Result of FASTA (omim) for
pF1KA1930
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1930, 1219 aa
1>>>pF1KA1930 1219 - 1219 aa - 1219 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 16.3770+/-0.000469; mu= -31.2593+/- 0.029
mean_var=672.7348+/-142.391, 0's: 0 Z-trim(122.8): 46 B-trim: 0 in 0/62
Lambda= 0.049448
statistics sampled from 41514 (41566) to 41514 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.769), E-opt: 0.2 (0.487), width: 16
Scan time: 21.510
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056948 (OMIM: 611410,616515) protein FAM65B iso ( 591) 1411 116.8 4.4e-25
XP_016867015 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot ( 591) 1411 116.8 4.4e-25
XP_016867016 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot ( 591) 1411 116.8 4.4e-25
XP_016867014 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot ( 613) 1411 116.8 4.5e-25
NP_001273376 (OMIM: 611410,616515) protein FAM65B ( 613) 1411 116.8 4.5e-25
XP_006715344 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot ( 625) 1411 116.8 4.6e-25
XP_016867013 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot ( 642) 1411 116.8 4.7e-25
NP_001273375 (OMIM: 611410,616515) protein FAM65B ( 647) 1411 116.8 4.7e-25
XP_011513310 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot (1018) 1411 116.9 6.8e-25
NP_001332961 (OMIM: 611410,616515) protein FAM65B (1018) 1411 116.9 6.8e-25
XP_016867012 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot (1018) 1411 116.9 6.8e-25
XP_006715342 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot (1018) 1411 116.9 6.8e-25
XP_011513311 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot (1018) 1411 116.9 6.8e-25
NP_001332960 (OMIM: 611410,616515) protein FAM65B (1018) 1411 116.9 6.8e-25
XP_011513309 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot (1047) 1411 116.9 6.9e-25
NP_001273374 (OMIM: 611410,616515) protein FAM65B (1047) 1411 116.9 6.9e-25
XP_006715338 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot (1052) 1411 116.9 7e-25
NP_055537 (OMIM: 611410,616515) protein FAM65B iso (1068) 1404 116.4 1e-24
XP_011513314 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: prot (1102) 1404 116.4 1e-24
NP_002448 (OMIM: 158370) mucin-2 precursor [Homo s (5289) 501 52.4 9e-05
NP_000928 (OMIM: 180660) DNA-directed RNA polymera (1970) 469 49.9 0.0002
>>NP_056948 (OMIM: 611410,616515) protein FAM65B isoform (591 aa)
initn: 1381 init1: 891 opt: 1411 Z-score: 571.4 bits: 116.8 E(85289): 4.4e-25
Smith-Waterman score: 1414; 46.8% identity (70.9% similar) in 526 aa overlap (17-520:16-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMSLSVRPQRRLLSARVNRSQSFAGVLGSHERGPRSFPVFSPPGPPRKPPALSRVSRMFS
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NP_056 MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENSSALKKPQA--KLKKMHN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 VAHPAA---KVPQPERLDLVYTALKRGLTAYLEVHQQEQEKLQGQIRESKRNSRLGFLYD
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NP_056 LGHKNNNPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMKRNSRLGVLYD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LDKQVKSIERFLRRLEFHASKIDELYEAYCVQRRLRDGAYNMVRAYTTGSPGSREARDSL
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NP_056 LDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFAT-SPASKAARESL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 AEATRGHREYTESMCLLESELEAQLGEFHLRMKGLAGFARLCVGDQYEICMKYGRQRWKL
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NP_056 TEINRSFKEYTENMCTIEVELENLLGEFSIKMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RGRIEGSGKQVWDSEETIFLPLLTEFLSIKVTELKGLANHVVVGSVSCETKDLFAALPQV
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NP_056 KGKIEVNGKQSWDGEETVFLPLIVGFISIKVTELKGLATHILVGSVTCETKELFAARPQV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 VAVDINDLGTIKLSLEVTWSPFDKDDQPSAASSVNKASTVTKRFSTYSQSPPDTPSLREQ
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NP_056 VAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTASSGAGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KA1 AFYNMLRRQEELENGTA------WSLS-SE--SSDDSSSPQLSGTARHSPAPRPLVQQPE
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NP_056 SFFSNLP-DDIFENGKAAEEKMPLSLSFSDLPNGDCALTSHSTGSPSNSTNPEITI----
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 PLPIQVAFRRPETPSSGPLDEEGAVA-PVLANGHAPYSRTLSHISE-----ASVDAALAE
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NP_056 -TPAEFNLSSLASQNEGMDDTSSASSRNSLGEGQEPKSHLKEEDPEEPRKPASAPSEACR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KA1 ASVEAVGPESLAWGPSPPTHPAPTHGEHPSPVPPA-LDPGHSATSSTLG---TTGSVPTS
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NP_056 RQSSGAGAEHL-FLENDVAEALLQESEEASELKPVELDTSEGNITKQLVKRLTSAEVPMA
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 TDPAPSAHLDSVHKSTDSGPSELPGPTHTTTGSTYSAITTTHSAPSPLTHTTTGSTHKPI
::
NP_056 TDRLLSEGSVGGESEGCRSFLDGSLEDAFNGLLLALEPHKEQYKEFQDLNQEVMNLDDIL
530 540 550 560 570 580
>>XP_016867015 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: protein (591 aa)
initn: 1381 init1: 891 opt: 1411 Z-score: 571.4 bits: 116.8 E(85289): 4.4e-25
Smith-Waterman score: 1414; 46.8% identity (70.9% similar) in 526 aa overlap (17-520:16-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMSLSVRPQRRLLSARVNRSQSFAGVLGSHERGPRSFPVFSPPGPPRKPPALSRVSRMFS
. ::::::: : .:: : . . .:: : ....: .
