Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3547
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3547, 1091 aa
1>>>pF1KB3547 1091 - 1091 aa - 1091 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0590+/-0.0012; mu= 17.4436+/- 0.072
mean_var=68.5930+/-13.266, 0's: 0 Z-trim(101.2): 30 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.154858
statistics sampled from 6420 (6439) to 6420 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 2.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5598.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7 (1091) 7301 1641.1 0
CCDS33763.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1143) 3954 893.4 0
CCDS63647.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1145) 3937 889.6 0
CCDS77748.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1076) 3907 882.9 0
CCDS54588.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1150) 3186 721.8 2.1e-207
CCDS78253.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7 ( 309) 1898 433.9 2.6e-121
CCDS44785.1 CACNA2D4 gene_id:93589|Hs108|chr12 (1137) 1291 298.4 5.9e-80
CCDS54598.1 CACNA2D3 gene_id:55799|Hs108|chr3 (1091) 1015 236.8 2.1e-61
>>CCDS5598.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7 (1091 aa)
initn: 7301 init1: 7301 opt: 7301 Z-score: 8805.8 bits: 1641.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7301; 100.0% identity (100.0% similar) in 1091 aa overlap (1-1091:1-1091)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSWVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSWVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 YEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EVVYYNAKDDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIEDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EVVYYNAKDDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIEDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIML
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 FTDGGEERAQEIFNKYNKDKKVRVFTFSVGQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FTDGGEERAQEIFNKYNKDKKVRVFTFSVGQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 INTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVYLDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 INTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVYLDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKNPKSQEPVTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKNPKSQEPVTL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 DFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 ALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARSKKGKMKDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARSKKGKMKDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 SDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLINRVLLDAGFTNELVQNYWSKQKNIKGVKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLINRVLLDAGFTNELVQNYWSKQKNIKGVKAR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 FVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYEDSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKSGPGAYESGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYEDSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKSGPGAYESGI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 MVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKIDVNSWIENFTKTSIRDPCAGPVCDCKRNSDVMDCVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKIDVNSWIENFTKTSIRDPCAGPVCDCKRNSDVMDCVI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 LDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 GAGHRSAYVPSVADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEMEDDDFTASLSKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GAGHRSAYVPSVADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEMEDDDFTASLSKQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 SCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 QAEQTSDGPNPCDMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QAEQTSDGPNPCDMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090
pF1KB3 WLVSGSTHRLL
:::::::::::
CCDS55 WLVSGSTHRLL
1090
>>CCDS33763.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1143 aa)
initn: 3297 init1: 779 opt: 3954 Z-score: 4764.2 bits: 893.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3954; 54.6% identity (78.9% similar) in 1097 aa overlap (7-1080:44-1124)
10 20 30
pF1KB3 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGP-SSEEPFPSAVTIKS
: : : :. :: .: .: ::. :..
CCDS33 GPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLP-LLAAPGASAYSFPQQHTMQH
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 WVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSK
:. ...... . . .::.:: .::. ..:. :. :. ..::: .: :::.::. . .
CCDS33 WARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQ
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 ALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDL---DPEKNDSEPGSQ--RIKPVFI
:: ::: ::. : ::.:.... ...:::.:: : :::..: : ::. .. ::
CCDS33 ALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFI
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 EDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGS
:: :: ...:..:::.::::::.:::..::::::: ::..:: .::..::.::::::::
CCDS33 EDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGS
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 ATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLK
:::..:::::.:: :.:.:::::::::::::::::.:::::.:.:::::::::::::
CCDS33 ATGVTRYYPATPW----RAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLK
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 LIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGI
:..::: :::.::::::.::::::: .:: :::: ::::::::::::.:.::....:::
CCDS33 LMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGT
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KB3 TDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTFSV
: :: :: .::.:: : :..::::::.::.::::::.:.:..:.::: .. ::::::::
CCDS33 TGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSV
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 GQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNV
:::::: :.::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::
CCDS33 GQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNV
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 YLDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPN
: ::: ::::.::::::::.: .. . ::::::::::.::.:.::::::: .:: :
CCDS33 YEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQ--DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGAN
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 GYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKNPKSQEPVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTF
:: :::: ::::::::::.:.. . .:::::::::::::.. : ::: .::::..:.: .
