Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4076
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4076, 573 aa
1>>>pF1KB4076 573 - 573 aa - 573 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4156+/-0.00198; mu= 9.9535+/- 0.118
mean_var=273.9599+/-52.120, 0's: 0 Z-trim(104.2): 981 B-trim: 51 in 1/50
Lambda= 0.077487
statistics sampled from 6723 (7798) to 6723 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 3.030
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1701 205.0 2.2e-52
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1657 200.1 6.3e-51
CCDS12496.1 ZNF790 gene_id:388536|Hs108|chr19 ( 636) 1634 197.6 4e-50
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CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1591 192.8 1.1e-48
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1591 192.8 1.2e-48
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1569 190.2 5.7e-48
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1557 188.8 1.3e-47
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 1544 187.4 3.9e-47
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CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1538 186.9 6.9e-47
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1538 186.9 7.1e-47
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 1534 186.3 8.4e-47
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 1534 186.3 8.6e-47
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 1516 184.2 3.3e-46
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CCDS32991.1 ZNF599 gene_id:148103|Hs108|chr19 ( 588) 1516 184.3 3.6e-46
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19 ( 792) 1517 184.6 3.9e-46
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1512 183.9 4.9e-46
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1506 183.6 1.1e-45
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1499 182.5 1.4e-45
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1467 178.8 1.5e-44
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1465 178.5 1.7e-44
CCDS12847.1 ZNF614 gene_id:80110|Hs108|chr19 ( 585) 1466 178.7 1.7e-44
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1467 178.9 1.7e-44
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1461 178.2 2.5e-44
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1461 178.2 2.6e-44
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1461 178.2 2.6e-44
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1460 178.2 3.1e-44
CCDS56110.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 ( 574) 1453 177.3 4.6e-44
CCDS12964.1 ZNF587 gene_id:84914|Hs108|chr19 ( 575) 1453 177.3 4.6e-44
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 1451 177.0 5.4e-44
CCDS4438.1 ZNF354A gene_id:6940|Hs108|chr5 ( 605) 1451 177.1 5.6e-44
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1449 176.9 6.6e-44
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1449 176.9 6.7e-44
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1449 177.0 7.1e-44
CCDS74469.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 574) 1441 175.9 1.2e-43
CCDS12965.1 ZNF417 gene_id:147687|Hs108|chr19 ( 575) 1441 175.9 1.2e-43
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1438 175.5 1.3e-43
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1437 175.4 1.5e-43
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1439 175.9 1.6e-43
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1439 175.9 1.7e-43
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1439 175.9 1.7e-43
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1437 175.6 1.7e-43
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1434 175.2 2e-43
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1434 175.3 2.2e-43
>>CCDS9283.1 ZNF10 gene_id:7556|Hs108|chr12 (573 aa)
initn: 4039 init1: 4039 opt: 4039 Z-score: 2466.9 bits: 466.4 E(32554): 4.4e-131
Smith-Waterman score: 4039; 100.0% identity (100.0% similar) in 573 aa overlap (1-573:1-573)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQSCDIKMEGMARND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 DVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQSCDIKMEGMARND
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVAFTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVAFTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQDSCASNSNECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 LREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNGHQDSCASNSNECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PDNDNSLTHGSSLGISKGIHREKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 PDNDNSLTHGSSLGISKGIHREKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 SSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 VVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQ
430 440 450 460 470 480
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pF1KB4 RIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 RIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHT
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550 560 570
pF1KB4 GEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS92 GEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
550 560 570
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 6767 init1: 1415 opt: 1808 Z-score: 1118.4 bits: 217.0 E(32554): 5.7e-56
Smith-Waterman score: 1812; 49.0% identity (70.1% similar) in 576 aa overlap (14-573:14-578)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVMLENYKNLVSLGYQLTKP
:::.:: : :..::: : ::. .::.:::.... :::.:. : ::
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pF1KB4 DVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDSETAFEIKSSVSSRSIFKDKQSCDIKMEGMARND
.:: ::. : : :: .. : ..:: :: ..: :: ...: .. .. : .: . .
