Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3736
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3736, 451 aa
1>>>pF1KB3736 451 - 451 aa - 451 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7605+/-0.000725; mu= 16.3984+/- 0.044
mean_var=117.5229+/-36.710, 0's: 0 Z-trim(111.0): 242 B-trim: 1265 in 2/49
Lambda= 0.118308
statistics sampled from 11588 (12030) to 11588 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16
Scan time: 3.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS801.1 GPR61 gene_id:83873|Hs108|chr1 ( 451) 2993 521.9 5e-148
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CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 405 80.3 5.5e-15
CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 529) 380 76.0 1e-13
CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 546) 380 76.0 1e-13
CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 ( 549) 380 76.0 1e-13
CCDS2838.1 GPR62 gene_id:118442|Hs108|chr3 ( 368) 348 70.4 3.5e-12
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 333 68.0 2.6e-11
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 331 67.6 3e-11
CCDS7376.1 OPN4 gene_id:94233|Hs108|chr10 ( 478) 326 66.8 5.6e-11
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 323 66.2 7.2e-11
>>CCDS801.1 GPR61 gene_id:83873|Hs108|chr1 (451 aa)
initn: 2993 init1: 2993 opt: 2993 Z-score: 2771.0 bits: 521.9 E(32554): 5e-148
Smith-Waterman score: 2993; 100.0% identity (100.0% similar) in 451 aa overlap (1-451:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESSPIPQSSGNSSTLGRVPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGN
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CCDS80 MESSPIPQSSGNSSTLGRVPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 AAVMAVIAKTPALRKFVFVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSALFDHALFGEVACRLYLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMASVPVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMASVPVLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 RVSWEEGAPSVPPGCSLQWSHSAYCQLFVVVFAVLYFLLPLLLILVVYCSMFRVARVAAM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 QHGPLPTWMETPRQRSESLSSRSTMVTSSGAPQTTPHRTFGGGKAAVVLLAVGGQFLLCW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 QHGPLPTWMETPRQRSESLSSRSTMVTSSGAPQTTPHRTFGGGKAAVVLLAVGGQFLLCW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LPYFSFHLYVALSAQPISTGQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 LPYFSFHLYVALSAQPISTGQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 KPAPEEELRLPSREGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAVDFRIPGQIAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 KPAPEEELRLPSREGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAVDFRIPGQIAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB3 ETSEFLEQQLTSDIIMSDSYLRPAASPRLES
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 ETSEFLEQQLTSDIIMSDSYLRPAASPRLES
430 440 450
>>CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 (440 aa)
initn: 347 init1: 165 opt: 452 Z-score: 427.2 bits: 88.2 E(32554): 1.8e-17
Smith-Waterman score: 463; 31.7% identity (58.7% similar) in 407 aa overlap (19-411:2-379)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MESSPIPQSSGNSSTLGRVPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASES----VALFFMLLLDLTA
::. ::: ::...: : .. . :: . ... :::
CCDS19 MVPE-PGP-TANSTPAWGAGPPSAPGGSGWVAAALCVVIALTA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 VAGNAAVMAVIAKTPALRKF--VFVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSALFDHALFGEVA
:.:. ..:.: ::::. :. : ::...:..:: :::. ::. . ....
CCDS19 -AANSLLIALICTQPALRNTSNFFLVSLFTSDLMVGLVVMPPAMLN--ALYGRWVLARGL
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 CRLYLFLSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMA
: :. ..: : .::.. :...:: .. :.::..::: . ....:.: : :.:
CCDS19 CLLWTAFDVMCCSASILNLCLISLDRYLLILSPLRYKLRMTPLRALALVLGAWSLA-ALA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 S-VPVLGRVSWEE---GAPSVPPGCSLQWSHSAYCQLFVVVFAVLYFLLPLLLILVVYCS
: .:.: ..:.: . : :: : : : ::.: . : :.:: : .::
CCDS19 SFLPLL--LGWHELGHARPPVPGQCRLLASLP-----FVLVASGLTFFLPSGAICFTYCR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KB3 MFRVARVAAMQHGPLPTWMETPRQRSESLSSRSTM---VTSSGAPQTTPHRTFGGGKAAV
.. .:: :.: . : : : . : ::.:. : : :. . . . ... . ::..
