Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3849
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3849, 923 aa
1>>>pF1KB3849 923 - 923 aa - 923 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4944+/-0.00099; mu= 15.2615+/- 0.059
mean_var=86.6366+/-17.542, 0's: 0 Z-trim(106.4): 196 B-trim: 21 in 1/48
Lambda= 0.137792
statistics sampled from 8765 (8965) to 8765 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.64), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 3.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75339.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 923) 6043 1211.8 0
CCDS75340.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 818) 5201 1044.4 0
CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 923) 5195 1043.3 0
CCDS54929.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 930) 4563 917.6 0
CCDS54923.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 927) 4414 888.0 0
CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 931) 4388 882.8 0
CCDS75337.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 803) 4368 878.8 0
CCDS47293.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 929) 4357 876.7 0
CCDS58980.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 929) 4288 863.0 0
CCDS75342.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 820) 3738 753.6 3.4e-217
CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 810) 3593 724.8 1.6e-208
CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 3586 723.4 4.2e-208
CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 808) 3536 713.5 4.1e-205
CCDS75334.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 814) 3468 699.9 4.9e-201
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 3138 634.4 3.1e-181
CCDS54922.1 PCDHGA1 gene_id:56114|Hs108|chr5 ( 931) 3113 629.4 9.6e-180
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 3106 628.0 2.5e-179
CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 932) 3092 625.2 1.7e-178
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 3088 624.4 3e-178
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 3075 621.8 1.8e-177
CCDS47290.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 932) 3043 615.5 1.5e-175
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 3020 610.9 3.6e-174
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 2995 605.9 1.1e-172
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 2992 605.3 1.7e-172
CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 932) 2986 604.1 3.8e-172
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 2982 603.3 6.7e-172
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 2333 474.3 4e-133
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 2292 466.2 1.2e-130
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 2283 464.4 4e-130
CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 828) 2276 463.0 1.1e-129
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 2271 462.0 2.1e-129
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 829) 2239 455.6 1.7e-127
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 2210 449.9 9.7e-126
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 2191 446.1 1.3e-124
CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 820) 2187 445.3 2.2e-124
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 2166 441.1 4e-123
CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 ( 795) 2130 433.9 5.6e-121
CCDS4244.1 PCDHB2 gene_id:56133|Hs108|chr5 ( 798) 2130 433.9 5.6e-121
CCDS4250.1 PCDHB8 gene_id:56128|Hs108|chr5 ( 801) 2127 433.4 8.5e-121
CCDS4255.1 PCDHB13 gene_id:56123|Hs108|chr5 ( 798) 2120 432.0 2.2e-120
CCDS75328.1 PCDHB9 gene_id:56127|Hs108|chr5 ( 797) 2116 431.2 3.8e-120
CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 ( 776) 2115 431.0 4.3e-120
CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 ( 798) 2113 430.6 5.8e-120
CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 ( 787) 2110 430.0 8.7e-120
CCDS4248.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 794) 2107 429.4 1.3e-119
CCDS4249.1 PCDHB7 gene_id:56129|Hs108|chr5 ( 793) 2104 428.8 2e-119
CCDS4246.1 PCDHB4 gene_id:56131|Hs108|chr5 ( 795) 2091 426.2 1.2e-118
CCDS4245.1 PCDHB3 gene_id:56132|Hs108|chr5 ( 796) 2090 426.0 1.4e-118
CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 ( 797) 2078 423.6 7.2e-118
CCDS4252.1 PCDHB10 gene_id:56126|Hs108|chr5 ( 800) 2070 422.0 2.2e-117
>>CCDS75339.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 (923 aa)
initn: 6043 init1: 6043 opt: 6043 Z-score: 6488.4 bits: 1211.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6043; 100.0% identity (100.0% similar) in 923 aa overlap (1-923:1-923)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGSGAGELGRAERLPVLFLFLLSLFCPALCEQIRYRIPEEMPKGSVVGNLATDLGFSVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MGSGAGELGRAERLPVLFLFLLSLFCPALCEQIRYRIPEEMPKGSVVGNLATDLGFSVQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LPTRKLRVSSEKPYFTVSAESGELLVSSRLDREEICGKKPACALEFEAVAENPLNFYHVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LPTRKLRVSSEKPYFTVSAESGELLVSSRLDREEICGKKPACALEFEAVAENPLNFYHVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILEVAEDADIGLNSLQKYKLSLNPSFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILEVAEDADIGLNSLQKYKLSLNPSFSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFYRTGQIFSLNSKSGEITTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFYRTGQIFSLNSKSGEITTQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 KKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENAVPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENAVPGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNVTITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNVTITA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TDRGKPPLSSSISVILHIRDVNDNAPVFHQASYLVSVPENNPPGASIAQVCASDLDLGLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TDRGKPPLSSSISVILHIRDVNDNAPVFHQASYLVSVPENNPPGASIAQVCASDLDLGLN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GQVSYSIMASDLEPLALASYVSMSAQSGVVFAQRAFDYEQLRTFELTLQARDQGSPALSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GQVSYSIMASDLEPLALASYVSMSAQSGVVFAQRAFDYEQLRTFELTLQARDQGSPALSA
490 500 510 520 530 540
