FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0457, 505 aa
1>>>pF1KB0457 505 - 505 aa - 505 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4160+/-0.00115; mu= 10.1307+/- 0.070
mean_var=188.4667+/-35.510, 0's: 0 Z-trim(110.3): 108 B-trim: 77 in 2/51
Lambda= 0.093424
statistics sampled from 11422 (11533) to 11422 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.354), width: 16
Scan time: 2.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 3386 469.1 5.2e-132
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 3130 434.6 1.2e-121
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 2994 416.2 4e-116
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 2465 344.9 1.2e-94
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 1804 255.9 9e-68
CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12 ( 513) 1768 251.0 2.3e-66
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 1467 210.5 4.2e-54
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 1434 206.0 8.8e-53
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 1427 205.1 1.7e-52
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 1426 205.0 1.9e-52
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 1411 202.9 7.5e-52
CCDS73472.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 295) 1397 200.8 1.8e-51
CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 1372 197.7 3.1e-50
CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 1361 196.2 8.9e-50
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 1357 195.6 1.1e-49
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 1357 195.6 1.1e-49
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 1344 193.9 3.7e-49
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 1343 193.7 3.8e-49
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 1341 193.5 5.7e-49
CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12 ( 523) 1322 190.9 2.9e-48
CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 1315 190.0 5.8e-48
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 1308 189.0 1.1e-47
CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 1305 188.7 1.7e-47
CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 511) 1276 184.7 2.1e-46
CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12 ( 529) 1251 181.3 2.2e-45
CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 1190 173.2 7.1e-43
CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 520) 1172 170.7 3.6e-42
CCDS73473.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 410) 950 140.7 3.1e-33
CCDS41784.1 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 422) 936 138.8 1.2e-32
CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 452) 936 138.8 1.2e-32
CCDS53795.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 469) 885 132.0 1.5e-30
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 731 111.2 2.6e-24
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 708 108.1 2.2e-23
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 702 107.2 3.7e-23
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 702 107.3 3.7e-23
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 702 107.3 3.7e-23
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 700 107.0 4.7e-23
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 689 105.6 1.5e-22
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 643 99.4 1e-20
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 633 98.3 3.9e-20
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 606 94.4 3.6e-19
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 604 94.1 3.6e-19
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 597 93.1 6.7e-19
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 579 90.7 3.6e-18
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 570 89.5 8.9e-18
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 568 89.2 9.8e-18
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 568 89.2 1e-17
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 565 88.8 1.4e-17
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 564 88.6 1.4e-17
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 564 88.7 1.5e-17
>>CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 (505 aa)
initn: 3386 init1: 3386 opt: 3386 Z-score: 2483.5 bits: 469.1 E(32554): 5.2e-132
