Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3350
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3350, 635 aa
1>>>pF1KB3350 635 - 635 aa - 635 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9162+/-0.00142; mu= 7.7611+/- 0.082
mean_var=367.7491+/-86.474, 0's: 0 Z-trim(106.8): 628 B-trim: 100 in 1/51
Lambda= 0.066880
statistics sampled from 8418 (9166) to 8418 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 635) 4320 432.4 8.8e-121
CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 612) 2258 233.4 6.7e-61
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 312) 1286 139.2 8e-33
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 619) 1094 121.1 4.4e-27
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 724 85.8 3.2e-16
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 724 85.8 3.2e-16
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1292) 715 85.1 6.6e-16
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1308) 715 85.1 6.6e-16
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 705 83.5 8.1e-16
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 708 84.3 9.7e-16
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 708 84.3 9.8e-16
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 705 84.0 1.1e-15
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 705 84.0 1.2e-15
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 705 84.0 1.2e-15
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 705 84.0 1.2e-15
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 705 84.0 1.2e-15
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 705 84.0 1.2e-15
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 705 84.0 1.2e-15
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 (1210) 698 83.4 2e-15
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 693 82.8 2.5e-15
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 685 81.5 3e-15
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 ( 967) 690 82.5 3e-15
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 (1009) 690 82.5 3.1e-15
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 666 79.6 1e-14
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 672 80.7 1e-14
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 669 80.2 1e-14
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 669 80.3 1.1e-14
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 669 80.3 1.1e-14
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1055) 671 80.7 1.1e-14
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 669 80.3 1.1e-14
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1225) 671 80.8 1.2e-14
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1240) 671 80.8 1.2e-14
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1255) 671 80.8 1.2e-14
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 666 80.0 1.4e-14
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 664 80.0 1.7e-14
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 664 80.0 1.7e-14
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 664 80.0 1.8e-14
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 658 78.9 1.8e-14
CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1038) 663 79.9 1.9e-14
CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1040) 663 79.9 1.9e-14
CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1086) 663 79.9 1.9e-14
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 656 79.2 2.9e-14
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 655 79.1 3.2e-14
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 655 79.1 3.2e-14
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 655 79.1 3.2e-14
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 655 79.1 3.2e-14
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 655 79.1 3.2e-14
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 655 79.1 3.2e-14
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 654 79.0 3.4e-14
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3 ( 998) 643 78.0 7.1e-14
>>CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 (635 aa)
initn: 4320 init1: 4320 opt: 4320 Z-score: 2281.9 bits: 432.4 E(32554): 8.8e-121