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pF1KB3 NVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGHNAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGHNAWL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 SYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATLHLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATLHLVF
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670 680 690 700 710 720
pF1KB3 ADSLQEVLPDITDRPVPSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAVALRLRRSSSPAAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ADSLQEVLPDITDRPVPSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAVALRLRRSSSPAAW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 SCFQPGLCVKSGPVVPPNYSQGTLPYSYNLCVAHTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDILCGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SCFQPGLCVKSGPVVPPNYSQGTLPYSYNLCVAHTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDILCGDS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 SGALFPLCNSSESTSHPELQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SGALFPLCNSSESTSHPELQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 AMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSNATLTNAAG
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KB3 KRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
:::::::::::::::::::::::
CCDS75 KRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
910 920
>>CCDS75340.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 (818 aa)
initn: 5201 init1: 5201 opt: 5201 Z-score: 5584.6 bits: 1044.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5201; 100.0% identity (100.0% similar) in 799 aa overlap (1-799:1-799)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGSGAGELGRAERLPVLFLFLLSLFCPALCEQIRYRIPEEMPKGSVVGNLATDLGFSVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MGSGAGELGRAERLPVLFLFLLSLFCPALCEQIRYRIPEEMPKGSVVGNLATDLGFSVQE
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 LPTRKLRVSSEKPYFTVSAESGELLVSSRLDREEICGKKPACALEFEAVAENPLNFYHVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LPTRKLRVSSEKPYFTVSAESGELLVSSRLDREEICGKKPACALEFEAVAENPLNFYHVN
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pF1KB3 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILEVAEDADIGLNSLQKYKLSLNPSFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILEVAEDADIGLNSLQKYKLSLNPSFSL
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pF1KB3 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
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pF1KB3 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFYRTGQIFSLNSKSGEITTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFYRTGQIFSLNSKSGEITTQ
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pF1KB3 KKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENAVPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENAVPGT
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pF1KB3 LIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNVTITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNVTITA
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pF1KB3 TDRGKPPLSSSISVILHIRDVNDNAPVFHQASYLVSVPENNPPGASIAQVCASDLDLGLN
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pF1KB3 GQVSYSIMASDLEPLALASYVSMSAQSGVVFAQRAFDYEQLRTFELTLQARDQGSPALSA
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CCDS75 GQVSYSIMASDLEPLALASYVSMSAQSGVVFAQRAFDYEQLRTFELTLQARDQGSPALSA
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pF1KB3 NVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGHNAWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGHNAWL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 SYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATLHLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATLHLVF
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pF1KB3 ADSLQEVLPDITDRPVPSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAVALRLRRSSSPAAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ADSLQEVLPDITDRPVPSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAVALRLRRSSSPAAW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 SCFQPGLCVKSGPVVPPNYSQGTLPYSYNLCVAHTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDILCGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SCFQPGLCVKSGPVVPPNYSQGTLPYSYNLCVAHTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDILCGDS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 SGALFPLCNSSESTSHPELQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEMLQ
:::::::::::::::::::
CCDS75 SGALFPLCNSSESTSHPELVSFIYVYSFSLPTQFSVFT
790 800 810
>>CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 (923 aa)
initn: 2818 init1: 2818 opt: 5195 Z-score: 5577.3 bits: 1043.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5195; 85.6% identity (94.6% similar) in 925 aa overlap (1-923:1-923)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGSGAGELGRAERLPVLFLFLLSLFCPALCEQIRYRIPEEMPKGSVVGNLATDLGFSVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGSGAGELGRAERLPVLFLFLLSLFCPALCEQIRYRIPEEMPKGSVVGNLATDLGFSVQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LPTRKLRVSSEKPYFTVSAESGELLVSSRLDREEICGKKPACALEFEAVAENPLNFYHVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPTRKLRVSSEKPYFTVSAESGELLVSSRLDREEICGKKPACALEFEAVAENPLNFYHVN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILEVAEDADIGLNSLQKYKLSLNPSFSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::::: :.::.:.:: . :::
CCDS54 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILGSAHDADIGSNTLQNYQLSPSDHFSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
: :::.:::::::..:. ::::.:. ..:.::::: : ::::.:..... ::::::: :
CCDS54 INKEKSDGSKYPEMVLKTPLDREKQKSYHLTLTALDFGAPPLSSTAQIHVLVTDANDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB3 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFYRTGQI--FSLNSKSGEIT
::..::::::: ::: ::::::::.:::::::.:.:::.:: ...:: :.:::..::::
CCDS54 VFSQDVYRVSLSENVYPGTTVLQVTATDQDEGVNAEITFSFSEASQITQFDLNSNTGEIT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 TQKKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENAVP
. . :::::.::::.:.:.:::::..::::::... :::::.::: :.:: ..:.:.:
CCDS54 VLNTLDFEEVKEYSIVLEARDGGGMIAQCTVEVEVIDENDNAPEVIFQSLPNLIMEDAEL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 GTLIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNVTI
:: :::.:..:.:: .::::.:.:.:.:::::..::.:.::::::..:::::.::::.:.
