Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3321
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3321, 923 aa
1>>>pF1KB3321 923 - 923 aa - 923 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5859+/-0.000839; mu= 19.9386+/- 0.051
mean_var=76.7354+/-15.546, 0's: 0 Z-trim(108.0): 86 B-trim: 117 in 1/51
Lambda= 0.146412
statistics sampled from 9813 (9903) to 9813 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41775.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12 ( 923) 6229 1325.7 0
CCDS31784.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12 ( 881) 5930 1262.6 0
CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 858) 2683 576.7 6.5e-164
CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 867) 2683 576.7 6.5e-164
CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (1011) 2683 576.7 7.4e-164
CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 840) 2670 573.9 4.3e-163
CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 791) 2606 560.4 4.8e-159
CCDS55093.1 RAPGEF5 gene_id:9771|Hs108|chr7 ( 730) 1225 268.7 2.9e-71
CCDS77023.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 505) 939 208.2 3.3e-53
CCDS77022.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 511) 925 205.2 2.6e-52
CCDS11363.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 456) 860 191.5 3.2e-48
CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4 (1499) 532 122.5 6.1e-27
CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1391) 505 116.8 3e-25
CCDS34225.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1601) 505 116.8 3.3e-25
CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1509) 504 116.6 3.7e-25
CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1504) 503 116.4 4.2e-25
CCDS54900.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1609) 503 116.4 4.5e-25
CCDS54897.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 ( 827) 384 91.1 9.6e-18
CCDS48047.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1077) 352 84.4 1.3e-15
CCDS78450.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1094) 352 84.4 1.3e-15
CCDS48048.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1095) 352 84.4 1.3e-15
CCDS65733.1 RALGPS2 gene_id:55103|Hs108|chr1 ( 557) 289 70.9 7.6e-12
CCDS1325.1 RALGPS2 gene_id:55103|Hs108|chr1 ( 583) 289 70.9 7.9e-12
CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5 (1237) 289 71.1 1.5e-11
CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 ( 489) 283 69.6 1.7e-11
CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257) 283 69.8 3.6e-11
CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1273) 283 69.8 3.6e-11
CCDS55344.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9 ( 305) 269 66.5 8.7e-11
>>CCDS41775.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12 (923 aa)
initn: 6229 init1: 6229 opt: 6229 Z-score: 7103.8 bits: 1325.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6229; 99.9% identity (99.9% similar) in 923 aa overlap (1-923:1-923)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MKVGWPGESCWQVGLAVEDSPALGAPRVGALPDVVPEGTLLNMVLRRMHRPRSCSYQLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MKVGWPGESCWQVGLAVEDSPALGAPRVGALPDVVPEGTLLNMVLRRMHRPRSCSYQLLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 EHQRPSCIQGLRWTPLTNSEESLDFSESLEQASTERVLRAGRQLHRHLLATCPNLIRDRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EHQRPSCIQGLRWTPLTNSEESLDFSESLEQASTERVLRAGRQLHRHLLATCPNLIRDRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 YHLRLYRQCCSGRELVDGILALGLGVHSRSQVVGICQVLLDEGALCHVKHDWAFQDRDAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YHLRLYRQCCSGRELVDGILALGLGVHSRSQVVGICQVLLDEGALCHVKHDWAFQDRDAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 FYRFPGPEPEPVGTHEMEEELAEAVALLSQRGPDALLTVALRKPPGQRTDEELDLIFEEL
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FYRFPGPEPEPVRTHEMEEELAEAVALLSQRGPDALLTVALRKPPGQRTDEELDLIFEEL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LHIKAVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LHIKAVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VTTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VTTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 KVVLVLERASQGAGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMGPDSSAHDPTETFLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KVVLVLERASQGAGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMGPDSSAHDPTETFLSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FLLTHRVFMPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQWVALYGSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FLLTHRVFMPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQWVALYGSML
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 HTDPVATSFLQKLSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRRCHRLENGCGNASPQMKARNLPVWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HTDPVATSFLQKLSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRRCHRLENGCGNASPQMKARNLPVWL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PNQDEPLPGSSCAIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQEDGWTKGQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PNQDEPLPGSSCAIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQEDGWTKGQV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQEVHELIPHPDQLGPTVGSAEGLDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQEVHELIPHPDQLGPTVGSAEGLDL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 VSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHLRDVTTANLERFMRRFNELQYWVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHLRDVTTANLERFMRRFNELQYWVAT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 ELCLCPVPGPRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRLAHTWERLPHKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ELCLCPVPGPRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRLAHTWERLPHKV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 RKLYSALERLLDPSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMPLLLKDMTFIHEGNHTLVENLINFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RKLYSALERLLDPSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMPLLLKDMTFIHEGNHTLVENLINFE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 KMRMMARAARMLHHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHEDSQVARISTCSEQSLSTRSPASTWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KMRMMARAARMLHHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHEDSQVARISTCSEQSLSTRSPASTWA
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KB3 YVQQLKVIDNQRELSRLSRELEP
:::::::::::::::::::::::
CCDS41 YVQQLKVIDNQRELSRLSRELEP
910 920
>>CCDS31784.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12 (881 aa)
