Result of FASTA (ccds) for
pF1KB1326
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB1326, 942 aa
1>>>pF1KB1326 942 - 942 aa - 942 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9727+/-0.000962; mu= 11.4309+/- 0.058
mean_var=202.0962+/-41.937, 0's: 0 Z-trim(113.2): 55 B-trim: 132 in 1/50
Lambda= 0.090218
statistics sampled from 13836 (13890) to 13836 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.427), width: 16
Scan time: 5.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3342.1 DGKQ gene_id:1609|Hs108|chr4 ( 942) 6516 861.3 0
CCDS11590.1 DGKE gene_id:8526|Hs108|chr17 ( 567) 871 126.4 1.6e-28
CCDS55758.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 906) 832 121.5 7.4e-27
CCDS55759.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 928) 832 121.5 7.5e-27
CCDS44580.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 929) 832 121.5 7.5e-27
CCDS44579.2 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 933) 832 121.5 7.5e-27
CCDS55757.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 934) 832 121.5 7.5e-27
CCDS7918.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 ( 945) 832 121.5 7.6e-27
CCDS41640.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 (1117) 832 121.6 8.6e-27
CCDS83227.1 DGKI gene_id:9162|Hs108|chr7 ( 734) 781 114.8 6.3e-25
CCDS5845.1 DGKI gene_id:9162|Hs108|chr7 (1065) 781 114.9 8.3e-25
CCDS47548.1 DGKB gene_id:1607|Hs108|chr7 ( 773) 584 89.2 3.4e-17
CCDS47547.1 DGKB gene_id:1607|Hs108|chr7 ( 804) 584 89.2 3.5e-17
CCDS43181.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 ( 752) 583 89.0 3.7e-17
CCDS3274.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 ( 791) 583 89.0 3.8e-17
CCDS43182.1 DGKG gene_id:1608|Hs108|chr3 ( 766) 551 84.9 6.7e-16
CCDS8896.1 DGKA gene_id:1606|Hs108|chr12 ( 735) 548 84.5 8.5e-16
CCDS46546.1 DGKD gene_id:8527|Hs108|chr2 (1170) 456 72.7 4.8e-12
CCDS2504.1 DGKD gene_id:8527|Hs108|chr2 (1214) 456 72.7 4.9e-12
CCDS55899.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1084) 448 71.6 9.3e-12
CCDS55898.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1100) 448 71.6 9.4e-12
CCDS9382.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1164) 448 71.6 9.8e-12
CCDS9381.1 DGKH gene_id:160851|Hs108|chr13 (1220) 448 71.6 1e-11
CCDS75980.1 DGKK gene_id:139189|Hs108|chrX (1271) 447 71.5 1.1e-11
>>CCDS3342.1 DGKQ gene_id:1609|Hs108|chr4 (942 aa)
initn: 6516 init1: 6516 opt: 6516 Z-score: 4593.7 bits: 861.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6516; 99.9% identity (100.0% similar) in 942 aa overlap (1-942:1-942)
10 20 30 40 50 60
pF1KB1 MAAAAEPGARAWLGGGSPRPGSPACSPVLGSGGRARPGPGPGPGPERAGVRAPGPAAAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MAAAAEPGARAWLGGGSPRPGSPACSPVLGSGGRARPGPGPGPGPERAGVRAPGPAAAPG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB1 HSFRKVTLTKPTFCHLCSDFIWGLAGFLCDVCNFMSHEKCLKHVRIPCTSVAPSLVRVPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HSFRKVTLTKPTFCHLCSDFIWGLAGFLCDVCNFMSHEKCLKHVRIPCTSVAPSLVRVPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB1 AHCFGPRGLHKRKFCAVCRKVLEAPALHCEVCELHLHPDCVPFACSDCRQCHQDGHQDHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AHCFGPRGLHKRKFCAVCRKVLEAPALHCEVCELHLHPDCVPFACSDCRQCHQDGHQDHD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB1 THHHHWREGNLPSGARCEVCRKTCGSSDVLAGVRCEWCGVQAHSLCSAALAPECGFGRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 