: ::::::.
XP_005 RTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHT
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pF1KB4 GEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENA
::. :.::::: ::: .:.: :: ::::. ::::: :. ..: :: .: : .:.
XP_005 GEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKP
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 Y
:
XP_005 YGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACR
590 600 610 620 630 640
>--
initn: 727 init1: 395 opt: 395 Z-score: 251.1 bits: 56.6 E(85289): 3e-07
Smith-Waterman score: 407; 68.4% identity (84.8% similar) in 79 aa overlap (435-513:592-670)
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 YECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECH
:..::: ::.:: : .:.::::::::::::
XP_005 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
570 580 590 600 610 620
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 DCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGI
:::::: ::. : :.::::::::: : .::::: ....: :::: :.:
XP_005 DCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
630 640 650 660 670
530 540 550 560 570
pF1KB4 IFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
>>XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (658 aa)
initn: 6767 init1: 1415 opt: 1808 Z-score: 1046.7 bits: 203.8 E(85289): 1.5e-51
Smith-Waterman score: 1812; 49.0% identity (70.1% similar) in 576 aa overlap (14-573:14-578)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKP
:::.:: : :..::: : ::. .::.:::.... :::.:. : ::
XP_016 MTPGVRVSTDPEQVTFEDVVVGFSQEEWGQLKPAQRTLYRDVMLDTFRLLVSVGHWLPKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQSCDIKMEGMARND
.:: ::. : : :: .. : ..:: :: ..: :: ...: .. .. : .: . .
XP_016 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB4 LWYLSLEEV-----WKCRDQLDKYQENPERHLRQVAFTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLL
::: :.. :.: :. : :::: :. . :. ...: .: : :
XP_016 LWYCRGEDTEGHWEWSC--------ESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNG-FGENISL
130 140 150 160 170
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pF1KB4 PAQLVLREYFHKRDS-HT-----KSLKHDLVLNGHQDSCASNS----NECGQTFCQNIHL
.: . . .:.: :: : : : :: : .:.... .:::..: .. :
XP_016 NPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPD--LNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSAL
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 IQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQ
:. :::::.. :.: . ... ..:.: . :: ::::.: .::. :. . : .::
XP_016 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
230 240 250 260 270 280
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pF1KB4 LIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHT
:::::::::.::::::: : . :..:::::.::::.::::.: ::. : : ::
XP_016 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
290 300 310 320 330 340
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pF1KB4 GDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRP
:.: : :..:::.: ::: : .::: ::::::::: ::::.: : : :: :::::. .:
XP_016 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 YECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECH
:::.::::..:: . :. :.::::: ::. :..::: ::.:: : .:.:::::::::::
XP_016 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 DCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGI
.:::.: ::. : ::::::::::::: .::::: ....: ::::::.::. :.:::::
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::: .:.: :: ::::. ::::: :. ..: :: .: : .:. :
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530 540 550 560 570 580
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410 420 430 440 450 460
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470 480 490 500 510 520
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:::::: ::. : :.::::::::: : .::::: ....: :::: :.:
XP_016 DCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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::: .:.: :: ::::. ::::: :. ..: :: .: : .:. :
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410 420 430 440 450 460
pF1KB4 YECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECH
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pF1KB4 DCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGI
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NP_001 DCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KB4 IFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
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::.... :::.:. : ::.:: ::. :
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NP_001 AFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQ
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410 420 430 440 450 460
pF1KB4 YECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECH
:..::: ::.:: : .:.::::::::::::
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pF1KB4 DCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGI
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NP_001 DCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KB4 IFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
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: .. .. .... . :: . : . .::. .... . :...
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: ::.. : .. ::::. : .. .:: : :::.: ..: . .... :.:
NP_001 SYLLVHQQTHAEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLV
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NP_001 IHQRIHTGENPYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHER
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NP_001 IHTGEKPYECNECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTG
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NP_001 VKPYGCIQCGKGFSLKSQLIVHQRSHTGMKPYVCNECGKAFRSKSYLIIHTRTHTGEKLH
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NP_001 CGKAFGLKSQLIIHQRTHTGEKPFECSECQKAFNTKSNLIVHQRTHTGEKPYSCNECGKA
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pF1KB4 LVNTSNLIGYQTNHIRENAY
.. :.:: .. :
NP_001 FTFKSQLIVHKGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSK
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pF1KB4 TGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHREKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKP
::: :..:.: :: .:.: :: ::: ::
NP_001 GEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVHKGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKP
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pF1KB4 YECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCN
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NP_001 YGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTHTGEKPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECS
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.:::.: ....:: :::::.::::: : ::::.: ....::.:.::: .:::::::::
NP_001 ECGKAFNRKDQLISHQRTHAGEKPYGCSECGKAFSSKSYLIIHMRTHSGEKPYECNECGK
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.. .: :.::.: :.:..:..:..: : :: . .: ::: :: :::::: .:::.: .
NP_001 AFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQCEKSFSGKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIR
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pF1KB4 SSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPF
.: :::::: :.::::: : .:::.: .:. : ::: :.::. ::..:: : .: .
NP_001 NSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTFSQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQL
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pF1KB4 IVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
:.:: .:. ..
NP_001 IMHQRTHVDDKH
940
>>NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 isofo (947 aa)
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10 20 30 40
pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVM
..: ::::::: :::.::: ::. .::.::
NP_003 QKQKSRRIEKVLEWLFISQEQPKITKSWGPLSFMDVFVDFTWEEWQLLDPAQKCLYRSVM
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pF1KB4 LENYKNLVSLGYQLTKPDVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIF
::::.:::::::: ::::.:..::.::: .:. .. ..: :. :...: . .. ..
NP_003 LENYSNLVSLGYQHTKPDIIFKLEQGEELCMVQAQVPNQTCPN--TVWKIDDLMDWHQEN
120 130 140 150 160
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pF1KB4 KDKQSCDIK-MEGMARNDL-----WYLSLEEVWKCRDQ----------LDKYQENP---E
::: . : .: . . : ::: .. :: . : ..:: .
NP_003 KDKLGSTAKSFECTTFGKLCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGFQ
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. .
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pF1KB4 HLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYS
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pF1KB4 TGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHREKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKP
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pF1KB4 SYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQ
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NP_001 IMHQRTHVDDKH
860
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pF1KB4 PAQLVLREYFHKRDS-HT-----KSLKHDLVLNGHQDSCASNS----NECGQTFCQNIHL
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XP_016 NPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPD--LNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSAL
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