initn: 5930 init1: 5930 opt: 5930 Z-score: 6762.8 bits: 1262.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5930; 99.9% identity (99.9% similar) in 881 aa overlap (43-923:1-881)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 VGLAVEDSPALGAPRVGALPDVVPEGTLLNMVLRRMHRPRSCSYQLLLEHQRPSCIQGLR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MVLRRMHRPRSCSYQLLLEHQRPSCIQGLR
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 WTPLTNSEESLDFSESLEQASTERVLRAGRQLHRHLLATCPNLIRDRKYHLRLYRQCCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 WTPLTNSEESLDFSESLEQASTERVLRAGRQLHRHLLATCPNLIRDRKYHLRLYRQCCSG
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 RELVDGILALGLGVHSRSQVVGICQVLLDEGALCHVKHDWAFQDRDAQFYRFPGPEPEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RELVDGILALGLGVHSRSQVVGICQVLLDEGALCHVKHDWAFQDRDAQFYRFPGPEPEPV
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 GTHEMEEELAEAVALLSQRGPDALLTVALRKPPGQRTDEELDLIFEELLHIKAVAHLSNS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RTHEMEEELAEAVALLSQRGPDALLTVALRKPPGQRTDEELDLIFEELLHIKAVAHLSNS
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 VKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGLVTTLHEGDDFGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGLVTTLHEGDDFGQ
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 LALVNDAPRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHGKVVLVLERASQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LALVNDAPRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHGKVVLVLERASQG
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 AGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMGPDSSAHDPTETFLSDFLLTHRVFMPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMGPDSSAHDPTETFLSDFLLTHRVFMPSA
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 QLCAALLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQWVALYGSMLHTDPVATSFLQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLCAALLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQWVALYGSMLHTDPVATSFLQK
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 LSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRRCHRLENGCGNASPQMKARNLPVWLPNQDEPLPGSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRRCHRLENGCGNASPQMKARNLPVWLPNQDEPLPGSSC
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 AIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQEDGWTKGQVLVKVNSAGDAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQEDGWTKGQVLVKVNSAGDAIG
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 LQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQEVHELIPHPDQLGPTVGSAEGLDLVSAKDLAGQLTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQEVHELIPHPDQLGPTVGSAEGLDLVSAKDLAGQLTD
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KB3 HDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHLRDVTTANLERFMRRFNELQYWVATELCLCPVPGPRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHLRDVTTANLERFMRRFNELQYWVATELCLCPVPGPRA
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KB3 QLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRLAHTWERLPHKVRKLYSALERLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRLAHTWERLPHKVRKLYSALERLLD
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830 840 850
pF1KB3 PSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMPLLLKDMTFIHEGNHTLVENLINFEKMRMMARAARML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMPLLLKDMTFIHEGNHTLVENLINFEKMRMMARAARML
760 770 780 790 800 810
860 870 880 890 900 910
pF1KB3 HHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHEDSQVARISTCSEQSLSTRSPASTWAYVQQLKVIDNQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 HHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHEDSQVARISTCSEQSLSTRSPASTWAYVQQLKVIDNQR
820 830 840 850 860 870
920
pF1KB3 ELSRLSRELEP
:::::::::::
CCDS31 ELSRLSRELEP
880
>>CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (858 aa)
initn: 2380 init1: 846 opt: 2683 Z-score: 3056.3 bits: 576.7 E(32554): 6.5e-164
Smith-Waterman score: 2733; 50.1% identity (76.8% similar) in 857 aa overlap (74-923:27-855)
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 VLRRMHRPRSCSYQLLLEHQRPSCIQGLRWTPLTNSEESLDFSESLEQASTERVLRAGRQ
::: . . : .... .. .:..::::.
CCDS63 MAGLLAPPYGVMETGSNNDRIPDKENTPLIEPHVPLRPANTITKVPSEKILRAGKI
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 LHRHLLATCPNLIRDRKYHLRLYRQCCSGRELVDGILALGLGVHSRSQVVGICQVLLDEG
:. .:. :..::::::::. ::::: : :::: .. ::::.:.::. ::::..:
CCDS63 LRNAILSRAPHMIRDRKYHLKTYRQCCVGTELVDWMMQQTPCVHSRTQAVGMWQVLLEDG
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210
pF1KB3 ALCHVKHDWAFQDRDAQFYRFPGPEPE--PVGTHEM----EEELAEAVALLSQRGPDALL
.: :: .. :::. :::: : : :. :.: .::: ... :::: :::: .
CCDS63 VLNHVDQEHHFQDK-YLFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPDAHM
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 TVALRKPPGQRTDEELDLIFEELLHIKAVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQG
. ::::::::: ..:..:.::::::::..:::..::::::.::.:: :.:.:::::.::
CCDS63 RMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLFNQG
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 DKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGLVTTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRV
..::::::: ::::::: .:::.: :::::::::.:::::::::::.:.:::::::::::
CCDS63 EEGTSWYIILKGSVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHFLRV
240 250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 DKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHGKVVLVLERASQGAGPS-RPPTPGRNRYTVMSGTPEKI
::.:::::..::::.:.::.:: . :::::.. : : . . ...:::::::::::
CCDS63 DKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTVMSGTPEKI
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 LELLLEAMGPDSSAHDPTETFLSDFLLTHRVFMPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERST
:: .::.. ... .. :.. :.::.. : ::::..::: ::. :.:..:. :.:::.
CCDS63 LEHFLETIRLEATLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLCPALVAHYHAQPSQGTEQEKMD
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 YVCNKRQQILRLVSQWVALYGSMLHTDPVATSFLQKLSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRR
:. :......::: ::.:.::..:. : :. .::... :. :.:. :.:: :: ..
CCDS63 YALNNKRRVIRLVLQWAAMYGDLLQEDDVSMAFLEEFYVSVSDDARMIAALKEQLPELEK
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 CHRLENGCGNASPQMKARNLPVWLPNQDEPLPGSSCAIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQL
. . . .:: : . : . . :: . :. .:.: . . ::. :...
CCDS63 IVK-QISEDAKAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQ-PIRGSDEVLFKVYCMDHTYTTIRV
480 490 500 510 520 530
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 PVTASVREVMAALAQEDGWTKGQVLVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQ
::..::.::..:.:.. : .: ..::..:.:. . :.:. .: :.: .: :::. .
