Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3404
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3404, 1691 aa
1>>>pF1KB3404 1691 - 1691 aa - 1691 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.0763+/-0.00157; mu= -32.4707+/- 0.092
mean_var=762.7851+/-164.931, 0's: 0 Z-trim(109.3): 467 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.046438
statistics sampled from 10358 (10796) to 10358 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.653), E-opt: 0.2 (0.332), width: 16
Scan time: 5.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719) 6289 438.9 7.2e-122
CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638) 5004 352.8 5.7e-96
CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711) 4383 311.2 2e-83
CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551) 2148 161.4 2.2e-38
CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 629) 1726 132.9 3.4e-30
CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 530) 1712 131.9 5.8e-30
CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 624) 1712 131.9 6.6e-30
CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 625) 1712 131.9 6.6e-30
CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 639) 1594 124.0 1.6e-27
CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354) 1528 119.8 6.2e-26
CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2 (1388) 1519 119.3 9.7e-26
CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2069) 1392 110.9 4.8e-23
CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2027) 1358 108.6 2.3e-22
>>CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719 aa)
initn: 6289 init1: 6289 opt: 6289 Z-score: 2301.4 bits: 438.9 E(32554): 7.2e-122
Smith-Waterman score: 11092; 98.3% identity (98.4% similar) in 1719 aa overlap (1-1691:1-1719)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
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CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
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CCDS15 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
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CCDS15 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
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CCDS15 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
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CCDS15 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
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CCDS15 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 QQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 QQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 RDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLE
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CCDS15 RDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 NELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKK
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CCDS15 NELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 ELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLT
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CCDS15 ELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 SELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQA
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CCDS15 SELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 LASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEEL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 NKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 NKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNTP
910 920 930 940 950 960
970 980 990
pF1KB3 TDALDQFE----------------------------RKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLM
:::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS15 TDALDQFETVDSTPLSVHTPTLRKKGCPGSTGFPPKRKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLM
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB3 VGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPK
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CCDS15 VGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB3 PAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 ASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB3 YVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGLFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGLFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIEL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KB3 IPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLSETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVA
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CCDS15 IPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLSETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KB3 MKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPYNVQWMAIFSEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPYNVQWMAIFSEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KB3 MLHSNDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEYLLCFNSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MLHSNDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEYLLCFNSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KB3 SCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPLKKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPLKKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KB3 KMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRRYSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 KMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRRYSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISN
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1540 1550 1560 1570 1580 1590
pF1KB3 PTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMNPRPQESRTVFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMNPRPQESRTVFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSG
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1600 1610 1620 1630 1640 1650
pF1KB3 LSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPMPSPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDFDGEDSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPMPSPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDFDGEDSDS
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1660 1670 1680 1690
pF1KB3 PRHSTASNSSNLSSPPSPVSPRKTKSLSLESTDRGSWDP
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS15 PRHSTASNSSNLSSPPSPASPRKTKSLSLESTDRGSWDP
1690 1700 1710
>>CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638 aa)
initn: 8533 init1: 4870 opt: 5004 Z-score: 1836.4 bits: 352.8 E(32554): 5.7e-96
Smith-Waterman score: 10412; 93.6% identity (93.7% similar) in 1719 aa overlap (1-1691:1-1638)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 QQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHV
:::::::::
CCDS15 QQEREDLNK---------------------------------------------------
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 RDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ------------------------------LEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLE
550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 NELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 NELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLKK
580 590 600 610 620 630
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 ELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLT
640 650 660 670 680 690
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 SELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQA
700 710 720 730 740 750
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 LASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEEL
760 770 780 790 800 810
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 NKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 NKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNTP
820 830 840 850 860 870
970 980 990
pF1KB3 TDALDQFE----------------------------RKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLM
:::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS15 TDALDQFETVDSTPLSVHTPTLRKKGCPGSTGFPPKRKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLM
880 890 900 910 920 930
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB3 VGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPK
940 950 960 970 980 990
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB3 PAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIH
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB3 ASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSV
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KB3 YVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGLFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGLFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIEL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KB3 IPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLSETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 IPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLSETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVA
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CCDS15 MKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPYNVQWMAIFSEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYS
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CCDS15 MLHSNDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEYLLCFNSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPS
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CCDS15 SCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPLKKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKN
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CCDS15 KMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRRYSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISN
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CCDS15 LSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPMPSPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDFDGEDSDS
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CCDS15 PRHSTASNSSNLSSPPSPASPRKTKSLSLESTDRGSWDP
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CCDS99 PDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEER
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CCDS99 LSNSNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRV
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.::::::.... :::...:::.::.:. .::::.. . .:::::.:::::.::.. ::.