CCDS54 GTHIALLKVRDKDSRHNGEVTCKLEGDVPFKILTSSRNTYKLVTDAVLDREQNPEYNITV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 TATDRGKPPLSSSISVILHIRDVNDNAPVFHQASYLVSVPENNPPGASIAQVCASDLDLG
::::::::::::: :. ::: ::::::::: :.::.: : :::::::::.:: ::: :::
CCDS54 TATDRGKPPLSSSSSITLHIGDVNDNAPVFSQSSYIVHVAENNPPGASISQVRASDPDLG
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 LNGQVSYSIMASDLEPLALASYVSMSAQSGVVFAQRAFDYEQLRTFELTLQARDQGSPAL
:::::: ::::::: :.::::.::.:::::::::::.::::.:::::::::::::::
CCDS54 PNGQVSYCIMASDLEQRELSSYVSISAESGVVFAQRAFDHEQLRAFELTLQARDQGSPAL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 SANVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGHNA
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS54 SANVSLRVLVDDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPHAAEPGYLVTKVVAVDADSGHNA
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pF1KB3 WLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATLHL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAVRQRLLVAVRDGGQPPLSATATLHL
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660 670 680 690 700 710
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::::::::::::::::: ::: ::::::::::::::::::::.:.:::.:::::::::::
CCDS54 VFADSLQEVLPDITDRPDPSDLQAELQFYLVVALALISVLFLVAMILAIALRLRRSSSPA
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.:::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SWSCFQPGLCVKSESVVPPNYSEGTLPYSYNLCVAHTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDILCG
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:::::::::::::: ::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSSGALFPLCNSSELTSHQ--QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSNATLTNA
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900 910 920
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:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
900 910 920
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. .::::::.:: .:.:.::::.:::..:.:::.:: .. : :..:::.:::::..::
CCDS54 VSARKLRVSAEKLHFSVDAESGDLLVKNRIDREQICKERRRCELQLEAVVENPLNIFHVI
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILEVAEDADIGLNSLQKYKLSLNPSFSL
: :::.:::.:.: .. ..:.: :::. :::. :. : : ::..::.. ::.. :: :::
CCDS54 VVIEDVNDHAPQFDKKEIHLEIFESASAGTRLSLDPATDPDININSIKDYKINSNPYFSL
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pF1KB3 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
... ..::.:::::.::: ::::.: : :.::::::: :: :.:....:.: :.:::::
CCDS54 MVRVNSDGGKYPELSLEKLLDREEQRSHSLILTALDGGDPPRSATAHIEISVKDTNDNPP
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pF1KB3 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFYRTGQ----IFSLNSKSGE
::.:: ::.:: ::.:::. ::::.:::::::.:.::.: : :.: .:::. :.:
CCDS54 VFSRDEYRISLSENLPPGSPVLQVTATDQDEGVNAEINYYFRSTAQSTKHMFSLDEKTGM
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pF1KB3 ITTQKKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENA
: .....:::....:.: ::..::::: .:: : :.: ::::::::. . :: ..::::.