CCDS63 PVATSVKEVISAVADKLGSGEGLIIVKMSSGGEKVVLKPNDVSVFTTLTINGRLFACPRE
540 550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 EVHELIPHPDQLGPTVGSAEGLDLVSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHL
. : : :.: :::::.. ..:.:.:::: :.: .:: ::: .:..:::....: ...
CCDS63 QFDSLTPLPEQEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNF
600 610 620 630 640 650
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 RDVTTANLERFMRRFNELQYWVATELCLCPVPGPRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFA
. :::::. :.:::::.:.::.::.::: . :.:::.::::.::: :: ::::::::
CCDS63 KK-TTANLDLFLRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFA
660 670 680 690 700 710
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 VMFGLSNSAISRLAHTWERLPHKVRKLYSALERLLDPSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMP
...:::: :.:::: :::.:: : .:.:. .: :.::: :::.:::..::: ::.:::::
CCDS63 IVMGLSNVAVSRLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYRLTVAKLEPPLIPFMP
720 730 740 750 760 770
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 LLLKDMTFIHEGNHTLVENLINFEKMRMMARAARMLHHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHED
::.::::: ::::.:...::.:::::::.: .:: ... ::. :..: ..... :.:
CCDS63 LLIKDMTFTHEGNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQ---PFNPDAAQANKNHQD
780 790 800 810 820
880 890 900 910 920
pF1KB3 SQVARISTCSEQSLSTRSPASTWAYVQQLKVIDNQRELSRLSRELEP
.:: ::.::.:::::: ::..:..:::
CCDS63 ---------------VRS------YVRQLNVIDNQRTLSQMSHRLEPRRP
830 840 850
>>CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (867 aa)
initn: 2380 init1: 846 opt: 2683 Z-score: 3056.2 bits: 576.7 E(32554): 6.5e-164
Smith-Waterman score: 2733; 50.1% identity (76.8% similar) in 857 aa overlap (74-923:36-864)
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 VLRRMHRPRSCSYQLLLEHQRPSCIQGLRWTPLTNSEESLDFSESLEQASTERVLRAGRQ
::: . . : .... .. .:..::::.
CCDS42 YRQYMAGLLAPPYGVMETGSNNDRIPDKENTPLIEPHVPLRPANTITKVPSEKILRAGKI
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 LHRHLLATCPNLIRDRKYHLRLYRQCCSGRELVDGILALGLGVHSRSQVVGICQVLLDEG
:. .:. :..::::::::. ::::: : :::: .. ::::.:.::. ::::..:
CCDS42 LRNAILSRAPHMIRDRKYHLKTYRQCCVGTELVDWMMQQTPCVHSRTQAVGMWQVLLEDG
70 80 90 100 110 120
170 180 190 200 210
pF1KB3 ALCHVKHDWAFQDRDAQFYRFPGPEPE--PVGTHEM----EEELAEAVALLSQRGPDALL
.: :: .. :::. :::: : : :. :.: .::: ... :::: :::: .
CCDS42 VLNHVDQEHHFQDK-YLFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPDAHM
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 TVALRKPPGQRTDEELDLIFEELLHIKAVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQG
. ::::::::: ..:..:.::::::::..:::..::::::.::.:: :.:.:::::.::
CCDS42 RMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLFNQG
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 DKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGLVTTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRV
..::::::: ::::::: .:::.: :::::::::.:::::::::::.:.:::::::::::
CCDS42 EEGTSWYIILKGSVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHFLRV
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 DKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHGKVVLVLERASQGAGPS-RPPTPGRNRYTVMSGTPEKI
::.:::::..::::.:.::.:: . :::::.. : : . . ...:::::::::::
CCDS42 DKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTVMSGTPEKI
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 LELLLEAMGPDSSAHDPTETFLSDFLLTHRVFMPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERST
:: .::.. ... .. :.. :.::.. : ::::..::: ::. :.:..:. :.:::.
CCDS42 LEHFLETIRLEATLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLCPALVAHYHAQPSQGTEQEKMD
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 YVCNKRQQILRLVSQWVALYGSMLHTDPVATSFLQKLSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRR
:. :......::: ::.:.::..:. : :. .::... :. :.:. :.:: :: ..
CCDS42 YALNNKRRVIRLVLQWAAMYGDLLQEDDVSMAFLEEFYVSVSDDARMIAALKEQLPELEK
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 CHRLENGCGNASPQMKARNLPVWLPNQDEPLPGSSCAIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQL
. . . .:: : . : . . :: . :. .:.: . . ::. :...
CCDS42 IVK-QISEDAKAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQ-PIRGSDEVLFKVYCMDHTYTTIRV
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 PVTASVREVMAALAQEDGWTKGQVLVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQ
::..::.::..:.:.. : .: ..::..:.:. . :.:. .: :.: .: :::. .
CCDS42 PVATSVKEVISAVADKLGSGEGLIIVKMSSGGEKVVLKPNDVSVFTTLTINGRLFACPRE
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 EVHELIPHPDQLGPTVGSAEGLDLVSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHL
. : : :.: :::::.. ..:.:.:::: :.: .:: ::: .:..:::....: ...
