Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3755
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3755, 590 aa
1>>>pF1KB3755 590 - 590 aa - 590 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4995+/-0.00106; mu= 13.2185+/- 0.064
mean_var=166.4369+/-58.569, 0's: 0 Z-trim(106.4): 257 B-trim: 1096 in 2/46
Lambda= 0.099414
statistics sampled from 8445 (8978) to 8445 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 3.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 3892 571.5 1.1e-162
CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 ( 532) 1203 185.7 1.2e-46
CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 ( 460) 1117 173.3 5.8e-43
CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 ( 466) 957 150.4 4.8e-36
CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 ( 479) 950 149.4 9.7e-36
CCDS13493.1 HRH3 gene_id:11255|Hs108|chr20 ( 445) 538 90.3 5.7e-18
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 479 81.7 1.8e-15
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 462 79.3 1.1e-14
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 454 78.1 2.1e-14
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 454 78.3 2.6e-14
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 454 78.4 2.8e-14
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 450 77.6 3.4e-14
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 443 76.7 7.5e-14
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 434 75.2 1.5e-13
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 433 75.2 1.9e-13
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 433 75.2 2e-13
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 433 75.2 2e-13
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 433 75.2 2e-13
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 427 74.3 3.2e-13
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 423 73.7 4.6e-13
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 423 73.9 5.8e-13
CCDS11887.1 HRH4 gene_id:59340|Hs108|chr18 ( 390) 417 72.9 8.8e-13
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 416 72.8 1e-12
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 416 72.8 1.1e-12
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 416 72.8 1.1e-12
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 414 72.5 1.3e-12
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 411 72.1 1.8e-12
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 407 71.5 2.6e-12
CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 394 69.6 9e-12
CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 394 69.6 9.4e-12
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 380 67.6 3.9e-11
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 376 67.0 5.3e-11
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 371 66.2 8.1e-11
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 371 66.3 8.6e-11
>>CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 (590 aa)
initn: 3892 init1: 3892 opt: 3892 Z-score: 3034.5 bits: 571.5 E(32554): 1.1e-162
Smith-Waterman score: 3892; 100.0% identity (100.0% similar) in 590 aa overlap (1-590:1-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTLHNNSTTSPLFPNISSSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGTTDDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MTLHNNSTTSPLFPNISSSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGTTDDPL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GGHTVWQVVFIAFLTGILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 GGHTVWQVVFIAFLTGILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 SMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 TTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 YMPVTIMTILYWRIYKETEKRTKELAGLQASGTEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 YMPVTIMTILYWRIYKETEKRTKELAGLQASGTEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 KRSNRRKYGRCHFWFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 KRSNRRKYGRCHFWFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TRAIYSIVLKLPGHSTILNSTKLPSSDNLQVPEEELGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 TRAIYSIVLKLPGHSTILNSTKLPSSDNLQVPEEELGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 PKSFSKLPIQLESAVDTAKTSDVNSSVGKSTATLPLSFKEATLAKRFALKTRSQITKRKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 PKSFSKLPIQLESAVDTAKTSDVNSSVGKSTATLPLSFKEATLAKRFALKTRSQITKRKR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 MSLVKEKKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 MSLVKEKKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB3 PVCYALCNKTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS16 PVCYALCNKTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQAL
550 560 570 580 590
>>CCDS10031.1 CHRM5 gene_id:1133|Hs108|chr15 (532 aa)
initn: 1722 init1: 1153 opt: 1203 Z-score: 950.7 bits: 185.7 E(32554): 1.2e-46
Smith-Waterman score: 1748; 53.2% identity (74.2% similar) in 547 aa overlap (48-578:8-529)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 SSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGT--TDDPLGGHTVWQVVFIAFLT
: .. .:: . .:: : .:.:. :: .:
CCDS10 MEGDSYHNATTVNGTPVNHQPLERHRLWEVITIAAVT
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 GILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWA
....:.::.::.::..:::::.::::::::.::::::::::::..::::.::::.:.:::
CCDS10 AVVSLITIVGNVLVMISFKVNSQLKTVNNYYLLSLACADLIIGIFSMNLYTTYILMGRWA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 LGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVI
::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::::.:
CCDS10 LGSLACDLWLALDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTPKRAGIMIGLAWLI
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIY
::.::::::: :::.::::::: :: :::::::::::::::::::.::..::::: :::
CCDS10 SFILWAPAILCWQYLVGKRTVPLDECQIQFLSEPTITFGTAIAAFYIPVSVMTILYCRIY
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 KETEKRTKELAGLQASG--TEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRCHF
.:::::::.:: ::.: :.:: .. .: . ::: . . .. . .: . .