Smith-Waterman score: 3386; 99.8% identity (99.8% similar) in 505 aa overlap (1-505:1-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MTCGSGFGGRAFSCISACGPRPGRCCITAAPYRGISCYRGLTGGFGSHSVCGGFRAGSCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTCGSGFGGRAFSCISACGPRPGRCCITAAPYRGISCYRGLTGGFGSHSVCGGFRAGSCG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 RSFGYRSGGVCGPSPPCITTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCVKQEEKEQIKSLNSRFAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RSFGYRSGGVCGPSPPCITTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCVKQEEKEQIKSLNSRFAAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 IDKVRFLEQQNKLLETKLQFYQNRECCQSNLEPLFEGYIETLRREAECVEADSGRLASEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IDKVRFLEQQNKLLETKLQFYQNRECCQSNLEPLFEGYIETLRREAECVEADSGRLASEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 NHVQEVLEGYKKKYEEEVSLRATAENEFVALKKDVDCAYLRKSDLEANVEALIQEIDFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NHVQEVLEGYKKKYEEEVSLRATAENEFVALKKDVDCAYLRKSDLEANVEALIQEIDFLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 RLYEEEIRILQSHISDTSVVVKLDNSRDLNMDCIIAEIKAQYDDIVTRSRAEAESWYRSK
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RLYEEEILILQSHISDTSVVVKLDNSRDLNMDCIIAEIKAQYDDIVTRSRAEAESWYRSK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 CEEMKATVIRHGETLRRTKEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQNSKLEAAVAQSEQQGEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CEEMKATVIRHGETLRRTKEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQNSKLEAAVAQSEQQGEAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 LSDARCKLAELEGALQKAKQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIEIATYRRLLEGEEQRLCEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSDARCKLAELEGALQKAKQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIEIATYRRLLEGEEQRLCEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 IGAVNVCVSSSRGGVVCGDLCVSGSRPVTGSVCSAPCNGNVAVSTGLCAPCGQLNTTCGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IGAVNVCVSSSRGGVVCGDLCVSGSRPVTGSVCSAPCNGNVAVSTGLCAPCGQLNTTCGG
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB0 GSCGVGSCGISSLGVGSCGSSCRKC
:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GSCGVGSCGISSLGVGSCGSSCRKC
490 500
>>CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 (493 aa)
initn: 3212 init1: 3118 opt: 3130 Z-score: 2297.2 bits: 434.6 E(32554): 1.2e-121
Smith-Waterman score: 3130; 95.5% identity (97.1% similar) in 491 aa overlap (1-486:1-491)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MTCG-----SGFGGRAFSCISACGPRPGRCCITAAPYRGISCYRGLTGGFGSHSVCGGFR
:::: :: :::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MTCGFNSIGCGFRPGNFSCVSACGPRPSRCCITAAPYRGISCYRGLTGGFGSHSVCGGFR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB0 AGSCGRSFGYRSGGVCGPSPPCITTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCVKQEEKEQIKSLNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 AGSCGRSFGYRSGGVCGPSPPCITTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCVKQEEKEQIKSLNS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 RFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKLQFYQNRECCQSNLEPLFEGYIETLRREAECVEADSGR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS88 RFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKLQFYQNRECCQSNLEPLFAGYIETLRREAECVEADSGR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 LASELNHVQEVLEGYKKKYEEEVSLRATAENEFVALKKDVDCAYLRKSDLEANVEALIQE
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LASELNHVQEVLEGYKKKYEEEVALRATAENEFVALKKDVDCAYLRKSDLEANVEALIQE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 IDFLRRLYEEEIRILQSHISDTSVVVKLDNSRDLNMDCIIAEIKAQYDDIVTRSRAEAES
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::
CCDS88 IDFLRRLYEEEIRILQSHISDTSVVVKLDNSRDLNMDCIVAEIKAQYDDIATRSRAEAES
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 WYRSKCEEMKATVIRHGETLRRTKEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQNSKLEAAVAQSEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 WYRSKCEEMKATVIRHGETLRRTKEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQNSKLEAAVAQSEQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 QGEAALSDARCKLAELEGALQKAKQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIEIATYRRLLEGEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 QGEAALSDARCKLAELEGALQKAKQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIEIATYRRLLEGEEQ
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 RLCEGIGAVNVCVSSSRGGVVCGDLCVSGSRPVTGSVCSAPCNGNVAVSTGLCAPCGQLN
:::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::: ::::::
CCDS88 RLCEGVEAVNVCVSSSRGGVVCGDLCVSGSRPVTGSVCSAPCNGNLVVSTGLCKPCGQLN
430 440 450 460 470 480
480 490 500
pF1KB0 TTCGGGSCGVGSCGISSLGVGSCGSSCRKC
::::::::: :
CCDS88 TTCGGGSCGQGRH
490
>>CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 (486 aa)