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pF1KB3 ENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEIKNLK
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pF1KB3 KELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKL
::.::::..::::.:::..:::::::..:: ..: :: . .:..::::...: .:::::
CCDS99 KEVHDSESHQLALQKEILMLKDKLEKSKRERHNEMEEAVGTIKDKYERERAMLFDENKKL
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pF1KB3 TSELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQ
:.: .:: .. ..:. .:.:::.:..::: ::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS99 TAENEKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKDARGYLQ
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pF1KB3 ALASKMTEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEE
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CCDS99 ALASKMTEELEALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQSALEAEIRAKQLVQEE
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pF1KB3 LNKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEE-LRSEKGIEHQDSQHSFLAFLN
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CCDS99 LRKVKDANLTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFN
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pF1KB3 TPTDALDQFER-------------------------------------------------
: : : :
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pF1KB3 -------KTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCP
:.::: .:::..::.: .:::::::::::: .::::.:.::..: . :: .::
CCDS99 ALAGPKPKAHQFSIKSFSSPTQCSHCTSLMVGLIRQGYACEVCSFACHVSCKDGAPQVCP
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pF1KB3 VPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKA
.::::.: :::.: :.::::::.:::..:::.::::::::: :.::: ::::::. :::.
CCDS99 IPPEQSKRPLGVDVQRGIGTAYKGHVKVPKPTGVKKGWQRAYAVVCDCKLFLYDLPEGKS
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pF1KB3 SQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLA
.::.:. :::.:.::.:::::::::::::::.:.::::::::::: :.: .. :.:.:.
CCDS99 TQPGVIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHATRRDIPCIFRVTASLLGAPSKTSSLLILT
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pF1KB3 DTENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIAL
..:::: ::::.: :..::.::..:.. :.:: :::::.:::::. .:::.: .:::.
CCDS99 ENENEKRKWVGILEGLQSILHKNRLRNQVVHVPLEAYDSSLPLIKAILTAAIVDADRIAV
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pF1KB3 GNEEGLFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIELIPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRET
: ::::.:..::.: :.:..: ::.::::: : ...: .. :::.::.:.: :.::: :
CCDS99 GLEEGLYVIEVTRDVIVRAADCKKVHQIELAPREKIVILLCGRNHHVHLYPWSSLDGAEG
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pF1KB3 DF-YKLSETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVAMKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPYNV
.: :: :::::: .... ..... ::: ::.:: .::::. ..: ::::.:: .: .:
CCDS99 SFDIKLPETKGCQLMATATLKRNSGTCLFVAVKRLILCYEIQRTKPFHRKFNEIVAPGSV
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pF1KB3 QWMAIFSEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYSMLHSNDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKE
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CCDS99 QCLAVLRDRLCVGYPSGFCLLSIQGDGQPLNLVNPNDPSLAFLSQQSFDALCAVELESEE
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pF1KB3 YLLCFNSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPSSCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQ
:::::. .:.:.: ::::.: ::::::: : .: . ...:::: .::.::: .:::.:
CCDS99 YLLCFSHMGLYVDPQGRRARAQELMWPAAPVACSCSPTHVTVYSEYGVDVFDVRTMEWVQ
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pF1KB3 TLPLKKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKNKMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKR
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CCDS99 TIGLRRIRPLNSEGTLNLLNCEPPRLIYFKSKFS-GAVLNVPDTSDNSKKQMLRT-RSKR
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pF1KB3 RYSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISNPTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMNPRPQ
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CCDS99 RFVFKVPEEERLQQRREMLRDPELRSKMISNPTNFNHVAHMGPGDGMQVLMDLPLSAVP-
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pF1KB3 ESRTVFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSGLSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPM
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CCDS99 ------------PS-QEERPGP-----APTNLARQPPSRNKPYISWPSSGGSEPSVTVPL
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pF1KB3 PSPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDFDGE-DSDSPRHSTASNSSNLSSPPSPVSPRKTKSLS
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CCDS99 RSMSD--------------PDQDFDKEPDSDSTKHSTPSNSSNPSGPPSPNSPHRSQ-LP
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1690
pF1KB3 LESTDRGSWDP
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CCDS99 LEGLEQPACDT
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CCDS31 SPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAETA
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CCDS31 CFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQF
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::::::.:: :.::: :::::.::::.:.:.:::::::::::::.: .: :.:::::::
CCDS31 YLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLRLNTNGMVDSSVAVGT
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CCDS31 PDYISPEILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHEDH
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pF1KB3 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
.::: .: :: .:.::::.:.: .:.:::..:..::..:::: :.::. . . :::::
CCDS31 LQFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFFEGVDWERLASSTAPYIP
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pF1KB3 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
:. .: :::::::::: :.. :.:::.: ::::::::::::::::. .