CCDS10 RETEKRTKDLADLQGSDSVTKAEKRKPAH-RALFRSC--LRCPRPTLAQRERNQAS----
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 WFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKLPG
: ... .. . .: . : .: . . .. . ::..:: : . ..: : :
CCDS10 WSSSRRSTSTTGKPSQATGPSANWAKAEQLTTCSSYPSSEDED-KPATDPVLQVVYKSQG
280 290 300 310 320
380 390 400 410 420
pF1KB3 HSTILNSTKLPSSDNLQVPEEELGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSF---------PKSF
. . : ::.. . :. : ...:: : .. :::
CCDS10 KES---------------PGEEFSAEETEETFVKAETEKSDYDTPNYLLSPAAAHRPKSQ
330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 SKLPIQLESAVDTAKTSDVNSSVGKSTATLPLSF---KEATLAKRFALKTRSQITKRKRM
. . ... .: . ....:.. : . .: : :: . .: . . :.:::::.
CCDS10 KCVAYKFRLVVKADGNQETNNGCHK-VKIMPCPFPVAKEPS-TKGLNPNPSHQMTKRKRV
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 SLVKEKKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNP
::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.:.: :.:.:::::::.::::::
CCDS10 VLVKERKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVSTFCDKCVPVTLWHLGYWLCYVNSTVNP
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590
pF1KB3 VCYALCNKTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQAL
.::::::.::: ::::::::. ::: ... : : .:
CCDS10 ICYALCNRTFRKTFKMLLLCRWKKKKVEEKLYWQGNSKLP
500 510 520 530
>>CCDS8040.1 CHRM1 gene_id:1128|Hs108|chr11 (460 aa)
initn: 1646 init1: 1094 opt: 1117 Z-score: 884.7 bits: 173.3 E(32554): 5.8e-43
Smith-Waterman score: 1581; 52.3% identity (70.2% similar) in 526 aa overlap (51-570:10-444)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 IHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGTTDDPLGGHTVWQVVFIAFLTGILAL
::. :. : :. :::.::.. ::.:.:
CCDS80 MNTSAPPAVSPNITVLAP--GKGPWQVAFIGITTGLLSL
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 VTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLA
.:. ::.::..::::: .::::::::::::::::::::..::::.:::..:..::::.::
CCDS80 ATVTGNLLVLISFKVNTELKTVNNYFLLSLACADLIIGTFSMNLYTTYLLMGHWALGTLA
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 CDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLW
::::::.:::::::::::::.::::::::.::::.:::::: .::..::::::..:::::
CCDS80 CDLWLALDYVASNASVMNLLLISFDRYFSVTRPLSYRAKRTPRRAALMIGLAWLVSFVLW
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 APAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEK
:::::::::.::.::: :.:.:::::.: ::::::.::::.:::.: ::::::.:::.
CCDS80 APAILFWQYLVGERTVLAGQCYIQFLSQPIITFGTAMAAFYLPVTVMCTLYWRIYRETEN
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310
pF1KB3 RTKELAGLQASGTEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRC------HFW
:..:::.::.: : : .. : :: : .: . . : . :::
CCDS80 RARELAALQGSET---------PGKGGGSSSSSERSQPGAEGSPETPPGRCCRCCRAPRL
220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 FTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKLPGH
. . ::: :. ..:..: .:. .::. :. ::: .:.:.:
CCDS80 LQAYSWK---EEEEEDEGS------------MESLTSSEGEEPGSE------VVIKMP--
270 280 290 300
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 STILNSTKLPSSDNLQVPEEELGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSFPKSFSKLPIQLESA
::: : .: : .: :.. : :
CCDS80 -----------------------MVDPEAQAPTKQPPRSS------PNTV-KRP------
310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 VDTAKTSDVNSSVGKSTATLPLSFKEATLAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKKAAQTLS
: : : .::. : . . :..::: .:::::::::.:::
CCDS80 --TKKGRD---RAGKGQK--P--------------RGKEQLAKRKTFSLVKEKKAARTLS
330 340 350 360
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 AILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTT
:::::::.:::::::::::.::: .:.:.:.:.:::::::.:::.::.:::::::.:: :
CCDS80 AILLAFILTWTPYNIMVLVSTFCKDCVPETLWELGYWLCYVNSTINPMCYALCNKAFRDT
370 380 390 400 410 420
560 570 580 590
pF1KB3 FKMLLLCQCDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQAL
:..::::. ::.. ::
CCDS80 FRLLLLCRWDKRRWRKIPKRPGSVHRTPSRQC
430 440 450 460
>>CCDS5843.1 CHRM2 gene_id:1129|Hs108|chr7 (466 aa)
initn: 1355 init1: 944 opt: 957 Z-score: 760.6 bits: 150.4 E(32554): 4.8e-36
Smith-Waterman score: 1335; 44.8% identity (69.8% similar) in 500 aa overlap (63-562:18-458)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 TVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGTTDDPLGGHTVWQVVFIAFLTGILALVTIIGNILVIVS
. ...::::....: :.::::::::::.::
CCDS58 MNNSTNSSNNSLALTSPYKTFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVS
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 FKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLAIDYVAS
.:::..:.:::::::.:::::::::::.::::.: : ... : :: ..::::::.:::.:
CCDS58 IKVNRHLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVS
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 NASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVG
::::::::.::::::: .:.:::: .::::: ::.::. :::.::.::::::::::..::
CCDS58 NASVMNLLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVG
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 KRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKRTKELAGLQASG
::: :::.:::.:. ..::::::::::.:: :::.:::.: . ...: :.