CCDS54 IKNNQSFDFEDVERYTMEVEAKDGGGLSTQCKVIIEILDENDNSPEIIITSLSDQILENS
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pF1KB3 VPGTLIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNV
:: ..::.: .: : : :::: :... ..:::: :::.: :::::::.:::::::::::
CCDS54 PPGMVVALFKTRDLDFGGNGEVRCNIETDIPFKIYSSSNNYYKLVTDGALDREQTPEYNV
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pF1KB3 TITATDRGKPPLSSSISVILHIRDVNDNAPVFHQASYLVSVPENNPPGASIAQVCASDLD
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CCDS54 TIVATDRGKPPLSSSRSITLYVADINDNAPVFDQTSYVVHVAENNPPGASIAQVSASDPD
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:::::..::::.::::::::..::::.::::::::::::::.::::.: :::::::.:::
CCDS54 LGLNGHISYSIVASDLEPLAVSSYVSVSAQSGVVFAQRAFDHEQLRAFALTLQARDHGSP
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.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 TLSANVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSAFFDMVPRSAEPGYLVTKVVAVDADSGH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NAWLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATL
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pF1KB3 HLVFADSLQEVLPDITDRPVPSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAVALRLRRSSS
::::::.:::.:::..:::: :::::::::::::::::::::::::::::.::::::: :
CCDS54 HLVFADNLQEILPDLSDRPVLSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAIALRLRRSLS
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pF1KB3 PAAWSCFQPGLCVKSGPVVPPNYSQGTLPYSYNLCVAHTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDIL
::.:.::.::::::::::::::::.::::::::::.:::: :::::::: : :..:..
CCDS54 PATWDCFHPGLCVKSGPVVPPNYSEGTLPYSYNLCIAHTGTKEFNFLKCSVPLHSNEDMV
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pF1KB3 CGDSSGALFPLCNSSESTSHPEL---QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQ
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CCDS54 CSVSPGALIPPHGGEDLTSHPETLTSQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQ
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pF1KB3 FDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSNA
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900 910 920
pF1KB3 TLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
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CCDS54 LPTRKLRVSAED-YFNVSLESGDLLVNGRIDREKICGRKLECALEFETVAENPMNVFHVV
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CCDS54 VVIQDINDNAPRFVAKGIDLEICESALPGVKFSLDSAQDADVEGNSLKLYTINPNQYFSL
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pF1KB3 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
::. :::::: : ::: ::::.:: :::.:::.::: :::::::.. :.::::::: :
CCDS54 STKESPDGSKYPVLLLEKPLDREHQSSHRLILTAMDGGDPPLSGTTHIWIRVTDANDNAP
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pF1KB3 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFYRTG---QIFSLNSKSGEI
::...::::::.:::: ::.::.: :::::::::.::::.: . ..:.:: ..:.:
CCDS54 VFSQEVYRVSLQENVPWGTSVLRVMATDQDEGINAEITYAFLNSPISTSLFNLNPNTGDI
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pF1KB3 TTQKKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENAV
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CCDS54 TTNGTLDFEETSRYVLSVEAKDGGVHTAHCNVQIEIVDENDNAPEVTFMSFSNQIPEDSD
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pF1KB3 PGTLIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNVT
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CCDS54 LGTVIALIKVRDKDSGQNGMVTCYTQEEVPFKLESTSKNYYKLVIAGALNREQTADYNVT
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pF1KB3 ITATDRGKPPLSSSISVILHIRDVNDNAPVFHQASYLVSVPENNPPGASIAQVCASDLDL
: :::.::: ::: :. ::: :.::::::::::::.: : :::::::::::: ::: ::
CCDS54 IIATDKGKPALSSRTSITLHISDINDNAPVFHQASYVVHVSENNPPGASIAQVSASDPDL
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pF1KB3 GLNGQVSYSIMASDLEPLALASYVSMSAQSGVVFAQRAFDYEQLRTFELTLQARDQGSPA
: ::.:::::.:::::: : ::::.: ::::::::::::.::::.::::::::::::::
CCDS54 GPNGRVSYSILASDLEPRELLSYVSVSPQSGVVFAQRAFDHEQLRAFELTLQARDQGSPA
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pF1KB3 LSANVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGHN
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSANVSLRVLVGDLNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGHN
540 550 560 570 580 590
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pF1KB3 AWLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AWLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATLH
600 610 620 630 640 650
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pF1KB3 LVFADSLQEVLPDITDRPVPSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAVALRLRRSSSP
:.:::::::::::..::: :::::.::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS54 LIFADSLQEVLPDLSDRPEPSDPQTELQFYLVVALALISVLFLLAVILAIALRLRRSSSL
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pF1KB3 AAWSCFQPGLCVKSGPVVPPNYSQGTLPYSYNLCVA-HTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDIL
. .::: ::: :::: ::::.:.::::::::::.: :..::::: :. . ... ::.:
CCDS54 DTEGCFQTGLCSKSGPGVPPNHSEGTLPYSYNLCIASHSAKTEFNSLNLTPEMAPPQDLL
720 730 740 750 760 770
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pF1KB3 CGDSSGALFPLCNSSESTS---HPEL---QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWP
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CCDS54 CDDPSMVV---CASNEDHKIAYDPSLSSHQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWP
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pF1KB3 NNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPG
840 850 860 870 880 890
900 910 920
pF1KB3 SNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
900 910 920
>>CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 (931 aa)
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pF1KB3 MGSGAGELGRAERLPVLFLFLLSLFCPALCEQIRYRIPEEMPKGSVVGNLATDLGFSVQE
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CCDS54 MKASSGRCGLVRWLQVLLPFLLSLFPGALPVQIRYSIPEELAKNSVVGNLAKDLGLSVRD
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 LPTRKLRVSSEKPYFTVSAESGELLVSSRLDREEICGKKPACALEFEAVAENPLNFYHVN
::.::::::.:: ::::. :::.::::.:.:::.::::.: :.:.:..:::::::....