Smith-Waterman score: 4320; 100.0% identity (100.0% similar) in 635 aa overlap (1-635:1-635)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSGMADSANHLPFFFGNITREEAEDYLVQGGMSDGLYLLRQSRNYLGGFALSVAHGRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MASSGMADSANHLPFFFGNITREEAEDYLVQGGMSDGLYLLRQSRNYLGGFALSVAHGRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AHHYTIERELNGTYAIAGGRTHASPADLCHYHSQESDGLVCLLKKPFNRPQGVQPKTGPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AHHYTIERELNGTYAIAGGRTHASPADLCHYHSQESDGLVCLLKKPFNRPQGVQPKTGPF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EDLKENLIREYVKQTWNLQGQALEQAIISQKPQLEKLIATTAHEKMPWFHGKISREESEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EDLKENLIREYVKQTWNLQGQALEQAIISQKPQLEKLIATTAHEKMPWFHGKISREESEQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 IVLIGSKTNGKFLIRARDNNGSYALCLLHEGKVLHYRIDKDKTGKLSIPEGKKFDTLWQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 IVLIGSKTNGKFLIRARDNNGSYALCLLHEGKVLHYRIDKDKTGKLSIPEGKKFDTLWQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VEHYSYKADGLLRVLTVPCQKIGTQGNVNFGGRPQLPGSHPATWSAGGIISRIKSYSFPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VEHYSYKADGLLRVLTVPCQKIGTQGNVNFGGRPQLPGSHPATWSAGGIISRIKSYSFPK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PGHRKSSPAQGNRQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PGHRKSSPAQGNRQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 KEVYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 KEVYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPRE
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KB3 MYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
610 620 630
>>CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 (612 aa)
initn: 2334 init1: 2252 opt: 2258 Z-score: 1206.8 bits: 233.4 E(32554): 6.7e-61
Smith-Waterman score: 4102; 96.4% identity (96.4% similar) in 635 aa overlap (1-635:1-612)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSGMADSANHLPFFFGNITREEAEDYLVQGGMSDGLYLLRQSRNYLGGFALSVAHGRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MASSGMADSANHLPFFFGNITREEAEDYLVQGGMSDGLYLLRQSRNYLGGFALSVAHGRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AHHYTIERELNGTYAIAGGRTHASPADLCHYHSQESDGLVCLLKKPFNRPQGVQPKTGPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AHHYTIERELNGTYAIAGGRTHASPADLCHYHSQESDGLVCLLKKPFNRPQGVQPKTGPF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EDLKENLIREYVKQTWNLQGQALEQAIISQKPQLEKLIATTAHEKMPWFHGKISREESEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EDLKENLIREYVKQTWNLQGQALEQAIISQKPQLEKLIATTAHEKMPWFHGKISREESEQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 IVLIGSKTNGKFLIRARDNNGSYALCLLHEGKVLHYRIDKDKTGKLSIPEGKKFDTLWQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IVLIGSKTNGKFLIRARDNNGSYALCLLHEGKVLHYRIDKDKTGKLSIPEGKKFDTLWQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VEHYSYKADGLLRVLTVPCQKIGTQGNVNFGGRPQLPGSHPATWSAGGIISRIKSYSFPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEHYSYKADGLLRVLTVPCQKIGTQGNVNFGGRPQLPGSHPA------------------
250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PGHRKSSPAQGNRQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 -----SSPAQGNRQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRP
290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 KEVYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KEVYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAE
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSM
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYA
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPRE
520 530 540 550 560 570
610 620 630
pF1KB3 MYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
580 590 600 610
>>CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 (312 aa)
initn: 1219 init1: 1029 opt: 1286 Z-score: 702.7 bits: 139.2 E(32554): 8e-33
Smith-Waterman score: 1286; 61.8% identity (83.1% similar) in 296 aa overlap (341-635:1-295)
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 GNRQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRPKEVYLDRKLL
.:::: ::::::.::::.. :...: : :
CCDS33 MPMDTSVYESPYSDPEELKDKKLFLKRDNL
10 20 30
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 TLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNP
. : ::: ::::.:..: :.:.: ::.:.:: .... : .:.. ::..:.:::::
CCDS33 LIADIELGCGNFGSVRQGVYRMRKKQIDVAIKVLK-QGTEKADTEEMMREAQIMHQLDNP
40 50 60 70 80
440 450 460 470 480
pF1KB3 YIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRH-VKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESN
::::.::.:.::. ::::::: :::.:.: .:. . .:. ::.::::::::::::.:
CCDS33 YIVRLIGVCQAEALMLVMEMAGGGPLHKFLVGKREEIPVSNVAELLHQVSMGMKYLEEKN
90 100 110 120 130 140
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKF
::::::::::::::..:::::::::::::: ::..:: :.. ::::.:::::::::. ::
CCDS33 FVHRDLAARNVLLVNRHYAKISDFGLSKALGADDSYYTARSAGKWPLKWYAPECINFRKF
150 160 170 180 190 200
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCW
::.:::::.:: ::::.:::::::. ::: :: :..:.:.:: :: :: :.: ::. ::
CCDS33 SSRSDVWSYGVTMWEALSYGQKPYKKMKGPEVMAFIEQGKRMECPPECPPELYALMSDCW
210 220 230 240 250 260
610 620 630
pF1KB3 TYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
: :.:: : .:: :.: ::....