CCDS42 QFDSLTPLPEQEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNF
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 RDVTTANLERFMRRFNELQYWVATELCLCPVPGPRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFA
. :::::. :.:::::.:.::.::.::: . :.:::.::::.::: :: ::::::::
CCDS42 KK-TTANLDLFLRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFA
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 VMFGLSNSAISRLAHTWERLPHKVRKLYSALERLLDPSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMP
...:::: :.:::: :::.:: : .:.:. .: :.::: :::.:::..::: ::.:::::
CCDS42 IVMGLSNVAVSRLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYRLTVAKLEPPLIPFMP
730 740 750 760 770 780
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 LLLKDMTFIHEGNHTLVENLINFEKMRMMARAARMLHHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHED
::.::::: ::::.:...::.:::::::.: .:: ... ::. :..: ..... :.:
CCDS42 LLIKDMTFTHEGNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQ---PFNPDAAQANKNHQD
790 800 810 820 830
880 890 900 910 920
pF1KB3 SQVARISTCSEQSLSTRSPASTWAYVQQLKVIDNQRELSRLSRELEP
.:: ::.::.:::::: ::..:..:::
CCDS42 ---------------VRS------YVRQLNVIDNQRTLSQMSHRLEPRRP
840 850 860
>>CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (1011 aa)
initn: 2380 init1: 846 opt: 2683 Z-score: 3055.2 bits: 576.7 E(32554): 7.4e-164
Smith-Waterman score: 2733; 50.1% identity (76.8% similar) in 857 aa overlap (74-923:180-1008)
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 VLRRMHRPRSCSYQLLLEHQRPSCIQGLRWTPLTNSEESLDFSESLEQASTERVLRAGRQ
::: . . : .... .. .:..::::.
CCDS42 YRQYMAGLLAPPYGVMETGSNNDRIPDKENTPLIEPHVPLRPANTITKVPSEKILRAGKI
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 LHRHLLATCPNLIRDRKYHLRLYRQCCSGRELVDGILALGLGVHSRSQVVGICQVLLDEG
:. .:. :..::::::::. ::::: : :::: .. ::::.:.::. ::::..:
CCDS42 LRNAILSRAPHMIRDRKYHLKTYRQCCVGTELVDWMMQQTPCVHSRTQAVGMWQVLLEDG
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210
pF1KB3 ALCHVKHDWAFQDRDAQFYRFPGPEPE--PVGTHEM----EEELAEAVALLSQRGPDALL
.: :: .. :::. :::: : : :. :.: .::: ... :::: :::: .
CCDS42 VLNHVDQEHHFQDK-YLFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPDAHM
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 TVALRKPPGQRTDEELDLIFEELLHIKAVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQG
. ::::::::: ..:..:.::::::::..:::..::::::.::.:: :.:.:::::.::
CCDS42 RMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLFNQG
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 DKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGLVTTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRV
..::::::: ::::::: .:::.: :::::::::.:::::::::::.:.:::::::::::
CCDS42 EEGTSWYIILKGSVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHFLRV
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 DKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHGKVVLVLERASQGAGPS-RPPTPGRNRYTVMSGTPEKI
::.:::::..::::.:.::.:: . :::::.. : : . . ...:::::::::::
CCDS42 DKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTVMSGTPEKI
450 460 470 480 490 500
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 LELLLEAMGPDSSAHDPTETFLSDFLLTHRVFMPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERST
:: .::.. ... .. :.. :.::.. : ::::..::: ::. :.:..:. :.:::.
CCDS42 LEHFLETIRLEATLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLCPALVAHYHAQPSQGTEQEKMD
510 520 530 540 550 560
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 YVCNKRQQILRLVSQWVALYGSMLHTDPVATSFLQKLSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRR
:. :......::: ::.:.::..:. : :. .::... :. :.:. :.:: :: ..
CCDS42 YALNNKRRVIRLVLQWAAMYGDLLQEDDVSMAFLEEFYVSVSDDARMIAALKEQLPELEK
570 580 590 600 610 620
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 CHRLENGCGNASPQMKARNLPVWLPNQDEPLPGSSCAIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQL
. . . .:: : . : . . :: . :. .:.: . . ::. :...
CCDS42 IVK-QISEDAKAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQ-PIRGSDEVLFKVYCMDHTYTTIRV
630 640 650 660 670 680
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 PVTASVREVMAALAQEDGWTKGQVLVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQ
::..::.::..:.:.. : .: ..::..:.:. . :.:. .: :.: .: :::. .
CCDS42 PVATSVKEVISAVADKLGSGEGLIIVKMSSGGEKVVLKPNDVSVFTTLTINGRLFACPRE
690 700 710 720 730 740
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 EVHELIPHPDQLGPTVGSAEGLDLVSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHL
. : : :.: :::::.. ..:.:.:::: :.: .:: ::: .:..:::....: ...
CCDS42 QFDSLTPLPEQEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNF
750 760 770 780 790 800
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 RDVTTANLERFMRRFNELQYWVATELCLCPVPGPRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFA
. :::::. :.:::::.:.::.::.::: . :.:::.::::.::: :: ::::::::
CCDS42 KK-TTANLDLFLRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFA
810 820 830 840 850 860
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 VMFGLSNSAISRLAHTWERLPHKVRKLYSALERLLDPSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMP
...:::: :.:::: :::.:: : .:.:. .: :.::: :::.:::..::: ::.:::::
CCDS42 IVMGLSNVAVSRLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYRLTVAKLEPPLIPFMP
870 880 890 900 910 920
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 LLLKDMTFIHEGNHTLVENLINFEKMRMMARAARMLHHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHED
::.::::: ::::.:...::.:::::::.: .:: ... ::. :..: ..... :.:
CCDS42 LLIKDMTFTHEGNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQ---PFNPDAAQANKNHQD
930 940 950 960 970 980
880 890 900 910 920
pF1KB3 SQVARISTCSEQSLSTRSPASTWAYVQQLKVIDNQRELSRLSRELEP
.:: ::.::.:::::: ::..:..:::
CCDS42 ---------------VRS------YVRQLNVIDNQRTLSQMSHRLEPRRP
990 1000 1010
>>CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (840 aa)
initn: 2367 init1: 846 opt: 2670 Z-score: 3041.6 bits: 573.9 E(32554): 4.3e-163
Smith-Waterman score: 2720; 50.7% identity (77.2% similar) in 841 aa overlap (90-923:25-837)
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LEHQRPSCIQGLRWTPLTNSEESLDFSESLEQASTERVLRAGRQLHRHLLATCPNLIRDR
:.. .:..::::. :. .:. :..::::
CCDS63 MAGLLAPPYGVMETGSNNDRIPDKENVPSEKILRAGKILRNAILSRAPHMIRDR
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 KYHLRLYRQCCSGRELVDGILALGLGVHSRSQVVGICQVLLDEGALCHVKHDWAFQDRDA
::::. ::::: : :::: .. ::::.:.::. ::::..:.: :: .. :::.