CCDS74 NVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPDLETRPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDG
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130 140 150 160 170
pF1KB4 LWYLSLEEV-----WKCRDQLDKYQENPERHLRQVAFTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLL
::: :.. :.: :. : :::: :. . :. ...: .: : :
CCDS74 LWYCRGEDTEGHWEWSC--------ESLESLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNG-FGENISL
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pF1KB4 PAQLVLREYFHKRDS-HT-----KSLKHDLVLNGHQDSCASNS----NECGQTFCQNIHL
.: . . .:.: :: : : : :: : .:.... .:::..: .. :
CCDS74 NPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPD--LNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSAL
180 190 200 210 220
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pF1KB4 IQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYECKECGKFFSWRSNLTRHQ
:. :::::.. :.: . ... ..:.: . :: ::::.: .::. :. . : .::
CCDS74 IEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQ
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pF1KB4 LIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGKSFSWFSHLVTHQRTHT
:::::::::.::::::: : . :..:::::.::::.::::.: ::. : : ::
CCDS74 RTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHT
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pF1KB4 GDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQSTHLILHQRTHVRVRP
:.: : :..:::.: ::: : .::: ::::::::: ::::.: : : :: :::::. .:
CCDS74 GEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKP
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pF1KB4 YECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHLYSHQRTHTGEKPYECH
:::.::::..:: . :. :.::::: ::. :..::: ::.:: : .:.:::::::::::
CCDS74 YECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECS
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pF1KB4 DCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQRIHVGEETYKCNQCGI
.:::.: ::. : ::::::::::::: .::::: ....: ::::::.::. :.:::::
CCDS74 QCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGR
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570
pF1KB4 IFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
::: .:.: :: ::::. ::::: :. ..: :: .: : .:. :
CCDS74 AFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSH
530 540 550 560 570 580
CCDS74 SSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSL
590 600 610 620 630 640
>>CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 (644 aa)
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Smith-Waterman score: 1737; 45.6% identity (71.0% similar) in 575 aa overlap (14-573:48-614)
10 20 30 40
pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVM
:::::: ::.:.:::. . ::. .::.::
CCDS42 LSHMMERKAWCSQESALSEEEEDTTRPLETVTFKDVAVDLTQEEWEQMKPAQRNLYRDVM
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90
pF1KB4 LENYKNLVSLGYQLTKPDVILRLEKGEEPWLVEREIHQETHPDS-ETAFEIK--------
::::.:::..: :.::::::..::. ::::..:.:. . :. :. .::
CCDS42 LENYSNLVTVGCQVTKPDVIFKLEQEEEPWVMEEEMFGRHCPEVWEVDEQIKKQQETLVR
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 --SSVSSRSIFKDKQ-SCDIKMEGMARNDLWYLSLEEVWKCRDQLDKYQENPERHLRQVA
.:.:.. ..:.: : . . .. : . . : :.::: :. ::
CCDS42 KVTSISKKILIKEKVIECKKVAKIFPLSSDIVTSRQSFYDC-DSLDKGLEHNLDLLRY--
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200
pF1KB4 FTQKKVLTQERVSESGKYGGNCLLPAQLVLREYFHKRDSHTKSLKHDLVLNG--HQDSCA
.: . ... .: :: .: :. :. . .. .. : : ::. . :
CCDS42 --EKGCVREKQSNEFGKPFYHC---ASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGEKP
200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 SNSNECGQTFCQNIHLIQFARTHTGDKSYKCPDNDNSLTHGSSLGISKGIHR-EKPYECK
. .:::..: .. .:: . :::.: ::: . ... . :.: . :: :::: ::
CCDS42 YECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACK
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 ECGKFFSWRSNLTRHQLIHTGEKPYECKECGKSFSRSSHLIGHQKTHTGEEPYECKECGK
.: : :: .::: .:. ::::::::::::::::::....:: :.: ::::.:: :.:::.
CCDS42 DCWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGR
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 SFSWFSHLVTHQRTHTGDKLYTCNQCGKSFVHSSRLIRHQRTHTGEKPYECPECGKSFRQ
.:: .: .. :.:.:::.: : ::.:::.: . : .: :.:.::::::: : ::::.: :
CCDS42 AFSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQ
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 STHLILHQRTHVRVRPYECNECGKSYSQRSHLVVHHRIHTGLKPFECKDCGKCFSRSSHL
:. : .:.:.:. .::::.::::..:.. .:..:..:::: ::.::..::: : . :.:
CCDS42 SSSLTVHMRNHTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSNL
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 YSHQRTHTGEKPYECHDCGKSFSQSSALIVHQRIHTGEKPYECCQCGKAFIRKNDLIKHQ
::: ::::::: : :::.:::.: : :..::::::::.: :::::: ....:..:.