CCDS54 LPARKLRVSAEKEYFTVNPESGDLLVSDRIDREQICGKQPLCVLDFDTVAENPLNIFYIA
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILEVAEDADIGLNSLQKYKLSLNPSFSL
: ..::::.:: : :....:.:.::..::: : :. : :.:.: ::::.:.:. : :.:
CCDS54 VIVQDINDNTPLFKQTKINLKIGESTKPGTTFPLDPALDSDVGPNSLQRYHLNDNEYFDL
130 140 150 160 170 180
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pF1KB3 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
:. :: ::::: :...::::..: :.:::::.::: :: ::::..::.:::::::::
CCDS54 AEKQTPDGRKYPELILKHSLDREEHSLHQLVLTAVDGGDPPQSGTTQIRIKVTDANDNPP
190 200 210 220 230 240
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pF1KB3 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFYRTGQ----IFSLNSKSGE
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CCDS54 VFSQDVYRVTLREDVPPGFFVLQVTATDRDEGINAEITYSFHNVDEQVKHFFNLNEKTGE
250 260 270 280 290 300
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pF1KB3 ITTQKKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENA
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CCDS54 ITTKDDLDFEIASSYTLSIEAKDPGDLAAHCSIQVEILDDNDCAPEVIVTSVSTPLPEDS
310 320 330 340 350 360
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pF1KB3 VPGTLIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNV
:::.::::: .:.:::::::: ::. :.. : . ::::: :::::::.::::. ::::.
CCDS54 PPGTVIALIKTRDRDSGENGEVYCQVLGNAKFILKSSSKNYYKLVTDGALDREEIPEYNL
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pF1KB3 TITATDRGKPPLSSSISVILHIRDVNDNAPVFHQASYLVSVPENNPPGASIAQVCASDLD
:::::: ::::::::: : ::: :::::::::.:.::.: : :::::::::::. ::: :
CCDS54 TITATDGGKPPLSSSIIVTLHISDVNDNAPVFQQTSYMVHVAENNPPGASIAQISASDPD
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pF1KB3 LGLNGQVSYSIMASDLEPLALASYVSMSAQSGVVFAQRAFDYEQLRTFELTLQARDQGSP
:: .:::::::.::::.: . ::::.::::::::::::::.::::.:::::::::::::
CCDS54 LGPSGQVSYSIVASDLKPREILSYVSVSAQSGVVFAQRAFDHEQLRAFELTLQARDQGSP
490 500 510 520 530 540
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pF1KB3 ALSANVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGH
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ALSANVSLRVLVGDLNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGH
550 560 570 580 590 600
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pF1KB3 NAWLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NAWLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATL
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 HLVFADSLQEVLPDITDRPVPSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAVALRLRRSSS
::.:::::::::::..:: ::::::.::::::::::::::::.::::::..:::: ::
CCDS54 HLIFADSLQEVLPDLSDRREPSDPQAKLQFYLVVALALISVLFFLAVILAISLRLRLSSR
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 PAAWSCFQPGLCVKSGPVVPPNYSQGTLPYSYNLCVA-HTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDI
::.:::::: : :: : ::::.:::::::::::: ...:::::::. . .: .::.