CCDS58 VRTVEDGECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRIKK--------
170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 TEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRCHFWFTTKSWKPSSEQMDQDHS
. .:.... : .: . .: .: :::.. . ..
CCDS58 ------DKKEPVANQDPVSPSLVQGRIVKPNNNNM--------------PSSDDGLEHNK
220 230 240 250
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 SSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKLPGHSTILNSTKLPSSDNLQVP
... : .. :: ....:.. .... .. ... .. :. .
CCDS58 IQNGKAPRDPVT--ENCVQGEEKESSNDSTSVSAVASNM--------------RDDEITQ
260 270 280 290 300
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 EEELGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSFPKSFSKLPIQLESAVDTAKTSDVNSSVGKSTA
.:. ..: .. :. . : . : . ::: : : : : .: .: :..
CCDS58 DENTVSTSLGHSKDENSKQTCIRIGTKTPKSDSCTP--------TNTTVEVVGSSGQNGD
310 320 330 340 350
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 TLPLSFKEATLAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVL
:. .:.... :.. :. : .:::...:. ::::::::::.:::.:::
CCDS58 E-----KQNIVARKIVKMTKQPAKKKPPPS--REKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVL
360 370 380 390 400
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 VNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQ
.:::: :::.: :..::::::::::.::.:::::: ::. ::: ::.:.
CCDS58 INTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLMCHYKNIGATR
410 420 430 440 450 460
580 590
pF1KB3 YQQRQSVIFHKRAPEQAL
>>CCDS44581.1 CHRM4 gene_id:1132|Hs108|chr11 (479 aa)
initn: 1390 init1: 949 opt: 950 Z-score: 755.1 bits: 149.4 E(32554): 9.7e-36
Smith-Waterman score: 1347; 45.4% identity (69.5% similar) in 522 aa overlap (42-562:7-471)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 LFPNISSSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGTTDDPLGGHTVWQVVFI
:. ..:: : :... .:: ..:::
CCDS44 MANFTPVNGSSGNQSVRLVTSSSHNRYETV-EMVFI
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 AFLTGILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIM
: .:: :.:::..:::::..:.:::.::.:::::::.::::::::::..::::.:.:::
CCDS44 ATVTGSLSLVTVVGNILVMLSIKVNRQLQTVNNYFLFSLACADLIIGAFSMNLYTVYIIK
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 NRWALGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGL
. : :: ..::::::.:::.:::::::::.::::::: .:.:::: :.:::: ::.::.
CCDS44 GYWPLGAVVCDLWLALDYVVSNASVMNLLIISFDRYFCVTKPLTYPARRTTKMAGLMIAA
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 AWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILY
:::.:::::::::::::. ::::::: ..:::::::.:..::::::::::.::.:::.::
CCDS44 AWVLSFVLWAPAILFWQFVVGKRTVPDNQCFIQFLSNPAVTFGTAIAAFYLPVVIMTVLY
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 WRIYKETEKRTKELAGLQASGTEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRC
.: ...:... . .:.: :.. :..::.:. . .:
CCDS44 IHISLASRSRVHKHRPEGPKEKKAKTLAFLKSP----------LMKQSVKKPPPGEAARE
220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 HFWFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKL
.. : . .: . .:.: . :: :.