CCDS19 ILLAARKQAVQVASLTTGMAS--QASETLQVPRTPRPGVESADSRRLATKHSRKALKASL
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 VLLAVGGQFLLCWLPYFSFHLYVALSAQPISTGQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQ
.: . :.:.. :::.: .. :. . :: : . :.::.:: : ::..: . :.
CCDS19 TLGILLGMFFVTWLPFFVANIVQAVC-DCISPGLFD-VLTWLGYCNSTMNPIIYPLFMRD
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 IRGELSKQFVCFFKPAPEEELRLPS-REGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVSRPLPSPKQE
.. :.. : : : : : :..:. :. .. :. : ... :: :
CCDS19 FKRALGR-----FLPCP----RCPRERQASLASPSLRTSHSGPRPGLS-LQQVLPLPL--
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450
pF1KB3 PPAVDFRIPGQIAEETSEFLEQQLTSDIIMSDSYLRPAASPRLES
:: :
CCDS19 PPDSDSDSDAGSGGSSGLRLTAQLLLPGEATQDPPLPTRAAAAVNFFNIDPAEPELRPHP
380 390 400 410 420 430
>>CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 (572 aa)
initn: 419 init1: 173 opt: 405 Z-score: 382.5 bits: 80.3 E(32554): 5.5e-15
Smith-Waterman score: 420; 26.2% identity (55.7% similar) in 465 aa overlap (12-446:65-515)
10 20 30 40
pF1KB3 MESSPIPQSSGNSSTLGRVPQTPGPS-TASGVPEVGLRDVA
: :. :. : . : . ..:. :: :.
CCDS13 AAPSEGPAVGGVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGE-PGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVS
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90
pF1KB3 SESVAL-FFMLLLDLTAVAGNAAVMAVIAKTPALRKFV--FVFHLCLVDLLAALTLMPLA
...:.. :. . : ::::: :. .: . :. . :. .: ..::: . :..:..
CCDS13 AQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFS
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 MLSSSALFDHALFGEVACRLYLFLSVCFVSLAILSVSAINVERYYYVVHPMRYEVRMTLG
.. .. ::.. : .. ..: . .:::. .:.:.:: : : ..: . ::
CCDS13 --ATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTER
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 LVASVLVGVWVKALAMASVPVLGRVSWEEGAPSVPPGCSLQWSHSAYCQLFVVVFAVLYF
.:..:. .:: ::... :.:: :.: .: :.. .. : ..: .: :
CCDS13 KAAAILALLWVVALVVSVGPLLG---WKEPVPPDERFCGI--TEEAG---YAVFSSVCSF
220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 LLPLLLILVVYCSMFRVARVAAMQHGPLPTWMETPRQR-SE---SLSSRSTMVTSSGAP-
::. .:.:.:: .. ::: .. . : . .. : . :: . :.. . ..::
CCDS13 YLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRS---LEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHG
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310
pF1KB3 -QTTPHRTFGGG------------KAAVVLLAVGGQFLLCWLPYFSFHLYVALSAQPIST
... .:: .. ::: .: : : :.:::.:.: .: : .
CCDS13 MRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPS
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 GQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFFKPAPEEE--LRLPSREGSI
: .:. :.::: ::..: : .:... . . . : . ... :. ...