CCDS54 SDAWDCFQPGLSSKPGPGVLPNYSEGTLPYSYNLCVASQSAKTEFNFLNITPELVPAQDL
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820
pF1KB3 LCGDSS-------GAL-FPLCNSSESTSHPELQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTG
.: ..: :: :. .:.. . ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VCDNASWEQNTNHGAAGVPF--ASDTILK---QAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTG
790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB3 TWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TWPNNQFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVY
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890 900 910 920
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IPGSNATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MGSGAGELGRAERLPVLFLFLLSLFCPALCEQIRYRIPEEMPKGSVVGNLATDLGFSVQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LPTRKLRVSSEKPYFTVSAESGELLVSSRLDREEICGKKPACALEFEAVAENPLNFYHVN
70 80 90 100 110 120
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:::::::::::::::::::::::::::::::::: :.::::: :.::.:.:: . :::
CCDS75 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILGSAHDADIGSNTLQNYQLSPSDHFSL
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pF1KB3 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
: :::.:::::::..:. ::::.:. ..:.::::: : ::::.:..... ::::::: :
CCDS75 INKEKSDGSKYPEMVLKTPLDREKQKSYHLTLTALDFGAPPLSSTAQIHVLVTDANDNAP
190 200 210 220 230 240
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pF1KB3 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFYRTGQI--FSLNSKSGEIT
::..::::::: ::: ::::::::.:::::::.:.:::.:: ...:: :.:::..::::
CCDS75 VFSQDVYRVSLSENVYPGTTVLQVTATDQDEGVNAEITFSFSEASQITQFDLNSNTGEIT
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pF1KB3 TQKKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENAVP
. . :::::.::::.:.:.:::::..::::::... :::::.::: :.:: ..:.:.:
CCDS75 VLNTLDFEEVKEYSIVLEARDGGGMIAQCTVEVEVIDENDNAPEVIFQSLPNLIMEDAEL
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360 370 380 390 400 410
pF1KB3 GTLIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNVTI
:: :::.:..:.:: .::::.:.:.:.:::::..::.:.::::::..:::::.::::.:.
CCDS75 GTHIALLKVRDKDSRHNGEVTCKLEGDVPFKILTSSRNTYKLVTDAVLDREQNPEYNITV
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pF1KB3 TATDRGKPPLSSSISVILHIRDVNDNAPVFHQASYLVSVPENNPPGASIAQVCASDLDLG
::::::::::::: :. ::: ::::::::: :.::.: : :::::::::.:: ::: :::
CCDS75 TATDRGKPPLSSSSSITLHIGDVNDNAPVFSQSSYIVHVAENNPPGASISQVRASDPDLG
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pF1KB3 LNGQVSYSIMASDLEPLALASYVSMSAQSGVVFAQRAFDYEQLRTFELTLQARDQGSPAL
:::::: ::::::: :.::::.::.:::::::::::.::::.:::::::::::::::
CCDS75 PNGQVSYCIMASDLEQRELSSYVSISAESGVVFAQRAFDHEQLRAFELTLQARDQGSPAL
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pF1KB3 SANVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGHNA
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS75 SANVSLRVLVDDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPHAAEPGYLVTKVVAVDADSGHNA
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pF1KB3 WLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATLHL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAVRQRLLVAVRDGGQPPLSATATLHL
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pF1KB3 VFADSLQEVLPDITDRPVPSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAVALRLRRSSSPA
::::::::::::::::: ::: ::::::::::::::::::::.:.:::.:::::::::::
CCDS75 VFADSLQEVLPDITDRPDPSDLQAELQFYLVVALALISVLFLVAMILAIALRLRRSSSPA
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720 730 740 750 760 770
pF1KB3 AWSCFQPGLCVKSGPVVPPNYSQGTLPYSYNLCVAHTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDILCG
.:::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SWSCFQPGLCVKSESVVPPNYSEGTLPYSYNLCVAHTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDILCG
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pF1KB3 DSSGALFPLCNSSESTSHPELQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQFDTEM
:::::::::::::: :::
CCDS75 DSSGALFPLCNSSELTSHQVSFL
790 800
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. .:.::::.:: .:.:.:.::.:::..:.:::.:: .. : :..:::.:::::..::
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70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILEVAEDADIGLNSLQKYKLSLNPSFSL
: :::.:::.:.: .. ..:.::::.. : ::: ::: ::..:::.::.:: : :::
CCDS47 VVIEDVNDHAPQFRKDEINLEISESVSLGMGTILESAEDPDISMNSLSKYQLSPNEYFSL
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pF1KB3 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
. :.. ::.:::::.:.:::::: :: :.::::::::: :: :::...:: : :::::::
CCDS47 VEKDNPDGGKYPELVLQKTLDRETQSAHHLVLTALDGGDPPRSGTAQIRILVIDANDNPP
190 200 210 220 230 240
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pF1KB3 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFY----RTGQIFSLNSKSGE
::..:::::::::.:::::..:.:.::::::::::::::::. .. ..:::. .:.
CCDS47 VFSQDVYRVSLREDVPPGTSILRVKATDQDEGINSEITYSFFGVADKAQHVFSLDYTTGN
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pF1KB3 ITTQKKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENA
: ::. :::::...:.. .:..: :.: ..: : ... ::::::::. . :: ..:.:..