CCDS42 IRHQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHE
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 RIHVGEETYKCNQCGIIFSQNSPFIVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHI
.::.::. .:::.:: ::. : . .: .::::. ::.:: :. . : :: .. .:
CCDS42 KIHTGEKPFKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRSHT
550 560 570 580 590 600
570
pF1KB4 RENAY
:. .
CCDS42 GEKPFECNECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
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>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
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CCDS12 EAFSLLEKGKEPWKILRDETRGPCPDMQSRCQTKKLLPKNGIF-EREIAQLEIMRICKNH
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CCDS12 SLDCLCFRGDWEGNTQFQTLQDNQEECFKQVIRTCEKRPTFNQHTVFNLHQRLNTGDKLN
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CCDS12 EFKELGKAFISGSD-HT---QHQLI---HTSEKFCGDKECGNTFLPDSEVIQYQTVHTVK
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CCDS12 CKECGKAFSCGSDLTRHQRIHTGEKPYECNECRKAFSQRSHLIKHQRIHTGEKPYECKEC
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. ::.:::::. ::: .:::.:.: ..: .::.::.:.. :.:..:: : .: .
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CCDS12 NSANLCEWTDYGNTFSHESNFAQHQNIYTFEKSYEFKDFEKAFSSSSHFISLL
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pF1KB4 MDAKSLTAWSRTLVTFKDVFVDFTREEWKLLDTAQQIVYRNVM
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CCDS45 LENYSNLVSLGYQHTKPDIIFKLEQGEELCMVQAQVPNQTCPN--TVWKIDDLMDWHQEN
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CCDS45 KDKLGSTAKSFECTTFGKLCLLSTKYLSRQKPHKCGTHGKSLKYIDFTSDYARNNPNGFQ
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CCDS45 VHGKSFFHSKHEQTVIGIKYCESIESGKTVNKKSQLMCQQMYMGEKPFGCSCCEKAFSSK
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CCDS45 SYLLVHQQTHAEEKPYGCNECGKDFSSKSYLIVHQRIHTGEKLHECSECRKTFSFHSQLV
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CCDS45 IHQRIHTGENPYECCECGKVFSRKDQLVSHQKTHSGQKPYVCNECGKAFGLKSQLIIHER
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CCDS45 IHTGEKPYECNECQKAFNTKSNLMVHQRTHTGEKPYVCSDCGKAFTFKSQLIVHQGIHTG
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::..::: :: .:.: ::: ::::.:::::.:::.::.. :: ::: :.::::::: .
CCDS45 ECNNCGKAFSFKSQLIIHQRIHTGENPYECHECGKAFSRKYQLISHQRTHAGEKPYECTD
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.. :.:: .. :
CCDS45 FTFKSQLIVHKGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKPYGCSECGKAFRSK
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CCDS45 GEKPYSCNECGKAFTFKSQLIVHKGVHTGVKPYGCSQCAKTFSLKSQLIVHQRSHTGVKP
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CCDS45 YGCSECGKAFRSKSYLIIHMRTHTGEKPHECRECGKSFSFNSQLIVHQRIHTGENPYECS
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CCDS45 AFIWKSLLIVHERTHAGVNPYKCSQCEKSFSGKLRLLVHQRMHTREKPYECSECGKAFIR
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CCDS45 NSQLIVHQRTHSGEKPYGCNECGKTFSQKSILSAHQRTHTGEKPCKCTECGKAFCWKSQL
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pF1KB4 IVHQIAHTGEQFLTCNQCGTALVNTSNLIGYQTNHIRENAY
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CCDS45 IMHQRTHVDDKH
940
>>CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 (659 aa)
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CCDS47 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKP
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CCDS47 DVISKLEQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEERE
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CCDS47 YISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKLEKT-HPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIR
120 130 140 150 160 170
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]