THHHHWREGNLPSGARCEVCRKTCGSSDVLAGVRCEWCGVQAHSLCSAALAPECGFGRLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB1 SLVLPPACVRLLPGGFSKTQSFRIVEAAEPGEGGDGADGSAAVGPGRETQATPESGKQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SLVLPPACVRLLPGGFSKTQSFRIVEAAEPGEGGDGADGSAAVGPGRETQATPESGKQTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB1 KIFDGDDAVRRSQFRLVTVSRLAGAEEVLEAALRAHHIPEDPGHLELCRLPPSSQACDAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KIFDGDDAVRRSQFRLVTVSRLAGAEEVLEAALRAHHIPEDPGHLELCRLPPSSQACDAW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB1 AGGKAGSAVISEEGRSPGSGEATPEAWVIRALPRAQEVLKIYPGWLKVGVAYVSVRVTPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AGGKAGSAVISEEGRSPGSGEATPEAWVIRALPRAQEVLKIYPGWLKVGVAYVSVRVTPK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB1 STARSVVLEVLPLLGRQAESPESFQLVEVAMGCRHVQRTMLMDEQPLLDRLQDIRQMSVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 STARSVVLEVLPLLGRQAESPESFQLVEVAMGCRHVQRTMLMDEQPLLDRLQDIRQMSVR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB1 QVSQTRFYVAESRDVAPHVSLFVGGLPPGLSPEEYSSLLHEAGATKATVVSVSHIYSSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QVSQTRFYVAESRDVAPHVSLFVGGLPPGLSPEEYSSLLHEAGATKATVVSVSHIYSSQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 AVVLDVACFAEAERLYMLLKDMAVRGRLLTALVLPDLLHAKLPPDSCPLLVFVNPKSGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AVVLDVACFAEAERLYMLLKDMAVRGRLLTALVLPDLLHAKLPPDSCPLLVFVNPKSGGL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 KGRDLLCSFRKLLNPHQVFDLTNGGPLPGLHLFSQVPCFRVLVCGGDGTVGWVLGALEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGRDLLCSFRKLLNPHQVFDLTNGGPLPGLHLFSQVPCFRVLVCGGDGTVGWVLGALEET
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 RYRLACPEPSVAILPLGTGNDLGRVLRWGAGYSGEDPFSVLLSVDEADAVLMDRWTILLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RYRLACPEPSVAILPLGTGNDLGRVLRWGAGYSGEDPFSVLLSVDEADAVLMDRWTILLD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB1 AHEAGSAENDTADAEPPKIVQMSNYCGIGIDAELSLDFHQAREEEPGKFTSRLHNKGVYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AHEAGSAENDTADAEPPKIVQMSNYCGIGIDAELSLDFHQAREEEPGKFTSRLHNKGVYV
730 740 750 760 770 780
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pF1KB1 RVGLQKISHSRSLHKQIRLQVERQEVELPSIEGLIFINIPSWGSGADLWGSDSDTRFEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RVGLQKISHSRSLHKQIRLQVERQEVELPSIEGLIFINIPSWGSGADLWGSDSDTRFEKP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB1 RMDDGLLEVVGVTGVVYMGQVQGGLRSGIRIAQGSYFRVTLLKATPVQVDGEPWVQAPGH
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RMDDGLLEVVGVTGVVHMGQVQGGLRSGIRIAQGSYFRVTLLKATPVQVDGEPWVQAPGH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940
pF1KB1 MIISAAGPKVHMLRKAKQKPRRAGTTRDARADAAPAPESDPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MIISAAGPKVHMLRKAKQKPRRAGTTRDARADAAPAPESDPR
910 920 930 940
>>CCDS11590.1 DGKE gene_id:8526|Hs108|chr17 (567 aa)
initn: 1003 init1: 248 opt: 871 Z-score: 625.7 bits: 126.4 E(32554): 1.6e-28
Smith-Waterman score: 871; 40.4% identity (67.3% similar) in 361 aa overlap (576-928:207-559)
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 VACFAEAERLYMLLKDMAVRGRLLTALVLPDLLHAKLPPDSCPLLVFVNPKSGGLKGRDL
..: .:: . ::....: .:: :. :
CCDS11 CDFGEFKNLIIPPSYLTSINQMRKDKKTDYEVLASKLGKQWTPLIILANSRSGTNMGEGL
180 190 200 210 220 230
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 LCSFRKLLNPHQVFDLTNGGPLPGLHLFSQVPCF--RVLVCGGDGTVGWVLGALEETRYR
: :: :::: ::::.:. :. .:.: . .: . ::::::::::::::: :... . .