initn: 2987 init1: 2932 opt: 2994 Z-score: 2198.2 bits: 416.2 E(32554): 4e-116
Smith-Waterman score: 2994; 93.8% identity (97.5% similar) in 485 aa overlap (1-483:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MTCGSGFGGRAFSCISACGPRPGRCCITAAPYRGISCYRGLTGGFGSHSVCGGFRAGSCG
::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MTCGSYCGGRAFSCISACGPRPGRCCITAAPYRGISCYRGLTGGFGSHSVCGGFRAGSCG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 RSFGYRSGGVCGPSPPCITTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCVKQEEKEQIKSLNSRFAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RSFGYRSGGVCGPSPPCITTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCVKQEEKEQIKSLNSRFAAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 IDKVRFLEQQNKLLETKLQFYQNRECCQSNLEPLFEGYIETLRREAECVEADSGRLASEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IDKVRFLEQQNKLLETKLQFYQNRECCQSNLEPLFEGYIETLRREAECVEADSGRLASEL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 NHVQEVLEGYKKKYEEEVSLRATAENEFVALKKDVDCAYLRKSDLEANVEALIQEIDFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NHVQEVLEGYKKKYEEEVSLRATAENEFVALKKDVDCAYLRKSDLEANVEALIQEIDFLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 RLYEEEIRILQSHISDTSVVVKLDNSRDLNMDCIIAEIKAQYDDIVTRSRAEAESWYRSK
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RLYEEEIRVLQSHISDTSVVVKLDNSRDLNMDCIIAEIKAQYDDIVTRSRAEAESWYRSK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 CEEMKATVIRHGETLRRTKEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQNSKLEAAVAQSEQQGEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CEEMKATVIRHGETLRRTKEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQNSKLEAAVAQSEQQGEAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 LSDARCKLAELEGALQKAKQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIEIATYRRLLEGEEQRLCEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LSDARCKLAELEGALQKAKQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIEIATYRRLLEGEEQRLCEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB0 IGAVNVCVSSSRGGVVCGDLCVSGSRPVTGS-VCSAPCNGNVAV-STGLCAPCGQLNTTC
.:.::::::::::::::::::.: . ::... : :.: :.::.: .:. ::: ..... :
CCDS41 VGSVNVCVSSSRGGVVCGDLCASTTAPVVSTRVSSVPSNSNVVVGTTNACAPSARVGV-C
430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KB0 GGGSCGVGSCGISSLGVGSCGSSCRKC
:: ::
CCDS41 GG-SCKRC
480
>>CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 (507 aa)
initn: 2567 init1: 2390 opt: 2465 Z-score: 1812.6 bits: 344.9 E(32554): 1.2e-94
Smith-Waterman score: 2608; 81.0% identity (89.3% similar) in 504 aa overlap (1-484:1-499)
10 20 30 40 50
pF1KB0 MTC-----GSGFG-GRAFSCISACGPRPG-RCCITAAPYRGISCYRGLTGGFGSHSVC--
:.: .:: : : :: :: .:. : ::::.::::::.:::::::: :::.:.:
CCDS88 MSCRSYRISSGCGVTRNFSSCSAVAPKTGNRCCISAAPYRGVSCYRGLTG-FGSRSLCNL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB0 ---------GGFRAGSCGRSFGYRSGGVCGPSPPCITTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GSCGPRIAVGGFRAGSCGRSFGYRSGGVCGPSPPCITTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCV
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB0 KQEEKEQIKSLNSRFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKLQFYQNRECCQSNLEPLFEGYIETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::..::.::::::: ::::::
CCDS88 KQEEKEQIKSLNSRFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKWQFYQNQRCCESNLEPLFSGYIETL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB0 RREAECVEADSGRLASELNHVQEVLEGYKKKYEEEVSLRATAENEFVALKKDVDCAYLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::
CCDS88 RREAECVEADSGRLASELNHVQEVLEGYKKKYEEEVALRATAENEFVVLKKDVDCAYLRK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 SDLEANVEALIQEIDFLRRLYEEEIRILQSHISDTSVVVKLDNSRDLNMDCIIAEIKAQY
::::::::::..: .:::::::::::.::.:::::::.::.:::::::::::::::::::
CCDS88 SDLEANVEALVEESSFLRRLYEEEIRVLQAHISDTSVIVKMDNSRDLNMDCIIAEIKAQY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB0 DDIVTRSRAEAESWYRSKCEEMKATVIRHGETLRRTKEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQ
::...::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS88 DDVASRSRAEAESWYRSKCEEMKATVIRHGETLRRTKEEINELNRMIQRLTAEIENAKCQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB0 NSKLEAAVAQSEQQGEAALSDARCKLAELEGALQKAKQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIE
.:::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::::::::
CCDS88 RAKLEAAVAEAEQQGEAALSDARCKLAELEGALQKAKQDMACLLKEYQEVMNSKLGLDIE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB0 IATYRRLLEGEEQRLCEGIGAVNVCVSSSRGGVVCGDLCVSGS--RPVTGSVCSAPCNGN
::::::::::::.:::::.:.:::::::::::: :: : : . : .: : :: ..