XP_016 MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENSSALKKPQA--KLKKMHN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 VAHPAA---KVPQPERLDLVYTALKRGLTAYLEVHQQEQEKLQGQIRESKRNSRLGFLYD
..: : :::.:.. :: ::: :: :::::: : .:: .:... ::::::: :::
XP_016 LGHKNNNPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMKRNSRLGVLYD
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120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LDKQVKSIERFLRRLEFHASKIDELYEAYCVQRRLRDGAYNMVRAYTTGSPGSREARDSL
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XP_016 LDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFAT-SPASKAARESL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 AEATRGHREYTESMCLLESELEAQLGEFHLRMKGLAGFARLCVGDQYEICMKYGRQRWKL
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XP_016 TEINRSFKEYTENMCTIEVELENLLGEFSIKMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RGRIEGSGKQVWDSEETIFLPLLTEFLSIKVTELKGLANHVVVGSVSCETKDLFAALPQV
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XP_016 KGKIEVNGKQSWDGEETVFLPLIVGFISIKVTELKGLATHILVGSVTCETKELFAARPQV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 VAVDINDLGTIKLSLEVTWSPFDKDDQPSAASSVNKASTVTKRFSTYSQSPPDTPSLREQ
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XP_016 VAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTASSGAGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KA1 AFYNMLRRQEELENGTA------WSLS-SE--SSDDSSSPQLSGTARHSPAPRPLVQQPE
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XP_016 SFFSNLP-DDIFENGKAAEEKMPLSLSFSDLPNGDCALTSHSTGSPSNSTNPEITI----
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 PLPIQVAFRRPETPSSGPLDEEGAVA-PVLANGHAPYSRTLSHISE-----ASVDAALAE
: . . . . : : .: . :..:. : :. . : ::. . .
XP_016 -TPAEFNLSSLASQNEGMDDTSSASSRNSLGEGQEPKSHLKEEDPEEPRKPASAPSEACR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KA1 ASVEAVGPESLAWGPSPPTHPAPTHGEHPSPVPPA-LDPGHSATSSTLG---TTGSVPTS
. ..: : : . . .. ..:. : . :. :: ... .. : :.. :: .
XP_016 RQSSGAGAEHL-FLENDVAEALLQESEEASELKPVELDTSEGNITKQLVKRLTSAEVPMA
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 TDPAPSAHLDSVHKSTDSGPSELPGPTHTTTGSTYSAITTTHSAPSPLTHTTTGSTHKPI
::
XP_016 TDRLLSEGSVGGESEGCRSFLDGSLEDAFNGLLLALEPHKEQYKEFQDLNQEVMNLDDIL
530 540 550 560 570 580
>>XP_016867016 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: protein (591 aa)
initn: 1381 init1: 891 opt: 1411 Z-score: 571.4 bits: 116.8 E(85289): 4.4e-25
Smith-Waterman score: 1414; 46.8% identity (70.9% similar) in 526 aa overlap (17-520:16-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMSLSVRPQRRLLSARVNRSQSFAGVLGSHERGPRSFPVFSPPGPPRKPPALSRVSRMFS
. ::::::: : .:: : . . .:: : ....: .