CCDS13 EGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRA
390 400 410 420 430 440
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 EENFLQF----LQGTGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAV-DFRIP-GQIAEETSEFLEQQLT
. :. .: . :. . ::.: :::.. ... : .. . : : : .:
CCDS13 STSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLL
450 460 470 480 490 500
440 450
pF1KB3 SDIIMSDSYLRPAASPRLES
. . . :: .:
CCDS13 GPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIRAGGAQRAEAACAQRSEVEAVSLGVPHEVAEGATCQAYE
510 520 530 540 550 560
>>CCDS1268.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 (529 aa)
initn: 345 init1: 134 opt: 380 Z-score: 359.8 bits: 76.0 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 380; 27.1% identity (58.7% similar) in 317 aa overlap (49-359:34-340)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 VPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGNAAVMAVIAKTPALRKFV-
.... . . :: ...... : : .
CCDS12 NSSLSCRKELSNLTEEEGGEGGVIITQFIAIIVITIFVCLGNLVIVVTLYKKSYLLTLSN
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 -FVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSALFDHALFGEVACRLYLFLSVCFVSLAILSVSAI
::: : : ..: .. ..:... :: . . .:: : : . .: . . : ..:....:
CCDS12 KFVFSLTLSNFLLSVLVLPFVVTSS--IRREWIFGVVWCNFSALLYLLISSASMLTLGVI
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 NVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMASVPVLGRVSWEEGAPSVPPGCS
..::: :..:: : ...: . .. .:: .:...: :..: : : :
CCDS12 AIDRYYAVLYPMVYPMKITGNRAVMALVYIWLHSLIGCLPPLFGWSSVEFDE--FKWMCV
130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 LQWSHSAYCQLFVVVFAVLYFLLPLLLILVVYCSMFRVARVAAMQ-HGPLPTWMETPRQR
: . : .. .:. :.:..:: : .:::::: : . : . .: ::
CCDS12 AAWHREPGYTAFWQIWCALF---PFLVMLVCYGFIFRVARVKARKVHCGTVVIVEEDAQR
180 190 200 210 220 230
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pF1KB3 SESLSSRSTMVTSSGAPQTTPHRTFGGG---KAAVVLLAVGGQFLLCWLPYFSFHLYVAL
. .: :: ..:::. ... . . .. :: ...:.: : :.. : ::. ::
CCDS12 TGRKNS-STSTSSSGSRRNAFQGVVYSANQCKALITILVVLGAFMVTWGPYMVVIASEAL
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 SAQPISTGQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFFKPAPEEELRLPS
.. . ..:. .::... . .:..:: :. .: :: .::
CCDS12 WGKSSVSPSLETWATWLSFASAVCHPLIYGLWNKTVRKELLG--MCFGDRYYREPFVQRQ
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 REGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAVDFRIPGQIAEETSEFLEQQLTS
CCDS12 RTSRLFSISNRITDLGLSPHLTALMAGGQPLGHSSSTGDTGFSCSQDSGTDMMLLEDYTS
360 370 380 390 400 410
>>CCDS72978.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 (546 aa)
initn: 345 init1: 134 opt: 380 Z-score: 359.7 bits: 76.0 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 380; 27.1% identity (58.7% similar) in 317 aa overlap (49-359:51-357)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 VPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGNAAVMAVIAKTPALRKFV-
.... . . :: ...... : : .