CCDS11 LGEFRILLNPVQVFDVTKTPPIKALQLCTLLPYYSARVLVCGGDGTVGWVLDAVDDMKIK
240 250 260 270 280 290
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 LACPE-PSVAILPLGTGNDLGRVLRWGAGYSGEDPFS-VLLSVDEADAVLMDRWTILLDA
:.::.:::::::::. .: ::.::.:: : . :: .: :::.. .::: . .
CCDS11 GQEKYIPQVAVLPLGTGNDLSNTLGWGTGYAGEIPVAQVLRNVMEADGIKLDRWKVQV--
300 310 320 330 340 350
730 740 750 760 770 780
pF1KB1 HEAGSAENDTADAEPPKIVQMSNYCGIGIDAELSLDFHQAREEEPGKFTSRLHNKGVYVR
... . . :: :.:: ..: :: ..:.:: ::. :. :.::. ::.::.
CCDS11 -----TNKGYYNLRKPKEFTMNNYFSVGPDALMALNFHAHREKAPSLFSSRILNKAVYLF
360 370 380 390 400
790 800 810 820 830
pF1KB1 VGLQK--ISHSRSLHKQIRLQVERQEVELPSIEGLIFINIPSWGSGADLWGSDSDTRFEK
: . ... ..:.:...:... ..: :::.::.: .:: ::.: :: . .: .
CCDS11 YGTKDCLVQECKDLNKKVELELDGERVALPSLEGIIVLNIGYWGGGCRLWEGMGDETYPL
410 420 430 440 450 460
840 850 860 870 880 890
pF1KB1 PRMDDGLLEVVGVTGVVYMGQVQGGLRSGIRIAQGSYFRVTLLKAT--PVQVDGEPWVQA
: :::::::::: : . .:.: : . .::.:. :. .:: . :.:::::::.:.
CCDS11 ARHDDGLLEVVGVYGSFHCAQIQVKLANPFRIGQAHTVRL-ILKCSMMPMQVDGEPWAQG
470 480 490 500 510 520
900 910 920 930 940
pF1KB1 PGHMIISAAGPKVHMLRKAKQKPRRAGTTRDARADAAPAPESDPR
: . :. . . ...: ..: :
CCDS11 PCTVTITHKTHAMMLYFSGEQTDDDISSTSDQEDIKATE
530 540 550 560
>>CCDS55758.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 (906 aa)
initn: 767 init1: 307 opt: 832 Z-score: 595.7 bits: 121.5 E(32554): 7.4e-27
Smith-Waterman score: 832; 40.8% identity (68.3% similar) in 375 aa overlap (575-938:260-620)
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 DVACFAEAERLYMLLKDMAVRGRLLTALVLPDLLHAKLPPDSCPLLVFVNPKSGGLKGRD
: ... : :::::::::::: .:
CCDS55 QNTLKASKKKKRASFKRKSSKKGPEEGRWRPFIIRPTPSPLMKPLLVFVNPKSGGNQGAK
230 240 250 260 270 280
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 LLCSFRKLLNPHQVFDLTNGGPLPGLHLFSQVPCFRVLVCGGDGTVGWVLGALEETRYRL
.. :: :::.:::::..::: .:... .: .:.:.:::::::::.:..:.. : .
CCDS55 IIQSFLWYLNPRQVFDLSQGGPKEALEMYRKVHNLRILACGGDGTVGWILSTLDQLRLK-
290 300 310 320 330 340
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 ACPEPSVAILPLGTGNDLGRVLRWGAGYSGEDPFSVLLS-VDEADAVLMDRWTILLDAH-
: : ::::::::::::.:.: ::.::. : : : .:: :.:...: .::: . . .
