Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3726
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3726, 859 aa
1>>>pF1KB3726 859 - 859 aa - 859 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1967+/-0.0011; mu= 11.7665+/- 0.066
mean_var=105.0347+/-21.494, 0's: 0 Z-trim(106.3): 188 B-trim: 289 in 1/51
Lambda= 0.125143
statistics sampled from 8688 (8883) to 8688 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 3.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10999.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 859) 5640 1029.6 0
CCDS54060.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 813) 5316 971.1 0
CCDS11000.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 822) 5070 926.6 0
CCDS73936.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 641) 4094 750.4 2.3e-216
CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1271) 3778 693.4 6.3e-199
CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1227) 2306 427.7 6.2e-119
CCDS58497.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 310) 1694 317.0 3.3e-86
CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 548) 474 96.8 1.1e-19
CCDS74082.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 ( 889) 474 96.9 1.7e-19
CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs108|chr2 ( 475) 440 90.7 6.8e-18
CCDS56147.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 334) 421 87.2 5.4e-17
CCDS46454.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 433) 421 87.2 6.8e-17
CCDS46455.1 CHN1 gene_id:1123|Hs108|chr2 ( 459) 421 87.2 7.1e-17
CCDS59214.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 ( 794) 421 87.3 1.2e-16
CCDS73082.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 ( 799) 421 87.3 1.2e-16
CCDS59215.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 ( 816) 421 87.3 1.2e-16
CCDS59216.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 ( 841) 421 87.3 1.2e-16
CCDS7170.1 ARHGAP12 gene_id:94134|Hs108|chr10 ( 846) 421 87.3 1.2e-16
CCDS74299.1 SYDE1 gene_id:85360|Hs108|chr19 ( 668) 401 83.7 1.2e-15
CCDS12324.1 SYDE1 gene_id:85360|Hs108|chr19 ( 735) 401 83.7 1.3e-15
CCDS47566.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 332) 383 80.3 6.2e-15
CCDS1215.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1 ( 890) 390 81.7 6.3e-15
CCDS30918.1 ARHGAP30 gene_id:257106|Hs108|chr1 (1101) 390 81.7 7.6e-15
CCDS5420.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 468) 383 80.4 8.4e-15
CCDS7144.2 ARHGAP21 gene_id:57584|Hs108|chr10 (1958) 393 82.4 8.8e-15
CCDS44769.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (2087) 384 80.8 2.9e-14
CCDS31718.1 ARHGAP32 gene_id:9743|Hs108|chr11 (1738) 378 79.6 5.1e-14
CCDS54254.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19 (1123) 372 78.5 7.4e-14
CCDS12477.1 ARHGAP33 gene_id:115703|Hs108|chr19 (1126) 372 78.5 7.4e-14
CCDS56027.1 ARHGAP23 gene_id:57636|Hs108|chr17 (1491) 373 78.7 8.4e-14
CCDS45095.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14 (1501) 368 77.8 1.6e-13
CCDS32062.1 ARHGAP5 gene_id:394|Hs108|chr14 (1502) 365 77.3 2.3e-13
CCDS13952.2 SH3BP1 gene_id:23616|Hs108|chr22 ( 701) 358 75.9 2.8e-13
CCDS8795.1 RACGAP1 gene_id:29127|Hs108|chr12 ( 632) 357 75.7 2.9e-13
CCDS43135.1 ARHGAP31 gene_id:57514|Hs108|chr3 (1444) 359 76.2 4.7e-13
CCDS46127.1 ARHGAP35 gene_id:2909|Hs108|chr19 (1499) 357 75.8 6.2e-13
CCDS3611.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 655) 347 73.9 1e-12
CCDS43246.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 653) 342 73.0 1.9e-12
CCDS58079.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 608) 341 72.8 2e-12
CCDS34025.1 ARHGAP24 gene_id:83478|Hs108|chr4 ( 748) 342 73.0 2.2e-12
CCDS11845.1 RALBP1 gene_id:10928|Hs108|chr18 ( 655) 341 72.8 2.2e-12
CCDS7227.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 698) 341 72.8 2.3e-12
CCDS58081.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 704) 341 72.8 2.3e-12
CCDS58080.1 ARHGAP22 gene_id:58504|Hs108|chr10 ( 714) 341 72.8 2.4e-12
CCDS34075.1 ARHGAP10 gene_id:79658|Hs108|chr4 ( 786) 336 71.9 4.8e-12
CCDS32408.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 ( 803) 325 70.0 1.9e-11
CCDS32409.1 ARHGAP17 gene_id:55114|Hs108|chr16 ( 881) 325 70.0 2.1e-11
CCDS78219.1 CHN2 gene_id:1124|Hs108|chr7 ( 274) 315 68.0 2.6e-11
CCDS47297.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 ( 759) 319 68.9 3.9e-11
CCDS4277.1 ARHGAP26 gene_id:23092|Hs108|chr5 ( 814) 319 68.9 4.2e-11
>>CCDS10999.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 (859 aa)
initn: 5640 init1: 5640 opt: 5640 Z-score: 5504.4 bits: 1029.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5640; 100.0% identity (100.0% similar) in 859 aa overlap (1-859:1-859)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MEPLSHRGLPRLSWIDTLYSNFSYGTDEYDGEGNEEQKGPPEGSETMPYIDESPTMSPQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MEPLSHRGLPRLSWIDTLYSNFSYGTDEYDGEGNEEQKGPPEGSETMPYIDESPTMSPQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SARSQGGGDGVSPTPPEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SARSQGGGDGVSPTPPEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 EESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEKANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEKANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 NSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 KLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 RVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 QTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 PYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 LKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 RVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESKAHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESKAHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQH
790 800 810 820 830 840
850
pF1KB3 PPISFAELKRNTLYFSTDV
:::::::::::::::::::
CCDS10 PPISFAELKRNTLYFSTDV
850
>>CCDS54060.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 (813 aa)
initn: 5316 init1: 5316 opt: 5316 Z-score: 5188.6 bits: 971.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5316; 100.0% identity (100.0% similar) in 813 aa overlap (47-859:1-813)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 TLYSNFSYGTDEYDGEGNEEQKGPPEGSETMPYIDESPTMSPQLSARSQGGGDGVSPTPP
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MPYIDESPTMSPQLSARSQGGGDGVSPTPP