CCDS33 GYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQI
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 RTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSLALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARSKKGK
:::::: ::::::. .:.:::.:. .:.:::.:::: :: .:..:.: . : :
CCDS33 RTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQ-------
610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 MKDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKISDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADL
.: : : :..:: :..:::::.::.::. :::::::: :: :.... ::.. .:: :
CCDS33 VKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFL
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 INRVLLDAGFTNELVQNYWSKQK-NIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYE
.. ..::.:.:..::. : : : .. : :..::::::::.:..:.:.: :::: ..
CCDS33 LHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFN
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 DSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKS-GPGAYES---GIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKI
:::.::::: .::: :. . : :. ::.:: :::. . . :.:::::.:.
CCDS33 ASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKL
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850
pF1KB3 DVNSWIENF-----TKTSIRDP--CAGPV--C--DCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHD
:...: :.: ..: .: : :: : ::. :.. . ::..::::::...:..
CCDS33 DLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKC-GPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQN
840 850 860 870 880 890
860 870 880 890 900 910
pF1KB3 DYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVA
.:.::::.:.: .:: : : : :. ..:::::..: : . ::. :...::.::
CCDS33 HQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVA
900 910 920 930 940 950
920 930 940 950 960 970
pF1KB3 DILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDN
:.:...::..:::::..::.: .: . ..: : . . ..::. .::::.: .
CCDS33 DFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEG-SPETRESSCVMKQTQYYFGS
960 970 980 990 1000 1010
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB3 DSKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQTSDGPNPCD
. :.....:::::::.::...: ::::.:...:. :.. :.: : ::::. :.
CCDS33 VNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHSDGPEQCE
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB3 MVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL
.:..::::.:: .::: :. :: .::: ... ::: ....:.:::
CCDS33 LVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
CCDS33 HASRRL
1140
>>CCDS63647.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1145 aa)
initn: 3345 init1: 779 opt: 3937 Z-score: 4743.7 bits: 889.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3937; 54.4% identity (78.8% similar) in 1099 aa overlap (7-1080:44-1126)
10 20 30
pF1KB3 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGP-SSEEPFPSAVTIKS
: : : :. :: .: .: ::. :..
CCDS63 GPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLP-LLAAPGASAYSFPQQHTMQH
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 WVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSK
:. ...... . . .::.:: .::. ..:. :. :. ..::: .: :::.::. . .
CCDS63 WARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQ
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 ALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDL---DPEKNDSEPGSQ--RIKPVFI
:: ::: ::. : ::.:.... ...:::.:: : :::..: : ::. .. ::
CCDS63 ALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFI
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 EDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGS
:: :: ...:..:::.::::::.:::..::::::: ::..:: .::..::.::::::::
CCDS63 EDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGS
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 ATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLK
:::..:::::.:: :.:.:::::::::::::::::.:::::.:.:::::::::::::
CCDS63 ATGVTRYYPATPW----RAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLK
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 LIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGI
:..::: :::.::::::.::::::: .:: :::: ::::::::::::.:.::....:::
CCDS63 LMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGT
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KB3 TDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTFSV
: :: :: .::.:: : :..::::::.::.::::::.:.:..:.::: .. ::::::::
CCDS63 TGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSV
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 GQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNV
:::::: :.::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::
CCDS63 GQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNV
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 YLDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPN
: ::: ::::.::::::::.: .. . ::::::::::.::.:.::::::: .:: :
CCDS63 YEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQ--DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGAN
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 GYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKNPKSQEPVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTF
:: :::: ::::::::::.:.. . .:::::::::::::.. : ::: .::::..:.: .
CCDS63 GYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQI
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 RTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSLALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARSKKGK
:::::: ::::::. .:.:::.:. .:.:::.:::: :: .:..:.: . : :
CCDS63 RTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQ-------
610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 MKDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKISDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADL
.: : : :..:: :..:::::.::.::. :::::::: :: :.... ::.. .:: :
CCDS63 VKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFL
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 INRVLLDAGFTNELVQNYWSKQK-NIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYE
.. ..::.:.:..::. : : : .. : :..::::::::.:..:.:.: :::: ..
CCDS63 LHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFN
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 DSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKS-GPGAYES---GIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKI
:::.::::: .::: :. . : :. ::.:: :::. . . :.:::::.:.
