Result of FASTA (ccds) for
pF1KB0468
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0468, 984 aa
1>>>pF1KB0468 984 - 984 aa - 984 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8356+/-0.00103; mu= -2.6454+/- 0.063
mean_var=262.3742+/-52.259, 0's: 0 Z-trim(113.2): 114 B-trim: 3 in 1/53
Lambda= 0.079180
statistics sampled from 13710 (13824) to 13710 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.726), E-opt: 0.2 (0.425), width: 16
Scan time: 5.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3772.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4 ( 984) 6593 766.9 0
CCDS54811.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4 ( 867) 4511 529.0 1.6e-149
CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 778) 1014 129.5 2.6e-29
CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 777) 1005 128.5 5.2e-29
CCDS59229.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11 ( 339) 967 124.0 5.2e-28
CCDS8310.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11 ( 933) 967 124.2 1.2e-27
CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX ( 388) 872 113.1 1.1e-24
CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX ( 920) 872 113.3 2.3e-24
CCDS47298.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 742) 831 108.6 4.9e-23
CCDS5234.1 ESR1 gene_id:2099|Hs108|chr6 ( 595) 609 83.2 1.7e-15
>>CCDS3772.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4 (984 aa)
initn: 6593 init1: 6593 opt: 6593 Z-score: 4082.5 bits: 766.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6593; 99.9% identity (100.0% similar) in 984 aa overlap (1-984:1-984)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 METKGYHSLPEGLDMERRWGQVSQAVERSSLGPTERTDENNYMEIVNVSCVSGAIPNNST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 METKGYHSLPEGLDMERRWGQVSQAVERSSLGPTERTDENNYMEIVNVSCVSGAIPNNST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 QGSSKEKQELLPCLQQDNNRPGILTSDIKTELESKELSATVAESMGLYMDSVRDADYSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 QGSSKEKQELLPCLQQDNNRPGILTSDIKTELESKELSATVAESMGLYMDSVRDADYSYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 QQNQQGSMSPAKIYQNVEQLVKFYKGNGHRPSTLSCVNTPLRSFMSDSGSSVNGGVMRAI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS37 QQNQQGSMSPAKIYQNVEQLVKFYKGNGHRPSTLSCVNTPLRSFMSDSGSSVNGGVMRAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VKSPIMCHEKSPSVCSPLNMTSSVCSPAGINSVSSTTASFGSFPVHSPITQGTPLTCSPN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 VENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSPLSSMKSSISSPPSHCSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSPLSSMKSSISSPPSHCSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 ANINNSRCSVSSPSNTNNRSTLSSPAASTVGSICSPVNNAFSYTASGTSAGSSTLRDVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ANINNSRCSVSSPSNTNNRSTLSSPAASTVGSICSPVNNAFSYTASGTSAGSSTLRDVVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SPDTQEKGAQEVPFPKTEEVESAISNGVTGQLNIVQYIKPEPDGAFSSSCLGGNSKINSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 SSFSVPIKQESTKHSCSGTSFKGNPTVNPFPFMDGSYFSFMDDKDYYSLSGILGPPVPGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SSFSVPIKQESTKHSCSGTSFKGNPTVNPFPFMDGSYFSFMDDKDYYSLSGILGPPVPGF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 DGNCEGSGFPVGIKQEPDDGSYYPEASIPSSAIVGVNSGGQSFHYRIGAQGTISLSRSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DGNCEGSGFPVGIKQEPDDGSYYPEASIPSSAIVGVNSGGQSFHYRIGAQGTISLSRSAR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 DQSFQHLSSFPPVNTLVESWKSHGDLSSRRSDGYPVLEYIPENVSSSTLRSVSTGSSRPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DQSFQHLSSFPPVNTLVESWKSHGDLSSRRSDGYPVLEYIPENVSSSTLRSVSTGSSRPS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 KICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 QKCLQAGMNLGARKSKKLGKLKGIHEEQPQQQQPPPPPPPPQSPEEGTTYIAPAKEPSVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 QKCLQAGMNLGARKSKKLGKLKGIHEEQPQQQQPPPPPPPPQSPEEGTTYIAPAKEPSVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 TALVPQLSTISRALTPSPVMVLENIEPEIVYAGYDSSKPDTAENLLSTLNRLAGKQMIQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 TALVPQLSTISRALTPSPVMVLENIEPEIVYAGYDSSKPDTAENLLSTLNRLAGKQMIQV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 VKWAKVLPGFKNLPLEDQITLIQYSWMCLSSFALSWRSYKHTNSQFLYFAPDLVFNEEKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VKWAKVLPGFKNLPLEDQITLIQYSWMCLSSFALSWRSYKHTNSQFLYFAPDLVFNEEKM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 HQSAMYELCQGMHQISLQFVRLQLTFEEYTIMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEMRTNYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 HQSAMYELCQGMHQISLQFVRLQLTFEEYTIMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEMRTNYI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 KELRKMVTKCPNNSGQSWQRFYQLTKLLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESHALKVEFPAML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 KELRKMVTKCPNNSGQSWQRFYQLTKLLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESHALKVEFPAML