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 EGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQI
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 ETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALE
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 TAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKH
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 TPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSR
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 KLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHE
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 LEDMKMKISALKSEIQKEKANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LEDMKMKISALKSEIQKEKANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKS
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 YLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDD
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 DESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFE
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 IELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMN
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 GIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGI
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KB3 EEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDR
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KB3 LYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNL
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830 840 850
pF1KB3 ATVFGPTLLRPSEVESKAHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ATVFGPTLLRPSEVESKAHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFS
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 TDV
:::
CCDS54 TDV
>>CCDS11000.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 (822 aa)
initn: 5062 init1: 5062 opt: 5070 Z-score: 4948.5 bits: 926.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5070; 98.5% identity (98.9% similar) in 793 aa overlap (72-859:30-822)
50 60 70 80 90
pF1KB3 EGSETMPYIDESPTMSPQLSARSQGGGDGVSPTPPEGLAP-----GVEAGKGLEMRKLVL
.:: : . .: ::::::::::::::
CCDS11 MEEEEEAIGLLDKVLEDEDVFLLEECELGTPTSPGSGSPFLVAVKVEAGKGLEMRKLVL
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 SGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDN
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 LCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELK
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 VKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQN
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 FLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKT
240 250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 SAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEKA
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 NKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQK
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 LQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGF
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 KQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDK
480 490 500 510 520 530
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 TKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRT
540 550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 PSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKA
600 610 620 630 640 650
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 VFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENC
660 670 680 690 700 710
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 MMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESKAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESKAHL
720 730 740 750 760 770
820 830 840 850
pF1KB3 TSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
780 790 800 810 820
>>CCDS73936.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 (641 aa)
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Smith-Waterman score: 4094; 100.0% identity (100.0% similar) in 626 aa overlap (234-859:16-641)
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 SNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MEILLIIRFCCNCTYALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPD
10 20 30 40
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 YPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 YPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFL
50 60 70 80 90 100
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 FTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMK
110 120 130 140 150 160
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 ISALKSEIQKEKANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ISALKSEIQKEKANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSS
170 180 190 200 210 220
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 DYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLY
230 240 250 260 270 280
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 GFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQ
290 300 310 320 330 340
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 SLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFS
350 360 370 380 390 400
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 MKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYR
410 420 430 440 450 460
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pF1KB3 ISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFME
470 480 490 500 510 520
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 GIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPT
530 540 550 560 570 580
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pF1KB3 LLRPSEVESKAHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLRPSEVESKAHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
590 600 610 620 630 640
>>CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1271 aa)
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Smith-Waterman score: 3778; 68.1% identity (86.9% similar) in 847 aa overlap (23-859:429-1271)
10 20 30 40
pF1KB3 MEPLSHRGLPRLSWIDTLYSNFSYGTDEYDG---EGNEEQKGPPEGSETMPY
:.:: : . :::. .: .::
CCDS13 VSEATIVGVRKTGQIWPNDGEGAFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDG---LPY
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50 60 70 80 90 100
pF1KB3 IDESPTMSPQLSARSQGGGDG-VSPTPPEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYIN
::.::. ::.::....:. :. :: . : .. ::::::: ::::.::::: :..