CCDS31 ELRGPMDTSNFDVDDDTLNHPGTLPPPSHGAFSGHHLPFVGFTYTSG-----------SH
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pF1KB3 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
.: : .. : : ::... :::::.::::: ::.
CCDS31 SPES------------SSEAWAALERKLQCLEQEKVELSRKHQEA---------------
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pF1KB3 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQV-TESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKT
: : : ..:.:.:::.: : ..: ..:.. .. : :. . : .
CCDS31 LHAPTD------HRELEQLRKEVQTLRDRLPEMLRDKASLSQT--DG--PPAGSPGQDSD
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pF1KB3 LQQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARH
:.:: . :..::... :. : .:: :. :.. .:...: .::
CCDS31 LRQELDRLHRELAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQERE-------------
490 500 510 520 530
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pF1KB3 VRDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQL
:: ::. : : : :. ..
CCDS31 ---------------------------------------AATASQTRALSSQLEE-ARAA
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pF1KB3 ENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIH-ANEIKNL
. :::. :.: :. .: .:.:. . :.. :: :. . :: :.: ...
CCDS31 QRELEA----QVS------SLSRQ--VTQLQGQWEQRL----EESSQAKTIHTASETNGM
560 570 580 590
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pF1KB3 KKELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKK
.. :. : ::. :...::... . : .:: . : :::..
CCDS31 GPP--EGGPQEAQLRKEVAALREQLEQAHSHRPSGKEEALCQ-----------LQEENRR
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pF1KB3 LTSELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYL
:. : ..: . . . .:.:: : ..:. ..::::...:..::.::: .::::
CCDS31 LSREQERLEAELAQEQESKQRLEGE------RRETESNWEAQLADILSWVNDEKVSRGYL
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pF1KB3 QALASKMTEELEALRN---SSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQA
::::.::.::::.::: ..: .: : :: ::. :.. ::::::::::.:::::::.
CCDS31 QALATKMAEELESLRNVGTQTLPARPLDHQWKARRLQKMEASARLELQSALEAEIRAKQG
700 710 720 730 740 750
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pF1KB3 IQEELNKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQH--SF
.::.:..:. ... .: .:...::.. : .:. .: ::::.. .. . :. :
CCDS31 LQERLTQVQEAQLQAERRLQEAEKQSQALQQELAML---REELRARGPVDTKPSNSLIPF
760 770 780 790 800 810
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pF1KB3 LAFLNTPTD-ALDQ----------------------------FERK--------------
:.: .. : : : : :
CCDS31 LSFRSSEKDSAKDPGISGEATRHGGEPDLRPEGRRSLRMGAVFPRAPTANTASTEGLPAK
820 830 840 850 860 870
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pF1KB3 --THQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQT
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CCDS74 ERMELLQAEGATGP
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30 40 50 60 70 80
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CCDS11 YLS-SANPNDNRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKI
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..:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]