CCDS63 KYHLKTYRQCCVGTELVDWMMQQTPCVHSRTQAVGMWQVLLEDGVLNHVDQEHHFQDK-Y
60 70 80 90 100 110
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 QFYRFPGPEPE--PVGTHEM----EEELAEAVALLSQRGPDALLTVALRKPPGQRTDEEL
:::: : : :. :.: .::: ... :::: :::: . . ::::::::: ..:
CCDS63 LFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECDEELQDTMLLLSQMGPDAHMRMILRKPPGQRTVDDL
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 DLIFEELLHIKAVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNV
..:.::::::::..:::..::::::.::.:: :.:.:::::.::..::::::: ::::::
CCDS63 EIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELAGVLIFESHAKGGTVLFNQGEEGTSWYIILKGSVNV
180 190 200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 VTHGKGLVTTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRIIKDVEAKT
: .:::.: :::::::::.:::::::::::.:.:::::::::::::.:::::..::::.:
CCDS63 VIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVNDAPRAASIVLREDNCHFLRVDKEDFNRILRDVEANT
240 250 260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 MRLEEHGKVVLVLERASQGAGPS-RPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMGPDSSAHD
.::.:: . :::::.. : : . . ...::::::::::::: .::.. ... ..
CCDS63 VRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTVMSGTPEKILEHFLETIRLEATLNE
300 310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 PTETFLSDFLLTHRVFMPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQW
:.. :.::.. : ::::..::: ::. :.:..:. :.:::. :. :......::: ::
CCDS63 ATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLCPALVAHYHAQPSQGTEQEKMDYALNNKRRVIRLVLQW
360 370 380 390 400 410
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 VALYGSMLHTDPVATSFLQKLSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRRCHRLENGCGNASPQMK
.:.::..:. : :. .::... :. :.:. :.:: :: .. . . . .:: :
CCDS63 AAMYGDLLQEDDVSMAFLEEFYVSVSDDARMIAALKEQLPELEKIVK-QISEDAKAPQKK
420 430 440 450 460 470
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 ARNLPVWLPNQDEPLPGSSCAIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQE
. : . . :: . :. .:.: . . ::. :...::..::.::..:.:..
CCDS63 HKVLLQQFNTGDERAQKRQ-PIRGSDEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEVISAVADK
480 490 500 510 520 530
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 DGWTKGQVLVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQEVHELIPHPDQLGPTV
: .: ..::..:.:. . :.:. .: :.: .: :::. .. : : :.: ::::
CCDS63 LGSGEGLIIVKMSSGGEKVVLKPNDVSVFTTLTINGRLFACPREQFDSLTPLPEQEGPTV
540 550 560 570 580 590
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 GSAEGLDLVSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHLRDVTTANLERFMRRFN
:.. ..:.:.:::: :.: .:: ::: .:..:::....: .... :::::. :.::::
CCDS63 GTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKK-TTANLDLFLRRFN
600 610 620 630 640 650
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 ELQYWVATELCLCPVPGPRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRLAHT
:.:.::.::.::: . :.:::.::::.::: :: ::::::::...:::: :.:::: :
CCDS63 EIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVSRLALT
660 670 680 690 700 710
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 WERLPHKVRKLYSALERLLDPSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMPLLLKDMTFIHEGNHTL
::.:: : .:.:. .: :.::: :::.:::..::: ::.:::::::.::::: ::::.:.
CCDS63 WEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYRLTVAKLEPPLIPFMPLLIKDMTFTHEGNKTF
720 730 740 750 760 770
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 VENLINFEKMRMMARAARMLHHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHEDSQVARISTCSEQSLST
..::.:::::::.: .:: ... ::. :..: ..... :.: .
CCDS63 IDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQ---PFNPDAAQANKNHQD---------------V
780 790 800 810
900 910 920
pF1KB3 RSPASTWAYVQQLKVIDNQRELSRLSRELEP
:: ::.::.:::::: ::..:..:::
CCDS63 RS------YVRQLNVIDNQRTLSQMSHRLEPRRP
820 830 840
>>CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (791 aa)
initn: 2303 init1: 846 opt: 2606 Z-score: 2968.9 bits: 560.4 E(32554): 4.8e-159
Smith-Waterman score: 2656; 51.1% identity (77.2% similar) in 816 aa overlap (115-923:1-788)
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 FSESLEQASTERVLRAGRQLHRHLLATCPNLIRDRKYHLRLYRQCCSGRELVDGILALGL
.::::::::. ::::: : :::: ..
CCDS74 MIRDRKYHLKTYRQCCVGTELVDWMMQQTP
10 20 30
150 160 170 180 190
pF1KB3 GVHSRSQVVGICQVLLDEGALCHVKHDWAFQDRDAQFYRFPGPEPE--PVGTHEM----E
::::.:.::. ::::..:.: :: .. :::. :::: : : :. :.: .
