Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3796
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3796, 860 aa
1>>>pF1KB3796 860 - 860 aa - 860 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3642+/-0.00122; mu= 8.6859+/- 0.073
mean_var=268.0837+/-50.793, 0's: 0 Z-trim(111.6): 74 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.078332
statistics sampled from 12411 (12481) to 12411 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.716), E-opt: 0.2 (0.383), width: 16
Scan time: 4.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7653.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 ( 909) 4781 554.7 2.7e-157
CCDS7654.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 ( 738) 3349 392.7 1.2e-108
CCDS4338.1 ADAM19 gene_id:8728|Hs108|chr5 ( 918) 2087 250.2 1.2e-65
CCDS13058.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 ( 813) 1750 212.1 3.3e-54
CCDS63219.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20 ( 812) 1745 211.5 4.8e-54
CCDS44236.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 862) 1595 194.6 6.4e-49
CCDS1087.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 863) 1595 194.6 6.4e-49
CCDS1085.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 839) 1571 191.9 4.1e-48
CCDS1086.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 838) 1568 191.5 5.2e-48
CCDS1088.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 772) 1542 188.6 3.8e-47
CCDS58032.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 796) 1542 188.6 3.8e-47
CCDS1084.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 814) 1542 188.6 3.9e-47
CCDS58031.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 824) 1542 188.6 3.9e-47
CCDS6112.1 ADAM9 gene_id:8754|Hs108|chr8 ( 819) 1521 186.2 2e-46
CCDS60282.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 633) 1331 164.6 5e-40
CCDS58103.1 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 742) 1186 148.3 4.7e-35
CCDS31319.2 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 824) 1186 148.4 5.1e-35
CCDS58102.1 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 733) 1174 146.9 1.2e-34
CCDS6045.1 ADAM7 gene_id:8756|Hs108|chr8 ( 754) 1130 142.0 3.8e-33
CCDS43610.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 859) 1119 140.8 9.9e-33
CCDS43609.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 870) 1119 140.8 1e-32
CCDS43608.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 899) 1119 140.8 1e-32
CCDS47637.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 906) 1119 140.8 1e-32
CCDS34865.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8 ( 775) 1075 135.8 2.9e-31
CCDS82139.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17 ( 569) 1061 134.0 7.1e-31
CCDS11486.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17 ( 769) 1061 134.2 8.7e-31
CCDS2369.1 ADAM23 gene_id:8745|Hs108|chr2 ( 832) 1055 133.6 1.5e-30
CCDS9804.1 ADAM21 gene_id:8747|Hs108|chr14 ( 722) 1009 128.3 4.9e-29
CCDS3823.1 ADAM29 gene_id:11086|Hs108|chr4 ( 820) 996 126.9 1.5e-28
CCDS907.1 ADAM30 gene_id:11085|Hs108|chr1 ( 790) 993 126.5 1.8e-28
CCDS64882.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 716) 990 126.1 2.2e-28
CCDS32111.1 ADAM20 gene_id:8748|Hs108|chr14 ( 776) 990 126.2 2.3e-28
CCDS34884.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 735) 986 125.7 3e-28
CCDS47830.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8 ( 540) 962 122.8 1.6e-27
CCDS47846.1 ADAM32 gene_id:203102|Hs108|chr8 ( 787) 930 119.4 2.5e-26
CCDS83287.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 ( 715) 899 115.8 2.7e-25
CCDS6113.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 ( 739) 899 115.9 2.7e-25
CCDS64883.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 672) 762 100.3 1.2e-20