CCDS88 IATYRRLLEGEEHRLCEGVGSVNVCVSSSRGGVSCGGLSYSTTPGRQIT-SGPSAIGGSI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500
pF1KB0 VAVSTGLCAPCGQLNTTCGGGSCGVGSCGISSLGVGSCGSSCRKC
..:. :::: ... :::
CCDS88 TVVAPDSCAPCQPRSSSF---SCGSSRSVRFA
480 490 500
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10 20 30 40
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50 60 70 80 90
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.: . : : :: ::: : .:::: ::: :. : ::.:.::.::::::::::
CCDS88 LGPRADSCVGLGFGAGSGIGYGFGGPGFGYRVGGVGVPAAPSITAVTVNKSLLTPLNLEI
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
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::::: ::..::::::.::..::.:::::::::::::::::: .: :...: .:::::::
CCDS88 DPNAQRVKKDEKEQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKLLETKWSFLQEQKCIRSNLEPLF
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
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:.:: .:::. : . .:..:: .: ::.:.::::.:::::::: ::.::::::::::::
CCDS88 ESYITNLRRQLEVLVSDQARLQAERNHLQDVLEGFKKKYEEEVVCRANAENEFVALKKDV
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220 230 240 250 260 270
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: :.. ::::::::..: ::::::. :: :::..::::::.:::.::.:::::::.: ::
CCDS88 DAAFMNKSDLEANVDTLTQEIDFLKTLYMEEIQLLQSHISETSVIVKMDNSRDLNLDGII
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 AEIKAQYDDIVTRSRAEAESWYRSKCEEMKATVIRHGETLRRTKEEINELNRMIQRLTAE
::.::::.... ::::.::.::..: :::..:. .: ..:: ..:::::.:.:::: ::
CCDS88 AEVKAQYEEVARRSRADAEAWYQTKYEEMQVTAGQHCDNLRNIRNEINELTRLIQRLKAE
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
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.:.:: : .:::::::..::::::.::::.::::.:: :::.:::::: . ::::.::.
CCDS88 IEHAKAQRAKLEAAVAEAEQQGEATLSDAKCKLADLECALQQAKQDMARQLCEYQELMNA
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400 410 420 430 440 450
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:::::::::::::::::::.:::::.: ::. :::::::.::: . :.:: :.: .
CCDS88 KLGLDIEIATYRRLLEGEESRLCEGVGPVNISVSSSRGGLVCGPEPLVAGSTLSRGGV-T
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500
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...: ...:. : :: . ::. . .. . : :. : ::
CCDS88 FSGSSSVCATSGVLASCGP---SLGGARVAPATGDLLSTGTRS-GSMLISEACVPSVPCP
520 530 540 550 560
CCDS88 LPTQGGFSSCSGGRSSSVRFVSTTTSCRTKY
570 580 590 600
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10 20 30 40 50
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:: :...:: :: :: . .. .: : . ::: : .::.:.:.
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CCDS88 VGFGRPRVASRCGGTLPGFGYRLGATCGPSA-CITPVTINESLLVPLALEIDPTVQRVKR
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pF1KB0 EEKEQIKSLNSRFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKLQFYQNRECCQSNLEPLFEGYIETLRR
.:::::: ::.:::.::.:::::::.::::::: .:.:...:::.:.::.::::: .:::
CCDS88 DEKEQIKCLNNRFASFINKVRFLEQKNKLLETKWNFMQQQRCCQTNIEPIFEGYISALRR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
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CCDS88 QLDCVSGDRVRLESELCSLQAALEGYKKKYEEELSLRPCVENEFVALKKDVDTAFLMKAD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 LEANVEALIQEIDFLRRLYEEEIRILQSHISDTSVVVKLDNSRDLNMDCIIAEIKAQYDD
::.:.:::.::::::. :::::: .:::.::.:::.::.::::.:..: :::::::::::
CCDS88 LETNAEALVQEIDFLKSLYEEEICLLQSQISETSVIVKMDNSRELDVDGIIAEIKAQYDD
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pF1KB0 IVTRSRAEAESWYRSKCEEMKATVIRHGETLRRTKEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQNS
:..::.::::.::. . ::...:. : ..:: :.:: :.:..:::: :.::.: :
CCDS88 IASRSKAEAEAWYQCRYEELRVTAGNHCDNLRNRKNEILEMNKLIQRLQQETENVKAQRC
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB0 KLEAAVAQSEQQGEAALSDARCKLAELEGALQKAKQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIEIA
:::.:.:..::::::::.::.:::: :: ::::::::::::..:::::::::::::::::
CCDS88 KLEGAIAEAEQQGEAALNDAKCKLAGLEEALQKAKQDMACLLKEYQEVMNSKLGLDIEIA
360 370 380 390 400 410
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pF1KB0 TYRRLLEGEEQRLCEGIGAVNVCVSSSRGGVV---CGDLCVSGSRPVTGSVCSAPCNGNV
::::::::::.::::::: ::. ::::.:. . :: : :: .. .:
CCDS88 TYRRLLEGEEHRLCEGIGPVNISVSSSKGAFLYEPCGV-----STPVLSTGVLRSNGGCS
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500
pF1KB0 AVSTG-LCAPCGQLNTTCGGGSCGVGSCGISSLGVGSCGSSCRKC
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CCDS88 IVGTGELYVPC----EPQGLLSCGSGR--KSSMTLGAGGSSPSHKH
480 490 500 510
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10 20 30
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CCDS88 PSVSRTSFTSVSRSGGGGGGGFGRVSLAGACGVGGYGSRSLYNLG--GSKRISISTSGGS
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KB0 YR-----GISCYRGLTGGFGSHSVCGGFRAGSCGRSFGYR-SGGVCGPS-PPC----ITT
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CCDS88 FRNRFGAGAGGGYGFGGGAGSGFGFGGGAGGGFGLGGGAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQE
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90 100 110 120 130 140
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CCDS88 VTVNQSLLTPLNLQIDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTL
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150 160 170 180 190
pF1KB0 YQNR--ECCQSNLEPLFEGYIETLRREAECVEADSGRLASELNHVQEVLEGYKKKYEEEV
:.. . ..::::::: ::..:::. . . .. ::: ::: ..:...: .:.:::.:.
CCDS88 LQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEI
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pF1KB0 SLRATAENEFVALKKDVDCAYLRKSDLEANVEALIQEIDFLRRLYEEEIRILQSHISDTS
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CCDS88 NKRTTAENEFVMLKKDVDAAYMNKVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTS
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260 270 280 290 300 310
pF1KB0 VVVKLDNSRDLNMDCIIAEIKAQYDDIVTRSRAEAESWYRSKCEEMKATVIRHGETLRRT
::...::.:.:..: ::::.::::..:..:::.::::::..: ::.. :. :::. :: :
CCDS88 VVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIANRSRTEAESWYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNT
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pF1KB0 KEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQNSKLEAAVAQSEQQGEAALSDARCKLAELEGALQKA
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CCDS88 KHEISEMNRMIQRLRAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQKA
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pF1KB0 KQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIEIATYRRLLEGEEQRLC-EGIGAVNVCVSSSR-----
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CCDS88 KQDMARLLREYQELMNTKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGY
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440 450 460 470 480
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:: . : : . . .:: :. .:.:... :: . . .... : :
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pF1KB0 SCGVGSCGISSLGVG--SCGSSCRKC
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CCDS88 GVGFGSGGGSSSSVKFVSTTSSSRKSFKS
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10 20
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30 40 50 60 70
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pF1KB0 TTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCVKQEEKEQIKSLNSRFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKL
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CCDS41 QEVTVNQSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKW
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140 150 160 170 180 190
pF1KB0 QFYQNR--ECCQSNLEPLFEGYIETLRREAECVEADSGRLASELNHVQEVLEGYKKKYEE
. :.. . ..::::::: ::..:::. . . .. ::: ::: .:...: .:.:::.