CCDS13 IDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLS
460 470 480 490 500 510
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 QLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQV
.:::::::::::::.::::::::: :::::::.:. ..:::::::::.: :.::::. :
CCDS13 HLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQ
520 530 540 550 560 570
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 TMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHT
.: ::::::::::::.:::::: ::.: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :
CCDS13 RVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTT
580 590 600 610 620 630
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 SVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPR
. ..:.:::::.::::::::::::::::::..:::.:::::::::::::::::::.: ::
CCDS13 KNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPR
640 650 660 670 680 690
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 RTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKW
: ..:. ::: :::.::.:.::. :..:::::::::::.:::.:::: :.:: :::::::
CCDS13 RQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKW
700 710 720 730 740 750
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 YIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERL
::::.:: : .: :: :.. ::.::. .:.::: .:..::.:: :::: :.: :::
CCDS13 YIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDEELDALKIKISQIKNDIQREKRANKG-SKATERL
760 770 780 790 800 810
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 KKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVL
:::. :.: :::: ::.. ::.:.:::::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :
CCDS13 KKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNGKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSL
820 830 840 850 860 870
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 SSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLE
.:::::.::.:: ::.:::.::.: ::.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::
CCDS13 TSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLE
880 890 900 910 920 930
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 VDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIV
::::::::.::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::.:::. :...: .
CCDS13 VDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGEST
940 950 960 970 980 990
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 DKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGV
:..:::::.:::::... ..:. :: ::::.:..:.::.::..:::: ::.::::::::
CCDS13 DRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 KISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILL
::.::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.::::::::::::.::.::::. .
CCDS13 KIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 MLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDP
:.:.::.::::::::::::::::::.::..:: : ::::::::.:::.::..:: :::.
CCDS13 MMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEA
1120 1130 1140 1150 1160 1170
770 780 790 800 810 820
pF1KB3 NLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADI
::.::::::.::::::::: .::::::::::::::::::::: ::: .. . .:
CCDS13 NLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDS
1180 1190 1200 1210 1220 1230
830 840 850
pF1KB3 WSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
:: .::.:::::::.:: : . ::... :::.:
CCDS13 WSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV
1240 1250 1260 1270
>>CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1227 aa)
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10 20 30 40
pF1KB3 MEPLSHRGLPRLSWIDTLYSNFSYGTDEYDG---EGNEEQKGPPEGSETMPY
:.:: : . :::. .: .::
CCDS13 VSEATIVGVRKTGQIWPNDGEGAFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDG---LPY
400 410 420 430 440 450
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 IDESPTMSPQLSARSQGGGDG-VSPTPPEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYIN
::.::. ::.::....:. :. :: . : .. ::::::: ::::.::::: :..
CCDS13 IDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLS
460 470 480 490 500 510
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 QLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQV
.:::::::::::::.::::::::: :::::::.:. ..:::::::::.: :.::::. :
CCDS13 HLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQ
520 530 540 550 560 570
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 TMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHT
.: ::::::::::::.:::::: ::.: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :
CCDS13 RVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTT
580 590 600 610 620 630
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 SVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPR
. ..:.:::::.::::::::::::::::::..:::.:::::::::::::::::::.: ::
CCDS13 KNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPR
640 650 660 670 680 690
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 RTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKW
: ..:. ::: :::.::.:.::. :..:::::::::::.:::.:::: :.:: :::::::
CCDS13 RQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKW
700 710 720 730 740 750
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 YIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERL
::::.:: : .: :: :.. ::.::. .:.::: .:..::.:: :::: :.: :::
CCDS13 YIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDEELDALKIKISQIKNDIQREKRANKG-SKATERL
760 770 780 790 800 810
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 KKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVL
:::. :.: :::: ::.. ::.:.:::::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :
CCDS13 KKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNGKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSL
820 830 840 850 860 870
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 SSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLE
.:::::.::.:: ::.:::.::.: ::.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::
CCDS13 TSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLE
880 890 900 910 920 930
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 VDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIV
::::::::.::::::.::::::.:.:
CCDS13 VDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNE----------------------------------
940 950 960
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 DKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGV
::::... ..:. :: ::::.:..:.::.::..:::: ::.::::::::
CCDS13 ----------LDPQALQDRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGV
970 980 990 1000 1010
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 KISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILL
::.::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.::::::::::::.::.::::. .