CCDS83286.1 ADAM32 gene_id:203102|Hs108|chr8 ( 688) 683 91.4 5.8e-18
CCDS55212.1 ADAMDEC1 gene_id:27299|Hs108|chr8 ( 391) 497 70.1 8.5e-12
CCDS6044.1 ADAMDEC1 gene_id:27299|Hs108|chr8 ( 470) 497 70.2 9.6e-12
>>CCDS7653.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 (909 aa)
initn: 5484 init1: 4781 opt: 4781 Z-score: 2937.4 bits: 554.7 E(32554): 2.7e-157
Smith-Waterman score: 5883; 94.4% identity (94.4% similar) in 892 aa overlap (18-860:18-909)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAARPLPVSPARALLLALAGALLAPCEARGVSLWNQGRADEVVSASVRSGDLWIPVKSFD
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS76 MAARPLPVSPARALLLALAGALLAPCEARGVSLWNQGRADEVVSASVGSGDLWIPVKSFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB3 SKNHPEVLNIRLQRESKELIINLERNEGLIASSFTETHYLQDGTDVSLARNYT---GHCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS76 SKNHPEVLNIRLQRESKELIINLERNEGLIASSFTETHYLQDGTDVSLARNYTVILGHCY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 YHGHVRGYSDSAVSLSTCSGLRGLIVFENESYVLEPMKSATNRYKLFPAKKLKSVRGSCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YHGHVRGYSDSAVSLSTCSGLRGLIVFENESYVLEPMKSATNRYKLFPAKKLKSVRGSCG
130 140 150 160 170 180
180 190 200
pF1KB3 SHHNTPNLAAKNVFPPPSQTWARR------------------------------------
::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SHHNTPNLAAKNVFPPPSQTWARRHKRETLKATKYVELVIVADNREFQRQGKDLEKVKQR
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250
pF1KB3 ----------FYRPLNIRIVLVGVEVWNDMDKCSVSQDPFTSLHEFLDWRKMKLLPRKSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LIEIANHVDKFYRPLNIRIVLVGVEVWNDMDKCSVSQDPFTSLHEFLDWRKMKLLPRKSH
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 DNAQLVSGVYFQGTTIGMAPIMSMCTADQSGGIVMDHSDNPLGAAVTLAHELGHNFGMNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DNAQLVSGVYFQGTTIGMAPIMSMCTADQSGGIVMDHSDNPLGAAVTLAHELGHNFGMNH
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 DTLDRGCSCQMAVEKGGCIMNASTGYPFPMVFSSCSRKDLETSLEKGMGVCLFNLPEVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DTLDRGCSCQMAVEKGGCIMNASTGYPFPMVFSSCSRKDLETSLEKGMGVCLFNLPEVRE
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 SFGGQKCGNRFVEEGEECDCGEPEECMNRCCNATTCTLKPDAVCAHGLCCEDCQLKPAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SFGGQKCGNRFVEEGEECDCGEPEECMNRCCNATTCTLKPDAVCAHGLCCEDCQLKPAGT
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 ACRDSSNSCDLPEFCTGASPHCPANVYLHDGHSCQDVDGYCYNGICQTHEQQCVTLWGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ACRDSSNSCDLPEFCTGASPHCPANVYLHDGHSCQDVDGYCYNGICQTHEQQCVTLWGPG
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 AKPAPGICFERVNSAGDPYGNCGKVSKSSFAKCEMRDAKCGKIQCQGGASRPVIGTNAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AKPAPGICFERVNSAGDPYGNCGKVSKSSFAKCEMRDAKCGKIQCQGGASRPVIGTNAVS
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 IETNIPLQQGGRILCRGTHVYLGDDMPDPGLVLAGTKCADGKICLNRQCQNISVFGVHEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IETNIPLQQGGRILCRGTHVYLGDDMPDPGLVLAGTKCADGKICLNRQCQNISVFGVHEC
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 AMQCHGRGVCNNRKNCHCEAHWAPPFCDKFGFGGSTDSGPIRQADNQGLTIGILVTILCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AMQCHGRGVCNNRKNCHCEAHWAPPFCDKFGFGGSTDSGPIRQADNQGLTIGILVTILCL
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KB3 LAAGFVVYLKRKTLIRLLFTNKKTTIEKLRCVRPSRPPRGFQPCQAHLGHLGKGLMRKPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LAAGFVVYLKRKTLIRLLFTNKKTTIEKLRCVRPSRPPRGFQPCQAHLGHLGKGLMRKPP
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KB3 DSYPPKDNPRRLLQCQNVDISRPLNGLNVPQPQSTQRVLPPLHRAPRAPSVPARPLPAKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DSYPPKDNPRRLLQCQNVDISRPLNGLNVPQPQSTQRVLPPLHRAPRAPSVPARPLPAKP
790 800 810 820 830 840
800 810 820 830 840 850