CCDS41 TLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYED
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pF1KB0 EVSLRATAENEFVALKKDVDCAYLRKSDLEANVEALIQEIDFLRRLYEEEIRILQSHISD
:.. :..::::::.:::::: ::. : .:.:....: .::.::: ::. :. .:.::::
CCDS41 EINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISD
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260 270 280 290 300 310
pF1KB0 TSVVVKLDNSRDLNMDCIIAEIKAQYDDIVTRSRAEAESWYRSKCEEMKATVIRHGETLR
::::...::.:.:..: ::::.::::..:. ::::::::::..: ::...:. :::. ::
CCDS41 TSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLR
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320 330 340 350 360 370
pF1KB0 RTKEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQNSKLEAAVAQSEQQGEAALSDARCKLAELEGALQ
::.:: :.::::::: .:....: : ..:.::.:..::.:: ::.::. :: :: :::
CCDS41 NTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQ
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380 390 400 410 420 430
pF1KB0 KAKQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIEIATYRRLLEGEEQRLC-EGIGAVNVCVSSSRGGV
:::::.: :..::::.:: ::.::.::::::.:::::: :: ::.: ::. : .: .
CCDS41 KAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVVQSTVSS
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440 450 460 470 480 490
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: :: :. : .....:. :. . :. . ::: .::. : :..
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500 510 520 530 540 550
500
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. .:: ::
CCDS41 TTTSSSSRKSYKH
560
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10 20
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CCDS88 NSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAIS
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30 40 50 60 70
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. : . : . :::. . :: .:. : .:: .:: ::. : : :
CCDS88 G----GYGSRAGGSYGFGGAGSGFGF-GGGAGIGFGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCPPGGI
90 100 110 120 130
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pF1KB0 TTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCVKQEEKEQIKSLNSRFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKL
:.::.::::::::.::: : :. ::.::::.::..::.:::::::::::::.:.::
CCDS88 QEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKW
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140 150 160 170 180 190
pF1KB0 QFYQNR--ECCQSNLEPLFEGYIETLRREAECVEADSGRLASELNHVQEVLEGYKKKYEE
. :.. . ..::::::: ::..:::. . . .. ::: ::: ..:...: :.:::.
CCDS88 TLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYED
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200 210 220 230 240 250
pF1KB0 EVSLRATAENEFVALKKDVDCAYLRKSDLEANVEALIQEIDFLRRLYEEEIRILQSHISD
:.. :..::::::.:::::: ::. : .:.:....: .::.::: ::. :. .:.::::
CCDS88 EINKRTAAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISD
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260 270 280 290 300 310
pF1KB0 TSVVVKLDNSRDLNMDCIIAEIKAQYDDIVTRSRAEAESWYRSKCEEMKATVIRHGETLR
::::...::.:.:..: ::::.::::..:. ::::::::::..: ::...:. :::. ::
CCDS88 TSVVLSMDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLR
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320 330 340 350 360 370
pF1KB0 RTKEEINELNRMIQRLTAEVENAKCQNSKLEAAVAQSEQQGEAALSDARCKLAELEGALQ
::.:: :.::::::: .:....: : ..:.::.:..::.:: ::.::. :: :: :::
CCDS88 NTKQEIAEINRMIQRLRSEIDHVKKQCASLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQ
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410 420 430
pF1KB0 KAKQDMACLIREYQEVMNSKLGLDIEIATYRRLLEGEEQRLC-EGIGAVNVCVSSSRGGV
:::::.: :..::::.:: ::.::.::::::.:::::: :: ::.: ::: : .: .
CCDS88 KAKQDLARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNVSVVQSTISS
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KB0 VCGDLCVSGSRPVTGSVCSAPCNGNVAVSTGLCAPCGQLNTTCGGGSCGVGSCGISSLGV
: :: :. : ....... :. . :. . ::: .::. : :..
CCDS88 GYGGASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGIGGGFSSSSGR---AIGGGLSSVGG-GSSTIKY
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500
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. .:: ::
CCDS88 TTTSSSSRKSYKH
560
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pF1KB0 MTCG-SGFGGRAFSCISAC---GPRPGRCCIT
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CCDS88 NSARLPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAIS
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30 40 50 60 70
pF1KB0 AAPYRGISCYRGLTGGFGSHSVCGGFRAGSCGRSFGYR-----SGGVCGPS-PPC----I
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CCDS88 G----GYGSRAGGSYGFGGAGSGFGF-GGGAGIGFGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCPPGGI
90 100 110 120 130
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pF1KB0 TTVSVNESLLTPLNLEIDPNAQCVKQEEKEQIKSLNSRFAAFIDKVRFLEQQNKLLETKL
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CCDS88 QEVTVNQSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKW
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140 150 160 170 180 190
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CCDS88 TLLQEQGTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYED
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