CCDS63 ASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKL
780 790 800 810 820 830
810 820 830 840 850
pF1KB3 DVNSWIENF-----TKTSIRDP--CAGPV--C--DCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHD
:...: :.: ..: .: : :: : ::. :.. . ::..::::::...:..
CCDS63 DLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKC-GPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQN
840 850 860 870 880 890
860 870 880 890 900 910
pF1KB3 DYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVA
.:.::::.:.: .:: : : : :. ..:::::..: : . ::. :...::.::
CCDS63 HQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVA
900 910 920 930 940 950
920 930 940 950 960 970
pF1KB3 DILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDN
:.:...::..:::::..::.: .: . ..: : . . ..::. .::::.: .
CCDS63 DFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEG-SPETRESSCVMKQTQYYFGS
960 970 980 990 1000 1010
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB3 DSKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQ--TSDGPNP
. :.....:::::::.::...: ::::.:...:. :.. :.: : .:::.
CCDS63 VNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQ
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB3 CDMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL
:..:..::::.:: .::: :. :: .::: ... ::: ....:.:::
CCDS63 CELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQV
1080 1090 1100 1110 1120 1130
CCDS63 LVHASRRL
1140
>>CCDS77748.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1076 aa)
initn: 3345 init1: 779 opt: 3907 Z-score: 4707.9 bits: 882.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3907; 54.8% identity (79.4% similar) in 1072 aa overlap (33-1080:1-1057)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 AGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSWVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYE
.. :. ...... . . .::.:: .::.
CCDS77 MQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 KYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEV
..:. :. :. ..::: .: :::.::. . .:: ::: ::. : ::.:.... ...
CCDS77 DNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDI
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB3 VYYNAKDDL---DPEKNDSEPGSQ--RIKPVFIEDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGST
:::.:: : :::..: : ::. .. :::: :: ...:..:::.::::::.:::
CCDS77 VYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGST
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 IVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYD
..::::::: ::..:: .::..::.:::::::::::..:::::.:: :.:.::::::
CCDS77 VILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPW----RAPKKIDLYD
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 VRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSN
:::::::::::.:::::.:.::::::::::::::..::: :::.::::::.::::::: .
CCDS77 VRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEK
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 AQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKI
:: :::: ::::::::::::.:.::....::: : :: :: .::.:: : :..::::::.
CCDS77 AQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKM
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 IMLFTDGGEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTFSVGQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSI
::.::::::.:.:..:.::: .. :::::::::::::: :.::::: :::::.:::::
CCDS77 IMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSI
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 GAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVYLDALELGLVITGTLPVFNITGQFENK
:::::::::::::::::::::: .:::::::::: ::: ::::.::::::::.: ..
CCDS77 GAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQ--DGP
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 TNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKNPKSQE
. ::::::::::.::.:.::::::: .:: ::: :::: ::::::::::.:.. . .:
CCDS77 GEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFRE
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 PVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGT
::::::::::::.. : ::: .::::..:.: .:::::: ::::::. .:.:::.:. .:
CCDS77 PVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRST
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 DYSLALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARSKKGKMKDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCN
.:::.:::: :: .:..:.: . : : .: : : :..:: :..:::::.::.
CCDS77 NYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQ-------VKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCK
570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 DLKISDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLINRVLLDAGFTNELVQNYWSKQK-NIK
::. :::::::: :: :.... ::.. .:: :.. ..::.:.:..::. : : :
CCDS77 DLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTY
620 630 640 650 660 670
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 GVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYEDSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKS-GPG
.. : :..::::::::.:..:.:.: :::: .. :::.::::: .::: :. . :
CCDS77 SLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPL
680 690 700 710 720 730
780 790 800 810 820
pF1KB3 AYES---GIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKIDVNSWIENF-----TKTSIRDP--CAG
:. ::.:: :::. . . :.:::::.:.:...: :.: ..: .: : :
CCDS77 ELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKC-G
740 750 760 770 780 790
830 840 850 860 870 880
pF1KB3 PV--C--DCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVY
: : ::. :.. . ::..::::::...:.. .:.::::.:.: .:: : : : :
CCDS77 PNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFY
800 810 820 830 840 850
890 900 910 920 930 940
pF1KB3 AFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFP
. ..:::::..: : . ::. :...::.:::.:...::..:::::..::.: .: .