XP_016 MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENSSALKKPQA--KLKKMHN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 VAHPAA---KVPQPERLDLVYTALKRGLTAYLEVHQQEQEKLQGQIRESKRNSRLGFLYD
..: : :::.:.. :: ::: :: :::::: : .:: .:... ::::::: :::
XP_016 LGHKNNNPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMKRNSRLGVLYD
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pF1KA1 LDKQVKSIERFLRRLEFHASKIDELYEAYCVQRRLRDGAYNMVRAYTTGSPGSREARDSL
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XP_016 LDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFAT-SPASKAARESL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 AEATRGHREYTESMCLLESELEAQLGEFHLRMKGLAGFARLCVGDQYEICMKYGRQRWKL
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XP_016 TEINRSFKEYTENMCTIEVELENLLGEFSIKMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RGRIEGSGKQVWDSEETIFLPLLTEFLSIKVTELKGLANHVVVGSVSCETKDLFAALPQV
.:.:: .::: ::.:::.::::.. :.:::::::::::.:..::::.::::.:::: :::
XP_016 KGKIEVNGKQSWDGEETVFLPLIVGFISIKVTELKGLATHILVGSVTCETKELFAARPQV
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 VAVDINDLGTIKLSLEVTWSPFDKDDQPSAASSVNKASTVTKRFSTYSQSPPDTPSLREQ
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XP_016 VAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTASSGAGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDH
300 310 320 330 340 350
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pF1KA1 AFYNMLRRQEELENGTA------WSLS-SE--SSDDSSSPQLSGTARHSPAPRPLVQQPE
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XP_016 SFFSNLP-DDIFENGKAAEEKMPLSLSFSDLPNGDCALTSHSTGSPSNSTNPEITI----
360 370 380 390 400 410
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pF1KA1 PLPIQVAFRRPETPSSGPLDEEGAVA-PVLANGHAPYSRTLSHISE-----ASVDAALAE
: . . . . : : .: . :..:. : :. . : ::. . .
XP_016 -TPAEFNLSSLASQNEGMDDTSSASSRNSLGEGQEPKSHLKEEDPEEPRKPASAPSEACR
420 430 440 450 460 470
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pF1KA1 ASVEAVGPESLAWGPSPPTHPAPTHGEHPSPVPPA-LDPGHSATSSTLG---TTGSVPTS
. ..: : : . . .. ..:. : . :. :: ... .. : :.. :: .
XP_016 RQSSGAGAEHL-FLENDVAEALLQESEEASELKPVELDTSEGNITKQLVKRLTSAEVPMA
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 TDPAPSAHLDSVHKSTDSGPSELPGPTHTTTGSTYSAITTTHSAPSPLTHTTTGSTHKPI
::
XP_016 TDRLLSEGSVGGESEGCRSFLDGSLEDAFNGLLLALEPHKEQYKEFQDLNQEVMNLDDIL
530 540 550 560 570 580
>>XP_016867014 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: protein (613 aa)
initn: 1381 init1: 891 opt: 1411 Z-score: 571.1 bits: 116.8 E(85289): 4.5e-25
Smith-Waterman score: 1414; 46.8% identity (70.9% similar) in 526 aa overlap (17-520:16-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMSLSVRPQRRLLSARVNRSQSFAGVLGSHERGPRSFPVFSPPGPPRKPPALSRVSRMFS
. ::::::: : .:: : . . .:: : ....: .
XP_016 MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENSSALKKPQA--KLKKMHN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 VAHPAA---KVPQPERLDLVYTALKRGLTAYLEVHQQEQEKLQGQIRESKRNSRLGFLYD
..: : :::.:.. :: ::: :: :::::: : .:: .:... ::::::: :::
XP_016 LGHKNNNPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMKRNSRLGVLYD
60 70 80 90 100 110
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pF1KA1 LDKQVKSIERFLRRLEFHASKIDELYEAYCVQRRLRDGAYNMVRAYTTGSPGSREARDSL
::::.:.:::..:::::: ::.::::::::.::::.::: .: .:..: ::.:. ::.::
XP_016 LDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFAT-SPASKAARESL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 AEATRGHREYTESMCLLESELEAQLGEFHLRMKGLAGFARLCVGDQYEICMKYGRQRWKL
.: .:. .::::.:: .: ::: :::: ..::::::::::: :::::: ::::::::::
XP_016 TEINRSFKEYTENMCTIEVELENLLGEFSIKMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RGRIEGSGKQVWDSEETIFLPLLTEFLSIKVTELKGLANHVVVGSVSCETKDLFAALPQV
.:.:: .::: ::.:::.::::.. :.:::::::::::.:..::::.::::.:::: :::
XP_016 KGKIEVNGKQSWDGEETVFLPLIVGFISIKVTELKGLATHILVGSVTCETKELFAARPQV
240 250 260 270 280 290
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pF1KA1 VAVDINDLGTIKLSLEVTWSPFDKDDQPSAASSVNKASTVTKRFSTYSQSPPDTPSLREQ
:::::::::::::.::.:: ::: .:. ..... :::... .:.: :::. :.::.....