CCDS44 ELRNGKLEEAPPPALPPPPRPVAD-------------KDTSNESSSGSATQ---------
270 280 290 300
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 PGHSTILNSTKLPSSDNLQVPEEELGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSFPKSFSKLPIQL
:. . :... :.. : . : :: .... .. . : ::
CCDS44 -------NTKERPATE-LSTTEATTPAMP----APPLQP-RALNPASRWSK------IQ-
310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 ESAVDTAKTSDVNSSVGKSTATLPLSFKEAT-LAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKKAA
. : .:.. .. . . . : ... :. .:..:: .:.:. :...:. ..:.:..
CCDS44 ---IVTKQTGNECVTAIEIVPATPAGMRPAANVARKFASIARNQVRKKRQMA-ARERKVT
350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 QTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKT
.:. :::::::.::::::.::::::::.:::: : :..::::::.:::.::.:::::: :
CCDS44 RTIFAILLAFILTWTPYNVMVLVNTFCQSCIPDTVWSIGYWLCYVNSTINPACYALCNAT
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590
pF1KB3 FRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQAL
:. ::. :::::
CCDS44 FKKTFRHLLLCQYRNIGTAR
460 470
>>CCDS13493.1 HRH3 gene_id:11255|Hs108|chr20 (445 aa)
initn: 506 init1: 342 opt: 538 Z-score: 436.1 bits: 90.3 E(32554): 5.7e-18
Smith-Waterman score: 616; 26.8% identity (55.8% similar) in 534 aa overlap (38-566:8-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 TTSPLFPNISSSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRA-AGNFSSPDGTTDDPLGGHTVW
: :.: : ::. .. :. : ..:
CCDS13 MERAPPDGPLNASGALAGEAAAAGGAR----GFSAAW
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 QVVFIAFLTGILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFT
.:. : : ..: ..:..:: ::...: ....:.: ::.:::.:: .:...:.. . :..
CCDS13 TAVLAA-LMALLIVATVLGNALVMLAFVADSSLRTQNNFFLLNLAISDFLVGAFCIPLYV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 TYIIMNRWALGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKR-TTKRA
:.. .::..: : :::..::. ..:..:...::.::..:.:: ..:::.. :.::
CCDS13 PYVLTGRWTFGRGLCKLWLVVDYLLCTSSAFNIVLISYDRFLSVTRAVSYRAQQGDTRRA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVT
. :.::..:.:..:::: :.:. : ..: :.:. .:. . . . .. :. :
CCDS13 VRKMLLVWVLAFLLYGPAILSWEYLSGGSSIPEGHCYAEFFYNWYFLITASTLEFFTPFL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 IMTILYWRIYKETEKRTK-ELAGL-QASGTEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRS
.:.. :: . ..::. .: : .:.: : : : .:
CCDS13 SVTFFNLSIYLNIQRRTRLRLDGAREAAGPEPPPEAQPSPPPPP-GC-------------
220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NRRKYGRCHFWFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRA
: :... . : . . : .:.:.
CCDS13 ----------W--------------------GCWQKGHGEAMPLHRYGVGEAAVGAEA--
260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 IYSIVLKLPGHSTILNSTKLPSSDNLQVPEEELGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSFPKS
:..: :: . ::: .
CCDS13 ---------GEAT-------------------LG---------------GGGGGGSVASP
290 300
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FSKLPIQLESAVDTAKTSDVNSSVGKSTATLPLSFKEATLAKRFALKTRSQITKRKRMSL
: :. .... .. :. ... : : . :.: ::. . ..: .:.: :.:
CCDS13 TS-------SSGSSSRGTERPRSLKRGSK--P-SASSASLEKRMKMVSQS-FTQRFRLS-
310 320 330 340 350
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VKEKKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDS-CIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPV
...:.:..:..:. : . :.::...... . : . :.: ... ..:: . ::.::::
CCDS13 -RDRKVAKSLAVIVSIFGLCWAPYTLLMIIRAACHGHCVPDYWYETSFWLLWANSAVNPV
360 370 380 390 400 410
550 560 570 580 590
pF1KB3 CYALCNKTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQAL
: ::...:: .: :: : .:
CCDS13 LYPLCHHSFRRAFTKLL---CPQKLKIQPHSSLEHCWK
420 430 440
>>CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 (390 aa)
initn: 565 init1: 328 opt: 479 Z-score: 391.0 bits: 81.7 E(32554): 1.8e-15
Smith-Waterman score: 479; 32.6% identity (68.2% similar) in 264 aa overlap (30-292:13-269)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MTLHNNSTTSPLFPNISSSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAG-NFSSPDGTTDDP
: :. : . :.: : . : :. : .:
CCDS49 MEEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDS
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LGGHTVWQVVFIAFLTGILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGV
.. :.:... .:. ...:.: ..: .::.. ...:.: ::.. ::: .::....