CCDS77 TRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYH
860 870 880 890 900 910
950 960 970 980 990 1000
pF1KB3 RLLEAVEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTN
..: : . . ..::. .::::.: . . :.....:::::::.::...: :::
CCDS77 SWFQADPAEAEG-SPETRESSCVMKQTQYYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTN
920 930 940 950 960 970
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB3 LIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQ--TSDGPNPCDMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTD
:.:...:. :.. :.: : .:::. :..:..::::.:: .::: :. :: .:
CCDS77 LLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSD
980 990 1000 1010 1020 1030
1060 1070 1080 1090
pF1KB3 CGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL
:: ... ::: ....:.:::
CCDS77 CGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVHASRRL
1040 1050 1060 1070
>>CCDS54588.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1150 aa)
initn: 3029 init1: 920 opt: 3186 Z-score: 3836.9 bits: 721.8 E(32554): 2.1e-207
Smith-Waterman score: 3993; 54.8% identity (79.4% similar) in 1097 aa overlap (7-1080:44-1131)
10 20 30
pF1KB3 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGP-SSEEPFPSAVTIKS
: : : :. :: .: .: ::. :..
CCDS54 GPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLP-LLAAPGASAYSFPQQHTMQH
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 WVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSK
:. ...... . . .::.:: .::. ..:. :. :. ..::: .: :::.::. . .
CCDS54 WARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQ
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 ALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDL---DPEKNDSEPGSQ--RIKPVFI
:: ::: ::. : ::.:.... ...:::.:: : :::..: : ::. .. ::
CCDS54 ALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFI
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 EDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGS
:: :: ...:..:::.::::::.:::..::::::: ::..:: .::..::.::::::::
CCDS54 EDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGS
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 ATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLK
:::..:::::.:: :.:.:::::::::::::::::.:::::.:.:::::::::::::
CCDS54 ATGVTRYYPATPW----RAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLK
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 LIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGI
:..::: :::.::::::.::::::: .:: :::: ::::::::::::.:.::....:::
CCDS54 LMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGT
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KB3 TDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTFSV
: :: :: .::.:: : :..::::::.::.::::::.:.:..:.::: .. ::::::::
CCDS54 TGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSV
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 GQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNV
:::::: :.::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::
CCDS54 GQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNV
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 YLDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPN
: ::: ::::.::::::::.: .. . ::::::::::.::.:.::::::: .:: :
CCDS54 YEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQ--DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGAN
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 GYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKNPKSQEPVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTF
:: :::: ::::::::::.:.. . .:::::::::::::.. : ::: .::::..:.: .
CCDS54 GYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQI
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 RTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSLALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARSKKGK
:::::: ::::::. .:.:::.:. .:.:::.:::: :: .:..:.: . : :.. .:
CCDS54 RTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQVKLPISK
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 MKDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKISDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADL
.:: : : :..:: :..:::::.::.::. :::::::: :: :.... ::.. .:: :
CCDS54 LKDFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFL
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 INRVLLDAGFTNELVQNYWSKQK-NIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYE
.. ..::.:.:..::. : : : .. : :..::::::::.:..:.:.: :::: ..
CCDS54 LHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFN
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 DSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKS-GPGAYES---GIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKI
:::.::::: .::: :. . : :. ::.:: :::. . . :.:::::.:.
CCDS54 ASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKL
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850
pF1KB3 DVNSWIENF-----TKTSIRDP--CAGPV--C--DCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHD
:...: :.: ..: .: : :: : ::. :.. . ::..::::::...:..
CCDS54 DLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKC-GPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQN
850 860 870 880 890 900
860 870 880 890 900 910
pF1KB3 DYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVA
.:.::::.:.: .:: : : : :. ..:::::..: : . ::. :...::.::
CCDS54 HQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVA
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950 960 970
pF1KB3 DILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDN
:.:...::..:::::..::.: .: . ..: : . . ..::. .::::.: .
CCDS54 DFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEG-SPETRESSCVMKQTQYYFGS
970 980 990 1000 1010 1020
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB3 DSKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQTSDGPNPCD
. :.....:::::::.::...: ::::.:...:. :.. :.: : ::::. :.