CCDS33 IYKWEDRPDFLTVEQRMRACYYSLASKVEGPPGSTQKAEAACA
270 280 290 300 310
>>CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 (619 aa)
initn: 2251 init1: 1046 opt: 1094 Z-score: 599.8 bits: 121.1 E(32554): 4.4e-27
Smith-Waterman score: 2324; 54.4% identity (77.7% similar) in 631 aa overlap (6-635:1-602)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASSGMADSANHLPFFFGNITREEAEDYLVQGGMSDGLYLLRQSRNYLGGFALSVAHGRK
: : : :::::.:.:.: :::..: .::.:::.:::: :::..::..: .
CCDS33 MPDPAAHLPFFYGSISRAEAEEHLKLAGMADGLFLLRQCLRSLGGYVLSLVHDVR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 AHHYTIERELNGTYAIAGGRTHASPADLCHYHSQESDGLVCLLKKPFNRPQGVQPKTGPF
::. :::.::::::::::..: .::.::...:.. ::: : :.:: :::.:..:. : :
CCDS33 FHHFPIERQLNGTYAIAGGKAHCGPAELCEFYSRDPDGLPCNLRKPCNRPSGLEPQPGVF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EDLKENLIREYVKQTWNLQGQALEQAIISQKPQLEKLIATTAHEKMPWFHGKISREESEQ
. :.. ..:.::.:::.:.:.::::::::: ::.::::::::::.:::.:....:::.:.
CCDS33 DCLRDAMVRDYVRQTWKLEGEALEQAIISQAPQVEKLIATTAHERMPWYHSSLTREEAER
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 IVLIGSKTNGKFLIRARDNNGSYALCLLHEGKVLHYRIDKDKTGKLSIPEGKKFDTLWQL
. :..:.::::.: : ..:.::: :.. : :: :..::.:: :::: ::::::::
CCDS33 KLYSGAQTDGKFLLRPRKEQGTYALSLIYGKTVYHYLISQDKAGKYCIPEGTKFDTLWQL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VEHYSYKADGLLRVLTVPCQKIGTQGNVNFGGRPQLPGSHPATWSAGGIISRIKSYSFPK
::. . :::::. : : . .. .:.. .. : :: .::.: . :.
CCDS33 VEYLKLKADGLIYCLKEACPN-SSASNASGAAAPTLP-AHPST------------LTHPQ
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 PGHRKSSPAQGNRQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRP
:. .:.. . : :: : .. :. .:::: ::::::.::::..
CCDS33 ------------RRIDTLNSDGYTPEPARITSPDKPR--PMPMDTSVYESPYSDPEELKD
290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 KEVYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAE
:...: : : . : ::: ::::.:..: :.:.: ::.:.:: .... : .:.. :
CCDS33 KKLFLKRDNLLIADIELGCGNFGSVRQGVYRMRKKQIDVAIKVLK-QGTEKADTEEMMRE
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470
pF1KB3 ANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRH-VKDKNIIELVHQVS
:..:.:::::::::.::.:.::. ::::::: :::.:.: .:. . .:. ::.::::
CCDS33 AQIMHQLDNPYIVRLIGVCQAEALMLVMEMAGGGPLHKFLVGKREEIPVSNVAELLHQVS
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 MGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWY
::::::::.:::::::::::::::..:::::::::::::: ::..:: :.. ::::.:::
CCDS33 MGMKYLEEKNFVHRDLAARNVLLVNRHYAKISDFGLSKALGADDSYYTARSAGKWPLKWY
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 APECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPR
::::::. ::::.:::::.:: ::::.:::::::. ::: :: :..:.:.:: :: ::
CCDS33 APECINFRKFSSRSDVWSYGVTMWEALSYGQKPYKKMKGPEVMAFIEQGKRMECPPECPP
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630
pF1KB3 EMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
:.: ::. :: : :.:: : .:: :.: ::....