pF1KB3 ALRQAQGTCKPNPPQKPLPADPLARTTRLTHALARTPGQWETGLRLAPLRPAPQYPHQVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ALRQAQGTCKPNPPQKPLPADPLARTTRLTHALARTPGQWETGLRLAPLRPAPQYPHQVP
850 860 870 880 890 900
860
pF1KB3 RSTHTAYIK
:::::::::
CCDS76 RSTHTAYIK
>>CCDS7654.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 (738 aa)
initn: 4651 init1: 3346 opt: 3349 Z-score: 2063.8 bits: 392.7 E(32554): 1.2e-108
Smith-Waterman score: 4451; 92.6% identity (92.7% similar) in 688 aa overlap (18-656:18-705)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAARPLPVSPARALLLALAGALLAPCEARGVSLWNQGRADEVVSASVRSGDLWIPVKSFD
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS76 MAARPLPVSPARALLLALAGALLAPCEARGVSLWNQGRADEVVSASVGSGDLWIPVKSFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB3 SKNHPEVLNIRLQRESKELIINLERNEGLIASSFTETHYLQDGTDVSLARNYT---GHCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS76 SKNHPEVLNIRLQRESKELIINLERNEGLIASSFTETHYLQDGTDVSLARNYTVILGHCY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 YHGHVRGYSDSAVSLSTCSGLRGLIVFENESYVLEPMKSATNRYKLFPAKKLKSVRGSCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 YHGHVRGYSDSAVSLSTCSGLRGLIVFENESYVLEPMKSATNRYKLFPAKKLKSVRGSCG
130 140 150 160 170 180
180 190 200
pF1KB3 SHHNTPNLAAKNVFPPPSQTWARR------------------------------------
::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SHHNTPNLAAKNVFPPPSQTWARRHKRETLKATKYVELVIVADNREFQRQGKDLEKVKQR
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250
pF1KB3 ----------FYRPLNIRIVLVGVEVWNDMDKCSVSQDPFTSLHEFLDWRKMKLLPRKSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LIEIANHVDKFYRPLNIRIVLVGVEVWNDMDKCSVSQDPFTSLHEFLDWRKMKLLPRKSH
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260 270 280 290 300 310
pF1KB3 DNAQLVSGVYFQGTTIGMAPIMSMCTADQSGGIVMDHSDNPLGAAVTLAHELGHNFGMNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DNAQLVSGVYFQGTTIGMAPIMSMCTADQSGGIVMDHSDNPLGAAVTLAHELGHNFGMNH
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 DTLDRGCSCQMAVEKGGCIMNASTGYPFPMVFSSCSRKDLETSLEKGMGVCLFNLPEVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DTLDRGCSCQMAVEKGGCIMNASTGYPFPMVFSSCSRKDLETSLEKGMGVCLFNLPEVRE
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 SFGGQKCGNRFVEEGEECDCGEPEECMNRCCNATTCTLKPDAVCAHGLCCEDCQLKPAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SFGGQKCGNRFVEEGEECDCGEPEECMNRCCNATTCTLKPDAVCAHGLCCEDCQLKPAGT
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 ACRDSSNSCDLPEFCTGASPHCPANVYLHDGHSCQDVDGYCYNGICQTHEQQCVTLWGPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ACRDSSNSCDLPEFCTGASPHCPANVYLHDGHSCQDVDGYCYNGICQTHEQQCVTLWGPG
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 AKPAPGICFERVNSAGDPYGNCGKVSKSSFAKCEMRDAKCGKIQCQGGASRPVIGTNAVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AKPAPGICFERVNSAGDPYGNCGKVSKSSFAKCEMRDAKCGKIQCQGGASRPVIGTNAVS
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 IETNIPLQQGGRILCRGTHVYLGDDMPDPGLVLAGTKCADGKICLNRQCQNISVFGVHEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IETNIPLQQGGRILCRGTHVYLGDDMPDPGLVLAGTKCADGKICLNRQCQNISVFGVHEC
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 AMQCHGRGVCNNRKNCHCEAHWAPPFCDKFGFGGSTDSGPIRQADNQGLTIGILVTILCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS76 AMQCHGRGVCNNRKNCHCEAHWAPPFCDKFGFGGSTDSGPIRQAEARQEAAESNRERGQG
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680 690 700 710 720 730
pF1KB3 LAAGFVVYLKRKTLIRLLFTNKKTTIEKLRCVRPSRPPRGFQPCQAHLGHLGKGLMRKPP
CCDS76 QEPVGSQEHASTASLTLI
730
>>CCDS4338.1 ADAM19 gene_id:8728|Hs108|chr5 (918 aa)
initn: 2260 init1: 1077 opt: 2087 Z-score: 1292.0 bits: 250.2 E(32554): 1.2e-65
Smith-Waterman score: 2415; 43.0% identity (64.4% similar) in 915 aa overlap (15-849:12-908)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MAARPLPVSPARALLLALAGALLAPCEARGVSLWNQGRADEVVSASVRSGDLWIPV-KSF
:::.: : : :: . :..: .: : ... .: :: :.