CCDS54 VNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHSDGPEQCE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB3 MVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL
.:..::::.:: .::: :. :: .::: ... ::: ....:.:::
CCDS54 LVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
CCDS54 HASRRL
1150
>>CCDS78253.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7 (309 aa)
initn: 1898 init1: 1898 opt: 1898 Z-score: 2291.3 bits: 433.9 E(32554): 2.6e-121
Smith-Waterman score: 1898; 100.0% identity (100.0% similar) in 293 aa overlap (1-293:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSWVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSWVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 YEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 YEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EVVYYNAKDDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIEDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EVVYYNAKDDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIEDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASDSKEISP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIML
CCDS78 SPEEIFNAE
>>CCDS44785.1 CACNA2D4 gene_id:93589|Hs108|chr12 (1137 aa)
initn: 984 init1: 297 opt: 1291 Z-score: 1548.9 bits: 298.4 E(32554): 5.9e-80
Smith-Waterman score: 1452; 29.0% identity (59.2% similar) in 1130 aa overlap (10-1068:50-1118)
10 20 30
pF1KB3 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAV----TIKS
: .:. ::.: : . .: :.:
CCDS44 ATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLWLLLLGTSLSPAWGQAKIPLETVKL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 WVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSK
:.: . :: . . :: : :. .. .: .. .::. ..:.:..: . .
CCDS44 WADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSLKIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVE
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 ALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAK--DDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIEDA
:. :. ::... :.. :... . :::. .. : . : : :.. . . .:
CCDS44 AVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFD---YYNSVLINERDEKGNFVELGAEFL---LESNA
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 NFGR-QISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSAT
.:. .. . ..:..::..:. . .:: . . ::. :: .: ..::.: :: :::::
CCDS44 HFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDILNGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSAT
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 GLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLI
:. : ::. :. . : . .: : : ::::.:.::::..::::::::..:: . .
CCDS44 GFFRIYPGIKWTPDE---NGVITFDCRNRGWYIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIA
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 RTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVS-CFQH-LVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGI
. ... .:.::...::.:. ..:. .. . ::. ::::. :.. .: :... .::.
CCDS44 KHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEPCFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGV
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380
pF1KB3 TDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRAN--CNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTF
... ::. : ... .. . ::. :::..::. : . .:.::: : ::::::.
CCDS44 GVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIMLISDGAVEDYEPVFEKYNWPDCKVRVFTY
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 SVGQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWT
.:.. ..:.::.::::: .: ... . :..::: ::.::::. : ... ::
CCDS44 LIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLADTQENVMEYLHVLSRPMVINHD--HDIIWT
440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 NVYLD-------ALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRL
..:.: : : :. : ..:::. .:.: .. ..:::.: ::.:... .:
CCDS44 EAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSK----KNETR-SHGILLGVVGSDVALRELMKL
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550
pF1KB3 TPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQP--KNPKSQEPV----TLDFLDAELENDIKVE
.::. : .:: : :::.: ::.:.: .. :. .: ..:. ..: :.. .
CCDS44 APRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYREGKKLKPKPNYNSVDLSEVEWEDQAE-S
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600
pF1KB3 IRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERY-IDKGNRT------YTWTPVNGTDYSLALVLPTY
.:. ::. :.: :: :.: . .:::.:. : .: .. : .::..::
CCDS44 LRTAMINRETG-----TL--SMDVKVPMDKGKRVLFLTNDYFFTDISDTPFSLGVVLSRG
610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 SFYYIKAKLEETITQARSKKGKMKDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYC-NDLKISDNNTE
:: . .. ..: ..: :.:: . .: .: :: .:. . .
CCDS44 HGEYI------LLGNTSVEEG-LHD--LLHPD-LALAG-DWI----YCITDIDPDHRKLS
660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 FLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLINRVLLDAGFTNELVQNYWS------KQKNIKGVKAR
: . .:. :: :. :. .:. .::.:: : . . ::. .... . :
CCDS44 QLEAMIRFLTRKDPDLE-CDEELVREVLFDAVVTAPM-EAYWTALALNMSEESEHVVDMA
710 720 730 740 750
730 740 750 760
pF1KB3 FVVTDGGITR----VYPKEAGENWQENPETYEDSF--------YKRSLDNDNYVFTAPYF
:. : .:. : : ..... .:: . : :... .. :.