CCDS74 CVHSRTQAVGMWQVLLEDGVLNHVDQEHHFQDK-YLFYRFLDDEHEDAPLPTEEEKKECD
40 50 60 70 80
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 EELAEAVALLSQRGPDALLTVALRKPPGQRTDEELDLIFEELLHIKAVAHLSNSVKRELA
::: ... :::: :::: . . ::::::::: ..:..:.::::::::..:::..::::::
CCDS74 EELQDTMLLLSQMGPDAHMRMILRKPPGQRTVDDLEIIYEELLHIKALSHLSTTVKRELA
90 100 110 120 130 140
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 AVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGLVTTLHEGDDFGQLALVND
.::.:: :.:.:::::.::..::::::: ::::::: .:::.: :::::::::.::::::
CCDS74 GVLIFESHAKGGTVLFNQGEEGTSWYIILKGSVNVVIYGKGVVCTLHEGDDFGKLALVND
150 160 170 180 190 200
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 APRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRIIKDVEAKTMRLEEHGKVVLVLERASQGAGPS-R
:::::.:.:::::::::::::.:::::..::::.:.::.:: . :::::.. : : .
CCDS74 APRAASIVLREDNCHFLRVDKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQ
210 220 230 240 250 260
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 PPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMGPDSSAHDPTETFLSDFLLTHRVFMPSAQLCAA
. ...::::::::::::: .::.. ... .. :.. :.::.. : ::::..::: :
CCDS74 GNSQPQQKYTVMSGTPEKILEHFLETIRLEATLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLCPA
270 280 290 300 310 320
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 LLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQWVALYGSMLHTDPVATSFLQKLSDLV
:. :.:..:. :.:::. :. :......::: ::.:.::..:. : :. .::... :
CCDS74 LVAHYHAQPSQGTEQEKMDYALNNKRRVIRLVLQWAAMYGDLLQEDDVSMAFLEEFYVSV
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 GRDTRLSNLLREQWPERRRCHRLENGCGNASPQMKARNLPVWLPNQDEPLPGSSCAIQVG
. :.:. :.:: :: .. . . . .:: : . : . . :: . :. .
CCDS74 SDDARMIAALKEQLPELEKIVK-QISEDAKAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQ-PIRGS
390 400 410 420 430 440
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 DKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQEDGWTKGQVLVKVNSAGDAIGLQPDA
:.: . . ::. :...::..::.::..:.:.. : .: ..::..:.:. . :.:.
CCDS74 DEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEVISAVADKLGSGEGLIIVKMSSGGEKVVLKPND
450 460 470 480 490 500
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 RGVATSLGLNERLFVVNPQEVHELIPHPDQLGPTVGSAEGLDLVSAKDLAGQLTDHDWSL
.: :.: .: :::. .. : : :.: :::::.. ..:.:.:::: :.: .:: :
CCDS74 VSVFTTLTINGRLFACPREQFDSLTPLPEQEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWEL
510 520 530 540 550 560
680 690 700 710 720 730
pF1KB3 FNSIHQVELIHYVLGPQHLRDVTTANLERFMRRFNELQYWVATELCLCPVPGPRAQLLRK
:: .:..:::....: .... :::::. :.:::::.:.::.::.::: . :.:::.:
CCDS74 FNCVHELELIYHTFGRHNFKK-TTANLDLFLRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKK
570 580 590 600 610 620
740 750 760 770 780 790
pF1KB3 FIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRLAHTWERLPHKVRKLYSALERLLDPSWNH
:::.::: :: ::::::::...:::: :.:::: :::.:: : .:.:. .: :.::: ::
CCDS74 FIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVSRLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNH
630 640 650 660 670 680
800 810 820 830 840 850
pF1KB3 RVYRLALAKLSPPVIPFMPLLLKDMTFIHEGNHTLVENLINFEKMRMMARAARMLHHCRS
:.:::..::: ::.:::::::.::::: ::::.:...::.:::::::.: .:: ... ::
CCDS74 RAYRLTVAKLEPPLIPFMPLLIKDMTFTHEGNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRS
690 700 710 720 730 740
860 870 880 890 900 910
pF1KB3 HNPVPLSPLRSRVSHLHEDSQVARISTCSEQSLSTRSPASTWAYVQQLKVIDNQRELSRL
. :..: ..... :.: .:: ::.::.:::::: ::..
CCDS74 Q---PFNPDAAQANKNHQD---------------VRS------YVRQLNVIDNQRTLSQM
750 760 770 780
920
pF1KB3 SRELEP
:..:::
CCDS74 SHRLEPRRP
790
>>CCDS55093.1 RAPGEF5 gene_id:9771|Hs108|chr7 (730 aa)
initn: 1110 init1: 677 opt: 1225 Z-score: 1392.9 bits: 268.7 E(32554): 2.9e-71
Smith-Waterman score: 1320; 35.6% identity (64.9% similar) in 744 aa overlap (153-880:3-718)
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LRLYRQCCSGRELVDGILALGLGVHSRSQVVGICQVLLDEGALCHVKHDWAFQDRDAQFY
.:. :.::: : . : . ::: . ::
CCDS55 MAIGVWQLLLDMGIMLSVDQHLYFQDTYV-FY
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 RFPGPEPEPVGTH-EMEEELAEAVALLSQRGPDALLTVALRKPPGQRTDEELDLIFEELL
.: . : . . : ::: ..: :: : : . : . . .... :
CCDS55 QFSSDECSYLYCEFEREEEWQNGVKLLLQLVP----LIPARGGICELSHQKIEDSEESSD
40 50 60 70 80
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HIKAVAHLSNSVKRELAAVLLFEPHSKAGTVLFSQGDKGTSWYIIWKGSVNVVTHGKGLV
.: ...:...:.::::::. .. ...: . : ..... .. . .: :..
CCDS55 EI--LVRLTSAVQRELAAVIALKARKSA----IEQDEENNDKHVAVTEAESVPDSQAGVM
90 100 110 120 130 140
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TTLHEGDDFGQLALVNDAPRAATIILREDNCHFLRVDKQDFNRII-KDVEAKTMRLEEHG
:.: :..:.. ::. : ..: .::..::.. .. .: :. :....:.