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KB0 VEIISDQLPKVESGNAKPLYFHRK
::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VEIISDQLPKVESGNAKPLYFHRK
970 980
>>CCDS54811.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4 (867 aa)
initn: 4623 init1: 4511 opt: 4511 Z-score: 2798.0 bits: 529.0 E(32554): 1.6e-149
Smith-Waterman score: 5574; 88.0% identity (88.1% similar) in 984 aa overlap (1-984:1-867)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 METKGYHSLPEGLDMERRWGQVSQAVERSSLGPTERTDENNYMEIVNVSCVSGAIPNNST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 METKGYHSLPEGLDMERRWGQVSQAVERSSLGPTERTDENNYMEIVNVSCVSGAIPNNST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 QGSSKEKQELLPCLQQDNNRPGILTSDIKTELESKELSATVAESMGLYMDSVRDADYSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QGSSKEKQELLPCLQQDNNRPGILTSDIKTELESKELSATVAESMGLYMDSVRDADYSYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 QQNQQGSMSPAKIYQNVEQLVKFYKGNGHRPSTLSCVNTPLRSFMSDSGSSVNGGVMRAI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS54 QQNQQGSMSPAKIYQNVEQLVKFYKGNGHRPSTLSCVNTPLRSFMSDSGSSVNGGVMRAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 VKSPIMCHEKSPSVCSPLNMTSSVCSPAGINSVSSTTASFGSFPVHSPITQGTPLTCSPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VKSPIMCHEKSPSVCSPLNMTSSVCSPAGINSVSSTTASFGSFPVHSPITQGTPLTCSPN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 VENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSPLSSMKSSISSPPSHCSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSPLSSMKSSISSPPSHCSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 ANINNSRCSVSSPSNTNNRSTLSSPAASTVGSICSPVNNAFSYTASGTSAGSSTLRDVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ANINNSRCSVSSPSNTNNRSTLSSPAASTVGSICSPVNNAFSYTASGTSAGSSTLRDVVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 SPDTQEKGAQEVPFPKTEEVESAISNGVTGQLNIVQYIKPEPDGAFSSSCLGGNSKINSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SPDTQEKGAQEVPFPKTEEVESAISNGVTGQLNIVQYIKPEPDGAFSSSCLGGNSKINSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 SSFSVPIKQESTKHSCSGTSFKGNPTVNPFPFMDGSYFSFMDDKDYYSLSGILGPPVPGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSFSVPIKQESTKHSCSGTSFKGNPTVNPFPFMDGSYFSFMDDKDYYSLSGILGPPVPGF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 DGNCEGSGFPVGIKQEPDDGSYYPEASIPSSAIVGVNSGGQSFHYRIGAQGTISLSRSAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DGNCEGSGFPVGIKQEPDDGSYYPEASIPSSAIVGVNSGGQSFHYRIGAQGTISLSRSAR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 DQSFQHLSSFPPVNTLVESWKSHGDLSSRRSDGYPVLEYIPENVSSSTLRSVSTGSSRPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DQSFQHLSSFPPVNTLVESWKSHGDLSSRRSDGYPVLEYIPENVSSSTLRSVSTGSSRPS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 KICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 QKCLQAGMNLGARKSKKLGKLKGIHEEQPQQQQPPPPPPPPQSPEEGTTYIAPAKEPSVN
:::::::::::
CCDS54 QKCLQAGMNLG-------------------------------------------------
670
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 TALVPQLSTISRALTPSPVMVLENIEPEIVYAGYDSSKPDTAENLLSTLNRLAGKQMIQV
CCDS54 ------------------------------------------------------------
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 VKWAKVLPGFKNLPLEDQITLIQYSWMCLSSFALSWRSYKHTNSQFLYFAPDLVFNEEKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 --------GFKNLPLEDQITLIQYSWMCLSSFALSWRSYKHTNSQFLYFAPDLVFNEEKM
680 690 700 710 720
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 HQSAMYELCQGMHQISLQFVRLQLTFEEYTIMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEMRTNYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HQSAMYELCQGMHQISLQFVRLQLTFEEYTIMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEMRTNYI
730 740 750 760 770 780
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pF1KB0 KELRKMVTKCPNNSGQSWQRFYQLTKLLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESHALKVEFPAML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KELRKMVTKCPNNSGQSWQRFYQLTKLLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESHALKVEFPAML
790 800 810 820 830 840
970 980
pF1KB0 VEIISDQLPKVESGNAKPLYFHRK
::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEIISDQLPKVESGNAKPLYFHRK
850 860
>>CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 (778 aa)
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Smith-Waterman score: 1603; 39.7% identity (63.0% similar) in 808 aa overlap (248-984:6-778)
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 ASFGSFPVHSPITQGTPLTCSPNVENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSPLSSMKSSISSPPS
: .:.. : .: :.. ... . .. .