CCDS13 KIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 MLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDP
:.:.::.::::::::::::::::::.::..:: : ::::::::.:::.::..:: :::.
CCDS13 MMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEA
1080 1090 1100 1110 1120 1130
770 780 790 800 810 820
pF1KB3 NLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADI
::.::::::.::::::::: .::::::::::::::::::::: ::: .. . .:
CCDS13 NLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDS
1140 1150 1160 1170 1180 1190
830 840 850
pF1KB3 WSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
:: .::.:::::::.:: : . ::... :::.:
CCDS13 WSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV
1200 1210 1220
>>CCDS58497.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 (310 aa)
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Smith-Waterman score: 1694; 99.6% identity (100.0% similar) in 263 aa overlap (597-859:48-310)
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 ILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKF
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLALEESGSKRPPNTGARLWGRVRNKLLRNKLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKF
20 30 40 50 60 70
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 TSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISG
80 90 100 110 120 130
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 VATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIA
140 150 160 170 180 190
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 LSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLR
200 210 220 230 240 250
810 820 830 840 850
pF1KB3 PSEVESKAHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSEVESKAHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
260 270 280 290 300 310
>>CCDS11498.1 ARHGAP27 gene_id:201176|Hs108|chr17 (548 aa)
initn: 492 init1: 454 opt: 474 Z-score: 466.9 bits: 96.8 E(32554): 1.1e-19
Smith-Waterman score: 474; 40.8% identity (67.3% similar) in 211 aa overlap (613-817:319-526)
590 600 610 620 630
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.: . ::. .. :: .: .:. : .
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. ::: .... .::::.:: .:.::.. :: ::.. :.::::: . :: :. :
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... : :.: :...:.:.:::.::::::::. . :. .: :.: : . :
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. :.:::: :: :. .:..:: :: :. :.::....: ::::::::: :.. .
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:
CCDS11 TMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
530 540
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Smith-Waterman score: 474; 40.8% identity (67.3% similar) in 211 aa overlap (613-817:660-867)
590 600 610 620 630
pF1KB3 NNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSM-KFTSRDMSLK--RTPSK
.: . ::. .. :: .: .:. : .
CCDS74 FGSSERLGSWQEKEEDARPNAAAPALGPVGLESDLSKVRHKLRKFLQRRPTLQSLREKGY
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. ::: .... .::::.:: .:.::.. :: ::.. :.::::: . :: :. :
CCDS74 IKDQVFGCALAALCERERSRVPRFVQQCIRAVEARGLDIDGLYRISGNLATIQKLRYKVD
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... : :.: :...:.:.:::.::::::::. . :. .: :.: : . :
CCDS74 HDER---LDLDDGRWEDVHVITGALKLFFRELPEPLFPFSHFRQFIAAIKLQDQARRSRC
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. :.:::: :: :. .:..:: :: :. :.::....: ::::::::: :.. .
CCDS74 VRDLVRSLPAPNHDTLRMLFQHLCRVIEHGEQNRMSVQSVAIVFGPTLLRPEVEETSMPM
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820 830 840 850
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:
CCDS74 TMVFQNQVVELILQQCADIFPPH
870 880
>>CCDS2184.1 ARHGAP15 gene_id:55843|Hs108|chr2 (475 aa)
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580 590 600 610 620 630
pF1KB3 NKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSK
.:. . : .: ... :: .: ::: :
CCDS21 TELLSHYDSDIKEQKPEHRKSLMFRLHHSASDTSDKNRVKSRLK-KFITRRPSLKTLQEK
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pF1KB3 K--QTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAV
. .:: .. : .:: : ::..:.::.: :::::.. ::::.:: . :: :. .
CCDS21 GLIKDQIFGSHLHKVCERENSTVPWFVKQCIEAVEKRGLDVDGIYRVSGNLATIQKLRFI
280 290 300 310 320 330
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. ..: : :.: ::....:.::..::::::::. .. :.:.: .: ..
CCDS21 VNQEEK---LNLDDSQWEDIHVVTGALKMFFRELPEPLFPYSFFEQFVEAIKKQDNNTRI
340 350 360 370 380
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. . :...:: :: :. :. :: ... : : :: ..:. ::::::::
CCDS21 EAVKSLVQKLPPPNRDTMKVLFGHLTKIVAKASKNLMSTQSLGIVFGPTLLRAENETGNM
390 400 410 420 430 440
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CCDS21 AIHMVYQNQIAELMLSEYSKIFGSEED
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859 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 13:50:51 2016 done: Thu Nov 3 13:50:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]