XP_016 VAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTASSGAGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KA1 AFYNMLRRQEELENGTA------WSLS-SE--SSDDSSSPQLSGTARHSPAPRPLVQQPE
.:.. : .. .::: : ::: :. ..: . . . .:. .: :. .
XP_016 SFFSNLP-DDIFENGKAAEEKMPLSLSFSDLPNGDCALTSHSTGSPSNSTNPEITI----
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 PLPIQVAFRRPETPSSGPLDEEGAVA-PVLANGHAPYSRTLSHISE-----ASVDAALAE
: . . . . : : .: . :..:. : :. . : ::. . .
XP_016 -TPAEFNLSSLASQNEGMDDTSSASSRNSLGEGQEPKSHLKEEDPEEPRKPASAPSEACR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KA1 ASVEAVGPESLAWGPSPPTHPAPTHGEHPSPVPPA-LDPGHSATSSTLG---TTGSVPTS
. ..: : : . . .. ..:. : . :. :: ... .. : :.. :: .
XP_016 RQSSGAGAEHL-FLENDVAEALLQESEEASELKPVELDTSEGNITKQLVKRLTSAEVPMA
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 TDPAPSAHLDSVHKSTDSGPSELPGPTHTTTGSTYSAITTTHSAPSPLTHTTTGSTHKPI
::
XP_016 TDRLLSEGSVGGESEGCRSFLDGSLEDAFNGLLLALEPHKEQYKEFQDLNQEVMNLDDIL
530 540 550 560 570 580
>>NP_001273376 (OMIM: 611410,616515) protein FAM65B isof (613 aa)
initn: 1381 init1: 891 opt: 1411 Z-score: 571.1 bits: 116.8 E(85289): 4.5e-25
Smith-Waterman score: 1414; 46.8% identity (70.9% similar) in 526 aa overlap (17-520:16-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMSLSVRPQRRLLSARVNRSQSFAGVLGSHERGPRSFPVFSPPGPPRKPPALSRVSRMFS
. ::::::: : .:: : . . .:: : ....: .
NP_001 MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENSSALKKPQA--KLKKMHN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 VAHPAA---KVPQPERLDLVYTALKRGLTAYLEVHQQEQEKLQGQIRESKRNSRLGFLYD
..: : :::.:.. :: ::: :: :::::: : .:: .:... ::::::: :::
NP_001 LGHKNNNPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMKRNSRLGVLYD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LDKQVKSIERFLRRLEFHASKIDELYEAYCVQRRLRDGAYNMVRAYTTGSPGSREARDSL
::::.:.:::..:::::: ::.::::::::.::::.::: .: .:..: ::.:. ::.::
NP_001 LDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFAT-SPASKAARESL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 AEATRGHREYTESMCLLESELEAQLGEFHLRMKGLAGFARLCVGDQYEICMKYGRQRWKL
.: .:. .::::.:: .: ::: :::: ..::::::::::: :::::: ::::::::::
NP_001 TEINRSFKEYTENMCTIEVELENLLGEFSIKMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RGRIEGSGKQVWDSEETIFLPLLTEFLSIKVTELKGLANHVVVGSVSCETKDLFAALPQV
.:.:: .::: ::.:::.::::.. :.:::::::::::.:..::::.::::.:::: :::
NP_001 KGKIEVNGKQSWDGEETVFLPLIVGFISIKVTELKGLATHILVGSVTCETKELFAARPQV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 VAVDINDLGTIKLSLEVTWSPFDKDDQPSAASSVNKASTVTKRFSTYSQSPPDTPSLREQ
:::::::::::::.::.:: ::: .:. ..... :::... .:.: :::. :.::.....
NP_001 VAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTASSGAGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KA1 AFYNMLRRQEELENGTA------WSLS-SE--SSDDSSSPQLSGTARHSPAPRPLVQQPE
.:.. : .. .::: : ::: :. ..: . . . .:. .: :. .