CCDS34 MDSKESLTPGREENPSSVLAQERGDVMDFYKTLRG
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 HCSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSPAN--INNSRCSVSSPSNTNNRSTLSSPAASTVGSICS
.:: .:::. .. .: :. .. . :::. .. . ...: . .: .
CCDS34 GATVKVSASSPSLAVASQSDSKQRRLLVDFPKGSVSNAQQPDLSKAVSLSMGLYMGETET
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370
pF1KB0 PV-NNAFSYTASGT---SAGSSTLRDVVPS----------PDTQEKGAQ--------EVP
: .: ... .: :.: . :. . : :.. ...:. :
CCDS34 KVMGNDLGFPQQGQISLSSGETDLKLLEESIANLNRSTSVPENPKSSASTAVSAAPTEKE
100 110 120 130 140 150
380 390 400 410
pF1KB0 FPKTEEVESAISNGVTGQL-----NIVQYIKPEP------DGAFSSSCLG---GNSKINS
::::. :. .. . :: :. : . : :::. : ..: :
CCDS34 FPKTHSDVSSEQQHLKGQTGTNGGNVKLYTTDQSTFDILQDLEFSSGSPGKETNESPWRS
160 170 180 190 200 210
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 D-----SSFSVPIKQESTKHSCSGTSFKGNPTVNPFPFMDGSYFSFMDDKDYY--SLSGI
: . . :. :. . :.: : .:. . : . .. :. : : :..
CCDS34 DLLIDENCLLSPLAGEDDSFLLEGNS---NEDCKPLILPD-TKPKIKDNGDLVLSSPSNV
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520
pF1KB0 LGPPVPGFDGNCEGSGFPVGIKQEPDDGSYYPEASIPSSAIVG-----------VNSGGQ
: : . : :::: :. : .::.:.. :.: .::::
CCDS34 TLPQVKTEKEDFIELCTPGVIKQEKL-GTVYCQASFPGANIIGNKMSAISVHGVSTSGGQ
280 290 300 310 320 330
530 540 550 560 570
pF1KB0 SFHYRIGAQGTISLSRSARDQSFQHLSSFPPVNTLVESW---KSHGD--LSSRRSDGYPV
.:: .. : :::.. .::. .. .::. . :.: .. :: :.: . ..:
CCDS34 MYHYDMN---TASLSQQ-QDQK-PIFNVIPPIPVGSENWNRCQGSGDDNLTSLGTLNFPG
340 350 360 370 380
580 590 600 610 620
pF1KB0 LEYIPENVSSSTLR--------SVSTGSSRPS-KICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFF
. .. :: ..: : ::... : :.::::.::::::::::.:::::::::
CCDS34 RTVFSNGYSSPSMRPDVSSPPSSSSTATTGPPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTCGSCKVFF
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KB0 KRAVEG-QHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRLQKCLQAGMNLGARKSKKLGKLKGIHE
:::::: :::::::::::::::::::::::::: .::::::::: :::.:: :.:::..
CCDS34 KRAVEGRQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKK--KIKGIQQ
450 460 470 480 490 500
690 700 710 720 730 740
pF1KB0 EQPQQQQPPPPPPPPQSPEEGTTYIAPAKEPSVNTALVPQLSTISRALTPSPVMVLENIE
.: : :. :.:: .::: ::. : .:: ::
CCDS34 ATTGVSQETSENP-------GNKTIVPAT--------LPQL-------TPTLVSLLEVIE
510 520 530 540
750 760 770 780 790 800
pF1KB0 PEIVYAGYDSSKPDTAENLLSTLNRLAGKQMIQVVKWAKVLPGFKNLPLEDQITLIQYSW
::..::::::: ::.. ...::: :.:.:.: .:::::..:::.:: :.::.::.::::
CCDS34 PEVLYAGYDSSVPDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQMTLLQYSW
550 560 570 580 590 600
810 820 830 840 850 860
pF1KB0 MCLSSFALSWRSYKHTNSQFLYFAPDLVFNEEKMHQSAMYELCQGMHQISLQFVRLQLTF
: : .:::.::::.......: :::::..::..: ::. :. : .: .. :::...
CCDS34 MFLMAFALGWRSYRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSY
610 620 630 640 650 660
870 880 890 900 910 920
pF1KB0 EEYTIMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEMRTNYIKELRKMVTKCPNNSGQSWQRFYQLTK
::: ::.:::::..:::::::: :.:.: .::::: : ..: .::.:.:::::::::
CCDS34 EEYLCMKTLLLLSSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTK
670 680 690 700 710 720
930 940 950 960 970 980
pF1KB0 LLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESHALKVEFPAMLVEIISDQLPKVESGNAKPLYFHRK
::::::..: .::..:: :: .. ....::: ::.:::..:.:: .:: : : ::.:
CCDS34 LLDSMHEVVENLLNYCFQTFLDK-TMSIEFPEMLAEIITNQIPKYSNGNIKKLLFHQK
730 740 750 760 770
>>CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 (777 aa)
initn: 1592 init1: 873 opt: 1005 Z-score: 634.2 bits: 128.5 E(32554): 5.2e-29
Smith-Waterman score: 1615; 39.8% identity (63.1% similar) in 807 aa overlap (248-984:6-777)
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 ASFGSFPVHSPITQGTPLTCSPNVENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSPLSSMKSSISSPPS
: .:.. : .: :.. ... . .. .
CCDS42 MDSKESLTPGREENPSSVLAQERGDVMDFYKTLRG
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 HCSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSPAN--INNSRCSVSSPSNTNNRSTLSSPAASTVGSICS
.:: .:::. .. .: :. .. . :::. .. . ...: . .: .
CCDS42 GATVKVSASSPSLAVASQSDSKQRRLLVDFPKGSVSNAQQPDLSKAVSLSMGLYMGETET
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370
pF1KB0 PV-NNAFSYTASGT---SAGSSTLRDVVPS----------PDTQEKGAQ--------EVP
: .: ... .: :.: . :. . : :.. ...:. :
CCDS42 KVMGNDLGFPQQGQISLSSGETDLKLLEESIANLNRSTSVPENPKSSASTAVSAAPTEKE
100 110 120 130 140 150
380 390 400 410
pF1KB0 FPKTEEVESAISNGVTGQL-----NIVQYIKPEP------DGAFSSSCLG---GNSKINS
::::. :. .. . :: :. : . : :::. : ..: :
CCDS42 FPKTHSDVSSEQQHLKGQTGTNGGNVKLYTTDQSTFDILQDLEFSSGSPGKETNESPWRS
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: : . : :::: :. : .::.:.. :.: .::::
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. .. :: ..: : ::... : :.::::.::::::::::.:::::::::
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CCDS14 -----------------EASSTTSPTEE-TTQKLTVSHIE--GYECQPIFLNVLEAIEPG
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pF1KB0 IVYAGYDSSKPDTAENLLSTLNRLAGKQMIQVVKWAKVLPGFKNLPLEDQITLIQYSWMC
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CCDS14 DSVQPIARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
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CCDS47 DLLIDENCLLSPLAGEDDSFLLEGNS---NEDCKPLILPD-TKPKIKDNGDLVLSSPSNV
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pF1KB0 LEYIPENVSSSTLR--------SVSTGSSRPS-KICLVCGDEASGCHYGVVTCGSCKVFF
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CCDS47 RTVFSNGYSSPSMRPDVSSPPSSSSTATTGPPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTCGSCKVFF
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CCDS47 TTGVSQETSENP-------GNKTIVPAT--------LPQL-------TPTLVSLLEVIEP
510 520 530 540
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pF1KB0 EIVYAGYDSSKPDTAENLLSTLNRLAGKQMIQVVKWAKVLPGFKNLPLEDQITLIQYSWM
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pF1KB0 CLSSFALSWRSYKHTNSQFLYFAPDLVFNEEKMHQSAMYELCQGMHQISLQFVRLQLTFE
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CCDS47 FLMAFALGWRSYRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYE
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CCDS47 EYLCMKTLLLLSSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKL
670 680 690 700 710 720
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CCDS47 LDSMHENVMWLKPESTSHTLI
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