CCDS55 CKLQERDEIGRIELVQK--------LAKENYQFLQTDKKEQEKSEHQDDEVTTVQVKEQD
150 160 170 180 190
370 380 390 400 410
pF1KB3 KVVLVLERASQGAGPSRPPTPGRN----RYTVMSGTPEKILELLLEAMGPDSSAHDPTET
. ::::... : ::. :: : ::.:.::::::::: ::. . . :::
CCDS55 QSVLVLKKV-QCCGPA--PTAGSAESHWRYVVVSGTPEKILEHLLNDLHLEEVQDKETET
200 210 220 230 240 250
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 FLSDFLLTHRVFMPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQWVALY
.:.:::::. ::: . .:: :::.:. .. :.:. .. : .....:.:::::.:::
CCDS55 LLDDFLLTYTVFMTTDDLCQALLRHYSAKKYQGKEE--NSDVPRRKRKVLHLVSQWIALY
260 270 280 290 300
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 GSMLHTDPVATSFLQKLSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRRC---HRLENGCGNASPQMKA
. : : . ::. . : :. .:... : .. :: .. . ::: :
CCDS55 KDWLPEDEHSKMFLKTIYRNVLDDVYEYPILEKELKEFQKILGMHR-RHTVDEYSPQKKN
310 320 330 340 350 360
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 RNLPVWLPNQDEPLPGSSCAIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQED
. : . ... : . . .. ... . .:: .... :.. ..:.. ..:..
CCDS55 KALFHQFSLKENWLQHRGTVTET-EEIFCHVYITEHSYVSVKAKVSSIAQEILKVVAEKI
370 380 390 400 410 420
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 GWTKGQV-LVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQEVHELIPHPDQLGPTV
... .. :: .. .:. :::. .. :: . :..: . . : : ..
CCDS55 QYAEEDLALVAITFSGEKHELQPNDLVISKSLEASGRIYVYRKDLADTLNPFAENEESQQ
430 440 450 460 470 480
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 GSAEGLDLVSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHLRDVTTANLERFMRRFN
: . : . .. ::: .: . :::::::::. :::..... : . :::: ...: :
CCDS55 RSMRILGM-NTWDLALELMNFDWSLFNSIHEQELIYFTFSRQGSGE-HTANLSLLLQRCN
490 500 510 520 530 540
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 ELQYWVATELCLCPVPGPRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRLAHT
:.: :::::. :: : :.::..::::.::: : :.:::::::...::.....:::..:
CCDS55 EVQLWVATEILLCSQLGKRVQLVKKFIKIAAHCKAQRNLNSFFAIVMGLNTASVSRLSQT
550 560 570 580 590 600
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 WERLPHKVRKLYSALERLLDPSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMPLLLKDMTFIHEGNHTL
::..: : .::.: :: : ::: ::..:: :. :..:: ::::::::::.:::::::.:.
CCDS55 WEKIPGKFKKLFSELESLTDPSLNHKAYRDAFKKMKPPKIPFMPLLLKDVTFIHEGNKTF
610 620 630 640 650 660
840 850 860 870 880
pF1KB3 VENLINFEKMRMMARAARMLHHCRSHNPVPLSP-----LRSRVSHLHE-DSQVARISTCS
..::.::::..:.: ..: :.:::... ::: :.: :.::. ::: :
CCDS55 LDNLVNFEKLHMIADTVRTLRHCRTNQFGDLSPKEHQELKSYVNHLYVIDSQQALFELSH
670 680 690 700 710 720
890 900 910 920
pF1KB3 EQSLSTRSPASTWAYVQQLKVIDNQRELSRLSRELEP
CCDS55 RIEPRV
730
>>CCDS77023.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 (505 aa)
initn: 735 init1: 579 opt: 939 Z-score: 1068.8 bits: 208.2 E(32554): 3.3e-53
Smith-Waterman score: 957; 34.3% identity (64.4% similar) in 537 aa overlap (399-922:1-501)
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ASQGAGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMGPDSSAHDPTETFLSDFLLTHRVF
..:. : :. : . .:.:..::: .:
CCDS77 MMLRPGYPLSQESFPIDILLDDIVLTHSLF
10 20 30
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 MPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQWVALYGSMLHTDPVATS
.:. .. : :.. :. ::: : .. ...: : .. ... : ..:. . :
CCDS77 LPTEKFLQEL-HQYFVR-AGGMEGPEGL---GRKQACLAMLLHFLDTYQGLLQEEEGAGH
40 50 60 70 80
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FLQKLSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRRCHRLENGCG------NASPQMKARNLPVWLPN
... : :. .: : . ::: . : :.: . : :. ... : .
CCDS77 IIKDLYLLIMKDESLYQGLRE---DTLRLHQLVETVELKIPEENQPPSKQVKPLFRHFRR
90 100 110 120 130 140
550 560 570 580 590
pF1KB3 QDEPLPGSSCAIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQE-------DGW
: : . :.. .:.. . :::: .:.. ..:::.......... :
CCDS77 IDSCLQ-TRVAFRGSDEIFCRVYMPDHSYVTIRSRLSASVQDILGSVTEKLQYSEEPAGR
150 160 170 180 190 200
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 TKGQVLVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQEVHELIPHPDQLGPTVGSA
. .:: :.:.:. . ::: : :.::.: .::. . . . :.: :... . :..
CCDS77 EDSLILVAVSSSGEKVLLQPTEDCVFTALGINSHLFACTRDSYEALVPLPEEIQVSPGDT
210 220 230 240 250 260
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 EGLDLVSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHLRDVTTANLERFMRRFNELQ
: . : .:.:..:: : :: .:..:.. ::. .. : ::::: ...: .:.