NP_001 SFFSNLP-DDIFENGKAAEEKMPLSLSFSDLPNGDCALTSHSTGSPSNSTNPEITI----
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA1 PLPIQVAFRRPETPSSGPLDEEGAVA-PVLANGHAPYSRTLSHISE-----ASVDAALAE
: . . . . : : .: . :..:. : :. . : ::. . .
NP_001 -TPAEFNLSSLASQNEGMDDTSSASSRNSLGEGQEPKSHLKEEDPEEPRKPASAPSEACR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KA1 ASVEAVGPESLAWGPSPPTHPAPTHGEHPSPVPPA-LDPGHSATSSTLG---TTGSVPTS
. ..: : : . . .. ..:. : . :. :: ... .. : :.. :: .
NP_001 RQSSGAGAEHL-FLENDVAEALLQESEEASELKPVELDTSEGNITKQLVKRLTSAEVPMA
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KA1 TDPAPSAHLDSVHKSTDSGPSELPGPTHTTTGSTYSAITTTHSAPSPLTHTTTGSTHKPI
::
NP_001 TDRLLSEGSVGGESEGCRSFLDGSLEDAFNGLLLALEPHKEQYKEFQDLNQEVMNLDDIL
530 540 550 560 570 580
>>XP_006715344 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: protein (625 aa)
initn: 1381 init1: 891 opt: 1411 Z-score: 571.0 bits: 116.8 E(85289): 4.6e-25
Smith-Waterman score: 1414; 46.8% identity (70.9% similar) in 526 aa overlap (17-520:50-565)
10 20 30 40
pF1KA1 MMSLSVRPQRRLLSARVNRSQSFAGVLGSHERGPRSFPVFSPPGPP
. ::::::: : .:: : . .
XP_006 RRRQLNRLPTRLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENSSAL
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 RKPPALSRVSRMFSVAHPAA---KVPQPERLDLVYTALKRGLTAYLEVHQQEQEKLQGQI
.:: : ....: ...: : :::.:.. :: ::: :: :::::: : .:: .:.
XP_006 KKPQA--KLKKMHNLGHKNNNPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQL
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 RESKRNSRLGFLYDLDKQVKSIERFLRRLEFHASKIDELYEAYCVQRRLRDGAYNMVRAY
.. ::::::: :::::::.:.:::..:::::: ::.::::::::.::::.::: .: .:.
XP_006 KDMKRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAF
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 TTGSPGSREARDSLAEATRGHREYTESMCLLESELEAQLGEFHLRMKGLAGFARLCVGDQ
.: ::.:. ::.::.: .:. .::::.:: .: ::: :::: ..::::::::::: :::
XP_006 AT-SPASKAARESLTEINRSFKEYTENMCTIEVELENLLGEFSIKMKGLAGFARLCPGDQ
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 YEICMKYGRQRWKLRGRIEGSGKQVWDSEETIFLPLLTEFLSIKVTELKGLANHVVVGSV
::: ::::::::::.:.:: .::: ::.:::.::::.. :.:::::::::::.:..::::
XP_006 YEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEETVFLPLIVGFISIKVTELKGLATHILVGSV
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 SCETKDLFAALPQVVAVDINDLGTIKLSLEVTWSPFDKDDQPSAASSVNKASTVTKRFST
.::::.:::: ::::::::::::::::.::.:: ::: .:. ..... :::... .:.:
XP_006 TCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTASSGAGNKAAALQRRMSM
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390
pF1KA1 YSQSPPDTPSLREQAFYNMLRRQEELENGTA------WSLS-SE--SSDDSSSPQLSGTA
:::. :.::......:.. : .. .::: : ::: :. ..: . . . .:.
XP_006 YSQGTPETPTFKDHSFFSNLP-DDIFENGKAAEEKMPLSLSFSDLPNGDCALTSHSTGSP
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 RHSPAPRPLVQQPEPLPIQVAFRRPETPSSGPLDEEGAVA-PVLANGHAPYSRTLSHISE
.: :. . : . . . . : : .: . :..:. : :. . :
XP_006 SNSTNPEITI-----TPAEFNLSSLASQNEGMDDTSSASSRNSLGEGQEPKSHLKEEDPE
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500
pF1KA1 -----ASVDAALAEASVEAVGPESLAWGPSPPTHPAPTHGEHPSPVPPA-LDPGHSATSS
::. . . . ..: : : . . .. ..:. : . :. :: ... ..