CCDS72 NSSLSCRKELSNLTEEEGGEGGVIITQFIAIIVITIFVCLGNLVIVVTLYKKSYLLTLSN
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 -FVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSALFDHALFGEVACRLYLFLSVCFVSLAILSVSAI
::: : : ..: .. ..:... :: . . .:: : : . .: . . : ..:....:
CCDS72 KFVFSLTLSNFLLSVLVLPFVVTSS--IRREWIFGVVWCNFSALLYLLISSASMLTLGVI
90 100 110 120 130
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pF1KB3 NVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMASVPVLGRVSWEEGAPSVPPGCS
..::: :..:: : ...: . .. .:: .:...: :..: : : :
CCDS72 AIDRYYAVLYPMVYPMKITGNRAVMALVYIWLHSLIGCLPPLFGWSSVEFDE--FKWMCV
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 LQWSHSAYCQLFVVVFAVLYFLLPLLLILVVYCSMFRVARVAAMQ-HGPLPTWMETPRQR
: . : .. .:. :.:..:: : .:::::: : . : . .: ::
CCDS72 AAWHREPGYTAFWQIWCALF---PFLVMLVCYGFIFRVARVKARKVHCGTVVIVEEDAQR
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 SESLSSRSTMVTSSGAPQTTPHRTFGGG---KAAVVLLAVGGQFLLCWLPYFSFHLYVAL
. .: :: ..:::. ... . . .. :: ...:.: : :.. : ::. ::
CCDS72 TGRKNS-STSTSSSGSRRNAFQGVVYSANQCKALITILVVLGAFMVTWGPYMVVIASEAL
260 270 280 290 300 310
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pF1KB3 SAQPISTGQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFFKPAPEEELRLPS
.. . ..:. .::... . .:..:: :. .: :: .::
CCDS72 WGKSSVSPSLETWATWLSFASAVCHPLIYGLWNKTVRKELLG--MCFGDRYYREPFVQRQ
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 REGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAVDFRIPGQIAEETSEFLEQQLTS
CCDS72 RTSRLFSISNRITDLGLSPHLTALMAGGQPLGHSSSTGDTGFSCSQDSGTDMMLLEDYTS
380 390 400 410 420 430
>>CCDS58043.1 GPR161 gene_id:23432|Hs108|chr1 (549 aa)
initn: 345 init1: 134 opt: 380 Z-score: 359.6 bits: 76.0 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 380; 27.1% identity (58.7% similar) in 317 aa overlap (49-359:54-360)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 VPQTPGPSTASGVPEVGLRDVASESVALFFMLLLDLTAVAGNAAVMAVIAKTPALRKFV-
.... . . :: ...... : : .
CCDS58 NSSLSCRKELSNLTEEEGGEGGVIITQFIAIIVITIFVCLGNLVIVVTLYKKSYLLTLSN
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 -FVFHLCLVDLLAALTLMPLAMLSSSALFDHALFGEVACRLYLFLSVCFVSLAILSVSAI
::: : : ..: .. ..:... :: . . .:: : : . .: . . : ..:....:
CCDS58 KFVFSLTLSNFLLSVLVLPFVVTSS--IRREWIFGVVWCNFSALLYLLISSASMLTLGVI
90 100 110 120 130 140
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 NVERYYYVVHPMRYEVRMTLGLVASVLVGVWVKALAMASVPVLGRVSWEEGAPSVPPGCS
..::: :..:: : ...: . .. .:: .:...: :..: : : :
CCDS58 AIDRYYAVLYPMVYPMKITGNRAVMALVYIWLHSLIGCLPPLFGWSSVEFDE--FKWMCV
150 160 170 180 190
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pF1KB3 LQWSHSAYCQLFVVVFAVLYFLLPLLLILVVYCSMFRVARVAAMQ-HGPLPTWMETPRQR
: . : .. .:. :.:..:: : .:::::: : . : . .: ::
CCDS58 AAWHREPGYTAFWQIWCALF---PFLVMLVCYGFIFRVARVKARKVHCGTVVIVEEDAQR
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pF1KB3 SESLSSRSTMVTSSGAPQTTPHRTFGGG---KAAVVLLAVGGQFLLCWLPYFSFHLYVAL
. .: :: ..:::. ... . . .. :: ...:.: : :.. : ::. ::
CCDS58 TGRKNS-STSTSSSGSRRNAFQGVVYSANQCKALITILVVLGAFMVTWGPYMVVIASEAL
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 SAQPISTGQVESVVTWIGYFCFTSNPFFYGCLNRQIRGELSKQFVCFFKPAPEEELRLPS
.. . ..:. .::... . .:..:: :. .: :: .::
CCDS58 WGKSSVSPSLETWATWLSFASAVCHPLIYGLWNKTVRKELLG--MCFGDRYYREPFVQRQ
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 REGSIEENFLQFLQGTGCPSESWVSRPLPSPKQEPPAVDFRIPGQIAEETSEFLEQQLTS
CCDS58 RTSRLFSISNRITDLGLSPHLTALMAGGQPLGHSSSTGDTGFSCSQDSGTDMMLLEDYTS
380 390 400 410 420 430
>>CCDS2838.1 GPR62 gene_id:118442|Hs108|chr3 (368 aa)
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20 30 40 50 60 70
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:..:.. .... :. ::.:...:. .::.