CCDS77 E-IHRVEPEDVANHLTAFHWELFRCVHELEFVDYVFHGERGRR-ETANLELLLQRCSEVT
270 280 290 300 310
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 YWVATELCLCPVPGPRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRLAHTWER
.:::::. :: .:: :::::.::::.:: :....: ::.::..::.:.:.::: :::.
CCDS77 HWVATEVLLCEAPGKRAQLLKKFIKIAALCKQNQDLLSFYAVVMGLDNAAVSRLRLTWEK
320 330 340 350 360 370
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 LPHKVRKLYSALERLLDPSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMPLLLKDMTFIHEGNHTLVEN
:: : ..:. .: : :: ::. :: ...:..::::::.::.:::.::.:::..:::..
CCDS77 LPGKFKNLFRKFENLTDPCRNHKSYREVISKMKPPVIPFVPLILKDLTFLHEGSKTLVDG
380 390 400 410 420 430
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 LINFEKMRMMARAARMLHHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHEDSQVARISTCSEQSLSTRSP
:.:.::.. .:. .: ... ::. :. :. ... .::.
CCDS77 LVNIEKLHSVAEKVRTIRKYRSR-PLCLD-MEASPNHLQ---------------------
440 450 460 470
900 910 920
pF1KB3 ASTWAYVQQLKVIDNQRELSRLSRELEP
: :::.:..::::: : .:: .::
CCDS77 --TKAYVRQFQVIDNQNLLFELSYKLEANSQ
480 490 500
>>CCDS77022.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 (511 aa)
initn: 735 init1: 579 opt: 925 Z-score: 1052.7 bits: 205.2 E(32554): 2.6e-52
Smith-Waterman score: 943; 34.3% identity (64.1% similar) in 543 aa overlap (399-922:1-507)
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 ASQGAGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMGPDSSAH----DPTETF--LSDFL
.:.. : ::.: . : . :.:..
CCDS77 MLIHPRGLPSSSHRRKINSTYFYILLDDIV
10 20 30
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LTHRVFMPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQWVALYGSMLHT
::: .:.:. .. : :.. :. ::: : .. ...: : .. ... : ..:.
CCDS77 LTHSLFLPTEKFLQEL-HQYFVR-AGGMEGPEGL---GRKQACLAMLLHFLDTYQGLLQE
40 50 60 70 80
490 500 510 520 530
pF1KB3 DPVATSFLQKLSDLVGRDTRLSNLLREQWPERRRCHRLENGCG------NASPQMKARNL
. : ... : :. .: : . ::: . : :.: . : :. ... :
CCDS77 EEGAGHIIKDLYLLIMKDESLYQGLRE---DTLRLHQLVETVELKIPEENQPPSKQVKPL
90 100 110 120 130 140
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 PVWLPNQDEPLPGSSCAIQVGDKVPYDICRPDHSVLTLQLPVTASVREVMAALAQE----
. : : . :.. .:.. . :::: .:.. ..:::..........
CCDS77 FRHFRRIDSCLQ-TRVAFRGSDEIFCRVYMPDHSYVTIRSRLSASVQDILGSVTEKLQYS
150 160 170 180 190 200
600 610 620 630 640
pF1KB3 ---DGWTKGQVLVKVNSAGDAIGLQPDARGVATSLGLNERLFVVNPQEVHELIPHPDQLG
: . .:: :.:.:. . ::: : :.::.: .::. . . . :.: :...
CCDS77 EEPAGREDSLILVAVSSSGEKVLLQPTEDCVFTALGINSHLFACTRDSYEALVPLPEEIQ
210 220 230 240 250 260
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 PTVGSAEGLDLVSAKDLAGQLTDHDWSLFNSIHQVELIHYVLGPQHLRDVTTANLERFMR
. :..: . : .:.:..:: : :: .:..:.. ::. .. : ::::: ...
CCDS77 VSPGDTE-IHRVEPEDVANHLTAFHWELFRCVHELEFVDYVFHGERGRR-ETANLELLLQ
270 280 290 300 310
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 RFNELQYWVATELCLCPVPGPRAQLLRKFIKLAAHLKEQKNLNSFFAVMFGLSNSAISRL
: .:. .:::::. :: .:: :::::.::::.:: :....: ::.::..::.:.:.:::
CCDS77 RCSEVTHWVATEVLLCEAPGKRAQLLKKFIKIAALCKQNQDLLSFYAVVMGLDNAAVSRL
320 330 340 350 360 370
770 780 790 800 810 820
pF1KB3 AHTWERLPHKVRKLYSALERLLDPSWNHRVYRLALAKLSPPVIPFMPLLLKDMTFIHEGN
:::.:: : ..:. .: : :: ::. :: ...:..::::::.::.:::.::.:::.
CCDS77 RLTWEKLPGKFKNLFRKFENLTDPCRNHKSYREVISKMKPPVIPFVPLILKDLTFLHEGS
380 390 400 410 420 430
830 840 850 860 870 880
pF1KB3 HTLVENLINFEKMRMMARAARMLHHCRSHNPVPLSPLRSRVSHLHEDSQVARISTCSEQS
.:::..:.:.::.. .:. .: ... ::. :. :. ... .::.
CCDS77 KTLVDGLVNIEKLHSVAEKVRTIRKYRSR-PLCLD-MEASPNHLQ---------------
440 450 460 470 480
890 900 910 920
pF1KB3 LSTRSPASTWAYVQQLKVIDNQRELSRLSRELEP
: :::.:..::::: : .:: .::
CCDS77 --------TKAYVRQFQVIDNQNLLFELSYKLEANSQ
490 500 510
923 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 12:51:17 2016 done: Thu Nov 3 12:51:17 2016
Total Scan time: 3.140 Total Display time: 0.270
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]