CCDS49 IS--LPWKVLLVMLLA-LITLATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAK
. : . : : . .::.::...::.::. : . .::...: ::..:::..:: . : ::
CCDS49 LVMPISTMYTVTGRWTLGQVVCDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 RTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAA
:: :::.:::.:.::.:. . : .::. ... : .:: .. .. : ....:
CCDS49 RTPKRAAVMIALVWVFSISISLPP-FFWRQAKAEEEV--SECVVN-TDHILYTVYSTVGA
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 FYMPVTIMTILYWRIYKETEKRTKELAGLQASGTEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQS
::.:. .. :: ::: :...: . . ... .... .. ::. : .:
CCDS49 FYFPTLLLIALYGRIYVEARSRILKQTPNRTGKRLTRAQLITDSPGSTSSVTSINSRVPD
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 MKRSNRRKYGRCHFWFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGS
CCDS49 VPSESGSPVYVNQVKVRVSDALLEKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLV
280 290 300 310 320 330
>>CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 (422 aa)
initn: 643 init1: 382 opt: 462 Z-score: 377.5 bits: 79.3 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 528; 25.7% identity (54.6% similar) in 526 aa overlap (41-563:11-420)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 PLFPNISSSWIHSPSDAGLPPGTVTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGTTDDPLGGHTVWQVVF
:.. . : . .:: .. :: :.
CCDS34 MDVLSPGQGNNTTSPPAPFETGGNTTG--ISDVTVSYQVI
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 IAFLTGILALVTIIGNILVIVSFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYII
..: : : . ...:: :.... ....:..: ::.. ::: .::...:. . . . : .
CCDS34 TSLLLGTLIFCAVLGNACVVAAIALERSLQNVANYLIGSLAVTDLMVSVLVLPMAALYQV
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 MNRWALGNLACDLWLAIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIG
.:.:.::...:::..:.: . ..:...: .:..:::..:: :. : ::: .::...:.
CCDS34 LNKWTLGQVTCDLFIALDVLCCTSSILHLCAIALDRYWAITDPIDYVNKRTPRRAAALIS
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 LAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTIL
:.:.:.:.. : .: :. . . : : :. .. :. ....:::.:. .: .:
CCDS34 LTWLIGFLISIPPMLGWR--TPEDRSDPDACTIS--KDHGYTIYSTFGAFYIPLLLMLVL
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 YWRIYKETEKRTKELAGLQASGTEAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGR
: ::.. .. : .. : . :. ::.. ..:
CCDS34 YGRIFRAARFRIRK------------TVKKVEKTGADT------------------RHG-
220 230 240
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 CHFWFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSDSWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLK
: :. .. . .:.: .: .: :..:
CCDS34 -------ASPAPQPKKSVNGESGSRNWR------------------LGVESKA-------
250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 LPGHSTILNSTKLPSSDNLQVPEEELGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSFPKSFSKLPIQ
: . : : : :..: ::... :.
CCDS34 --GGALCAN-----------------GAV---RQGD---------DGAALEV------IE
280 290
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 LESAVDTAKTSDVNSSVGKSTATLPLSFKEATLAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKKAA
.. . .. . . : .: : : ::.. :.. . ...:.:..:.:..
CCDS34 VHRVGNSKEHLPLPSEAGP-TPCAPASFER---------KNERNAEAKRKMALARERKTV
300 310 320 330 340
500 510 520 530 540
pF1KB3 QTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDS-C-IPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCN
.::. :. .::. : :. :..:: ::.: : .: . . :: : :: .::: :: :
CCDS34 KTLGIIMGTFILCWLPFFIVALVLPFCESSCHMPTLLGAIINWLGYSNSLLNPVIYAYFN
350 360 370 380 390 400
550 560 570 580 590
pF1KB3 KTFRTTFKMLLLCQ-CDKKKRRKQQYQQRQSVIFHKRAPEQAL
: :...:: .. :. :
CCDS34 KDFQNAFKKIIKCKFCRQ
410 420
>>CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 (365 aa)
initn: 603 init1: 339 opt: 454 Z-score: 372.0 bits: 78.1 E(32554): 2.1e-14
Smith-Waterman score: 457; 35.0% identity (67.1% similar) in 234 aa overlap (64-297:18-240)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 VTHFGSYNVSRAAGNFSSPDGTTDDPLGGHTVWQVVFIAFLTGILALVTIIGNILVIVSF
:. . ..: . ... .: . :. ::...