XP_006 EPRKPASAPSEACRRQSSGAGAEHL-FLENDVAEALLQESEEASELKPVELDTSEGNITK
500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 TLG---TTGSVPTSTDPAPSAHLDSVHKSTDSGPSELPGPTHTTTGSTYSAITTTHSAPS
: :.. :: .::
XP_006 QLVKRLTSAEVPMATDRLLSEGSVGGESEGCRSFLDGSLEDAFNGLLLALEPHKEQYKEF
550 560 570 580 590 600
>>XP_016867013 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: protein (642 aa)
initn: 1381 init1: 891 opt: 1411 Z-score: 570.8 bits: 116.8 E(85289): 4.7e-25
Smith-Waterman score: 1414; 46.8% identity (70.9% similar) in 526 aa overlap (17-520:45-560)
10 20 30 40
pF1KA1 MMSLSVRPQRRLLSARVNRSQSFAGVLGSHERGPRSFPVFSPPGPP
. ::::::: : .:: : . .
XP_016 DDVFGEGLPTRLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENSSAL
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 RKPPALSRVSRMFSVAHPAA---KVPQPERLDLVYTALKRGLTAYLEVHQQEQEKLQGQI
.:: : ....: ...: : :::.:.. :: ::: :: :::::: : .:: .:.
XP_016 KKPQA--KLKKMHNLGHKNNNPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQL
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 RESKRNSRLGFLYDLDKQVKSIERFLRRLEFHASKIDELYEAYCVQRRLRDGAYNMVRAY
.. ::::::: :::::::.:.:::..:::::: ::.::::::::.::::.::: .: .:.
XP_016 KDMKRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAF
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 TTGSPGSREARDSLAEATRGHREYTESMCLLESELEAQLGEFHLRMKGLAGFARLCVGDQ
.: ::.:. ::.::.: .:. .::::.:: .: ::: :::: ..::::::::::: :::
XP_016 AT-SPASKAARESLTEINRSFKEYTENMCTIEVELENLLGEFSIKMKGLAGFARLCPGDQ
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 YEICMKYGRQRWKLRGRIEGSGKQVWDSEETIFLPLLTEFLSIKVTELKGLANHVVVGSV
::: ::::::::::.:.:: .::: ::.:::.::::.. :.:::::::::::.:..::::
XP_016 YEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEETVFLPLIVGFISIKVTELKGLATHILVGSV
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 SCETKDLFAALPQVVAVDINDLGTIKLSLEVTWSPFDKDDQPSAASSVNKASTVTKRFST
.::::.:::: ::::::::::::::::.::.:: ::: .:. ..... :::... .:.:
XP_016 TCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTASSGAGNKAAALQRRMSM
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390
pF1KA1 YSQSPPDTPSLREQAFYNMLRRQEELENGTA------WSLS-SE--SSDDSSSPQLSGTA
:::. :.::......:.. : .. .::: : ::: :. ..: . . . .:.
XP_016 YSQGTPETPTFKDHSFFSNLP-DDIFENGKAAEEKMPLSLSFSDLPNGDCALTSHSTGSP
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 RHSPAPRPLVQQPEPLPIQVAFRRPETPSSGPLDEEGAVA-PVLANGHAPYSRTLSHISE
.: :. . : . . . . : : .: . :..:. : :. . :
XP_016 SNSTNPEITI-----TPAEFNLSSLASQNEGMDDTSSASSRNSLGEGQEPKSHLKEEDPE
440 450 460 470 480
460 470 480 490 500
pF1KA1 -----ASVDAALAEASVEAVGPESLAWGPSPPTHPAPTHGEHPSPVPPA-LDPGHSATSS
::. . . . ..: : : . . .. ..:. : . :. :: ... ..
XP_016 EPRKPASAPSEACRRQSSGAGAEHL-FLENDVAEALLQESEEASELKPVELDTSEGNITK
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 TLG---TTGSVPTSTDPAPSAHLDSVHKSTDSGPSELPGPTHTTTGSTYSAITTTHSAPS
: :.. :: .::
XP_016 QLVKRLTSAEVPMATDRLLSEGSVGGESEGCRSFLDGSLEDAFNGLLLALEPHKEQYKEF
550 560 570 580 590 600
>>NP_001273375 (OMIM: 611410,616515) protein FAM65B isof (647 aa)
initn: 1381 init1: 891 opt: 1411 Z-score: 570.8 bits: 116.8 E(85289): 4.7e-25
Smith-Waterman score: 1414; 46.8% identity (70.9% similar) in 526 aa overlap (17-520:50-565)
10 20 30 40
pF1KA1 MMSLSVRPQRRLLSARVNRSQSFAGVLGSHERGPRSFPVFSPPGPP
. ::::::: : .:: : . .