CCDS43 MPGGAGAARLCLLAFALQPLRPRAAREPG-WTRG--SEEGSPKLQH-ELIIPQWKTS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 DS---KNHPEVLNIRLQRESKELIINLERNEGLIASSFTETHYLQDGTDVSLARNYTGHC
.: ..:: ..:.. :..:::..::.:: :.: :.::::: ..:. . .:. ::
CCDS43 ESPVREKHPLKAELRVMAEGRELILDLEKNEQLFAPSYTETHYTSSGNPQTTTRKLEDHC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 YYHGHVRGYSDSAVSLSTCSGLRGLI-VFENESYVLEPMKSATNRYKLFPAKKLKSVRGS
.::: :: :.:.:::: :.:::: : : :::.::. .. ... .. ...:: :.
CCDS43 FYHGTVRETELSSVTLSTCRGIRGLITVSSNLSYVIEPLPDSKGQHLIYRSEHLKPPPGN
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KB3 CGSHHNTPNLAAKNV-FPPPSQTWARR---------------------------------
:: .:. :. . : .. ::
CCDS43 CGFEHSKPTTRDWALQFTQQTKKRPRRMKREDLNSMKYVELYLVADYLEFQKNRRDQDAT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240
pF1KB3 -------------FYRPLNIRIVLVGVEVWNDMDKCSVSQDPFTSLHEFLDWRKMKLLPR
::: :::::.:::.:::. . : ::..:...: ::.::. ::: .
CCDS43 KHKLIEIANYVDKFYRSLNIRIALVGLEVWTHGNMCEVSENPYSTLWSFLSWRR-KLLAQ
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 KSHDNAQLVSGVYFQGTTIGMAPIMSMCTADQSGGIVMDHSDNPLGAAVTLAHELGHNFG
: ::::::..:. :.:::::.::.:.::.. ::::. ::::.: .:.:.:.:::.:::::
CCDS43 KYHDNAQLITGMSFHGTTIGLAPLMAMCSVYQSGGVNMDHSENAIGVAATMAHEMGHNFG
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 MNHDTLDRGCSCQMAVEKGGCIMNASTGYPFPMVFSSCSRKDLETSLEKGMGVCLFNLPE
:.::. : : :. .. ::::: :.::.::: ::..:.:..:. :..: :.:: :.:.
CCDS43 MTHDSAD--C-CSASAADGGCIMAAATGHPFPKVFNGCNRRELDRYLQSGGGMCLSNMPD
360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VRESFGGQKCGNRFVEEGEECDCGEPEECMNRCCNATTCTLKPDAVCAHGLCCEDCQLKP
.: .::..::: ..:.:::::::: ::: : ::::..:::.: : :::: ::..:.:
CCDS43 TRMLYGGRRCGNGYLEDGEECDCGEEEECNNPCCNASNCTLRPGAECAHGSCCHQCKLLA
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AGTACRDSSNSCDLPEFCTGASPHCPANVYLHDGHSCQDVDGYCYNGICQTHEQQCVTLW
:: ::... .::::::::: :::::.: : :: :. ..:::::.: :...:: ::
CCDS43 PGTLCREQARQCDLPEFCTGKSPHCPTNFYQMDGTPCEGGQAYCYNGMCLTYQEQCQQLW
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GPGAKPAPGICFERVNSAGDPYGNCGKVSKSSFAKCEMRDAKCGKIQCQGGASRPVIGTN
::::.::: .:::.:: ::: .::::: .. ::.::::::::::::.. .:: . .:
CCDS43 GPGARPAPDLCFEKVNVAGDTFGNCGKDMNGEHRKCNMRDAKCGKIQCQSSEARP-LESN
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
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720 730 740 750 760
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770 780 790 800 810 820
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260 270 280 290 300 310
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CCDS44 ELNCSWVHLDLGSDVAQPLLTLPGTACGPGLVCIDHRCQRVDLLGAQECRSKCHGHGVCD
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pF1KB3 NRKNCHCEAHWAPPFCDKFGFGGSTDSGPIRQADNQGLTIGILVTILCLLAAGFVVYLKR
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CCDS44 SNRHCYCEEGWAPPDC--------TTQLKATSSLTTGLLLSLLV-LLVLVMLGASYWYRA
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CCDS44 RLHQRLCQLKGPTCQYRAAQSGPSERP-G--PPQRAL--LARGT-KASALSFPAP--P--
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CCDS44 KPPPPRKPLPADPQGRCP--SGDLP-GPGAGIPPL-VVPSRPAPPPPTVSSLYL
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CCDS10 KLELDGDSHILELLQNRELVPGRPTLVWYQPDGTRVVSEGHTLENCCYQGRVRGYAGSWV
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