CCDS55 --PPPPVAILPLGTGNDLARTLNWGGGYTDE-PVSKILSHVEEGNVVQLDRWDLHAEPNP
350 360 370 380 390 400
730 740 750 760 770 780
pF1KB1 EAGSAENDTADAEPPKIVQMSNYCGIGIDAELSLDFHQAREEEPGKFTSRLHNKGVYVRV
::: . : . .. . ..:: ..:.::...:.::..:: .: ::.::..:: :. .
CCDS55 EAGPEDRDEGATDRLPLDVFNNYFSLGFDAHVTLEFHESREANPEKFNSRFRNKMFYAGT
410 420 430 440 450 460
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pF1KB1 GLQK--ISHSRSLHKQIRLQVERQEVELPSIEGL-----IFINIPSWGSGADLWGSDSDT
... .. :..: :.::. . ... :.:. : .:.::: . .:. :: ..
CCDS55 AFSDFLMGSSKDLAKHIRVVCDGMDLT-PKIQDLKPQCVVFLNIPRYCAGTMPWGHPGEH
470 480 490 500 510 520
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pF1KB1 R-FEKPRMDDGLLEVVGVTGVVYMGQVQ-GGLRSGIRIAQGSYFRVTLLKATPVQVDGEP
. :: : ::: :::.: : .. .. .: :: : :..: .: :: ::::::::
CCDS55 HDFEPQRHDDGYLEVIGFT-MTSLAALQVGG--HGERLTQCREVVLTTSKAIPVQVDGEP
530 540 550 560 570 580
900 910 920 930 940
pF1KB1 WVQAPGHMIISAAGPKVHMLRKAKQKPRRAGTTRDARADAAPAPESDPR
: ... : : .. :..::: ::... ..: :.::
CCDS55 CKLAASRIRI-ALRNQATMVQKAK---RRSAAP--LHSDQQPVPEQLRIQVSRVSMHDYE
590 600 610 620 630
CCDS55 ALHYDKEQLKEASVPLGTVVVPGDSDLELCRAHIERLQQEPDGAGAKSPTCQKLSPKWCF
640 650 660 670 680 690
>>CCDS55759.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 (928 aa)
initn: 767 init1: 307 opt: 832 Z-score: 595.5 bits: 121.5 E(32554): 7.5e-27
Smith-Waterman score: 832; 40.8% identity (68.3% similar) in 375 aa overlap (575-938:282-642)
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 DVACFAEAERLYMLLKDMAVRGRLLTALVLPDLLHAKLPPDSCPLLVFVNPKSGGLKGRD
: ... : :::::::::::: .:
CCDS55 QNTLKASKKKKRASFKRKSSKKGPEEGRWRPFIIRPTPSPLMKPLLVFVNPKSGGNQGAK
260 270 280 290 300 310
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 LLCSFRKLLNPHQVFDLTNGGPLPGLHLFSQVPCFRVLVCGGDGTVGWVLGALEETRYRL
.. :: :::.:::::..::: .:... .: .:.:.:::::::::.:..:.. : .
CCDS55 IIQSFLWYLNPRQVFDLSQGGPKEALEMYRKVHNLRILACGGDGTVGWILSTLDQLRLK-
320 330 340 350 360 370
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 ACPEPSVAILPLGTGNDLGRVLRWGAGYSGEDPFSVLLS-VDEADAVLMDRWTILLDAH-
: : ::::::::::::.:.: ::.::. : : : .:: :.:...: .::: . . .
CCDS55 --PPPPVAILPLGTGNDLARTLNWGGGYTDE-PVSKILSHVEEGNVVQLDRWDLHAEPNP
380 390 400 410 420
730 740 750 760 770 780
pF1KB1 EAGSAENDTADAEPPKIVQMSNYCGIGIDAELSLDFHQAREEEPGKFTSRLHNKGVYVRV
::: . : . .. . ..:: ..:.::...:.::..:: .: ::.::..:: :. .