CCDS33 ELYALMSDCWIYKWEDRPDFLTVEQRMRACYYSLASKVEGPPGSTQKAEAACA
570 580 590 600 610
>>CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052 aa)
initn: 608 init1: 365 opt: 724 Z-score: 404.6 bits: 85.8 E(32554): 3.2e-16
Smith-Waterman score: 724; 39.4% identity (68.9% similar) in 315 aa overlap (322-626:371-676)
300 310 320 330 340
pF1KB3 RIKSYSFPKPGHRKSSPAQGNRQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPM-DTEVY--
: :.:: . .: . .:. . .:. :
CCDS63 ADLIDGYCRLVNGTSQSFIIRPQKEGERALPSIPKLAN-SEKQGMRTHAVSVSETDDYAE
350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 ----ESPYADPEEIRPKEVYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQM-KKVVKTVAVKI
:. :. : : :. .: : . .: :.:: :..: :. .. . .::.:
CCDS63 IIDEEDTYTMPST-RDYEIQRERIEL---GRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKT
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 LKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIG-ICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQ
:: ..: ......: :: .:.:.:.:.::..:: : : :. .::. :: : ..::
CCDS63 CKNCTSD-SVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWI-IMELCTLGELRSFLQV
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 NRHVKD-KNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRA
.. : ..: ..:.: .. ::: . :::::.::::::. .. .:..:::::. ..
CCDS63 RKYSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSRYME-
520 530 540 550 560 570
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 DENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEV
: .:::: ..:: :.::.::: ::. .:.: :::: ::: ::: . .: ::..:.:...:
CCDS63 DSTYYKA-SKGKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDV
580 590 600 610 620 630
590 600 610 620 630
pF1KB3 TAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
. .:.:::. : .:: .:.::. ::.:: :: :. .. .:
CCDS63 IGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQEERM
640 650 660 670 680 690
CCDS63 RMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPSRPGYPSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSH
700 710 720 730 740 750
>>CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065 aa)
initn: 608 init1: 365 opt: 724 Z-score: 404.6 bits: 85.8 E(32554): 3.2e-16
Smith-Waterman score: 724; 39.4% identity (68.9% similar) in 315 aa overlap (322-626:371-676)
300 310 320 330 340
pF1KB3 RIKSYSFPKPGHRKSSPAQGNRQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPM-DTEVY--
: :.:: . .: . .:. . .:. :
CCDS56 ADLIDGYCRLVNGTSQSFIIRPQKEGERALPSIPKLAN-SEKQGMRTHAVSVSETDDYAE
350 360 370 380 390
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 ----ESPYADPEEIRPKEVYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQM-KKVVKTVAVKI
:. :. : : :. .: : . .: :.:: :..: :. .. . .::.:
CCDS56 IIDEEDTYTMPST-RDYEIQRERIEL---GRCIGEGQFGDVHQGIYMSPENPALAVAIKT
400 410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 LKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIG-ICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQ
:: ..: ......: :: .:.:.:.:.::..:: : : :. .::. :: : ..::
CCDS56 CKNCTSD-SVREKFLQEALTMRQFDHPHIVKLIGVITENPVWI-IMELCTLGELRSFLQV
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 NRHVKD-KNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRA
.. : ..: ..:.: .. ::: . :::::.::::::. .. .:..:::::. ..
CCDS56 RKYSLDLASLILYAYQLSTALAYLESKRFVHRDIAARNVLVSSNDCVKLGDFGLSRYME-
520 530 540 550 560 570
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 DENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEV
: .:::: ..:: :.::.::: ::. .:.: :::: ::: ::: . .: ::..:.:...:
CCDS56 DSTYYKA-SKGKLPIKWMAPESINFRRFTSASDVWMFGVCMWEILMHGVKPFQGVKNNDV
580 590 600 610 620 630
590 600 610 620 630
pF1KB3 TAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
. .:.:::. : .:: .:.::. ::.:: :: :. .. .:
CCDS56 IGRIENGERLPMPPNCPPTLYSLMTKCWAYDPSRRPRFTELKAQLSTILEEEKAQQEERM
640 650 660 670 680 690
CCDS56 RMESRRQATVSWDSGGSDEAPPKPSRPGYPSPRSSEGFYPSPQHMVQTNHYQVSGYPGSH
700 710 720 730 740 750
>>CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1292 aa)
initn: 648 init1: 393 opt: 715 Z-score: 399.1 bits: 85.1 E(32554): 6.6e-16
Smith-Waterman score: 715; 41.3% identity (69.6% similar) in 283 aa overlap (343-619:690-967)
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 RQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRPKEVYLDRKLLTL
..::. : : . : :... : : :
CCDS42 GLFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVE-PLT-PSGTAPNQAQL-RILKET
660 670 680 690 700 710
380 390 400 410 420
pF1KB3 EDKE---LGSGNFGTVKKGYY--QMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQL
: :. :::: :::: :: . . . : ::.::: ::.. : . :.. :: .: ..