CCDS47 ILTQQPLDFEEVERYTINIEAKDRGSLSTRCKVIVEVVDENDNSPEIIITSLSDQIMEDS
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pF1KB3 VPGTLIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNV
::...::.: .:::::::::: :.:. ::::: :::.: :::::: .:::::::::::
CCDS47 PPGVVVALFKTRDQDSGENGEVRCSLSRGVPFKIHSSSNNYYKLVTDEALDREQTPEYNV
370 380 390 400 410 420
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pF1KB3 TITATDRGKPPLSSSISVILHIRDVNDNAPVFHQASYLVSVPENNPPGASIAQVCASDLD
::.:::::::::::: .. ::: ::::::::: :..::: ::::: :::::::: ::: :
CCDS47 TIAATDRGKPPLSSSKTITLHITDVNDNAPVFGQSAYLVHVPENNQPGASIAQVSASDPD
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pF1KB3 LGLNGQVSYSIMASDLEPLALASYVSMSAQSGVVFAQRAFDYEQLRTFELTLQARDQGSP
.::::.::::..::::: .:.::::.::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS47 FGLNGRVSYSLIASDLESRTLSSYVSVSAQSGVVFAQRAFDHEQLRTFELTLQARDQGSP
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pF1KB3 ALSANVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::::::::::::
CCDS47 ALSANVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDTVPRAAQPGYLVTKVVAVDADSGH
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pF1KB3 NAWLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATL
::::::::.:::::::::::::::::: .:::::.:..::::::::::::::::::::::
CCDS47 NAWLSYHVVQASEPGLFSLGLRTGEVRMVRALGDKDSVRQRLLVAVRDGGQPPLSATATL
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pF1KB3 HLVFADSLQEVLPDITDRPVPSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAVALRLRRSSS
::::::::::::::..:.:.::: :::.::::::::::::::::::::::.:::::.: :
CCDS47 HLVFADSLQEVLPDFSDHPTPSDSQAEMQFYLVVALALISVLFLLAVILAIALRLRQSFS
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pF1KB3 PAAWSCFQPGLCVKSGPVVPPNYSQGTLPYSYNLCV-AHTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDI
:.: .::. :: ::::: :::::.:::::.::.:: . . ::::. .. . ::
CCDS47 PTAGDCFESVLCSKSGPVGPPNYSEGTLPYAYNFCVPGDQMNPEFNFFTSVDHCPATQDN
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pF1KB3 LCGDSSGALFPLCNSSESTSHP-ELQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQF
: :: : : :. .. . :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LNKDSMLLASILTPSVEADKKILKQQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNNQF
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pF1KB3 DTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSNAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSNAT
850 860 870 880 890 900
900 910 920
pF1KB3 LTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
910 920
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pF1KB3 MGSGAGELGRAERLPVLFLFLLSLFCPALCEQIRYRIPEEMPKGSVVGNLATDLGFSVQE
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CCDS58 MGNSSGWRGPAGQRRMLFLFLLSLLDQALSEPIRYAIPEELDRGSLVGNLAKDLGFGVGD
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pF1KB3 LPTRKLRVSSEKPYFTVSAESGELLVSSRLDREEICGKKPACALEFEAVAENPLNFYHVN
::::.::: .:: .:::: :.:.::::.:.::::::::: .:.:::: :::.::::.::.
CCDS58 LPTRNLRVIAEKKFFTVSPENGNLLVSDRIDREEICGKKSTCVLEFEMVAEKPLNFFHVT
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CCDS58 VLIQDINDNPPTFSQNITELEISELALTGATFALESAQDPDVGVNSLQQYYLSPDPHFSL
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pF1KB3 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
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CCDS58 IQKENLDGSRYPELVLKAPLDREEQPHHHLVLTAVDGGEPSRSCTTQIRVIVADANDNPP
190 200 210 220 230 240
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pF1KB3 VFNRDVYRVSLRENVPPGTTVLQVSATDQDEGINSEITYSFYRTG----QIFSLNSKSGE
::..:.:::.. ::.: :..::.: : :.:::::.:: :.: : :.:.:.::.::
CCDS58 VFTQDMYRVNVAENLPAGSSVLKVMAIDMDEGINAEIIYAFINIGKEVRQLFKLDSKTGE
250 260 270 280 290 300
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pF1KB3 ITTQKKLDFEETKEYSMVVEGRDGGGLVAQCTVEINIQDENDNSPEVTFHSLLEMILENA
.:: .::::: :.. ::..::: .: : :.:.:.:::::.::.:. : . : :.:
CCDS58 LTTIGELDFEERDSYTIGVEAKDGGHHTAYCKVQIDISDENDNAPEITLASESQHIQEDA
310 320 330 340 350 360
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pF1KB3 VPGTLIALIKIHDQDSGENGEVNCQLQGEVPFKIISSSKNSYKLVTDGTLDREQTPEYNV
:: .:::: :: ::: :::. :::.:. ::::....::.:.:::::.::::: :::::
CCDS58 ELGTAVALIKTHDLDSGFNGEILCQLKGNFPFKIVQDTKNTYRLVTDGALDREQIPEYNV
370 380 390 400 410 420
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pF1KB3 TITATDRGKPPLSSSISVILHIRDVNDNAPVFHQASYLVSVPENNPPGASIAQVCASDLD
::::::.:.:::::: .. ::: :::::.:::::::: : : ::::::::::.: ::: :
CCDS58 TITATDKGNPPLSSSKTITLHILDVNDNVPVFHQASYTVHVAENNPPGASIAHVRASDPD
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pF1KB3 LGLNGQVSYSIMASDLEPLALASYVSMSAQSGVVFAQRAFDYEQLRTFELTLQARDQGSP
:: :: ::: :.:::::: :.::::.::.:::::::::::.::::.:::::::::::::
CCDS58 LGPNGLVSYYIVASDLEPRELSSYVSVSARSGVVFAQRAFDHEQLRAFELTLQARDQGSP
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pF1KB3 ALSANVSLRVLVGDRNDNAPRVLYPALGPDGSALFDMVPRAAEPGYLVTKVVAVDADSGH
.::::::::::: ::::::: ::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::.