CCDS44 FLGTRAGLLRSSLFVGSEKVSDRKFLTPEDEASVFTLDRFPLWYRQASEHPAGSFVFNLR
760 770 780 790 800 810
770 780 790 800 810 820
pF1KB3 NKSGP-GAYESGIMV-SKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKIDVNS-----WIENFTKTSIRDP
:: .: : ... : :: . .. . :..:... .. : . ... :
CCDS44 WAEGPESAGEPMVVTASTAVAVTVDKRTAIAAAAGVQMKLEFLQRKFWAATRQCSTVDGP
820 830 840 850 860 870
830 840 850 860 870 880
pF1KB3 CAGPVCDCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYA
:. .:. .:: .:: ..:..::.:.... . . :::.::.: ... .:....:..
CCDS44 CTQ---SCE-DSD-LDCFVIDNNGFILISKR---SRETGRFLGEVDGAVLTQLLSMGVFS
880 890 900 910 920 930
890 900 910 920 930
pF1KB3 FNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLT---
::::..:.:.. :.:: : :. : . . ::. : .::...: :
CCDS44 QVTMYDYQAMCKPSS------HHHSAAQPLVSPI---SAFLTATRW-LLQELVLFLLEWS
940 950 960 970 980
940 950 960 970 980 990
pF1KB3 -----FPRLLEA--VEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCSRIF
. : :: : .. . : : :: . .. . .:...:: :...:
CCDS44 VWGSWYDRGAEAKSVFHHSHKHKKQDPLQPCDTEYPVFVYQPAIREANGIVECGPCQKVF
990 1000 1010 1020 1030 1040
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB3 HGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQTSDGPNP---CDMVKQPRYRKGPDVCF
... :.::...... :: :. . : : : :: ... . :. :: :
CCDS44 VVQQIPNSNLLLLVTDP--TCDCSIFPPVLQEATEVKYNASVKCDRMRSQKLRRRPDSCH
1050 1060 1070 1080 1090
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB3 DNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL
. :. ::::.: . :
CCDS44 AFHPEENAQDCGGASDTSASPPLLLLPVCAWGLLPQLLR
1100 1110 1120 1130
>>CCDS54598.1 CACNA2D3 gene_id:55799|Hs108|chr3 (1091 aa)
initn: 979 init1: 243 opt: 1015 Z-score: 1215.9 bits: 236.8 E(32554): 2.1e-61
Smith-Waterman score: 1468; 29.0% identity (59.6% similar) in 1143 aa overlap (3-1084:14-1090)
10 20 30 40
pF1KB3 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSWVDKMQEDLVTLAK
:. ::: .: :. .: ::. .: .: .: :.. . .. ..:
CCDS54 MAGPGSPRRASRGASALLAAAL-LYAALGDVVRSEQQIPLSV-VKLWASAFGGEIKSIAA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 TASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQA
:: . : :..:. ..: .. :::. :...:... ..:.:. ::. ::...
CCDS54 KYSGSQLLQKKYKEYEKDVAIEEIDGLQLVKKLAKNMEEMFHKKSEAVRRLVEAAEEAHL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 AHQWREDFASNEVVYYNAK--DDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIEDANFGR-QISYQHAAV
:.. :. . :.:: .. : . : : :.. : . . .:. .. . . :
CCDS54 KHEFDADL---QYEYFNAVLINERDKDGNFLELGKEFI---LAPNDHFNNLPVNISLSDV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 HIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDN
..::..:. . ..: . :. .:..:: : ..::::.:: :::: :. : ::. : .
CCDS54 QVPTNMYNKDPAIVNGVYWSESLNKVFVDNFDRDPSLIWQYFGSAKGFFRQYPGIKWEPD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 SRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDD
: . .: : : ::::.:.::::..::::::::..:: : . . .:: .:.::.::
CCDS54 ---ENGVIAFDCRNRKWYIQAATSPKDVVILVDVSGSMKGLRLTIAKQTVSSILDTLGDD
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 DFVNVASFNSNAQDVS-CFQH-LVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQL
:: :. ..: . . : :.. ::::. ::. ... .... :::: ... ::. :
CCDS54 DFFNIIAYNEELHYVEPCLNGTLVQADRTNKEHFREHLDKLFAKGIGMLDIALNEAFNIL
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 LNYNVSRAN--CNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTFSVGQHNYDRGPIQW
..: . . :.. :::.:::. . . :: ::: :.:::.::. .:.. ..:
CCDS54 SDFNHTGQGSICSQAIMLITDGAVDTYDTIFAKYNWPDRKVRIFTYLIGREAAFADNLKW
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB3 MACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVYLDAL-------
::: :::.. .: ... .. :..::: ::.:: :. :. ..: ::..:.:.