CCDS50 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAI
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 KVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLAIDYVASN
..:.:. ::.. ::: .::...:. : : ::.:.:: :: . :..::..:.. .
CCDS50 GTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCT
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 ASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGK
:...: ::..:::..:: . : :::.:::..:: .:.::. . : :::. .
CCDS50 CSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPP-LFWRSHR-R
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 RTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKRTKELAGLQASGT
. ::..: :: .. :. ....:::.:.:.. :::.:::. . : : : :.
CCDS50 LSPPPSQCTIQH-DHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAA----KSL--YQKRGS
170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 EAETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRCHFWFTTKSWKPSSEQMDQDHSS
. : . : :. : .: .: :
CCDS50 SRHLSN--RSTDSQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG
220 230 240 250 260 270
>>CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 (487 aa)
initn: 754 init1: 412 opt: 454 Z-score: 370.5 bits: 78.3 E(32554): 2.6e-14
Smith-Waterman score: 663; 28.4% identity (58.9% similar) in 496 aa overlap (67-559:26-483)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 FGSYNVSRAAGNFSSPDGTTDDPLGGHTVWQVVFIAFLTGILALVTIIGNILVIVSFKVN
:.. .. . . . :::. :.::. . . .
CCDS26 MSLPNSSCLLEDKMCEGNKTTMASPQLMPLVVVLSTICLVTVGLNLLVLYAVRSE
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 KQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLAIDYVASNASV
..:.::.: ...::. ::::.:.. : . :..:..:.:: : .::..:::::.::.
CCDS26 RKLHTVGNLYIVSLSVADLIVGAVVMPMNILYLLMSKWSLGRPLCLFWLSMDYVASTASI
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 MNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTV
...... .::: :. .:: : :: ::.. : :: .:: ::. :: :..:. . .:
CCDS26 FSVFILCIDRYRSVQQPLRYLKYRTKTRASATILGAWFLSF-LWVIPILGWNHFMQQTSV
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 P-PGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKRTKELAGLQASGTEA
.: .: . . ::: ::.:. .: .: .::: .... ..
CCDS26 RREDKCETDFYDVTWFKVMTAIINFYLPTLLMLWFYAKIYKAVRQHCQH----------R
180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 ETENFVHPTGSSRSCSSYELQQQSMKRSNRRKYGRCHFWFTTKSWKPSSEQMDQDHSSSD
: : : : : .:. .. : .. .: :. : . : ::. . . .:
CCDS26 ELINRSLP-----SFSEIKLRPENPK-GDAKKPGKESPWEVLKR-KPK-DAGGGSVLKSP
230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 SWNNNDAAASLENSASSDEEDIGSETRAIYSIVLKLPGHSTILNSTKLPSSDNLQVPEEE
: . .. . . : .:.: . . .. .... . . . : . :. .:
CCDS26 SQTPKEMKSPVVFSQEDDREVDKLYCFPLDIVHMQAAAEGSSRDYVAVNRSHG-QLKTDE
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 LGMVDLERKADKLQAQKSVDDGGSFPKSFSKLPIQLESAVDTAKTSDVNSSVGK--STAT
:. . :.... .. . :. :: .. :. :... . :: : ..
CCDS26 QGLNT--HGASEISEDQMLGDSQSFSRT------------DSDTTTETAPGKGKLRSGSN
340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 LPLSFKEATLAKRFALKTRSQITKRKRMSLVKEKKAAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLV
:.. . : ::. ..:. .. . . .:.:::. :. :. :::. : :: :. .:
CCDS26 TGLDYIKFTW-KRLRSHSRQYVSG---LHMNRERKAAKQLGFIMAAFILCWIPYFIFFMV
390 400 410 420 430
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 NTFCDSCIPKTFWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKMLLLCQCDKKKRRKQQY
.:: .: . . . :: :::::.::. : :::..:. ::: .:
CCDS26 IAFCKNCCNEHLHMFTIWLGYINSTLNPLIYPLCNENFKKTFKRILHIRS
440 450 460 470 480
580 590
pF1KB3 QQRQSVIFHKRAPEQAL
590 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 22:00:16 2016 done: Sat Nov 5 22:00:17 2016
Total Scan time: 3.070 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]