CCDS42 ELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKIL-NETTGPKANVEFMDEALIMASM
720 730 740 750 760 770
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNR-HVKDKNIIELVHQVSMGMKYLE
:.:..::..:.: . . .:: .. : : .:..... .. .. ... :.. :: :::
CCDS42 DHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLE
780 790 800 810 820 830
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 ESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINY
: .:::::::::::. . ...::.::::.. :..::. :.:. :: :.::.: :::.:
CCDS42 ERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADG-GKMPIKWMALECIHY
840 850 860 870 880 890
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 YKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMN
::. .:::::.:: .:: ...: ::: :. :. .::::::. : : ..: .:
CCDS42 RKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMV
900 910 920 930 940 950
610 620 630
pF1KB3 LCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
:: :...:: :
CCDS42 KCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLE
960 970 980 990 1000 1010
>>CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1308 aa)
initn: 648 init1: 393 opt: 715 Z-score: 399.1 bits: 85.1 E(32554): 6.6e-16
Smith-Waterman score: 715; 41.3% identity (69.6% similar) in 283 aa overlap (343-619:690-967)
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 RQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRPKEVYLDRKLLTL
..::. : : . : :... : : :
CCDS23 GLFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFLETELVE-PLT-PSGTAPNQAQL-RILKET
660 670 680 690 700 710
380 390 400 410 420
pF1KB3 EDKE---LGSGNFGTVKKGYY--QMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQL
: :. :::: :::: :: . . . : ::.::: ::.. : . :.. :: .: ..
CCDS23 ELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKIL-NETTGPKANVEFMDEALIMASM
720 730 740 750 760 770
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNR-HVKDKNIIELVHQVSMGMKYLE
:.:..::..:.: . . .:: .. : : .:..... .. .. ... :.. :: :::
CCDS23 DHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLE
780 790 800 810 820 830
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 ESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINY
: .:::::::::::. . ...::.::::.. :..::. :.:. :: :.::.: :::.:
CCDS23 ERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADG-GKMPIKWMALECIHY
840 850 860 870 880 890
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 YKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMN
::. .:::::.:: .:: ...: ::: :. :. .::::::. : : ..: .:
CCDS23 RKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMV
900 910 920 930 940 950
610 620 630
pF1KB3 LCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
:: :...:: :
CCDS23 KCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLE
960 970 980 990 1000 1010
>>CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (542 aa)
initn: 747 init1: 368 opt: 705 Z-score: 397.5 bits: 83.5 E(32554): 8.1e-16
Smith-Waterman score: 790; 33.8% identity (55.8% similar) in 473 aa overlap (164-632:148-524)
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 QTWNLQGQALEQAIISQKPQLEKLIATTAHEKMPWFHGKISREESEQIVLIGSKTNGKFL
:: :.:: .:: .: :..: ::.::
CCDS44 YNQNGEWSEVRSKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRSAAEY--LLSSLINGSFL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 IRARDNN-GSYALCLLHEGKVLHYRIDKDKTGKLSIPEGKKFDTLWQLVEHYSYKADGLL
.: ... :. .. : .::.: ::::. ::. . ..:.:: .::.:.: ::::.
CCDS44 VRESESSPGQLSISLRYEGRVYHYRINTTADGKVYVTAESRFSTLAELVHHHSTVADGLV
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 RVLTVPCQKIGTQGNVNFGGRPQLPGSHPATWSAGGIISRIKSYSFPKPGHRKSSPAQGN
.: : : . .: . : : : :
CCDS44 TTLHYPAPKCN---------KPTVYGVSPI--------------------HDK-------
240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 RQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPMDTEVYESPYADPEEIRPKEVYLDRKLLTL
: ..: .:.