CCDS55 EAGPEDRDEGATDRLPLDVFNNYFSLGFDAHVTLEFHESREANPEKFNSRFRNKMFYAGT
430 440 450 460 470 480
790 800 810 820 830
pF1KB1 GLQK--ISHSRSLHKQIRLQVERQEVELPSIEGL-----IFINIPSWGSGADLWGSDSDT
... .. :..: :.::. . ... :.:. : .:.::: . .:. :: ..
CCDS55 AFSDFLMGSSKDLAKHIRVVCDGMDLT-PKIQDLKPQCVVFLNIPRYCAGTMPWGHPGEH
490 500 510 520 530 540
840 850 860 870 880 890
pF1KB1 R-FEKPRMDDGLLEVVGVTGVVYMGQVQ-GGLRSGIRIAQGSYFRVTLLKATPVQVDGEP
. :: : ::: :::.: : .. .. .: :: : :..: .: :: ::::::::
CCDS55 HDFEPQRHDDGYLEVIGFT-MTSLAALQVGG--HGERLTQCREVVLTTSKAIPVQVDGEP
550 560 570 580 590 600
900 910 920 930 940
pF1KB1 WVQAPGHMIISAAGPKVHMLRKAKQKPRRAGTTRDARADAAPAPESDPR
: ... : : .. :..::: ::... ..: :.::
CCDS55 CKLAASRIRI-ALRNQATMVQKAK---RRSAAP--LHSDQQPVPEQLRIQVSRVSMHDYE
610 620 630 640 650
CCDS55 ALHYDKEQLKEASVPLGTVVVPGDSDLELCRAHIERLQQEPDGAGAKSPTCQKLSPKWCF
660 670 680 690 700 710
>>CCDS44580.1 DGKZ gene_id:8525|Hs108|chr11 (929 aa)
initn: 767 init1: 307 opt: 832 Z-score: 595.5 bits: 121.5 E(32554): 7.5e-27
Smith-Waterman score: 832; 40.8% identity (68.3% similar) in 375 aa overlap (575-938:283-643)
550 560 570 580 590 600
pF1KB1 DVACFAEAERLYMLLKDMAVRGRLLTALVLPDLLHAKLPPDSCPLLVFVNPKSGGLKGRD
: ... : :::::::::::: .:
CCDS44 QNTLKASKKKKRASFKRKSSKKGPEEGRWRPFIIRPTPSPLMKPLLVFVNPKSGGNQGAK
260 270 280 290 300 310
610 620 630 640 650 660
pF1KB1 LLCSFRKLLNPHQVFDLTNGGPLPGLHLFSQVPCFRVLVCGGDGTVGWVLGALEETRYRL
.. :: :::.:::::..::: .:... .: .:.:.:::::::::.:..:.. : .
CCDS44 IIQSFLWYLNPRQVFDLSQGGPKEALEMYRKVHNLRILACGGDGTVGWILSTLDQLRLK-
320 330 340 350 360 370
670 680 690 700 710 720
pF1KB1 ACPEPSVAILPLGTGNDLGRVLRWGAGYSGEDPFSVLLS-VDEADAVLMDRWTILLDAH-
: : ::::::::::::.:.: ::.::. : : : .:: :.:...: .::: . . .
CCDS44 --PPPPVAILPLGTGNDLARTLNWGGGYTDE-PVSKILSHVEEGNVVQLDRWDLHAEPNP
380 390 400 410 420
730 740 750 760 770 780
pF1KB1 EAGSAENDTADAEPPKIVQMSNYCGIGIDAELSLDFHQAREEEPGKFTSRLHNKGVYVRV
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CCDS83 NPRQVFDLSQEGPKDALELYRKVPNLRILACGGDGTVGWILSILDELQLS---PQPPVGV
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CCDS83 VCKLPLNV--FNNYFSLGFDAHVTLEFHESREANPEKFNSRFRNKMFYAGAAFSDFLQRS
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CCDS83 SRDLSKHVKVVCDGTDLT-PKIQELKFQCIVFLNIPRYCAGTMPWGNPGDHHDFEPQRHD
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CCDS83 ISLRN-QANMVQKSKRRTSMPLLNDPQSVPDRLRIRVNKISLQDYEGFHYDKEKLREASI
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Thu Nov 3 11:50:37 2016 done: Thu Nov 3 11:50:38 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]