CCDS54 MACANKGFFTQISTLADVQENVMEYLHVLSRPKVI--DQEHDVVWTEAYIDSTLPQAQKL
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 --ELG--LVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNG
. : :. : ..:::. .:.: :. ..:::.:.:: .... . :.. : .:
CCDS54 TDDQGPVLMTTVAMPVFSK----QNETRSKG-ILLGVVGTDVPVKELLKTIPKYKLGIHG
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560
pF1KB3 YYFAIDPNGYVLLHPNLQ---PKNPKSQEP--VTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESG
: ::: :::.: ::.:. .. : ..: ..:. ..: :. : .:: :.. ..:
CCDS54 YAFAITNNGYILTHPELRLLYEEGKKRRKPNYSSVDLSEVEWEDRDDV-LRNAMVNRKTG
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610
pF1KB3 EKTFRTLVKSQDERYIDKGNRT------YTWTPVNGTDYSLALVLPT-YSFYYIKAKLEE
. : :: . .:::.:. : .: ..:: .::...: .. :......
CCDS54 K--FSMEVK----KTVDKGKRVLVMTNDYYYTDIKGTPFSLGVALSRGHGKYFFRGNV--
590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 TITQARSKKGKMKDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCN-DLKISDNNTEFLLNFNEFIDR
:: .. ..: : .:: .. .::: ::. . : .. ..
CCDS54 TIEEG------LHDLE--HPD------VSLADEWSYCNTDLHPEHRHLSQLEAIKLYLKG
640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KB3 KTPNNPSCNADLINRVLLDAGFTNELVQNYWS-----KQKNI-KGVKARFVVTDGGITRV
: : .:. .::..::.:: . .. ::. :..: :::.. :. : :..:.
CCDS54 KEPLL-QCDKELIQEVLFDAVVSAP-IEAYWTSLALNKSENSDKGVEVAFLGTRTGLSRI
680 690 700 710 720 730
740 750 760 770
pF1KB3 YPKEAGENWQENPETYE----------DSF---YKRSLDN--DNYVFTAPYFNKSGPGAY
.: . : . . : : :.:. .. ..:.. :. ..::
CCDS54 N-LFVGAEQLTNQDFLKAGDKENIFNADHFPLWYRRAAEQIPGSFVYSIPF--STGPVNK
740 750 760 770 780 790
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 ESGIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKIDVNSWIENFTKTSIRDPCAGPVCDCKRNSDVM
. . .: .... . : :.:::.. .. . ..: .: . :. . .....
CCDS54 SNVVTASTSIQLLDERKSPVVAAVGIQMKLEFFQRKFWTASRQCASLDGKCSISCDDETV
800 810 820 830 840 850
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 DCVILDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGA
.: ..:..::.:.. .::: : : :::::. ..: .:.... . ::::..:. .
CCDS54 NCYLIDNNGFILVS--EDYT-QTGDFFGEIEGAVMNKLLTMGSFKRITLYDYQAMCRANK
860 870 880 890 900 910
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 APKQGAGHRSAYVPSVADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEMEDDDFTAS
..:: : . : : . .:. : . . :. . : . .:.::.
CCDS54 ESSDGA-H-GLLDPYNA-------FLSAVKWIMTELVLFLVEF----NLCSWWHSDMTAK
920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 LSK-----QSCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGT
.: . : :: . . : .: . : .::. : ... ..::....:.: .
CCDS54 AQKLKQTLEPCDTEYPAFVSERTIKETTGNIACEDCSKSFVIQQIPSSNLFMVVVDS--S
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB3 CPCDTR---LLIQAEQTSDGPNPCDMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPS
: :.. . : . :. .: . :. :. : . :. .:::. .:. .
CCDS54 CLCESVAPITMAPIEIRYNESLKCERLKAQKIRRRPESCHGFHPEENARECGGAPSLQAQ
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090
pF1KB3 LWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL
.. . ::: : :
CCDS54 T--VLLLLPLLLMLFSR
1080 1090
1091 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 17:11:29 2016 done: Tue Nov 8 17:11:30 2016
Total Scan time: 2.730 Total Display time: 0.280
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]