CCDS44 -----------------WE---------------------------------MERTDITM
260
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 EDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYI
. : ::.:..: : : . :: ::::: ::. : .:.: :: ::... .: .
CCDS44 KHK-LGGGQYGEVYVGVW--KKYSLTVAVKTLKE---DTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNL
270 280 290 300 310 320
440 450 460 470 480
pF1KB3 VRMIGICEAES-WMLVMEMAELGPLNKYLQQ-NRH-VKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESN
:...:.: : ...: :. : : ::.. ::. : .. .. :.: .:.:::..:
CCDS44 VQLLGVCTLEPPFYIVTEYMPYGNLLDYLRECNREEVTAVVLLYMATQISSAMEYLEKKN
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKF
:.:::::::: :. .: .:..:::::. . .: : :.. .:.:.:: ::: . : :
CCDS44 FIHRDLAARNCLVGENHVVKVADFGLSRLMTGDT--YTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNTF
390 400 410 420 430 440
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCW
: :::::.::::.:: .::..:: :. :.: .:::: :: : ::: ..:.:: ::
CCDS44 SIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYDLLEKGYRMEQPEGCPPKVYELMRACW
450 460 470 480 490 500
610 620 630
pF1KB3 TYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
.. .::.:: .. ......:
CCDS44 KWSPADRPSFAETHQAFETMFHDSSISEVLLHCANQTCITL
510 520 530 540
>>CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130 aa)
initn: 727 init1: 344 opt: 708 Z-score: 396.0 bits: 84.3 E(32554): 9.7e-16
Smith-Waterman score: 798; 34.0% identity (57.6% similar) in 474 aa overlap (164-632:123-499)
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 QTWNLQGQALEQAIISQKPQLEKLIATTAHEKMPWFHGKISREESEQIVLIGSKTNGKFL
:: :.:: .::. .: :..: ::.::
CCDS35 YNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEY--LLSSGINGSFL
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 IRARDNN-GSYALCLLHEGKVLHYRIDKDKTGKLSIPEGKKFDTLWQLVEHYSYKADGLL
.: ... :. .. : .::.: ::::. . ::: . ..:.:: .::.:.: ::::.
CCDS35 VRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLI
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 RVLTVPCQKIGTQGNVNFGGRPQLPGSHPATWSAGGIISRIKSYSFPKPGHRKSSPAQGN
.: : .: : ....:.
CCDS35 TTL------------------------H-----------------YPAP--KRNKPT---
220
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 RQESTVSFNPYEPELAPWAADKGPQREALPMDTEVYE-SPYADPEEIRPKEVYLDRKLLT
:: :: : : ..: .:
CCDS35 ----------------------------------VYGVSPNYDKWE-------MERTDIT
230 240
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 LEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPY
.. : ::.:..: : .: . :: ::::: ::. : .:.: :: ::... .:
CCDS35 MKHK-LGGGQYGEVYEGVW--KKYSLTVAVKTLKE---DTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPN
250 260 270 280 290
440 450 460 470 480
pF1KB3 IVRMIGICEAES-WMLVMEMAELGPLNKYLQQ-NRH-VKDKNIIELVHQVSMGMKYLEES
.:...:.: : .... :. : : ::.. ::. :. .. .. :.: .:.:::..
CCDS35 LVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLLYMATQISSAMEYLEKK
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 NFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYK
::.:::::::: :. .: .:..:::::. . .: : :.. .:.:.:: ::: . : :
CCDS35 NFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDT--YTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNK
360 370 380 390 400 410
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 FSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLC
:: :::::.::::.:: .::..:: :. :.: .::: :: : :::...:.:: :
CCDS35 FSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRAC
420 430 440 450 460 470
610 620 630
pF1KB3 WTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
: .. .::.:: .. ..... .
CCDS35 WQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESSISDEVEKELGKQGVRGAVSTLLQAPELPTKTRTS
480 490 500 510 520 530
635 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 13:00:45 2016 done: Thu Nov 3 13:00:45 2016
Total Scan time: 2.760 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]