CCDS58 TLSANVSLRVLVDDRNDNAPLVLYPALGPEGSALFDMVPRSAEPGYLVTKVVAVDADSGY
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pF1KB3 NAWLSYHVLQASEPGLFSLGLRTGEVRTARALGDRDAARQRLLVAVRDGGQPPLSATATL
:::::::..:::::::::::::::::::::.::::.::::::::.:::::: :::::. :
CCDS58 NAWLSYHIVQASEPGLFSLGLRTGEVRTARTLGDREAARQRLLVTVRDGGQQPLSATVML
610 620 630 640 650 660
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pF1KB3 HLVFADSLQEVLPDITDRPVPSDPQAELQFYLVVALALISVLFLLAVILAVALRLRRSSS
::.:::::::. ::..:::.::::::::::.:::::::::::::::::::..:::: ::
CCDS58 HLIFADSLQEIQPDLSDRPTPSDPQAELQFHLVVALALISVLFLLAVILAISLRLRCSSR
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 PAAWSCFQPGLCVKSGPVVPPNYSQGTLPYSYNLCVA-HTGKTEFNFLKCSEQLSSGQDI
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CCDS58 PATEGYFQPGVCFKTVPGVLPTYSERTLPYSYNPCAASHSSNTEFKFLNIKAENAAPQDL
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 LCGDSSGALFPLCNSSESTSHP---ELQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNN
:: ..: : .. : :. . :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LCDEAS--WFESNDNPEMPSNSGNLQKQAPPNTDWRFSQAQRPGTSGSQNGDDTGTWPNN
790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 QFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QFDTEMLQAMILASASEAADGSSTLGGGAGTMGLSARYGPQFTLQHVPDYRQNVYIPGSN
840 850 860 870 880 890
900 910 920
pF1KB3 ATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ATLTNAAGKRDGKAPAGGNGNKKKSGKKEKK
900 910 920
>>CCDS75342.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 (820 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGSGAGELGRAERLPVLFLFLLSLFCPALCEQIRYRIPEEMPKGSVVGNLATDLGFSVQE
::.. .. :: ::: .:: :: :.: : ::: ::::. ::::::::: :::.:: .
CCDS75 MGGSCAQRRRAGPRQVLFPLLLPLFYPTLSEPIRYSIPEELAKGSVVGNLAKDLGLSVLD
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 LPTRKLRVSSEKPYFTVSAESGELLVSSRLDREEICGKKPACALEFEAVAENPLNFYHVN
. .::::::.:: .:.:.::::.:::..:.:::.:: .. : :..:::.:::::..::
CCDS75 VSARKLRVSAEKLHFSVDAESGDLLVKNRIDREQICKERRRCELQLEAVVENPLNIFHVI
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 VEIEDINDHTPKFTQNSFELQISESAQPGTRFILEVAEDADIGLNSLQKYKLSLNPSFSL
: :::.:::.:.: .. ..:.: :::. :::. :. : : ::..::.. ::.. :: :::
CCDS75 VVIEDVNDHAPQFDKKEIHLEIFESASAGTRLSLDPATDPDININSIKDYKINSNPYFSL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 IIKEKQDGSKYPELALEKTLDREQQSYHRLVLTALDGGHPPLSGTTELRIQVTDANDNPP
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CCDS75 MVRVNSDGGKYPELSLEKLLDREEQRSHSLILTALDGGDPPRSATAHIEISVKDTNDNPP
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