NP_001 RRRQLNRLPTRLPEIMLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENSSAL
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KA1 RKPPALSRVSRMFSVAHPAA---KVPQPERLDLVYTALKRGLTAYLEVHQQEQEKLQGQI
.:: : ....: ...: : :::.:.. :: ::: :: :::::: : .:: .:.
NP_001 KKPQA--KLKKMHNLGHKNNNPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQL
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KA1 RESKRNSRLGFLYDLDKQVKSIERFLRRLEFHASKIDELYEAYCVQRRLRDGAYNMVRAY
.. ::::::: :::::::.:.:::..:::::: ::.::::::::.::::.::: .: .:.
NP_001 KDMKRNSRLGVLYDLDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAF
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KA1 TTGSPGSREARDSLAEATRGHREYTESMCLLESELEAQLGEFHLRMKGLAGFARLCVGDQ
.: ::.:. ::.::.: .:. .::::.:: .: ::: :::: ..::::::::::: :::
NP_001 AT-SPASKAARESLTEINRSFKEYTENMCTIEVELENLLGEFSIKMKGLAGFARLCPGDQ
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KA1 YEICMKYGRQRWKLRGRIEGSGKQVWDSEETIFLPLLTEFLSIKVTELKGLANHVVVGSV
::: ::::::::::.:.:: .::: ::.:::.::::.. :.:::::::::::.:..::::
NP_001 YEIFMKYGRQRWKLKGKIEVNGKQSWDGEETVFLPLIVGFISIKVTELKGLATHILVGSV
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KA1 SCETKDLFAALPQVVAVDINDLGTIKLSLEVTWSPFDKDDQPSAASSVNKASTVTKRFST
.::::.:::: ::::::::::::::::.::.:: ::: .:. ..... :::... .:.:
NP_001 TCETKELFAARPQVVAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTASSGAGNKAAALQRRMSM
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390
pF1KA1 YSQSPPDTPSLREQAFYNMLRRQEELENGTA------WSLS-SE--SSDDSSSPQLSGTA
:::. :.::......:.. : .. .::: : ::: :. ..: . . . .:.
NP_001 YSQGTPETPTFKDHSFFSNLP-DDIFENGKAAEEKMPLSLSFSDLPNGDCALTSHSTGSP
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KA1 RHSPAPRPLVQQPEPLPIQVAFRRPETPSSGPLDEEGAVA-PVLANGHAPYSRTLSHISE
.: :. . : . . . . : : .: . :..:. : :. . :
NP_001 SNSTNPEITI-----TPAEFNLSSLASQNEGMDDTSSASSRNSLGEGQEPKSHLKEEDPE
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500
pF1KA1 -----ASVDAALAEASVEAVGPESLAWGPSPPTHPAPTHGEHPSPVPPA-LDPGHSATSS
::. . . . ..: : : . . .. ..:. : . :. :: ... ..
NP_001 EPRKPASAPSEACRRQSSGAGAEHL-FLENDVAEALLQESEEASELKPVELDTSEGNITK
500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KA1 TLG---TTGSVPTSTDPAPSAHLDSVHKSTDSGPSELPGPTHTTTGSTYSAITTTHSAPS
: :.. :: .::
NP_001 QLVKRLTSAEVPMATDRLLSEGSVGGESEGCRSFLDGSLEDAFNGLLLALEPHKEQYKEF
550 560 570 580 590 600
>>XP_011513310 (OMIM: 611410,616515) PREDICTED: protein (1018 aa)
initn: 1981 init1: 891 opt: 1411 Z-score: 567.9 bits: 116.9 E(85289): 6.8e-25
Smith-Waterman score: 1741; 33.5% identity (55.4% similar) in 1248 aa overlap (17-1219:16-1018)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MMSLSVRPQRRLLSARVNRSQSFAGVLGSHERGPRSFPVFSPPGPPRKPPALSRVSRMFS
. ::::::: : .:: : . . .:: : ....: .