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:: ... :::.:::::: ..:::..:.. . .. .: . :: :::. .. :
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.:.:... :: .:::.: : :: :..::. : .... .:: . : .
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: ::. .. : ..:.: : :: ::.: .: ..: ::: ::.. : :. .
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: .:.::.:: ... : :. . :::::.. :::: :: :::::
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220 230 240 250
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: : ....:..:::..: :...::.:: :.: .: :.::.. . :.:
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.: . .. . .:: :: : :. . : .:.: : . : :. : :.:
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:: :. : .:.. . . : ...: ..:.
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10 20 30 40 50
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:..:: :. .: . :: . :. .: ..::: ..:..:.. .. .. . ..:.
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. : .. ..: . .:::. ::...:: : . ..: . .: . .:..::: . .
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.. :.:: :.: ::. :.. . : ..:. : : .:: .:::.:: .
CCDS43 ISIGPLLG---WKEPAPNDDKECGVTE------EPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRV
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. ::. . .. : . : . .. . . :.. ..:. : .:. ...
CCDS43 YIVAKRTTKNLEAGVMKE-MSNSKELTLRIHSKNFHEDTLSSTKAKGHNPRSSIAVKLFK
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::: .: : :.:.:::::.: .. : .:. .: : .:: :.:::
CCDS43 FSREKKAAKTLGIVVGMFILCWLPFFIALPLGSLFSTLKP--PDAVFKVVFWLGYFNSCL
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::..: : ..... . . . : . ... : : :. .. . .:
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CCDS43 KDSLDDSGSCLSGSQRTLPSASPSPGYLGRGAPPPVELCAFPEWKAPGALLSLPAPEPPG
410 420 430 440 450 460
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CCDS43 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGN
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. : :.. . ::. : ::. : . :::.:. .:: .. : : :: : .
CCDS43 TLVCAAVIRFRHLRSKVTNFFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGF--WPFGSF-CNI
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CCDS43 WVAFDIMCSTASILNLCVISVDRYWAISSPFRYERKMT-PKAAFILISVAWTLSVLISFI
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:: ..::... :. : . :: . :. . ... .:. : .:. ...:.:
CCDS43 PV--QLSWHKAKPTSPSDGNATSLAETIDNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYT
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..:.: :.::.... . . . .. .. . : : :... . .:
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..:. .: ..: .: . :. :: :. ...:: . ...: :
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CCDS43 EPRGSISKECNLV-YLIPHAVG--SSEDLKKEEAAGIARPLEKLSPALSVILDYDTDVSL
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CCDS73 MNPPSGPRVPPSPTQEPSCMATPAPPSWWDSSQSSISSLGRLPSISPTAPGTWAAAWVPL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
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: . : : ... .::. ::.. :: .:. .. .. .:: .:...: . :.:
CCDS73 PTVDVPDHAHYTLGTV-ILLVGLTGMLGNLTVIYTFCRSRSLRTPANMFIINLAVSDFLM
70 80 90 100 110
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..: :. . .:.:. . ::::..:..: : .. : ......:: ..:: ...:.
CCDS73 SFTQAPV--FFTSSLYKQWLFGETGCEFYAFCGALFGISSMITLTAIALDRYLVITRPLA
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. .: ::.:::. ::: . : .: : .: .. .:: .. : . .
CCDS73 TFGVASKRRAAFVLLGVWLYALAWSLPPFFG---WSAYVPEGLLTSCSWDYMSFTPAVRA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]