XP_011 MLVGSQSFSPGGPNGIIRSQSFAGFSGLQERRSRCNSFIENSSALKKPQA--KLKKMHN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KA1 VAHPAA---KVPQPERLDLVYTALKRGLTAYLEVHQQEQEKLQGQIRESKRNSRLGFLYD
..: : :::.:.. :: ::: :: :::::: : .:: .:... ::::::: :::
XP_011 LGHKNNNPPKEPQPKRVEEVYRALKNGLDEYLEVHQTELDKLTAQLKDMKRNSRLGVLYD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA1 LDKQVKSIERFLRRLEFHASKIDELYEAYCVQRRLRDGAYNMVRAYTTGSPGSREARDSL
::::.:.:::..:::::: ::.::::::::.::::.::: .: .:..: ::.:. ::.::
XP_011 LDKQIKTIERYMRRLEFHISKVDELYEAYCIQRRLQDGASKMKQAFAT-SPASKAARESL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA1 AEATRGHREYTESMCLLESELEAQLGEFHLRMKGLAGFARLCVGDQYEICMKYGRQRWKL
.: .:. .::::.:: .: ::: :::: ..::::::::::: :::::: ::::::::::
XP_011 TEINRSFKEYTENMCTIEVELENLLGEFSIKMKGLAGFARLCPGDQYEIFMKYGRQRWKL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA1 RGRIEGSGKQVWDSEETIFLPLLTEFLSIKVTELKGLANHVVVGSVSCETKDLFAALPQV
.:.:: .::: ::.:::.::::.. :.:::::::::::.:..::::.::::.:::: :::
XP_011 KGKIEVNGKQSWDGEETVFLPLIVGFISIKVTELKGLATHILVGSVTCETKELFAARPQV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KA1 VAVDINDLGTIKLSLEVTWSPFDKDDQPSAASSVNKASTVTKRFSTYSQSPPDTPSLREQ
:::::::::::::.::.:: ::: .:. ..... :::... .:.: :::. :.::.....
XP_011 VAVDINDLGTIKLNLEITWYPFDVEDMTASSGAGNKAAALQRRMSMYSQGTPETPTFKDH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KA1 AFYNMLRRQEELENGTAWSLSSESSDDSSSPQLSGTARHSPAPRPLVQQPEPLPIQVAFR
.:.. : .. .::: : : .:....:
XP_011 SFFSNLP-DDIFENGKA-------------------------------AEEKMPLSLSFS
360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA1 RPETPSSGPLDEEGAVAPVLANGHAPYSRTLSHISEASVDAALAEASVEAVGPESLAWGP
: : :: : ::.
XP_011 ----------D--------LPNG----------------DCALT----------------
390
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pF1KA1 SPPTHPAPTHGEHPSPVPPALDPGHSATSSTLGTTGSVPTSTDPAPSAHLDSVHKSTDSG
.:: ::: .::.:
XP_011 -----------------------SHS--------TGSPSNSTNPE---------------
400
540 550 560 570 580 590
pF1KA1 PSELPGPTHTTTGSTYSAITTTHSAPSPLTHTTTGSTHKPIISTLTTTGPTLNIIGPVQT
:: : :. .. .:.:.. . ..
XP_011 ------------------ITIT---PAEFN-----------LSSLASQNEGMD-------
410 420
600 610 620 630 640 650
pF1KA1 TTSPTHTMPSPTHTTASPTHTSTSPTHTPTSPTHKTSMSPPTTTSPTPSGMGLVQTATSP
:... ...: . . : : : .: :
XP_011 ------------DTSSASSRNSLGEGQEPKS--HLKEEDP-----------------EEP
430 440 450
660 670 680 690 700 710
pF1KA1 THPTTSPTHPTTSPILINVSPSTSLELATLSSPSKHSDPTLPGTDSLPCSPPVSNSYTQA
.:...: : . . . . :.. : :... :
XP_011 RKPASAP------------------------SEACRRQSSGAGAEHLFLENDVAEALLQE
460 470 480 490
720 730 740 750 760 770
pF1KA1 DPMAPRTPHPSPAHSSRKPLTSPAPDPSESTVQSLSPTPSPPTPAPQHSDLCLAMAVQTP
. : : ::. : ::... . . .:. .: :. .
XP_011 SEEA----------SELKPVEL---DTSEGNITKQLVKRLTSAEVPMATDRLLSEGSVGG
500 510 520 530 540
780 790 800 810 820 830
pF1KA1 VPTAAGGSGDRSLEEALGALMAALDDYRGQFPELQGLEQEVTRLESLLMQRQGLTRSRAS
. . : :::.:...:. ::. .. :. :.: :.::: :...: . ...:::.:
XP_011 ESEGCRSFLDGSLEDAFNGLLLALEPHKEQYKEFQDLNQEVMNLDDILKCKPAVSRSRSS
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NP_001 ATAF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]